עבודה זו מתארת את השימוש בטכנולוגיית עריכת הגנום CRISPR-Cas9 כדי נוקאאוט גן אנדוגני OsABCG15 ואחריו Agrobacterium שונה-פרוטוקול טרנספורמציה בתיווך לייצר קו זכר סטרילי יציב באורז.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
עבודה זו מתארת את השימוש בטכנולוגיית עריכת הגנום CRISPR-Cas9 כדי נוקאאוט גן אנדוגני OsABCG15 ואחריו Agrobacterium שונה-פרוטוקול טרנספורמציה בתיווך לייצר קו זכר סטרילי יציב באורז.
עקירת הזכר היא תכונה אגרונומית חשובה לייצור זרעים היברידיים המאופיינת בדרך כלל על ידי פגמים פונקציונליים באיברי רבייה/גימטים גבריים. ההתפתחויות האחרונות בטכנולוגיית עריכת הגנום CRISPR-Cas9 מאפשרות יעילות עריכה גבוהה ומוטציות נוקאאוט מצילות זמן של גנים של מועמדים אנדוגניים באתרים ספציפיים. בנוסף, אגרובקטריום-מתווכים טרנספורמציה גנטית של אורז היא גם שיטת מפתח לשינוי גנים, אשר אומצה באופן נרחב על ידי מעבדות ציבוריות ופרטית רבות. במחקר זה, יישם CRISPR-Cas9 כלי עריכת הגנום ויצרנו בהצלחה שלושה קווי מוטציה סטרילי זכר על ידי עריכת גנום ממוקד של OsABCG15 ב cultivar japonica. השתמשנו בשיטת שינוי אגרובקטריום-מתווכת אורז שיכול לספק אמצעים מצוינים של סירוס גנטי לייצור זרעים היברידיים באורז. צמחים טרנסגניים ניתן להשיג בתוך 2-3 חודשים וטרנספורמטורים הומוזיגים הוקרן על ידי genotyping באמצעות ההגדלה PCR ו רצף סנגר. אפיון פנוטיפי בסיסי של קו הומוזיגוס סטרילי זכר בוצע על ידי תצפית מיקרוסקופית של איברי הרבייה זכר האורז, ניתוח קיימות אבקה על ידי יוד אשלגן יודיד (I2-KI) מכתים חצי דק חתך של anthers מתפתח.
אורז הוא יבול המזון החשוב ביותר, במיוחד במדינות מתפתחות, ומייצג מזון בסיסי עבור יותר ממחצית מאוכלוסיית העולם. בסך הכל, הביקוש לדגן אורז גדל והוא צפוי לגדול ב-50% עד 2030 ו-100% עד 20501,,2. שיפורים עתידיים בתפוקת אורז יצטרכו לנצל משאבים מולקולריים וגנטיים מגוונים ש הופכים את האורז למודל מצוין למחקר צמחים מונוקוטלדונים. אלה כוללים מערכת טרנספורמציה יעילה, מפה מולקולרית מתקדמת, ומסד נתונים נגיש לציבור של תגי רצף מבוטאים, אשר נוצרובמשך שנים רבות 3,4. אסטרטגיה אחת לשיפור תפוקת היבול היא ייצורזרעים היברידיים 5, מרכיב מרכזי שבו היא היכולת לתמרן את הפוריות הגברית. הבנת השליטה המולקולרית של פוריות הגבר בגידולי דגנים יכולה לעזור לתרגם ידע מפתח לטכניקות מעשיות כדי לשפר את ייצור הזרעים היברידיים ולשפראת פרודוקטיביות היבול 6,7.
טרנספורמציה גנטית היא כלי מפתח למחקר בסיסי וחקלאות מסחרית שכן היא מאפשרת הכנסת גנים זרים או מניפולציה של גנים אנדוגניים בצמחי יבול, ותוצאות יצירת קווים מהונדסים גנטית. פרוטוקול טרנספורמציה מתאים יכול לעזור להאיץ מחקרים גנטיים ומולקולריים ביולוגיה להבנה בסיסית של ויסותגנים 8. בחיידקים, טרנספורמציה גנטית מתרחשת באופן טבעי; עם זאת, בצמחים, הוא מבוצע באופן מלאכותי באמצעות טכניקות ביולוגיהמולקולרית 9,10. אגרובקטריום tumefaciens הוא קרקע נישאת, חיידק גראם שלילי הגורמים למחלת מרה הכתר בצמחים על ידי העברת T-DNA, אזור של Ti plasmid שלה, לתוך תא הצמח באמצעות מערכת הפרשת סוגIV 11,12. בצמחים, A. tumefaciens-תווך טרנספורמציה נחשבת שיטה נפוצה לשינוי גנים כי זה מוביל יציב ושילוב מספר עותק נמוך של T-DNA לתוך הגנוםהמארח 13. אורז טרנסגני נוצר לראשונה באמצעות טרנספורמציהגנטית מתווכת אגרובקטריום באמצע שנות ה־90 של המאה ה־20, ב־japonica cultivar14. באמצעות פרוטוקול זה, מספר קווים טרנסגניים הושגו בתוך תקופה של 4 חודשים עם יעילות טרנספורמציה של 10%-30%. המחקר הצביע על כך שיש שני צעדים קריטיים לטרנספורמציה המוצלחת: האחד הוא אינדוקציה של תרכובת עוברית מזרעים בוגרים והשנייה היא תוספת של acetosyringone, תרכובת פנולית, לתרבות החיידקית במהלך טיפוח שותף, המאפשר יעילות טרנספורמציה גבוהה יותר בצמחים14,15. פרוטוקול זה שימש בהרחבה עם שינויים קלים japonica16,17,,18,19, כמו גם cultivars אחרים כגון indica20,21,22,,23 ו japonica טרופי,24,25. ואכן, מעל 80% מהמאמרים המתארים את טרנספורמציה אורז להשתמש אגרובקטריום-מתווכים שינוי גן ככלי13. עד כה פותחו מספר פרוטוקולי טרנספורמציה גנטית באמצעות זרעי אורז כחומר התחלתי לאינדוקציה16,,17,,18,,19. עם זאת, מעט מאוד ידוע על תפרה צעירה כמו explants לייצור יבלות. בסך הכל, חשוב להקים פרוטוקול מהיר, לשחזור ויעיל של שינוי גנים והתחדשות עבור גנומיקה תפקודית ומחקרים על שיפור היבול.
בשנים האחרונות, ההתקדמות של טכנולוגיית CRISPR-Cas9 הביאה מנגנון עריכה גנומי מדויק כדי להבין את תפקוד הגנים ולספק שיפורים חשובים אגרונומית לגידולצמחים 26,27. CRISPR מציע גם הבטחה ניכרת למניפולציה של התפתחות הרבייה הגברית וייצור היברידי. במחקר זה, השתמשנו במערכת נוקאאוט גנים באמצעות טכנולוגיית CRISPR-Cas9 והכנסנו אותה לפרוטוקול יעיל של שינוי גן אורז באמצעות תפלות צעירות כהסברים, ובכך יצרנו קווים סטריליים יציבים לחקר התפתחות הרבייה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. sgRNA-CAS9 צמח ביטוי וקטור בנייה וקטורית אגרובקטריום-תיווך טרנספורמציה
2. טרנספורמציה גנטית אורז ותרבות רקמת הצמח
3. זיהוי גנוטיפ
4. שים לב לפנוטיפ הבסיסי של המוטנט
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הוכח כאן הוא השימוש בטכנולוגיית עריכת גנים כדי ליצור קו סטרילי זכר למחקר עתידי על ידי אגרובקטריום-מתווכים טרנספורמציה גנטית באורז. כדי ליצור את הקו הסטרילי הגברי של osabcg15, CRISPR-CAS9-בתיווך mutagenesis שימש לבנייה וקטורית בינארית. SgRNA היה מונע על ידי היזם OsU3, בעוד קלטת הביטוי של hSpCas9 היה מונע על ידי מקדם 35S כפול, ואת הווקטור האמצעי הורכב pCAMBIA1300 וקטור בינארי יחיד תוכנן עבור אגרובקטריום-מתווכים טרנספורמציה יציבה של אורז. ייצוג גרפי של המבנה ששימש עבור CRISPR/Cas9-בתיווך ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מוטנטים סטריליים גבריים מלאכותיים נוצרים באופן מסורתי על ידי מוטגנזה פיזית, כימית או ביולוגית אקראית. למרות שאותם טכניקות רבות עוצמה, טבעם האקראי לא מצליח לנצל את הכמות העצומה של ידע גנומי מודרני בעל פוטנציאל לספק שיפורים מותאמים אישית ברבייה מולקולרית32. מערכת CRISPR-Cas9 שימשה באופן נרחב בצמחים בשל האמצעים הפשוטים והמשתלמים שלה כדילתמרן ולערוך DNA 29,33; יש לו פוטנציאל לחסוך זמן בהשוואה לשיטות mutagenesis מסורתיות.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים רוצים להכיר Xiaofei חן למתן תפלות אורז צעיר וסיוע בהפיכה את תרבות רקמת האורז בינוני. עבודה זו נתמכה על ידי הקרן הלאומית למדעי הטבע של סין (31900611).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 1-חומצה נפתלינאצטית | Sigma-Aldrich | N0640 | |
| 2, 4-Dichlorophenoxyacetic acid | Sigma-Aldrich | D7299 | |
| 6-Benzylaminopurine (6-BA) | Sigma-Aldrich | B3408 | |
| Acetosyringone | Sigma-Aldrich | D134406 | |
| Agar | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10000561 | |
| אמוניום גופרתי | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 10002918 | |
| אנאורין הידרוכלוריד | סיגמא-אולדריץ' | T4625 | |
| אתנול נטול מים | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 10009218 | |
| פפטון בקטריולוגי | סנגון ביוטק | A100636 | |
| תמצית בקר | סנגון ביוטק | A600114 | |
| חומצה בורית | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10004808 | |
| סידן כלוריד דיהידראט | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 20011160 | |
| קזאין חומצה הידרוליזט | בייג'ינג XMJ מדעי ושות', בע"מ | C184 | |
| קובלט (II) כלוריד הקסהידראט | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 10007216 | |
| נחושת (II) סולפט פנטהידראט | סינופארם ריאגנט כימי ושות', בע"מ | 10008218 | |
| D(+)-גלוקוז נטול מים | סינופארם ריאגנט כימי ושות', בע"מ | 63005518 | |
| D-סורביטול | סינופארם ריאגנט כימי ושות 'בע"מ | 63011037 | |
| EDTA, מלח דיסודיום, דיהידראט | סיגמא-אולדריץ' | E5134 | |
| EOS מצלמות SLR דיגיטליות ומצלמות מערכת קומפקטיות | Canon | EOS 700D | |
| פורמלדהיד | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 10010018 | |
| אוטומטי לחלוטין סיבובי מיקרוטום | Leica Biosystems | Leica RM 2265 | |
| קרחון חומצה אצטית | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 10000208 | |
| גליצין | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 62011516 | |
| Hygromycin | בייג'ינג XMJ מדעי ושות', בע"מ | H370 | |
| אינוזיטול | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 63007738 | |
| יוד | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 10011517 | |
| ברזל (II) סולפט הפטהידראט | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 10012116 | |
| Kanamycine | בייג'ינג XMJ מדעי ושות', בע"מ | K378 | |
| קינטין | סיגמא-אולדריץ' | K0753 | |
| L-ארגינין | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 62004034 | |
| L-חומצה אספרטית | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 62004736 | |
| L-גלוטמין | בייג'ינג XMJ מדעי ושות', בע"מ | G229 | |
| L-פרוליין | בייג'ינג XMJ מדעי ושות', בע"מ | P698 | |
| מגנזיום סולפט הפטהידראט | סינופארם ריאגנט כימי ושות', בע"מ | 10013018 | |
| מנגן גופרתי מונוהידראט | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 10013418 | |
| מיקרוסקופים | NIKON | Eclipse 80i | |
| MS | Phytotech | M519 | |
| חומצה ניקוטינית | סיגמא-אולדריץ' | N0765 | |
| פיטגל | סיגמא-אולדריץ' | P8169 | |
| אשלגן כלורי | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 10016308 | |
| אשלגן דימימן פוספט | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 10017608 | |
| אשלגן יודיד | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 10017160 | |
| אשלגן חנקתי | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 1001721933 | |
| פירידוקסין הידרוכלוריד (B6) | סיגמא-אולדריץ' | 47862 | |
| Rifampicin | בייג'ינג XMJ מדעי ושות', בע"מ | R501 | |
| נתרן הידרוקסיד | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 10019718 | |
| נתרן מוליבדט דיהידראט | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 10019816 | |
| סטריאו מיקרוסקופים | Leica Microsystems | Leica M205 A | |
| סוכרוז | סינופארם ריאגנט כימי ושות', בע"מ | 10021418 | |
| ערכות הטמעה של טכנוביט 7100 | Heraeus Teknovi, גרמניה | 14653 | |
| Timentin | בייג'ינג XMJ Scientific Co., Ltd | T869 | |
| Toluidine Blue O | Sigma-Aldrich | T3260 | |
| אמבט מים לקטעי פרפין | Leica Biosystems | Leica HI1210 | |
| תמצית שמרים | Sangon Biotech | A515245 | |
| אבץ גופרתי heptahydrate | סינופארם כימי ריאגנט ושות', בע"מ | 10024018 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.