פרוטוקול זה מפרט את הייצור והשימוש הניתנים להתאמה אישית של בדיקות פלואורסצנטיות לתיוג תאי B ספציפיים לאנטיגן.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
פרוטוקול זה מפרט את הייצור והשימוש הניתנים להתאמה אישית של בדיקות פלואורסצנטיות לתיוג תאי B ספציפיים לאנטיגן.
ייצור אנטיגן פלואורסצנטי הוא שלב קריטי בזיהוי תאי B ספציפיים לאנטיגן. כאן, פירטנו את ההכנה, הטיהור והשימוש במצומדי אנטיגן PEG-אנטיגן פלואורסצנטיים בעלי ארבע זרועות לזיהוי סלקטיבי של תאי B ספציפיים לאנטיגן באמצעות מעורבות נלהבת עם קולטני תאי B קוגנטיים. באמצעות כימיה מודולרית של קליק וכימיה של ערכת פלואורופור הזמינה מסחרית, הדגמנו את הרבגוניות של הכנת מצומדים פלואורסצנטיים מותאמים אישית על ידי יצירת מערכים נפרדים לחלבון פרוטאוליפיד (PLP139-151) ואינסולין, שהם אוטואנטיגנים חשובים במודלים של עכברים של טרשת נפוצה וסוכרת מסוג 1, בהתאמה. בדיקות פותחו עבור כל מצומד פלואורסצנטי במודל המחלה המתאים לו באמצעות ציטומטריית זרימה. מערכי אנטיגן הושוו לאוטואנטיגן חד-ערכי כדי לכמת את התועלת של מולטימריזציה על עמוד השדרה של PEG. לבסוף, הדגמנו את התועלת של פלטפורמה זו על ידי בידוד והערכה של תגובות תאי אנטי-אינסולין B לאחר גירוי אנטיגן ex vivo. תיוג תאי B ספציפיים לאינסולין איפשר זיהוי מוגבר של שינויים בגירוי משותף (CD86) שאחרת היו מופחתים בניתוח תאי B מצטבר. יחד, דוח זה מאפשר ייצור ושימוש במערכי אנטיגן פלואורסצנטיים ככלי חזק לחקירת אוכלוסיות תאי B.
מערכת החיסון הנרכשת ממלאת תפקיד קריטי בהתקדמות או רגרסיה של מצבי מחלה רבים, כולל אוטואימוניות, סרטן ומחלות זיהומיות1. עבור יישומים רחבים כולל חקר אימונופתולוגיה או פיתוח טיפולים מדויקים חדשים, לעתים קרובות קריטי להעריך את תגובות תאי B ו-T ספציפיות לאנטיגן העומדות בבסיס התקדמות המחלה 2,3,4. טטרמרים של קומפלקס תאימות היסטולוגית עיקרי (MHC) זמינים באופן נרחב ומסחרי לזיהוי שיבוטים של תאי T ספציפיים לאנטיגן5. מבנים אלה המסומנים בפלואורופור מציגים קומפלקסים מרובעים של פפטיד-MHC כדי לעסוק בשקיקה בקולטני תאי T קוגנטיים ליישומי תיוג כגון מיקרוסקופיה וזרימה ציטומטרית.
אנטיגנים לחקירת תאי B יכולים להציג משקלים מולקולריים, מטענים ומסיסות מגוונים ביותר 6,7. בעת שימוש באנטיגן מונומרי כבדיקות תאי B מסיסים, ייתכן שתכונות האנטיגן הפיזיקוכימיות לא יתייצבו באמצעות קומפלקס עם מולקולת הסטרפטווידין המסיסה במים הגדולה בהרבה, או עלולות להציג בעיות מסיסות כריאגנטים מונומריים לפני הצימוד. לפיכך, חלק מהחלבונים מציגים קשיים ביולוגיים ותוצאות בלתי צפויות בתרגול 7,8. צימוד צבע פלואורסצנטי ישיר יכול לפעמים להפוך מבנים לבלתי מסיסים במים וליפופילים. תרכובות אנטיגן צבע ישירות אלה רגישות להטמעה לא ספציפית בתוך קרומי התאים, מה שמבלבל ניתוחים ספציפיים לאנטיגן 7,8,9. אסטרטגיות מסוימות התגברו על אתגרי המסיסות על ידי צימוד אנטיגן ופלואורופורים עם קבוצות פונקציונליות אחרות. Cambier et al., למשל, השתמשו באינסולין ביוטיניל בצורתו המקורית כדי לעסוק בקולטני תאי B ספציפיים לאינסולין (BCR) לפני הוספת סטרפטווידין עם תווית פלואורופור בצורה הדרגתית10. בעוד שגישה זו אפשרה הערכה של תאי B הנקשרים לאינסולין מונומרי ברזולוציה גבוהה, נדרשו שני שלבי תיוג. פרוטוקול הניתן להכללה להכנת בדיקות תאי B מבוססות פולימר מוכנות לשימוש המשולב בקלות עם הליכי תיוג נוגדנים פלואורסצנטיים נפוצים יועיל לקידום המחקר של תאי B במחלה.
בפרוטוקול זה, אנו מפרטים את הייצור והשימוש במערכי אנטיגן פלואורסצנטיים (FAAs) עבור תיוג חד-שלבי וניתן להכללה של תאי B ספציפיים לאנטיגן עבור ניסויי מיקרוסקופיה וזרימה ציטומטרית (איור 1). מערכי אנטיגן מסיסים (SAgAs) שימשו בעשור האחרון כאימונותרפיה ספציפית לאנטיגן ממוקד תאי B כנגד מחלות אוטואימוניות 11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22 . SAgAs ממנפים תצוגת אנטיגן רב-ערכית על עמודי שדרה פולימריים גמישים כדי לעסוק בשקיקה בקולטני תאי B ולעורר השפעות אימונומודולטוריות, אם כי ספציפיות האנטיגן שלהם מספקת הזדמנות נוספת לחקור תאי B מעניינים כאשר הם מחוברים לפלואורופור23. עמודי השדרה הפולימריים המרכיבים SAgAs מעניקים מסיסות במים לביו-מקרומולקולה הכוללת ויכולים להפחית את מאפייני האנטיגן הקיצוניים לפעמים המבלבלים את יצירת הבדיקה ואת ספציפיות הצביעה 6,24. השתלנו אנטיגנים רבים בגודל ובמורכבות על פלטפורמת SAgA באמצעות כימיית קליק מודולרית, התורמת לשימוש באפיטופים קטנים של פפטידים וחלבונים מלאים14,18. כאן, אנו מדגימים FAAs ככלי תיוג תאי B חזקים ספציפיים לאנטיגן שניתן להשתמש בהם במקביל לתיוג נוגדנים פלואורסצנטיים טיפוסיים. הכנו והערכנו FAAs המורכבים מאינסולין אנושי לתיוג תאי B במודל עכבר טרנסגני של סוכרת מסוג 1 (VH125), כמו גם FAAs ששילבו חלבון פרוטאוליפיד 139-151 (PLP), אפיטופ פפטיד לדלקת מוח אוטואימונית ניסיונית (EAE), מודל העכבר של טרשת נפוצה. כוונתנו בשימוש במודלים אלה של מחלות הייתה להדגים את הרבגוניות של פלטפורמה זו, הן להחלפה מודולרית של אנטיגנים המשמשים, והן לכדאיות השימוש עם אפיטופים פפטידיים (PLP) וחלבונים מלאים (אינסולין) כאחד. פרוטוקול זה מוצג במטרה להנגיש, ללא צורך במומחיות נרחבת בביו-צימוד. הריאגנטים, כמו גם שיטות הסינתזה והטיהור, מתוכננים להיות מגוונים ומיושמים בקלות ברוב מעבדות המחקר המתמקדות בכימיה, ביולוגיה מולקולרית או אימונולוגיה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כל ההליכים בבעלי חיים המיוצגים בעבודה זו אושרו על ידי הוועדה המוסדית לטיפול ושימוש בבעלי חיים באוניברסיטת קנזס.
1. סינתזת מערך אנטיגן (4-6 ימים)
2. צימוד פלואורופור (1-2 ימים)
3. אפיון FAA (2-4 שעות)
4. פיתוח בדיקה על ידי טיטרציה של FAA (3-5 שעות)
הערה: מוצג שימוש ב-FAA עבור זרימה ציטומטרית, אך ניתן לשנות את אותם שלבים לשימוש בפורמטים אחרים כגון אימונוהיסטוכימיה או מיקרוסקופיה פלואורסצנטית. בעת החלת FAA עבור פורמט חדש, יש להשלים בדיקת אופטימיזציה חדשה. ניתן להשיג אוכלוסיות תאים מעורבות או מבודדות באמצעות שיטות עיבוד דם או איברי לימפה23,29. קציר באמצעות עיכול אנזימטי של רקמות אינו מומלץ, מכיוון שסמני פני התאים עלולים להישפך.
5. ניתוח טיטרציה של FAA ואופטימיזציה של מינון תיוג (1-2 שעות)
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
התפוקה המטוהרת של אינסולין-אלקין (איור 2, פאנל עליון), שנקבעה על פי משקל, נעה בדרך כלל בין 50 ל-65%. יבולים של פחות מ-40% נגרמו ככל הנראה על ידי זיהום מים ב-DMSO נטול מים ו/או הידרוליזה של הפרופרגיל NHS-ester. עבור ריבוי אנטיגנים (איור 1B), התפוקה המטוהרת של מערך האנטיגן של האינסולין (איור 2, פאנל אמצעי) נעה בין 60-75% וניתוח SDS-PAGE אישר שהתוצר העיקרי הוא המין הארבע-ערכי (איור 3A). עבור שינוי פלואורופ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פיתחנו פרוטוקול (איור 1) לבניית FAAs מותאמים אישית לזיהוי תאי B ספציפיים לאנטיגן, מה שמפשט את היצירה של בדיקות תאי B עבור מטרות אנטיגן קשות. בחרנו פולימרי PEG בעלי 4 זרועות עם קבוצות אזיד סופיות כמצע קל לבניית FAAs, מכיוון ש-PEG מעניק מסיסות במים בעוד ידיות האזיד הפונקציונליות מאפשרות תגובות צימוד פשוטותבלחיצה 33. המספר המוגדר של ידיות פונקציונליות (4 זרועות) תורם לצימוד אנטיגן כימי פשוט מכיוון שניתן להשתמש באנטיגן בעודף טוחנת כדי לעק...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
CJB הוא מייסד שותף של Orion Bioscience, Inc., חברה המעניקה רישיון לטכנולוגיית SAgA לחקירת השימושים הטיפוליים שלה. דוח זה מבוסס על עבודה הנתמכת על ידי תוכנית המחקר לתארים מתקדמים של הקרן הלאומית למדע במסגרת מענק מס' 1946099. כל הדעות, הממצאים, המסקנות או ההמלצות המובעות בחומר זה הן של המחברים ואינן משקפות בהכרח את העמדות של הקרן הלאומית למדע.
אנו מודים לקולט וורצ'סטר על עזרתה באיסוף הנתונים. עבודה זו נתמכה על ידי קרן PhRMA (JDG), תוכנית מלגות המחקר לתארים מתקדמים של הקרן הלאומית למדע (KDA), ועל ידי מענקי NIH R21AI143407, R21AI144408 ו-DP5OD023118.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 1,1,3,3-tetramethylguanidine | Alfa Aesar | AAA12314AC | |
| 12 M חומצה הידרוכלורית | פישר כימי | A508-4 | |
| 12% Mini-PROTEAN TGX ג'ל חלבון טרומי, 10 בארות, 30 ul | Bio-Rad | 4561043 | |
| 20 kDa 4 זרועות PEG אזיד | Jenkem ארה"ב | A7185-1 | |
| 3.5 kDa MWCO צינורות דיאליזה (תאית מחודשת) | פישר מדעי | 25-152-10 | |
| אצטוניטריל, HPLC כיתה | פישר כימי | A998-4 | |
| Alexa Fluor 647 נגד עכבר CD19 נוגדן BioLegend | 115522 | ||
| נטול מים דימתילסולפוקסיד | ACROS Organics | AC610420010 | |
| בריום כלוריד | ACROS Organics | 203135000 | |
| Brilliant Blue G-250 Dye | Fisher BioReagents | BP100-50 | |
| Cell Prime r-אינסולין | EMD Millipore | 4512-01 | אינסולין אנושי רקומביננטי לאינסולין סינתזת FAA |
| נחושת (II) סולפט פנטהידראט | ACROS Organics | AC197722500 | |
| דימתילסולפוקסיד | פישר כימיקל | S67496 | |
| פלואורסצאין איזותיוציאנט (FITC) 1 | סיגמא-אולדריץ' | F7250-1G | |
| חומצה אצטית קרחונית | פישר כימית | A38-212 | |
| גליצרול | ACROS Organics | 15892-0010 | |
| גליצין | פישר כימיקל | G46-500 | |
| homopropargyl-PLP | Biomatik | NA | em>סינתזה מותאמת אישית (רצף: homopropargyl-HSLGKWLGHPDKF; טוהר: 97.29%) |
| יוד | Sigma-Aldrich | 207772-100G | |
| מתנול, HPLC כיתה | פישר כימיקל | A452-4 | |
| NHS-רודמין (5/6-קרבוקסי-טטרמתיל-רודמין סוקסימידיל אסטר), איזומר מעורב | Thermo Scientific | 46406 | אנלוגי זמין מסחרית של אסטר Rhodamine-B NHS המשמש בנייר |
| PE/Cyanine7 נגד עכבר CD3 נוגדן | BioLegend | 100220 | |
| אשלגן יודיד | סיגמא-אולדריץ' | 30315 | |
| פרופרגיל N-הידרוקסיסוקסימיד אסטר | סיגמא-אולדריץ' | 764221 | |
| נתרן אסקורבט | סיגמא-אולדריץ' | A7631 | |
| נתרן ביוקרבונט | סיגמא-אולדריץ' | S5761-1KG | |
| נתרן דודציל סולפט | פישר ביו-ריאגנטים | BP166-100 | |
| נתרן פוספט מונוהידראט מונוהידראט | פישר כימי | S468-500 | |
| חומצה טריפלואורואצטית | סיגמא-אולדריץ' | 302031-10x1 מ"ל | |
| טריס בסיס | פישר ביו-ריאגנטים | BP152-500 | |
| טריס (3-הידרוקסיפרופילטריאזולילמתיל) אמין | ClickChemTools | 1010-1000 | |
| xBridge BEH C18 3.5 אום, 4.6 x 150 מ"מ עמוד | מים | 186003034 | |
| xBridge BEH C18 5um OBD עמוד הכנה, 19 x 250 מ"מ | 186004021 | מים |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה