RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
he_IL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
אנו מתארים פרוטוקול לקבלת סיבים מנותקים אנזימטית באורכים וסוגים שונים משישה שרירים של עכברים בוגרים: שלושה מהם כבר תוארו (flexor digitorum brevis, extensor digitorum longus, soleus) ושלושה מהם נותקו בהצלחה בפעם הראשונה (extensor hallucis longus, peroneus longus, peroneus digiti quarti).
סיבי שרירי השלד המתקבלים על ידי דיסוציאציה אנזימטית של שרירי העכבר הם מודל שימושי לניסויים פיזיולוגיים. עם זאת, רוב המאמרים עוסקים בסיבים הקצרים של ה-FDB (flexor digitorum brevis), המגבילים את טווח התוצאות העוסקות בסוגי סיבים, מגבילים את כמות החומר הביולוגי הזמין ומונעים קשר ברור בין תופעות פיזיולוגיות תאיות לבין ידע ביוכימי ודינמי קודם שהושג בשרירים אחרים.
מאמר זה מתאר כיצד להשיג סיבים שלמים משישה שרירים בעלי פרופילים ואורכים שונים של סוגי סיבים. באמצעות C57BL/6 עכברים בוגרים, אנו מראים את פרוטוקול דיסקציית השרירים ובידוד הסיבים ומדגימים את התאמת הסיבים למחקרים חולפים Ca2+ ואפיונם המורפומטרי. הרכב סוג סיבים של השרירים מוצג גם. כאשר מנותקים, כל השרירים נותרו שלמים, סיבים חיים המתכווצים במהירות במשך יותר מ -24 שעות. FDB נתן קצר (<1 מ"מ), peroneus digiti quarti (PDQA) ו peroneus longus (PL) נתן ביניים (1-3 מ"מ), בעוד extensor digitorum longus (EDL), extensor hallucis longus (EHL), ושרירי סולאוס שחררו סיבים ארוכים (3-6 מ"מ).
כאשר תועדו עם הצבע המהיר Mag-Fluo-4, Ca2+ transients של סיבי PDQA, PL ו-EHL הראו קינטיקה מהירה וצרה המזכירה את סוג המורפולוגיה II (MT-II), הידוע כמתאים לסיבים מסוג IIX ו-IIB. זה עולה בקנה אחד עם העובדה כי שרירים אלה יש מעל 90% של סיבים מסוג II לעומת FDB (~ 80%) ו soleus (~ 65%). מעבר ל-FDB, אנו מדגימים לראשונה דיסוציאציה של מספר שרירים, היוצרים סיבים המשתרעים על פני טווח אורכים שבין 1 ל-6 מ"מ. סיבים אלה הם קיימא ונותנים Ca2+ מהיר transients, המציין כי MT-II ניתן להכליל סיבים מהירים IIX ו- IIB, ללא קשר למקור השריר שלהם. תוצאות אלה מגדילות את הזמינות של מודלים למחקרי שרירי שלד בוגרים.
שריר השלד הבוגר של יונקים הוא רקמה רב תכליתית. הוא מווסת בכבדות את חילוף החומרים, הוא המקור העיקרי לייצור חום, ותכונותיו הדינמיות מעניקות לו תפקיד מפתח בנשימה, תנועה של מקטעי גוף, או תזוזה מנקודה אחת לאחרת 1,2,3. שרירי השלד רלוונטיים גם לפתופיזיולוגיה של מחלות רבות, כולל מצבים תורשתיים וכרוניים, כגון מיופתיות, ניוון או סרקופניה, כמו גם מצבים כרוניים רבים שאינם שרירים, כגון מחלות לב מטבוליות 3,4,5,6,7,8.
מחקר ex vivo של התכונות המבניות והתפקודיות של שרירי שלד בוגרים בהקשר של בריאות ומחלות התאפשר בעיקר באמצעות שני מודלים ניסיוניים: שריר שלם וסיבים מבודדים. במאהה-20, חוקרים ניצלו את התכונות של השרירים השלמים, השלמים extensor digitorum longus (EDL), soleus, tibialis anterior ו-gastrocnemius של מינים קטנים שונים כמודלים מרכזיים כדי ללמוד על יחידות מוטוריות, סוגי סיבים ותכונות דינמיות כגון כוח וקינטיקה של כיווץ והרפיה 9,10,11,12,13,14,15,16. עם זאת, הופעתם של מחקרים מעודנים יותר בביולוגיה של התא העבירה את האזור לחקר סיבי שריר בודדים. עבודה חלוצית אפשרה אז בידוד של סיבי flexor digitorum brevis (FDB) שלמים של חולדות על ידי דיסוציאציה אנזימטית לצורך אפיון עוקב 17,18,19. למרות סיבי FDB ניתן להשיג גם על ידי דיסקציה ידנית20, הקלות והתפוקה הגבוהה של דיסוציאציה אנזימטית של שרירי מורין, בנוסף להתאמתם למגוון גישות ניסיוניות, הפכו את המודל האחרון בשימוש נרחב במהלך שני העשורים האחרונים.
סיבי ה-FDB הקצרים מתאימים למחקרים אלקטרופיזיולוגיים וביופיזיקליים אחרים, ניתוחים ביוכימיים, מטבוליים ופרמקולוגיים, ניסויים במיקרוסקופ אלקטרונים ופלואורסצנטיים, טרנספקציה לגישות ביולוגיה של התא, או כמקור לתאי גזע במחקרי מיוגנזה 5,21,22,23,24,25,26,27,28, 29,30,31,32. עם זאת, שימוש רק בסיבי FDB בניסויי שרירים מצמצם את היקף המחקר העוסק בסוגי סיבים ומגביל את כמות החומר הביולוגי הזמין לטכניקות מתודולוגיות מסוימות או להשגת מידע נוסף מחיה אחת. מגבלות אלה מעכבות התאמה ברורה של תופעות פיזיולוגיות תאיות עם מחקרים ביוכימיים ודינמיים קודמים שבוצעו בשרירים שלמים ושלמים שונים (למשל, EDL, soleus, peronei).
התגברות על מגבלות אלה, קבוצות מסוימות הצליחו לנתק את שרירי EDL וסוליאוס הארוכים יותר 24,33,34,35,36,37,38,39,40, ובכך פתחו את הדלת להרחיב עוד יותר את השיטה לשרירים רלוונטיים אחרים. עם זאת, השימוש בסיבי EDL ו-soleus עדיין נדיר, ככל הנראה בשל היעדר פרטים מתודולוגיים לקבלת סיבים שלמים. כאן, אנו מתארים בפירוט כיצד לבודד סיבים באורכים וסוגים שונים משישה שרירים: שלושה מהם כבר תוארו (FDB, EDL, ו soleus) ושלושה מהם בהצלחה מנותקים בפעם הראשונה (extensor hallucis longus [EHL], peroneus longus [PL], ו peroneus digiti quarti [PDQA]). תוצאות העבודה הנוכחית מאשרות כי המודל של סיבים מנותקים אנזימטית מתאים למגוון רחב של מחקרים ומתאמים עתידיים עם נתונים שפורסמו בעבר, ובכך מגדיל את זמינותם של מודלים למחקרי שרירי שלד בוגרים.
כל הנהלים אושרו על ידי הוועדה לאתיקה בניסויים בבעלי חיים של אוניברסיטת אנטיוקיה (UdeA) (פרוטוקול 104 מיום 21 ביוני 2016 ו-005 מיום 15 באפריל 2021), על פי חוק 84 משנת 1989 והחלטה 8430 משנת 1993 שהונפקו על ידי ממשלת קולומביה ובוצעו ודווחו בהתאם למחקר בבעלי חיים: הנחיות דיווח בניסויי Vivo (ARRIVE)41. כל התוצאות המוצגות כאן מגיעות מעכברים בריאים, בני 7-13 שבועות, 20-26 גרם, C57BL/6 זכרים. איור 1 מראה את העיצוב הכללי של מחקר זה ואת סדר ההליכים. כל הריאגנטים, החומרים ופרטי הציוד מפורטים בטבלת החומרים.
1. בעלי חיים
2. דיסקציה
3. פרוטוקול בידוד סיבי שריר
4. הליכים ניסיוניים
הערה: סיבים מבודדים שימשו להערכות ריכוז סרקופלזמיות Ca2+ , מדידות מורפומטריות ומחקרי ביטוי שרשרת כבדה מיוזין (MHC).
(1)
(2)
(3)5. ניתוחים סטטיסטיים וגרפים
הערה: יחידת הניסוי היא סיב שריר.
ריכוז סרקופלזמי Ca2+ במהלך עווית
כדי להדגים את ההיתכנות של ניסויים פיזיולוגיים בקבוצת סיבים מנותקים ולהרחיב את הממצאים הקודמים שלנו על צימוד עירור-כיווץ (ECC) וסוגי סיבים, Ca2+ transients נרכשו בסיבים מכל השרירים. ראשית, FDB (n = 5) ו- EDL (n = 7) הראו קינטיקה Ca2+ המכונה מורפולוגיה מסוג II (MT-II). אלה הם אותות מהירים, קוצניים, אשר RT נמשך ~ 1 ms; שלב הדעיכה שלו יכול להיות מצויד בפונקציה דו-מעריכית כאשר הרכיב הראשון (A1) גדול מ-30% מהמשרעת כולה, והשיא שלו [Ca2+] הוא בין 15 ל-30 מיקרומטר33,47 (איור 3B). התוצאות שלהם מאוגדות (n = 12) בעמודה הראשונה של טבלה 1, בעוד שהתוצאות של הארעיים Ca2+ של הסולאוס (n = 6) מוצגות בעמודה השנייה של טבלה 1. אותות הסולאוס סווגו כמורפולוגיה מסוג I (MT-I, איור 3B) - רחב יותר, עם RT מעל 1.2 מילישניות, A1 נמוך מ-30%, ושיא [Ca2+] בין 7 ל-13 מיקרומטר33,47. שני טורים אלה נחשבו כסימוכין להשוואת מעברי Ca2+ של השרירים החדשים. מאחר שכל הסיבים מ-PDQA (n = 4), PL (n = 6) ו-EHL (n = 4) חלקו את MT-II (איור 3B), הנתונים שלהם מאוגרים (n = 14) בעמודה השלישית של טבלה 1. אותות אלה הראו RT ממוצע של ~1 מילישניות, A1 של ~45%, שיא [Ca2+] מעל 15 מיקרומטר, ומשווים היטב עם התוצאות המוצגות בעמודה הראשונה אך שונות בבירור מאלה המוצגות בטור השני, כפי שאושר על ידי הניתוח הסטטיסטי (טבלה 1). האות המהיר ביותר של כל הדגימה הגיע מסיב EHL, עם ΔF/F של 0.66, [Ca2+] של 16.99 מיקרומטר, RT של 0.85 אלפיות השנייה, HW של 2.42 מילישניות ו-DT של 10.56 אלפיות השנייה. τ1 ו-τ2 היו 1.63 ו-7.21 אלפיות השנייה, בהתאמה, בעוד שהערכים A1 ו-A2 היו 56.60% ו-43.40%. האות האיטי ביותר הגיע מסיב סוליאוס, עם ΔF/F של 0.41, [Ca2+] של 9.76 מיקרומטר, RT של 1.56 אלפיות השנייה, HW של 9.43 מילישניות ו-DT של 31.88 מילישניות. τ1 ו-τ2 היו 2.81 ו-96.42 אלפיות השנייה, בהתאמה, בעוד שהערכים A1 ו-A2 היו 19.55% ו-80.45%.
סוללה של סיבים קצרים, בינוניים וארוכים
התצפית על הבדלים ברורים בין הסיבים בהתאם למקור השריר שלהם אפשרה אפיון מורפומטרי מלא יותר. ההיסטוגרמות של איור 4 מראות שינויים מרשימים באורכי הסיבים בכל השרירים. זה מודגש כאשר משווים את הסיב הקצר ביותר מ FDB (227.06 מיקרומטר) עם אחד הארוך ביותר מ soleus (5.69 מ"מ). ערכי האורך הממוצע מסוכמים בטבלה 2. נמצאו הבדלים סטטיסטיים מובהקים בין הקבוצות (p < 0.01). תוצאות אלה מאפשרות סיווג סיבי FDB כקצרים (<1 מ"מ); PDQA ו- PL כביניים (1 עד 3 מ"מ); ו-EDL, EHL ו-soleus באורך של >3 מ"מ (איור משלים S2).
לעומת זאת, נצפו הבדלים קלים בקטרים הממוצעים של סיבי כל השרירים (טבלה 2) ובהתפלגות הערכים (איור 4). עם זאת, היו הבדלים סטטיסטיים מובהקים בין הקבוצות (p < 0.01). כאשר הוערכו בפירוט, היו הבדלים בין FDB לבין שריר אחר ובין FDB (FDB 38.40 ± 9.40 מיקרומטר, n = 370) לבין מאגר הסיבים הבינוניים והארוכים (45.07 ± 9.99 מיקרומטר, n = 422, p < 0.05). התא הדק ביותר של כל הדגימה נמדד 18.42 מיקרומטר (FDB) והעבה ביותר הגיע ל-82.79 מיקרומטר (PDQA).
סוגי סיבים המשמשים בניסויים פיזיולוגיים
ראשית, סוגי הסיבים הקיימים בכל שריר שלם נקבעו על ידי immunofluorescence. למעט הסולאוס (soleus), השרירים הראו דומיננטיות של יותר מ-76% מהסיבים מסוג II (איור משלים S3, טבלה 3 וטבלה 4). EHL, PL ו-PDQA הם שרירים מהירים במיוחד, עם יותר מ-90% מהסיבים המהירים ועד 58.8% מהסיבים מסוג IIB, כפי שנמצא ב-PDQA. EHL ו-PDQA היו כמעט נטולי סיבים מסוג I. סיבי I/IIA היברידיים היו נוכחים בכל השרירים באחוזים נמוכים. כצפוי, סיבים מסוג I ו-IIA היוו מעל 82% מכלל סיבי הסולאוס (soleus). שריר זה כמעט נטול סיבי IIB המהירים ביותר. על פי הפרופיל של סוגי סיבים, הסולאוס הוא האיטי ביותר וה- PDQA הוא השריר המהיר ביותר מבין ששת הנבדקים.
לאחר מכן, ומכיוון שהוא רלוונטי יותר לניסויים פיזיולוגיים של סיבים בודדים, נדונה השאלה אילו סוגי סיבים מופיעים בתרחיף התא הנגזר מה-FDB המנותק. נמצא כי פרופיל הסיבים בתרחיף התא משקף את הרכב הסיבים הקיימים בהקפאה: שלושה מתוך ארבעה סיבים מנותקים היו מסוג II (איור 5 וטבלה 3).
לבסוף, הרכב השרירים אושר על ידי הפרדת איזופורמים MHC שלהם באמצעות SDS-PAGE. התוצאות היו עקביות עם הדפוס הכללי שנצפה בבדיקות immunofluorescence. הסולאוס הועשר ב-MHC IIa ו-I, בעוד שה-EDL, EHL והפרוני הועשרו ב-MHC IIx ו-IIb אך היו נטולי I (איור משלים S4).

איור 1: תכנון המחקר. (א) ציוד ופתרונות שיוקמו לפני תחילת הליך הנתיחה. 1. סטריאוסקופ מספר אחת. 2. מלמטה למעלה: סט של חמש פיפטות מלוטשות אש, כלי דיסקציה ובקבוקוני קולגנאז בתוך צידנית ניידת (מארז צהוב). 3. מארז סינון, תא נתיחה, בקבוקוני זכוכית מסומנים עם מכסה, מתלה עם פתרונות מסוננים. 4. כלי נתיחה. 5. סטריאוסקופ עם תא דיסקציה מספר שניים המחוברים למצלמה וממריץ חשמלי. (B) הליך הדיסקציה של קבוצת ששת שרירי הגפיים האחוריות של עכברים, כפי שמוסבר באיור 2. (C) לאחר הדיסקציה יש לוודא את כיווץ השרירים ותקינתם לפני שממשיכים לשלב הפרוטוקול הבא. השריר השמאלי בפאנל השמאלי מראה שריר PL גלי, מכווץ יתר על המידה ולא מגיב (חץ כחול), אשר לא ישמש להשגת סיבים מנותקים. במקום זאת, פרוטוקול הדיסקציה צריך להיות ממוטב ולהתחיל מחדש. מקבילו PL מנותח היטב (שריר ימין בלוח השמאלי) מציג מראה מוארך ומתכווץ באופן גלוי (וידאו משלים S1). הפאנל מימין מראה שני שרירי EDL (חץ כחול) ושני שרירי FDB בתוך תמיסת הקולגנאז עם המראה הנכון והישר. (D) ברגע שהשרירים מנותקים, שפכו את הסיבים המבודדים לתוך תא הניסוי ובדקו את כיווץ ושלמותם. בלוח השמאלי, סיבי PL חיים (חץ כחול) ומתים. בלוח הימני, סיבי EDL חיים (חץ כחול) ומתים. (ה-ג) שלוש קבוצות של ניסויים בוצעו עם הסיבים המבודדים: (E) מדידות ריכוז Sarcoplasmic Ca2+ במהלך עוויתות (תוצאות באיור 3). (F) ניתוחים מורפומטריים (התוצאות מוצגות באיור 4). דוגמה זו מציגה סיב PL. (G) אימונופלואורסנציה עבור מחקרי ביטוי שרשרת כבדה של מיוזין (התוצאות מודגמות באיור 5). דוגמה זו מציגה סיב FDB מבודד. פסי קנה מידה = 5 מ"מ (B,C), 100 מיקרומטר (D,F,G). קיצורים: FDB = flexor digitorum brevis; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: הפניות אנטומיות ופרוצדורה כללית לניתוח קבוצה של שישה שרירי גפיים אחוריות של עכבר. שורות, מלמעלה למטה, מציגות את השרירים על פי סדר הדיסקציה הטוב ביותר: FDB, soleus, EDL, EHL, PL ו- PDQA. עמודות, משמאל לימין, מציגות את אבני הדרך במהלך הנתיחה. העמודה הראשונה מראה את השרירים או הגידים הדיסטליים שלהם חשופים כך שהדיסקציה יכולה להתחיל. לדוגמה, חיצים כחולים מצביעים על FDB ו-soleus in situ ועל הגידים הדיסטליים של ה-EDL. שתי העמודות הבאות ממחישות את הדיסקציה עצמה ואת השרירים החשופים לאחר הגיד הדיסטלי שנחתך/נחתך, כפי שמסומן, למשל, עם החץ הכחול בשורה EDL. מומלץ להסיר את ענף ה- FDB המופנה לספרה החמישית. העמודה הימנית ביותר מציגה את השרירים לאחר שהוסרו לחלוטין, כאשר הגידים הפרוקסימליים מכוונים לחלק העליון של התמונות. קווים כחולים ולא רציפים (עמודה ימנית קיצונית) ממחישים את החתכים האורכיים או האלכסוניים שיש לבצע בשרירי הסולאוס וה-EDL כדי להבטיח שהקולגנאז ייכנס לנפחם. מוטות קנה מידה = 5 מ"מ. קיצורים: FDB = flexor digitorum brevis; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus; EHL = extensor hallucis longus; PDQA = peroneus digiti quarti. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: Ca2+ transients שתועדו בסיבים שהתקבלו מקבוצה של שישה שרירי גפיים אחוריות של עכבר. (A) התקנה המשמשת לרכישת ארעי Ca2+ תחת תאורה מעומעמת. פאנל שמאלי: 1. PMT מחובר למיקרוסקופ פלואורסצנטי הפוך (2). 3. מצלמה צמודה למיקרוסקופ. 4. ממריץ חשמלי המוצמד לתא הניסוי. 5. ניתן להשתמש במערכת המיקרומניפולציה כאשר מתוכננות בדיקות אלקטרופיזיולוגיה והזרקה כדי להשלים את רכישת Ca2+ transients. לוח אמצעי: תא הניסוי (הכנסה) עם התאים הטעונים מותקן על במת המיקרוסקופ ומואר באור כחול (450-490 ננומטר, חץ כחול) כדי לעורר את הצבע. במערך זה, פריטים 1 עד 5 מונחים מעל שולחן נגד רטט ובתוך כלוב של פאראדיי. פאנל ימני: לאחר אימות איכות ההתכווצות וטעינת הצבע באמצעות המצלמה (6), האור הנפלט מופנה ל- PMT, הגירוי החשמלי מתחיל, והאות מוזן לדיגיטציה (7) ולתוכנת הרכישה (8) כדי להקליט את Ca2+ חולף. ניתן לראות את הפונקציה המשולבת של אלמנטים אלה במהלך ניסוי חי בסרטון משלים S6. (B) Ca2+ טרנזיאנטים מייצגים, מכוילים של סיבי עכבר FDB, PDQA, PL, EDL, EHL ו-soleus. האותות הדומים, המהירים והצרים של FDB, PDQA, PL, EDL ו-EHL מאשרים כי MT-II כבר ידוע כי מקורם בסיבי IIX ו-IIB, שהם הנפוצים ביותר בשרירים אלה. לעומת זאת, ארעי הסולאוס איטי וקטן יותר, אופייני ל-MT-I, שתואר במקור בסיבי I ו-IIA. העקומה האדומה מעל אותות EDL וסוליאוס מדגימה כי שלב הדעיכה של MT-I ו- MT-II יכול להיות מצויד בפונקציית דעיכה דו-מעריכית. פסי כיול חלים על כל החלוניות. פס אנכי = 2.5 מיקרומטר של [Ca2+], פס אופקי = 10 אלפיות השנייה. מקש הצבע בתחתית מסייע לזהות את השרירים. קיצורים: FDB = flexor digitorum brevis; PDQA = peroneus digiti quarti; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus; EHL = extensor hallucis longus; PMT = צינור מכפיל אור; MT-I = סוג מורפולוגיה I; MT-II = סוג מורפולוגיה II. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: מדידות מורפומטריות של סיבים קצרים, בינוניים וארוכים שהתקבלו על-ידי דיסוציאציה אנזימטית של קבוצת ששת שרירי הגפיים האחוריות של עכבר. סיבים שלמים, בריאים ומייצגים מכל שריר מתוארים בלוחות העמודים השמאליים ביותר. התמונות נערכו רק כדי להפחית את רעשי הרקע ולשפר את הניגודיות, ללא מניפולציה ישירה של סיבי השריר. פסי קנה מידה = 100 מיקרומטר (כל החלוניות). פרוטוקול המדידה, כמו גם המראה והאיכות של הסיבים הארוכים השלמים, ניתן לראות עוד יותר באיור משלים S1. העמודה האמצעית מציגה את התפלגות האורכים, מסודרים מהשריר שיצר את הסיבים הקצרים ביותר (FDB), לשריר עם הסיבים הארוכים ביותר (סולאוס). יש רצף של אורכים כך שיש חפיפה מסוימת בין השרירים, המשתרע על סך של ~ 5.5 מ"מ. התפלגות הקוטר מוצגת בחלוניות העמודות הימניות ביותר. רוב הסיבים הם בין 30 ל 60 מיקרומטר, עם הבדלים קטנים בין השרירים. ניתוחי בדיקה חוזרת (n = 78 סיבים, שווה ערך ל-9.85% מכלל המדגם של n = 792) של המדידות המורפומטריות הראו יכולת שחזור גבוהה מאוד (מקדם שונות ממוצע של 1.77%-רווח בר-סמך 95%, CI95%, 1.26-2.27%─מקדם מתאם ממוצע של 0.99% (CI95% 0.98-0.99)), והדגישו את האמינות הטובה של התוצאות. עקומות התפלגות גאוס נוספו עם תוכנת גרפים מורשית. איור משלים S2 מציג את תרשימי העמודות של הערכים הממוצעים של אורך וקוטר ואת המיזוגים של התפלגות האורך והקוטר של כל השרירים להשוואה קלה יותר. מקש הצבע בתחתית מסייע לזהות את השרירים. קיצורים: FDB = flexor digitorum brevis; PDQA = peroneus digiti quarti; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus; EHL, = extensor hallucis longus. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: מבחני אימונופלואורסנציה עבור סוגי סיבים בתרחיף התא בשרירי FDB מנותקים. תמונות של שדות שונים מציגות סיבי FDB שלמים ומנותקים המודבקים לתחתית השקפים. (A) סיב אנטימיוזין II חיובי (פלואורסצנטיות ירוקה, חץ כחול בהיר אלכסוני) מנוגד בבירור לסיב שלילי (ראש חץ כחול בהיר), מה שמדגים את כוח ההבחנה של הבדיקה. נוכחותם של שני הסיבים בתמונה יכולה להיות מאושרת בגלל תיוג הגרעינים (פלואורסצנטיות כחולה). (B) שדה אחר מראה סיב אנטימיוזין II-חיובי נוסף. (C) זיהוי נכון של שרשרת מיוזין כבדה ברצועות A (פלואורסצנטיות ירוקה) על ידי הנוגדנים אושר באמצעות מיקרוסקופ קונפוקלי. הרצועות השחורות הרוחביות הידועות ביותר לשמצה מתאימות לרצועות I, מועשרות באקטין ולכן צפויות שלא להיות מזוהות על ידי הנוגדנים. (D) המטוקסילין מסמן בסגול את הגרעינים ההיקפיים הטיפוסיים והשופעים, ואוזין מסמן את הסרקופלסמה של הסיב, ומראה תא שלם ובוגר. פסי קנה מידה = 50 מיקרומטר (A,B,D); 10 מיקרומטר (C). קיצור: FDB = flexor digitorum brevis. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
| סיבי | FDB ו-EDL | סולאוס | PDQA, PL ו-EHL | p |
| n | 12 | 6 | 14 | |
| ΔF/F | 0.68±0.15 | 0.46±0.06*,† | 0.66±0.12 | <0.01 |
| [כא2+] (מיקרומטר) | 17.46±5.18 | 11.14±1.86*,† | 16.82±3.29 | <0.01 |
| RT (ms) | 0.95±0.10 | 1.26±0.20*,† | 0.95±0.09 | <0.01 |
| שיפוע עלייה (F/ms) | 5.97±1.41 | 3.12±0.79*,† | 5.83±0.97 | <0.01 |
| HW (ms) | 3.59±0.85 | 8.17±3.00*,† | 3.19±0.54 | <0.01 |
| DT (ms) | 16.98±7.37 | 27.26±7.13*,† | 11.32±2.06* | <0.01 |
| מדרון ריקבון (F/ms) | -0.24±0.07 | -0.10±0.03*,† | -0.35±0.08* | <0.01 |
| τ1 (מטר/שניה) | 1.86±0.37 | 2.07±0.66† | 1.57±0.18 | <0.05 |
| τ2 (ms) | 11.50±3.93 | 46.38±27.14*,† | 8.29±2.14 | <0.01 |
| א1 (%) | 48.14±7.27 | 25.94±8.98*,† | 44.59±8.29 | <0.01 |
| א2 (%) | 51.86±7.27 | 74.06±8.98*,† | 55.41±8.29 | <0.01 |
| מורפולוגיה | MT-II | MT-I | MT-II |
טבלה 1: קינטיקה של Ca2+ transients בסיבים מנותקים אנזימטית המתקבלים מקבוצה של שישה שרירי גפיים אחוריות של עכבר. ערכים הם ממוצע ± סטיית תקן. ערכי p מתאימים למבחן ניתוח השונות. *שונה באופן משמעותי מקבוצות FDB ו- EDL. †שונה באופן משמעותי מקבוצות PDQA, PL ו- EHL. קיצורים: F = פלואורסצנטיות; [Ca2+] = שיא ציטוסולי Ca2+ ריכוז; RT = זמן עלייה; HW = משך במחצית מקסימום; DT = זמן ריקבון; τ1 ו- τ2 = קבועי זמן של ריקבון; A1 ו- A2 = אמפליטודות של ריקבון; FDB = flexor digitorum brevis; PDQA = peroneus digiti quarti; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus; EHL = extensor hallucis longus; MT-I = סוג מורפולוגיה I; MT-II = סוג מורפולוגיה II.
| סיבי | FDB | PDQA | PL | EDL | EHL | סולאוס | p |
| n | 370 | 142 | 80 | 70 | 87 | 43 | |
| אורך (מ"מ) | 0.42±0.05* | 2.20±0.26** | 2.69±0.26† | 3.51±0.53†† | 3.83±0.44‡ | 4.62±0.64 | <0.01 |
| קוטר (μm) | 38.40±9.40* | 46.39±9.50¶ | 45.98±11.18 | 44.43±7.62 | 41.96±9.16 | 46.36±12.85 | <0.01 |
טבלה 2: מדידות מורפומטריות של סיבים קצרים, בינוניים וארוכים המתקבלות על ידי דיסוציאציה אנזימטית של קבוצת ששת שרירי הגפיים האחוריות של עכבר. ערכים הם ממוצע ± סטיית תקן. ערכי p מתאימים למבחן ניתוח השונות. *שונה סטטיסטית מ- PDQA, PL, EDL, EHL ו- soleus. **שונה באופן משמעותי מ- PL, EDL, EHL ו- soleus. †שונה באופן משמעותי מ- EDL, EHL ו- soleus. ††שונה באופן משמעותי מ EHL ו soleus. ‡שונה משמעותית מסולאוס. ¶שונה משמעותית מ- EHL. קיצורים: FDB = flexor digitorum brevis; PDQA = peroneus digiti quarti; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus; EHL = extensor hallucis longus.
| שריר/סיבים | N | n | סה"כ סוג I + I/IIA (%) | סה"כ סוג II (%) |
| FDB | 5 | 747 | 21.94±11.47 | 78.06±11.47 |
| *FDB | 8 | 1483 | 23.46±2.51 | 76.54±2.51 |
טבלה 3: סוגי סיבים בהקפאה ובתרחיף התא בשרירי FDB מנותקים של עכבר. ערכים הם ממוצע ± סטיית תקן. N מתייחס למספר בעלי החיים, בעוד n מתייחס למספר הכולל של סיבים שנותחו בניסויים. שורת FDB מציגה נתונים של כל השריר כפי שנקבע בהקפאה, בעוד ששורת FDB מתאימה לסיבים מבודדים בתרחיף התא לאחר ניתוק השריר. העמודה "סה"כ סוג II" משקפת סיבים טהורים מסוג IIA, IIX ו- IIB. קיצור: FDB = flexor digitorum brevis.
