קולגן הוא רכיב ליבה של ECM, ומספק רמזים חיוניים מספר תהליכים תאיים החל הגירת בידול ושגשוגם. הניתן כאן הוא פרוטוקול להטבעת תאים בתוך הידרוג קולגן 3D, טכניקה מתקדמת יותר ליצירת מטריצות קולגן אקראי או מיושר באמצעות microchannels PDMS.
מאמר שיטה
קולגן הוא רכיב ליבה של ECM, ומספק רמזים חיוניים מספר תהליכים תאיים החל הגירת בידול ושגשוגם. הניתן כאן הוא פרוטוקול להטבעת תאים בתוך הידרוג קולגן 3D, טכניקה מתקדמת יותר ליצירת מטריצות קולגן אקראי או מיושר באמצעות microchannels PDMS.
מבחינה היסטורית, רוב התהליכים התאיים נחקרו בשני ממדים בלבד. בעוד שמחקרים אלה היו אינפורמטיביים לגבי מנגנוני איתות תאים כלליים, הם מזניחים רמזים תאיים חשובים המתקבלים מהתכונות המבניות והמכניות של המיקרו-סביבה המקומית והמטריצה החוץ-תאית (ECM). כדי להבין כיצד תאים מתקשרים בתוך ECM פיזיולוגי, חשוב לחקור אותם בהקשר של מבחנים תלת מימדיים. נדידת תאים, התמיינות תאים והתפשטות תאים הם רק כמה תהליכים שהוכחו כמושפעים משינויים מקומיים בתכונות המכניות של ECM תלת מימדי. קולגן I, מרכיב סיבי ליבה של ה-ECM, הוא יותר ממרכיב מבני פשוט של רקמה. בתנאים רגילים, רמזים מכניים מרשת הקולגן מכוונים מורפוגנזה ושומרים על מבנים תאיים. במיקרו-סביבות חולות, כגון מיקרו-סביבת הגידול, רשת הקולגן עוברת לעתים קרובות עיצוב מחדש באופן דרמטי, ומדגימה הרכב שונה, תצהיר משופר וארגון סיבים שונה. בסרטן השד, מידת יישור הסיבים חשובה, שכן עלייה בסיבים מיושרים בניצב לגבול הגידול נמצאה בקורלציה לפרוגנוזה גרועה יותר של המטופל1. מטריצות קולגן מיושרות גורמות להפצה מוגברת של תאי גידול באמצעות נדידה מתמשכת2,3. להלן פרוטוקול פשוט להטמעת תאים בתוך הידרוג'ל קולגן סיבי תלת מימדי. פרוטוקול זה ניתן להתאמה בקלות לפלטפורמות רבות, ויכול לייצר באופן שחזורי מטריצות קולגן מיושרות ואקראיות לחקירת נדידת תאים, חלוקת תאים ותהליכים תאיים אחרים במיקרו-סביבה פיזיולוגית תלת מימדית מתכווננת.
תהליכים תאיים רבים נחקרו בהרחבה בשני ממדים, ובכך יצרו ידע קולקטיבי של מנגנוני איתות תאים בסיסיים. עם זאת, מחקרים אלה מזניחים רמזים תאיים חשובים המתקבלים מהתכונות המבניות והמכניות של המיקרו-סביבה התאית המקומית והמטריצה החוץ-תאית (ECM). כדי להבין טוב יותר כיצד תאים מתקשרים בהקשר פיזיולוגי, חשוב לחקור אותם במבחנים תלת-ממדיים (תלת-ממדיים). ה-ECM עבור מבחנים תלת-ממדיים אלה יכול להיות נגזר מתאים או מורכב מחדש מחלבונים מטוהרים. ללא קשר למקור ה-ECM, מבחני מטריצה תלת מימדיים הוכחו כבעלי ערך רב להבנת האופן שבו תאים מנווטים ומתקשרים בתוך העולם הפיזיולוגי. לדוגמה, תאים הגדלים במטריצות תלת-ממדיות מציגים מצבי תנועה מובהקים התלויים באופי המכני של ה-ECM הסובב אותם, שאינם נצפים בניסויים דו-ממדיים4-6. יתר על כן, לתאים שגודלו בתלת מימד יש גם פחות ופחות סיבי לחץ והידבקויות מוקדיות בולטים יותר מאשר עמיתיהם הגדלים על משטחים קשים כמו זכוכית או פלסטיק7.
עם זאת, החשיבות של מבחני תלת מימד קונטקסטואליים אינה מוגבלת לנדידת תאים. ניתן לחקור כמה אירועי איתות תאים אחרים רק באמצעות מבחני תלת מימד. במהלך התמיינות רקמות ותאים, נוקשות הסביבה החוץ-תאית ו-ECM מספקת אותות שיכולים להשפיע על אירועים מורפוגניים. לדוגמה, טובולוגנזה של אפיתל החלב מתרחשת רק במטריצות תלת-ממדיות עם קשיחות נמוכה, אך לא במטריצות נוקשות וגם לא בשכבות דו-ממדיות8,9. כאשר הם מתורבתים בתוך מטריצות תלת מימד נוקשות, אותם תאי אפיתל מקבלים פנוטיפ חריג עם התפשטות מוגברת ובליטות קרום התא המונעות באמצעות איתות FAK ו-ERK משתנה10. ידוע כי מסלולי איתות ותהליכים תאיים רבים אחרים מושפעים באופן דומה מהנוקשות של הסביבה התאית המקומית, ומפלי איתות אלה מדגישים את החשיבות של חקירת אירועי איתות ופנוטיפ תאי בהקשר של תכונות מכניות מקומיות מתאימות של ECM תלת מימדי.
קולגן I הוא חלבון רלוונטי במיוחד לשימוש במחקרי מבחנה מכיוון שהוא המרכיב הנפוץ ביותר ב-ECM ואחראי על רבות מהתכונות המכניות של המיקרו-סביבה התאית. בעוד שבמקור הוא נחשב לחלבון מבני בלבד, כיום ידוע שתפקידו מורכב בהרבה. הרכב סיבי הקולגן, הארכיטקטורה, הכיוון, הצפיפות והנוקשות מספקים כולם סביבה מרוכזת של מידע איתות5. במהלך התקדמותן של מחלות מסוימות, כגון דלקת כרונית וגידול, רשת הקולגן מעוצבת מחדש באופן דרמטי2,11. ליתר דיוק בסרטן השד, שקיעת קולגן מוגברת ונוקשות רקמות מלוות וככל הנראה תורמות להתקדמות הגידול. בגידולים מוקדמים אלה, רשת הקולגן הנוקשה נראית מתוחה ומיושרת יותר, כך שרוב הסיבים עוטפים את הגידולהגדל 2. ככל שהגידול מתקדם, הקולגן ממשיך להתארגן מחדש, ואזורים ברשת הסיבית הופכים מכוונים בניצב לגבול הגידול2,12. יישור מאונך משמש כסמן ביולוגי פרוגנוסטי שבו לחולים אלה יש התקדמות גרועה יותר ללא מחלה והישרדות כללית1. הסבר אחד למתאם זה הוא שהתוצאות הגרועות הן תוצאה של התפשטות מוגברת של תאי גידול באמצעות נדידת תאים מתמשכת ברשתות קולגן מיושרות3.
כדי להבין כיצד תאים מגיבים באופן ספציפי ליישור וארגון שנצפו בהתקדמות הגידול, יש צורך ליצור מטריצות קולגן תלת-ממדיות אקראיות ומיושרות לניסויים. ישנן שלוש מתודולוגיות בסיסיות לגרימת יישור בתוך רשתות סיביות. הטכניקה הראשונה משתמשת במכשיר מעורר מתח שבו הקולגן בין שתי נקודות מכווץ או נמתח כדי ליצור יישור. סיבים המקבילים לציר הכוח נמשכים מתוחים ואילו סיבים בניצב לציר נדחסים ומכווצים. בעוד שטכניקות הנגרמות על ידי מתח מציעות בדרך כלל יישור מעולה, גישה זו דורשת ציוד מגושם שאינו ניתן להתאמה בקלות לפלטפורמות רבות3,13. לחלופין, ניתן ליצור מתח המושרה על ידי תאים על ידי הצבת פקקים מקומיים של תאים שלאחר מכן מתכווצים ומיישרים את הקולגן13. לשיטה זו יש בעיה להיות משתנה, מכיוון שפרמטרים רבים עשויים להיות כפופים לשינויים. השיטה השנייה משתמשת בחרוזים מגנטיים ובשדה מגנטי במהלך פילמור כדי לגרום ליישור קולגן13,14. ניתן להשיג תוצאות טובות משיטה זו עם ציוד לא מתוחכם, אך היא דורשת שימוש בנוגדנים או בשיטה אחרת כדי למגנט את הפולימר. לכן, זה יכול להיות מעט יקר לשימוש, והנוקשות של ג'ל הקולגן עשויה להשתנות על ידי החיבורים המוגברים ברשת. יתר על כן, החרוזים המגנטיים המשמשים בתהליך זה הם לרוב אוטו-פלואורסצנטיים, וזה בעייתי עבור ניסויי הדמיה. לבסוף, ניתן ליצור יישור על ידי תעלות מיקרופלואידיות PDMS3,15,16. בשיטה זו, יישור קולגן מושג על ידי הזרמת קולגן מפולמר דרך תעלות מיקרופלואידיות קטנות. ניתן לייצר תעלות מיקרופלואידיות אלו במספר רב של עיצובים, וניתנות להתאמה בקלות לפלטפורמות רבות. יתר על כן, הם חסכוניים מאוד מכיוון שמשתמשים בכמויות קטנות מאוד של קולגן וריאגנטים אחרים בשל גודלם הזעיר
.מסופק כאן פרוטוקול פשוט להטמעת תאים בתוך הידרוג'ל קולגן סיבי תלת מימדי. בנוסף, ניתנת גם טכניקה מתקדמת יותר, שבה משתמשים בתעלות מיקרופלואידיות PDMS לשליטה בארגון ויישור מטריצת הקולגן. פרוטוקול זה ניתן להתאמה בקלות לפלטפורמות רבות, ויכול ליצור באופן שחזורי מטריצות קולגן מיושרות ואקראיות לחקירת נדידת תאים, חלוקת תאים ותהליכים תאיים אחרים במיקרו-סביבה פיזיולוגית תלת מימדית.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. נטרול, דילול פלמור של פתרונות קולגן לחקירת 3D מבחני התכווצות סלולארית
2. המערבי סופג, תא המורפוגנזה וג'ל Gontractility Assay
דור 3. PDMS microchannels עבור יישור סיבי קולגן
הערה: כדי ליצור מטריצות קולגן מיושר, תבנית עבור microchannels PDMS (איור 2 א) דורש מאסטר סיליקון SU-8 עשה דרך-ליתוגרפיה רך 15.
4. הכנות PDMS microchannels לשימוש
5. הכנת קולגן לשימוש ב microchannels
6. לשפוך בציר microchannels אקראי קולגן
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בעוד מבחני 3D ניתן לעשות זאת בתוך אותה הנוקשות של ג'ל קולגן, שינוי הקשיח ג'ל ניתן להשתמש כדי לקבוע כיצד התאים יגיבו לשינויים מכאניים microenvironment הסלולר שלהם. הידרוג קולגן נוקשה מוגדר כג'ל שבו התאים המוטבעים אינם מסוגלים מקומית להתכווץ קולגן שמסביב. ההתכווצות הפנימית של תאים מסוגים שונים היא ייחודית, ולכן עדיף להתחיל עם עקומת contractility פשוט להקים ריכוז הקולגן כי יהיה המורגש תואם ונוקשה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
ג'ל קולגן 3D הם תוספת רבת ערך בארגז הכלים שלנו כדי להבין כיצד תאים לפרש ולהגיב microenvironment המקומית שלהם. כתב יד זה ספק פרוטוקול בסיסי מאוד להטבעת תאים בתוך מטריצת קולגן 3D, וכדי ליצור מטריצות reproducibly עם סיבי קולגן אקראיים או מיושרים. פרוטוקולי שניהם עובדים פלטפורמות וישימות היכן isoforms קולגן השונה, crosslinkers, או חלבונים מטריקס אחרים ניתן להוסיף פוטנציאלי בעת פילמור. זה גם קל לשנות את הפלטפורמות להעריך זמנים ונקודות קצה שונים עבור ביטוי גנים וייצור חלבון. הדמיה, ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
החוקרים אין לחשוף
המחברים מבקשים להודות UO1CA143069 מספרים מענק, R01CA142833, R01CA114462, RO1CA179556, T32-AG000213-24, ו T32-GM008692-18 למימון עבודה זו. אנחנו גם מכירים ג'רמי Bredfelt ו Yuming ליו של לוקוסים לפיתוח וסיוע בניתוח CT-FIRE.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| קורנינג | קולגן זנב עכברוש בריכוז גבוה | 354249 | |
| ערכת אלסטומר SylGard184 | קורנינג | NC9285739 | אלסטומר לתעלות PDMS |
| HEPES | Fisher | BP310 | עבור מאגר נטרול HEPES |
| KCl | פישר | BP366 | עבור מאגר נטרול HEPES |
| KH2PO4 | Fisher | BP362 | עבור מאגר נטרול HEPES |
| Na2HPO4 | Fisher | S374 | עבור מאגר נטרול HEPES |
| NaCl | Fisher | BP358 | עבור מאגר נטרול HEPES |
| היטל נויבאואר המציטומטר משופר | פישר | 15170-208 | ספירת תאים 6 בארות |
| צלחת תרבית שאינה רקמה | קורנינג | 351146 | |
| צלחת תחתית זכוכית 50 מ"מ | MatTek | P50g-1.5-30-f | |
| Bel-Art פלסטיק מייבש ואקום Bel-Art | Bel-Art | F4200-2021 | תא הסרת גז |
| לסרט שקיפות PDMS | 3M | pp2950 | סרט פלסטיק למזיגת תעלות pdms |
| ThermoScientific CimaRec | ThermoScientific | HP141925 | פלטה חמה לריפוי מיקרו-ערוצים PDMS |
| ווסת ואקום | דיוק | רפואי PM3100 | ווסת ואקום למיקרו-ערוצי קולגן |
| 8 אינץ' x 8 אינץ' יריעת גומי | אמזון - גומי-קל | סיליקון - | יריעת גומי 60A למזיגת מיקרו-ערוץ PDMS |
| 8 אינץ' x 8 אינץ' x 0.125 אינץ' יריעת אקריליק | יריעות פרספקס | של אמזון | למזיגת מיקרו-ערוצי PDMS |
| משקולות 10 ק"ג | משקולת אמזון | CAP | למזיגת מיקרו-ערוצים PDMS |
| 15 מ"ל צינורות חרוטיים | פישר | 352097 | |
| 50 מ"ל צינורות חרוטיים | פישר | 352098 | |
| צנרת פלסטיק | נקודה מדעית | 229202B, 229206B ו-667225B | 2 מ"ל, 5 מ"ל ו-25 מ"ל |
| 70% EtOH | פישר | NC9663244 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה