היווצרות של צרורות actomyosin במבחנה ומדידת ייצור כוח אנסמבל מיוזין באמצעות פינצטה אופטית מוצג ונדון.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
היווצרות של צרורות actomyosin במבחנה ומדידת ייצור כוח אנסמבל מיוזין באמצעות פינצטה אופטית מוצג ונדון.
מיוסינים הם חלבונים מוטוריים המבצעים הידרוליזה של ATP כדי לצעוד לאורך מסלולי נימה אקטין (AF) והם חיוניים בתהליכים תאיים כגון תנועתיות והתכווצות שרירים. כדי להבין את מנגנוני ייצור הכוח שלהם, מיוזין II נחקר הן ברמת המולקולה הבודדת (SM) והן כצוותים של מנועים במבחנה באמצעות שיטות ביופיזיות כגון לכידה אופטית.
מחקרים אלה הראו שהתנהגות של יצירת כוח מיוזין יכולה להיות שונה מאוד כאשר עוברים מרמת המולקולה הבודדת בסידור של שלושה חרוזים לקבוצות של מנועים העובדים יחד על משטח חרוז קשיח או כיסוי בסידור גלישה. עם זאת, מבני בדיקה אלה אינם מאפשרים להעריך את הדינמיקה הקבוצתית של מיוזין בתוך היררכיה מבנית ויסקו-אלסטית כפי שהיו עושים בתוך תא. פיתחנו שיטה המשתמשת בפינצטה אופטית כדי לחקור את המכניקה של יצירת כוח על ידי הרכבי מיוזין המקיימים אינטראקציה עם חוטי אקטין מרובים.
צרורות אקטומיוזין אלה מאפשרים חקירה בסביבה היררכית ותואמת, הלוכדת תקשורת מוטורית ותפוקת כוח אנסמבל. האופי הניתן להתאמה אישית של הבדיקה מאפשר לשנות את תנאי הניסוי כדי להבין כיצד שינויים בהרכב המיוזין, בצרור חוטי האקטין או בסביבה הסובבת גורמים לתפוקות כוח שונות.
חלבונים מוטוריים חיוניים לחיים, וממירים אנרגיה כימית לעבודה מכנית 1,2,3. מנועי מיוזין מתקשרים עם חוטי אקטין על ידי נקיטת צעדים לאורך החוטים הדומים למסלול, והדינמיקה של רשתות אקטין-מיוזין מבצעת התכווצות שרירים, תנועתיות תאים, טבעת התכווצות במהלך ציטוקינזיס ותנועת מטען בתוך התא, בין שאר המשימות החיוניות 3,4,5,6,7,8 . מאחר שלמיוסינים יש כל כך הרבה תפקידים חיוניים, כשל בתפקוד של רשת המיוזין-אקטין יכול להוביל להתפתחות מחלות, כגון מוטציות בשרשרת הכבדה של המיוזין הגורמות להיפר-התכווצויות יתר של הלב בקרדיומיופתיה היפרטרופית (HCM)9,10,11,12,13,14 . בהתכווצות שרירים, מנועי מיוזין בודדים משתפים פעולה זה עם זה על ידי עבודה כאנסמבל כדי לספק את האנרגיה המכנית הנדרשת המבצעת את ההחלקה היחסית של AFs 4,15,16,17,18. מנועי מיוזין יוצרים גשרים צולבים בין AFs ומשתמשים בשינויים קונפורמיים עקב המחזור המכנוכימי שלהם כדי לנוע באופן קולקטיבי לעבר הקצה התיל של החוטים המיושרים 17,18,19,20,21.
פיתוח מבחני תנועתיות כמותיים במבחנה ברמת ה-SM תוך שימוש בטכניקות כגון השמנה אופטית הקל על איסוף פרטים חסרי תקדים על האופן שבו מנועי מיוזין בודדים מתפקדים, כולל מדידת ייצור כוח SM וגדלי צעדים 22,23,24,25,26,27,28,29,30 . Finer et al. פיתחו את בדיקת הלכידה האופטית "שלושה חרוזים" או "משקולת" כדי לחקור את מכניקת ייצור הכוח של מנועי מיוזין II בודדים23,31. מכיוון שמיוזין שריר II עובד בצוותים כדי לכווץ AFs אך אינו מעובד ברמת SM, היה צורך לארגן מחדש את כיוון בדיקת הלכידה האופטית מהגישה הקלאסית של חרוזים הקשורים למנוע32. כדי ליצור את בדיקת המשקולת, שתי מלכודות אופטיות שימשו להחזקת AF מעל מנוע מיוזין הקשור לחרוז המחובר לכיסוי, ותפוקת הכוח על ידי המנוע היחיד נמדדה באמצעות תנועות של המיקוד האוטומטי בתוך מלכודת23.
עם זאת, כוחות SM ושימוש בכיוון בדיקה של מנוע יחיד/נימה בודדת אינם נותנים תמונה מלאה על יצירת כוח ברמת המערכת מכיוון שחלבונים מוטוריים רבים, כולל מיוזין II, אינם פועלים בבידוד ולעתים קרובות אינם מתפקדים כסכום חלקיהם 15,16,17,32,33,34,35,36 . מבנים מורכבים יותר הכוללים יותר ממנוע אחד המקיים אינטראקציה עם יותר מחוט אחד נחוצים כדי להבין טוב יותר את הסינרגיה של רשתות המיוזין וחוטי האקטין15,32. כיוון בדיקת המשקולת נוצל כדי לחקור יצירת כוח אנסמבל קטן על ידי חיבור מיוזינים מרובים לחרוז או שימוש בחוט עבה מיוזין המחובר למשטח ומאפשר למנועים לקיים אינטראקציה עם המיקוד האוטומטיהתלוי 4,23,34,37,38,39,40.
מבחני אנסמבל קטנים אחרים כוללים בדיקת גלישה של נימה במבחנה שבה מנועי מיוזין מצופים על משטח כיסוי, וחרוז הקשור ל- AF משמש כדי לחקור את הכוח שנוצר על ידי צוות המנועים 4,35,36,38,39,40,41,42,43 . בשני המקרים הללו, המיוזינים קשורים למשטח קשיח - חרוז או כיסוי - ומשתמשים במיקוד אוטומטי אחד. במקרים אלה, המנועים אינם מסוגלים לנוע בחופשיות או לתקשר זה עם זה, וגם קיום מיוסינים הקשורים באופן נוקשה אינו משקף את הסביבה התואמת, ההיררכית, שבה המנועים יעבדו יחד בסרקומר32. מחקרים קודמים הציעו כי מיוזין II יכול לחוש את סביבתו ולהסתגל בהתאם לשינויים בתנאי ריכוז ויסקואלסטיים או מוטוריים על ידי שינוי מאפיינים כגון ייצור כוח ויחס חובה41,44,45. לפיכך, יש צורך לפתח מבחן לכידה אופטי המטפח ולוכד תקשורת מוטורית ותאימות מערכת כדי לצייר תמונה מציאותית יותר של היסודות המכניסטיים של יצירת כוח הרכב מיוזין II.
כאן, פיתחנו שיטה לשילוב מבנה היררכי במבחנה עם לכידה אופטית על ידי יצירת צרורות אקטומיוזין או סנדוויצ'ים המורכבים ממנועי מיוזין מרובים המקיימים אינטראקציה בין שני חוטי אקטין. לגיאומטריה מודולרית זו יש את היכולת לחקור ישירות כיצד גורמים מולקולריים וסביבתיים משפיעים על יצירת כוח מיוזין בהרכב. יתר על כן, לחקר מנגנוני יצירת הכוח באמצעות הרכבי אקטין-מיוזין אלה יש פוטנציאל לסייע במידול ובהבנת האופן שבו משימות תאיות בקנה מידה גדול, כגון התכווצות שרירים, מתפשטות מהרמה המולקולרית 9,10,13.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. כיסויי תחריט
2. פילמור נימה אקטין
3. הכנת מיוזין וחרוזים
4. הכנת תאי זרימה
5. הכנת צרור אקטומיוסין
6. מדידות כוח באמצעות מלכודת אופטית (NT2 Nanotracker2)
הערה: בעוד שהפרוטוקול שלהלן מיועד במיוחד למערכת NT2, ניתן להשתמש בבדיקה זו עם מערכות השמנה אופטיות אחרות, כולל אלה שנבנו בהתאמה אישית, שיש להן גם יכולות פלואורסצנטיות. זרימת העבודה הכללית נשארת זהה של מיקוד פני השטח של השקופית, ביצוע כיול חרוזים ורכישת נתונים על ידי מציאת חבילות אקטין פלואורסצנטיות. עבור מערכת NT2, איור משלים S1, איור משלים S2, איור משלים S3, איור משלים S4, איור משלים S5, איור משלים S6 ואיור משלים S7 מספקים פרטים על מערכת ההשמנה האופטית וממשק התוכנה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
תאי זרימה המכילים את מערכות צרור האקטומיוזין הם בעלי עיצוב סטנדרטי, המורכב משקופית מיקרוסקופ וכיסוי חרוט המופרדים על ידי תעלה העשויה מסרט דביק דו-צדדי (איור 1). לאחר מכן, הבדיקה נבנית מהכיסוי באמצעות מבואות מבוימים כמתואר בפרוטוקול. הבדיקה הסופית מורכבת מחוטים של אקטין המסומנים ברודמין; ריכוז המיוזין הרצוי (1 μM שימש לתוצאות המייצגות באיור 2 ובאיור 3); ביוטינילציה, אלקסה פלואור 488 עם תווית חוטי אקטין; 1 מיקרומטר חרוזי סטרפטאווידין;...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מחקר במבחנה באמצעות פינצטה אופטית בשילוב עם הדמיה פלואורסצנטית בוצע כדי לחקור את הדינמיקה של הרכבי מיוזין המקיימים אינטראקציה עם חוטי אקטין. צרורות אקטין-מיוזין-אקטין הורכבו באמצעות מיוזין שריר II, רודמין אקטין בתחתית הצרור ועל משטח הכיסוי, וסיבי אקטין בעלי תווית של 488 ביוטינילים בחלק העליון של הצרור. חלבון אקטין משרירי ארנב עבר פולימריזציה וייצוב באמצעות מאגרי אקטין כלליים (GAB) ומאגרי פילמור אקטין (APB). GAB ו-APB חייבים להיות מוכנים טריים מדי יום במעבדה באמצעות ATP, מאגר FC ומאגר TC. מיוזין שריר II שימש ליצי...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין ניגודי עניינים להצהיר.