| שריר | N | n | סוג I (%) | סוג I/IIA (%) | סוג IIA (%) | סוג IIX (%) | סוג IIB (%) | סה"כ סוג II (%) |
| PDQA | 4 | 597 | 0.00±0.00 | 10.15±2.62 | 19.33±6.19 | 11.68±7.57 | 58.84±7.63 | 89.85±2.62 |
| PL | 4 | 576 | 3.44±3.94 | 2.04±2.48 | 23.01±7.03 | 37.85±5.66 | 35.66±9.36 | 94.52±3.90 |
| EDL | 4 | 826 | 0.00±0.00 | 10.44±8.33 | 5.67±5.07 | 24.75±10.93 | 59.15±11.36 | 89.56±8.33 |
| EHL | 5 | 618 | 24±0.76 | 5.29±3.31 | 19.04±6.83 | 21.18±10.91 | 54.25±11.73 | 94.47±3.05 |
| סולאוס | 4 | 729 | 32.18±4.48 | 1.74±1.30 | 50.37±7.46 | 14.58±6.94 | 1.12±1.93 | 66.08±5.59 |
טבלה 4: סוגי סיבים בהקפאה של השרירים המעניקים סיבי עכבר בינוניים וארוכים. ערכים הם ממוצע ± סטיית תקן. N מתייחס למספר בעלי החיים, בעוד n מתייחס למספר הכולל של סיבים שנותחו בניסויים. כל השורות מציגות נתונים של השריר כולו כפי שנקבע בהקפאה. עמודות מסוג I, IIA, IIX ו- IIB משקפות סיבים טהורים, ואילו עמודת I/IIA מתייחסת לסיבים היברידיים. העמודה "סה"כ סוג II" היא סיכום של העמודות מסוג IIA, IIX ו- IIB. קיצורים: PDQA = peroneus digiti quarti; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus; EHL = extensor hallucis longus.
קובץ משלים 1: מחקרי הבעת שרשרת כבדה של מיוזין בשרירים שלמים. הפרוטוקולים מציגים פרטים לקביעת איזופורמים של שרשרת מיוזין כבדה על ידי אימונופלואורסנציה בקריוסקציה ועל ידי אלקטרופורזה של ג'ל נתרן דודציל סולפט-פוליאקרילאמיד בהומוגנאטים של כל השרירים. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
איור משלים S1: פרטים על המורפולוגיה של הסיבים המתקבלים על ידי דיסוציאציה אנזימטית של קבוצת ששת שרירי הגפיים האחוריות של עכבר. (A) סרגל כיול המיקרומטר של המיקרוסקופ הפתוח לקביעת קנה המידה בתוכנת ניתוח התמונה מוצג משמאל. הלוח הימני מראה כיצד הקוטר נמדד שוב ושוב כפי שמצוין על ידי הקווים הכחולים המאונכים לציר הארוך של הסיב (חיצים כחולים), בעוד שהאורך נמדד פעם אחת מקצה לקצה כפי שמודגם על ידי הקו הכחול לאורך הציר הראשי של הסיב. (B) מספר תמונות הורכבו בעריכה קלה כדי להדגים את המראה הארוך והבריא של סיבי PDQA, PL, EDL, EHL ו-SOLEUS (תוספות כחולות, ירוקות, צהובות, כתומות וורודות קטנות). התמונות שהורכבו נערכו עוד יותר כדי לתת לסיבים מראה טוב יותר (תמונות גדולות, שחורות ולבנות). (C) תמונות DIC של סיבי FDB, PDQA, PL ו-soleus המדגישות את אי-הסדירות הרגילה של קצהו ואת הפסיעות הרוחביות הידועות שלהם. ניתן לראות את מראה ה-DIC של סיבי ה-EDL וה-EHL הנותרים ב-Supplemental Video S3 וב-Supplemental Video S4. פסי קנה מידה = 100 מיקרומטר. מקש הצבע בתחתית מסייע לזהות את השרירים. קיצורים: FDB, flexor digitorum brevis; PDQA, peroneus digiti quarti; PL, peroneus longus; EDL, extensor digitorum longus; EHL, extensor hallucis longus; DIC = ניגודיות הפרעה דיפרנציאלית. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
איור משלים S2: תרשימי עמודות והתפלגויות אורך וקוטר ממוזגים של הסיבים המתקבלים על ידי דיסוציאציה אנזימטית של קבוצת ששת שרירי הגפיים האחוריות של העכבר. (A) חלקות עמודות (ממוצע ± סטיות תקן) ו-(B) היסטוגרמות ממוזגות מאשרות את הפער באורכים אך את הדמיון בין הקטרים בין כל הקבוצות. *שונה באופן משמעותי מ- PDQA, PL, EDL, EHL ו- soleus. **שונה באופן משמעותי מ- PL, EDL, EHL ו- soleus. †שונה באופן משמעותי מ- EDL, EHL ו- soleus. ††שונה באופן משמעותי מ EHL ו soleus. ‡שונה משמעותית מסולאוס. ¶שונה משמעותית מ- EHL. מקש הצבע בתחתית מסייע לזהות את השרירים. קיצורים: FDB = flexor digitorum brevis; PDQA = peroneus digiti quarti; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus; EHL = extensor hallucis longus. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
איור משלים S3: מחקרי אימונופלואורסנציה עבור הרכב סוג סיבים של קבוצה של שישה שרירי גפיים אחוריות של עכבר. קריוסקציות מייצגות עם תווית נוגדנים המשמשות לניתוחים מדגימות את האיכות הטובה והשלמות של הדגימות. יש דומיננטיות ברורה של סוג סיבים II בכל השרירים, למעט הסולאוס שבו כמות הסיבים מסוג I היא גדולה. פסי קנה מידה = 100 מיקרומטר. מקש הצבע בתחתית מסייע לזהות את השרירים. קיצורים: FDB = flexor digitorum brevis; PDQA = peroneus digiti quarti; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus; EHL = extensor hallucis longus. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
איור משלים S4: הפרדה אלקטרופורטית של איזופורמים MHC בקבוצה של שישה שרירי גפיים אחוריות של עכבר. (A) שני ג'לים מלאים מייצגים הפועלים בימים שונים עם דגימות שונות מדגימים את האיכות, הניקיון ויכולת השחזור של מרחק ההפרדה והנדידה של איזופורמים MHC כאשר הם מוכתמים בכחול קומאסי. למרות ששתי התמונות הללו נערכו מעט כדי לשפר את הניגודיות והבהירות עבור הקורא, הניתוחים בוצעו בג'לים לא ערוכים. (B) דוגמאות לניתוח הפסים עבור כל אחד מששת השרירים. לאחר בחירת החזר השקעה בנתיבי הג'ל, נוצר פרופיל עלילה והתאמה גאוסיאנית משמשת להערכת חלקם של איזופורמים MHC בקבוצה של שישה שרירים. הרכב MHC שנמצא היה: FDB: I 9.0 ± 5.0%, IIa + IIx 91.0 ± 5.0% (n = 3); PDQA: IIa + IIx 25.9 ± 2.4%, IIb 74.1 ± 2.4% (n = 3); PL: IIa + IIx 24.9 ± 2.2%, IIb 75.1 ± 2.2% (n = 3); EDL: IIa + IIx 22.0 ± 2.3%, IIb 78.0 ± 2.3% (n = 4); EHL: IIa + IIx 27.5 ± 1.0%, IIb 72.5 ± 1.0% (n = 3); soleus: I 35.8 ± 2.5%, IIa (+IIx + IIb כאשר קיים) 64.2 ± 2.5% (n = 4). מקש הצבע בתחתית מסייע לזהות את השרירים. המלבן האפור מתחת לג'ל הימני ביותר ב- A מתייחס לסמן המשקל המולקולרי המציין את נדידת IIa ל~ 200 KDa. קיצורים: FDB = flexor digitorum brevis; PDQA = peroneus digiti quarti; PL = peroneus longus; EDL = extensor digitorum longus; EHL = extensor hallucis longus; MHC = שרשרת כבדה מיוזין; ROI = אזור עניין. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
וידאו משלים S1: ה-peroneus longus הפגוע, הגלי והפרונוס (PL, משמאל) אינו מתכווץ בעת גירוי, בעוד שה-PL השלם (מימין) מתכווץ היטב, גם כאשר הוא רחוק יותר מהאלקטרודות. הגדלה פי 0.8. פרוטוקול הגירוי משחרר פולסי זרם מלבניים של 1.2 אלפיות השנייה, 0.7 הרץ ו-50 וולט דרך שתי אלקטרודות. אנא לחץ כאן כדי להוריד סרטון זה.
וידאו משלים S2: התכווצות סיבי peroneus longus. הגדלה פי 20. מצב ניגודיות הפרעה דיפרנציאלית. פרוטוקול הגירוי משחרר פולסי זרם מלבניים של 1.2 אלפיות השנייה, 0.5 הרץ ו- 50 וולט דרך שתי אלקטרודות פלטינה. אנא לחץ כאן כדי להוריד סרטון זה.
וידאו משלים S3: התכווצות extensor digitorum longus סיבים. הגדלה פי 20. מצב ניגודיות הפרעה דיפרנציאלית. פרוטוקול הגירוי משחרר פולסי זרם מלבניים של 1.2 אלפיות השנייה, 0.5 הרץ ו- 50 וולט דרך שתי אלקטרודות פלטינה. אנא לחץ כאן כדי להוריד סרטון זה.
וידאו משלים S4: התכווצות extensor hallucis longus סיבים. הגדלה פי 20. מצב ניגודיות הפרעה דיפרנציאלית. פרוטוקול הגירוי משחרר פולסי זרם מלבניים של 1.2 אלפיות השנייה, 0.5 הרץ ו- 50 וולט דרך שתי אלקטרודות פלטינה. אנא לחץ כאן כדי להוריד סרטון זה.
וידאו משלים S5. התכווצות סיבי סוליאוס. הגדלה פי 20. מצב ניגודיות הפרעה דיפרנציאלית. פרוטוקול הגירוי משחרר פולסי זרם מלבניים של 1.2 אלפיות השנייה, 0.5 הרץ ו-50 וולט, דרך שתי אלקטרודות פלטינה. אנא לחץ כאן כדי להוריד סרטון זה.
וידאו משלים S6: הקלטה חיה של Ca2+ ארעי מסיב extensor digitorum longus טעון Mag-Fluo-4, AM כמתואר בשלב 4.1.4. פרוטוקול הגירוי משחרר פולסי זרם מלבניים של 1.2 אלפיות השנייה, 0.5 הרץ ו- 50 וולט דרך שתי אלקטרודות פלטינה. אנא לחץ כאן כדי להוריד סרטון זה.
המחברים מצהירים כי אין להם ניגודי עניינים.
אנו מתארים פרוטוקול לקבלת סיבים מנותקים אנזימטית באורכים וסוגים שונים משישה שרירים של עכברים בוגרים: שלושה מהם כבר תוארו (flexor digitorum brevis, extensor digitorum longus, soleus) ושלושה מהם נותקו בהצלחה בפעם הראשונה (extensor hallucis longus, peroneus longus, peroneus digiti quarti).
המחברים מביעים את תודתם לפרופסור רובינסון רמירז מ-UdeA על העזרה עם בעלי חיים וכמה תמונות ולקרולינה פלאסיוס על התמיכה הטכנית. יוהאן פינדה מקיקה עזר לנו להתקין את מצלמות הצבע והפלורסצנטיות. שיואן נגו, מאוניברסיטת קווינסלנד, הגיה באדיבות את כתב היד. מחקר זה מומן על ידי CODI-UdeA (2020-34909 מה-22 בפברואר 2021, ו-2021-40170 מה-31 במרץ 2022, SIU), ומשרד התכנון UdeA (E01708-K ו-ES03180101), מדיין, קולומביה, ל-JCC. המממנים לא השתתפו באיסוף וניתוח נתונים, בכתיבת כתבי יד או בהגשתם.
| <חזק>ריאגנטיםחזקים> | |||
| אתנול מוחלט | סיגמא אולדריץ' | 32221 | |
| אצטון | Merck | 179124 | |
| אקרילאמיד | Gibco BRL | 15512-015 | |
| אמוניום פרסולפט | Panreac | 141138.1610 | |
| אנטי מיוזין I נוגדן | סיגמא אולדריץ' | M4276 | נוגדן ראשוני |
| נוגדן אנטי מיוזין II | סיגמא אולדריץ' | M8421 | נוגדן ראשוני |
| אנטי מיוזין IIA נוגדן | אמריקאי אוסף תרבות | סוג SC-71 | נוגדן ראשוני. נגזר מ-HB-277 hybridoma |
| Anti myosin IIB anti myosin Developmental | Studies Hybridoma Bank | BF-F3-c | נוגדן ראשוני |
| ביס-אקרילאמיד | AMRESCO | 0172 | |
| אלבומין סרום בקר | Thermo Scientific | B14 | |
| מגיב ברדפורד | Merck | 1.10306.0500 | |
| ברומופנול כחול | קרלו ארבה | 428658 | |
| סידן פחמתי | Merck | 102066 | |
| סידן דו-כלוריד (CaCl2) | Merck | 2389 | |
| כלורופורם | סיגמא אולדריץ' | 319988 | |
| קולגנאז סוג 2 | וורת'ינגטון | CLS-2/LS004176 | |
| קונסול-הר | תרמו סיינטיפיק | 9990440 | |
| Coomassie כחול מבריק R 250 | Merck | 112553 | |
| דימתיל סולפוקסיד (DMSO) | Sigma Aldrich | D2650 | |
| Dithiothreitol (DTT) | AMRESCO | 0281 | |
| חומצה עידית (EDTA | AMRESCO | 0322, | |
| Eosin Y | Sigma Aldrich | E4009 | |
| גליצרול | Panreac | 1423291211 | |
| Glycine | Panreac | 151340.1067 | |
| סרום עיזים | Sigma Aldrich | G9023 | |
| Hematoxylin | Thermo Scientific | 6765015 | |
| HEPES | AMRESCO | 0511 | |
| Hoechst 33258 | Sigma Aldrich | 861405 | |
| Imidazole | AMRESCO | M136 | |
| Isopentane | Sigma Aldrich | M32631 | |
| Laminin | Sigma Aldrich | L2020 | |
| Mag-Fluo-4, AM | Invitrogen | M14206 | מוכן רק ב-DMSO. חומצה פלורונית אינה נדרשת ואין להשתמש בה כדי למנוע הידרדרות סיבים. |
| יישום Mercaptoethanol | A11080100 | ||
| Methanol | Protokimica | MP10043 | |
| עכברים | מספר | עבור כתב היד הזה, השתמשנו רק בעכברי C57BL/6. עם זאת, כמה תוצאות ראשוניות הראו שהפרוטוקול עובד היטב עבור עכברי וובסטר שוויצריים באותו גיל ומשקל. | |
| Mowiol 4-88 | Sigma Aldrich | 81381 | |
| N,N,N',N'-tetramethylethane-1,2-diamine (TEMED) | Promega | V3161 | |
| N-benzyl-p-toluene sulphonamide (BTS) | Tocris | 1870 | |
| תרכובת חיתוך אופטימלית (OCT) | Thermo Scientific | 6769006 | |
| נוגדן משני | Thermo Scientific | A-11001 | נוגדן משני נגד עכבר עיזים IgG (H+L) נספג צולב, Alexa Fluor 488 |
| נתרן דודציאל סולפט | Panreac | 1323631209 | |
| טריס 0.5 מ', pH 6.8 | AMRESCO | J832 | |
| Tris(Hydroxymethyl)aminomethane | AMRESCO | M151 | |
| Triton X-100 | AMRESCO | M143 | |
| <חזק>חומריםחזק> | |||
| תא חיתוך | שקופיות טעונותבהתאמה | אישית | |
| Erie Scientific | 5951PLUS | ||
| תא אמבטיה ניסיוני | Warner Instruments | RC-27NE2 | תא אמבטיה צר עם גירוי שדה, מורכב על פלטפורמה מחוממת PH-6 |
| מלקחיים עדינים | מכשירי דיוק עולמיים | 500338, 500230 | |
| מספריים עדינים | מכשירי דיוק עולמיים | מספריים ואנות 501778 | |
| פיפטות | פסטר מזכוכית מספר | טיפים | |
| מלוטשים באשבקבוקוני זכוכית עם מכסה | מספר | 2-3 מ"ל | |
| נפח מספריים הפעלה | מכשירי דיוק עולמיים | 501223-G | |
| <חזק>ציודחזק> | |||
| צנטריפוגה | תרמו סיינטיפיק | SL 8R | |
| מיקרוסקופ קונפוקלי | אולימפוס | FV1000 | |
| Cryostat | Leica | CM1850 | |
| המצלמה הדיגיטלית | Zeiss | Erc 5s ו-Axio 305 | Axio 305, יחד עם סטריאוסקופ Stemi 508, שימשו לצילום תמונות במהלך הדיסקציה; בעוד ש-Erc 5s או Axio 208, יחד עם מיקרוסקופ Axio Observer A1, שימשו לצילום תמונות של הסיבים המבודדים ובדיקות האימונופלואורסצנציה |
| Digitizer | Molecular Devices | 1550A Digidata | |
| Electrophoresis chamber | Bio Rad | מיקרוסקופ הפוך Mini-Protean IV | |
| בשילוב עם פלואורסצנציה | Zeiss | Axio Observer A1 | בשילוב עם מקור אור מתאים, מסננים ומטרות לפוטו-מכפיל פלואורסצנטי |
| Horiba | R928 שפופרת, Hamamatsu, בפוטומטר D104, Horiba | מחובר ליציאה הצדדית של מיקרוסקופ הקרינה | |
| Stereoscope Zeiss | Stemi 508 | ||
| ממריץ | כלי דשא | אמבט מים S6 | |
| Memmert | WNE-22 | ||
| Xilol | Sigma Aldrich | 808691 | |
| Software | |||
| תוכנה חינמית לניתוחי אלקטרופורזות | אוניברסיטת קנטקי | GelBandFitter v1.7 | http://www.gelbandfitter.org |
| תוכנה חינמית לניתוח תמונות ומורפומטריה | המכונים הלאומיים לבריאות | ImageJ v1.54 | https://imagej.nih.gov/ij/index.html |
| תוכנה מורשית לקליטה וניתוח אותות Ca2+ | Molecular Devices | pCLAMP v10.05 | |
| https://www.moleculardevices.com תוכנה מורשית לניתוחים סטטיסטיים וגרפים | OriginLab | OriginPro 2019 | https://www.originlab.com/ |