זהו פרוטוקול זמן cost effective במבחנה חוקרים על מנגנוני ההתנגדות רכשה סוכני טיפולית ממוקד, ובגלל זה צורך רפואי קליניות מאוד בניהול סרטן.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
זהו פרוטוקול זמן cost effective במבחנה חוקרים על מנגנוני ההתנגדות רכשה סוכני טיפולית ממוקד, ובגלל זה צורך רפואי קליניות מאוד בניהול סרטן.
בעשרים השנים האחרונות ראינו משמרת של תרופות ציטוטוקסיות לטיפול ממוקד לאונקולוגיה רפואית. למרות יישוב סוכני טיפולית הראו יעילות קלינית מרשים יותר תופעות לוואי ממוזער טיפולים מסורתיים, תרופתיים הפך המגבלה העיקרית היתרונות שלהם. מספר מודלים פרה/במבחנה/ויוו של ההתנגדות רכשה סוכני ממוקד בטיפול קליני פותחו בעיקר באמצעות שתי אסטרטגיות: מניפולציה גנטית i) להכנת דגמים אחרים של ההתנגדות רכשה, ii) במבחנה / אין ויוו מבחר דגמים עמיד. בשנת העבודה הנוכחית, אנו מציעים מסגרת המאחד, על חקירת המנגנון הבסיסי אחראי על ההתנגדות רכשה סוכני טיפולית ממוקד, החל מהדור של subclones הסלולר עמידים לתרופות על תיאור של להשתיק הליכים המשמשים עבור שחזור הרגישות לחומר המדכא. פשוט הזמן cost effective בגישה זו הוא החלים נרחב, אפשרות להאריך בקלות לחקור את מנגנוני ההתנגדות לסמים אחרים טיפולית יישוב בגידול שונים histotypes.
עוקב אחרי התגליות מכריע בביולוגיה מולקולרית, תאית, מספר מולקולות נגד סרטן מסונתז הרומן פותחו באופן סלקטיבי היעד oncogenic איתות המסלולים במגוון רחב של סוגי גידולים. בפרט, שתי קטגוריות של יישוב סוכני טיפולית עם מאפיינים ייחודיים באונקולוגיה, תרכובות כימיות כלומר סינתטי של נוגדנים חד-שבטיים רקומביננטי, ידועים השיגו הצלחות קליני וטיפול בסרטן שינו באופן דרמטי העשורים האחרונים1,2,3.
ובכל זאת, למרות התגובה הראשונית שלהם מרשים לטיפול, הרוב המכריע של חולי סרטן פיתחו עמידות לתרופות לכל הסוכנים טיפולית יישוב, נוגדנים חד-שבטיים והן מעכבי קינאז. כתוצאה מכך, תרופתיים, המשוכה העיקריים תרופות נגד סרטן קלאסי4, הוא עדיין אתגר גדול עבור טיפולים ממוקדים המתעוררים5,6.
עמידות לטיפול ממוקד עשוי להיות מהותי (קרי, ראשי) או רכשה (קרי, משני). התנגדות פנימית מתאר דה נובו חוסר תגובה לטיפול, בעוד התנגדות משני מתרחשת לאחר תקופת בתגובה סמים טיפול7. האחרון הוא הנגרמת על ידי התפרצויות של גדודים קטן של תאים סרטניים בתוך עיקר הגידול פרימיטיבי או בנויים דיסטלי נישות אנטומי נסתר, מפגין עד 90% עמידות לתרופה אחת או יותר ממוקד סוכני טיפולית. המנגנונים המולקולריים שבבסיס פיתוח עמידות לטיפול ממוקד בעיקר תוצאה של מוטציות היעד והפעלה מיותר של אחרים פרו-הישרדות איתות המסלולים, ההבנה של מי הוא עדיין רחוק מלהיות שלם8.
בעבודה זאת, הצענו זמן cost effective בגישה לחקור מנגנונים במבחנה של ההתנגדות רכשה סוכני טיפולית ממוקד, החל מהדור של subclones הסלולר עמידים לתרופות על תיאור של שתיקת הליכים המשמשים עבור שחזור הרגישות לחומר המדכא, כלי חיוני המשמש עבור בדיקה ואימות של בהנחות עבודה. בפרט, הגישה שלנו שימש לחקור, סרטן קיבה, מנגנוני ההתנגדות הרצפטין (למשל, הרצפטין), מואנשים חד-שבטיים מיקוד המחשבים חוץ-תאי של החלבון HER29. הרצפטין + כימותרפיה מקובל כטיפול רגיל קו ראשון לסרטן שד גרורתי HER2 חיובי. בזכות מחקרים פרה מציג את האנטי-HER2 טיפולים יש פעילות משמעותית בשני במבחנה , ויוו HER2 חיובי סרטן קיבה מודלים10,11, היה מולקולרית שהתרופות המתוות HER2 בחן בהרחבה בניסויים קליניים, חלקם עדיין בעיצומה, על חולים עם גסטרו סרטן12,13,14,15.
מחקרים אלה הדגישו את המספר העולה מהמטופלים חווים התנגדות הרצפטין16, בדומה אל תצפית על מעכבי טיפולית יישוב אחרים. בפרט, קצב התגובה של הרצפטין היה 47%, חציון ההישרדות הכוללת של חולים על הרצפטין + כימותרפיה היה ארוך יותר לחולים על כימותרפיה לבד172.7 חודשים בלבד. זה הציע כי בעוד הרצפטין העיקרי ההתנגדות היא שכיחה, הרצפטין משני ההתנגדות היא בלתי נמנעת. מסיבה זו, יש צורך דחוף כדי להבהיר את מנגנוני גרימת טיפול ממוקד-HER2 עמידות סרטן קיבה, אשר הוא בעייתי עוד יותר בהתחשב הטרוגניות גנטית אינטרה-tumoral את זה neoplasia18.
בנוסף, מנגנוני עמידות הרצפטין בסרטן קיבה הוכיחו מאתגר להסביר, חלקית עקב הקושי בהשגת במודלים פרה אמין נציג של מצב זה. אושימה. et al. דיווח על שיטת הבחירה ויוו של שורות תאים עמידים הרצפטין סרטן קיבה, המורכב תרבות חוזרות ונשנות של גרורות קטנות הצפק שיורית לאחר הטיפול עם הרצפטין19. עם זאת, הצורך של זיווד, ההתמחות לטיפול בבעלי חיים ספציפיים ועל האישור של ועדת האתיקה חיה תרמו הפיכתה לפעולת לצרוך זמן עלות. הגישה שנתאר בעבודה זו פשוט וקל החלים נרחב, אפשרות להאריך בקלות לחקור את מנגנוני ההתנגדות לסמים אחרים טיפולית גידול שונים histotypes20.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הערה: פרוטוקול זה במיוחד הותאם לניתוח של המנגנונים ההתנגדות רכשה הרצפטין של שורות תאים של סרטן קיבה וורויקשייר-חיוביות. כל מכשירי מעבדה הצורך מדווחים בטבלה של חומרים.
1. דור של Subclones עמידים לטיפול ממוקד
הערה: זה הכי קריטי, קשה לתקנן את שלב בפרוטוקול בשל העובדה כי שורות תאים שונים עשוי להפגין רגישויות שונות לחומר המדכא טיפולית יישוב עצמאי של התרכזות histotype או התרופה שלהם הגידול בשימוש.
2. אימות פרוטוקול עבור המועמד ממוקד בטיפול ההתנגדות ג'ין (R-גן)
הערה: לאחר אפיון גנים, חתימות המשויך ההתנגדות רכשה יעד טיפול וג'ין כל מועמד כמו נהג של התנגדות ייחקר באמצעות: א) RT-PCR, ומערבי ב) כתם ניתוח.
3. שחזור רגישות מעכב היעד-טיפול על ידי המועמד R-גן דפיקה למטה
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
איור 1 מתווה במסגרת ההליך ניסיוני. שלושה סרטן קיבה-שורות תאים המבטאים רמה גבוהה של HER2, רגישות הרצפטין (IC50 < שיא רמת הפלסמה של התרופה, 2A איור, גרף השמאלי) גדלו במדיום תרבות המכיל את הסוכן טיפולית יישוב. מנה 10-fold נמוכים מריכוז הפלסמה שיא של הרצפטין (10 µg/mL) היה לקבוע את המינון ההתחלתי, בהדרגה ל 400 µg/mL על פני תקופה של 8-12 חודשים. לאחר מכן, השגנו שלוש subclones מאופיין הפנוטיפ ההתנגדות יציב עם IC50
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בעוד אישית ממוקדת טיפולים יש elicited ההתלהבות גוברת, אלה טיפולים "חכם" כביכול עם הפנים את המשוכה הגדולות באותה תרופות כימותרפיות המסורתי, כלומר, רכישת תרופתיים מהירה ובלתי צפויים. כדי לשפר את התוצאות של טיפול ממוקד, צריך יהיה לפתור בעיות תרופתיים דרך הבנה טובה יותר של המנגנונים שגורמים להם. כאן, הצגנו מתודולוגיה נגישים נרחב במבחנה כדי לחקור את מנגנוני ההתנגדות רכשה לסמים טיפול ממוקד במודלים קו תאי סרטן.
הדור של יישוב subclones עמידים לטיפול הוא הכי קריטי, קשה לתקנן בשלב של פ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים אין לחשוף.
המחברים רוצים להודות ד ר ורוניקה זאנוני לעריכת כתב היד.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| Trizol Reagent | Invitrogen | 15596026 | TRIzol Reagent הוא ריאגנט לבידוד RNA כולל באיכות גבוהה או בו זמנית לבידוד RNA, DNA וחלבון ממגוון דגימות ביולוגיות |
| ערכת סינתזה ISCRIPT CDNA | Bio-Rad | 1708891 | ערכת סינתזת cDNA iScript היא ערכת סינתזת cDNA רגישה וקלה לשימוש לניתוח ביטוי גנים באמצעות qPCR בזמן אמת. |
| בדיקת ביטוי גנים של TaqMan | Life Technologies | 4331182 | Applied Biosystems מבחני ביטוי גנים של TaqMan מורכבים מזוג פריימרים PCR ללא תווית ובדיקה של TaqMan עם תווית צבע FAM או VIC של Applied Biosystems בקצה 5' וקלסר חריץ מינורי (MGB) ומרווה לא פלואורסצנטי (NFQ) בקצה 3'. |
| מגיב מיצוי חלבון יונקים M-PER | Thermo Scientific | 78501 | Thermo Scientific M-PER מגיב מיצוי חלבון יונקים נועד לספק מיצוי חלבון מסיס כולל יעיל ביותר מתאי יונקים מתורבתים. |
| קוקטייל מעכב עצירת פרוטאז ופוספטאז (100X) | Thermo Scientific | 78440 | קוקטייל מעכב פרוטאז ופוספטאז תרמו סיינטיפיק (100X) מספק את הנוחות של פתרון יחיד עם הגנה מלאה על דגימות חלבון עבור ליזטים של תאים ורקמות. |
| ערכת בדיקת חלבון Pierce BCA | Thermo Scientific | 23225 | ערכת בדיקת החלבון Thermo Scientific Pierce BCA היא ריאגנט בדיקה דו-רכיבי, דיוק גבוה ותואם לחומרי ניקוי שנקבע למדידת ריכוז החלבון הכולל (A562nm) בהשוואה לתקן חלבון. |
| 4x Laemmli Sample Buffer | Bio-Rad | 1610747 | השתמש ב-4x Laemmli Sample Buffer להכנת דגימות עבור SDS PAGE. להפחתת דגימות, הוסף חומר הפחתה כגון 2-מרקפטואתנול למאגר לפני הערבוב עם הדגימה. |
| 4– 20% ג'ל חלבון טרומי Mini-PROTEAN TGX | Bio-Rad | 456-1094 | ג'ל TGX (Tris-Glycine eXtended) בעל אורך חיים ארוך יש נוסחה חדשה וניתן להשתמש בהם הן להפרדות חלבון דנטורציה סטנדרטיות והן לאלקטרופורזה טבעית. |
| תקני Precision Plus Protein WesternC Blotting Standards | Bio-Rad | 1610376 | Precision Plus Protein Prestained זמינים בפורמטים Dual Color, All Blue, Kaleidoscope ו-Dual Xtra. לכל הארבעה יש את אותם דפוסי נדידת ג'ל, עם 3 רצועות ייחוס בעוצמה גבוהה (25, 50 ו-75 kD). |
| 10x Tris/Glycine/SDS | Bio-Rad | 1610732 | 10x Tris/glycine/SDS הוא חוצץ רץ מעורבב מראש להפרדת דגימות חלבון על ידי SDS-PAGE. |
| חבילות העברה של Trans-Blot Turbo Mini PVDF חבילות העברה | של Bio-Rad | 1704156 | Trans-Blot Turbo Mini PVDF להעברה מהירה ויעילה של חלבונים ממיני ג'לים באמצעות מערכת Trans-Blot Turbo Transfer System. כל חבילת העברה אטומה בוואקום ומוכנה לשימוש מכילה שתי ערימות מאגר יונים רוויות חוצץ וממברנת PVDF רטובה מראש. |
