כאן אנו מתארים את ההטמעה והפרשנות של התוצאות של שיטת ההתחדשות הכמותית העצמית של ממוגרפיה.
מאמר שיטה
כאן אנו מתארים את ההטמעה והפרשנות של התוצאות של שיטת ההתחדשות הכמותית העצמית של ממוגרפיה.
בלוטת החלב מתאפיינת ביכולת התחדשות נרחבת, כאשר היא עוברת שינויים הורמונליים מסיבי במהלך מחזור החיים של הנקבה. תפקידה של תאי גזע הפטמות מלמד באופן נרחב הן בהקשר הפיזיולוגי/ההתפתחותי והן ביחס לסרטן השד. בהיבט זה, מחקרים vivo ex התמקדו במאפייני MaSC מבוקשים מאוד אחרי. תרביות ממוגרפיה מייצגות תחליף של היווצרות איברים והפכו לכלי רב ערך עבור מחקר בסיסי וטרנסלייתי. כאן, אנו מציגים פרוטוקול מפורט עבור הדור של התרבויות הראשיות של murine וכימות של תכונות הצמיחה של MaSC. הפרוטוקול כולל איסוף ועיכול בלוטת החלב, בידוד תאי האפיתל הראשוניים של החלב (MECs), הקמת תרבויות ממוגרפיה ראשיות, הפסנות סדרתית, כימות ממוגרפיה של פרמטרי גדילה ופרשנות של התוצאות. כדוגמה, אנו מציגים את ההשפעה של ביטוי ברמה נמוכה מכונן Myc על נורמלי MECs המוביל לחידוש עצמי מוגבר והתפשטות.
בידוד ובתרבות החוץ-גופית בתאי הגזע האפיתל של הפטמות הפכו להיות חיוניים להבנת המאפיינים שלהם בביולוגיה של תאי החלב. שושלת היוחסין אלגנטי השתלת סדרתי בחני הופעלו המחקר של תאי גזע (ה scs) וקבוצות מערכות אחרות של רקמות בהקשר של שלהם vivo נישה. עם זאת, גישה זו היא זמן רב ודורש את הדור של מודלים העכבר הכתבת1,2,3,4,5. לכן, בתרבות החוץ-גופית ובהפצת תאי גזע הפטמות (מצות) תוך שמירה על תכונות מרכזיות של מפתח, כלומר התחדשות עצמית ויכולת בידול, הוא אחד האתגרים הגדולים ביותר בתחום. בשנים האחרונות, שיטת ממוגרפיה היתה בשימוש נרחב כדי לדגמן הן רקמת החלב הרגיל ואת הצמיחה סרטן השד, כדי לכמת ה scs נורמלי או סרטן (CSCs) ולהעריך יכולת התחדשות עצמית שלהם ככתב פונדקאית של פעילותם בהתאמה שלהם vivo ההקשר6,7,8,9,10,11.
שיטת הממוגרפיה הינה גישה יעילה וחסכונית, שבה תאי האפיתל מבודדים טריים (MECs) הם מתורבתים בתנאים שאינם מחסיד, עם ההנחה שרק מסקארי ישרוד ויוצרים כדורים בהשעיה בעוד כל סוגי התא האחרים ימותו על ידי אנואיקיס. יתרה מזאת, היכולת ליצור מספר דורות של ממוגרפיה במעברים סדרתיים לא-מיוצרים קשורה ליכולת ההתחדשות העצמית של מסקארי6,9,11. כאן, אנו מתארים פרוטוקול מפורט של שיטת ממוגרפיה כמותית, אשר פותחה בתחילה על ידי dontu ועמיתיו7 כשינוי של הגדרת הנוירוספירה החלוצית12, המאפשר צמיחה של הבנה ה scs בתנאים ללא מחסיד, סרום ללא התוספת של גורמי הצמיחה המתאימים7,12.
בהליכים vivo בוצעו בהתאם להנחיות האיחוד האירופי 2010/63 ולאחר אישור ועדת האתיקה המוסדית שלנו (האורגניזם לרווחתם של בעלי חיים-OPBA) ומשרד הבריאות האיטלקי (מספרי IACUC 762/2015 ו537/2017).
1. איסוף ועיכול בלוטת החלב מוריין
2. בידוד של משפחת מוריין הראשי
3. ציפוי מחדש של ממוגרפיה טורית
4. ספירת כדור באמצעות ניתוח תמונה דיגיטלית (DIA)
5. חישוב עקומת הצמיחה המצטבר
הערה: מספר כדורי הממוגרפיה שנספרו בכל באר בסוף כל מעבר (Pn) משקף את מספר התאים המתחילים בממוגרפיה הנזרע בתחילת Pn.
Myc ביטוי יתר ברגיל MECs, מוביל לתדר מוגבר של ממוגרפיה ליזום תאים. הדבר מושג באמצעות מנגנון כפול: Myc מגדיל את שיעור החלוקה הסימטרית של MaSC ואת תדירות התכנות מחדש לתוך מסקארי חדשים11. כדי לבדוק את ההשפעה של ביטוי מכונן נמוך, השתמשנו Rosa26-Myc מודל העכבר הטרנסגניים, שבו פעילות Myc יכול להיגרם על ידי 4-הידרוקסיטמוקסיפן (4-OHT)15. אנו מצופה לראשונה את MECs על הדבקה נמוכה במיוחד 6-צלחות להסרת פיברוהפיצוצים, בהעדר של 4-OHT. לאחר המעבר הראשון, נחלק את התרבות בשתיים: שתי בארות לא טופלו (שליטה) ושתי בארות טופלו עם 200 ננומטר 4-OHT (MycER). ספרנו את הספרה ואת מספרי הטלפון של 5 מעברים רצופים לשלושה ניסויים עצמאיים (שולחן 1). מספרי התאים והספירה המצטברים לכל מעבר מוצגים בטבלה 2. האינדוקציה עם 4-OHT מוביל את הספירה מוגברת שיעורי צמיחה התא, כפי שמוצג באיור 1.

איור 1: תוצאות מייצגות. כדור מצטבר (A) ו-Cell (ב) הצמיחה עקומות של שליטה ומיסר ממוגרפיה. ממוצע וסטיית התקן של 3 ניסויים עצמאיים מוצגים. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
| ציפוי ראשון | ציפוי שנייה | ציפוי שלישי | ציפוי 4 | ציפוי 5 | ||||||||||||
| ציפוי תאים | ספירת תאים | ספירת הספירה | ציפוי תאים | ספירת תאים | ספירת הספירה | ציפוי תאים | ספירת תאים | ספירת הספירה | ציפוי תאים | ספירת תאים | ספירת הספירה | ציפוי תאים | ספירת תאים | ספירת הספירה | ||
| Exp1 | פקד | 77,000 | 50,000 | 31 | 65,000 | 58,500 | 41 | 57,000 | 30,000 | 32 | 30,000 | 22,000 | מיכל 5 | 22,000 | 0 | 0 |
| 77,000 | 81,000 | 41 | 65,000 | 55,000 | 23 | |||||||||||
| מינצר | 77,000 | 31, 0000 | 193 | 80,000 | 375,000 | 323 | 80,000 | 380,000 | 217 | 80,000 | 220,000 | 223 | 80,000 | 170,000 | 155 | |
| 77,000 | 110,000 | 142 | 80,000 | 505,000 | 396 | 80,000 | 270,000 | 149 | 80,000 | 290,000 | 194 | 80,000 | 250,000 | 160 | ||
| Exp2 | פקד | 75,000 | 75,000 | 71 | 60,000 | 17,000 | 34 | 28,000 | 45,000 | 29 | 45,000 | 13,000 | 2 | 13,000 | 0 | 0 |
| 75,000 | 47,000 | 45 | 60,000 | 11,000 | 47 | |||||||||||
| מינצר | 75,000 | 200,000 | 188 | 80,000 | 225,000 | 277 | 80,000 | 230,000 | 155 | 80,000 | 210,000 | 211 | 80,000 | 100,000 | 95 | |
| 75,000 | 250,000 | 192 | 80,000 | 202,500 | 283 | 80,000 | 305,000 | 185 | 80,000 | 160,000 | 237 | 80,000 | 100,000 | 133 | ||
| Exp3 | פקד | 82,500 | 130,000 | 121 | 80,000 | 45,000 | 105 | 80,000 | 110,000 | 86 | 80,000 | 58,500 | 75 | 58,500 | 58,500 | 78 |
| 82,500 | 125,000 | 177 | 80,000 | 71,250 | 42 | |||||||||||
| מינצר | 82,500 | 325,000 | 457 | 80,000 | 610,000 | 327 | 80,000 | 367,000 | 309 | 80,000 | 500,000 | 260 | 80,000 | 115,000 | 146 | |
| 82,500 | 475,000 | 463 | 80,000 | 455,000 | 392 | 80,000 | 415,000 | 204 | 80,000 | 470,000 | 295 | 80,000 | 185,000 | 161 | ||
טבלה 1: מספרי כדורים שנספרו ומספרים של תאים מצופים ונספרים בכל מעבר.

טבלה 2: חישוב מספרי כדור מצופה ומספרי כדור מצטבר ותאים. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של טבלה זו. (לחץ לחיצה ימנית להורדה).
כאן, אנו מתארים פרוטוקול לתיאור כמותי של מאפייני צמיחה MaSC בתוך מבחנה. כדוגמה, אנו מציגים את ההשפעה של ביטוי מכונן מסתורי ברמה נמוכה על מסקארי מורטין רגיל. גישה זו, עם זאת, ניתן להחיל באופן שווה על הקשרים שונים. התאים הראשוניים אנושיים או מורקיים, כמו גם קווי התאים הקבועים, יכולים להיות מתורבתים באנקורג ' תנאים עצמאיים כדי ליצור תרבויות ממוגרפיה שיכול להיות החוצה באופן סדרתי. ביטוי גנטי יתר והפרעות RNA ניתן להציג בקלות בפרוטוקול עם תוספת של צעד ויראלי התמרה בסוף המעבר הראשון (אחרי שלב 3.5). לחילופין, ניתן להידבק בתאים ולאחר מכן מצופים בהם כספירות ממוגרפיה.
היבט קריטי של הבקשה המוצגת כאן הוא צפיפות התא זריעה, אשר צריך להיות נמוך מספיק כדי למנוע את הדור של אגרגטים להפריע הפרשנות של התוצאות16,17. המבנה של הממוגרפיה יכול להיות אינפורמטיבי כדי לפתור את העמימות הזו. יש לספור רק כדורים דחוסים בסוף כל מעבר. יש לקחת בחשבון גם את המעגל של הספרואידים ואת הגודל. באמצעות התהליך האוטומטי של ה-DIA, שלב זה מובטחת עם סף מתאים באופן אובייקטיבי ומוחלט. לעתים קרובות, ושלתי יוצרים מבנים שכבתית או אשכולות קטנים יותר של תאים שצריכים להיות כלולים בספירות הממוגרפיה. ככלל אגודל, אנו משתמשים מסף של קוטר 100 יקרומטר. לבסוף, יש לנקוט בטיפול כדי למנוע העברה של ממעברות שלמות או לא-מלאה ממעבר אחד למשנהו. מצד שני, ליטוף עודף יוביל למוות תאים מוגבר. לפיכך, אם נתקלים בקשיים כאלה, מומלץ להשתמש בטריסיזציה קלה או בטיפול במאהבורסה ולהעביר את הספירות השבולים באמצעות מסננת של 40 יקרומטר כדי להבטיח את הדור של השעיות בתאים בודדים.
השימוש בספירה יעילות (SFE) שימש לחילופין, כתחליף לvivo SC או CSC לשעבר לפני הספירה בתרבויות ממוגרפיה. SFE הוא אכן מדד של תאים כמו גזע באוכלוסיית תאים נתונה. עם זאת, היא מייצגת גישה פחות מצפונית, שכן היא מספקת מידע רק בנקודות זמן נפרדות. החישוב של מספרי כדור מצטבר והדור של עקומות גדילה מצטברות, במקום זאת, מאפשר את היסק של שיעור הצמיחה של התרבות מן הצעד הראשוני הזריעה התאים עד התרבות מתיש או, במקרה של תרבויות מונצח, עבור מספר הפסקאות הרצוי. הערכת המאפיינים של הצמיחה מאפשרת את הערכת הסטייה מהגידול האקספוננציאלי דרך המקדם R2 , ובשלב השני, הערכה של ערך ה-GR עצמה.
חשוב לעשות זאת, ניתן להשתמש בעקומות הצטברות ממוגרפיה מצטברת כדי להעריך את ההשפעה של מעכבי מולקולות קטנות או תרופות כימותרפיות אחרות באופן סלקטיבי ב-CSC level6,11. בניגוד ממוגרפיה ראשונית נורמלי, אשר מבחינה פונקציונלית הפליטה ב 5-7 מעברים, ממוגרפיה הגידול נוטים להתרחב ללא הגבלת זמן. תכונה זו מקושרת ליכולת החידוש העצמי הבלתי מוגבלת של CSC. ההשפעות על הפצת ו CSC עצמית התחדשות יכול להיות בלתי מצמידים באמצעות הדור של תאים סרטניים ממוגרפיה הצמיחה עקומות, בהתאמה. אפקט מסוים של CSC צפוי לגרום לירידה בקצב הגדילה המצטבר של ממוגרפיה, עם או ללא השפעה על קצב צמיחת התאים המצטבר6,11.
בסופו של דבר, תחום אחר של עניין הוא אחד הרקמה למבוגרים SC תכנות מחדש. בגדלים מסוימים של ממוגרפיה מורכב מאוכלוסיית תאים הטרוגנית בדרך כלל, בה רק שבר מזערי שומר על תכונות כמו גזע, כולל יכולת התחלת ממוגרפיה והתחדשות בלוטת החלב על השתלת vivo6,9,11,18,19. ושלתי הפטמות יכול להיות מבודד כך גם באמצעות התווית מחוץ ליחידה שמירה בחני6,9,11 או, ex vivo, באמצעות סמנים שטח הוקמה2,3. בעיקר, ושלתי הפטמות אינן שורדות אנואיקיס ואינן מאפשרות ליצור כדורים ממוגרפיה. ביטוי Myc שנאכף הוכח להעניק פוטנציאל חניכה של ממוגרפיה לושלתי הפטמות מבודדים כ-PKHneg ינוס11, וכתוצאה מכך הדור של תרבות שיכול להיות מיושן לנצח. באופן דומה, ניתן לבדוק הפרעות של הרגולטורים השליליים של תכנות משנה פיזיולוגית תוך שימוש באותה שיטת. בהקשר זה, בעיה נפוצה שעלולה להתעורר היא המספר המוגבל של קלט תאים. אם הקלט תא נמוך מ-10,000 תאים, אנו ממליצים לזריעה בלוחות 24-לוחות (מקסימום 5,000 תאים בעלי קיימא/mL). אף על פי כן, האנקורג ' התנאים העצמאיים התרבות יכול להיות הוכח קשה מדי עבור הבקיע מתכנות, במיוחד במקרים שבהם אפקט התיכנות מתכנות אינו מיידי. במקרים כאלה, השימוש במטריצה תומכת ובתרבויות תלת ממדיות של האורגנואיד יכול להיות מתאים יותר ל-20.