עבודה זו נתמכת בחלקה על ידי מלגת המחקר של מועצת הסטודנטים לתארים מתקדמים של אוניברסיטת מיסיסיפי (OA), מכללת המצטיינים של אוניברסיטת מיסיסיפי סאלי מקדונל-בארקסדייל (JCW, JER), קונסורציום מענקי החלל של מיסיסיפי תחת מענק מספר NNX15AH78H (JCW, DNR), ואיגוד הלב האמריקאי תחת מענק מספר 848586 (DNR).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| חלבון אקטין (ביוטין): שריר | השלד שלד | AB07-A | חלבון אקטין ביוטיניל |
| חלבון אקטין, שריר שלד ארנב | שלד | AKL99-A | חלבון אקטין |
| Alexa Fluor 488 Phalloidin | Invitrogen | A12379 | מייצב אקטין וצבע Alexa Fluor 488 |
| ATP | Fisher Scientific | BP413-25 | נדרש לאקטין הרכבה ותנועתיות מיוזין |
| בטא-D-גלוקוז | פישר מדעי | MP218069110 | חלק ממערכת ניקוי חמצן המשמשת להפחתת פוטוהלבנה במהלך הדמיה פלואורסצנטית |
| חוסם דרגת ספיגה (קזאין) | Biorad | 1706404 | משמש לחסימת פני השטח מקשירה לא ספציפית |
| CaCl2 | Fisher scientific | C79500 | סידן כלורי, מספק את השליטה הדרושה על הדינמיקה של רשת מיוזין אקטין |
| קטלאז | פישר מדעי | ICN10040280 | חלק ממערכת ניקוי חמצן המשמשת להפחתת פוטוהלבנה במהלך הדמיה פלואורסצנטית |
| Coverslips | Fisher scientific | 12544C | משמש לייצור תאי זרימה |
| DTT | Fisher מדעי | AC327190010 | משמש להכנת חיץ |
| אתנול | פישר מדעי | A4094 | Regent המשמש לניקוי כיסויים |
| גלוקוז אוקסידאז | פישר מדעי | 34-538-610KU | חלק ממערכת ניקוי חמצן המשמשת להפחתת פוטוהלבנה במהלך הדמיית פלואורסצנטי |
| KCl | Fisher scientific | P217-500 | משמש להכנת חיץ |
| KOH | Fisher Scientific | P250-1 | משמש לחרוט כיסויים ולהתאים חוצץ pH |
| MgCl2 | Fisher scientific | M33-500 | משמש להכנת חיץ |
| שקופיות מיקרוסקופ | פישר מדעי | 12-544-2 | משמש לייצור תאי זרימה |
| חלבון מיוזין II: שריר שלד ארנב | שלד | MY02 | חלבון מוטורי מיוזין באורך מלא מבודד משריר השלד של ארנב |
| Nanotracker2 | Bruker/JPK | NT2 | מכשיר לכידה אופטי |
| פולי-ליזין | סיגמא-אולדריץ' | P8920 | מתקנים הידבקות של חוטי אקטין על משטח הזכוכית של הכיסוי |
| רודמין פלואידין | שלד ציטולוגי | PHDR1 | מייצב אקטין וכתם פלואורסצנטי רודמין |
| חרוזי סטרפטווידין, 1 μ m | Spherotech | SVP-10-5 | ידית לכידה אופטית |
| Tris-HCl | Fisher מדעי | PR H5121 | משמש להכנת מאגר |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.