הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.

מאמר שיטה

באמצעות קרינה פלואורסצנטית בחיי עיר הכלאה (דגים) כדי לנטר את מצב היד לכידות ב- Prometaphase, מפה של אני דרוזופילה Oocytes

10.8K צפיות

⸱

DOI:

10.3791/56802

⸱

6 בדצמבר 2017

 , 
1Department of Biological Sciences, Dartmouth College

במאמר זה

סיכום

כתב יד זה מציג שיטה מפורטת ליצירת X-כרומוזום הזרוע המחקרים וכל ביצוע קרינה פלואורסצנטית בחיי עיר הכלאה (דגים) לבדוק את מצבה של אחותך כרומטידה לכידות ב- prometaphase, מפה של עצרתי דרוזופילה oocytes. פרוטוקול זה מתאים לקביעת אם הזרוע meiotic לכידות הוא שלם או קטועים ב שונים אחרים.

תקציר

בבני אדם, כרומוזום סגרגציה שגיאות oocytes אחראים המכריע של הפלות, מומים מולדים. יתר על כן, נשים בגיל, הסיכון שלהם להריון שהעובר aneuploid גדל באופן דרמטי, תופעה זו נקראת השפעת גיל אימהי. אחד הדרישה כרומוזום מדויק סגרגציה במהלך לחטיבות meiotic הוא תחזוקה של אחותו כרומטידה לכידות במהלך התקופה המורחבת prophase oocytes להיתקל. ממצאים cytological בני אדם והן דגם אורגניזמים מעידים כי לכידות meiotic מתדרדר במהלך תהליך ההזדקנות. בנוסף, הפרדה בין שגיאות oocytes האנושי הם הנפוצות ביותר במהלך המיוזה אני, עקבי עם הפסד מוקדמת של הזרוע לכידות. השימוש של אורגניזמים מודל הוא קריטי עבור להתיר את המנגנונים העומדים בבסיס תלויי-גיל אובדן של לכידות. דרוזופילה melanogaster מציע מספר יתרונות לימוד ברגולציה של לכידות meiotic ב oocytes. עם זאת, עד לאחרונה, רק בדיקות גנטיות היו זמינות assay אובדן היד לכידות ב oocytes של אחרים שונים או בתנאים שונים ניסיוני. כאן, הוא פרוטוקול מפורט בתנאי לשימוש פלורסצנטיות בחיי עיר הכלאה (דגים) ישירות להמחיש מפגמים הזרוע לכידות ב prometaphase מפה של עצרתי דרוזופילה oocytes ואני. על ידי יצירת בדיקה דגים זה hybridizes את הזרוע דיסטלי של כרומוזום ה- X ואיסוף קונאפוקלית ערימות Z, חוקר יכול להמחיש את מספר אותות נפרדים דגים בשלושה ממדים ו לקבוע אם אחותי כרומטידה הזרועות מופרדים. ההליך שתואר מאפשר לכמת פגמים לכידות הזרוע מאות דרוזופילה oocytes. ככזה, בשיטה זו מספק כלי חשוב לחקור את המנגנונים שתורמים לכידות תחזוקה, כמו גם את הגורמים שמובילים את מותו במהלך תהליך ההזדקנות.

מבוא

סגרגציה תקין של הכרומוזומים במהלך מיטוזה, מיוזה דורש האחות כרומטידה לכידות להיות הוקמה, ומתוחזק שפורסם אופנה מתואמת1,2. לכידות נוסדה במהלך שלב S ומתווך על ידי cohesin מורכבים, המהווה קישורים פיזיים להחזיק את האחות chromatids ביחד. מיוזה, לכידות דיסטלי להתהפכויות גם מתפקד להחזיק homologs רקומביננטי יחד, הקשר גופניות הזה מסייע להבטיח כיוון נכון של טרינארית על כל ציר אני (איור 1)3,4, 5. שחרורו של הזרוע לכידות-"אנאפאזה" אני מאפשר את homologs הפרדת כדי צירים ההפוכים. עם זאת, אם הזרוע לכידות פגים, homologs רקומביננטי לאבד את החיבור הפיזי שלהם גם של הפרדת באופן אקראי, אשר יכול לגרום aneuploid לגמטות (איור 1).

ב- oocytes האנושי, שגיאות בסגרגציה כרומוזום הגורם המוביל של הפלות, מומים מולדים, כגון תסמונת דאון6, השכיחות שלהם עולה אקספוננציאלית עם גיל7. כרומטידה אחות לכידות נוסדה בשנת oocytes עוברי, רקומבינציה meiotic הושלמה לפני הלידה. Oocytes ואז לעצור באמצע prophase אני עד הביוץ ובמהלך המעצר הזה, האגודה פיזי מתמשך של homologs רקומביננטי מסתמך על אחותי כרומטידה לכידות. לכן, הפרדה מדויקת במהלך המיוזה ותוצאות הריון נורמלי דורשים כי לכידות נשארים בעינם עד חמישה עשורים.

אובדן מוקדמת של לכידות במהלך מעצרו meiotic ממושך של האדם oocytes הוצע לתרום האפקט גיל אימהי, שורות מרובות של ראיות תומכות זו השערה8,9. עם זאת, לאור האתגרים של הלומדים לכידות meiotic ב oocytes האנושי, הרבה ההבנה שלנו של תופעה זו מסתמך על השימוש של מודל אורגניזמים5,10,11,12, 1314,,15.

דרוזופילה melanogaster oocytes מציעים יתרונות רבים עבור המחקר של סגרגציה לכידות והסכמה כרומוזום meiotic. Assay הגנטי פשוטות מאפשרת לשחזר רומא גמטות aneuploid ולמדוד את הנאמנות של X-הפרדה בין כרומוזום16,11,17בקנה מידה גדול. יתר על כן, אחד יכול גם לקבוע האם כרומוזום סגרגציה שגיאות מתעוררות כי homologs רקומביננטי missegregate במהלך המיוזה אני, הפנוטיפ עקבי עם אובדן היד לכידות11,18, מוקדמת 19. ישיר התבוננות המדינה של לכידות meiotic ב דרוזופילה oocytes אפשרי גם באמצעות קרינה פלואורסצנטית בחיי עיר הכלאה (דגים). למרות oligonucleotides פלורסנט כי hybridize אל לווין חוזרות רצפים שימשו במשך יותר מעשור כדי לפקח על לכידות pericentromeric בוגרת דרוזופילה oocytes4,20, ניתוח של הזרוע לכידות כבר הרבה יותר מאתגר. ויזואליזציה של מצב היד לכידות דורש בדיקה המתפרס על אזור גדול של עותק בודד רצף בהיר מספיק את התוצאה גלוי אותות עבור אחותי בודדים chromatids כאשר היד לכידות נעדר. בנוסף, התנאים קיבוע oocyte והגודל של DNAs שכותרתו חייבת לאפשר חדירה21 לתוך גדול בוגר דרוזופילה oocyte (200 מיקרומטר רחב על ידי רב 500 מיקרומטר). לאחרונה, בדיקה הזרוע היה בהצלחה מנוצל כדי להמחיש דרוזופילה oocyte chromatids במהלך "אנאפאזה", אבל המחברים הצהיר כי הם לא היתה אפשרות לזהות אות ב- prometaphase או מפה של עצרתי oocytes22. כאן אנו מספקים פרוטוקול מפורט עבור הדור של X-זרוע כרומוזום דגים רגשים ועל תנאים הכנה oocyte אפשרו לנו assay לירידה מוקדמת של אחותו כרומטידה לכידות ב- prometaphase ומפה של אני oocytes. שיטות אלה, אשר אפשרו לנו לזהות מוצרים גנים הדרושים לשם שמירה על לכידות meiotic, יאפשר לאחרים assay עבור אחותי כרומטידה לכידות מפגמים בוגרת דרוזופילה oocytes של אחרים שונים.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

1. תכשירים

  1. היכונו פתרונות פלורסצנטיות בחיי עיר הכלאה (דגים). להכין את כל הפתרונות באמצעות הנדסה גנטית מים.
    1. להכין 5 x המאגר של שינוי Robb: 275 מ מ אשלגן אצטט, 200 מ"מ סודיום אצטט, 500 מ מ סוכרוז, גלוקוז 50 מ מ, 6 מ מ מגנזיום כלוריד, 5 מ מ סידן כלורי, 500 מ מ HEPES pH = 7.4. להביא את ה-pH 7.4 באמצעות 10 N NaOH. מסנן לחטא ולאחסן ב-20 ° C. הפשרת ולאחר לדלל כדי 1 x כנדרש ולאחסן aliquots x 1 ב-20 ° C.
    2. הכינו 10 x buffered פוספט תמיסת מלח (PBS) באמצעות 1.3 M NaCl, 70 מ"מ נה2HPO4,2PO NaH 30 מ מ4. להביא pH 7.0 באמצעות 10 N NaOH. לחטא על ידי עיקור autoclaving או המסנן.
  2. להכין coverslips זכוכית אקרילית-L-ליזין יום אחד לפני הצורך.
    1. פיפטה אתנול 70% המכיל 1% חומצה הידרוכלורית על פני coverslip 18 מ"מ x 18 מ"מ #1.5, דגירה 5 דק שימוש השאיפה ואקום להסיר את הנוזל. חזור עם מים הנדסה גנטית סטרילי. לכסות את פני השטח של coverslip עם 0.1 מ"ג/מ"ל פולי-L-ליזין, תקופת דגירה של 10 דקות.
    2. האחות כדי להסיר את נוזל, אוויר יבש במשך 10 דקות החנות coverslips לצד פולי-L-ליזין למעלה בתוך מיכל פלסטיק עם מכסה ההדוקות כדי למנוע אבק.
  3. להכין פסטר משך פיפטות להסרת פתרונות נוזלי מבלי להסיר את oocytes. מעל להבה מבער בונזן, חום באמצע של כוס ארוכה פסטר פיפטה כשאתה מושך בעדינות בכל קצה עד הזכוכית נמס ומשיכה לגזרים.

2. דור של הזרוע בדיקה דגים

הערה: כל השלבים צנטריפוגה מבוצעות ב g x ~ 16,000-21,000 (מהירות מירבית על רוב microcentrifuges מלמעלה בטבלה). צנטריפוגה קצר ספינים לציין ספינינג על מערבולת ס' 5-15 מציין vortexing ~ 15 s-max מהירות אלא אם נכתב אחרת.

הערה: ניתן להשיג BACs עבור הזרוע הגששים ממשאבים PAC BAC. שני רגשים זרוע תהיה של כרומוזום X שימשו בהצלחה בשיטה זו. רגש בזרוע אחד היה מורכב של 6 שיבוטים BAC המתאים ל cytological להקות 6E-7B (BACR17C09, BACR06J12, BACR35J16, BACR20K01, BACR35A18, BACR26L11). החללית זרוע אחרת כללה 6 שיבוטים BAC המתאימים כדי להקות cytological 2F - 3C (BACR13K19, BACR21G11, BACR09H13, BACR30B01, BACR34O03, BACR03D13). BACs כדי אחרים כרומוזום דרוזופילה אזורים יכול להיות עיינת בשעות: http://www.fruitfly.org/sequence/X1-11-assembly.html. שני רגשים pericentric מזהה חזור בלוויין bp 359 כרומוזום X שימשו בהצלחה בשיטה זו. בדיקה נוקלאוטיד 22 כבר בשימוש נרחב, ועובד טוב (5'-Cy3-AGGGATCGTTAGCACTCGTAAT)19,23. בדיקה נוקלאוטיד 28 לאחרונה נבדקה והוכחה גם עבד טוב (5'-Cy3-GGGATCGTTAGCACTGGTAATTAGCTGC)24. HPLC טהור oligonucleotides 5' המסומנת fluorophore ספציפיים הורו ממקור מסחרי (למשל, טכנולוגיות DNA משולב).

  1. תכינו BAC לשכפול ה-DNA בעקבות הוראות ערכת כמפורט בטבלה של חומרים. Resuspend בגדר DNA המתקבל 100 מ של התרבות ב- 200 µL TE; ריכוז הדנ א הסופי צריך לנוע בין 5-40 ng/µL בהתאם השיבוט BAC.
  2. לבצע הגברה DNA עבור כל BAC באמצעות ערכת הגברה, כפי שצוין במקטע הטבלה של חומרים, והפרוטוקול הבאים. תהליך ה-DNA BAC עבור כל המשובטים בנפרד. להשתמש אנזימים מאגרי מסופק עם הקיט בשלבים 2.2.1 דרך 2.2.3.
    1. פיצול אקראי של ה-DNA BAC: עבור כל BAC, השתמש טה להכין 10 µL של פתרון ה-DNA 1 ng/µL בשפופרת PCR 200 µL. להוסיף 1 µL 10 X פיצול המאגר. במקום הצינור במכונת ה-PCR בגיל 95 ° C עבור בדיוק 4 דק מיד מגניב המדגם במי קרח, צנטריפוגה בקצרה. הדגירה היא זמן רגיש, כל סטייה עשוי לשנות את תוצאות.
    2. ספריית הכנה
      הערה: שיטה זו משתמשת תחל אקראי כדי ליצור ספריה של קטעים amplifiable.
      1. את הצינור המכיל את ה-DNA להוסיף את הקוד הבא: µL 2 1 x ספריית הכנת מאגר, µL 1 של ספריית מייצב פתרון. לערבב ביסודיות על ידי vortexing, צנטריפוגה בקצרה, מקום ברכבת התחתית המכונה PCR ב 95 ° C עבור 2 דק מיד מגניב המדגם במי קרח, צנטריפוגה בקצרה.
      2. להוסיף 1 µL של ספריית הכנה האנזים PCR שפופרת, מיקס, צנטריפוגה בקצרה. המקום PCR צינור המכונה PCR, דגירה כדלקמן: 16 מעלות צלזיוס למשך 20 דקות, 24 מעלות למשך 20 דקות, 37 מעלות צלזיוס למשך 20 דקות, 75 º C למשך 5 דקות, ואז תחזיק ב 4 º C.
      3. להסיר דגימות מן המכונה PCR, צנטריפוגה בקצרה. דוגמאות עשוי להיות מוגבר באופן מיידי או המאוחסנים ב-20 ° C עד שלושה ימים.
    3. הגברה של ספריית ה-DNA BAC
      1. להוסיף את ריאגנטים הבאים התגובה כל קטע אקראי 15 µL: 7.5 µL 10 x מיקס מאסטר הגברה, 47.5 µL נוקלאז מים חינם, 5 µL WGA DNA פולימראז. לערבב ביסודיות על ידי vortexing, צנטריפוגה בקצרה.
      2. המקום PCR צינור המכונה PCR, דגירה כדלקמן: הראשונית דנטורציה 95 ° C למשך 3 דקות, 14 מחזורים של דנטורציה ב 94 ° C 15 s, חישול/הסיומת-65 מעלות צלזיוס למשך 5 דקות, ואז תחזיק ב 4 º C.
      3. בתום רכיבה על אופניים, assay את ריכוז הדנ א. ריכוז הדנ א צריך להיות לפחות 800 ng / µL. לשמור דגימות ב 4 ° C או חנות ב-20 ° C עד מוכן למערכת העיכול. באופן אופציונלי, להעריך את גודל מקטע DNA על-ידי הפעלת 400 ננוגרם של ה-DNA על ג'ל agarose 2%. שברי צריך לנוע בין 200 bp עד 3 kb (איור 2).
  3. אנזים הגבלה העיכול של DNA מוגבר
    1. מקום 20 µg של ה-DNA מוגבר מהסעיף הקודם צינור microfuge 1.5 mL. להוסיף 20 יחידות של Alul, Haelll, Msel, Mspl, Rsal, 25 יחידות של BfuCl, 0.5 BSA 100 x µL, µL 5 10 x אנזים הגבלה עיכול מאגר, ולכוונן את העוצמה כדי 50 µL על-ידי הוספת את הכמות המתאימה של הנדסה גנטית H2O.
    2. דגירה לעכל את בן לילה ב 37 מעלות צלזיוס בתוך אינקובטור למניעת עיבוי על המכסה. אתנול לזרז את ה-DNA מעוכל. להוסיף התקציר: 1 µL גליקוגן, כרך 1/10 3 מ' סודיום אצטט, כרכים 2.5 כיתה מולקולרית 100% אתנול. דגירה ב- 80 ° C 1 h או לילה.
    3. צנטריפוגה למשך 30 דקות ב 4 º C. צניפה DNA לשטוף עם נפח 1 חדר temp 70% אתנול וביו -ספין בשביל 5 דקות ב 4 º C. הסר את תגובת שיקוע ולתת את ה-DNA הצניפה אוויר יבש או יבש בעדינות עם זרם קבוע של אוויר.
    4. Resuspend בגדר דנ א 36 µL סטרילי הנדסה גנטית H2O ולהשתמש µL 1 של ה-DNA כדי assay את ריכוז הדנ א, אשר צריכה להיות כ 285 ng / µL. לאחסן את ה-DNA ב-20 ° C.
    5. לחלופין להעריך גודל מקטע דנ א פועל 400 ננוגרם של ה-DNA על ג'ל agarose 2%. שברי רוב צריך טווח מ- 100-200 bp, עם קליטה חלשה עד 500 bp (איור 2).
  4. 3' עוקבת. אחרי התגובה
    1. Denature ה-DNA מתעכל ב 100 מעלות צלזיוס במשך 1 דקה בתוך גוש חום. מקררים מיד במי קרח. כדי µL 35 ה-DNA, להוסיף את הדברים הבאים: 50 µL 400 מ נתרן cacodylate, 1 µL 10 מ מ DTT ו מערבולת היטב. להוסיף 4 µL 25 מ מ CoCl2, 2.5 µL 2 מ מ 5-(3-aminoallyl)-dUTP מן ארס תיוג ערכת כפי שצוינו בטבלה של חומרים, 5 µL 1 מ dTTP, 18 µL 5 מאגר x TdT, ו 1 µL deoxynucleotidyl מסוף טרנספראז (TdT) 400 U / µL. מערבולת, צנטריפוגה בקצרה.
      התראה: CoCl2 הוא רעיל, לענוד הגנה הולמת.
    2. תקופת דגירה של 2 h ב 37 מעלות צלזיוס בתוך אינקובטור למניעת עיבוי. להוסיף 1 µL של 250 מ מ EDTA לעצור את התגובה ואת מערבולת בקצרה כדי לערבב. אתנול לזרז את ה-DNA זנב כמתואר לעיל (שלבים 2.3.2 - 2.3.4). Resuspend בגדר דנ א מיובשים 10 µL סטרילי הנדסה גנטית H2O. חנות ה-DNA ב-20 ° C עד מוכנים להמשיך.
  5. לנהל את ההטיה הפלורסנט באמצעות ערכת תיוג DNA כמפורט בטבלת חומרים.
    הערה: לאחר צבע יתווסף לשמור דגימות בחושך.
    1. Denature ה-DNA זנב ב 95 מעלות צלזיוס למשך 5 דקות בתוך גוש חום. מיד מגניב DNA קרח מים, צנטריפוגה בקצרה. הכנת מאגר תיוג בהתאם להוראות ערכת ולהוסיף 6 µL כל מדגם ה-DNA. Resuspend כל שפופרת של צבע ב- 4 µL של דימתיל סולפוקסיד הערכה. מערבולת, צנטריפוגה בקצרה.
    2. להשתמש שפופרת אחת של צבע עבור כל תגובה תיוג. הוסף את הפתרון לצבוע אל ה-DNA, מערבולת, צנטריפוגה בקצרה. דגירה התגובה תיוג בטמפרטורת החדר במשך 2 h בחושך. להוסיף 3 µL של 3 מ' hydroxylamine כדי לעצור את התגובה ואחריה µL 77 של נוקלאז-חופשית H2O הערכה. מערבולת, צנטריפוגה בקצרה.
  6. הסרת צבע שאינו מצומדת באמצעות ערכת טיהור PCR כפי שמצוין בטבלה של חומרים. בצע את הוראות היצרן. Elute DNA מן העמודה פעמיים באמצעות 40 µL • תנאי המאגר בכל פעם.
  7. אתנול לזרז הדי שכותרתו כפי שתואר קודם לכן (שלבים 2.3.2 - 2.3.4). Resuspend בגדר דנ א מיובשים במאגר • תנאי µL 10.
  8. להכין תערובת בדיקה
    1. תווית ה-dna לקבוע ריכוז לצבוע fluorochrome ב pmol/µL. ריכוז fluorophore עשויים לנוע בין 30-100 pmol/µL, בהתאם BAC. ריכוז ה-DNA עשוי לנוע בין 300-800 ng/µL.
      הערה: ההגדרה microarray עובד גם על ספקטרופוטומטרים microvolume, כגון שצוינו בטבלה של חומרים. בחלון microarray, בחר את ה-DNA-50 וציין את fluorochrome.
    2. ליצור שילוב אב על-ידי שילוב כמויות equimolar (pmol עבור חיל הים) של כל אחד הגששים BAC. מערבולת 30 s לפני שילוב. כדי להימנע מחזורים ההקפאה/ההפשרה, הכנת aliquots של המיקס מאסטר, חלות פרפין הסרט הצינורות כדי למנוע אידוי, ולאחסן בחושך ב-20 ° C.
      הערה: mastermix המכילה 250 pmol של כל אחד BAC בודדים 6 רגשים ב הנפח הכולל של 30-50 µL עובד טוב. Aliquot המכיל 25 pmol (עבור חיל הים) עבור כל BAC יהיה מספיק לתגובות הכלאה 40 שני µL, עם ריכוז בדיקה סופית של 0.31 pmol עבור חיל הים/µL עבור כל BAC.

3. ניתוח של קיבוע של Oocytes

  1. לאסוף 30 הבוגרת הבתולה של גנוטיפ המתאים. כדי להעשיר עבור oocytes בשלב מאוחר, החזק נשים ללא גברים בבקבוקון עם אוכל לעוף, שמרים יבשים 3-5 ימים לפני ניתוח25. יום לפני ניתוח, להעביר הנקבות בלי גז בקבוקון טריים עם שמרים.
  2. לבצע את הקרע.
    הערה: ראה איור 3 כלים נדרשים. פתרונות מוסרות באמצעות פיפטה פסטר משך אלא אם נכתב אחרת. בעת העברת השחלות תמיד להשתמש טיפ פיפטה מצופה עם 10% הפתרון BSA.
    1. בקערה הרדודה ויבתר המכיל המאגר של שינוי Robb, להשתמש מלקחיים להסיר את השחלות נקבה יחידה. שימוש מלקחיים או מחט טונגסטן בעדינות לפעור כל השחלה, המאפשר את הפתרון לפנות ovarioles הפנימית. להעביר את הזוג של השחלות splayed צינור microfuge 1.5 mL המכיל המאגר של 1 מ"ל ששינה Robb.
    2. חזור על שלב 3.2.1 לצבור השחלות של 20-25 נקבות בצינור microfuge 1.5 mL. סיום והניתוחים של הנקבות 20-25 בתוך 10 דקות.
  3. לבצע קיבוע כדלקמן.
    1. עם פיפטה משך פסטר, להסיר את הנוזל בצינור microfuge, השתמש P1000 כדי להוסיף במהירות 500 µL של 37 ° C פתרון השחלות, ולאחר מכן להוסיף מיד µL 500 של טמפרטורת החדר heptane ב השחלות.
    2. צינור microfuge לנער כדי מערבבים ומניחים על nutator במשך 3 דקות להסיר את הצינור microfuge nutator ואת המקום בארון תקשורת צינור עבור 1 דקות לאפשר את oocytes ליישב את העניין. הזמן קיבוע מוחלט הוא 4 דקות.
      התראה: פתרון heptane ב הם רעילים, לענוד הגנה הולמת.
    3. הסר את הפתרון ולשטוף את השחלות 3 פעמים ב- 500 µL ל- PBS המכיל BSA 0.5% ו- 0.1% טריטון X-100 (PBSBTx)
  4. חזור על אחרים שנותרו.

4. הסרת Chorions וממברנות Vitelline

הערה: ראה איור 3 כלים נדרשים.

  1. נפרדים oocytes בשלב מאוחר
    1. להוסיף 1 מ"ל PBSBTx תבשיל ויבתר רדוד. השתמש P200 עם טיפ מצופה BSA להעביר השחלות קבוע (ב µL ~ 150) לתוך המנה רדוד. פיפטה השחלות למעלה ולמטה עם קצה פיפטה מצופה BSA לנתק את oocytes בוגר מ oocytes פחות בוגר.
    2. כאשר oocytes בשלב מאוחר מספיק מופרדים, להעביר את כל רקמת צינור microfuge 500 µL. להסיר את עודף נוזל עם פיפטה משך פסטר, עוזב על 150-200 µL בצינור. חזור על סעיף 4.1 אחרים שנותרו.
  2. להתכונן מתגלגל
    1. טרום רטוב מאכל טוב עמוק עם 200 µL של PBSBTx. לכסות, מניחים בצד. לקבל 3 שקופיות זכוכית חלבית, קבע שקופית #3 הצידה. יש לשפשף בעדינות את האזורים זכוכית חלבית של שקופיות #1 ו #2 ביחד. לשטוף אותם במים יונים כדי להסיר את כל רסיסי הזכוכית ויבש עם מגבון חד פעמיות.
    2. מעיל האזורים עמומה של שקופיות #1 ו #2 עם PBSBTx על-ידי הוספת µL 50 של PBSBTx שקופית אחת ומשפשף את האזור הזה כאשר השקופית אחרים. הסר את הנוזל עם מגבון חד פעמיות.
    3. מקם את השקופיות תחת מיקרוסקופ ויבתר בתצורה שמוצג באיור 4A. לשמור האזורים עמומה של שקופיות #1 ו #2 בקשר עם שקופית #3 תומכים שקופית #2.
  3. רול oocytes; ודא כי הכיוון של גלגול הוא תמיד קו ישר, לא תנועה מעגלית.
    1. Prewet P200 פיפטה עצה ב PBSBTx ומעוררים את oocytes בצינור microfuge על ידי pipetting למעלה ולמטה. להעביר 50 µL של oocytes המכילה נוזל במרכז החלק זכוכית חלבית של שקופית #1. הרם שקופית 2 # לעשות את זה.
    2. הורידו לאט שקופית #2 עד מתח הפנים של הנוזל יוצר חותם בין שני האיזורים זכוכית חלבית. צריך להיות מספיק נוזלים כדי לכסות את האזור חלבית אבל אף אחד לא צריך להיות מחלחל החוצה. אם הנוזל עולה על גדותיו, להשתמש פיפטה פסטר משך כדי להסיר עודפי נוזלים.
    3. להחזיק את השקופית התחתון (#1) במקום עם יד אחת, תשתמש ביד השנייה כדי להעביר את השקופית העליונה (#2) הלוך בכיוון אופקי, שמירה על שקופית #2 רמת והחלק הנתמכות ב- #3. לבצע תחת מיקרוסקופ להמחשת קל של תנועות oocyte והתקדמות.
      הערה: תנועה זו ליצור חיכוך של לגרום את oocytes "לגלגל" ולאבד את chorions שלהם. לחץ מינימלי צריך לשמש, התנועות צריכות להיות קצר ומהיר.
    4. אחרי כמה תנועות בכיוון אופקי, קצת לשנות את הזווית של התנועה (איור 4B). במרווחים מרובים, להגדיל בהדרגה את זווית 90 מעלות עד התנועה של השקופית העליונה (#2) ניצב לכיוון ההתחלה (איור 4B). שים לב chorions ריק יהיה גלוי בנוזל oocytes חסר chorions יופיע ארוכים ודקים.
    5. חזור על שלבים 4.3.3 - 4.3.4 כ 7 - 10 פעמים עד הפתרון הופך מעוננים מעט. תפסיק להתגלגל כאשר הרוב המכריע של oocytes (75-85%) מופיעים איבדו את הקרומים vitelline שלהם.
      הערה: קצה מחודד הבולט הוא לעתים קרובות גלוי על oocytes חסר ממברנות vitelline. ממברנות vitelline קשים יותר להסרה מאשר chorions. לחץ קל ניתן להחיל את השקופית העליונה (שקופית #2) תוך מתיחת להשגת הסרה של ממברנות vitelline. מנסה להסיר ממברנות vitelline מכל oocytes לעתים קרובות התוצאות הרס של אחרים oocytes.
    6. הרם בעדינות את השקופית העליונה (#2), גרירת אחת מפינותיו למרכז של האזור עמומה של השקופית התחתון (#1) כך התגלגל oocytes לצבור במרכז האזור עמומה. לשטוף oocytes של שתי שקופיות עם PBSBTx לתוך המנה עמוק טוב המכיל PBSBTx.
    7. לנקות שקופיות #1 ו #2 במים הנדסה גנטית, יבש עם מגבון חד פעמיות, ואפס. חזור על שלבים 4.3.1 - 4.3.6 ללא עד כל oocytes של גנוטיפ באותה כבר התגלגל. פעולה זו דורשת בדרך כלל 3-4 סיבובים של מתגלגלים לכל גן # מושגים בסיסיים.
  4. הסרת לכלוך לאחר מתגלגל
    1. להוסיף 1 מ"ל PBSBTx צינור חרוטי 15 מ"ל. מערבולת הנוזל כדי להרגיע את צידי הצינור.
    2. שימוש PBSBTx מצופה P1000 פיפטה עצה, העברת oocytes התגלגל מן המצולות טוב צלחת צינור חרוטי המכיל 1 מ ל PBSBTx. הוספה mL 2 נוספים של PBSBTx אל הצינור חרוט המכיל את oocytes.
    3. תן את oocytes להתחיל ליישב את העניין, ואז להסיר את החלק העליון 2 מ"ל של פתרון המכיל פסולת (chorions, vitellines, וכו ') עם P1000 ולמחוק. אם יש צורך, להחזיק את הצינור חרוט על רקע כהה כדי לראות את oocytes אטום כפי הם שוקעים.
    4. להוסיף 2 אוטם נוסף של PBSBTx oocytes, וחזור על שלב 4.4.3. חזור על 4.4.3. סה"כ 3 סיבובים של הסרת פסולת.
    5. שימוש PBSBTx מצופה P1000 פיפטה עצה, העברה oocytes בחזרה אל הצינור המקורי µL 500 microfuge. 20 - 25 נקבות אמור להניב כ 50 µL של oocytes בוגרת מגולגל.
  5. חזור על סעיף 4 אחרים שנותרו באמצעות שקופיות קפואה טרייה, תבשיל טוב נקי עמוק, צינור חרוטי עבור כל גנוטיפ.
  6. אם נחוץ אחסון, העברה oocytes כדי PBS 1 x עם 0.1% TritionX-100 וחנות לילה ב 4 º C. אחסון לטווח ארוך אינו מומלץ כי פורמלדהיד crosslinking יכול להיות הפוך על ידי חומרי ניקוי ללא יונית.

5. דגים

הערה: כל שוטף מבוצעות על nutator בטמפרטורת החדר אלא אם צוין אחרת. Oocytes זה כבר התגלגל להתארך להתיישב לתחתית הצינור microfuge, במיוחד בתחום פתרונות המכילים formamide. חשוב להיות סבלניים בעת שינוי פתרונות כך oocytes הם לא איבד את התהליך. זה עשוי לדרוש מחכה 5-15 דקות כדי לאפשר oocytes להתיישב לאחר שטיפות, שוטף. שימו לב גם כי oocytes ב formamide הם פחות אטום.

  1. חילוץ וטיפול RNAse
    1. לשטוף את oocytes עם µL 500 ל- PBS המכיל 1% טריטון X-100 (PBSTx). להסיר את הנוזל ולהוסיף 500 µL החילוץ מאגר (PBSTx המכיל RNAse). דגירה על nutator בטמפרטורת החדר במשך שעתיים.
  2. הכלאה קדם שוטף
    1. לשטוף oocytes 3 פעמים עם 500 µL 2 x ציטראט נתרן מלוחים המכילים Tween 20 (SSCT). מחממים את aliquot (~ 500 גנוטיפ/µL) 2 x SSCT + 50% formamide ל- 37 מעלות צלזיוס.
      התראה: formamide הוא רעיל, ללבוש הגנה הולמת.
    2. לשטוף oocytes 3 פעמים למשך 10 דקות כל אחד ב- 500 µL 2 x SSCT. לשטוף oocytes 10 דקות ב- 500 µL 2 x SSCT + 20% formamide. לשטוף oocytes 10 דקות ב- 500 µL 2 x SSCT + 40% formamide. לשטוף oocytes 10 דקות ב- 500 µL 2 x SSCT + 50% formamide.
    3. להסיר את הנוזל ולהוסיף 500 µL של 37 ° C 2 x SSCT + 50% formamide מהשלב 5.2.1 לטעום, תקופת דגירה של 2 h ב 37 ° C עם סיבוב.
      הערה: תנור הכלאה מצויד rotator עובד עליו היטב. צינור microfuge קצף "לצוף" המצורפת מסובב יכול לשמש כדי לאבטח את הצינורות.
  3. דנטורציה של הכלאה
    1. לשימוש כל שפופרת של oocytes, µL 40 x 1 הכלאה מאגר המכיל 2.5 ng/µL centromeric החללית ואת 0.31 pmol עבור חיל הים/µL של כל בדיקה BAC. להכין פתרון של בדיקה במאגר הכלאה, מספיקים כל אחרים. מערבולת החללית s לערבב 30 לפני הוספת.
    2. באמצעות טיפ פיפטה P200 מצופים BSA, להעביר oocytes צינור PCR 200 µL. לשמור דגימות 37 ° C ו oocytes לתת ייחוס לתחתית ולאחר מכן השתמש על פיפטה פסטר משך כדי להסיר כמה שיותר נוזלים ככל האפשר.
    3. הוסף µL 40 של הכלאה לאודנום בדיקה (להכין בסעיף 2) כדי oocytes. למקם את הצינור PCR המכיל oocytes המכונה PCR, דגירה כדלקמן: 37 º C למשך 5 דקות, 92 º C למשך 3 דקות, ואז 37 º C למשך הלילה. לאחר בדיקה נוספת של oocytes, לשמור אותם בחושך ככל האפשר.
  4. פוסט-הכלאה שוטף
    1. מחממים את 2 x SSCT + 50% formamide ל- 37 ° C ולשמור אותו בחממה הכלאה. עם BSA מצופה P200 פיפטה עצה, להוסיף 100 µL של 37 ° C 2 x SSCT + 50% formamide ברכבת התחתית PCR עם oocytes, להעביר oocytes את צינור microfuge µL חדש 500.
    2. להוסיף את µL 400 נוספים של 37 ° C 2 x SSCT + 50% formamide אותו צינור ולתת ש-oocytes להתישב 37 ° C בחממה.
      הערה: ליישב בדרך כלל לוקח יותר זמן בשלב זה. זה לא חריג לקחת 15 דקות או יותר. חוסר סבלנות תגרום לאובדן משמעותי של oocytes.
    3. לשטוף את oocytes 3 פעמים במשך 20 דקות ב- 500 µL 37 ° C 2 x SSCT + 50% formamide ב 37 ° C עם סיבוב. שמור oocytes ב 37 ° C ואילו הם. מתפשרים.
    4. לשטוף את oocytes 3 פעמים למשך 10 דקות כל אחד ב- 500 µL 37 ° C 2 x SSCT + 50% formamide ב 37 ° C עם סיבוב. שמור oocytes ב 37 ° C ואילו הם. מתפשרים.
    5. בטמפרטורת החדר, לשטוף את oocytes 10 דקות ב- 500 µL 2 x SSCT + 40% formamide ב nutator. לשטוף את oocytes 10 דקות ב- 500 µL 2 x SSCT + 20% formamide. לשטוף את oocytes 10 דקות ב- 500 µL 2 x SSCT.
  5. כתם עם דאפי
    התראה: דאפי רעיל, לענוד הגנה הולמת.
    1. לשטוף oocytes עבור 20 דקות בתמיסה 500 µL דאפי (1 µg/ml) 2 x SSCT על nutator. יש לשטוף את oocytes 3 פעמים ב- 500 µL 2 x SSCT. לשטוף oocytes פי 2 עבור 10 דקות כל אחד ב- 500 µL 2 x SSCT על nutator. דוגמאות ניתן לאחסן עד 4 שעות בטמפרטורת החדר בחושך עד שיהיו מוכנים לעלות על coverslips.
  6. הרכבה
    הערה: ראה איור 3 כלים נדרשים.
    1. המקום פולי-L-ליזין מצופה coverslip תחת המיקרוסקופ ויבתר. הסר נוזל באמצעות הרכבת התחתית של oocytes, התאמת אמצעי האחסון הכולל כ-150 µL. עם BSA מצופה P200 פיפטה עצה, פיפטה למעלה ולמטה כדי לפזר oocytes לאורך כל הפתרון ולאחר מכן להעביר µL 40 של הפתרון/oocytes coverslip מצופה פולי-L-ליזין.
    2. הסר מעט מהנוזל coverslip באמצעות פיפטה פסטר משך עד oocytes מקל coverslip אבל עדיין מוקפים בנוזל. עם מלקחיים, החזק את תלוש הכיסוי בצד אחד, שימוש במחט טונגסטן בעדינות מביצועם גושים של oocytes, להעביר אותם על מנת להשיג שכבה אחת של oocytes שאינם חופפים.
    3. הסר את שאר הנוזל סביב oocytes עם פיפטה משך פסטר. קח זכוכית נקייה ולהשתמש בגז דחוס לפוצץ את כל האבק. הוסף µL 22 של הרכבה מדיה (למשל, Prolong-זהב) לאמצע של השקופית. הורידו לאט את השקופית לכיוון coverslip, עם התקשורת הרכבה פונה המדגם, עד התקשורת נוגע המדגם. מתח תגרום את coverslip לדבוק השקופית.
    4. המקום שקופיות בתוך מיכל פלסטיק עם מכסה ההדוקות המכיל שכבה של טרי dessicant (למשל, drierite). תן שקופיות יבש 3-5 ימים בחושך לפני הדמיה. זמן הייבוש עשוי להשתנות בהתאם הלחות של החדר.

6. הדמיה

  1. בעת הסרת שקופיות יבש מהתיבה של dessicant, לנקות אותם כדי להסיר את כל חלקיקי אבק. חותם coverslips עם לק. ניתן לאחסן שקופיות אטום ללא הגבלת זמן ב-20 ° C.
  2. רוכשים את סריקת תמונות קונאפוקלית באמצעות מטרה שמן גבוהה מפתח נומרי X 40 עם 6 X זום דיגיטלי לייזר.
    הערה: באופן אידיאלי, תוכנת המערכת תאפשר אחד כדי למצוא ולסמן את מיקום X-Y של כרומוזומים meiotic עבור oocytes מרובים בעת הצגתם באמצעות epifluorescence. יכולת זו חוסכת זמן במהלך מפגש הדמיה. המהירה הלבנה עם יעד מפתח נומרי גבוהה 60 X עשה את השימוש בו אינו מתאים עם מערכת קונאפוקלית שבחרת, אבל זה יפעלו עבור מערכות אחרות.
  3. לכידת סידרה Z עבור כל oocyte, הגדרת העליון והתחתון של הסדרה באמצעות האות דאפי.
    הערה: לקבל, היסט, ואת עוצמת הלייזר צריך להיקבע מדעית באמצעות תת-קבוצה של oocytes. ברגע נמצאו פרמטרים מתאימים, התאמות קלות רק צריך להתבצע.
    אם השתנה רכישה נדרשות הגדרות, להשתמש של אוסף התמונות שנאספו בעבר כדי לאמוד את השינויים הדרושים. כדי למנוע הלבנת, להימנע מראש הדמיה החללית היד לפני לכידת הסדרה Z. עם גודל צעד של 0.25 מיקרומטר, סדרת Z בדרך כלל בטווח של 25 עד 30 צעדים בהתאם הכיוון ואת המיקום של הכרומוזומים. גודל צעד קטן יותר עשוי לשפר את היכולת להעריך אם שני מקומות דגים מופרדים בממד צירית, אבל יש פשרה עם הזמן הדרוש כדי ללכוד צעדים קטנים ואובדן של עוצמת האות בשל הלבנת. מטרה X 40 עם 6 X זום דיגיטלי ושדה 1,024 x 512 התמונה יוצרת תמונות עם גודל פיקסלים של 0.05 מיקרומטר.

7. תמונה ניתוח והניקוד לכידות פגמים

  1. Deconvolve הסדרה Z כדי למטב את האות לרעש יחס עבור כל oocyte19.
    הערה: חבילת תוכנה כגון שצוינה טבלת חומרים מאפשר אחד deconvolve באמצעות שיקום אינטגרטיבית, כמו גם לחתוך, חדות-לשפר תמונות. חשוב לציין, חבילת תוכנה המאפשר אחד כדי הצגת תמונות והניקוד לכידות פגמים בתלת מימד הכרחי.
  2. עבור כל oocyte, משיבים את מספר מוקדים centromeric זה colocalize עם האות דאפי וכאב בזרוע. אובדן של לכידות תוצאות האותות ברורים ולא מופרדות שלוש או ארבע עבור בדיקה ספציפית. . זה לא נדיר להתבונן בשני מוקדים מחוברים על חוט דק. לפי הקריטריונים המחמירים ביותר, מוקדים אלה לא ייחשב "מופרד".

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

תוצאות

איור 5 מציג תמונות שהושג עם בדיקה היד זה hybridizes על אזור cytological 6E-7B על כרומוזום ה- X . התוצאה בדיקה לאות שיתוף רגישה עם זה של דאפי, הוא שקל להבחין ברקע, שימש בהצלחה לכמת הזרוע לכידות פגמים שונים אחרים19. כימות של לכידות פגמים הוגבל ל prometaphase אני, מפה של אני שלבים; oocytes לפני התמוטטות מעטפת הגרעין לא נכללו ניתוח19. מעטפה גרעיני שלם ניכרת בסריקת בערוץ דאפי כי הכרומוזומים oocyte תהיו מוקפי...

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

דיון

השימוש של דגים רגשים להעריך מצב היד לכידות ב prometaphase אני מפה של אני דרוזופילה oocytes הוא קידום משמעותי בשדה של מיוזה דרוזופילה . מבחינה היסטורית, חוקרים דרוזופילה היה מוגבל ל בדיקות גנטיות להסיק מוקדמת אובדן היד לכידות בוגרת oocytes11,18,19. עכשיו, עם השיטות המובאות כאן, המדינה של הזרוע לכידות יכול להיות לבדיקה ישירות באמצעות דגים. היכולת לקבל ראיות פיזיות לירידה מוקדמת של הזרוע לכידות מאוד מרחיב...

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

המחברים מצהירים אין אינטרסים כלכליים מתחרים.

תודות

עבודה זו נתמכה על ידי NIH גרנט GM59354 מוענק שרון אי ביקל. אנו מודים הוי נגוין ש לקבלת סיוע בפיתוח הפרוטוקול ליצירת זרוע פלורסנט הגששים, אן Lavanway לעזרה עם מיקרוסקופיה קונפוקלית ולאחר ג' ריד אמיליאנו לקבלת סיוע טכני. אנו מודים גם יחד עם עמיתים רבים בקהילה דרוזופילה עבור דיונים מועילים ועצות.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
ערכת הכנה <חזקה>ערכות
MidiQiagen12143Prep BAC clone DNA
GenomePlex ערכת הגברת גנום שלם (WGA)סיגמאWGA2הגברת שיבוט BAC DNA
ARES Alexa Fluor 647 ערכת תיוג DNAInvitrogenA21676תווית BAC שיבוט DNA
PCR ערכת טיהורQiagen28104הסר צבע לא מצומד בעקבות תיוג של שיבוט BAC DNA
NameCompanyCatalog NumberComments
>Chemicals & פתרונות
<חזקים>הערה: כל התמיסות מוכנות באמצעות מים סטריליים אולטרה-טהורים ויש לעקר אותן על ידי חיטוי או עיקור מסנן.
אלבומין בסרום בקר (BSA)Fisher ScientificBP1600-100הכן 10% ציר
הקפאה בכמות סידן
כלוריפישר סיינטיפיקC75-500
DAPI (4', 6-דיאמידינו-2-פנילינדול, דיהידרוכלוריד)InvitrogenD1306<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה. הכן 100&מיקרו; מלאי גרם/מ"ל באתנול 100%, אחסן במכסות ב-20 מעלות צלזיוס. הכן 1 &מיקרו; תמיסת גרם/מ"ל ב-2X SSCT לפני השימוש.
Dextran sulfateSigmaD-8906
DrieriteDrierite Company23001
Dithiothreitol (DTT)Invitrogen15508-013הכן מלאי 10 מ"מ
dTTP (10 ומיקרו; מול, 100 ומיקרו; l)Boehringer Mannheim1277049הכן מלאי 1 מ"מ
EDTA (חומצה טטראצטית דיסודיום אתילנדיאמיןפישר סיינטיפיקS311-500הכן מלאי 250 מ"מ
100% אתנול (דרגה מולקולרית, 200 הוכחה)DeconLaboratories2716
Tris (טהור במיוחד)Invitrogen15504-020
EGTA (אתילנביס (אוקסיאתילניטרילו) חומצה טטראצטית)סיגמאE-3889
16% פורמלדהידטד פלה, בע"מ18505<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה
פורממידInvitrogenAM9342<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה
גלוקוזפישר סיינטיפיקD16-1
גליקוגןרוש901393
HEPESBoehringer Mannheim737-151
הפטןפישר סיינטיפיקH350-4<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה.
חומצה הידרוכלוריתMilliporeHX0603-4<חזקה>רעילה: ללבוש הגנה מתאימה.
הידרוקסילאמיןסיגמא438227הכינו 3 מ' מלאי
4.9 מ' מגנזיום כלורידסיגמא104-20
Na2HPO4 Ÿ 7H2OFisher ScientificS373-500
NaH2PO4 Ÿ 2H2O Fisher ScientificS369-500
פולי-L-ליזין (0.1 מ"ג/מ"ל)SigmaP8920-100
אשלגן אצטטFisher ScientificBP364-500
נתרן אצטטFisher ScientificS209-500הכן מלאי 3M
נתרן קקודילאטPolysciences, Inc.1131<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה. הכן 400mM
מלאי נתרן ציטראטפישר סיינטיפיקBP327-1
נתרן כלוריפישר סיינטיפיקS271-3נתרן כלורי
סוכרוזפישר סיינטיפיקS5-500
10% טווין 20תרמו סיינטיפיק28320גופרי שטח
10% טריטון X-100תרמו סיינטיפיק28314גופרים
nameCompanyCatalog NumberComments
Solutions
הערה: כל הפתרונות מוכנים באמצעות מים סטריליים אולטרה-טהורים ויש לעקר אותם על ידי חיטוי או עיקור מסנן.
מאגר10 מ"מ טריס, 1 מ"מ EDTA, pH = 8.0
20X SSC (נתרן ציטראט מלוח)3 M NaCl, 300 מ"מ נתרן ציטראט
2X תמיסת<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה. 200 מ"מ נתרן קקודילאט, 200 מ"מ סוכרוז, 80 מ"מ נתרן אצטט, 20 מ"מ EGTA
1.1X מאגרהכלאה3.3X SSC, 55% פורממיד, 11% דקסטרן סולפט
תמיסת<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה. 4% פורמלדהיד, 1X תמיסת קיבוע קקודילאט
PBSBTx1X PBS, 0.5% BSA, 0.1% Trition X-100
PBSTx1X PBS, 1% Trition X-100
מאגר מיצוי (PBSTx + Rnase)1X PBS, 1% Trition X-100, 100 & מיקרו; גרם/מ"ל RNase,
2X SSCT2X SSC
2X SSCT + 20% פורממיד<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה. 2X SSC, 0.1% טווין 20, 20% פורממיד
2X SSCT + 40% פורממיד<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה. 2X SSC, 0.1% טווין 20, 40% פורממיד
2X SSCT + 50% פורממיד<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה. 2X SSC, 0.1% Tween 20, 50% formamide
NameCompany>CatalogComments
>Enzymes
AluINew England BiolabsR0137S
HaeIIINew England BiolabsR0108S
MseIניו אינגלנד BiolabsR0525S
MspIניו אינגלנד BiolabsR0106S
RsaIניו אינגלנד BiolabsR0167S
BfuCIניו אינגלנד BiolabsR0636S
100X BSAניו אינגלנד Biolabsמגיע עם אנזימי NEB
10X NEB buffer #2New England Biolabsמאגר עיכול אנזים הגבלה. מגיע עם אנזימי NEB
Terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) 400 U/µ lRoche/Sigma3333566001
TdT bufferRoche/Sigmaמגיע עם אנזים TdT
קובלט כלורידRoche/Sigma<חזק>רעיל: ללבוש הגנה מתאימה. מגיע עם אנזים TdT
RNase A (10 מ"ג/מ"ל)Thermo-ScientificEN0531
שםחברהמספר קטלוגיComments
>Cytology Tools etc.Forceps
Dumont#5 INOX, Biologie
9" פיפטות פסטר זכוכית חד פעמיותפישר13-678-20Cחיטוי לעיקור
חיתוך זכוכית רדודהבהתאמה אישית
צלחת באר עמוקה (3 בארות)Pyrex7223-34
Fisherfinest שקופיות מיקרוסקופ פרימיוםפישר סיינטיפיק22-038-104משמש לכיסוי כלי באר
עמוקים שקופיות זכוכית חלבית, 25 x 75 מ"מVWR Scientific48312-002
שקופיות זכוכית, 3 x 1 אינץ', עובי 1 מ"מThermo-Scientific3051
Coverslips, 10 x 10 מ"מ, מס' 1.5Thermo-Scientific3405
טונגסטןתוצרת בית
Prolong GOLD הרכבה מדיהמולקולריותP36930
אוויר דחוס בפחיתשונים
<חזק>שם<חזק>חברה<חזק>מספר קטלוגי<חזק>הערות
<חזק>ציוד
PCR שונים
Nanodrop 2000, ספקטרופוטומטר ספקטרופוטומטרמיקרו-נפח תרמו-מדעי
וורטקסרמגוון
מיקרופוגה שולחנית בטמפרטורת החדר
ב -4 מעלות; C
תנור היברידיזציה או חממה עם מסובב
מגוון נוטר
A1RSi סריקת לייזר קונפואלניקון40X שמן תוכנית פלואור DIC (NA 1.3)
<חזק>שם<חזק>חברה<חזק>מספר קטלוגי<חזק>הערות
><חזק>חומרים מתכלים וכו '
50 מ"ל צינורות חרוטייםשונים
של 1.5 מ"ל צינורות מיקרופוגהשונים
500 ומיקרו; l צינורות מיקרופוגהשונים
200 ומיקרו; l צינורות PCR
עם מכסה הדוקשוניםלהחזקת Drierite
Kimwipesמגבונים חד פעמייםשונים
Parafilmסרט פרפיןשונים
שם<>strongחברהמספר קטלוגיComments
Other
HPLC מטוהר 5'-labeled oligonucleotidesIntegrated DNA Technologiesבדיקות עם תווית Cy3 המזהות את החזרה הלוויינית של 359 bp של הכרומוזום X
Volocity תוכנת ניתוח תמונה תלת מימדיתPerkinElmerגרסה 6.3
) TE תיקון קקודילאט תיקון , , 0.1% טווין 20, , , צלחת מחט בדיקות מיקרופוגה שולחנית שונה בלוק חום שונים של 15 מ"ל צינורות חרוטיים שונים של 1.5 מ"ל שונים מיכל פלסטיק שונים

מקורות

  1. Peters, J. M., Nishiyama, T. Sister chromatid cohesion. CSH Perspect Biol. 4 (11), (2012).
  2. McNicoll, F., Stevense, M., Jessberger, R. Cohesin in gametogenesis. Curr Top Dev Biol. 102, 1-34 (2013).
  3. Buonomo, S. B., et al. Disjunction of homologous chromosomes in meiosis I depends on proteolytic cleavage of the meiotic cohesin Rec8 by separin. Cell. 103 (3), 387-398 (2000).
  4. Bickel, S. E., Orr-Weaver, T., Balicky, E. M. The sister-chromatid cohesion protein ORD is required for chiasma maintenance in Drosophila oocytes. Curr. Biol. 12 (11), 925-929 (2002).
  5. Hodges, C. A., Revenkova, E., Jessberger, R., Hassold, T. J., Hunt, P. A. SMC1beta-deficient female mice provide evidence that cohesins are a missing link in age-related nondisjunction. Nat Genet. 37 (12), 1351-1355 (2005).
  6. Freeman, S. B., et al. The National Down Syndrome Project: design and implementation. Public Health Rep. 122 (1), 62-72 (2007).
  7. Nagaoka, S. I., Hassold, T. J., Hunt, P. A. Human aneuploidy: mechanisms and new insights into an age-old problem. Nat Rev Genet. 13 (7), 493-504 (2012).
  8. Angell, R. R. First-meiotic-division nondisjunction in human oocytes. Am. J. Hum. Genet. 61, 23-32 (1997).
  9. Tsutsumi, M., et al. Age-related decrease of meiotic cohesins in human oocytes. PLoS One. 9 (5), e96710(2014).
  10. Liu, L., Keefe, D. L. Defective cohesin is associated with age-dependent misaligned chromosomes in oocytes. Reprod Biomed Online. 16 (1), 103-112 (2008).
  11. Subramanian, V. V., Bickel, S. E. Aging predisposes oocytes to meiotic nondisjunction when the cohesin subunit SMC1 is reduced. PLoS Genet. 4 (11), e1000263(2008).
  12. Chiang, T., Duncan, F. E., Schindler, K., Schultz, R. M., Lampson, M. A. Evidence that weakened centromere cohesion is a leading cause of age-related aneuploidy in oocytes. Curr. Biol. 20 (17), 1522-1528 (2010).
  13. Lister, L. M., et al. Age-related meiotic segregation errors in mammalian oocytes are preceded by depletion of cohesin and Sgo2. Curr. Biol. 20 (17), 1511-1521 (2010).
  14. Duncan, F. E., et al. Chromosome cohesion decreases in human eggs with advanced maternal age. Aging Cell. 11 (6), 1121-1124 (2012).
  15. Yun, Y., Lane, S. I., Jones, K. T. Premature dyad separation in meiosis II is the major segregation error with maternal age in mouse oocytes. Development. 141 (1), 199-208 (2014).
  16. Subramanian, V. V., Bickel, S. E. Heterochromatin-mediated association of achiasmate homologues declines with age when cohesion is compromised. Genetics. 181, 1207-1218 (2009).
  17. Jeffreys, C. A., Burrage, P. S., Bickel, S. E. A model system for increased meiotic nondisjunction in older oocytes. Curr. Biol. 13 (6), 498-503 (2003).
  18. Weng, K. A., Jeffreys, C. A., Bickel, S. E. Rejuvenation of Meiotic Cohesion in Oocytes during Prophase I Is Required for Chiasma Maintenance and Accurate Chromosome Segregation. PLoS Genetics. 10 (9), e1004607(2014).
  19. Perkins, A. T., Das, T. M., Panzera, L. C., Bickel, S. E. Oxidative stress in oocytes during midprophase induces premature loss of cohesion and chromosome segregation errors. Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (44), E6823-E6830 (2016).
  20. Dernburg, A. F., Sedat, J. W., Hawley, R. S. Direct evidence of a role for heterochromatin in meiotic chromosome segregation. Cell. 86, 135-146 (1996).
  21. Dernburg, A. F., Sedat, J. W. Method Cell Biol. 53, Academic Press. 187-233 (1998).
  22. Guo, Z., Batiha, O., Bourouh, M., Fifield, E., Swan, A. Role of Securin, Separase and Cohesins in female meiosis and polar body formation in Drosophila. J Cell Sci. 129 (3), 531-542 (2016).
  23. Giauque, C. C., Bickel, S. E. Heterochromatin-Associated Proteins HP1a and Piwi Collaborate to Maintain the Association of Achiasmate Homologs in Drosophila Oocytes. Genetics. 203 (1), 173-189 (2016).
  24. Joyce, E. F., Apostolopoulos, N., Beliveau, B. J., Wu, C. T. Germline progenitors escape the widespread phenomenon of homolog pairing during Drosophila development. PLoS Genet. 9 (12), e1004013(2013).
  25. Gilliland, W. D., Hughes, S. F., Vietti, D. R., Hawley, R. S. Congression of achiasmate chromosomes to the metaphase plate in Drosophila melanogaster oocytes. Dev Biol. 325 (1), 122-128 (2009).
  26. Gyuricza, M. R., et al. Dynamic and Stable Cohesins Regulate Synaptonemal Complex Assembly and Chromosome Segregation. Curr Biol. 26 (13), 1688-1698 (2016).
  27. Radford, S. J., McKim, K. S. Techniques for Imaging Prometaphase and Metaphase of Meiosis I in Fixed Drosophila Oocytes. J Vis Exp. (116), (2016).

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

הדפסות חוזרות והרשאות

תגיות

גשוש FISHלכידות זרועות מייוטיותפרומטפאזה Iמיקרוסקופיה קונפוקליתגלגול של ביציתהפרדת כרומוזומים
באמצעות קרינה פלואורסצנטית בחיי עיר הכלאה (דגים) כדי לנטר את מצב היד לכידות ב- Prometaphase, מפה של אני דרוזופילה Oocytes
צרו קשר
המליצו לספרייה

פרטיות

תנאי שימוש

מדיניות

זכויות יוצרים © 2026 MyJoVE Corporation. כל הזכויות שמורות.