באופן כללי, שיטת הממוגרפיה היא אפשרות חסכונית שניתן לעבוד בקלות עבור מאפיינים כמו גזע הבקיע באוכלוסיות מואליות נורמליות ומוסריות. הגישה הכמותית הנלקחת בפרוטוקול זה מקלה על ההשוואות בין תרבויות שבוצעו בתנאים שונים או חשופים לגירויים מגוונים. כאשר בעקבות בקפדנות, הוא מספק מערכת פשוטה יחסית ex vivo מודל המאפשר uncoupling של שחקנים מרובים המגדירים תכונות גזע ב vivo, המציע את האפשרות של לימודים מפורטים יותר מכונאי.
. למחברים אין מה לגלות
אנו מודים לברונו אמאטי על המתנה האדיבה של דגם העכבר הטרנסגניים Rosa26-MycER. עבודה זו ממומנת על ידי מענקים WWCR, AIRC, ERC, ואת משרד הבריאות האיטלקי P.G.P. טלוויזיה ו X.A. נתמכים על ידי FIRC ו-א ' י על ידי מענק FUV.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| מאגר ליזה ACK | Lonza | 10-548E | בופר ליזה אמוניום-כלוריד-אשלגן, 100 מ"ל. |
| B27 | Invitrogen | 17504-044 | תוספת B27 50X (10 מ"ל). ריכוז סופי 2% v/v. |
| bFGF | Peprotech | 100-18B | גורם גדילה פיברובלסטים רקומביננטי אנושי - בסיסי, 50 μg. תמיסת מלאי 100 μ g/μ L ב-Tris 5 מ"מ pH 7.6. דילול סופי 0.02% v/v. |
| קולגנאז | סיגמא | C2674 | קולגנאז מClostridium histolyticum. סוג I-A, אבקה ליופילית, 1 גרם. מלאי 20,000 U/mL ב-DMEM. דילול סופי 1% v/v. |
| DMEM | Lonza | 12-614F | הבינוני של Eagle's שונה של Dulbecco |
| S17859L0615 | Dulbecco פוספט חוצץ | ||
| מלח EGF | Tebu-Bio | AF-100-15 | גורם גדילה אפיתל אנושי רקומביננטי. פתרון מלאי 100 μ גרם/מ"ל ב-dH סטרילי<תת>2O. דילול סופי של 0.02% v/v. |
| גלוטמין | לונזה | 17-605E | L-גלוטמין, 200 מ"מ. דילול סופי 1% v/v. |
| Heparin | PharmaTex | 34692032 | ריכוז מלאי 5,000 IU/mL. דילול סופי 0.008% v/v. |
| Hyaluronidase | Sigma | H4272 | Type IV-S, אבקה, 750-3,000 U/mg מוצק, 30 מ"ג. תמיסת מלאי 10 מ"ג/מ"ל ב-dH סטרילי<תת>2O. דילול סופי 1% v/v. |
| הידרוקורטיזון | סיגמא | H0888 | ריכוז מלאי 100 μ גרם/מ"ל. דילול סופי 0.5% v/v. |
| אינסולין | SAFCBiosciences | 91077C | אינסולין, רקומביננט אנושי, אבקה יבשה, 250 מ"ג. ריכוז ציר 1 מ"ג/מ"ל. דילול סופי 0.5% v/v. |
| צלחות חיבור נמוכות 6 בארות | קורנינג | 351146 | צלחות תרבית תאים סטריליות 6 בארות לא מטופלות עם תחתית ומכסה שטוחים שקופים. |
| MEBM | Lonza | CC-3151 | גידול תאי אפיתל חלב בינוני בסיסי |
| תערובת פניקלין-סטרפטומיצין | לונזה | 17-602F | מכיל 10,000 U אשלגן פניצילין ו-10,000 ומיקרו; גרם סטרפטומיצין סולפט למ"ל במי מלח של 0.85%. דילול סופי 1% v/v. |
| Poly-HEMA | Sigma | P3932 | מתמוסס ב-95% EtOH בן לילה ב-55 מעלות צלזיוס ריכוז מלאי 12% w/v. דילול סופי 1% v/v ב-95% EtOH. מסנן (0.22 μ מ) לפני השימוש. |