אנו מציגים פרוטוקול לקביעת כיראליות רב-תאית במבחנה, תוך שימוש בטכניקת המיקרו-פטרינג. בדיקה זו מאפשרת כימות אוטומטי של הטיות שמאל-ימין של סוגים שונים של תאים וניתן להשתמש בה למטרות סינון.
מאמר שיטה
אנו מציגים פרוטוקול לקביעת כיראליות רב-תאית במבחנה, תוך שימוש בטכניקת המיקרו-פטרינג. בדיקה זו מאפשרת כימות אוטומטי של הטיות שמאל-ימין של סוגים שונים של תאים וניתן להשתמש בה למטרות סינון.
כיראליות היא תכונה תאית פנימית, המתארת את האסימטריה במונחים של קיטוב לאורך ציר שמאל-ימין של התא. מכיוון שתכונה ייחודית זו מושכת תשומת לב גוברת בשל תפקידיה החשובים הן בהתפתחות והן במחלות, שיטת כימות סטנדרטית לאפיון כיראליות תאים תקדם את המחקר ואת היישומים הפוטנציאליים. בפרוטוקול זה אנו מתארים בדיקה של אפיון כיראליות רב-תאית המשתמשת במערכים מיקרו-פטרתיים של תאים. מיקרו-פטרנים סלולריים מיוצרים על שקופיות זכוכית מצופים טיטניום/זהב באמצעות הדפסה מיקרו-קונקרטית. לאחר זריעה על האיים המוגדרים באופן גיאומטרי (למשל, בצורת טבעת), המצופים בחלבון, התאים נודדים בכיוון ויוצרים יישור מוטה לכיוון הכיוון השעון או לכיוון נגד כיוון השעון, אותו ניתן לנתח ולכמת באופן אוטומטי על ידי תוכנית MATLAB שנכתבה בהתאמה אישית. כאן אנו מתארים בפירוט את הייצור של מצעים micropatterned, זריעת תאים, איסוף תמונות וניתוח נתונים ומציגים תוצאות מייצגות שהושגו באמצעות תאי NIH/3T3. פרוטוקול זה אומת בעבר במספר מחקרים שפורסמו והוא כלי יעיל ואמין לחקר כיראליות תאים במבחנה.
אסימטריה שמאל-ימין (LR) של התא, הידועה גם בשם ידיים תאיות או כיראליות, מתארת את קוטביות התא בציר LR ומוכרת כתכונה ביופיזית בסיסית, שמורה, 1,2,3,4,5. כיראליות התא נצפתה הן in vivo והן in vitro במספר קשקשים. ממצאים קודמים חשפו מערבולת כיראלית של שלד אקטין ציטוסקלטון בתאים בודדים שנזרעו באיים עגולים6, נדידה ויישור מוטים של תאים בתוך גבולות מוגבלים 7,8,9,10,11, ולולאה א-סימטרית של צינור חום עוף 12.
ברמה הרב-תאית, כיראליות התאים יכולה להיקבע מתוך נדידה או יישור כיווניים, סיבוב תאי, דינמיקה של השלד הציטוסקטלי ומיקום אברוני התא 7,8,9,10,11,12,13. הקמנו בדיקה מבוססת מיקרו-פטרינגשל 14 כדי לאפיין ביעילות את ההטיה הכיראלית של תאים דביקים 7,8,9,10. כאשר המיקרו-פטרנים בצורת טבעת מגבילים באופן גיאומטרי את צבירי התאים, התאים מפגינים יחד נדידה כיוונית ויישור מוטה. תוכנית MATLAB פותחה כדי לזהות ולמדוד באופן אוטומטי את יישור התאים בתמונות של ניגודיות פאזה של הטבעת. כיוון יישור התאים המקומיים מכמת בזווית מוטה, בהתאם לסטייתו מהכיוון ההיקפי. לאחר ניתוח סטטיסטי, תבנית הטבעת של התאים מוגדרת כהטיות נגד כיוון השעון (CCW) או כהטיות בכיוון השעון (CW).
בדיקה זו שימשה לאפיון הכיראליות של פנוטיפים של תאים מרובים (טבלה 1), והאסימטריה LR של תאים נמצאה כ-7,11,15 ספציפיים לפנוטיפ. יתר על כן, הפרעה לדינמיקה ולמורפולוגיה של אקטין יכולה לגרום להיפוך של הטיה כיראלית 7,8, ועקה חמצונית יכולה לשנות גם את כיראליותהתאים 9. בגלל הפשטות של ההליך והחוסן של הגישה 7,8,9,10, בדיקת כיראליות דו-ממדית זו מספקת כלי יעיל ואמין לקביעה ולימוד כיראליות רב-תאית במבחנה.
מטרת פרוטוקול זה היא להדגים את השימוש בשיטה זו כדי לאפיין את כיראליות התא. פרוטוקול זה מתאר כיצד לייצר מערכים תאיים עם דוגמאות באמצעות טכניקת הדפסה מיקרו-קונטקונטקטית ולבצע ניתוח כיראליות באופן אוטומטי באמצעות תוכנית MATLAB.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. ייצור חותמות פולידימתילסילוקסן (PDMS)16
2. ציפוי שקופיות זכוכית
3. הדפסה מיקרו-קונקרטית
4. זריעת תאים על גבי שקופיות מיקרו-פוטרניות
5. אוסף תמונות
6. אפיון כיראליות של תאים (איור 2)
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
רבע שעה לאחר זריעת תאי NIH/3T3, הידבקות התאים בתבנית הטבעת אושרה חזותית על ידי הדמיית ניגודיות פאזה. לאחר תרבית מאוחרת יותר של 24 שעות, התאים על התבניות התכנסו והתארכו עם יישורים א-סימטריים בעליל, מוטים לכיוון הכיוון השעון (איור 2). נדידה כיוונית של תאים מחוברים נרשמת על ידי הדמיה בהילוך מהיר, ניתן לכמת את תנועתיות התאים ואת המורפוגנזה באמצעות ניתוחים נוספים של הסרטון. כדי לבצע ניתוח כיראליות, תמונות של ניגודיות פאזה ברזולוציה גבוהה נלקחות לאחר הקיבוע (איור 2A-C...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בדיקת התבניות בצורת טבעת המתוארת כאן מספקת כלי קל לשימוש לאפיון כמותי של כיראליות רב-תאית, המסוגלת להפיק תוצאות אמינות ביותר וניתנות לחזרה. ייצור מהיר של מיקרו-סביבה מוגדרת זהה וניתוח בלתי מוטה מאפשר עיבוד אוטומטי בתפוקה גבוהה של דגימות בגודל גדול. פרוטוקול זה דן בייצור המיקרו-פטרנים הטבעתיים, בתבניות התאים ובניתוח אוטומטי של יישור התאים המוטה ותנועת הכיוון. שיטה זו תואמת לטכניקות הדמיה חיות לחקר תנועתיות התאים והמורפוגנזה הכיראלית, וניתן לשלב אותה באופן פוטנציאלי בתוכנות אחרות לזיהוי רעילות9 או ל...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין מה לחשוף.
עבודה זו מומנה על ידי המכונים הלאומיים לבריאות (OD /NICHD DP2HD083961 ו- NHBLI R01HL148104). ליאו ק. וואן הוא חוקר פיו במדעים ביו-רפואיים (PEW 00026185), הנתמך על ידי נאמנויות הצדקה של פיו. האוקאנג ג'אנג נתמך על ידי מלגת קדם-דוקטורט של איגוד הלב האמריקאי (20PRE35210243).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 200 הוכחה אתנול | Koptec | DSP-MD-43 | |
| BZX מערכת מיקרוסקופ | Keyence | BZX-600 | |
| מדיום הנשר השונה של Dulbecco (DMEM), מאייד | Gibco | ||
| Temscal | BJD-1800 | ציפוי סרט זהב-טיטנום | |
| סרום בקר עוברי | VWR | 89510-186 | |
| פיברונקטין מפלזמת בקר | סיגמא | F1141-5MG | |
| שקופיות מיקרוסקופ זכוכית | VWR | 10024-048 | |
| פינצטה מזכוכית | Exelta | 390BSAPI | |
| כדורי אידוי זהב | חומרים מתקדמים בינלאומיים | AU18 | |
| HS-(CH2)11-EG3-OH (EG3) | Prochimia | TH 001-m11.n3-0.2 | |
| MATLAB | Mathworks | MATLAB_R2020b | |
| תאי NIH/3T3 ATCC | CRL-1658 | ||
| OAI יישור מגע | OAI | 200 | פוטוליתוגרפיה UV |
| אוקטדקנתיול (C18) | Sigma | O1858-25ML | |
| שייקר אורביטלי | VWR | 89032-088 | |
| מי מלח חוצץ פוספט (PBS) | מוצר מחקר בינלאומי | P32080-100T | |
| פולידימתילסילוקסן סילגארד 184 | דאו קורנינג | DC4019862 | |
| רקיק אוניברסיטת | רקיק סיליקון | מזהה #809 | |
| נתרן פירובט | תרמו פישר מדעי | 11360-070 | |
| SU-8 3050 פוטו-רזיסט | MicroChem | Y311075 0500L1GL | |
| כדורי אידוי טיטניום | בינלאומי מתקדם חומרים | מסכת שקיפות TI14 | |
| (עם תכונה) | Outputicity.com | שירות | הדפסת מסכות |
| Trypsin-EDTA (0.25%) | Thermo fisher scientific | 25200-072 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה