מאמר שיטה

וזמינותו כתב המבוסס על ידי קרינה פלואורסצנטית פשוט לזהות את מרכיבי התא הדרושות רעלן ריצין שרשרת (RTA) סחר בבני אדם שמרים

DOI:

10.3791/56588

15 בדצמבר 2017

במאמר זה

סיכום

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

בכתב היד, נתאר את השימוש assay כתב המבוסס על שמרים זריחה כדי לזהות רכיבים התאית מעורבת הסחר ולהרוג את התהליכים של ציטוטוקסיות של יחידת משנה של ריצין הרעלן הצמח (RTA).

תקציר

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

בקטריאלי, צמח A / B רעלים ניצול של מסלולים סחר טבעי בתאים האיקריוטים להגיע שלהם target(s) תאיים ב ציטוזול ו להרוג בסופו של דבר. כזה A / B רעלים מורכבת בדרך כלל פעיל enzymatically Asubunit (למשל, ריצין רעלן (RTA)), תא אחד או יותר מחייב Bsubunit(s), אשר אחראים על רעלן קשירה ספציפי ל התא קולטנים משטח. הידע הנוכחי שלנו על איך A / B רעלים מסוגלים ביעילות משכר תאי עזר מדענים להבין את המנגנונים התאיים הבסיסיים, כמו אנדוציטוזה וחלבון תאיים מיון גבוהה התאים האיקריוטים. מנקודת מבט רפואית, חשוב גם לזהות את המסלולים סחר הרעלן הגדולות כדי למצוא פתרונות טיפול הולם עבור חולים או ובסופו של דבר לפתח יישומים מבוססי-הרעלן טיפולית לטיפול בסרטן.

מאז ניתוח ברמת הגנום של A / הרעלן B תאים בתרבית של סחר בבני אדם היא מורכבת, גוזלת זמן יקר, מספר מחקרים על A / B הרעלן תחבורה בוצעו באורגניזם מודל שמרים האפייה. למרות היותו פחות מורכב, יסוד תהליכים תאיים שמרים ואת התאים האיקריוטים גבוה יותר דומים הינם לעיתים קרובות התוצאות המתקבלות שמרים ניתן להעביר למצב יונקים.

כאן, אנו מתארים assay כתב מהיר, קל לשימוש כדי לנתח את וגדילת של RTA ב שמרים. היתרון חיוני וזמינותו חדשה הוא הזדמנות לחקור לא רק RTA רטרו-טרנסלוקציה של תוך-פלזמית (ER) ציטוזול, אבל מעדיף אנדוציטוזה, הרעלן רטרוגרדית תחבורה של קרום פלזמה לחדר המיון. הבדיקה עושה שימוש פלסמיד כתב המאפשר מדידה עקיפות של RTA רעילות דרך פליטת קרינה פלואורסצנטית חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP) לאחר תרגום ויוו . מאז RTA מונע ביעילות אתחול של חלבון ביוסינטזה מאת 28S rRNA depurination, וזמינותו זו מאפשרת זיהוי חלבונים בתא המארח מעורב התחבורה RTA תאיים באמצעות זיהוי שינויים פליטת קרינה פלואורסצנטית.

מבוא

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

חולים הסובלים זיהומים על ידי הרעלן לייצר חיידקים מייצגים מעמסה רפואית וכלכלית חמורה עבור כל מערכת הבריאות חברתית, במיוחד מאז טיפולי יעיל חסרים עדיין במידה רבה. לפתח אסטרטגיות טיפוליות חדשות, מנגנונים מורכבים שיכרון א גם לא רלוונטי רפואית / B רעלנים כגון כולרה טוקסין, רעלן שיגה או ריצין צריך להיות מובן במלואו ברמה המולקולרית המבוססת על הרומן מבחני רב עוצמה שיש ליישם.

בשנים האחרונות, מספר מחקרים ניסו לנתח A / B הרעלן תחבורה בין שמרים בתרבית של תאים באמצעות שיטות ועתירת עלות עתירי כמו רעלן רדיואקטיבי תיוג1,2 , כמו גם סינון שמבוסס siRNA ניגש3. במקרים מסוימים, הרעלן סחר כבר מטמיעים ויוו על-ידי קרינה פלואורסצנטית מיקרוסקופ לאחר צימוד כימי ו/או גנטי של הרעלן בודדים subunits עם fluorophores, נקודות קוונטיות או חלבונים פלורסנט4,5. למרבה הצער, ושינויים אלו לעיתים קרובות להוביל מאפיינים טבעיים לא פעילים ו/או שינו הרעלנים. דרך אלגנטית נוספת בעקיפין לענות על מגוון רחב של שאלות מדעיות היא השימוש במערכות כתב המבוסס על אנזימים כגון לוציפראז lacZ, או חלבונים פלורסנט (למשל GFP או Discosoma sp. (חלבון פלואורסצנטי אדום dsRed)).

כתב יד זה, מתואר פרוטוקול פשוט אשר מזהה הסלולר הרכיבים הדרושים עבור הובלה תאיים של RTA extracellularly יישומית ב cerevisiae ס. ובכך, זריחה-כתב פלסמיד המכיל אות N-מסוף ER-ייבוא ואחריו GFP משמש חיישן ביוסינטזה חלבון, אשר מודד בעקיפין בתיווך RTA חלבון תרגום עיכוב על ידי GFP פלורסצנטיות פליטה לאחר ויוו תרגום6. במקרה זה RTA אנדוציטוזה ו/או וגדילת לרעה (או באופן חיובי) מושפע ב מוטציה מחיקה שמרים מסוים לעומת פראי-סוג, זה ניתן לאתר באמצעות עלייה (או ירידה) פליטת קרינה פלואורסצנטית GFP6.

עד כה, כל שיטות ניתוח תחבורה RTA תאי שמרים היו מוגבלים לתהליך רטרו-רוברטסונית אר-אל-ציטוזול RTA. במערכת כזו מלאכותי, מתבטאת RTA המכיל אות ייבוא אר מ יזם inducible וכתוצאה מכך פנוטיפ אובדניות1,7. למרות התא מחייב B-יחידת משנה של ריצין הוא חסר הגדרת הניסוי המתואר בכתב היד, וכך, לא לגמרי מייצגים את המצב הטבעי של שיכרון ריצין holotoxin8, הרעלן תחבורה של פלזמה ממברנה דרך מנגנון גולג'י לחדר המיון יכול להיות חיקה בשיתוף פעולה הדוק עם assay הרומן הזה. מעניין, תוצאות ראשוניות שהושגו במחקר פיילוט מציינים כי המסלולים סחר בשימוש על ידי RTA לחשוף את הדמיון הבולט עם תוואי שיכרון ריצין holotoxin.

לסיכום, שיטת שתואר יכול לשמש כדי לקבוע את התפקיד הספציפי של החלבונים שנבחרו ב- RTA אנדוציטוזה, סחר בבני אדם שמרים. יתר על כן, הגדרת הניסוי הזה יכול בקלות להתאים אחרים ריבוזום inactivating רעלנים המופרשים שמרים שונים ומינים חיידקיים כגון zymocin או טוקסין שיגה והופק.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

הערה: סקירה כללית של תהליך העבודה הכללי ניסיוני מתואר באיור1.

זהירות: RTA היא רעילה ביותר עבור בני אדם. בטיחות מעבדה הרשאה S2 (אבטחה ברמה מקבילה 2) נדרש. בבקשה ללבוש כפפות במהלך הניסוי כולו.

1. heterologous ביטוי של RTA שלו מתויגת ב- Escherichia coli

  1. להפוך e. coli תאים המכילים את הביטוי פלסמיד pET24-RTA6 (שלו) או את pET24a וקטור ריק(+) באמצעות תקן אלקטרופורציה פרוטוקולים9,10. תאים המכילים את פלסמיד ריק לשמש פקד שלילי.
  2. לאחר בחירת שיבוטים חיובית על צלחות ליברות (100 µg/mL) המכילות kanamycin, לחסן את התאים המכילים את פלסמיד ביטוי RTA או הווקטור ריק מ ל LBקאן בינוני (LB בינוני עם µg/mL 100 של kanamycin), דגירה-37 ° C ו- 220 סל"ד במשך 24 שעות ביממה.
  3. תוספת 1 L LBקאן בינוני עם תרבות קדם 5 מ"ל, דגירה תאים על 37 ° C ו- 220 סל"ד עד תאים מיצית את יתר של600 של 0.8-1.0 (כ 3-4 שעות). לאחר מכן, לצמצם את תרבות הטמפרטורה 28 ° C ולהכין של 1 מ' של איזופרופיל-β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG) מניות פתרון H2O.
  4. זירוז RTA לביטוי e. coli על-ידי הוספת IPTG ריכוז סופי של 1 מ מ.
  5. לאחר h 3.5 ב 28 ° C ו- 220 סל"ד, קציר תאים על ידי צנטריפוגה-g 10,000 x ו- 4 מעלות צלזיוס למשך 10 דקות, לשטוף את גלולה פעמיים עם 5 מ של איגוד מאגר (500 מ מ NaCl imidazole 10 מ מ, 20 מ מ ח'2PO4 pH = 7.4) 10,000 x g ו- 4 מעלות צלזיוס במשך 10 דקות, resuspend צנפה במאגר איגוד מ ל.
    הערה: פרוטוקול ניתן להשהות בשלב זה, תאים שניתן לאחסן ב 80 מעלות צלזיוס במשך מספר ימים.

2. טיהור של RTA שלו מתויג באמצעות כרומטוגרפיית זיקה

  1. Sonicate תאים על קרח באמצעות פרוטוקול הבאים: s 15 דופק (20 מיקרון), השהה s 30. חזור על שלב זה חמש פעמים.
  2. תגובת שיקוע באמצעות מערכת סינון סטרילי מזרק (0.2 µm גודל הנקבוביות) צנטריפוגה תא lysate-21,000-g ו- 4 מעלות צלזיוס למשך 15 דקות ולסנן.
    הערה: תא כדורי דוגמאות בהצלחה sonicated של הצג גבולות שקוף.
  3. השתמש מערכת טיהור אוטומטיות מצויד של מ ל2 +ני-מבוססת עמודת זיקה לטהר את השבר שלו מתויג RTA מ סטרילי-מסוננים e. coli supernatant. באופן כללי, השתמש על מהירות • תנאי של 1 mL/min. ומגניב מערכת טיהור כל כדי למנוע מחייב רעלן שאינו יעיל ואובדן של פעילות הרעלן
    הערה: פרמטרים עבור טיהור RTA יעיל מפורטים בטבלה 1. ראה גם בקר ואח. עוד מידע9.
    1. בקצרה, equilibrate עמודת זיקה עם 20 מ של איגוד המאגר כדי להסיר את מאגר אחסון. החל סטרילי-מסוננים תגובת שיקוע על גבי עמודת זיקה באמצעות מזרק.
    2. לשטוף את העמודה עם 25-35 מ ל איגוד המאגר כדי להסיר את החלבונים לא מאוגד מן העמודה. בצע את שלב כביסה עד ספיגת UV-280 ננומטר נמצא בקרבת הערך ההתחלתי UV.
    3. Elute שבר RTA המאוגדים ב- 20-35 מ ל • תנאי מאגר (500 מ מ imidazole, 500 מ מ NaCl, 20 מ מ ח'2PO4, pH = 7.2) ולשמור את הדגימה על קרח (איור 2A ו- 2B איור).
      הערה: • תנאי של השבר RTA מסומן על ידי עלייה קליטה UV. אנא שימו לב לאסוף באופן בלעדי זה שבר למניעת זיהום עם חלבונים מאוגד לא ספציפית.
    4. להשתמש µL 20 eluted דגימות לביצוע כחול Coomassie מכתים11 או12,ניתוח תספיג13 (אופציונלי). השתמש הראשי שלו נגד נוגדנים (1:1, 000) משני אנטי-mouse-אג-HRP (1:10, 000) כדי לזהות RTA ולוודא מדגם טוהר (איור 3).
    5. Desalt שבר RTA eluted על עמודה desalting מ ל, equilibrate מדגם בסורביטול 0.8 מ'.
      1. להחליף את עמודת זיקה של המערכת לטיהור באמצעות עמודת desalting, equilibrate תחילה את העמודה עם 20 מ של 0.8 מ' בסורביטול.
      2. השבר RTA eluted חלות על העמודה באמצעות מזרק. רוחצים את העמודה עם 100 מ של 0.8 מ' בסורביטול את elute השבר RTA desalted בשפופרת 15 מ"ל ברגע קליטתם UV מתחיל לגדול (איור 2C).
      3. לאחסן את השבר RTA eluted ב 4 º C.
        הערה: עוצרים ישירות RTA שבר דגימה כאשר מוליכות מגביר כדי למנוע זיהום מלח. פרמטרים עבור ההליך desalting מפורטים בטבלה 1.
  4. להתרכז שבר RTA eluted ב 10,000 x g ו- 4 מעלות צלזיוס למשך 30-180 דקות באמצעות עמודת ספין 10 kDa ניתוק נפח סופי של 1-2 מ ל ולאחסן מדגם ב 4 מעלות צלזיוס למשך 3-4 שבועות.
    התראה: אין להקפיא את הדגימה מאז קפוא מוביל אובדן מוחלט של RTA פעילות.
  5. לקבוע ריכוז חלבון באמצעות ערכת קביעת חלבון קונבנציונלי. ריכוז חלבון צריך להיות בטווח של 1-1.5 מ"ג/מ"ל.
    הערה: RTA נוטה לזרז אם ריכוז חלבון גבוהה מדי (> 5 מ"ג/מ"ל).

3. שמרים טרנספורמציה והסרה דופן התא

  1. בעקבות מוטציות שמרים פראי-סוג או שנבחרו למחיקה GFP כתב פלסמיד pRS315-K28SP- GFP6 באמצעות שיטות טרנספורמציה של ליתיום סטנדרטית אצטט14. דגירה לתאים לאוצין הנשירה (d/o) צלחות גלוקוז (2% גלוקוז, 1.5% אגר, 0.5% אמוניום סולפאט, 0.17% בסיס חנקן שמרים (YNB) ו- 0.087% d/o לערבב בלי לאוצין) ב 30 מעלות צלזיוס במשך 2-3 ימים לבחירה שיבוט חיובי.
  2. לאסוף 3 שמרים שונים שיבוטים של כל צלחת ואת לחסן השיבוטים ב- 100 מ של לאוצין בינוני של raffinose d/o (2% raffinose, 0.5% אמוניום סולפאט, 0.17% YNB ו- 0.087% d/o לערבב בלי לאוצין)-220 סל ד ו- 30 ° C עד OD600 = 1.0-2.0 (2-4 x 107 תאים/mL).
    הערה: צמיחת תאים של זנים מחיקה שמרים שונים היא שונה. לפקח על יתר600 ויה ספקטרופוטומטרים.
  3. כדי לחשב ערכי600 OD, לדלל דגימות OD600 = 0.1-0.3 (1:5 עד 1:10 דילולים) ולמדוד את יתר600 בספקטרופוטומטר. אזכור, השתמש H2O בתוספת הכמות המתאימה של לאוצין d/o raffionose בינונית.
לבסוף, resuspend OD600 = 125 ב 5 מ ל מים סטריליים (5 x 108 תאים/mL).
  • צנטריפוגה תאים ב 25 מעלות צלזיוס למשך 5 דקות ב 10,000 x g תאים פעמיים עם 5 מ ל מים סטריליים, וקונטה resuspend תאים במאגר spheroplasting 50 מ ל (0.8 מ' בסורביטול, 10 מ מ טריס-HCl (pH 7.5), 10 מ מ CaCl2, 2 מ מ dithiothreitol (DTT), האנזים lytic 200 של µg/mL).
  • דגירה התרבות 50 מ ל- 100 סל"ד ו- 30 מעלות צלזיוס במשך 90 דקות אופציונלי: לפקח על היווצרות spheroplast כל 15 דקות על ידי מיקרוסקופ לעומת זאת שלב. תחת המיקרוסקופ, תאים צריך צבע כהה אפור שקוף. ברייט (refractile) תאים מתעכלים דיו, בעוד רוחות (אפור חיוור תאים עם קצת, אם בכלל, המבנה הפנימי) מתעכלים יתר על המידה.
  • בדוק spheroplast יעילות הכנה עבור כל דגימה.
    1. לאחר שלב הגמר 3.5, לערבב 4 µL של התרבות spheroplasted 50 מ עם מאגר spheroplasting µL (spheroplasts6 × 10 כ- 2) 496, צנטריפוגה 10 דקות ב 400 x g.
    2. Resuspend צנפה 10 מ ל H2O מזוקקים, דוגמת מערבולת עבור s 30, ואת הצלחת לצאת µL 10 המדגם על צלחות d/o לאוצין של גלוקוז (2% גלוקוז, 1.5% אגר, 0.5% אמוניום סולפאט, 0.17% YNB ו- 0.087% d/o לערבב בלי לאוצין).
    3. תקופת דגירה תאים של 3 ימים ב- 30 ° C. לספור את המספר הכולל של מושבות תאים בוגרים על הצלחת. להערכת נתונים, להשתמש רק דוגמאות עם יעילות גבוהה יותר 98% (מספר מושבת תאים כולל < מושבות 40/צלחת).
  • צנטריפוגה תאים מהשלב 3.5 400 x g ו- 4 ° C עבור תאים 10 דקות, לשטוף פעמיים עם 5 מ"ל התייצב לאוצין d/o raffinose בינוני (בסורביטול 0.8 מ', 2% raffinose, 0.5% אמוניום סולפאט, 0.17% YNB ו- 0.087% הנשירה לערבב בלי לאוצין). Resuspend תאים מ ל לאוצין מיוצב d/o raffinose בינוני (1 x 108 תאים/mL) ולהשתמש ישירות התאים למדידות וזמינותו GFP כתב (סעיף 4).
  • 4. GFP כתב Assay מדידה ב 96-ובכן צלחות

    1. זרע spheroplasts תא שמרים שהושג בשלב 3.7 96-ובכן לוחות (200 µL טוב).
    2. להוסיף 70 µL לאוצין מיוצב d/o בינוני raffinose המכיל בקרה שלילית (eluate של ני2 +-זיקה מטוהרים תא lysate מתאי IPTG-induced e. coli לבטא את הווקטור ריק) או מטוהרים RTA ב ריכוז RTA הסופי של 5 מיקרומטר ( המתאים 160 g/L RTA) כל היטב.
    3. מיד להוסיף 30 µL התייצב גלקטוז פתרון (30% גלקטוז, בסורביטול 0.8 מ') זירוז ביטוי GFP, ולאחר מכן להתחיל את המדידה.
      הערה: בצע משכפל טכנית לפחות 3 לכל ניסוי ומשוכפלת 3 ביולוגי לכל זן שמרים.
    4. לאחר סיום הכנת הדוגמא (שלבים 4.1-4.3), מכניסים את הצלחת 96-ובכן קורא פלורסצנטיות ולהתחיל את המדידה. השתמש במסנן nm 475/509 להגדיר נדרש לגילוי קרינה פלואורסצנטית GFP. לבצע מדידות ב 30 מעלות צלזיוס, 120 סל ד, ועם חזק בקוטר של 1 מ מ מעל חלון זמן של 20 h (מדידה במרווחים של 10 דקות).
      הערה: ערכת מסנן GFP זמין בדרך כלל בכל מערכות הקורא. טמפרטורה, חלון זמן, מדידה, במרווחי זמן וריכוז RTA יכול להיות מותאם לצרכים שלך. נציג התוצאות מוצגות באיור4.
    5. אופציונלי: השתמש בקרות פנימיות נוספות במדידה לבקרת איכות. להכין פקד שלילי על-ידי הוספת 30 µL לאוצין מיוצב d/o raffinose בינוני במקום 30% גלקטוז (אין אינדוקציה GFP). בנוסף, להוסיף µL 70 של 0.8 מ' בסורביטול התייצב G418 פתרון (300 µg/mL). החומר המדכא תרגום החלבון G418 משמש בקרה חיובית עבור עיכוב חלבונים כמו זה מונע GFP ביטוי שמרים.
    6. לחשב פלורסצנטיות GFP היחסי באחוזים עבור נקודת הזמן 20 h לפי המשוואה הבאה (ראה איור 4A): figure-protocol-1 איפה NC הוא הפקד שלילי
      1. לחלופין, לקבוע את פלורסצנטיות GFP היחסי עבור כל נקודה מדידה (תוך עשר דקות במקרה זה, ראה גם שלב 4.4) באמצעות המשוואה הנ ל. כפי שמוצג באיור 4B, ליצור גרף על ידי סופג עוצמות קרינה פלואורסצנטית GFP (ציר y) במשך הזמן (ציר x).

    הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

    תוצאות

    Loading...
    $$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

    תהליך העבודה הכללי של הפרוטוקול המתואר בכתב יד זה מודגם באיור 1, בערך מסכם את השלבים יחיד עבור הניסוי assay עוקבות של הכתב GFP וטיהור RTA מוצלחת. תיאור מפורט יותר של כל שלב בודדים ניתן למצוא בפרוטוקול. איור 2 ממחישה את התוצאות הצפויות טיהור RTA מוצלחת מאת כרומטוגרפיית זיקה (איור 2 א) ושליטה וקטור ריק (איור 2B). איור 2C מראה תוצאה נציג של ניס...

    הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

    דיון

    Loading...
    $$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

    בעת ביצוע בפרוטוקול לעיל, אנו ממליצים על ההצעות הבאות על מנת להשיג תוצאות מוצלחות של הניסוי.

    ביטוי חלבון heterologous, חשוב לא תעלה על ריכוז IPTG של 1 מ מ. ריכוז IPTG > 1 מ"מ לעכב יזם-induced RTA ביטוי ולהוביל להורדת התשואות הרעלן. יתר על כן, התאים לא צריך להיות מעובד בטמפרטורה גבוהה יותר 28 ° C כדי למנוע היווצרות הגוף הכללה, קיפול לא יעיל ו איון הרעלן. RTA ביטוי בטמפרטורה נמוכה (למשל, 20-28 מעלות צלזיוס) אפשרית, מוביל גם ייצור הרעלן פעילים ביולוגית. עם זאת, הפחתת טמפרטורה נוספים ...

    הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

    גילויים

    Loading...
    $$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

    המחברים אין לחשוף.

    תודות

    Loading...
    $$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

    חלקים של מחקר זה היו מתבקשים נתמך על ידי מענק של פתוח (SFB 1027, A6).

    הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

    חומרים

    רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
    שםחברהמספר קטלוגהערות
    <זנים חזקים>חיידקים ושמרים
    E. coli BL21 DE3(Gold)Aligent Technologies230130
    S. cerevisiae BY4742EuroscarfY10000
    S. cerevisiae BY4742 מוטציות מחיקהDharmaconYSC1054כל האוסף
    nameCompanyCatalog NumberComments
    Plasmids המשמשים בפרוטוקול זה
    pET24a(+) (Novagen)Millipore69772-3
    pET-RTA(His6)בקר et al. (2016)3
    CompanyCatalog NumberComments
    Reagents
    Zymolyase 20TUSBioZ1000.250אנזים ליטי לדופן התא הסרה
    מרק LB בינוניThermo Scientific1085502115 גרם אגר נוסף לייצור צלחת
    YNBThermo ScientificDF0335-15-9
    אמוניום גופרתיSigma-AldrichA4418-100G
    תערובת נשירה של שמרים ללא לאוציןסיגמא-אולדריץ'Y1376-20G
    אגרסיגמא-אולדריץ'05040-100 גרם
    D-גלוקוזסיגמא-אולדריץ'G8270-100G
    DTTסיגמא-אולדריץ'
    סיגמא-אולדריץ'83400-25G
    D-סורביטולסיגמא-אולדריץ'S1876-1KG
    D-גלקטוזסיגמא-אולדריץ'G0750-10MG
    G418תרמו סיינטיפיק
    IPTGSigma-AldrichI6758-1G
    ImidazoleRoth3899.1
    PAGE סרגל צבוע מראשסולם חלבון Fermentas26616המשמש לניתוח מערבי
    שםחברהמספר קטלוגיהערות
    <חזק>חומר לטיהור RTA, התפלה ומדידות קורא
    ספקטרופוטומטר Ultrospec 2100 proAmersham
    Soniprep 150MSEדגם ישן, דגמים אחרים זמינים
    Fluoroskan AscentThermo Scientific5210470דגם ישן, לא זמין יותר
    & אומל; מוצר KTAPurifierThermo Scientific28406266הופסק והוחלף
    HisTRAP עמודת HPGE Healthcare17-5248-02
    עמוד התפלהHiTRAP GE Healthcare11-0003-29
    מסנן סטרילי MidisartSartorius16534K0.2 & micro; ערכת
    בדיקת חלבון BCAm פירס23225
    ערכת בדיקה 660 ננומטרThermo Scientific22660
    96 צלחות בארThermo Scientific260860
    שםחברהמספר קטלוגיComments
    <נוגדנים חזקים>(אופציונלי)
    נוגדנים ראשוניים נגד טטרה-HisQiagen34670; דילול 1:1,000
    נוגדן משני נגד עכבר-HRPSigma-AldrichA9044-2ML, דילול 1:10,000
    10197777001-רפינוז 11811031 בגודל נקבוביות

    מקורות

    Loading...
    $$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
    1. Li, S., et al. Folding-competent and folding-defective forms of ricin A chain have different fates after retrotranslocation from the endoplasmic reticulum. Mol Biol Cell. 21 (15), 2543-2554 (2010).
    2. Li, S., Spooner, R. A., Hampton, R. Y., Lord, J. M., Roberts, L. M. Cytosolic entry of Shiga-like toxin a chain from the yeast endoplasmic reticulum requires catalytically active Hrd1p. PLoS One. 7 (7), e41119(2012).
    3. Moreau, D., et al. Genome-wide RNAi screens identify genes required for Ricin and PE intoxications. Dev Cell. 21 (2), 231-244 (2011).
    4. Giepmans, B. N., Adams, S. R., Ellisman, M. H., Tsien, R. Y. The fluorescent toolbox for assessing protein location and function. Science. 312 (5771), 217-224 (2006).
    5. Majoul, I. V., Bastiaens, P. I., Soling, H. D. Transport of an external Lys-Asp-Glu-Leu (KDEL) protein from the plasma membrane to the endoplasmic reticulum: studies with cholera toxin in Vero cells. J Cell Biol. 133 (4), 777-789 (1996).
    6. Becker, B., Schnoder, T., Schmitt, M. J. Yeast Reporter Assay to Identify Cellular Components of Ricin Toxin A Chain Trafficking. Toxins (Basel). 8 (12), (2016).
    7. Li, X. P., Baricevic, M., Saidasan, H., Tumer, N. E. Ribosome depurination is not sufficient for ricin-mediated cell death in Saccharomyces cerevisiae. Infect Immun. 75 (1), 417-428 (2007).
    8. Lord, J. M., Roberts, L. M., Robertus, J. D. Ricin: structure, mode of action, and some current applications. Faseb J. 8 (2), 201-208 (1994).
    9. Becker, B., Schmitt, M. J. Adapting yeast as model to study ricin toxin a uptake and trafficking. Toxins (Basel). 3 (7), 834-847 (2011).
    10. Seidman, C. E., Struhl, K., Sheen, J., Jessen, T. Introduction of plasmid DNA into cells. Curr Protoc Mol Biol. , (2001).
    11. Brunelle, J. L., Green, R. Coomassie blue staining. Methods Enzymol. 541, 161-167 (2014).
    12. Shapiro, A. L., Vinuela, E., Maizel, J. V. Jr Molecular weight estimation of polypeptide chains by electrophoresis in SDS-polyacrylamide gels. Biochem Biophys Res Commun. 28 (5), 815-820 (1967).
    13. Towbin, H., Staehelin, T., Gordon, J. Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: procedure and some applications. 1979. Biotechnology. 24, 145-149 (1992).
    14. Ito, H., Fukuda, Y., Murata, K., Kimura, A. Transformation of intact yeast cells treated with alkali cations. J Bacteriol. 153 (1), 163-168 (1983).
    15. Vitetta, E. S., Yen, N. Expression and functional properties of genetically engineered ricin B chain lacking galactose-binding activity. Biochim Biophys Acta. 1049 (2), 151-157 (1990).
    16. Wales, R., Roberts, L. M., Lord, J. M. Addition of an endoplasmic reticulum retrieval sequence to ricin A chain significantly increases its cytotoxicity to mammalian cells. J Biol Chem. 268 (32), 23986-23990 (1993).
    17. Breslow, D. K., et al. A comprehensive strategy enabling high-resolution functional analysis of the yeast genome. Nat Methods. 5 (8), 711-718 (2008).
    18. Jablonowski, D., Schaffrath, R. Zymocin, a composite chitinase and tRNase killer toxin from yeast. Biochem Soc Trans. 35 (Pt 6), 1533-1537 (2007).
    19. Jablonowski, D., Schaffrath, R. Saccharomyces cerevisiae RNA polymerase II is affected by Kluyveromyces lactis zymocin. J Biol Chem. 277 (29), 26276-26280 (2002).
    20. Jablonowski, D., Frohloff, F., Fichtner, L., Stark, M. J., Schaffrath, R. Kluyveromyces lactis zymocin mode of action is linked to RNA polymerase II function via Elongator. Mol Microbiol. 42 (4), 1095-1105 (2001).

    הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

    הדפסות חוזרות והרשאות

    בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה

    בקש הרשאה

    תגיות

    GFP

    מאמרים קשורים