ניתוח הקשר בין מבנה המיטוכונדריה לתפקוד נדרש להבנה מעמיקה של מנגנוני הרגולציה של פונקציונליות המיטוכונדריה. שיטות ספציפיות לחקר המבנה והתפקוד המיטוכונדריאלי בשחלות דרוזופילה חיות וקבועות מתוארות ומודגמות במאמר זה.
מאמר שיטה
ניתוח הקשר בין מבנה המיטוכונדריה לתפקוד נדרש להבנה מעמיקה של מנגנוני הרגולציה של פונקציונליות המיטוכונדריה. שיטות ספציפיות לחקר המבנה והתפקוד המיטוכונדריאלי בשחלות דרוזופילה חיות וקבועות מתוארות ומודגמות במאמר זה.
ניתוח הקשר בין מבנה המיטוכונדריה לתפקוד נדרש להבנה מעמיקה של מנגנוני הרגולציה של פונקציונליות המיטוכונדריה. מיקרוסקופיה פלואורסצנטית היא כלי הכרחי להערכה ישירה של המבנה והתפקוד המיטוכונדריאלי בתאים חיים ולחקר יחסי המבנה-תפקוד המיטוכונדריה, אשר מווסת בעיקר על ידי המולקולות השולטות באירועי ביקוע והיתוך בין מיטוכונדריה. מאמר זה מתאר ומדגים שיטות ספציפיות לחקר המבנה והתפקוד המיטוכונדריאלי ברקמה חיה כמו גם ברקמה קבועה באורגניזם המודל Drosophila melanogaster. הרקמה הנבחרת כאן היא שחלת הדרוזופילה, שניתן לבודד ולהפוך אותה למתאימה למיקרוסקופיה קונפוקלית חיה ex vivo. יתר על כן, המאמר מתאר כיצד לבצע מניפולציה גנטית של חלבון הביקוע המיטוכונדריאלי, Drp1, בשחלות דרוזופילה כדי לחקור את המעורבות של ביקוע מיטוכונדריאלי מונע Drp1 בוויסות הקשר בין מבנה לתפקוד המיטוכונדריאלי. השימוש הנרחב בשיטות כאלה מודגם בנתונים שכבר פורסמו כמו גם בנתונים חדשים. ניתן להרחיב את השיטות המתוארות עוד יותר להבנת ההשפעה הישירה של חומרים מזינים ו/או גורמי גדילה על התכונות המיטוכונדריאליות ex vivo. בהתחשב בכך שחוסר ויסות מיטוכונדריאלי עומד בבסיס האטיולוגיה של מחלות שונות, השיטות החדשניות המתוארות שפותחו באורגניזם מודל הניתן לטיפול גנטי, דרוזופילה, צפויות לתרום באופן משמעותי להבנת הפרטים המכאניסטיים של הקשר בין מבנה לתפקוד המיטוכונדריה ולפיתוח אסטרטגיות טיפוליות מכוונות מיטוכונדריה.
המיטוכונדריה מתואר קלסי כמו תחנת הכח הסלולר, שכן הם המושבים העיקריים של ייצור אנרגיה בתאי בדיל. יתר על כן, המיטוכונדריה לשחק תפקיד קריטי במטבוליזם, דור חום, שינוי שומנים, סידן הומאוסטזיס חיזור, תזמור תהליכי איתות תא, וכו '1. המיטוכונדריה גם לשחק תפקיד פעיל האינדוקציה של מוות של תאי 2, כמו גם מחזור התא תקנה 3. רב-פונקציונלי כזו מעלה את השאלות העקרוניות הבאות: א) איך המיטוכונדריה אל לבצע את כל הפונקציות האלה בו זמנית ב) האם יש ברכות המיטוכונדריה ספציפיות או subzones כי הם מיוחדים עבור פונקציות נפרדות? בהקשר זה, חשוב לציין כי המיטוכונדריה רב התכליתית הן דינמיות הצורה, הגודל שלהם, ואת המבנה בתוך תאים בודדים וכי הצורה היציבה של המיטוכונדריה יכולה להשתנות בין סוגי תאים. עשרות שנים של מחקר ממעבדה שונהoratories מראה כי השינוי של צורת המיטוכונדריה, גודל ומבנו, דינמיקה המיטוכונדריה פנתה במשותף, הוא חיוני בשמירת פונקציות המיטוכונדריה שונה 4,5,6. ממצאים אלה מעלים את האפשרות כי המיטוכונדריה יכול להשיג רב הפונקציונלית שלהם מכוח הדינמי המבני שלהם.
מאמצים נרחבים נערכים להבין את הקשר מבנה-תפקוד המיטוכונדריה. הדינמי של מבנה המיטוכונדריה נשמר בעיקר על ידי היכולת שלהם לעבור אירועי ביקוע ואיחוי אחד עם השני. ביקוע של המיטוכונדריה גדול ממיר אותם אלמנטי המיטוכונדריה קטנים, תוך היתוך בין שני המיטוכונדריה קטן ממזג אותם לאלמנט המיטוכונדריה גדול 7. יתר על כן, היתוך חולף של שתי המיטוכונדריה עלול להתרחש כדי לאפשר הערבוב של תוכנם. אירועי הביקוע ואיחוי של ממברנות המיטוכונדריה הפנימיות וחיצוניות נשלטים בקפידה על ידי המפרטific קובע של חלבונים. מנגנון ביקוע הגרעין מורכב הקשורות dynamin חלבון 1 (Drp1), אשר גייס מן cytosol אל המיטוכונדריה ידי האינטראקציה שלה עם חלבונים המיטוכונדריה בתום לב מסוים (למשל, Fis1 או Mff1), בעוד פונקצית Drp1 יכולה גם להיות מוסדרת על ידי חלבונים אחרים על פני המיטוכונדריה 4. למרות Drp1 פועלת על הממברנה החיצונית, יכולות הביקוע שלה להשפיע על הקרום הפנימי גם כן. התזמור של הביקוע של ממברנות המיטוכונדריה חיצוניות ופנימיות אינו מובן היטב. מצד השני, פיוז'ן של הקרום הפנימי נשלט על הליבה על ידי הפעילויות של Opa1, בעוד mitofusins השולטים ההיתוך של 5-הממברנה החיצונית. יתרת אירועי הביקוע ואיחוי המנטרל של המיטוכונדריה להכתיב את צורת המיטוכונדריה היציבה בתא. לדוגמה, הדחקה של ביקוע המיטוכונדריה תביא היתוך שלם ללא התנגדות, בעוד יתר פעילות של המיטוכונדריהביקוע l יביא לפיצול של המיטוכונדריה 3.
המחקר של קשר מבנה פונקצית המיטוכונדריה כרוך בעיקר שתי גישות מחמיאות: א) מנתח של פנוטיפים הסלולר האורגניזם לאחר מניפולציה גנטית של חלבוני היתוך / ביקוע המיטוכונדריה ב) הערכות ישירות של מבנה המיטוכונדריה ותפקוד. ראוי לציין כי אנליזה גנטית לא תמיד לחשוף את הפונקציונליות הישירה של המולקולה בהישג היד (במקרה זה, חלבוני היתוך / ביקוע המיטוכונדריה), כמו פנוטיפים שעלולים להתעורר עקב השפעות משניות. לכן, זה הוא בעל חשיבות עליונה לפתח ולהשתמש בכלים כדי לחקור את המבנה המיטוכונדריה ותפקוד ישירות. כל הערכה של מבנה המיטוכונדריה כרוכה כלים מיקרוסקופיה שונים. שימוש מיקרוסקופ פלואורסצנטי של תאי חיים התקדם המחקרים מאוד של דינמיקה המיטוכונדריה, מאז הדינמיות המיטוכונדריה ניתן לנטר הן מבחינה איכותיות quantitatively באמצעות כלי מיקרוסקופ פלואורסצנטי המתאימים וטכניקות 8. כלי מיקרוסקופיה קרינה מבוססות פותחו כדי לחקור את המבנה המיטוכונדריה ותפקוד ברקמות תסיסנית חיות וקבועות, הבהרת המשמעות של הדינמיות המיטוכונדריה vivo 9. אלה ושיטות החישוב לסקר מתוארים כאן, עם המטרה של לימוד מבנה המיטוכונדריה ותפקוד בשחלה תסיסנית.
השחלה תסיסנית מורכבת שושלות בתאי מין וגם סומטיים, אשר נובעות בתאי גזע בוגרים שלהם שוכני germarium 10,11. שישה עשר בתאי הנבט סינסיציאלי (GCS) לקבל במארז ידי תאי זקיק סומטי (FCS) כדי ליצור תאי ביצה הפרט העולות מתוך germarium (איור 1). אחת מ -16 GCS לקבל מחויב להיות ביצית, ואת GCS 15 הנותר להתפתח לתאי אחות ששומרים על הגדילה של תא הביציתאת הקלת הבשלת הביצית לפני שהוא הניח. רוב FCS לעבור 9 סיבובים של חטיבות mitotic לפני שהם יציאת מחזור תא mitotic סופנים להתמיין שכבת תא אפיתל בדוגמת המורכבת תאי זקיק קדמי (AFCs), תאי זקיק אחורי (PFCs), ותאי גוף עיקריים (MBCs) . תאי הביצה הרצופים מחוברים באמצעות תאי גבעול, אשר הם מובחנים תאים נגזרים גם FCS בשלב המוקדם של התפתחות. צורת מיטוכונדריאלי מוסדרת על ידי Drp1 חלבון ביקוע המיטוכונדריה מעורב באופן פעיל בתהליך של התמיינות במהלך ההתפתחות הנורמלית של שכבת FC שחלות תסיסנית 9,12. שיטות שימוש במחקרים אלה כדי לזהות את המעורבות של Drp1 בפיתוח שכבת תאי זקיק תסיסנית מתוארות כאן.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. הכנת תסיסנית (הכלים הנדרשים מתוארים איור 2 א)
2. Dissection של תסיסנית השחלות (הכלים הנדרשים מתוארים איור 2 א)
3. הכנה למיקרוסקופיה Live-רקמה
הערה: הכלים הנדרשים מתוארים באיור 2A.
4. הקרינה והפסד Photobleaching (FLIP) Assay להעריך המשכיות מטריקס מיטוכונדריאלי
הערה: משכיות מטריקס מיטוכונדריאלי במבנה המיטוכונדריה התמזג מוקם לאחר ההיתוך המוחלט של ממברנות פנימיים וחיצוניים המיטוכונדריה בעקבות התקדמות דרך שלבי ביניים. ביקוע של המיטוכונדריה עשוי חזרו על אותן הפעולות אך בכיוון ההפוך (איור 3 א). FLIP הוא מיקרוסקופיה מבוססי זמן לשגות השיטה וכמותיות, שניתן להשתמש בהם כדי להעריך המשכיות מטריקס המיטוכונדריההמדינה התמזגו הסופית של vivo לשעבר המיטוכונדריה (שלבים 3 ו -4 ב איור 3 א) בשחלות תסיסנית חי 9. את assay FLIP מתבצע כאזור קטן של עניין (ROI) של המיטוכונדריה להביע מולקולת ניאון במטריצה המיטוכונדריה כי הוא photobleached במרווחי זמן קבוע (ROI FLIP באיור 3 א). כתוצאה מכך, בכל אזור המיטוכונדריה שמסביב כי היא רציפה עם ROI FLIP (ROI ניסיוני איור 3 א) יאבד אות בשל חילופי מולקולות במטריצה המיטוכונדריה הרציפה. ניסויי FLIP הפגינו כאן מבוצעים על תסיסנית מהונדסת מבטא mitoYFP, אשר מכיל את רצף מיקוד המיטוכונדריה של למקטע השמיני אדם ציטוכרום אוקסידאז מתויג עם YFP למקד אותו המטריצה המיטוכונדריה צורת diffusible בחופשיות. ניסוי דומה יכול גם להתבצע עם transgene מיטו pUASP-מיטו-GFP, כפי שדווח בעבר 9. פרוטוקול FLIP דומה ניתן להשתמש עם בדיקה ממוקדת במרחב הבין-הקרום המיטוכונדריה להיות מסוגל לזהות את משכיות נובע ההיתוך של החיצון אך לא את הקרומים המיטוכונדריה הפנימיים (שלב 2 ב איור 3 א).
