Dissection ו-הרכבה שטוחה של שלד Threespine קוצן branchial

Summary

השלד המסועף, כולל מגרפות זימים, שיני לוע ועצמות מסועפות, משמש כאתר העיקרי לעיבוד מזון ברוב הדגים. כאן אנו מתארים פרוטוקול לניתוח והרכבה שטוחה של השלד הפנימי הזה בסטיקלבק תלת-שדרתי. שיטה זו ישימה גם למגוון מיני דגים אחרים.

Abstract

מקטעי הלוע האחוריים של ראש החולייתנים מולידים את השלד המסועף, האתר העיקרי של עיבוד מזון בדגים. המורפולוגיה של השלד הענפי של הדג מותאמת לתזונה של המין. דג תלת-קוצים (Gasterosteus aculeatus) הופיע כמערכת מודל לחקר הבסיס הגנטי וההתפתחותי של הבדלים אבולוציוניים במגוון תכונות. אוכלוסיות ימיות של סטיקלבקים התיישבו שוב ושוב באינספור אגמים ונחלים חדשים של מים מתוקים. הסתגלות לתזונה החדשה בסביבות מים מתוקים אלה עומדת ככל הנראה בבסיס סדרה של שינויים גולגולתיים שהתפתחו שוב ושוב באוכלוסיות מים מתוקים שמקורן באופן עצמאי. אלה כוללים שלושה שינויי דפוס עיקריים בשלד הענף: הפחתה במספר ובאורך עצמות מגרפת הזימים, עלייה במספר שיני הלוע והגדלת אורכי העצם המסועפים. כאן אנו מתארים פרוטוקול מפורט לניתוח והרכבה שטוחה של השלד הענפי הפנימי בדגי סטיקלבק תלת-שדרתיים. חיתוך של כל השלד המסועף התלת מימדי והרכבתו שטוחה להכנה דו-ממדית ברובה מאפשרת הדמיה וכימות קלים של מורפולוגיה של שלד מסועף. שיטת דיסקציה זו זולה, מהירה, קלה יחסית וישימה למגוון רחב של מיני דגים. בסטיקלבק, שיטה יעילה זו מאפשרת לכמת את המורפולוגיה של השלד בהכלאות גנטיות כדי למפות אזורים גנומיים השולטים בדפוס הגולגולת.

Introduction

סכום מדהים של מגוון קיים בשלד הראש בין חוליות, במיוחד בקרב דגים. במקרים רבים המגוון הזה הופך לפשוט אסטרטגיות האכלה שונות ^{1 - 4,} והוא יכול לכלול שינויים משמעותיים הוא דפוסי craniofacial חיצוניים ופנימיים. שלד branchial ממוקם באופן פנימי בגרון של דג והמקיף ביותר של חלל buccal. שלד branchial מורכב 5 מקטעים הומולוגיים סדר, הקדמיים וארבעת מהם לתמוך הזימים. יחד חמישה קטעים אלה כממשק בין דגים ופירות שלהם ^5. וריאצית שפע של תכונות כולל rakers זימים, שיני בלוע, ועצמות branchial לתרום ליקוט יעיל על סוגים שונים של מזון.

הקוצנים עברו קרינה אדפטיבית לאחר צורות אושיאניק האבות יישבו אגמי מים מתוקים ונחלים ברחבי חצי הכדור הצפוני. המעבר בתזונהמ זואופלנקטון קטן באוקיינוס ​​כדי טרף גדול במים מתוקים הביא וריאציה trophic דרמטית תכונות כמה craniofacial ^6. בעוד מחקרים רבים התמקדו על הבדלי craniofacial חיצוניים הקוצנים ^{7 - 13,} שינויי craniofacial חשובים להתפתח שוב ושוב בשלד branchial הפנימי. היכולת ליצור כלאיים פורים בין אוכלוסיות קוצן ברורות מורפולוגית מספקת הזדמנות מצוינת כדי למפות את הבסיס הגנטי של שינויים התפתחו עד שלד branchial.

תכונה אחת trophic של משמעות אקולוגית היא הדפוסים של rakers זימים, עצמות עורי תקופתיות המרפדות את פניהם הקדמיים וגם אחוריים של עצמות branchial ומשמשים לסנן פריטים טרפים. דגים כי בדרך כלל ניזונים טרף קטנים נוטים להיות יותר ויותר בצפיפות הזימים במרווחים rakers לעומת דגים הניזונים טרף גדול יותר ^14,15. וריאציה rakers הזימים דווחה הן within ובין מיני ^14-19, והיבטים של דפוסי מגרפות זימים לתרום נישות trophic וכושר ^16. עשרות שנים של מחקר תיעדו בהרחבה מספר זיז הזים וריאציה בהרחבה הקוצנים threespine ^{17 - 21;} עם זאת, מחקרים אלה מתמקדים בדרך כלל בשורה הראשונה של rakers זימים. מחקר שנערך לאחרונה הוכיח מודולריות בבקרה הגנטית של מספר מגרפות זימים פני שלד branchial ^22,23 ועל פני שורה אחת מגרפות זימים ריווח ²³ ואורך ²⁴ המדגיש את החשיבות של לימוד יותר משורה אחת או מגרפות זימים אחת להבין את בסיס גנטי ההתפתחותי של הפחתת מגרפות זימים.

אחת מתכונותיהן trophic שניות של שניהם המשמעות האקולוגית ביו הן הדפוסים של שיניים בלועות. שיני דגים יכולות להיות ממוקמות בשני הלסת האוראלית בשלד branchial, המכונות שיני בלוע. שיני Oral משמשות בעיקר עמ 'rey ללכוד בשיניים בלוע משמשים מניפולציה לעיסה וטרף ^{25 - 27.} שתי הסדרות יוצרים באמצעות מנגנונים התפתחותיים משותף ונחשבים מבחינה התפתחותית הומולוגיים ^28. מודולריות מעניין מתרחש תוך שלחלק מינים, כגון דג זברה, שיני בלוע פה ועל גב חוסר ²⁹ בעוד מינים אחרים ceratobranchials מספר שיניים, pharyngobranchials, ולפעמים שיני basihyal ו hypobranchials ^30. בשנת הקוצנים, שיניים בלוע נמצאים ventrally על ceratobranchial ו dorsally החמישי על הקדמי וגם האחורי pharyngobranchials ^31. קינמטיקה על האכלת קוצן להראות הלסת האוראלית משמשת בעיקר עבור לכידת טרף והקלת האכלת יניקת ⁹ עוזב לעיסה ללסת הבלוע. בשנת ציקלידים, מורפולוגיה הלסת בלוע התחתון משתנה באופן דרמטי ^32,33 ו הוכח להיות אדפטיבית בקורלציה עם נישה trophic ^34. רַבאוכלוסיות קוצן מים מתוקים ple התפתחו מגדילה דרמטית במספר שן בלוע גחון ^23,35,36. מחקר שנערך לאחרונה הוכיח כי הבסיס הגנטי ההתפתחותי של רווח השן התפתח זה הנו ייחודי, בעיקר בשתי אוכלוסיות נגזרות עצמאי של הקוצנים מים מתוקים ^36. בניגוד שיניים יונקים, דגים להתחדש שיניהם ברציפות לאורך החיים הבוגרים ^37. שתי אוכלוסיות מים מתוקות שיניים גבוהות שתוארו לעיל אלה התפתחו בקצב החלפת שן מואץ, ובכך יוצרים מערכת החולייתנים נדירה לחקר הבסיס הגנטי של התחדשות ^36.

אחת מתכונותיהן trophic שלישי התפתח שוב ושוב הקוצנים מים מתוקים ארוכה עצמות epibranchial ו ceratobranchial, את homologs קשת המגזרי branchial של הלסת העליונה והתחתונה, בהתאמה ^38. עצמות branchial ארוכות להעניק חלל buccal גדול וסבירות הם אדפטיבית על שאפשרו פריטי טרף גדולים להיות גonsumed. יתר על כן, בדגים אחרים, עצמות epibranchial חשובות לדיכאון של צלחות שן בלוע הגבה ^25. כמו זיז זים ושיני בלוע, עצמות branchial הן פנימיות ולכן, קשה לדמיין או לכמת בקלות.

כאן אנו מציגים פרוטוקול מפורט לנתח שטוח הר שלד branchial, המאפשרים הדמיה קלה וכימות של מגוון תכונות craniofacial חשובים. בעוד פרוטוקול זה מתאר לנתיחת קוצן, באותה שיטה זו פועלת על מגוון רחב של דגים אחרים.

Protocol

כל העבודה דגים אושרה על ידי ועדת טיפול בבעלי חיים מוסדיים השתמש מאוניברסיטת קליפורניה-ברקלי (מספר פרוטוקול R330). המתת חסד בוצעה באמצעות טבילה 0.025% Tricaine-S שנאגרו עם 0.1% נתרן ביקרבונט ^39. כל השלבים מבוצעים בטמפרטורת החדר.

1. הכנה

הערה: בצע את פעולות 1.1-1.5 צינורות חרוטים או צלוחיות נצנץ שיכול לאטום בחוזקה להיות מונח אופקי. דגים לא צריכים להיות מזועזע כל הזמן, אבל מנסה לערבב הפתרון לעתים קרובות ככל האפשר על ידי היפוך בעדינות או טלטול מתלה של צינורות או צלוחיות לחשוף את כל הצדדים של הדג לפתרון מכתים ולאפשר כתם לחדור לרקמה שווה. אל תניחו קבוצה גדולה של דגים על שייקר פלטפורמה, כמו המשקל הכבד של הנוזל ישבור שייקר.

1. תקן או דג טרי מורדם או דגים מאוחסן אתנול עם 10% Neutral שנאגר פורמלין (NBF) הלילה. לחלופין, להשתמש 4% paraformאלדהיד בתמיסה 1x PBS במקום 10% NBF.
   הערה: אם להפיק ממנה DNA, קליפ חלק קטן של סנפירי זנב או חזה לפני הקיבוע ולאחסן באתנול.
2. השלך לתקן כראוי במנדף כימי ולהחליף עם מי ברז (כלומר ~ pH 7.0) עבור 2 שעות. הימנע משימוש במי דה מיונן כפי שקרה לעתים קרובות יכול להיות חומצי יכול decalcify עצם.
3. סר מים ודגי כתם עם 0.008% Alizarin האדום S ב 1% KOH במים למשך 24 שעות. עבור דגים פחות מ -20 מ"מ אורך סטנדרטי, השתמש 0.004% Alizarin האדום ס (ערוך 100x (פתרון מניות 0.8%) של Alizarin האדום S אז מה שיכול להיות מדולל).
4. הסר כתם (הצבת מיכל פסולת המתאים במנדף) ודגים המקום במי ברז למשך מספר שעות. שינוי מים לפי הצורך עד לשטוף במים הוא בעיקר ברור.
5. סור דגי מים ומקום לתוך 50% גליצרול, 0.25% KOH לסליקה עדינה לנתיחה שלאחר מכן.
   הערה: פרוטוקול מכתים זה שונה מן השיטות שתוארו קודם לכן ^40,41.

הערה: ראה איור 1 עבור סקירה של מורפולוגיה שלד ראש רלוונטי.

איור 1:. קוצן ראש מורפולוגיה שלד Alizarin האדום מוכתם ראש קוצן threespine צלם עם קרינה תחת סט מסנן rhodamine B. מורפולוגיה שימושיים מתויג: אופ = opercle, Subop = subopercle, BSRs = branchiostegal קרני, Preop = preopercle, Infraorb 1-3 = 1-3 infraorbital (circumorbitals המכונה גם או suborbitals), דנט = dentary, Premax = premaxilla, מקס = maxilla נאס, = אף, לאט. ethm = לרוחב כִּברָתִי, Psph = parasphenoid, Fron = העצם הפרונטלית. לתיאור מפורט יותר של השלד ראש קוצן, לראות אנקר (1974) ^31. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר שלנתון זה.

1. הנח את הדג השטוח (איור 2 א) וכנס המלקחיים של השען # 5 חד לתוך הצד של העין בזווית של 45 מעלות ~ לנקב את הקרום המכסה את העין.
2. מקלף את הקרום הרחק מן העין, דומה לקליפת מכסת יוגורט (איור 2 ב).
3. הכנס מלקחיים פתוחים מאחורי העין, לאחוז את עצב הראייה מאחורי העין, ולהסיר את העין (איור 2 ג). אין לנקב את העין כפי שהוא ידלוף מלנין. אם ניקב, מלנין ניתן נשטף במהלך השלבים מאוחר יותר.
4. חזור על צד שני.
5. החל האחורי, למקום להב מספריים לנתח קטן אחד תחת כנף opercle, להב מספריים גרור dorsally מעל opercle, ואז לחתוך רקמות רכות ועד ארובת העין (איור 2 ד). חותכים הגבו עד עצם opercle.
6. חותך את העצם הפרונטלית (גב אל ארובת העין) (איור 2E).
7. חותכים את העצם parasphenoid קו האמצע סביב tהוא המרכז של ארובת העין (איור 2F).
8. לחתוך opercle חוזר על הצד שכנגד.
9. הכנס מלקחיים תחת opercle ולאט לאט לקלף את הפנים מהגוף, זמירה כל רקמות רכות עדיין מחוברות (2G איור - H). שים לב שלא לשבש את השורה הראשונה של rakers זימים.
   1. עם מלקחיים, לנתק את ceratohyals משני הצדדים מן basihyal קו האמצע תוך קילוף והסרה של שלד craniofacial קדמית (הלסת כולה כולל dentary, premaxilla, ו maxilla; השלד hyoid כולו כולל opercle עורי החיצוני, preopercle, subopercle, ו קרן branchiostegal ואת הגב שבבסיס ואלמנטי endochondral גחון; והחלק הקדמי של הגולגולת כולל האף, כִּברָתִי לרוחב, ועצמות infraorbital, ראה איורים 1 ו 2I).
   2. קוצי אגן יכולים להיות מקופלים החוצה מהגוף, ויכולים לשמש כידית עבור מלקחיים לאחוז of כאשר ההווה. שדרות ננעלו במקומו. כדי לבטל את הנעילה, משוך בעדינות את עמוד שדרה עם מלקחיים ישירות מגוף דגים, אז בעדינות לכופף בדיעבד ללחוץ עמוד שדרה שטוחה נגד דגים.
10. הכניסו נסגר מלקחיים אחוריים גחון לשלד branchial (ממש מתחת צינור מעיים) ו מלקחיים גרורים קדמי, מתגרים לגזרים את השרירים ורצועות הנותרים המקובעים לשלד branchial (האיור 2J - K).
11. באמצעות קצות מלקחיים סגורים, לגרד ממנו את שרירי הצמדת השלד הגבה branchial אל braincase הגחון בתוך אחורי לכיוון קדמי (האיור 2L).
12. חזור על 2.9 ו 2.10 על הצד שכנגד.
13. אחוז בבסיס צינור המעיים ולמשוך anteriorly להסיר את הצינור שלד ובמעיים branchial (איור 2M - N).
14. הפרד את צינור המעיים על ידי יצירת האחורי חתך בניצב סוף ceratobranchial החמישי (איור 2 טו
15. לאחר הסרת כל שברי עצמות שנותרו מן braincase בצד הגבי של שלד branchial, הכנס מספריים לתוך סל branchial לעשות חתך הגבה (חיתוך קדמי אל אחורי) בין הסטים הבילטרליים של צלחות שן הגבה (איור 3 א - ד). ודא לחתוך מרוכז כדי למנוע נזק לוחות השן הגבי.
16. לעשות שני חתכים לרוחב רדודים לומן המעי גומי בקצה האחורי של השלד branchial (הקצה הקדמי של צינור המעיים) כדי לסייע עם פתיחת שלד branchial (איור 3E).
17. הנח דגים וכל פיסות הרקמה לתוך צנצנת והניח שלד branchial לתוך צינור microcentrifuge עם גליצרול 50%, 0.25% KOH להמשיך סליקה עדינה, או גליצרול 100% אם לא סליקה נוספת נדרשת. צנצנות וצינורות תווית עם מזהה ייחודי, כך שניתן יהיה לעקוב. סכום סליקה הנדרש הוא בעיקר פונקציה של הגודל של הדגים, דגים בוגרים גדולים (מעל 40 מ 'מ 'אורך סטנדרטי) בדרך כלל לחייב סליקה נוספת.

איור 2:. לנתיחת שלד branchial קוצן Alizarin האדום מוכתם דגי קוצן threespine מוכנים לנתיחה. עין depigmented מ סליקה נרחבת. חצים כחולים מציינים את כיוון התנועה. (א) להציג לרוחב של ראש קוצן, הקדמי הוא בצד ימין. (ב) הסרת קרום המכסה את העין. (ג) הסרת העין. (ד) הגבה לחתוך מעל opercle. (E) לחתוך עצם פרונטאלית. (F) Parasphenoid לחתוך. (G - אני) הסרת שלד הפנים. (J) הסרת חיבורי רקמות רכות שלד branchial גחון. (K - L) הסרת חיבורי שלד הגבה branchial. ( M - N) הסרת שלד branchial. (O) הפרד את צינור המעיים מן השלד branchial. עיין בשלבים 2.1 דרך 2.16 לפרטים נוספים. סרגל קנה מידה = 5 מ"מ. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

3. שלד branchial מחדש מכתים (במידת הצורך)

1. כדי להכתים את כהה שלד branchial או רקמות ברורות יותר, להסיר גליצרול 50%, פתרון KOH 0.25% ולשטוף עם 1% KOH פעמים (לשטוף אחד חמש דקות ואחריו לשטוף את שני 24 שעות תוך רעד אופקי על שייקר פלטפורמה).
2. סר 1% KOH מחדש כתם עם 0.008% Alizarin האדום S ב KOH 1% למשך 24 שעות.
3. הסר כתם ולהחליף עם KOH 1% למשך 24 שעות.
4. הסר פתרון KOH ולהחליף עם 50% גליצרול, 0.25% KOH.

4. הרכבת branchial שלד

1. הסר שלד branchialמ גליצרול 50%, 0.25% KOH או 100% גליצרול מקום קרוב לתחתית של תלוש כיסוי זכוכית 22 מ"מ x 60 מ"מ עם הצד הגבי פונה כלפי מעלה (איור 3F). הוסף כמה טיפות של גליצרול 50%, 0.25% KOH או 100% גליצרול על גבי שלד branchial. אם מעבר מ 50% גליצרול, 0.25% KOH ל -100% גליצרול, פתרון שינוי בצינור microcentrifuge ולנער עבור> 5 דקות לפני הרכבה לאזן רקמות.
2. מרדדי שני כדורים קטנים של פלסטלינה ומניח על קצוות של להחליק את המכסה לפעול כמו מפרידים.
3. רופף במקום coverslip שני על גבי בלחץ חזק מספיק כדי לשטח את שלד branchial הקדמי (האיור 3G).
4. פיל לפתוח את דש הגבי עזב כולל צלחות שן מגבות, לרדד, וחלק בין coverslips (האיור 3H).
5. טכניקה חזור עם דש הגבי תקין ולדחוף השלד כולו branchial מהקצה של coverslip (איור 3I).
   1. לשנותבאופן מקורי, להחזיק דשי הגבי של חלל פתוח עם מלקחיים ובזהירות מקום coverslip על, משטח את שלד branchial בתנועה אחת חלקה.
   2. לחלופין, הר השלד branchial הפוך על תלוש לכסות אחד, מפשק אותן למעלה ולמטה בכל צד הגב החוצה רוחבית כך כוח המשיכה אינו מאפשר השלד branchial לסגור לגבות. ואז לכסות עם תלוש כיסוי הזכוכית שני 22 מ"מ x 60 מ"מ ו להפוך הכנה.
      הערה: טכניקות הרכבה שונות נוהגות לעבוד טוב יותר או גרוע יותר עבור כל אדם. נסה כל ולראות מה מרגיש הכי נוח.
6. לחץ קל על coverslip העליון לשטח כדורי חימר מספיק כדי לשמור על שלד branchial הרכוב שטוח, אך היזהרו שלא למחוץ את הדגימה.
   1. במהלך תהליך ההרכבה, ceratobranchials יכול לסובב לטשטש שורה של rakers. תרופה זו על ידי הזזה מלקחיים בין coverslips מחדש המכוונת את ceratobranchials או שלד branchial כולו.
7. חנות preps שטוחה במגשי שקופית roטמפרטורת אום. רכוב גליצרול 100%, ניתן לאחסן preps בין coverslips לגשר במשך עשור לפחות. מלקחיים ומספריים נקיים עם isopropanol או אתנול וטיפי כיסוי.

איור 3:. שטוח הרכבת שלד branchial המניפולציה ואת ההרכבה של שלד branchial מוצג. חצים כחולים מציינים את כיוון התנועה. (א) branchial הגבה שלד למעלה בצד. (B - D) סיבוב חתך בין לוחות שן הגבה. (E), קיצוץ רוחבי ברקמות רכות להמשיך לפתוח את הבסיס של צינור הבטן. (F) שלד branchial ממוקם בחלק התחתון של coverslip מוכן גובר. (G) coverslip השנייה מונחת על החצי הקדמי של שלד branchial (מעל צלחות שן מגבות). (H - I)הרכבה שטוחה של שלד branchial ידי דשי צלחת שן הגבה פתיחת זזה בין שני תלושים לכסות. עיין בשלבים 4.1 עד 4.6 לפרטים נוספים. סרגל קנה מידה = 5 מ"מ. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

Results

תוצאות פרוטוקול זה שלד branchial רכוב גזור ושטוח (איור 4) שבו מגוון של תכונות תזונתיות חשובות ניתן לכמת. מתוך תפיסת גב, כל השורות של rakers זימים, כל צלחות השן בלועה, וכמעט כל עצמות branchial ניתן מדמיינים בקלות לכמת ^{22 - 24,35,36,38,42.} Alizarin האדום S גם מאיר על rhodamine או מסנן אדום דומה המאפשר תיוג כפול עם סמנים אחרים (למשל, מהונדס GFP ⁴²⁾ שיטה חלופית של ויזואליזציה. ...

Discussion

השלד המסועף הוא קבוצה מורכבת של עצמות בגרון של דג שמתמרן, מסנן ולועס פריטי מזון בדרכם לוושט. תכונות טרופיות מעניינות רבות, כולל דפוס של מגרפות זימים, שיני לוע ועצמות ענפיות, משתנות בין המינים ובתוכם. את רוב התכונות הללו קשה עד כמעט בלתי אפשרי למדוד במדויק עם השלד המסועף באתרו (למשל, אורך מגרפת הזימים, אורך עצם הענף). פרוטוקול הרכבה שטוח זה מציב את כל רכיבי השלד המסועפים במישור דו-ממדי פשוט כדי להקל על הדמיה וכימות של תכונות מרובות.

מגבלה אחת של פרוטוקול זה היא שלמרות שניתן ל...

Materials

List of materials used in this article

Name	Company	Catalog Number	Comments
אשלגן הידרוקסיד (KOH)	EMD	PX1480-1
גליצרול	סיגמא-אולדריץ'	G7893-4L
10% ניטרלי חוצץ פורמלין (NBF)	Azer Scientific	NBF-4-G
אליזרין אדום S	EMD	AX0485-3
משקפיים כיסוי מיקרוסקופ 22 מ"מ x 60 מ"מ	VWR	16004-350
100 מ"מ x 10 מ"מ זכוכית פטרי צלחת	קימבל צ'ייס	23064-10010	לניתוח דגימות על
סילגארד 184 ערכת אלסטומר סיליקון	דבקי אלסוורת'	184 ערכת סיל אלאסט 0.5 ק"ג	ניתן לשפוך לתוך צלחות פטרי מזכוכית או פלסטיק להכנת צלחות ניתוח
דוגמנות חימר	סרג'נט ארט	22-4000	1 ק"ג בקבוקוני
נצנוץ קרם (מארז של 500)	זכוכית בורוסיליקט 986586 וויטון		עם מכסה בורג
מלקחיים-דומונט #5 Inox (טיפ ביולוגי)	FST	11252-20	Dumostars הם מספריים אלטרנטיביים
לניתוח	FST	15003-08	גדלים חלופיים זמינים בהתאם לגודל המדגם
ניתוח מיקרוסקופ	Leica	S6E עם KL300 LED	דגמים רבים אחרים עובדים יפה, בעלי בסיס שטוח מסייע
לצינורות מיקרוצנטריפוגה 1.7 מ"ל	דנוויל	C2170
מגש שקופיות קרטון	פישר	12-587-10