כאן קצב זרימת החמצן הוא מדד לקצב הפוטוסינתזה של התרבית. שיעורים גבוהים יותר של פוטוסינתזה, ומכאן קיבוע פחמן, מתורגמים לשיעורי גדילה גבוהים יותר. משמעות הדבר היא שהמשתמש יכול להשוות את קצב זרימת החמצן בין טיפולים שונים לבין ימי פעילות כפרוקסי לצמיחה. בקצרה, חיישן הגז פועל על-ידי לכידה ושחרור של בועות גז בתא מדידה דו-תאי (איור 4B). בועות גז מהכניסה שבבסיס החיישן נעות מעלה דרך נוזל האריזה. בועות מצטברות בתא אחד של תא המדידה לנפח של כ-3.2 מ"ל. ברגע שמגיעים לסף זה, קצות תאי המדידה. פעולה זו משחררת את הגז ומאפסת את המערכת. כל טיפ נרשם על ידי תוכנת רכישת הנתונים.
בנתונים לדוגמה, הושוו קצב הצמיחה של שלושה טיפולים בעלי עוצמות משתנות של אור יום וריכוזי ביומסה ראשוניים (IBCs). טיפולים אלה נבחרו באופן שרירותי למטרות הפגנה. הם היו (A) 300 μmolפוטונים m-2 s-1 ו-0.03 גרםAFDW L-1, (B) 600μmol פוטונים m-2 s-1 ו-0.13 gAFDW L-1, ו-(C) 600 μmolפוטונים m-2 s-1 ו-0.40 גרםAFDW L-1. הקרנות אלה נמדדו באמצעות בדיקה כדורית במרכז צינור ה-PVC לפני שהונחו בקבוקים על הרציפים. עומק התרבית והצפיפות משפיעים על הנחתת האור. מכאן שעוצמת האור הממשית שחוותה מיקרו-אצות יכולה להיות שונה מאלו שדווחו. כל טיפול בוצע במשולש – בתוך PBR אחד שהכיל שלושה בקבוקים.
כאן, ניסוי מוצלח התאפיין בדפוסים יומיים משוכפלים היטב של הפקת גז (איור 7A–C). בשעות המוארות (ביום), תפוקת הגז עלתה בהתמדה, ובמשך שעות שאינן מוארות (לילה), הופסקה הפקת הגז (איור 7A–C). שני גזים מיוצרים על ידי מיקרו-אצות, חמצן מפוטוסינתזה ופחמן דו-חמצני מנשימה28. הפוטוסינתזה מוגבלת לשעות מוארות, ואילו הנשימה מתרחשת ברציפות אך היא פעילה ביותר בלילה28. הפוטוסינתזה נבנית, ואילו הנשימה מזרזת את הביומסה28. בתחילה, הרכב הגז של מרחב הראש זהה לזה של האטמוספרה. עם כל היפוך של תא המדידה, O2 מזיז את הגז האטמוספרי. לכן, קריאות חיישני גז יוחסו לייצור O2 גם אם הגז היוצא לא היה O2 טהור. לחץ כניסת הגז המינימלי עבור חיישן הגז הוא נמוך ביותר, 8-9 mbar, מה שהופך את הלחץ על ראש הבקבוק רק מעט מעל האטמוספירה (1.01 בר בגובה פני הים). לפיכך, קריאות חיישני גז מתחילות זמן קצר לאחר שבועות O2 עוזבות את המדיום.
CO2 המשתחרר מנשימה אינו תורם לקריאות חיישני גז משתי סיבות. ראשית, בתווך האלקליין, CO2 מגיב לביקרבונט, ומפחית את ה-pH (איור 8). שנית, אם CO2 אכן בורח, חיישן הגז האורז את הנוזל, Silox, ממיס בועות CO2 לפני שהן יכולות להגיע לתא המדידה, ומוציא את CO2 במשטחהנוזלי 29. זה נתמך על ידי היעדר קריאות חיישן גז לילה. אלה שכן התרחשו תועדו זמן קצר לאחר כיבוי האורות, מה שמצביע על כך שקריאות מייצגות שחרור חמצן שיורי בשעות היום (איור 7).
במערך הניסוי (תוך שימוש בנתוני טמפרטורה ולחץ מקומיים), מרחב ראש של 80 מ"ל בלחץ סביבתי דרש 340 מ"ל של O2 מפוקח כדי ליצור לחץ חלקי O2 של 99%. כאן, הנפח הכולל של חמצן המיוצר במשך 4 ימים נע בין 316 (SEM ± 11) מ"ל בטיפול A ל 902 (SEM ± 51) מ"ל בטיפול C (טבלה 1). לכן, עד סוף הניסוי, מרחב הראש של כל הבקבוקים היה מכיל בעיקר O2. הריכוז המוגבר של מרחב הראש O2, ובכך הירידה בריכוז של N2, היו משפיעים על הלחץ והרוויה החלקיים של גזים אלה. עם מרחב ראש של 99% O2 , חושבה עלייה של פי 5 ב-DO. עבור תרבויות 1.1 L, זה תורגם ל-23 מ"ל נוספים של DO. לעומת זאת, ההערכה הייתה שהמעבר למרחב ראש של 1% N2 היה גורם ל-15 מ"ל של N2 להשתחרר. משמעות הדבר היא שתחת מרחב ראש חמצן כמעט טהור, יותר O2 מומס מאשר N2 נעקר. לפיכך, מכיוון שנותר יותר O2 בתווך, השפעה זו הייתה מובילה להערכות חסר קלות בכמות החמצן הפוטוסינתזתי המיוצר.
האתגר העיקרי של שיטה זו התעורר כאשר התרבויות נעשו צפופות. עם יותר ביומסה, ומכאן יותר נשימה, הביקוש ל-O2 גדל. צריכת O2 בלילה יצרה מרחב לחץ. זה גרם לנוזל אריזת חיישן גז לנוע למעלה דרך קו הגז. כאשר ייצור O2 התחדש, היה צורך להחזיר את נוזל האריזה לחיישני הגז. זה גרם לעיכוב בקריאת חיישן הגז הראשון. עם זאת, בלילה הרביעי, עוצמת הלחץ התת-לחץ הזה גרמה לנוזל האריזה להגיע ולטפטף לשניים משלושת השכפולים של טיפול B, ויצרה חלקלקות של שמן פני השטח. בשל רמת נוזל האריזה המופחתת, חיישני הגז התקצרו, ושחררו O2 לא מדיד ישירות לאטמוספרה. זה גרם לאיסוף הנתונים להיות שטוח (איור 7B).
תת-לחץ יכול להיגרם גם על ידי התכווצות הנגרמת על ידי טמפרטורה של נפח מרחב הראש. עם זאת, ההשפעה כאן הייתה מינימלית. תעלות קירור וזרימת אוויר פיזרו כראוי את עודפי החום. מבין שני משטרי האור שנבדקו, שינוי הטמפרטורה המרבי הפחית את נפח מרחב הראש ב-1% או פחות, שווה ערך לתזוזת נוזל אריזה של 800 μL במרחב ראש של 80 מ"ל. תנופת הטמפרטורה היומית המרבית הייתה 1.4 מעלות צלזיוס עבורמשטרי הפוטונים m-2 s-1 של 300 מיקרומול (איור 6) ו-3.2 מעלות צלזיוס עבורמשטרי הפוטונים m-2 s-1 של 600 מיקרומול. עליית הטמפרטורה הממוצעת בשעות היום עבור 300 ו 600 מיקרומולפוטונים m-2 s-1 משטרים היה 0.7 ו 1.8 מעלות צלזיוס, בהתאמה. טמפרטורות התרבית חזרו לנקודת ההתחלה במהלך הלילה (איור 6).
נתוני קצב צמיחה ברזולוציה גבוהה יכולים לחשוף מגמות שאחרת עלולות להיעלם מעיניהם. שקול טיפולים B ו- C. למרות ה-IBCs השונים שלהם, שניהם יצרו את אותה כמות של ביומסה כוללת (gAFDW), מה שגרם לשינוי זהה ב-pH הבינוני (טבלה 1). בהינתן רק נקודות נתונים התחלתיות וסופיות, אדם יכול להניח בצדק שאין הבדל בקצב הצמיחה הממוצע בין שני הטיפולים (טבלה 1). עם זאת, נתוני קצב זרימת חמצן מקוונים גילו כי לכל טיפול היו שיעורי גדילה יומיים משתנים. וריאציות אלה באו לידי ביטוי גם במדידות pH פעמיים ביום (איור 8). ביום הראשון, קצב הגדילה של טיפול ב' היה נמוך מזה של טיפול ג'. ביום השלישי, זה התהפך כאשר קצב הגדילה של טיפול B עלה על זה של טיפול C (איור 7B,C). נתוני קצב זרימת החמצן הצביעו על כך שקצב הגדילה הגבוה ביותר התרחש ביום השלישי בטיפול B (איור 7B).
נפח החמצן הכולל שנוצר על ידי כל בקבוק בשלושת הטיפולים שימש להערכת השינוי שלהם בסך הכל ביומסה (gAFDW). זה הושג באמצעות משוואה גנרית לסינתזת ביומסה פוטוסינתטית: CO2 + 0.2 NH3 + 0.6 H2O = CH1.8 O0.5 N0.2 + 1.05 O2. העלייה בלחץ החלקי של מרחב הראש O2 והעלייה ברוויה ב-DO בעקבותיה היו צפויות לגרום להערכת חסר קלה של צמיחת הביומסה. זה היה נכון לגבי חמש מתוך שבע דוגמאות (טבלה 2). בממוצע, צמיחת הביומסה המשוערת הייתה בטווח של 10% מצמיחת הביומסה שנמדדה. חלק מההערכות היו שונות רק ב-1-3 מ"ג מהצמיחה הנמדדת. שתי דוגמאות להערכת יתר של צמיחה, כלומר הופק יותר חמצן מכפי שצמיחת ביומסה יכולה להסביר. כל O2 הנצרך על ידי נשימה בן לילה צריך לבוא לידי ביטוי בפיגור בייצור O2 למחרת. כאן, הניסויים הופסקו בסוף הלילה. בדרך זו, קטבוליזם ביומסה בן לילה במהלך 8 השעות האחרונות של כל ניסוי אינו נמדד. זה עלול לגרום להערכות יתר של צמיחת ביומסה, במיוחד בתרבויות צפופות. לפיכך, מומלץ להפסיק את הניסויים בתום השעות המוארות.

איור 1: בסיס מעמד הכור. (A) ממדים של רכיבי הבסיס במ"מ. (B) כיוון של זיזי פינות מתכת המאבטחים את שתי התמיכות האנכיות. (C) אחד מארבעה אורכי פלדה קצרים מחבר את החצי האחורי של צינור ה-PVC לעמדת הכור. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 2: רכיבים חשמליים. (A) מבט אחורי של ה-PBR המציג את הקורה הצולבת העליונה ואת התצורה של הרכיבים החשמליים. (B) מבט קדמי של PBR לאחר התקנת אור. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 3: פרטי פלטפורמת הבקבוק. (A) מידות השכבה העליונה והתחתונה במ"מ. (B) ראשי בריחים שקועים בשתי השכבות. (C) סוגריים מסולסלים מחברים את השכבה התחתונה ישירות לחצי האחורי של צינור ה-PVC. (D) חמישה חלקים קצרים של צינורות קשיחים המותקנים מעל ברגים צרים מפרידים בין השכבות העליונות והתחתונות. (E) כאשר פלטפורמת הבקבוק הושלמה, המשטח צריך להיות סמוק. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 4: קו גז ויציאת דגימה אופציונלית. אם יש צורך ביציאת הדגימה, קווי הגז צריכים לכלול שסתום חד-כיווני במורד הזרם של המחט. (B) חיישן גז נפחי. רמת האריזה הנוזלית צריכה לגעת בבורג העקיבה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 5: עקומה סטנדרטית המקשרת בין הגדרות תוכנת בקרת LED לעוצמת האור הפנימית. עיגולים לבנים ומשולשים אפורים מייצגים כל אחד PBR בודד. עבור כל הגדרת תאורה, כל ארבעת גופי התאורה הוגדרו לערך זהה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 6: שינוי טמפרטורת התרבית עבור 300μmol פוטונים m-2 s-1 משטרי אור. במהלך התוכנית היומית של 24 שעות, 16:8 שעות, נוריות LED העלו את טמפרטורת התרבית בשעות היום. החץ הכחול מציין את ההבדל בין הטמפרטורה המינימלית למקסימום. שגיאת תוכנית אור גרמה לירידת הטמפרטורה לפני רדת החשכה; זה תוקן לפני תחילת הניסוי. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 7: ייצור חמצן לשלושה תנאי ניסוי ייחודיים. כל כור קיבל שילוב שונה של עוצמת האור וריכוז הביומסה הראשוני (IBC); (A) 300פוטונים מיקרומול m-2 s-1 ו- IBC 0.03 גרםAFDW L-1, (B) 600פוטונים מיקרומול m-2 s-1 ו- IBC 0.13 גרםAFDW L-1, (C) 600פוטונים מיקרומול m-2 s-1 ו- IBC 0.40 גרםAFDW L-1. הגרפים העליונים מציגים את תפוקת החמצן המצטברת (mL) ואת קצב זרימת הגז (mL/h). קווים שחורים מוצקים, קווים כחולים מקווקווים וקווים אדומים מנוקדים הם העתקים משוכפלים. זמן הריצה של כל ניסוי היה 104 שעות, שכלל ארבעה מחזורי יום-לילה מלאים של 16:8 שעות. הצללה כתומה כהה מייצגת שעות לילה ושעות יום כתומות בהירות. שימו לב שבטיפול ב', ייצור חמצן שטוח ביום 4 עבור שניים משלושת השכפולים. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 8: תגובת pH. כל כור קיבל שילוב שונה של עוצמת אור ו-IBC; (יהלומים ירוקים) 300 μmolפוטונים m-2 s-1 ו- IBC 0.03 gAFDW L-1, (משולשים אדומים) 600פוטונים μmol m2 s-1 ו- IBC 0.13 gAFDW L-1, (עיגולים סגולים) 600 μmolפוטונים m-2 s-1 ו- IBC 0.40 גרםAFDW L-1 . הצללה כתומה כהה מייצגת שעות לילה ושעות יום כתומות בהירות. פסי שגיאה מייצגים את שגיאת התקן של הממוצע. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
| טיפול | עוצמת האור (מיקרומול פוטונים m-2 s-1) | IBC (gAFDW L-1) | Δ סך הכל ביומסה (gAFDW) | Δ pH | סה"כ חמצן המיוצר (מ"ל) |
| A | 300 | 0.031 | 0.289 (± 0.01) | 0.15 (± 0.01) | 316.2 (±11.4) |
| B | 600 | 0.130 | 0.674 (± 0.02) | 0.52 (± 0.27) | 834.6* |
| C | 600 | 0.400 | 0.675 (± 0.02) | 0.55 (± 0.03) | 902.2 (±50.5) |
| * רק אחד משלושת ההעתקים הצליח | | |
טבלה 1: שינוי מדד הצמיחה משעה 0 ל-104. סוגריים מרובעים מייצגים את השגיאה הסטנדרטית של הממוצע.
| טיפול | עוצמת האור (מיקרומולפוטונים m-2 s-1) | IBC (gAFDW L-1) | צמיחת ביומסה נמדדה (gAFDW) | צמיחת ביומסה חזויה (gAFDW) | לזלזל (%) |
| A | 300 | 0.031 | 0.289 | 0.288 | 0.5 |
| A | 300 | 0.031 | 0.311 | 0.270 | 13.1 |
| A | 300 | 0.031 | 0.268 | 0.247 | 7.9 |
| B | 600 | 0.13 | 0.708 | 0.705 | 0.4 |
| C | 600 | 0.4 | 0.718 | 0.796 | -10.9 |
| C | 600 | 0.4 | 0.640 | 0.830 | -29.7 |
| C | 600 | 0.4 | 0.668 | 0.659 | 1.3 |
טבלה 2: אומדני צמיחה המבוססים על סך החמצן הנמדד. רק שכפול אחד מתוך 300 μmolפוטונים m-2 s-1 ו- IBC = 0.13 גרםAFDW L-1 טיפול רץ להשלמה.
איור משלים 1: צילום מסך מתוכנת בקרת LED. ניתן לשלוט בכל אחד מארבעת גופי התאורה באופן עצמאי על-ידי הזזת לחצני העמעם או הזנת ערך מספרי לתוך תיבת הטקסט. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
איור משלים 2: צילום מסך של חלון התצורה של תוכנת רכישת הנתונים. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
איור משלים 3: צילום מסך של חלון הרישום של תוכנת רכישת הנתונים. מלבנים ירוקים בהירים מציינים חיישני גז מקוונים. הנתונים מוצגים בזמן אמת. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
טבלה משלימה 1: דוגמה למשטר אור של 24 שעות. עבור תוכנית יומית של 16:8 שעות, יש 48 סטים של 30 דקות כל אחד. כוכביות מציינות זמני דגימה מוצעים. אנא לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.
טבלה משלימה 2: אלקליניות גבוהה הרכב בינוני pH גבוה. אנא לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.
טבלה משלימה 3: פתרון רכיב מעקב. הוסיפו לריכוז סופי של 1 מ"ל/ל' למדיום הבסיס. אנא לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.