5. מכתים חי עם צבעי מיטוכונדריאלי פלורסנט
הערה: מצב יציב מבנה המיטוכונדריה ופוטנציאל ניתן להעריך באמצעות צבעים המשלבים לתוך המיטוכונדריה במיוחד בתאים וברקמות חיים. יכול להיות מוכתם השחלות חיים תסיסנית vivo לשעבר עם המיטוכונדריה פלורסנטכתמים כדי להמחיש את המיטוכונדריה, להעריך מיני חמצן תגובתי המיטוכונדריה (Mito-ROS) ייצור, ועל מנת להעריך את פוטנציאל של המיטוכונדריה לכל המוני יחידה. ניתן להשיג זאת על ידי שיתוף מכתים עם אתיל אסתר tetramethylrhodamine לצבוע פוטנציומטרית המיטוכונדריה (TMRE) וכתם המיטוכונדריה תואם חי המייצג את מסת המיטוכונדריה (ראה לוח חומרים עבור צבעים ספציפיים).
דור 6. Drp1 Null פסיפסים
הערה: האסטרטגיה המשובטים משמש כאן מציגה חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP) שיבוטים -שלילית Drp1 null ברקע של רקע GFP חיובי, phenotypically wild-type כי הוא הטרוזיגוטיים genotypically עבור המוטציה Drp1 null 9. הלם-חום הנגרמת היעד הכרה flippase-flippase (FLP-FRT) רקומבינציה mitotic אתר ספציפי בתיווך יוצר שיבוטים הומוזיגוטים של אלל drpKG03815 null מבחינה תפקודית. הגנוטיפ של תסיסנית נושאת מוטצית Drp1 הוא drpKG03815 FRT40A / ארגון נוער קתולי, ואילו גנוטיפ נושאה את חום הלם-induced FLP (hsFLP) סמן משובט UbiGFP הוא hsflp; NLS-GFP היוביקוויטין (UbiGFP) 40A FRT / ארגון הנוער הקתולי. הגנוטיפ של seצאצאי lected של ההכלאה בין גנוטיפים לעיל הוא hsFLP / +; drpKG03815 FRT40A / UbiGFPFRT40A.
7. Co-immunostaining עבור Cyclin E ו המיטוכונדריה
הערה: כדי לזהות תסיסנית Cyclin E (dCyclinE), השתמשנו נוגדן מסחרי השיג שאותן עורר נגד dCyclinE 9 (ראה חומרי טבלה). כסמן המיטוכונדריה, השתמשנו נוגדן כנגד ATP-B (למקטע של המתחם synthase ATP במיטוכונדריה) 9.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
השיטות שתוארו ניתן להשתמש כדי לחקור את המבנה המיטוכונדריה ותפקוד שחלות תסיסנית חיות וקבועות (איור 2 ב). בתנאים כמה דוגמאות של תוצאות חזויות שהושגו עם השיטות שתוארו.
דיסקציה של השחלה תסיסנית: כאשר גזור נוסף, הבטן ניתקה (איור 3B) מן (איור 3 א) תסיסנית כולה צריכה לשחר...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
צעדים קריטיים בתוך הפרוטוקול
Photobleaching: מניעת photobleaching מופרזת של דגימות ניאון הוא הכרחי כדי ביצוע מיקרוסקופיה confocal יעיל. לכן, הזמן שלוקח לאתר דגימות דרך העינית או להגדיר פרמטרים רכישת התמונה דרך במצב סריקה בזמן אמת צריך להיות ממוזער כדי למזער photobleaching.
נזק לרקמות: מאז המיטוכונדריה נחשבים החיישנים של ב...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין אינטרסים כלכליים מתחרים.
אנו מודים ללינה פאטל ודיימונד וודארד על עזרתם בהכנת המדיום לדרוזופילה ולד"ר איגור צ'סנוקוב על מתן גישה לסטריאומיקרוסקופ המחובר למצלמה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| המדיה של גרייס (מדיום ניתוח חרקים) | פישר סיינטיפיק | 30611031-2 | |
| 41 Paraformaldehyde AQ | Electronic Microscopy Sciences | 50-259-99 | |
| Mitotracker Green (כתם מיטוכונדריאלי כולל) | Life Technologies | m7514 | Reconstruct and Aliquot |
| Tetramethylrhodamine ethyl ester perchlorate | Sigma Aldrich | 87917-25MG | Remake and Aliquot |
| MitoSox (כתם Mito-Ros) | Life Technologies | m36008 | Reconstruct and Aliquot |
| PolyLysine | MP Biomedicals | ICN15017625 | |
| בקבוקוני זבוב | פישר סיינטיפיק | AS-515 | |
| זבוב חרוטי | פישר סיינטיפיק | AS-355 | |
| זיזי בקבוקון זבוב | פישר סיינטיפיק | AS273 | |
| זבוב חרוטי פלגים | פישר סיינטיפיק | AS 277 | |
| ג'אזמיקס מזון דרוזופילה (מזון דרוזופילה) | פישר סיינטיפיק | AS153 | |
| סרום בקר אלבומין | סיגמא אולדריץ' | A9647-50G | |
| ציקלין E נוגדן (d-300) | סנטה קרוז | sc- 33748 | |
| נוגדן ATPB [3D5] - סמן מיטוכונדריאלי | AbCam | ab14730 | |
| Cy3 AffiniPure Goat Anti-Mouse IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 115-165-146 | |
| Cy5 AffiniPure Goat Anti-Rabbit IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 111-175-144 | |
| Hoechst | Fisher Scientific | H3570 | |
| VectaShield | Fisher Scientific | H100 | |
| Azer Scientific EverMark Select Microscope Slides | פישר סיינטיפיק | 22-026-252 | |
| כיסוי מיקרוסקופ זכוכית | פישר סיינטיפיק | 12-542-B | |
| מאט טק קורפ תחתית זכוכית Mircrowell צלחת | פישר סיינטיפיק | P35G-0-14-C | |
| שמרים מיובשים פעילים | פישר | ICN10140001 | |
| מיקרוסקופ קונפוקלי | קארל זייס | LSM 700 | |
| דומונט #5 מלקחיים | טכנולוגיות מדע עדינות | 11251-20 | |
| מחזיק סיכות מצופה ניקל מוריה | טכנולוגיות מדע עדינות | 26016-12 | |
| Minutien Pins | Fine Science Technologies | 26002-15 | |
| MYFP ( w[*]; P{w[+mC]=sqh-EYFP-Mito}3 ) | Bloomington Stock Center | 7194 | |
| Fly Pad | Fly stuff | 59-118 | |
| Blowgun | Fly stuff | 54-104 | |
| Blowgun needle | Flystuff | 54-119 | |
| Dissecting Microscope | Carl Zeiss | Stemi 2000 | |
| Analyses software | Carl Zeiss | Zen | |
| אנליזות תוכנה | פתוח | תמונה J | |
| מחקר מיקרוסקופ זום מאקרו | אולימפוס | MVX10 | |
| QICAM מהיר 1394 מצלמה דיגיטלית מקוררת, 12 סיביות, מונו | QImaging | QIC-F-M-12-C | |
| QCapture Pro 5.1 | QImaging |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה