ב פרוטוקול זה, אנחנו מתארים טכניקות ניתוח ראוי תודרנית פרחים, siliques, כמה טכניקות ניקוי בסיסי, ונבחר מכתים נהלי כולה-הר תצפיות מבני הרבייה.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
ב פרוטוקול זה, אנחנו מתארים טכניקות ניתוח ראוי תודרנית פרחים, siliques, כמה טכניקות ניקוי בסיסי, ונבחר מכתים נהלי כולה-הר תצפיות מבני הרבייה.
בשל כלי אימתני שלו ללימודי הגנטי המולקולרי, תודרנית לבנה הוא אחד המינים דגם הבולטים ביותר בביולוגיה צמח, במיוחד, צמח הרבייה הביולוגית. עם זאת, צמח מורפולוגי, אנטומי, וניתוחים ultrastructural באופן מסורתי כוללים גוזלת זמן הטמעה חלוקתה הליכים שדה בהיר, סריקה של מיקרוסקופ אלקטרונים. התקדמות אחרונים במיקרוסקופ קונפוקלי פלורסצנטיות, המדינה-of-the-art תלת-ממדי בעזרת מחשב מיקרוסקופיים ניתוחים ו עידון רציפה של טכניקות מולקולריות כדי לשמש על דגימות כולה-הר מינימלית מעובד, הוביל לביקוש מוגבר פיתוח טכניקות עיבוד מדגם מינימלי ויעילה. פרוטוקול זה, אנו מתארים שיטות ניקוד כראוי תודרנית ופרחים, בסיסי ניקוי טכניקות, siliques, כמה הליכים מכתימים עבור כולה-הר תצפיות מבני הרבייה.
פרחים בין החשובים ביותר מגדיר את האיברים של angiosperms. צמחים פורחים הופיע לפני כמה שנים 90-130 מיליון1, ואת המגוון כל כך מהר כי הופעתם מהירה תוארה "תעלומה הזוועה" מאת צ'רלס דרווין2. האינטרסים של חוקרי הצמחים בהתפתחות פרחים מגוונים. מחקר התמקדה הבנת המקור האבולוציוני של הפרח כולו, או את האבולוציה של תכונות אנטומיות מבניות, פונקציונלי ספציפי של פרחים3,4,5,6 . וריאציית גבוהה ב טופס פרחוני, מבנה, כמו גם את דרכי רבייה אל-זוויגית ופוגע להסתמך עליהם, להפוך הפרח מבנה מורכב מאוד. זה הוביל במאמצים מגוונים לאפיון התכונות אנטומיה מבניים איברים פרחוני, תוך שימוש בטכניקות microscopical אלקטרון ואור זה יכול להיות משולב עם חקירות גנטית ומולקולרית7. יתרה מזאת, כמקור של פירות וזרעים, פרחים הם בחשיבות עליונה על תזונת האדם ושל בעלי החיים. לכן, אפיון ופיתוח פרחים ופירות יש השלכות רבות על מחקר יישומי, כולל מזון אבטחה עבור אוכלוסיה אנושית וגובר ואסטרטגיות שימור אקולוגי תחת סביבה משתנה8 , 9 , 10.
פיתוח פרח תודרנית מתחיל עם פרח אינדוקציה, הטרנספורמציה של meristem וגטטיבי כדי meristem תפרחת (קבוצה של פרחים). פרח primordia מבוצעים רוחבית לאגף מ meristem תפרחת11. Primordia איברים פרחוני בהדרגה בצורה המעגלים הקונצנטריים מבחוץ אל מרכז הפרח, ובסופו של דבר לפתח לתוך עלי גביע, עלי כותרת, אבקנים, carpels7. אלו איברים פרחוני להגשים הגנתי התזונתי, ברורים, ואת פונקציונלי (למשל, המשיכה המאביק) תפקידי מיני צמחים שונים, עם איברי המין סופגת את התפתחות gametophytes זכר ונקבה, בהתאמה12 , 13. gametophytes, בתורו, להבדיל כל זוג של זכר (זרע) ולהכפיל גמטות הנשי (ביצה, תא מרכזי), אשר התאחדו על הפריה כדי ליצור את הדור הבא של הזיגוטה, את האנדוספרם העיקרי, רקמות מסוף המשנה התפתחות העובר ה-14,15. פיתוח זרעים ופירות תומכת צמיחה, התבגרות, שימור העובר ופיזור, בסופו של דבר, שלה. מחקר מקיף בוצעה כדי לאפיין את הפרחים והתפתחות העובר במיני צמחים שונים, במיוחד במינים דגם תודרנית7,16,17.
ניתוחים מיקרוסקופיים מוקדם של התפתחות פרחים היו מבוססים על מדגם גוזלת זמן עיבוד והתבוננות טכניקות, כמו פרפין או שרף הטבעה ו חלוקתה, בשילוב עם אור או מיקרוסקופ אלקטרונים. טכניקות אלה מיקרוסקופיים מסורתי שימשו לעיתים קרובות בשילוב עם חקירות הגנטי המולקולרי, כגון ניתוחים microscopical של מוטציות, הלוקליזציה של RNA על ידי הכלאה בחיי עיר או חיסונית-זיהוי חלבונים. התקדמות אחרונים במיקרוסקופ שדה רחב וקונפוקלי פלורסצנטיות, התמונה בעזרת מחשב תלת-ממדי המדינה-of-the-art ניתוחים, עידון רציפה של שיטות מולקולריות שניתן להשתמש בהם על דגימות כולה-הר מינימלית מעובד, הוביל צורך טכניקות עיבוד מינימלי ויעילה מדגם נתונות מעדיפים כמותני. בשנים האחרונות הפך התקדמות משמעותית בפיתוח טכניקות ניקוי על הדגימה בעלי חיים שלמים-הר. הם לעיבוד המדגם שקוף באמצעות מימית אוריאה - או סוכר מבוססי ריאגנטים (למשל, קנה מידה, SeeDB, מעוקב)18,19,20, או על ידי באופן סלקטיבי הסרת שומנים (באמצעות הנוזל מרחביות) לאחר הטבעה דגימות ב hydrogels יציב; הסרת שומנים יכולה להיות מושגת באמצעות דיפוזיה פסיבית (שונה,למשלפרוטוקול בהירות21, ברית-PARS-חישוקים22) או באופן פעיל על-ידי אלקטרופורזה (בהירות המקורי פרוטוקול23 ו מעשה-פרסטו24). בעידודה של התקדמות מהירה זו, כמה טכניקות נגזר גם מתגלים לשימוש בצמחים.
בנייר זה שיטות התמקדו המודל תודרנית, נתאר ההליך את הקרע הנכון של ניצני פרחים, פרחים, siliques צעיר, קרחת היער של דגימות כולה-הר עבור צביעת מגוונות ונהלים התבוננות באמצעות קלאסית או שיטה סליקה מבוססי מרחביות האחרונות. דוגמאות עמילן, callose של כרומטין מכתים ניתנת. אף על פי נהלים אלה עליך בהמשך שיפורים והתאמות בעת שימוש עם מינים אחרים, אנו מקווים שהם יהיה להגדיר את הבמה עבור מחקר נוסף על שיטות אלה פשוט אבל קריטיים המהווים נקודת ההתחלה של פרויקטי מחקר רבים.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. פרח, קיבוע Silique
2. ניתוח תחת Stereomicroscope
3. קלוראל-הידרייט המבוסס על חישוף, מכתים סליקה משולב
הערה: התוצאות הטובות ביותר עבור סליקה מבוססי קלוראל-הידרייט מתקבלים עם FPA50 קבוע חומר.
4. בשילוב אלכסנדר מכתים, ניקוי 4½ של הר של פורים
הערה: פרוטוקול אלכסנדר המקורי מבוסס על שחרור גרגרי אבקה על השקופית לפני צביעת. יעיל ואינפורמטיבי יותר, שונה אלכסנדר מכתים ולניקוי הליך זה ההכתמה של בוגר גרגירי אבקה בתוך פורים בוגרת אבל ללא dehiscent.
5. הסרת Exine את גרגרי אבקה
הערה: מומלץ להשתמש לשבועיים של Carnoy עבור צביעת דאפי.
6. נתרן גופרתי Dodecyl (מרחביות) ניקוי
הערה: בהתאם האיבר פרחוני כדי להיות מנותח, על המיומנויות של החוקר לנתח דגימות מאוד רך וקטן, הטיפול מרחביות יכול להתבצע גם בעבר (עבור חוקרים מנוסים) או לאחר הקרע צעד (עבור פחות מנוסים חוקרים) על חומצה אצטית-מתנול קבוע חומר.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
תודרנית שייך למשפחת Brassicacea, הנושאת את התפרחות עם פרחים דו מיניים מסודרים בתפרחת (איור 1). כל פרח יש ארבעה עלי גביע, 4 עלי כותרת, 6 אבקנים (ארבעה ארוך וקצר שני), שחלה syncarpous המורכבת carpels שני מלידה מאוחה (איור 1F-H) מסודרים ארבעת המעגלים הקונצנטריים25,26. תודרנית יש tenuinucellate, ovules anatropous מסודרים הקודקודית placentati...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
קיומו של ניצני פרחים רבים בתוך תפרחת בודדת של תודרנית, המתפרסות על-פני כל שלבים התפתחותיים של פרח, מציע הזדמנות ייחודית ללימודי מכוון אפיון אפקט של טיפול או תכונה התפתחותית בו זמנית על פני בשלבים שונים של פיתוח פרח. נקודת התייחסות טובה בין מיני צמחים בודדים הוא פתיחת הפרח הראשון של התפרחת הראשי. צמחים מטופלים בצורה כזאת, כי הפריחה מסונכרנים ככל האפשר (למשל, 3 – 4 ימים ריבוד ב 4 ° C הגדלת נביטת הזרעים סינכרונית, ולכן אפילו יותר פריחה), וצמחים רק לפתוח את הפרח הראשון שלהם באותו יום הם נלקח כאצווה להפיץ בי...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים אין לחשוף.
עבודה זו נתמכה על ידי אוניברסיטת ציריך, הפורום הישראלי לאנרגיה מארי קירי גרנט (מענק. לא. TransEpigen-254797 אל A.H.), גרנט מתקדם של המועצה האירופית למחקר (מענק. לא. MEDEA-250358 אל U.G.), ומחקר ופיתוח טכנולוגיה פרוייקט (גרנט MecanX כדי U.G.) מ- SystemsX.ch, היוזמה שוויצרי במערכות ביולוגיות.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| <חזק>ריאגנטים וחומרים | |||
| אתנול | שרלאו | ET00102500 | |
| חומצה אצטית | Applichem | A3686,2500 | 100% ביולוגיה מולקולרית כיתה |
| חומצה אצטית קרחונית | סיגמא-אולדריץ' | 320099 | ביולוגיה מולקולרית כיתה |
| מתנול | שרלאו | ME03062500 | |
| תמיסת פורמלדהיד | סיגמא-אולדריץ | F1635 | |
| חומצה פרופיונית | סיגמא-אולדריץ | 81910-250 מ"ל | |
| כלורל הידרט | סיגמא-אולדריץ' | 15307 | |
| גליצרול | רוט | 3783.1 | |
| גומי ערבי | פלוקה | 51198 | |
| חומצה לקטית | פלוקה | 69773 | |
| פנול | סיגמא-אולדריץ' | 77607-250 מ"ל | השתמשנו בפנול נוזלי (השתמש בצפיפות כדי למצוא את הנפח הנדרש לתמיסה שלך) |
| שמן ציפורן | סיגמא-אולדריץ' | C8392-100 מ"ל | |
| קסילן | רוט | 4436.1 | |
| יוד | פלוקה | 57665 | |
| אשלגן יודיד | Merck | 5043 | |
| מלכיט ירוק | פלוקה | 63160 | |
| חומצת פוקסין | Fluka | 84600 | |
| תפוז G | Sigma | 7252 | |
| נתרן דודציל סולפט | סיגמא-אולדריץ' | L3771 | ביולוגיה מולקולרית כיתה |
| נתרן הידרוקסיד | סיגמא-אולדריץ' | 71690 | |
| נתרן די-מימן פוספט | Applichem | A1047,1000 | |
| נתרן פוספט דו-בסיסי | סיגמא-אולדריץ' | S9763-1KG | |
| אשלגן פוספט | סיגמא-אולדריץ' | 04347 | |
| EDTA | Applichem | A2937,1000 | |
| Calcofluor | Sigma | F6259 | מבהיר פלורסנט 28 |
| Auramine | Chroma | 10120 | |
| DAPI | Sigma | D9542 | רעיל |
| Triton-X-100 | Sigma | T8787 | |
| כחול אנילין | Merck | 1275 | |
| MS בינוני | קרולינה | 19-57030 | |
| מצע עשיר בחומרים מזינים | Einheitserde | ED73 | |
| זכוכית | אין מותג ספציפי | ||
| 15 מ"ל צינורות צנטריפוגה בז | VWR | 62406-200 | |
| מלקחיים של דומונד | Actimed | 0208-5SPSF-PS | |
| מלקחיים | DUMONT BIOLOGY | 0108-5 | |
| מזרק | BD | BD Plastipak 300013 | 1 מ"ל |
| מחט הכנה | BD | BD Microlance 304000 | |
| שקופיות מיקרוסקופ | Thermo Scientific | 10143562CE | קצוות חתוכים |
| Coverslips | Thermo Scientific | DV40008 | |
| קופסת | קופסת פלסטיק עם מגבת נייר לחה ותומכי שקופיות בפנים | ||
| שם | חברה | Catalog | Comments |
| >Solutions> | |||
| Fixatives | |||
| של Carnoy (Farmer's): | חומצה אצטית קרחונית 3:1 (מ"ל:מ"ל) | ||
| מתנול/חומצה אצטית | מקבע 50% (v/v) מתנול, 10% (v/v) חומצה אצטית קרחונית במים נטולי יונים | ||
| FPA50 פורמלין | חומצה פרופיונית, 50% אתנול; 5:5:90 (מ"ל:מ"ל:מ"ל) | ||
| <תמיסות ניקוי>חזקות | |||
| כלורל הידרט/גליצרול | כלורל הידרט: גליצרול: מים, 8:1:2 (גרם:מ"ל:מ"ל). יכול לשמש לכל שלבי התפתחות הפרחים ולהתפתחות סיליק במיקרוסקופ DIC. הקיבוע הטוב ביותר הוא FPA50 | ||
| Modified Hoyer | Gum ערבי מבוסס פורמלין 7.5 גרם, כלורל הידרט 100 גרם, גליצרול 5 מ"ל , מים 30 מ"ל. יכול לשמש לכל שלבי התפתחות הפרחים ולהתפתחות סיליק במיקרוסקופ DIC. הקיבוע הטוב ביותר הוא FPA50 | ||
| Herr's 4½ המבוסס על פורמלין; נוזל | חומצה לקטית, כלורל הידרט, גבישי פנול, שמן ציפורן, קסילן; 2:2:2:2:1, לפי משקל. יכול לשמש לכל שלבי התפתחות הפרחים (במיוחד להתפתחות אבקנים) ולהתפתחות סיליק במיקרוסקופ DIC. הקיבוע הטוב ביותר הוא | ||
| SDS/NaOH | לדלל את ה-SDS ואת תמיסת ה-NaOH ל-1% SDS / 0.2 N NaOH (דילול פי 10). לכל שלבי התפתחות הפרחים והסיליק. הקיבוע הטוב ביותר הוא מקבע מתאנו/חומצה אצטית; ניתן להשתמש גם בשני המקבעים האחרים. ניתן לשלב עם תמיסת צביעה קלקופלואור, אורמין, DAPI וכחול אנילין. | ||
| תמיסת | 10% (w/v) נתרן דודציל סולפט. ממיסים 10 גרם נתרן דודציל סולפט ב-80 מ"ל מים נטולי יונים ויוצרים עד 100 מ"ל עם מים נטולי יונים. | ||
| תמיסת | 2 N תמיסת NaOH: ממיסים 4 גרם NaOH ב-40 מ"ל מים נטולי יונים ויוצרים עד 100 מ"ל עם מים נטולי יונים | ||
| <חזקים >תמיסות ניקוי וצביעה משולבות | |||
| Herr's IKI-4½ | ל-4½ סטנדרטי; (סה"כ 9 גרם) להוסיף: 100 מ"ג יוד, 500 מ"ג אשלגן יודי. פתרון פינוי זה יכול לשמש לכל שלבי התפתחות הפרחים ולהתפתחות סיליק, בין אם להגברת הניגודיות או לאפיון דינמיקת העמילן. השתמש ב-FPA50 לניתוח מבני ובקיבוע של קרנוי לניתוח עמילן כמותי. | ||
| אלכסנדר מכתים | אתנול 95% 10 מ"ל, מלכיט ירוק (1% ב-95% EtOH) 1 מ"ל, חומצת פוקסין (1% ב-ddH2O) 5 מ"ל, תפוז G (1% ב-ddH2O) 0.5 מ"ל, פנול 5 גרם, כלורל הידרט 5 גרם, חומצה אצטית קרחונית 2 מ"ל, גליצרול 25 מ"ל. ניקוי / צביעה זו לבד או בשילוב עם 4½ של הר; ניתן להשתמש בתמיסה כדי להעריך הפלת אבקה בפרחים עם גרגרי אבקה בוגרים ותלת-תאיים. הוא משמש על חומר לא קבוע טרי. | ||
| <תמיסות צביעה חזקות> | |||
| תמיסת | Calcofluor Calcofluor 0.007% במים (גרם:מ"ל). שימש במקור כמבהיר אופטי. יכול לשמש לצביעה של תאית, פוליסכרידים קרבוקסיליים וקלוז בדפנות התאים. משמש לעתים קרובות להכתמת גרגר האבקה. ניתן להשתמש בכל שלושת המקבעים עם פתרון זה. | ||
| תמיסת | Auramine 0.01% במים (g:ml). צבע פלואורסנטי ליפופילי זה יכול לשמש בין היתר לצביעה של ציפורניים, קוטין ואקסין. ניתן להשתמש בכל שלושת המקבעים עם תמיסה זו | ||
| Calcofluor-Auramine | תמיסת Auramine: תמיסת Calcofluor, 3: 1. יכול לשמש לצביעה משולבת על ידי שני הפתרונות. ניתן לאמוד פרופורציות אחרות תוך שמירה על שיעור קטן יותר של קלקופלואור ביחס לאורמין. | ||
| תמיסת | DAPI 0.4 ug/ml, 0.1 M מאגר נתרן פוספט (pH 7), 0.1% Triton-X-100, 1 mM EDTA. ניתן להשתמש בתמיסה זו לצביעה של התפשטות כרומוזומים במהלך מיוזה זכרית ונשית, וגרעיני תאים של כל רקמה. משמש לעתים קרובות לחקר התפתחות גרגירי אבקה. קרנוי ומתנול / חומצה אצטית הם הקיבוע הטוב ביותר לתמיסה זו. מקבעים מבוססי פורמלדהיד כגון FPA50 עלולים להפריע לצביעה. עירור ב-UV ופליטה מקסימלית בסביבות 461 ננומטר. | ||
| מאגר נתרן פוספט (0.1 M) | קולטן פרוטון: 0.2 M Na2HPO4, תורם פרוטון: 0.2 M NaH2PO4, יחס תורם פרוטון / קולטן פרוטון: 1.364 (עבור pH 7) | ||
| תמיסה | 0.1% (w/v) כחול אנילין, 108 מ"מ K3PO4 (pH 11), 2% גליצרול. ניתן להשתמש בתמיסה זו לצביעה של קלוז ותאית בשלבי התפתחות רבים (למשל שקיעת קלוז בטרדות זכר ונקבה, פקקי קלוז בצינורות אבקה). עירור ב-UV ופליטה מקסימלית בסביבות 455. ניתן גם לרגש אותו ב-514 ננומטר עם פליטה באדום להכתמת תכולת התאים. |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.