Method Article

אפיון של אירועים קלציפיקציה שימוש אופטי חיה מיקרוסקופית אלקטרונים טכניקות בתוך ימית תולעת-שפופרת

DOI:

10.3791/55164

February 28th, 2017

In This Article

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

אנו מדגימים את השימוש בשיטות מיקרוסקופיה שונות השימושיות בהתבוננות בהסתיידות של תולעת צינור, Hydroides elegans, כמו גם באיתור ואפיון החומר המסוייד הראשון. מיקרוסקופיה חיה ומיקרוסקופ אלקטרונים משמשים יחד כדי לספק מידע פונקציונלי וחומרי החשוב בחקר ביו-מינרליזציה.

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

אפיון האירוע הראשון של ייצור ביולוגי של סידן פחמתי דורש שילוב של גישות מיקרוסקופיות. ראשית, ניתן לצפות בחלוקת pH תוך תאית ויוני סידן באמצעות מיקרוסקופיה חיה לאורך זמן. זה מאפשר זיהוי של שלב החיים והרקמה עם התכונה המעניינת למחקרי מיקרוסקופ אלקטרונים נוספים. שלב החיים והרקמות המעניינות בדרך כלל גבוהים יותר באותות pH ו-Ca.

כאן, באמצעות H. elegans, אנו מציגים פרוטוקול לאפיון נוכחותם של מבני סידן פחמתי בדגימה ביולוגית במיקרוסקופ האלקטרונים הסורק (SEM), תוך שימוש בספקטרוסקופיה של קרני רנטגן מפזרות אנרגיה (EDS) כדי להמחיש את הרכב היסודות, באמצעות עקיפה של פיזור אלקטרונים לאחור (EBSD) כדי לקבוע את נוכחותם של מבנים גבישיים, ושימוש במיקרוסקופ אלקטרונים הולכה (TEM) כדי לנתח את ההרכב והמבנה של החומר. בפרוטוקול זה, קרן יונים ממוקדת (FIB) משמשת לבידוד דגימות עם מימד המתאים לניתוח TEM. מכיוון ש-FIB היא טכניקה ספציפית לאתר, אנו מדגימים כיצד ניתן להשתמש במידע מהטכניקות הקודמות כדי לזהות את אזור העניין, שבו אותות Ca הם הגבוהים ביותר.

Introduction

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Biomineralization היא סדרה מורכבת של אירועים, אשר מגשרת חבילה של פעילות הסלולר וכתוצאה מכך הייצור של מינרלי הורה להפליא 1. האתגר הוא לאפיין הן את תהליך הסלולר הדינמי ואת המבנים מינרליים מתוחכמים באמצעות שילוב של שיטות מיקרוסקופיה אופטית האלקטרון. של העלאת ה- pH התוך-תאי מעדיף את היווצרות גבישים 3 קאקו, ומכאן, זיהוי שלב בחיים כי יש pH גדל מגלה בזמן הסתיידות עשוי להיות התרחשות 2, 3.

תולעי השפופרת ממשפחת Serpulidae הם calcifiers נפוץ בים 4. זהו גם מודל חסר חוליות פופולרי עבור מחקר ימי, במיוחד biofouling 5, 6. במחקר זה, התהליך של הסתיידות בתאי mineralizing דורותbiomineralization ng הוא ציין. התהליך המהיר של מטמורפוזה כולל את הופעתה של מבני סידן פחם 7, 8.

אנו מדגימים כיצד מדידות pH הפנימיות יכול להתבצע על תולעת-שפופרת, וכיצד שלבי חיים ורקמות רלוונטיות הסתיידות יכולים להיות מוקרנים. לאחר השלב של עניין החיים מזוהה, הרקמה האחראית הסתיידות ניתן לאפיין ברזולוציה גבוהה באמצעות שיטות מיקרוסקופיה אלקטרוניות. באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנטי, אנו קובעים את הזמן הדרוש סידן פחמתי להופיע לאחר אינדוקציה מותמרים. בשלב דומה של חיים לאחר מכן דמיין עם SEM-EDS להפצת רכב יסודות, ואת המינרלים שהופקדו נותחו באמצעות שתי שיטות מיקרוסקופיה אלקטרונית שונות, במיוחד SEM-EBSD ו FIB-TEM.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

הקרנת 1. לחי שלב רקמות עניין עם הדמיה חיה

  1. תרבות הזחלים הימיים כדי כשירות על פי שיטות שדווחו בעבר 6, 7, 9. דגירת הזחלים תולעת-שפופרת ב 5 זחלים לכל צפיפות מיליליטר עם מי ים מסונן עם 10 לילה לפני הצהריים מיקרומטר SNARF-1. מכסה את המכל עם רדיד אלומיניום על מנת להגן על בדיקת הניאון מ צילום לבן.
  2. שימו לב הזחלים באמצעות מיקרוסקופ לנתיחה. זחלים תולעת-שפופרת מוסמכת מוכנים מטמורפוזה ישחו בכיוון קדימה במקום בתנועה מעגלית.
  3. מעביר את הזחלים המוסמכים רשת 60 מיקרומטר. לחץ על הרשת נגד בצלחת פטרי, מתן גושפנקא טובה לשמור על נוזלים. לשחרר את החותם במהירות לשחרר וזורק את מי הים המכיל צבע פלואורסצנטי, שמירה על הזחלים.
  4. שטוף את הזחלים עם מי ים מלאכותי מסונן (FASW) פעמים, רשםונזהר שלא לייבש את הזחלים בתהליך.
  5. מניחים 10 עד 20 הזחלים מנות תחתית זכוכית דקה עם 5 מ"ל של FASW המכיל 10 -4 M isobutylmethylxanthine (IBMX) לצורך השגחה של תהליך המטמורפוזה.
  6. הכנס את הקוביות המסננות לזיהוי אות SNARF-1 (ערוץ 1: 580/30 Em 510/25 Ex; ערוץ 2: אקס 510/25 Em 640/35), ותמונת דסק"ש של הזחלים.
  7. מקם את זחלי מטמורפוזה תחת מטרת 20X, ואז, לייעל את זמן תריס (100-300 ms) מהיר מספיק כדי להבטיח תמונה ברורה של בעלי החיים היא נתפסה.
  8. גדר 1 מיקרומטר מרחק ללכוד Z-ערימה של כל שלושת הערוצים, כאשר הדמיה חייה, הדמיה כל שכבה עבור כל שלושת הערוצים לפני שעברתי את השכבה הבאה של z-הכיוון יאפשר מתאם טוב יותר בין ערוצים.
  9. תמונות גוניות אפורות יצוא עבור כל הערוצים והשכבות כקבצי TIF מתוכנת מיקרוסקופ: קובץ | יצוא | סוג TIF קובץ | הַתחָלָה.
  10. באמצעות ImageJ, im נמל את התמונה ברצף עבור כל ערוץ: קובץ | ייבוא ​​| רצף תמונה.
    1. כדי לייבא ערוץ 1 λ 1 em, הזן החל תמונה 3 ו תוספת: 4.
    2. כדי לייבא ערוץ 2 λ 2 em, הזן החל תמונה 4 ו תוספת: 4.
  11. צור תמונה מורכבת על ידי חלוקת λ 2 em ידי em λ 1 עבור כל פיקסל שכבה בפיקסל (תהליך | מחשבון תמונה ... | קובץ תמונה 640 ננומטר "פרד" קובץ תמונה 580 ננומטר), כלומר 640/580 ננומטר יחס.
  12. תמונה בחר | שולחנות בדיקה | 16 צבעים.
  13. בחר לנתח | כלים | בר כיול.
  14. בדוק את השכבות השונות, זיהוי השכבה המכילה את ההטרוגניות ביותר. זה מספק את המידע השימושי ביותר בנוגע לחלוקת pH הפנימית.
  15. באמצעות הקשר בין יחס 640/580 ננומטר ו- pH, לבנות פרופיל עלילה כדי להמחיש את ההפצה של ה- pH הפנימי.

= "Jove_title"> 2. כיול הפנימי pH

  1. לאחר מכתים לילה של 20 זחלים על עם 10 מיקרומטר SNARF -1 לפנות בוקר, להוסיף פתרונות המניות של nigericin ו KCl לפצות 50 מיקרומטר nigericin ו -150 מ"מ KCl לכיול.
  2. התאם את ה- pH של AFSW כיול עם לדלל NaOH או HCl, עד pH בסביבות 5.9 מושגת. הערת ערך ה- pH המדויק. מדד pH עם מד pH עם אלקטרודות זכוכית כי כבר מכויל על ידי מי ים מבוסס 2-אמינו-2-hydroxymethyl-1,3-propanediol (טריס) ו -2-aminopyridine 9.
  3. העבר הזחלים תולעת-שפופרת מוכתם אחד יחד עם נוזל עם pH ידוע מאכל יבש ונקי למדידת עוצמת האותות ב 640 ננומטר ו 580 ננומטר.
  4. חזור על שלבי 2.2 ו -2.3 לעוד ארבע נקודות pH הנעות בין 5.9 כדי 9.9. הם מייצגים מגוון של ערכים רלוונטיים מבחינה פיזיולוגית.
  5. בדוק כדי להבטיח את האותות מופיעים הומוגנית בכל הגוף החי. זה מצביע על כך pH התאי כבר דוארquilibrated עם מי הים הסביבתי.
  6. תמונה הזחלים תולעת-שפופרת בחמש סביבות pH מי ים שונים, להקליט בעוצמות כפי שמוצג "ערכי אפור" ב 640 ננומטר ב 580 ננומטר, כלומר, ללא וללא λ 2 ו λ 1 EXC.

3. ניתוח של ratiometric הדמיה נתונים

  1. הזן את הערך האפור כפי שהן נמדדות בחמישה מוקדים אקראיים או משטח של ריבית על בגיליון אלקטרוני.
  2. סמן כדי לראות את כיול חמש נקודות הראה קשר ליניארי כדי לציין pH התאי (למשל, משוואה כמו y = 0.30x - 1.47; y = ערך אפור; x = pH; R² = 0.934).
  3. חשב את ערכי ה- pH תוך-תאים מהמשוואה באמצעות היחס העוצם ננומטר 640/580 הנמדדים צעד 1.13.

שימור לדוגמא 4., התייבשות שמה עבור במיקרוסקופ אלקטרונים

  1. לשמר את שלב החיים של עניין עם paraformaldehyde 4%. במחקר זה, לתקן את וזרוע-רגליים 2-4 ימים לאחר מצורף, לשמור על בעלי החיים מקבעים עד ניתוח.
  2. עבודה במנדף, שלאחר לתקן את הדגימה עם בתמיסה מימית tetroxide אוסמיום 1% למשך 30 דקות כדי למזער הצטמקות רקמות במהלך תהליך התייבשות.
  3. מייבש את הדגימה עם סדרת אתנול מדורגת: אתנול 50% במשך 5 דקות, 70% אתנול למשך 5 דקות, 85% אתנול למשך 5 דקות, 95% אתנול למשך 5 דקות, ואתנול המוחלט ולבסוף למשך 5 דקות פעמים.
  4. עבודה במנדף, להוסיף 1: 1 פתרון של אתנול hexamethyldisilazane (HMDS) כדי הדגימה, המאפשר לנוזל להתאדות לגמרי.
  5. ב למכסה המנוע קטר, להוסיף 100% HMDS כדי הדגימה, המאפשר לנוזל להתאדות לגמרי.
  6. בעזרת סכין יהלום, להציג כמה חתכים כדי בצלחת התרבות, סביב כמה וזרוע-רגליים. מכוסה במכסה, להחזיק בתחתית הצלחת נגד בדל אלומיניום לשבור את המנה.
  7. תחת מיקרוסקופ לנתיחה, למצוא פיסת שבר המכיל תולעת-שפופרת ללא פגע.
  8. החל צבע כסף אל בדל אלומיניום ולאבטח את שבר את הבדל בזהירות. צבע מסביב לקצוות של שבר הפלסטיק להפחית טעינה.

5. איתור סידן עשיר אזור באמצעות SEM-EDS

  1. אבטח את בדל הדגימה על בעל המדגם.
  2. למדוד את גובהם של כל המכלול נגד המד מסופק עם מיקרוסקופ, התאמה גובה על ידי שחרור מכונת כביסת הנעילה והסיבוב לכתוב עד הדגימה היא בגובה רגיל, או להזין את הגובה כפי שנרשם.
  3. תודה אוויר לתוך תא חליפי מיקרוסקופ וסובב את דלת החדר פתוחה. החלק את מחזיק מדגם אל הקצה של המוט החליפין. ואז לסגור ולפנות את החדר.
  4. פתח את שסתום השער והחלק את מוט החליפין כלפי תא מיקרוסקופ. חלק את מוט החליפין כל הדרך להושיב בעל המדגם במלואו לתוך במת מיקרוסקופ. הסר את מוט החליפין ולסגור את שסתום השער.
  5. t קלטהוא לדגום ממדים ולשלוח הבמה לעמדה מוצא למקום המדגם מתחת לעמודת האלקטרונים.
  6. הגדר את רמת הוואקום הקאמרית 20-30 Pa במצב VP-SEM. הגדר את מתח מאיץ האלקטרונים עד 20 ק"ג ולהפוך את המתח הגבוה על.
  7. הרם את הבמה כדי מרחק עבודה מדגם של 10 מ"מ. רוכש בשידור חי ולאתר את הדגימה. למטב את התמונה התאמת אסטיגמציה ולהתמקד כנדרש.
  8. פתח את התוכנית SEM-EDS ובחר באפשרות מצב EDS-SEM. בחר באפשרות התפריט לרוץ מפת EDS.
  9. עדשה קבל שינוי והגדרות צמצם כדי להשיג זמן באישון ~ 30% בכל פעם בתהליך של 3 כמו נוטרו באמצעות מד השיעור בתכנית SEM-EDS. הפעל נהלי יישור קורה צמצם לאחר ביצוע שינויים בהגדרות קורות.
  10. בחר גדלה כך אורגניזם יחיד ממלא את השדה כולו מבט. הפעל את אפשרות תיקון ההיסחפות ללכוד תמונה בתכנית SEM-EDS.
  11. רוכשת map נתונים עם האורגניזם למלא את השדה כולו מבט, באמצעות להתעכב זמן של 50-100 ms. הפעל את המפה עד הנתונים מראים לוקליזציה ברורה של Ca בתוך האורגניזם (כ -15 דקות).
  12. כדי לקבל נתונים נקודים-כימות, לשנות את שעת התהליך עד 6 ולהתאים את חללית האלקטרונים לרכוש זמן באישון ~ 30%. הפעל צעדי יישור למטב את התמונה לפי צורך.
  13. בחר את הצבע אפשרות זיהוי בתוכנית SEM-EDS ולרכוש תמונה אחרת. באמצעות כלי נקודה האחת, לחץ על אזורים שהופיעו Ca עשיר במפת EDS, וכן שטחי Ca לקויים להשוואה. סרוק כל נקודה במשך זמן חיים של 30 שעות.

6. זיהוי מידע קריסטלוגרפיים של אזורים עשירים בסידן שימוש SEM-EBSD

  1. הסר דגימה המכיל שבר פלסטיק עניין מצד בדל דגימה שטוח להדביק על הפנים המשופעים של בדל 45 ° מראש מוטה באמצעות דבק מוליך כסף.
  2. הברג את הבדל על מדגם hמבוגרים ומצב הפנים זוויתי של הבדל (עם דגימה) לכיוון החלק הקדמי של בעל המדגם. הכנס את בעל המדגם לתוך התא של המיקרוסקופ באמצעות תא החליפין.
  3. הגדר את הוואקום הקאמרי 30 אבאי אלקטרונים מאיצים מתח עד 20 קילו. שלח המדגם מתחת לעמודה אלקטרונים להטות את הבמה 25 ° למקם את השטח מדגם כ 70 ° מנורמאלית אלומת אלקטרונים. סובב את המתח הגבוה על.
  4. הרם את הבמה כדי מרחק עבודה של ~ 18 מ"מ. השתמש העקיבה כדי להזיז את הבמה לאתר דגימה. הגדל את ההגדלה להפליל תכונות ספציפיות של עניין. יישר את הקורה כדי למטב את התמונה לפי הצורך.
  5. פתח את התוכנית SEM-EDS במצב EBSD. קלציט בחר ארגוניט כמו שלבים של עניין. הכנס את המצלמה EBSD ממרחק של 154 מ"מ. גדר תנאי מצלמת 1 x 1 binning ועת מסגרת 100 ms. באמצעות סריקת קרן מהר, לרכוש רקע.
    הערה: קצב פריימים שונהייתכן שיידרש בהתאם חללית האלקטרונים; להתאים את מסגרת דולר בדיקה או מצלמה כדי להשיג אות של 90% על.
  6. צילום תמונה בתוכנית SEM-EDS. השתמש בכלי במקום ניתוח ולחץ איפשהו על התמונה כדי לסרוק את הקורה בעניין זה. שים את חלון המצלמה כדי לראות אם בכלל דפוסי קיקוצ'י מזוהים.
  7. לחץ על אזורים שונים של התמונה כדי לסרוק אתרי הסתיידות פוטנציאל, התבוננות בחלון המצלמה בכל נקודה כדי לראות אם להקות קיקוצ'י נוכחות. אם דפוסי נוכחים ומתאימים לכל השלבים שנבחרו במסד הנתונים, הם יהיו צמודים באופן אוטומטי.

7. הכנת דוגמאות TEM שימוש FIB-SEM

  1. גמגום מעיל הדגימה SEM מוכן עם פלטינה או חומר דומה כדי ליצור שכבת מוליך.
    1. מניח את הקבוע בעבר, מיובש, רכובות דגימות לתוך הדיור של coater הגמגום ולהפוך את הכח על מנת להתחיל שאיבת התא למטה.
    2. לאחר הוואקום הקאמרי קורא 40 mTorr או פחות, סובב את מתג הגז על ולהגביר את זרימת גז הארגון להגיע לחץ קאמרי של 200 mTorr. התאם את זרימת הגז להשיג לחץ קאמרי סופי של 80 mTorr.
    3. סובב את מתג המתח על ולהגדיל את המתח להגיע זרם של 15 אמפר. כיוונתי את הטיימר ואת המעיל במשך זמן רב (~ 10 דקות) כדי ליצור שכבה עבה (~ 60 ננומטר) המגן על משטח הדגימה מפני נזק קרינה יון. להסדיר את המתח לשמור על הנוכחי יציב 15 mA.
    4. לאחר שסיים, כוח במורד coater כדי לשחרר את הוואקום ולהסיר המדגם.
  2. בורג בבסיס המוכן, גמגום מדגם מצופה על פוסט בורג M4 של בעל מדגם מכשיר. הדק עד יד חזקה, לשחרר את אום הנעילה, ולאחר מכן לסובב את הפוסט בעל מדגם כדי לשנות את הגובה של האסיפה. השתמש מד לייזר גובה ולהתאים את גובה להיות בתוך 1 מ"מ (= 0.04 אינץ ', כפי שהיא מוצגת בסרט) של supplie תקןד עם המכשיר.
  3. סגור את כל שסתומי אקדח FIB-SEM, ולאחר מכן להודות אוויר לתוך מנעל האוויר הבמה eucentric. לאחר הלחץ השווה עם הסביבה, חלק באוויר לנעול פתוח להדביק לבעל המדגם על החוד של מוט החליפין. סובב את הכפתור על קצה מוט החליפין למצב "הנעילה". סגור את מנעול האוויר ולפנות את תא מנעול האוויר.
  4. לאחר נעילת אוויר הבמה eucentric פונתה והלחץ תואם לזה של תא FIB-SEM, פתח את שסתום השער ולהכניס את המדגם על ידי לדחוף פנימה את מוט החליפין. החלק את מוט החליפין עד הסוף להושיב בעל מדגם בשלב מכשיר eucentric, ולאחר מכן סובב את מוט החליפין לתפקיד "הנעילה". החלק את מוט החליפין בחזרה החוצה ולסגור את שסתום השער.
  5. הזז את הבמה כדי למקם את המדגם תחת עמודת אלומת יונים. פתח את שסתומי השער לרכוש תמונת אלקטרונים משניים חייה-induced יון של FIB. השתמש הגדלה לשפלהסריקה סריקה מהירה כדי למזער את הנזק יון. אפס את המיקוד של קורה התצפית הנורמלי להעלות את גובה Z הבמה עד המדגם הוא בפוקוס. בשלב זה המדגם נמצא במיקום הצולב לנקודה שבה הן יון קורות האלקטרונים מתמקדים באותו המקום.
  6. שימוש בתמונה אלקטרונים מהשתיים מן SEM, לאתר את האזור של עניין הדגימה, באמצעות כדור העקיבה כדי להעביר את הדגימה סביב. תחומי העניין הם אזורים עשירים Ca כפי שנקבעו בעבר על ידי מיפוי EDS. סובב את הבמה לפי הצורך כדי לקבל את התכונות של עניין עולה בקנה אחד עם המסגרת של החלון.
  7. בממשק של חלון FIB, ללכוד תמונת מצב מהירה של הדגימה בהגדלה של 1,000X עם זום דיגיטלי נוסף 2X ולהסיק תבנית בתצהיר ~ 8 מיקרומטר x 2 מיקרומטר על פני השטח של עניין. גודל ההגדלה של התיבה בתצהיר עשוי להיות מותאם כדי להתאים תכונות בגדלים שונים. הגדר את תנאי הגמגום להפקיד הפחמן באמצעות 40 קקרן, 0.09 NA, באמצעות להתעכב זמן של 0.5 מיקרו-שניות למשך 5 דקות.
  8. לאחר בתצהיר של פחמן, לשנות את התנאים בתצהיר להפקיד טונגסטן באמצעות 40 kV, 0.7 קרן נה, והפקדה במשך 5 דקות כדי ליצור כובע טונגסטן ~ 2-3 מיקרומטר.
  9. לכידת תמונת מצב FIB באמצעות קרן תצפית להשתמש בכלי גמגום microsampling לצייר דפוס של ארבע קופסאות סביב הפקק טונגסטן. הגדר את התיבות העליונות ותחתונות להיות כ -15 מיקרומטר x 8 מיקרומטר; בתיבת 10 מיקרומטר התקינים x 5 מיקרומטר, ואת מיקרומטר תיבת 6 עזבה x 5 מיקרומטר, או גדולה מספיק כדי להקיף את השטח של עניין.
    1. לשנות את תנאי ייצור לחתוך באמצעות 40 ק, 19 קרן נה, ו להתעכב זמן של 50 מיקרו-שניות, ו 3-4 מסגרות הסריקה עבור כל התיבה. ואז לפברק דפוס. לאחר ייצור, שטח של עניין, עם שכבות C ו- W מגן, ידמה אי, עם כל החומר הסמוך הסיר על למעלה, למטה, ובצד ימין.
  10. הטה את הבמה 58 ° לשים את sample משטח נורמלי לעמודת האלקטרונים בזווית תלולה לעמודת היון. אתר את הישבן של מדגם "האי" באמצעות FIB וללכוד תמונה בהגדלה 1,000X וזום דיגיטלי 2-4X.
  11. צייר ~ 15 מיקרומטר x 2 מיקרומטר דפוס גמגום מעל החלק התחתון של הישבן של המדגם "האי", בסוף מאוד של איפה זה גלוי. לפברק את התיבה באמצעות קרן 4 NA במשך 3 דקות, או עד הקורה קצץ הדרך התחתונה של המדגם "האי".
  12. הטה את הבמה eucentric -58 ° ממיקומו הנוכחי (חזרה לאפס). הכנס את החללית טונגסטן microsampling ידי לחיצה על "בדיקה" בממשק FIB. בחר "MS" בלוח הבקרה בשלב ולהשתמש העקיבה כדי להזיז את החללית על פני החלק העליון של הדגימה.
  13. רוכש בשידור חי מן FIB בהגדלה של 1 kx ומקם את החללית כך הטיפ הוא בדיוק מעל הצד הימני של המכסה טונגסטן של microsample. בשעה שצפה בשידור חיSE תמונה מתוך SEM, משתמשת ידית שליטת Z של לוח הבמה כדי להוריד את החללית עד קשר כובע טונגסטן. זמזם יישמע פעם יצירת קשר.
  14. לכידת תמונה באמצעות FIB באמצעות קרן 40 kV, 0.01 NA, בהגדלה של זום דיגיטלי 1,000X ו 2X. השתמש בכלי בתצהיר כדי ליצור תיבת 2 מיקרומטר x 2 מיקרומטר מעל הקצה של החללית בו יצר קשר עם כובע טונגסטן של microsample.
    1. הגדר את התנאים להפקיד טונגסטן באמצעות 40 kV, 0.09 קרן נה, למשך 2 דקות ו להתעכב זמן של 0.5 מיקרו-שניות. ואז לפברק דפוס.
  15. צייר דפוס גמגום ~ 2 מיקרומטר x 5 מיקרומטר על הקצה השמאלי של microsample "זרוע" (שם הוא עדיין מחובר את חלק הארי של המדגם). לפברק הדפוס באמצעות 40 kV, 0.7 קרן נה, למשך 2 דקות, או עד הצפצוף עולה כי microsample כבר מנותק מן המדגם בתפזורת.
  16. השתמש ידית שליטה Z להעלות את החללית עם microsample המצורפת עדזה מנקה את המדגם בתפזורת, ולאחר מכן לחזור החללית. שלח במת eucentric משני הבית או עמדת Exchange.
  17. מניח חצי רשת נחושת לתוך מחזיק כניסת צד ולטעון בעל החדרת הטיהור בשלב הכניסה בצד. לפנות את התא והכנס את בעל כניסת הצד. הגדר את הבעל לתפקיד FIB.
  18. לחץ Side בלוח הבקרה בשלב ולהשתמש העקיבה להביא את הרשת במחצית לשדה הראייה בצג FIB. זוז לנקות שטח של הרשת חצי ולהשתמש ידית Z להביא את המשטח אל מוקד.
  19. לחץ בדיקה כדי להחדיר את המכשיר, לחץ MS בלוח הבקרה הבמה, ולהשתמש כפתור העקיבה ו- Z כדי למקם את microsample על גבי רשת חצי. מנמיכים את החללית עד המגעים microsample לרשת.
  20. לכידת תמונה על FIB בהגדלה 1,000X (זום 2X). השתמש בכלי בתצהיר ולצייר ~ 10 מיקרומטר x דפוס 3 מיקרומטר על הצד התחתון של microsample. טונגסטן פיקדון עם קרן 40 kV, 0.7 NA, באמצעות להתעכב tIME של 0.5 מיקרו-שניות במשך 3 דקות.
  21. השתמש גמגום כלי לצייר קטן 1 מיקרומטר x 3 מיקרומטר דפוס מעל קצה של החללית. לפברק דפוס באמצעות 40 kV, 0.7 NA הקורה בכל להתעכב זמן של 3 ms כדי לחתוך את החללית מן microsample. לחזור חללית פעם בחינם.
  22. לכידת תמונה FIB בהגדלה 5,000X ולצייר שתי תבניות גמגום 7 מיקרומטר x 4 מיקרומטר בחלק העליון והתחתון של microsample, השארת רווח מיקרומטר ~ 1 בין הקופסאות. מרכז את הדפוסים כדי לא לחתוך את הצדדים על ימין ועל שמאל של microsample. לפברק הן תבניות באמצעות 40 kV, 4 NA הקורה, ואת להתעכב זמן של 3 מיקרו-שניות, 2 דקות, הגדרת סריקה כיוון לעבר מרכז של microsample.
  23. לכידת תמונה אחרת באמצעות קרן תצפית FIB ב 5,000X. שינוי גודל קופסות הגמגום הקודמת ~ 6.5 מיקרומטר x 1 מיקרומטר, להתקרב יחד כדי להשאיר פער של ~ 0.5 מיקרומטר, לפברק באמצעות 40 kV, 0.7 קרן נה.
  24. הטיה לצד הכניסה הבמה 0.5 ° וכובעture אחר תמונה FIB. שינוי גודל קופסות הגמגום עד 6 מיקרומטר רחב. מקם את הדפוס העליון על הצד העליון של microsample לפברק באמצעות קרן 40 kV, 0.7 NA. הטה -0.5 ° וחזור עם דפוס גמגום התחתון בצד התחתון של microsample.
  25. בהמשך להקטין את רוחב התבנית על ידי ~ 0.5 מיקרומטר. הטה 0.5 ° גמגום בצד העליון של microsample באמצעות קרן 40 kV, 0.09 NA. חזור עם הצד התחתון ב -0.5 ° הטיה.
  26. הטה את ° הבמה 2.2 ולרכוש תמונה FIB ב 10,000X. שינוי גודל תבניות גמגום עד 5 מיקרומטר רחב ולשנות תנאי קרן עד 5 kV, 0.03 NA. מקם את התבנית העליונה מעל בצד העליון של microsample, ממש עד הקצה העליון, לפברק. הטה -2.2 ° וחזור עם הצד התחתון דפוס תחתון.
  27. חזור 5 צעדים טחינה kV עד microsample הופך אלקטרונים שקוף (~ 100 עובי ננומטר). לאחר שסיים, gunvalves הקרוב ולהסיר בעל כניסת צד.

8. Obtaining תבנית השתברות האזור שנבחר על TEM

  1. כדי להכין את המכשיר לניתוח, למלא היא דיואר צנצנות עם חנקן נוזלי ולהגדיר את המתח המאיץ ל -300 קילו.
  2. לאחר הכנת המדגם באמצעות FIB, להסיר את בעל כניסת צד מן FIB-SEM ולהתאים את המיקום סיכה כאלה כי אורך בעל תואם לזה של 300 קילו וולט TEM. סובב את הקצה בעל לעמדת התצפית הנכונה, שוב השוואתה בעל TEM הסטנדרטי כדי להבטיח אורינטצית מדגם נכונה.
    1. לחלופין, הסר את הרשת במחצית עם lamellae המצורפת מבעל FIB-SEM ומניחים בעל TEM סטנדרטי.
  3. טען את בעל מדגם לתוך תא החליפין של TEM ולפנות את החדר. ודא כי שסתום אקדח המכשיר נסגר האוויר הודה לתוך תא החליפין. לאחר קאמרית החליפין שאובים למטה, אזעקה נשמעת תישמע. סובב עם כיוון השעון בעל מדגם ולאפשר vacuאממ למשוך בעל המדגם ב למיקום התחנה הראשון.
  4. אפשר ואקום למכשיר להתאושש, ולאחר מכן פתח את שסתום אקדח. אפס את המיקוד גדל של גדלה של כ 10,000X.
  5. השתמש ידיות יישור להסיט את אלומת למרכז המסך זרחן. חוזה ולהרחיב את הקורה ולוודא שכל תנועת הקורה קונצנטריים. כוונן עבור stigmatism הקבל לפי הצורך.
  6. סובב את בעל מדגם השעון ולאפשר ואקום כדי למשוך את בעל במלואו לתוך הטור. השתמש ידיות התנועה הבמה כדי לנווט ולאתר המדגם.
  7. הגדל הגדלה על המדגם ולהתאים את גובה Z עד המדגם הוא בפוקוס. השתמש העיניים האופטית לפי צורך.
  8. הכנס את המצלמה ולהסיר את מסך זרחן. להרחיב את קרן הפרטים הדרושים על מנת למנוע oversaturating המצלמה. שנה את הפרמטרים של מיקוד ואת המצלמה, ולאחר מכן להתחיל רכישה ללכוד תמונה.
  9. כדי לרכוש תבנית עקיפה, מרכז ראשוןתכונה של עניין. הסר את צמצם המטרה והכנס את הצמצם העקיף.
  10. שינוי מצב העדשה העקיף על ידי לחיצה על כפתור DIFF בלוח הבקרה ולהשתמש ידית שליטת השוואה על לכווץ את הקורה.
  11. הכנס את השמיכה ככל שתידרש כדי למנוע במרכז הדפוס העקיף מהשריפה במסך המצלמה או זרחן. התחל רכישת המצלמה כדי ללכוד תמונה של התבנית.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

להלן כמה תצפיות של תהליך הסתיידות במהלך המטמורפוזה של תולעת-שפופרת. איור 1 מראה כי ערכי ה- pH ליד אזור צווארון גבוה ברקמות אחרות לאחר מטמורפוזה. 2i האיור מראה תולעת-שפופרת עם חלוקה הומוגנית של Ca, דבר מצביע נקבעה אירועי הסתיידות גדולים החלו; איור 2ii תערוכות תולעת-שפופרת אשר מסויד לתקופה ארוכה יותר, דבר המצביע על הסתיידות כבר עבר את נקודת הזמן של עניין; איור 2iii תערוכות תולעת-שפופ...

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

דימות אופטי Live הוא שיטה יעילה עבור התבוננות אירועים הסלולר ב אורגניזם רב-תאי. הנה, יון pH וסידן פנימי אינדיקטורים שימשו למדידת השטף של יונים באתרי מינרליזציה. באזורים אלה, יון שאיבה פעילה נדרשה להעלות pH ו Ca 2 + ריכוז לאפשר הסתיידות 2, 3. כאשר פונים מולקולות ניאון ללמוד אורגניזם, זה הוא קריטי על מנת להבטיח כי ריכוז בשימוש יש רעילות זניחה ומאפשר האורגניזם לבצע באופן רלוונטי מבחינה פיזיולוגית. ריכוז מכתים תחתון...

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

למחברים אין מה לחשוף.

Acknowledgements

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

המחברים מבקשים לשלוח תודה גדולה ל-Clemson Broadcast Productions, הקלטת אודיו מאת ג'יי ברייט, קריינות מאת א.ד. מקוויסטון, המתקת אודיו, ק. מרפי, צילום וידאו מאת ג. ספאק, אמנות גרפית מאת ט. מסרווי, עריכת וידאו על ידי ט. מסרווי וא. רוג'רס. הסיוע הטכני והייעוץ המדעי קיבלו השראה מעצותיהם של ס. קוואדה, ס. קובו, ג'יי הדסון, ט. דרודי, ד. מולווי, ה. קיאן, י. ו. לאם, מ. ב. ג'ונסטון, ק. קמפנטי, א. ק. ליין ור. דינשרם. מחקר זה מומן על ידי שלושה מענקי GRF מ-HKSAR-RGC (מספרי מענקים: 705511P, 705112P ו-17304914).

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials


List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
הקסמתילדיזילאזאן מדעי מיקרוסקופיה אלקטרונית16700 (EM)
אוסמיום טטרוקסיד 2% תמיסה מימיתמדעי מיקרוסקופיה אלקטרונית19192
IBMX 3-Isobutyl-1-methylxanthineThermoFisher ScientificPHZ1124
ניגריצין, חומצה חופשיתThermoFisher ScientificN7143-5MG
צלחת בקוטר 35 מ"מ, גודל חור 27 מ"מ, זכוכית מס' 0, ללא ציפויThermoFisher ScientificD110400
5-(ו-6)-Carboxy SNARF-1, Acetoxymethyl Ester, אצטטThermoFisher ScientificC-1271
BDH אשלגן כלורי, ACS כיתהVWRBDH0258-500G
דרגת ריאגנט, סיגמא גבישיP6148
1 M חומצה הידרוכלורית לניתוח נפחיWako Pure Chemical תעשיות, בע"מ083-01095
0.05 מ' תמיסת נתרן הידרוקסיד לניתוח נפחיWako Pure Chemical Industries, Ltd199-02185
CalceinSigmaC0875
FASWIwaki Co. Ltd.מעורבות תאית ימית
קוטר 47 מ"מ, 0.45 ומיקרו; mADVANTECA045A047A
אתנולWako Pure Chemical Industries, Ltd051-00476
מי ים מלאכותייםלפי SOP06 של DOE (1994), cdiac.ornl.gov/ftp/cdiac74/sop06.pdf
נתרן כלוריWako Pure Chemical Industries, Ltd191-01665
אשלגן כלוריWako Pure Chemical Industries, Ltd163-03545
מגנזיום כלוריד הקסהידראטWako תעשיות כימיות טהורות, בע"מ135-00165
סידן כלורידWako תעשיות כימיות טהורות, בע"מ039-00475
נתרן גופרתיWako תעשיות כימיות טהורות, בע"מ197-03345
חומצה הידרוכלוריתWako תעשיות כימיות טהורות, בע"מ089-08415
2-אמינו-2-הידרוקסימתיל-1,3-פרופנדיול (טריס)Wako Pure Chemical Industries, Ltd207-06275
2-aminopyridineWako Pure Chemical Industries, Ltd011-02775
אוריון 5 כוכבים פלוס מד pHThermo Scientific
PrpHecT ROSS מיקרו שילוב pH אלקטרודה 8220BNWPThermo Scientific
Axiovision, גרסה 4.6, Axio Observer Z1Zeiss
ImageJNIH, Bethesda, MD, ארה"ב
HRTEM H500Hitachi
SU6600 VPSEMHitachi
NB5000 מערכת קרן יונים ואלקטרונים ממוקדת (FIB-SEM)היטאצ'י 
Paraformaldehydeממברנות אסטר ריי-סי; למאגרים

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Aizenberg, J., et al. Skeleton of Euplectella sp.: structural hierarchy from the nanoscale to the macroscale. Science. 309 (5732), 275-278 (2005).
  2. de Nooijer, L. J., Toyofuku, T., Oguri, K., Nomaki, H., Kitazato, H. Intracellular pH distribution in foraminifera determined by the fluorescent probe HPTS. Limnol Oceanogr Methods. 6 (11), 610-618 (2008).
  3. de Nooijer, L. J., Langer, G., Nehrke, G., Bijma, J. Physiological controls on seawater uptake and calcification in the benthic foraminifer Ammonia tepida. Biogeosciences. 6 (11), 2669-2675 (2009).
  4. Smith, A. M., Riedi, M. A., Winter, D. J. Temperate reefs in a changing ocean: skeletal carbonate mineralogy of serpulids. Mar Biol. 160 (9), 1-14 (2013).
  5. Carpizo-Ituarte, E., Hadfield, M. Stimulation of metamorphosis in the polychaete Hydroides elegans Haswell (Serpulidae). Biol. Bull. 194 (1), 14(1998).
  6. Bryan, P. J., Kreider, J. L., Qian, P. Y. Settlement of the serpulid polychaete Hydroides elegans (Haswell) on the arborescent bryozoan Bugula neritina (L.): evidence of a chemically mediated relationship. J Exp Mar Biol Ecol. 220, 171-190 (1998).
  7. Chan, V. B. S., et al. Evidence of compositional and ultrastructural shifts during the development of calcareous tubes in the biofouling tubeworm, Hydroides elegans. J. Struct. Biol. 189 (3), 230-237 (2015).
  8. DOE. Handbook of methods for the analysis of the various parameters of the carbon dioxide system in sea water. Version 2. Dickson, A. G., Goyet, C. , ORNL/CDIAC-74 (1994).
  9. Chan, V. B. S., et al. Direct deposition of crystalline aragonite in the controlled biomineralization of the calcareous tubeworm. Front Mar Sci. 2, 97(2015).
  10. Bond, J., Varley, J. Use of flow cytometry and SNARF to calibrate and measure intracellular pH in NS0 cells. Cytometry A. 64, 43-50 (2005).
  11. Lloyd, G. E. Atomic number and crystallographic contrast images with the SEM: a review of backscattered electron techniques. Mineral Mag. 51, 3-19 (1987).
  12. Perez-Huerta, A., Dauphin, Y., Cuif, J. P., Cusack, M. High resolution electron backscatter diffraction (EBSD) data from calcite biominerals in recent gastropod shells. Micron. 42 (3), 246-251 (2011).
  13. Bandli, B. R., Gunter, M. E. Electron backscatter diffraction from unpolished particulate specimens: examples of particle identification and application to inhalable mineral particulate identification. Am. Mineral. 97, 1269-1273 (2012).
  14. Hayat, M. A. Principles and techniques of electron microscopy: biological applications. , Cambridge University Press. (2000).
  15. Wirth, R. Focused Ion Beam (FIB) combined with SEM and TEM: Advanced analytical tools for studies of chemical composition, microstructure and crystal structure in geomaterials on a nanometre scale. Chem Geo. 261, 217-229 (2009).
  16. Volkert, C. A., Minor, A. M. Focused ion beam microscopy and micromachining. MRS Bull. 32, 389-399 (2007).
  17. Kudo, M., et al. Microtexture of larval shell of oyster, Crassostrea nippona: A FIB-TEM study. J. Struct. Biol. 169 (1), 1-5 (2009).

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Calcium Carbonate CalcificationLive Optical MicroscopyElectron Microscopy TechniquesIntracellular pH ImagingScanning Electron MicroscopyEnergy Dispersive Xray SpectroscopyElectron Backscatter DiffractionTransmission Electron MicroscopyFocused Ion BeamMarine Tubeworm Larvae

Related Articles