פרוטוקול זה מספק שיטה של בידוד תאי T ראשוניים ומיקרוסקופ בהילוך מהיר של נדידת תאי T בתנאים סביבתיים ספציפיים עם ניתוח כמותי.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה מספק שיטה של בידוד תאי T ראשוניים ומיקרוסקופ בהילוך מהיר של נדידת תאי T בתנאים סביבתיים ספציפיים עם ניתוח כמותי.
התגובה החיסונית הנרכשת מסתמכת על יכולתו של תא T לנדוד דרך דם, לימפה ורקמות בתגובה לפתוגנים ולגופים זרים. נדידת תאי T היא תהליך מורכב הדורש תיאום של קלטי אותות רבים מהסביבה ומתאי מערכת החיסון המקומית, כולל כימוקינים, קולטני כימוקין ומולקולות הידבקות. יתר על כן, תנועתיות תאי T מושפעת מרמזים סביבתיים דינמיים, שיכולים לשנות את מצב ההפעלה, נוף השעתוק, ביטוי מולקולות ההיצמדות ועוד. In vivo, המורכבות של גורמים אלה השלובים לכאורה זה בזה מקשה להבחין באותות בודדים התורמים לנדידת תאי T. פרוטוקול זה מספק שורה של שיטות מבידוד תאי T ועד ניתוח בעזרת מחשב כדי להעריך נדידת תאי T בזמן אמת בתנאים סביבתיים ספציפיים ביותר. תנאים אלה עשויים לעזור להבהיר מנגנונים המווסתים את הנדידה, לשפר את הבנתנו את הקינטיקה של תאי T ולספק ראיות מכניסטיות חזקות שקשה להשיג באמצעות ניסויים בבעלי חיים. הבנה עמוקה יותר של האינטראקציות המולקולריות המשפיעות על נדידת תאים חשובה לפיתוח טיפולים משופרים.
תאי T הם הגורמים העיקריים לתגובה חיסונית נרכשת, ספציפית לאנטיגן. ברמת האוכלוסייה, תאי T הם הטרוגניים, המורכבים מתת-קבוצות תאיות בעלות פונקציות מיוחדות שונות. חשוב לציין, תאי CD8+ T הם המשפיעים הציטוליטיים העיקריים של המערכת החיסונית, אשר מבטלים ישירות תאים נגועים או לא מתפקדים1.
תאי T בוגרים מסוג CD8+ שוכנים ברקמה וזורמים דרך הדם והלימפה בחיפוש אחר אנטיגנים. במהלך ההדבקה, תאי T מוצגים עם אנטיגנים בדם או ברקמה ומתנקזים במהירות לטחול או לבלוטת הלימפה המתנקזת הקרובה ביותר כדי להתחיל תגובה חיסונית פרודוקטיבית. בכל מקרה, תאי T מופעלים, עוברים הרחבה שבטית ועוזבים את מערכת הלימפה כדי להיכנס לדם, אם עדיין לא שם. במהלך תהליך זה, איתות תוך-תאי מעניק את הירידה בוויסות של קולטני הביות הלימפטיים ואת ה-upregulation של קולטני אינטגרין וכימוקין רבים החיוניים לנדידה ספציפית לרקמה2. בסופו של דבר, ההגירה המכוונת של תאי T לאתרי זיהום מונעת על ידי אותות סביבתיים מתכנסים הכוללים איתות אינטגרין וכימוקין.
ניתן לסווג כימוקינים באופן כללי לשני סוגים עיקריים: (1) אותות הומיאוסטטים, החיוניים להתמיינות, הישרדות ותפקוד בסיסי, ו-(2) אותות דלקתיים, כגון CXCL9, CXCL10 ו-CCL3, הנדרשים לכימוטקסיס. באופן כללי, כימוקינים יוצרים שיפוע אות המניע נדידה כיוונית, המכונה כימוטקסיס, בנוסף להפעלת ביטוי אינטגרין1. כימוטקסיס מווסתת היטב ורגישה מאוד, עם תאי T המסוגלים להגיב לשינויים זעירים בשיפוע שיכולים להוביל אותם לכיוון או מיקום מסוים.
בנוסף לגורמים אלה הקשורים לתאי T, ההגירה מושפעת גם מההרכב והצפיפות של המטריצה החוץ תאית (ECM). ה-ECM מורכב מרשת צפופה של חלבונים, כולל קולגן ופרוטאוגליקנים, המספקים את הפיגום לקולטני אינטגרין דביקים על תאי T. אינטגרינים הם משפחה מגוונת של חלבונים טרנסממברנליים, שלכל אחד מהם תחומי קישור מיוחדים מאוד והשפעות איתות במורד הזרם. ביטוי דינמי של קולטני אינטגרין על פני תא T מאפשר הסתגלות מהירה לסביבתם המשתנה3. חשוב לציין, אינטגרינים מחברים את רשתות האקטין ECM והאקטין הציטו-שלד התוך-תאי שפועלות יחד כדי ליצור את כוח ההנעה הדרוש לתנועת תאי T.
לסיכום, דפוסי ההגירה משתנים בהתאם לפנוטיפ של תא החיסון או לאותות סביבתיים. תהליכים ביולוגיים מורכבים אלה מווסתים היטב על ידי ביטוי של ציטוקינים, כימוקינים ואינטגרינים על פני השטח של תא T, התאים הסובבים אותו, והרקמה המקומית הנגועה. In vivo, מנגנוני נדידה אלה יכולים להיות מורכבים ועשויים לנבוע ממספר אותות מוספים4. בשל מורכבות זו, זה יכול להיות בלתי אפשרי לקבוע קשר סיבתי בין משתנים שלובים לכאורה. כדי להתגבר על כך, ישנן מספר גישות במבחנה לחקר היבטים ספציפיים של נדידת תאי T כגון תגובה לאותות כימוקינים ספציפיים והאינטראקציה בין אינטגרינים של תאי T וחלבונים קושרי ECM. פרוטוקול זה מטפל בשיטות לבידוד והפעלה של תאי T מסוג +CD8, עם מבחני נדידת מבחנה במרחב דו-ממדי וכלי ניתוח חישוביים לניתוח נדידת תאי T שצוינו. שיטות אלה מועילות למשתמש מכיוון שהן אינן דורשות חומרים או התקנים מתוחכמים, כמו בכמה מבחני נדידת תאים אחרים המתוארים בספרות. נתוני נדידת תאים הנוצרים בשיטות אלה יכולים לספק ראיות לתגובות חיסוניות באופן פשטני המאפשר חקירה נוספת ומושכלת in vivo.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הפרוטוקולים של בעלי החיים אושרו על ידי הוועדה האוניברסיטאית למשאבי בעלי חיים באוניברסיטת רוצ'סטר. העכברים במחקר זה הוחזקו בחלל נטול הפתוגנים של מתקן בעלי החיים של אוניברסיטת רוצ'סטר. עכברי C57BL/6 זכרים/נקבות, בגילאי 6-12 שבועות (15-30 גרם), שימשו במחקר הנוכחי. בידוד רקמות עכבר יכול להתבצע על ספסל עם כפפות לכיסוי ידיים ומסכת פנים לכיסוי האף והפה, או בתוך ארון בטיחות ביולוגית. כל תרבית התאים והכנת הצלחת חייבים להתבצע בארון בטיחות ביולוגית. הריאגנטים והציוד ששימשו במחקר זה מפורטים בטבלת החומרים.
1. טיהור והפעלה של תאי CD8+ T
2. הרמת תאי CD8+ T מופעלים
3. הכנת צלחת זכוכית
4. הכנת תאים
5. מיקרוסקופ קיטועי זמן
6. ניתוח בעזרת תוכנה של נדידת תאי T
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
אישור להפעלת תאי T יכול להיות מושג על ידי ציטומטריית זרימה, המחפשת ביטוי מוגבר של CD69 ו- CD44, שהם סמנים קנוניים של הפעלה בתאי T מורין6. בנוסף, ניתן לקבוע את טוהר אוכלוסיית תאי T על ידי ציטומטריית זרימה עבור תאי CD3+ CD8+ T. שיטה זו מניבה >90% אוכלוסיית תאי CD8+ T.
ניתן להעריך את נדידת תאי T באמצעות תוכנות מעקב אחר תאים בסיוע תוכנה הניתנות לשחזור ואינן מתאימות לצרכי החוקר. כמה פרמטרים בסיסיים המשמשים לקביעת השפעות הניסוי כוללים מהירו...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הבנת ההשפעה הביולוגית של התכנסות אותות in vivo היא מאתגרת ולא קלה לפרשנות. הפרוטוקולים המוצגים כאן מספקים שיטה סבירה להבנת נדידת תאי T בתנאים מוגדרים מאוד ורלוונטיים ביולוגית. תנאים אלה יכולים להיות מוגדרים על פי שיקול דעתו של החוקר, וניתן לשנות את הפרוטוקולים כך שיתאימו לצרכים של אוכלוסיות תאי T שונות, מצב ההפעלה ופנוטיפ התא. יתר על כן, ליגנדים וקולטנים רבים יכולים להיחקר באמצעות הליכים מוגדרים אלה של חסימת נוגדנים 7,8 והליכים מצופים ליגנד
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים כי כל המחקר והכנת כתבי היד נעשו בהיעדר קשרים מסחריים או פיננסיים שיכולים להתפרש כניגוד עניינים פוטנציאלי.
אנו מודים לחברים קודמים ונוכחיים במעבדת קים שתרמו לפיתוח פרוטוקולים אלה לאורך זמן. הנתונים המייצגים התאפשרו על ידי P01 AI102851/AI/NIAID NIH HHS/United States ו-P01 HL018208/HL/NHLBI NIH HHS/United States. פרסום זה התאפשר בחלקו הודות למענק מספר T32 GM135134 מטעם פרס שירות המחקר הלאומי ע"ש רות ל. קירששטיין.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| צלחת 10 ס"מ | קורנינג | 353003 | או שווה ערך |
| 15 מ"ל צינור חרוטי | ThermoFisher | 339650 | או שווה ערך |
| 1x DPBS | Gibco | 14190144 | ללא סידן וללא מגנזיום |
| צלחת 6 בארות לא מטופלת | TC קורנינג | 3736 | או שווה ערך |
| 70 ומיקרו; מסננת תאים | m FisherScientific | 352350 | או שווה ערך |
| ACK lysing buffer | ThermoFisher | A1049201 | או שווה ערך |
| Allegra 6KR צנטריפוגה | ThermoScientific | sorvall 16R עם רוטור ודלי tx400 3655 | או שווה ערך |
| בטא מרקפטואתנול | Sigma | M3148 | או שווה ערך |
| CellTrace Violet | ThermoFisher | C34571 | או שווה ערך |
| צנטריפוגה | ThermoScientific | Sorvall ST 16R | או שווה ערך |
| קולגן (IV) | קורנינג | 354233 | או שווה ערך |
| צלחת תרבית DeltaT בעובי .17 מ"מ זכוכית שקופה | Bioptechs | 04200417C | |
| Dynabeads כבשים נגד חולדות IgG | Invitrogen | 11035 | |
| DynaMag 15 מגנט | ThermoFisher מדעי | 12301D | או שווה ערך |
| ערכת בידוד תאי T עכבר קל sep תא | גזע | 19851 | |
| FBS | SigmaAldrich | F2442-500ML | או שווה ערך |
| פיברונקטין | SigmaAldrich | 10838039001 | או שווה ערך |
| פיג'י | http://fiji.sc/ | weblink | |
| קוביות מסנן ניקון | או אולימפוס | ||
| GK1.5 | ATCC | TIB-207 | |
| HEPES | ThermoFisher | 15630080 | או שווה ערך |
| HQ CCD מצלמה | CoolSNAP | או שווה ערך | |
| ImageJ | http://imagej.nih.gov/ij/h | weblink | |
| ImageJ תקע מעקב אוטומטי http://imagej.net/TrackMate | weblink | ||
| ImageJ מעקב ידני חבר https://imagej.nih.gov/ij/plugins/track/track.html | weblink | ||
| L-15 | שונים | ראה חומרים | מתכון בינוני: לייבוביץ' s L-15 בינוני ללא פנול אדום (Gibco) בתוספת 1-5 גרם/ליטר גלוקוז |
| מדיום L-15 של ליבוביץ, ללא פנול אדום | ThermoFisher | 21083027 | |
| Luer Lok מזרק חד פעמי | Fisher Scientific | 14-955-459 | או שווה ערך |
| מדיום הפרדת לימפוציטים | Corning | 25-072-CI | או שווה ערך |
| M5/114 | ATCC | TIB-120 | |
| MEM חומצות אמינו לא חיוניות | ThermoFisher | 11140050 | או שווה ערך |
| מערכת חימום מיקרוסקופ | Okolab | okolab.com | עיצובים מותאמים אישית זמינים |
| שקופית Millicell EZ שקופית | Millipore | C86024 | |
| Mojosort עכבר CD8+ Naï ערכת בידוד תאי T | Biolegend | 480043 | |
| Mouse E-cadherin | R& D systems | 8875-EC-050 | או שווה ערך |
| ערכת דיסקציה כירורגית לעכבר | Fisher Scientific | 13-820-096 | או שווה ערך |
| רכיבי NIS | Nikon | Software | |
| שאינו TC 24wp | Corning | 353047 | או שווה ערך |
| פניצילין-סטרפטומיצין | ThermoFisher | 15140122 | או שווה ערך |
| חלבון A | ThermoFisher Scientific | או שווה ערך | |
| R9 | מגוון ראה חומרים | מתכון בינוני: RPMI 1640x בתוספת 10% FBS, 1% אנטיביוטיקה-אנטימיקוטית (Gibco), 20 מ"מ חוצץ HEPES (Gibco), 1% MEM חומצות אמינו לא חיוניות (Gibco), 50 μ M &-mercaptoethanol (Sigma-Aldrich) | |
| עכבר רקומביננטי ICAM-1 Fc כימרה | R& מערכות D | 796-IC-050 | או שווה ערך |
| עכבר רקומביננטי IL2 | Biolegend | 575410 | או שווה ערך |
| RPMI 1640x | ThermoFisher | 11875093 או שווה ערך | |
| T pins | Fisher Scientific | S99385 | או שווה ערך |
| TE2000-U מיקרוסקופ | ניקון | או שווה ערך | |
| כימוקין עכבר רקומביננטי שונה | & מערכות | או שווה ערך | |
| VCAM-1 Fc chimera | R& מערכות D | 643-VM-050 | או שווה ערך |
| Volocity | PerkinElmer | Software |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.