מאמר שיטה
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| Agarose, UltraPure | Invitrogen | 16500 | בדיקת סוניקציה (סעיף 4.3.6) וטיהור ג'ל של DNA מוגבר LM-PCR (סעיף 19.1) |
| אלבומין, סרום בקר (BSA), ללא פרוטאז, בידוד הלם חום, מינימום 98% | BioShop | ALB003 | נוגדן תמיסת חסימה |
| נגד Isl1 | DSHB | 39.3F7 | אינדוקציה של נוגדנים עם חרוזים (סעיף 5.6) |
| Bioruptor Pico& נ.ב.פ; | דיאגנוד | B01060010 | כרומטין סוניקט (סעיף 3.3) |
| אלבומין בסרום בקר (BSA), תגובת מילוי בדרגת ביולוגיה מולקולרית | של ניו אינגלנד BioLabs | B9000S | על חרוזים (סעיף 10.2) ודנוטורציה, חישול פריימר והארכת פריימר (סעיף 14.2) |
| צנטריפוגה 5424 R | Eppendorf | 5404000138 | כרומטין סוניקט (סעיף 3.5), בדיקת סוניקציה (סעיף 4.3.1, 4.3.3 ו-4.3.4) |
| צנטריפוגה 5804 R | Eppendorf | 22623508 קציר, תאים צולבים והקפאה (סעיף 1.3), ליזיס תאים (סעיף 2.2 ו-2.3), כרומטין סוניקט (סעיף 3.1) | |
| cOmplete, מיני, מעכב פרוטאז ללא EDTA קוקטייל | רוש | 4693159001 | נוסף לכל המאגרים, למעט מאגר Proteinase K ומאגר ChIP Elution |
| תמיסת dATP | England BioLabs | N0440S | dA-Tailing Reaction (סעיף 15.1) |
| חומצה דאוקסיקולית נתרן מלח | פישר מדעי | BP349 | מאגר ליזה 3, מאגר שטיפת מלח גבוה ומאגר שטיפת LiCl |
| תערובת dNTP, ביולוגיה מולקולרית כיתה | תרמו מדעי | R0192 | תגובת מילוי על חרוזים (סעיף 10.2) ודנטורינג, חישול פריימר והארכת פריימר (סעיף 14.2) |
| DreamTaq Green PCR Master Mix, 2x | Thermo Scientific | K1081 | PCR בתיווך קשירה (סעיף 18.1) |
| EDTA, 0.5 מ', תמיסה סטרילית, pH 8.0 | BioShop | EDT111 | מאגר ליזה 1-3, בדיקת סוניקציה (סעיף 4.1), מאגר שטיפת מלח גבוה, מאגר שטיפת LiCl ומאגר סילוק ChIP |
| אתיל אלכוהול נטול מים, 100% | אלכוהול מסחרי | P006EAAN | בדיקת סוניקציה (סעיף 4.3.3) |
| פורמלדהיד, 36.5-38%, מכיל 10-15% מתנול | Sigma | F8775 | קציר, תאים צולבים והקפאה (סעיף 1.1) |
| גליצרול, דרגת ריאגנט, מינימום 99.5% | BioShop | GLY002 | מאגר ליזה 1 |
| גליצין, דרגת ביוטכנולוגיה, מינימום 99% | BioShop | GLN001 | קציר, תאים צולבים והקפאה (סעיף 1.2) |
| גליקוגן, RNA דרגת | Thermo Scientific | R0551 | בדיקת סוניקציה (סעיף 4.3.3) |
| HEPES, תמיסה מסוננת סטרילית 1 M, pH 7.3 | BioShop | HEP003 | מאגר ליזה 1, מאגר שטיפת מלח גבוה |
| שבר קלנוב (3->5 exo-) | תגובת זנב dA של | ניו אינגלנד BioLabs | M0212S |
| Lambda exonuclease | New England BioLabs | M0262S | Lambda Exonuclease Digestive על חרוזים (סעיף 11.2) |
| משפר ליגאז | ניו אינגלנד BioLabs | E7645S | ערכת ספריית DNA NEBNext Ultra II. קשירת מתאם אינדקס על חרוזים (סעיף 9.1) וקשירת מתאם אוניברסלי (סעיף 16.1) |
| Ligase Master Mix | New England BioLabs | E7645S | NEBNext Ultra II ערכת ספריית DNA. קשירת מתאם אינדקס על חרוזים (סעיף 9.1) וקשירת מתאם אוניברסלי (סעיף 16.1) |
| ליתיום כלוריד (LiCl), מאגר ביושופ בדרגת ריאגנט | LIT704 | LiCl מאגר כביסה | |
| חרוזים חרוזים מגנטיים ל-ChIP (חלבון Dynabeads G) | Dynabeads חלבון G (חרוזים מגנטיים ל-ChIP) | חלבון Dynabeads G (חרוזים מגנטיים ל-ChIP) | דגירה של נוגדנים עם חרוזים (סעיף 5) |
| חרוזים מגנטיים לטיהור DNA (חרוזי AMPure XP) | בקמן קולטר | A63880 | (סעיף 13.3) וניקוי DNA (סעיף 17.1) |
| מתלה מגנטי (מגנט DynaMag-2) | Invitrogen | 12321D | משמש בשלבים רבים בסעיפים: 5 - 11, 13 |
| ערכת מיצוי ג'ל MinElute | Qiagen | 28604 | טיהור ג'ל של DNA מוגבר PCR (סעיף 19.2) |
| תמיסת מלח נתרן N-Lauroylsarcosine, תמיסה מימית 30%, ≥ 97.0% (HPLC) | Sigma | 61747 | מאגר ליזה 3 |
| אוקטילפנול אתוקסילט (IGEPAL CA630) | BioShop | NON999 | מאגר ליזה 1 ומאגר שטיפת LiCl |
| פנול: כלורופורם: אלכוהול איזואמיל, דרגת ביוטכנולוגיה (25:24:1) | BioShop | PHE512 | בדיקת סוניקציה (סעיף 4.3.1) |
| phi29 DNA פולימראז | ניו אינגלנד BioLabs | M0269L | תגובת מילוי על חרוזים (סעיף 10.2) ודה-נטורינג, חישול פריימר והארכת פריימר (סעיף 14.3 ו-14.4) |
| מי מלח חוצצים פוספט (PBS), 1x | קורנינג | 21040CV | קציר, הצלבה והקפאה של תאים (סעיף 1.3) וכרומטין סוניקט (סעיף 3.1), החדרת נוגדנים עם חרוזים (סעיף 5.1) |
| ספק כוח בסיסי | PowerPac BioRad | 1645050 | בדיקת סוניקציה (סעיף 4.3.6) וטיהור ג'ל של DNA מוגבר LM-PCR (סעיף 19.1) |
| מערכת ProFlex PCR | יישומית מערכת | ProFlex PCR | משמש בסעיפים: 14.2, 14.4, 15.2, 16.2 ו-18.2 |
| שפופרת LoBind חלבון, 2.0 מ"ל | Eppendorf | 22431102 | דגירה של נוגדנים עם חרוזים (סעיף 5.2) ו-Chromatin Immunoprecipitation (סעיף 6.3) |
| תמיסת Proteinase K, | 25530049 | Invitrogen | (סעיף 4.2) ו-Elution ו-Reverse Crosslink (סעיף 12.3) |
| Qubit 4.0 Fluorometer | Invitrogen | Q33226 | טיהור ג'ל של DNA מוגבר PCR (סעיף 19.3) |
| בדיקת Quibit dsDNA BR ערכת | Invitrogen | Q32853 | טיהור ג'ל של DNA מוגבר PCR (סעיף 19.3) |
| Rnase A, Dnase וללא פרוטאז | Thermo Scientific | EN0531 | בדיקת סוניקציה (סעיף 4.3.2) ומיצוי DNA (סעיף 13.2) |
| נתרן כלורי (NaCl), BioReagent | Sigma | S5886 | מאגר ליזה 1-3, מאגר שטיפת מלח גבוה |
| נתרן דודציל סולפט (SDS), | BioShop | SDS001 | (סעיף 4.1), מאגר שטיפת מלח גבוה וחרוזי סוניקציה של מאגר סילוק ChIP |
| וצינורות ביורופטור 15 מ"ל | דיאגנוד | C01020031 | כרומטין סוניקציה (סעיף 3.1 ו-3.2) |
| ThermoMixer F1.5 | Eppendorf | 5384000020 סעיף 4.2, 4.3.2, 4.3.5, 8.2, 9.2, 10.3, 11.2, 12.2, 12.3, 13.2 ו-16.2 | |
| תמיסת טריזמה הידרוכלוריד (Tris-HCl), מוסמכת BioPerformance, 1 M, pH 7.4 | Sigma | T2194 | 10 מ"מ Tris-HCl Buffer |
| תמיסת Trizma hydrochloride (Tris-HCl), מוסמכת BioPerformance, 1 M, pH 8.0 | Sigma | T2694 | מאגר ליזה 2, מאגר ליזה 3, בדיקת סוניקציה (סעיף 4.1), מאגר שטיפת LiCl ומאגר סילוק ChIP |
| מודול תיקון/זנב קצה Ultra II (24 rxn -> 120 rxn) | New England BioLabs | E7546S | תערובת תגובת הכנה סופית ותערובת אנזים סיום הכנה. תיקון קצה ותגובת זנב dA על חרוזים (סעיף 8.2) |
| נדנדה מיני צינור VWR, מהירות משתנה | VWR | 10159-752 | משמש בשלבים רבים בסעיפים: 1, 2, 5, 6 ו-7 |
| 2-[4-(2,4,4-trimethylpentan-2-yl)phenoxy] אתנול, Triton X-100, | BioShop | TRX506 | 1, כרומטין סוניקט (סעיף 3.4) ומאגר שטיפת מלח גבוה |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה