כל ההליכים בבעלי חיים בוצעו בהתאם למדריך לטיפול ושימוש בחיות ניסוי שנקבע על ידי המועצה הקנדית לטיפול בבעלי חיים. הניסויים בוצעו על פי פרוטוקול שאושר על ידי הוועדה המוסדית לטיפול ושימוש בבעלי חיים של רשת הבריאות האוניברסיטאית בטורונטו, קנדה.
1. ציון דרך בחיסון הגידול
הערה: "ציון דרך" מתייחס לתהליך של סימון העור של העכבר כדי לציין היכן יש להזריק את תאי הגידול כדי לייעל את מיקום DSFC. הליך ציון דרך זה צריך להיעשות באותו יום או יום אחד לפני החיסון. NOD מדוכא חיסון. Cg-Rag1tm1Mom Il2rgtm1Wjl/SzJ (NRG) עכבר נקבה שימש לעבודה זו.
- מרדימים את העכבר באמצעות 5% איזופלורן לאינדוקציה ו-2% איזופלורן לתחזוקה (קצב זרימת חמצן מוגדר ל-0.5 ליטר/דקה). שמור על טמפרטורת הגוף על ידי הנחת העכבר על כרית חימום עטופה במזרן כירורגי אוטוקלאב.
- הכן את העכבר לחיסון תאי הגידול על ידי גילוח ואחריו יישום של קרם רפואי להסרת שיער. הסירו היטב את הקרם להסרת השיער לאחר 30-60 שניות באמצעות מגבת נייר מעוקרת ורטובה. יש למרוח חומר סיכה וטרינרי לעיניים למניעת יובש.
- לחטא את העור עם ספוגית אלכוהול.
- יישר בעדינות את גוף העכבר והרם את העור לאורך עמוד השדרה של העכבר. בעזרת טוש כירורגי, ציירו נקודה אחת בצד אחד של העכבר במרכז עור האוהל. הנקודה צריכה להיות ממוקמת בערך במרכז עמוד השדרה החזי של העכבר.
הערה: זה יהיה המיקום הרצוי של הגידול.
2. חיסון הגידול
הערה: במחקר זה, אנו משתמשים בקו תאים אנושי לסרטן הלבלב (BxPC3). ניתן להשתמש גם בקווי תאים אחרים; עם זאת, שלבים ספציפיים של תרבית תאים עשויים להשתנות בין קווי תאים שונים. עיין בהוראות הכלולות בתאים לקבלת שינויים בהליך שלהלן.
- יש לגדל את התאים החל משבועיים לפני החיסון באמצעות מצע גדילה מלא (Roswell Park Memorial Institute 1640 בינוני עם 10% נסיוב בקר עוברי ו-1% פניצילין/סטרפטומיצין) בבקבוק של 75 מ"ל בטמפרטורה של 37°C ו-5% CO2. ודא שהתאים נשמרים בשלב הצמיחה המעריכית.
הערה: מספר המעבר צריך להיות מוגבל ל 10-15x ואת בקבוק 75 מ"ל צריך להכיל כ 6 מיליון תאים (~ 70% מפגש) בזמן החיסון.
- שאפו את המדיה ושטפו את התאים עם 5 מ"ל של מלח חוצץ פוספט (PBS) ללא סידן או מגנזיום.
- יש להוסיף 5 מ"ל של חומר לפירוק תאים ולדגור בטמפרטורה של 37°C ו-5% CO2 למשך 6-7 דקות. ודא שהתאים התנתקו באמצעות מיקרוסקופ והוסף 5 מ"ל של מצע גידול שלם.
הערה: הקשה עדינה על צד הבקבוק יכולה לסייע בניתוק התאים.
- מעבירים את המתלה לצינור צנטריפוגה של 15 מ"ל וצנטריפוגה ב 500 × גרם למשך 5 דקות כדי לגלול את התאים. לשאוף את התקשורת ולהשעות מחדש את התאים ב 5 מ"ל של מדיה צמיחה מלאה.
- לקבוע את ריכוז התא ואת ספירת התאים הכוללת באמצעות המוציטומטר.
- צנטריפוגה ב 500 × גרם במשך 5 דקות כדי לגלול תאים ולשאוף את התקשורת.
- בהתבסס על ספירת התאים הכוללת המתקבלת משלב 2.5, הוסף את הכמות המתאימה של מצע גידול מלא כדי להגיע לריכוז של
כאשר n הוא המספר הכולל של עכברים שיש לחסן. השהה מחדש את התאים.
הערה: מספר היעד של תאים שיש לחסן לכל עכבר הוא 250,000.
- העבר 1.5 מ"ל המכיל 250,000 תאים × n לתוך צינור מיקרוצנטריפוגה 1.5 מ"ל. צנטריפוגה צינור מיקרוצנטריפוגה 1.5 מ"ל ב 500 × גרם במשך 5 דקות ושאפו את התקשורת.
הערה: ניתן לשמור כל תרחיף תאים עודף באמבט מים חמים המחומם ל -37 מעלות צלזיוס כדי לשמש לחיסונים נוספים במידת הצורך.
- להשעות מחדש את התאים ב 10 μL × n של PBS. הניחו את התאים על קרח כדי לקרר את התרחיף.
הערה: לאחר שהתאים התקררו על קרח, יש להזריק אותם לעכבר תוך 20 דקות.
- הוסף 10 μL × n של קרום מרתף מסיס באמצעות קצות פיפטה צוננים. עומס מחטי אינסולין מקוררות של 29 מד עם 20 μL כל אחד ממתלי התא. שומרים את המזרקים על קרח.
- מרדימים את העכבר באמצעות 5% איזופלורן לאינדוקציה ו-2% איזופלורן לתחזוקה (קצב זרימת חמצן מוגדר ל-0.5 ליטר/דקה).
- הניחו את העכבר על כרית חימום עטופה במזרן ניתוחים מעוקר.
- לחטא את העור באתר ההזרקה עם ספוגית אלכוהול.
- הכנס את המחט ~ 1 ס"מ לפני נקודת ציון ולהזיז את המחט מתחת לעור עד שהיא נמצאת בנקודת הציון . מקם את הצד המשופע של המחט כלפי מעלה והזריק את 20 μL של תרחיף התא.
- המתן 45 שניות כדי לאפשר לקרום המרתף המסיס להתמצק לפני הסרת המזרק.
- הוציאו את העכבר מההרדמה, המתינו עד שהעכבר יהפוך לאמבולטורי, והחזירו אותו לכלוב שלו עם שאר העכברים.
- עקוב אחר הגידול מדי יום על ידי מישוש ולאפשר לגידול לגדול במשך 4 שבועות או עד שהגידול הוא בקוטר 4-8 מ"מ. יש להרדים את העכבר אם מתקיים אחד מהתנאים הבאים: גודל הגידול עולה על 1.5 ס"מ, גידול כיבי או כל סימן למחלה מערכתית (רדום, ירידה במשקל העולה על 20% משקל גוף תקין, אמבולציה לקויה, חוסר יכולת לווסת את טמפרטורת הגוף, אנורקסיה, יציבה כפופה, סימני כאב נראים לעין (הבעות פנים וכו ') או התייבשות).
3. ניתוח תא חלון
הערה: DSFC מורכב מארבעה חלקים המודפסים בתלת-ממד כפי שמוצג באיור 1. סכמות של כל חלק כלולות בקובץ משלים 1. כל החלקים מודפסים עם שרף פלסטיק שקוף תואם ביולוגית. מכלול תא החלון הראשי מורכב משלושה חלקים (איור 1A-C) עם טבעת סמן פידוקיאלית נוספת (איור 1D) שניתן להדביק במהלך הדמיית MRI או CT.

איור 1: סכמה של תא חלון קפל עור גבי. תא החלון הראשי מכיל שלושה חלקים. ראשית, (A) המסגרת הקדמית נתפרת מתחת לעור העכבר ומכילה כיסוי זכוכית המודבק באמצעות דבק UV-cured. (B) המסגרת האחורית נתפרת למסגרת הקדמית בצד החיצוני של העור. (C) תפס התמיכה מודבק לתחתית המסגרת האחורית ושומר על DSFC זקוף על גוף העכבר. (D) טבעת הסמן הפידוקיאלי מכילה שבע 'בארות' שבהן ניתן להכניס סמנים פידוקיאליים. ניתן להדביק את טבעת הסמן הפידוקיאלי על המסגרת הקדמית של DSFC באמצעות שלושת עמודי התמיכה. (E) מכלול DSFC מלא עם טבעת סמן fiducial מוצג. פסי קנה מידה = 1 ס"מ (A-D, משמאל למטה; E). קיצור: DSFC = תא חלון קיפול עור גבי. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
- יש לתת 1 מ"ג/ק"ג של 0.6 מ"ג/מ"ל בופרנורפין בשחרור מושהה 1-3 שעות לפני הניתוח. ודא שהעכבר הוא בעל גודל גוף ומשקל מספיקים כדי לסבול את DSFC ללא התכווצות בית החזה.
- יש לעקר את חלקי תא החלון הראשי (איור 1A-C) בחומר חיטוי נוזלי ברמה גבוהה למשך 12 דקות, ולאחר מכן להשרות באיזופרופיל אלכוהול למשך 5 דקות לפחות.
- מרדימים את העכבר באמצעות 5% איזופלורן לאינדוקציה ו-2% איזופלורן לתחזוקה (קצב זרימת חמצן מוגדר ל-0.5 ליטר/דקה).
- העבר את העכבר למזרן ניתוח סטרילי עם כרית חימום מתחת.
- יש לגלח את העכבר ולמרוח קרם רפואי להסרת שיער אם קיים שיער. לאחר 30-60 שניות, יש להסיר את הקרם להסרת שיער באמצעות מגבות נייר סטריליות ורטובות.
- יש למרוח חומר סיכה וטרינרי לעיניים למניעת יובש. יש למרוח שוב כל 30 דקות או לפי הצורך במהלך הניתוח.
- יש לחטא את העור על ידי מריחת פילינג 7.5% פובידון-יוד ושטיפה עם 70% אלכוהול איזופרופיל. הניחו לעור להתייבש באוויר.
- מרחו תמיסת 10% פובידון-יוד על העור ואפשרו לו להתייבש באוויר (איור 2A).
- החליפו את מזרן הניתוח במזרן מעוקר חדש.
- ודא שהעכבר הגיע למישור הכירורגי של ההרדמה באמצעות צביטת בוהן.
- הרימו את עור העכבר לאורך עמוד השדרה וחפשו את הגידול הגדל על אחד משני קפלי העור הרוחביים. הניחו את המסגרת האחורית של ה-DSFC (איור 2B) באותו צד של העור שהגידול גדל עליו, והקפידו למרכז את הגידול בתוך המסגרת.
- הוסיפו שלושה תפרים לכל אחד משלושת החורים העליונים של DSFC ואת המדריך הכירורגי כדי לתקן את מיקום המסגרת האחורית (איור 2B).
- הכניסו שלוש מחטים דרך המסגרת האחורית של DSFC בחורים שמכילים את הספייסרים (איור 2B).
הערה: ישנם שלושה 'ספייסרים' במסגרת האחורית של DSFC כדי לשמור על רווח בין המסגרת הקדמית והאחורית כדי להבטיח שזרימת הדם אינה מוגבלת לרקמה בתוך DSFC. הספייסרים נראים באיור 1B.
- באמצעות סמן כירורגי, סמנו את שש הנקודות שבהן הספייסרים של מסגרת DSFC האחורית יהיו ממוקמים משני צידי העור (נקודות 1-6 באיור 2C,D).
הערה: המחטים המוחדרות צריכות לשמש כמדריך למיקום המדויק של נקודות אלה.
- ציירו עיגול בקוטר 1 ס"מ כדי לציין את העור שיוסר בצד שממול למסגרת האחורית (איור 2D).
- הסר את המחטים ואת המסגרת האחורית מהעור על ידי חיתוך התפרים.
- חתכו את החור בקוטר 1 ס"מ בעור שסומן בשלב 3.15 באמצעות מספריים זעירים כירורגיים (איור 2E).
- הניחו את התפר הזמני כדי להצמיד את כל חלקי תא החלון לעור. הכנס תפר דרך נקודה 4, דרך החור העליון של המסגרת הקדמית של DSFC, ולאחר מכן דרך נקודה 1 בצד הנגדי של העכבר (איור 2F ושלבים 1-2 באיור משלים S1).
- השחילו את התפר דרך עמוד התמיכה העליון של המסגרת האחורית ואז חזרה דרך עמוד התמיכה במסגרת האחורית הקרובה ביותר לראש העכבר (איור 2F).
- הכנס את התפר דרך נקודה 2. לאחר מכן, השחילו את התפר דרך החור המתאים במסגרת הקדמית (איור 2G ושלב 3 באיור משלים S1).
- מתוך העור, השחילו את התפר דרך נקודה 6 כפי שמצוין באיור 2H ושלבים 3-4 באיור משלים S1.
- השחילו את התפר דרך נקודה 5 כפי שמצוין באיור 2I ושלב 4 באיור משלים S1.
- הביאו את התפר דרך המסגרת הקדמית, נקודה 3, ולאחר מכן דרך המסגרת האחורית כפי שמצוין באיור 2J ושלב 5 באיור משלים S1.
- החזירו את התפר דרך נקודה 1, המסגרת הקדמית של DSFC, ואז החוצה דרך נקודה 4 כפי שמצוין באיור 2K ושלב 6 באיור משלים S1.
- הדקו את כל המכלול עם התפר הזה והחליקו את המסגרת הקדמית מתחת לעור דרך החור שנוצר בשלב 3.17 (איור 2L,M).
- קשרו את שני הקצוות של תפר זה יחד וחתכו כל חוט עודף.
- בצע תפרים קבועים דרך החורים סביב היקף המסגרת הקדמית והאחורית של DSFC. תפרו את שתי המסגרות יחד בתבנית שמוצגת באיור 2N ובאיור משלים S2.
- חותכים ומסירים את התפר הזמני.
- הצמידו את תפס התמיכה למסגרת האחורית של DSFC על-ידי החלקתו לתוך הבליטה מהמסגרת האחורית (איור 2O).
הערה: תמונה של העכבר שבועיים לאחר הניתוח מוצגת באיור 2P,Q. תפס התמיכה משמש כדי לשמור על DSFC זקוף על העכבר כדי להפחית מתח ואי נוחות בעור.
- מתן 5 מ"ג/ק"ג משקל גוף Meloxicam, תרופה נוגדת דלקת לא סטרואידית, תת עורית להפחתת כאב ודלקת.
- הוציאו את העכבר מההרדמה, המתינו עד שהעכבר יהפוך לאמבולטורי, והחזירו אותו לכלוב שלו.
- בדוק את העכבר 2-3 שעות לאחר הניתוח ולאחר מכן מדי יום במשך שבוע אחד לפחות. שקול את נקודת הסיום שהושגה חודשיים לאחר ניתוח חדר החלון או אם אחד התנאים בשלב 2.17 מתקיימים (המוקדם מביניהם).

איור 2: הליך ניתוח DSFC. (A) העכבר מוכן לניתוח על-ידי הסרת השיער וחיטוי העור. הגידול התת עורי מסומן על ידי החץ. (B) המסגרת האחורית מונחת במקום המתאים ומאובטחת על ידי שלושה מזרקים וכן תפרים זמניים המודבקים למדריך הכירורגי השחור. (ג,ד) מיקומי הספייסר (נקודות 1-6) והחור מסומנים משני צידי העור. (E) העור מוסר. (פ-ק) תפר זמני מושחל דרך שתי שכבות העור, המסגרת הקדמית והאחורית של DSFC כדי לאבטח את כל החלקים יחד. (יב,ז) התפר הזמני מהודק, והמסגרת הקדמית מוחדרת מתחת לעור. (N) שמונה תפרים קבועים ממוקמים כדי לאבטח את DSFC. (O) לבסוף, התפר הזמני מוסר, ואת תפס התמיכה מחובר. (פ,כ) אותו עכבר מוצג שבועיים לאחר הניתוח משני הצדדים. קיצור: DSFC = תא חלון קיפול עור גבי. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
4. הדמיה אופטית
- לאפשר לעכבר להחלים ולדלקת לרדת לפחות 5 ימים לאחר הניתוח לפני ההדמיה.
- מרדימים את העכבר באמצעות 5% איזופלורן לאינדוקציה ו-2% איזופלורן לתחזוקה (קצב זרימת חמצן מוגדר ל-0.5 ליטר/דקה).
- יש למרוח חומר סיכה וטרינרי לעיניים למניעת יובש. יש למרוח שוב כל 30 דקות או לפי הצורך.
- אבטח את העכבר בשלב הדמיה באמצעות חיבור גז להרדמה כפי שמוצג באיור משלים S3.
- קבל תמונה במיקרוסקופ שדה ראייה רחב (>1.5 ס"מ רוחב) של brightfield. ודא שדיווטי הסמן הפידוקיאלי במסגרת הקדמית של DSFC גלויים.
הערה: ישנם שבעה דיווטים סביב היקף הזכוכית במסגרת הקדמית המתיישרים עם שבע בארות הסימון הפידוקיאליות בחיבור טבעת הסמן הפידוקיאלי. הדיבות האלה נראות באיור 1A.
- באותו יום, קבל תמונה microvascular באמצעות שיטת מיקרוסקופיה intravital של בחירה. השתמש באותו שלב הדמיה משלב 4.4 (איור משלים S3) לשם כך. הוציאו את העכבר מההרדמה, המתינו עד שהעכבר יהפוך לאמבולטורי, והחזירו אותו לכלוב שלו.
הערה: אנו משתמשים בטומוגרפיה קוהרנטית אופטית של שונות כתמים (svOCT) עבור תמונות מיקרו-וסקולריות תלת-ממדיות ברזולוציה גבוהה.
5. הדמיית תהודה מגנטית
- הניחו את כלוב העכבר מתחת למנורת חום כדי לחמם את העכברים למשך כ-15 דקות לפני שאתם מרדימים את העכבר.
הערה: חימום מקדם הרחבת כלי דם, אשר יסייע במיקום קטטר ורידי הזנב.
- מרדימים את העכבר באמצעות 5% איזופלורן לאינדוקציה ו-2% איזופלורן לתחזוקה (קצב זרימת חמצן מוגדר ל-0.5 ליטר/דקה).
- רשום את משקל העכבר באמצעות סולם אלקטרוני למינון נכון של תרופות.
הערה: למדידות מדויקות של משקל הגוף, הקפד להפחית את משקל מכלול DSFC (0.83 גרם).
- הניחו את העכבר על מיטת ה-MRI ומרחו חומר סיכה וטרינרי לעיניים למניעת יובש.
- שמור על טמפרטורת הגוף של העכבר באמצעות דוד שמש ומערכת משאבה.
- מקם כרית ניטור נשימתי מתחת לסרעפת של העכבר ושמור על 30 ± 5 נשימות לדקה.
- אם אתה משתמש בחומר ניגוד, הכנס מחט פרפר 27 G לווריד הזנב עם microtubing מחובר (30 μL של נפח מת ממולא מראש עם 1% תמיסת מלח הראפין). הצמידו את המחט והמיקרו-אבובינג למיטת ה-MRI בעזרת סרט ניתוח.
- אבטח את תא החלון ב'התקן אימוביליזציה' מודפס בתלת-ממד כפי שמוצג באיור 3.
- באמצעות מחט 18 גרם, להזריק חומר סיכה וטרינרי לעין לתוך שבעת הצינורות על סמן fiducial MRI.
- הצמידו את הסמן הפידוקיאלי ל-DSFC על-ידי יישור שלושת המחברים המרובעים לשלושת העמודים הבולטים מהמסגרת הקדמית (איור 3).
- חבר את צנתר ורידי הזנב לקו אספקת התרופות והמזרק במשאבה האוטומטית. הכנס את המיטה לסורק MRI פרה-קליני 7-tesla.
- קבל ערכות תמונה משוקללות T2 (T2w) קורונליות וציריות כדי להמחיש את מישור תא החלון (זמן הד TE = 25 אלפיות השנייה; זמן חזרה TR = 2,500 אלפיות השנייה; שדה ראייה של 40 x 40 מ"מ עם מטריצה של 64 x 64 עבור רזולוציה של 0.5 x 0.5 מ"מ במישור; עובי פרוסה של 0.5 מ"מ; 25 שניות). רשום סט משוקלל T2 קשת (TE = 25 אלפיות השנייה; TR = 2,500 אלפיות השנייה; שדה ראייה של 32 x 32 מ"מ עם מטריצה של 128 x 128 עבור רזולוציה של 0.25 x 0.25 מ"מ במישור; לפחות 11 פרוסות הדמיה; עובי פרוסה 0.5 מ"מ; 87 שניות), המסובבות לאחר מכן למישור DSFC וסמנים פידוקיאליים, בהתבסס על התצוגות העטרה והציריות, כפי שמוצג באיור 4. כוונו מחדש באופן איטרטיבי ומקמו את ערכת הקשת עד שפרוסות ההדמיה מיושרות במלואן, כך שפרוסה 5 מכילה באופן מלא אות רקמה ב-DSFC ופרוסה 6 אינה מכילה אות רקמה ב-DSFC.
- בצע הדמיה מיקרו-וסקולרית בשיטת MRI מיקרו-וסקולרית לפי בחירתך.
הערה: עבור רכישות MR מיקרו-וסקולריות, אין צורך לצלם את פרוסות הסמן הפידוקיאלי מכיוון שהתמונות נרכשות באותה מסגרת התייחסות של הדמיה כמו תמונות הרישום T2w.- רכוש את כל הרכישות המפורטות בשלבים 5.12 ו- 5.13 בשדה ראייה של 32 x 32 מ"מ עם מטריצה של 64 x 64 עבור רזולוציה של 0.5 x 0.5 מ"מ במישור. עבור כל רכישות MRI, השתמש בפעימות RF עקביות כדי לשפר את העקביות הגיאומטרית דרך מישור (עירור sinc; מיקוד מחדש sinc3; רוחב פס של 2,484 הרץ).
- להדמיית DCE:
- אם רוצים מדידות של ריכוז גדוליניום, השג מפות T1 באמצעות תמונות דו-ממדיות-נדירות שנרכשו בזמני חזרה משתנים (TE = 7 אלפיות השנייה; גורם נדיר = 2; TR = 350, 500, 750, 1,000, 1,500, 2,500 ו- 4,000 אלפיות השנייה; 8 דקות 28 שניות).
- בצע הדמיה בסדרת זמן באמצעות תמונות נדירות דו-ממדיות (TE = 8.1 אלפיות השנייה; גורם נדיר = 2; TR = 200 אלפיות השנייה; זווית היפוך = 90°; רזולוציה זמנית = 12.8 שניות; 188 חזרות; זמן ניטור כולל = 40 דקות 6 שניות).
- יש להזריק משקל גוף של 0.75 mmol / kg Gadobutrol מעל 10 שניות דרך וריד הזנב לאחר השלמת חמש חזרות תמונה באמצעות משאבת מזרק אוטומטית תואמת MR.
- עבור IVIM MRI:
- בצע הדמיה משוקללת דיפוזיה עם ערכי B הבאים: 0, 20, 40, 60, 80, 100, 150, 200, 400, 600, 800, 1,000 s/mm2 עם שלושה ממוצעים של B = 0 s/mm2 ודגימה איזוטרופית (TE = 16 ms; TR = 800 אלפיות השנייה; משך הדרגתי = 2.2 אלפיות השנייה; הפרדת שיפוע = 9 אלפיות השנייה; 61 דקות).
הערה: הדמיה משוקללת דיפוזיה נרכשת באמצעות קריאת התמרת פורייה דו-ממדית, במקום באמצעות הדמיה אקו-מישורית מועדת לעיוותים, כדי להבטיח עקביות גיאומטרית של הגידול ואותות הרקמה הסובבים אותו בתוך DSFC על פני ערכות התמונות ועם תמונות המיקרוסקופ התוך-חיוני.
- הוציאו את העכבר מההרדמה, המתינו עד שהעכבר יהפוך לאמבולטורי, והחזירו אותו לכלוב שלו.

איור 3: הגדרת הדמיית MR DSFC. (A) מבט צדדי ו-(B) מבט עליון של העכבר הממוקם על מיטת ה-MRI כאשר DSFC מאובטח ומשותק. לעכבר יש צנתר ורידים זנב להזרקת חומר ניגוד וטבעת היצרן הפידוקית מוצמדת למסגרת הקדמית של DSFC. קיצורים: DSFC = תא חלון קיפול עור גבי; MR = הדמיית תהודה מגנטית. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: מיקומי פרוסות MRI ביחס לסמנים פידוקיאליים ולתא החלון. (A) דיאגרמה של DSFC עם חיבור טבעת סמן פידוקיאלי עם 11 פרוסות MRI שכבת-על. יש לרכוש מספר תמונות משוקללות T2 כדי להבטיח שהפרוסות מיושרות כהלכה עם DSFC והרקמה. (ב,ג) מיקום נכון של 11 הפרוסות ביחס לרקמה ב- DSFC מכיוונים שונים. (D) פרוסה 5 היא הפרוסה השטחית ביותר שבה יבוצע ניתוח מתאם בין-מודאלי. (E) פרוסה 6 אינה מכילה אות רקמה המציין שהיא מיושרת כראוי עם DSFC. (F) לבסוף, 7 הסמנים הפידוקיאליים נראים בבירור בפרוסה 9. מוטות קנה מידה = 5 מ"מ. 'X' על הציר מציין שהציר נכנס לדף ועיגול מציין שהציר יוצא מהדף. קיצורים: DSFC = תא חלון קיפול עור גבי; MRI = הדמיית תהודה מגנטית. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
6. רישום משותף של MRI למיקרוסקופ תוך חיוני
- ב- MATLAB, פתחו את קובץ Multimodal_Image_Register.m הכלול בקובץ משלים 2.
- בסביבת העבודה, יש להעמיס את התמונה המיקרו-וסקולרית (איור 5A), את תמונת המיקרוסקופ brightfield (איור 5B) ואת נתוני ה-MRI המיקרו-וסקולרי (מפות פרמטרים של IVIM ו/או DCE MRI).
- לחץ על לחצן הפעל .
- באמצעות מאתר הקבצים הנפתחים, נווט אל הקובץ המכיל את פרוסות T2w MRI.
- בחרו עד ארבע פרוסות MRI T2w שמציגות בבירור את הסמנים הפידוקיאליים (איור 5C).
- יוצג ממשק משתמש המציג את תמונת המיקרוסקופ (איור 5B) ואת פרוסות ה-MRI T2w בעלות ממוצע העומק (איור 5C). מקמו נקודה על כל אחד משבעת הסמנים הפידוקיאליים בתמונת ה-MRI והתאימו אותם לנקודה המתאימה להם בתמונת המיקרוסקופ (סמנים פידוקיאליים מסתובבים סביב היקף הזכוכית במסגרת הקדמית של DSFC) כפי שמצוין בנקודות הירוקות באיור 5B,C.
- סגור את החלון.
- איור המכיל את תמונות ה-MRI והמיקרוסקופיה בשכבת-על יסייע בהערכת איכות הרישום בין שני מערכי הנתונים. אם הרישום מתאים, המשך את הקוד על ידי הקלדת y ולאחר מכן הקשה על Enter בחלון הפקודה. אחרת, נסה שוב שלב זה על-ידי הקלדת n בחלון הפקודה והקשה על Enter.
הערה: רישום משותף מוצלח של ערכת נתוני MRI עם תמונת המיקרוסקופ פירושו ששבעת הסמנים הפידוקיאליים הבהירים ממערך הנתונים של MRI ממורכזים ומוכלים במלואם בתוך הדיווטים המתאימים שלהם במסגרת הקדמית של DSFC.
- יוצג ממשק משתמש המציג את תמונת המיקרוסקופ (איור 5B) ואת מערך הנתונים של הדמיה מיקרו-וסקולרית svOCT (איור 5A). בחר לפחות שלוש נקודות ציון דרך מיקרו-וסקולריות בתמונה המיקרו-וסקולרית svOCT ואת הנקודות המתאימות בתמונת המיקרוסקופ כפי שמצוין על-ידי הנקודות הכחולות באיור 5A,B.
- סגור את החלון.
- איור המכיל את svOCT שכבת-על ותמונות מיקרוסקופיה יופיע כדי לסייע בהערכת איכות הרישום המשותף בין שני מערכי הנתונים. אם הרישום מתאים, המשך את הקוד על ידי הקלדת y ולאחר מכן הקשה על Enter בחלון הפקודה. אחרת, נסה שוב שלב זה על-ידי הקלדת n בחלון הפקודה והקשה על Enter.
הערה: רישום משותף מוצלח של ערכת הנתונים svOCT עם תמונת המיקרוסקופ פירושו שהכלים משני מערכי הנתונים מכוסים בצורה מושלמת זה עם זה.
- סגור את החלון.
- לאחר מכן תופיע תמונת המיקרו-קופי הרשומה במשותף. מיתאר את הגידול בתמונה זו.
- סגור את החלון.
- לאחר מכן יוצגו מספר דמויות: מערך הנתונים המיקרו-וסקולרי svOCT (איור 5D), תמונת המיקרוסקופ הרשום במשותף (איור 5E), ומפות פרמטרי MRI הרשומות במשותף (איור 5F). שמור את המפות לניתוח מאוחר יותר.
הערה: מפות ה-MRI המוצגות מוגבלות לקווי המתאר של הגידול שצוירו על-ידי המשתמש (איור 5F).

איור 5: רישום משותף מבוסס נקודות רב-מודאליות. (A) ערכת נתונים svOCT מיקרו-וסקולרית בקידוד עומק צבע; סרגל קנה מידה = 1 מ"מ. (B) תמונת מיקרוסקופ ברייטפילד של תא החלון; סרגל קנה מידה = 2 מ"מ. (C) ממוצע של פרוסות MRI T2w 8-11 המציגות את שבעת הסמנים הפידוקיאליים הכלולים בטבעת הסמן הפידוקיאלי; סרגל קנה מידה = 5 מ"מ. (C) ראשית, ערכת הנתונים 'נעה' של T2w MRI נרשמת במשותף לתמונת המיקרוסקופ 'הקבועה' של ברייטפילד באמצעות הסמנים הירוקים שהוזנו על-ידי המשתמש בשתי ערכות התמונות. לאחר מכן, תמונת המיקרוסקופ 'הנע' של שדה הבהיר ותמונת MRI הרשומה במשותף נרשמות במשותף ל'מערך הנתונים הקבוע של svOCT' באמצעות הסמנים הכחולים ב- A ו - B. מערך הנתונים הסופי שנרשם במשותף כולל את (D) svOCT, (E) תמונת מיקרוסקופ שדה בהיר ו-(F) מפת פרמטרים פונקציונלית של MRI. הווקסלים השחורים ב-F נמצאים מחוץ לגידול ולכן אינם נלקחים בחשבון בניתוח. עבור D-F, סרגל קנה מידה = 1 מ"מ. קיצורים: svOCT = טומוגרפיה קוהרנטית אופטית של שונות נקודתית; MRI = הדמיית תהודה מגנטית. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.