$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
התמקדנו בגנים ספציפיים ב-ESC ולאחר מכן בייצור כימרה כדי לפתח ייצור עכברים שעברו מניפולציה גנטית על פי כתב היד הקודם שלנו11. גנוטיפ ESC (המתואר בסעיף 4) מתבצע באופן שגרתי על ידי PCR באמצעות פריימרים. הפריימרים מתוכננים על רצפים גנומיים מחוץ לזרועות ההומולוגיות ועל הרצפים הספציפיים במקטע הדנ"א של KI (איור 2A). במקרה זה, אף אלל מסוג בר אינו מוגבר, בעוד שאמפליקון PCR בגודל מסוים מזוהה רק כאשר הדנ"א האקסוגני הממוקד הוא KI במוקד המטרה. תוצאות PCR מייצגות של גנוטיפ מוצגות באיור 2B. תשעה מתוך 22 שיבוטים (40.9%) הראו להקה ספציפית ל-KI במקרה זה. שלוש תוצאות מיקוד מייצגות, כולל התוצאה המוצגת באיור 2, מוצגות בטבלה 1. תוצאות אלה מצביעות על כך שהשיטה המוצגת כאן יעילה וניתנת לשחזור עבור KI גן ללא כל בחירות תרופות.
ESC נאסף בפיפטה בהזרקה, ואז נוצר חור בזונה פלוצ'ידה באמצעות פלוס פיאזואלקטרי, וה-ESC משתחרר בין התאים העובריים (איור 3). מבחינה טכנית, פרוטוקול זה להזרקת ESC לעובר בן שמונה תאים או שלב מורולה דומה לפרוטוקול להזרקת ESC לבלסטוציסט הנפוץ במתקני עכברים רבים. עכברים כימריים מייצגים מוצגים באיור 4. לצורך הערכת צבע הפרווה של כימריזם, העובר מזן ה-ICR (לבקנים, שיער לבן) שימש כמקבל B6 או B6-129 F1 ESC, ועוברי B6 שימשו כמקבלי BALB/c ESCs (איור 4).

איור 1: שרטוט של שילוב פלסמיד מעגלי בתיווך CRISPR/Cas9 ריבונוקלאופרוטאין (RNP) לתוך המוקד הספציפי של גנום ESC. אלקטרופורציה מציגה פלסמיד מעגלי כווקטור מיקוד לתוך תאי גזע עובריים עם Cas9-RNP. קיצורים: GOI = גן של עניין, HA = זרוע הומולוגיה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 2: ניתוחי PCR גנומיים לבדיקת KI של שיבוטים ממוקדים של ESC. (A) פריימרים ספציפיים ל-PCR של KI מתוכננים על רצפים גנומיים מחוץ לזרועות ההומולוגיות (קדימה) וברצפים הספציפיים במקטע הדנ"א של KI (הפוך). (B) תוצאות PCR של גנוטיפ מייצג. גנום מסוג בר שימש כבקרה שלילית. קיצורים: GOI = גן של עניין, HA = זרוע הומולוגיה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 3: תמונות מייצגות של הזרקת עובר בשלב שמונה תאים. (A) עבור מיקרו-הזרקה, שלושה כפילים של תאי גזע עובריים (שישה תאים, ראשי חץ) נאספים. (B) חור בזונה פלוצ'ידה נוצר עם פולס פיאזואלקטרי, ותאי גזע עובריים מגורשים בין כל בלסטומר. סרגל קנה המידה המוצג הוא 50 מיקרומטר. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 4: תמונות מייצגות של עכברי כימרה. (A,B) ה-ESC נגזר מ-C57BL/6N (JM8). A3, שיער אגוטי; A) או B6-129 F1 (שיער אגוטי; B) מוזרקים לעוברי ICR (לבקנים, שיער לבן), ולאחר מכן מעבירים את העוברים לפונדקאיות האם. (C) ה-ESC שמקורו ב-BALB/c (לבקנים, שיער לבן) מוזרק לעוברי C57BL/6J (שיער שחור), ולאחר מכן מעביר את העוברים לפונדקאיות אם. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
| מזהה פרויקט | כורומוזום | אורך 5'HA (bp) | אורך 3'HA (bp) | הוספת גודל (bp) | מספר השיבוטים שנותחו | מספר שיבוטים של KI | יעילות (%) | הערות |
| R26-CC* | Chr6 | 965 | 1006 | 5321 | 23 | 2 | 8.7% | - |
| ₪10-03* | Chr8 | 1000 | 997 | 3070 | 22 | 6 | 27.3% | - |
| P4-01* | Chr15 | 1000 | 1000 | 2569 | 22 | 9 | 40.9% | מוצג באיור 2 |
טבלה 1: יעילות KI בשלושה מוקדים גנומיים עצמאיים ב-ESC. *פרויקטים אלה לא פורסמו עד כה. שמם של גנים אלה ייחשף בכתבי יד עצמאיים בעתיד.