| חלבון מדויק StrepTactin-HRP מצומד | Bio-Rad | 1610381 | StrepTactin-חזרת פרוקסידאז (HRP) מצומד לזיהוי כימילומינסנט או קולורימטרי של תקני חלבון לא מוכתמים של Precision Plus Protein או Precision Plus Protein WesternC Standards על כתמים מערביים. |
| תמיסת Immun-Star WesternC | Bio-Rad | 5572 | Immun-Star WesternC, שיטה לזיהוי חלבונים, מזהה כמויות חלבון באמצע הפמטוגרמה. |
| ל-Invitrogen | 12935300 | בקרה שלילית בקרה | שלילית אין דמיון משמעותי ברצף לרצפי גנים של עכבר, חולדה או אדם. הבקרה נבדקה גם במסכים מבוססי תאים והוכחה כחסרת השפעה משמעותית על התפשטות התאים, כדאיות או מורפולוגיה. |
| opti-MEM Glutamax Medium | Thermo Fisher Scientific | 51985026 | Opti-MEM Medium הוא מדיום חיוני מינימלי (MEM) משופר המאפשר הפחתה של תוספי סרום בקר עוברי ב-50% לפחות ללא שינוי בקצב הגדילה או במורפולוגיה. |
| משתיק קול בחר מעוצב מראש & הפרעות 4390824 RNA (RNAi) מאומתות של siRNA | Ambion | (RNAi) היא הדרך הטובה ביותר להפיל ביעילות את ביטוי הגנים כדי לחקור את תפקוד החלבון במגוון רחב של סוגי תאים. | |
| Lipofectamine RNAiMAX Transfection Reagent | Invitrogen | 13778075 | Lipofectamine RNAiMAX Transfection Reagent מציע פתרון מתקדם ויעיל להעברת siRNA. אף מגיב טרנספקציה ספציפי אחר ל-siRNA אינו מספק אספקת siRNA קלה ויעילה כל כך במגוון רחב של קווי תאים, כולל סוגי תאים נפוצים, תאי גזע ותאים ראשוניים, כמו גם סוגי תאים קשים להעברה באופן מסורתי. |
| עכבר anti-IQGAP1 | Invitrigen | 33-8900 | ריכוז עבודה: 1:400 בתמיסת חלב 5% |
| עיזים נגד עכבר IgG-HRP: sc-2005 | Santa Cruz | sc-2005 | ריכוז עבודה: 1:10000 בתמיסת חלב 5% |
| PMSF | Sigma Aldrich | P 7626 | זהו מעכב של פרוטאזות סרין ואצטילכולין אסטראז |
| תרמו-ציקלר למחקר RT-PCR | MJ מחקר | MJ PTC-200 Thermal Cycler | הוא מאפשר הומוגניות טמפרטורה ומהירות הגברה של עד 3° ג/שנייה ניתן לבצע את הפרוטוקול גם עם מחזורים תרמיים אחרים |
| מכשיר RT-PCR בזמן אמת | מערכת Applied Biosystems | 7500 RT-PCR זוהי | פלטפורמה בעלת חמישה צבעים המשתמשת בריאגנטים של תגובת שרשרת פולימראז (PCR) מבוססי פלואורסצנציה כדי לספק כימות יחסי באמצעות סוג בדיקה השוואתי CT. ניתן לבצע את הפרוטוקול גם עם מחזורים תרמיים אחרים |
| ספקטרופוטומטרים Microvolume Thermo | Scientific | Nanodrop | הוא מספק מדידת גרעין חומצה מדויקת ומהירה תוך שימוש בנפח קטן של מערכת ספיגת הדגימה |
| Bio-Rad | Trans-Blot Turbo מערכת הוא | מבצע העברה יבשה תוך מספר דקות | |
| מערכת רכישת תמונה ותיעוד ג'ל | Bio-Rad | Chemidoc מערכת | קל לשימוש לזיהוי כימילומינסנט |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.