בידוד הנויטרופילים מהווה צעד מכריע בחקר NETosis, שבו בחירת שיטת בידוד מתאימה היא בעלת חשיבות עליונה להשגת תוצאות אמינות. גורם חשוב לשקול הוא התרחשות של זיהום לימפוציטים במהלך הבידוד. התמודדות עם אתגר זה משמעותית במיוחד כאשר מבודדים נויטרופילים של חולדות ממח העצם. למרות טווח הצפיפות המובהק של נויטרופילים (1.0814-1.0919, עם שיא של 1.0919) בהשוואה ללימפוציטים (1.0337-1.0765, עם שיא של 1.0526), זיהום בלימפוציטים נותר בלתי נמנע. ניתן לייחס זאת בחלקו לשפע הלימפוציטים במח העצם ולצפיפות המוגברת של לימפוציטים לא בשלים15. טכניקות כגון הפרדת שיפוע צפיפות, כגון שימוש בפרקול ופיקול, יכולות לסייע בבלימת זיהום לימפוציטים, אם כי השגת חיסול לימפוציטים מלא עשויה להיות מאתגרת. ניתן להשתמש בתמיסת פרקול מיוחדת, המכוילת לשיפוע צפיפות מסוים, כדי למזער את הזיהום על ידי ניצול שונות הצפיפות בין נויטרופילים של חולדות ותאי מח עצם אחרים. לכן, על החוקרים להעריך באופן מושכל את ההשפעה הפוטנציאלית של זיהום לימפוציטים על תוצאות הניסוי שלהם ולנקוט צעדים כדי למתן את השפעתו.
מחקר זה מדגיש את החשיבות של התאמת שיטות בידוד לדרישות ניסוי ספציפיות. בשיטה שתוארה קודם לכן14, שיטת הצעד האחד הדגימה שהיא פחות תובענית מבחינת זמן ומאמץ. ככזה, הוא אושר לרכישת NET בשל ההשפעה חסרת המשמעות של לימפוציטים מזהמים על הפרשת NET. לימפוציטים אלה יכולים להיות מסולקים לאחר מכן בשלב הצנטריפוגה הסופי. לעומת זאת, למאמצים הכרוכים בבידוד נויטרופילים והערכה עוקבת של NETosis והפרשת NET, הומלץ על השיטה הדו-שלבית14. גישה זו אפשרה כימות מדויק של NETs המיוצרים על ידי נויטרופילים תוך מזעור ההשפעה של גורמים מבלבלים פוטנציאליים הנובעים מזיהומי תאים אחרים.
ניתן לבצע שינויים בפרוטוקול הבידוד כדי לשפר הן את התנובה והן את הטוהר. לדוגמה, ניצול של ערכת מגיבים הדרגתיים בצפיפות אופטימלית יכול להניב יותר נויטרופילים. שיטות צנרת ושטיפה עדינות יכולות גם להפחית את אובדן התאים ולחזק את הטוהר. פעולות פתרון בעיות כגון ניטור רמת החומציות והטמפרטורה, לצד התאמת פרמטרים של צנטריפוגות, יכולות לתת מענה יעיל לאתגרים בהם נתקלים בתהליך הבידוד. אילוץ נלווה של בידוד מח עצם טמון בסבירות של נויטרופילים לא בשלים וזיהום תאי מח עצם אחרים, ובכך להשפיע הן על הטוהר והן על היבול. פיתוח גישה יעילה לסילוק לימפוציטים יכול לשפר את יעילות הבידוד הכוללת. אילוץ נוסף נוגע לצורך בהקרבת בעלי חיים לצורך בידוד מח עצם, שעשוי שלא להתאים למחקרי אורך של נויטרופילים של חולדות in vivo.
בידוד נויטרופילים לבני אדם מסתמך בעיקר על דם היקפי. שיטות קונבנציונליות כוללות Ficoll-Paque, Percoll, והפרדת חרוזים אימונומגנטית 16,17,18. גישת פיקול מפרידה אוכלוסיות לויקוציטים על בסיס ציפה ומסתמכת על חומר ניגוד כדי להבדיל נויטרופילים. הוא מציע פשטות וחסכוניות אך מתפשר על טוהר ותנובה ומציב אתגרים בסילוק תאי הדם האדומים. מצד שני, פרקול מנצלת שיפועי צפיפות, ומניבה טוהר נויטרופילים ותשואה גדולים יותר על חשבון ציוד מיוחד והגדלת ההוצאות והזמן19. הפרדת חרוזים אימונומגנטית היא טכניקה חדשה וספציפית יותר המשתמשת בחרוזים מגנטיים מצומדים לנוגדנים הנקשרים באופן ספציפי לנויטרופילים עם זיהום מינימלי מלויקוציטים אחרים. למרות שניתן לבצע אוטומציה, היא דורשת ציוד מיוחד וכרוכה בעלויות גבוהות יותר עקב הוצאות חרוזים. בעת בחירת שיטת בידוד נויטרופילים, החוקרים חייבים לשקול יבול, טוהר, עלות ומורכבות. נכון לעכשיו, השיטה הנוחה ביותר לבידוד נויטרופילים אנושיים כוללת שימוש ב- PolymorphPrep20. גישה זו מניבה נויטרופילים מטוהרים מאוד בכמויות משמעותיות תוך זמן קצר. עקרון PolymorphPrep תלוי בהפרדת תאים בהתאם לצפיפות.
בעכברים, בידוד נויטרופילים מדם היקפי אינו מומלץ בשל נפחי דם נמוכים והאתגר של הבטחת כמות מספקת וטוהר לניסויים במורד הזרם. למרות שהחולדות מספקות כמויות דם מספיקות (10 מ"ל לחולדה), מאפייני הדם ההיקפיים שלהן שונים מבני אדם ועכברים. חולדות מטבען מציגות ליקויים במיצוי נויטרופילים, כאשר מונוציטים הם התאים בעלי הגרעין הנפוצים ביותר13,14. לפיכך, בידוד דם היקפי מספק רק 2 x 105-5 x 105 נויטרופילים מחולדה אחת. מח העצם משמש כמקור נויטרופילים בר קיימא יותר, ומציע אספקה זמינה ושופעת ללא קשר למצב הזיהום של החיה. לחלופין, גרימת סביבה דלקתית בחלל הבטן או בבית החזה כדי להגביר את חדירת הנויטרופילים לבידוד אינה אמינה ומורכבת. לפיכך, מיצוי מח עצם מתגלה כמסלול מעשי ואמין לבידוד נויטרופילים של חולדות21.
NETosis כוללת תהליכים תאיים מגוונים הכוללים עיבוי DNA, אוטופגיה וגירוש מטריצה תוך תאית1. בבני אדם, שחול נטו הוא מקיף, ומשאיר אחריו שרידים של קרום התא. באופן מסקרן, מחקרי נויטרופילים של חולדות מציגים דפוסים שונים, החושפים יותר תוכן תוך-תאי לאחר גירוי. למרות גירוי PMA, נויטרופילים של חולדות מפגינים שחול רשת לא שלם, ומתיישרים עם ה-NETosis הספונטני שלהם. באופן מוזר, רשתות חולדה מדגימות נטייה לצורות מצטברות (aggNETs) ולא למבנה רשת נרחב, אולי בגלל יכולת קישור צולב מופחתת. תופעה זו עשויה להשפיע באופן משמעותי על צבירת נויטרופילים, ולהשפיע על התגובה החיסונית הרחבה יותר בחולדות. יישומים עתידיים של בידוד מח עצם עשויים לכלול חיטוט במסלולי איתות שונים ובתאי חיסון ב- NETosis. בנוסף, שיטה זו יכולה להקל על חקר NETosis במודלים שונים של מחלות, ולחשוף את תפקידי הנויטרופילים על פני פתולוגיות שונות. בסופו של דבר, טכניקות חדשניות לבידוד ואפיון NETs טומנות בחובן הבטחה לפענוח המנגנונים המניעים את NETosis ואת השלכותיו התפקודיות על פני מודלים מגוונים של בעלי חיים.