בכתב יד זה, שתי שיטות שימשו לזיהוי LPS ומוות כתוצאה מ-ATP של מקרופאגים THP-1 ממוינים ב-PMA. נעשה שימוש בצביעה כפולה של Annexin V/7-AAD, והתוצאות נותחו על ידי ציטומטריית זרימה מהצביעה הכוללת. כמו באנליזה ציטומטרית זרימה אחרת, קבוצה של תאים לא מוכתמים ושתי קבוצות של תאים מוכתמים בודדים הוקמו כדי לא לכלול תוצאות חיוביות כוזבות ושליליות כוזבות. התוצאות מראות כי לאחר גירוי LPS/ATP, מספר תאים איבדו את שלמות הממברנה, מה שמצביע על כך שייתכן שהתרחש מוות תאי. שיטת זיהוי זו מאפשרת לנו להעריך את מוות התאים מתאים שלמים. ראוי לציין כי הצביעה הכפולה של Annexin V/7-AAD אינה מספיקה כדי להבחין בין פירופטוזיס, אפופטוזיס ונקרופטוזיס. בשלבים המוקדמים של שלוש צורות אלה, PS ייחשף מחוץ לקרום הפלזמה, וצביעת Annexin V תהיה חיובית. שלמות הממברנה אובדת בשלב המאוחר של שלוש צורות אלה, ותוצאות הצביעה מראות צביעה חיובית כפולה. לכן, השתמשנו ב-SEM כדי להמשיך ולבחון את הצורות האפשריות של מוות תאי שעלולות להתרחש.
באפופטוזיס, היווצרות נקבוביות BAX/BAK על הקרום החיצוני של המיטוכונדריה, התכווצות התאים לאחר מכן והופעת קרום התא. נקרופטוזיס משתמש ב-MLKL כדי לפתוח נקבוביות בקרום התא, בעוד שאות פירופטוזיס מפעיל את הגסדרמין ליצירת נקבוביות בקרום התא. ראוי לציין כי הן pyroptosis ו necroptosis מלווים קרע קרום התא בשלב הסופי. עם זאת, נקבוביות גסדרמין גדולות בהרבה מנקבוביות MLKL, כך שלנקבוביות גסדרמין אין סלקטיביות יונים. תאים נקרופטוטיים מפגינים נפיחות משמעותית במורפולוגיה15. בסופו של דבר הם מסתיימים בקרע בממברנה. ללא קשר למסלול האיתות במעלה הזרם של הפעלת חדירות קרום התא, שינויים בקרום התא מלווים את שלוש צורות המוות התא הללו. השתמשנו ב-SEM כדי להמשיך ולהתבונן בקרום התא, מה שמספק דרך אינטואיטיבית לבחון מוות תאי. ראינו את המאפיינים של פירופטוזיס, כולל דימום הממברנה וקרום הקרע, ונקרופטוזיס, כולל התנפחות תאים וקרום הקרע, בהתאם למאפיינים שנחקרו על ידי חוקרים קודמים15. נצפו דימום קרום והתכווצות תאים, בהתאם למאפייני אפופטוזיס שנחקרו על ידי חוקרים קודמים16.
במחקרים קודמים, השילוב של LPS ו- ATP שימש לעתים קרובות כדי לגרום פירופטוזיס. באופן מעניין, ראינו תכונות של אפופטוזיס ונקרופטוזיס. למרות שכל שלוש הצורות עשויות להתרחש במוות תאי הנגרם על ידי LPS/ATP, מחקרים קודמים הראו כי פירופטוזיס נותר מצב המוות הדומיננטי. LPS הוא אחד הדפוסים המולקולריים המאופיינים ביותר הקשורים לפתוגן. ATP שוחרר מתאים גוססים, יש ריכוז גבוה בתוך התא. ATP חוץ-תאי הוא אחד הדפוסים המולקולריים הקשורים לסכנה17. LPS/ATP היא שיטת גירוי דו-שלבית קלאסית לגרימת פירופטוזיס. מחקרים הראו כי תוספת של ATP לתאים מעוררי LPS יכולה להפעיל במהירות קספאז-118 בעוד השתקת הגן קספאז-1 יכולה להפוך באופן משמעותי את מוות התאים הנגרם על ידי LPS/ATP19. במחקרים קודמים, מצאנו גם הפעלה הנגרמת על ידי LPS/ATP של חלבוני מטרה אפופטוטיים ונקרופטוטיים20,21. למרות LPS/ATP הוא גורם פירופטוזיס קלאסי, הוא עשוי גם לגרום לאפופטוזיס ונקרופטוזיס.
למעשה, שלוש צורות אלה לעתים קרובות אינן קיימות באופן עצמאי, והצלבה בין שלבי אותות. לדוגמה, חלבוני גסדרמין מכוונים למיטוכונדריה כדי לקדם שחרור ציטוכרום C כדי לשפר את מסלול אפופטוטי המיטוכונדריה22. הפעלה של קספאז-3 יכולה לבקע gasdermin E ולאחר מכן להפעיל pyroptosis23. מחקר מצביע על כך שאיתות MLKL/PIPK3 מעורב בהפעלה של NLRP3 inflammasomes24. שיחה צולבת מורכבת זו הובילה לרעיון של PANoptosis, המוגדר כמסלול מוות תאי מתוכנת דלקתי המווסת על ידי קומפלקס PANoptosome עם תכונות מפתח של פירופטוזיס, אפופטוזיס, ו / או נקרופטוזיס שלא ניתן להסביר על ידי אף אחד ממסלולי המוות התא המתוכנתים האלה לבד25. כאשר הרעיון של PANoptosis הוצע, מדענים תיארו את ההתרחשות של מוות תאי מתוכנת באופן מקיף יותר, זה גם מדגיש את המורכבות של מוות תאי מתוכנת. בינתיים, זה גם מצביע על המגבלות של שיטת מחקר זו. למרות שפירופטוזיס נחשב דומיננטי במוות תאי הנגרם על ידי LPS/ATP, לא ניתן לקבוע את חלקן של צורות מוות אלה או אם כולן קיימות, אפילו בצורות אחרות של מוות מתוכנת. זה יכול להיות תחום לחקור בעתיד.
פרוטוקול זה מבוסס על LPS ומוות כתוצאה מ-ATP של מקרופאגים. תיארנו שיטה של בדיקה מן השלם אל הפרט, אשר ישים גם מודלים ותאים אחרים. התוצאות מצביעות על כך שתאים עברו פירופטוזיס, אפופטוזיס או נקרופטוזיס, שאינו מוגבל לפירופטוזיס, מה שעוזר לחוקרים להבין טוב יותר את מוות התאים לאחר גירוי LPS ו-ATP ולבחור שיטה ניסיונית טובה יותר. במחקרים קודמים, Annexin V/7-AAD או Annexin V/PI צביעה כפולה שימש בדרך כלל כדי להצביע על התרחשות של אפופטוזיס26,27, כמה חוקרים השתמשו בו גם כדי לחקור אפופטוזיס28. למעשה, איננו יכולים להבחין בין שלושת סוגי המוות התאי באמצעות כתמים כפולים אלה. פרוטוקול זה מזכיר לחוקרים, במיוחד למתחילים, כי צביעה כפולה של Annexin V/7-AAD או Annexin V/PI אינה יכולה להתאים את סוג המוות הסלולרי. זה יכול רק להראות נזק לתא ומוות בכללותו או להצביע על כך שהתא אולי עבר צורה כלשהי של מוות. במחקר ממוקד יותר, יש צורך להציג קבוצת ביקורת המעכבת מקרי מוות אחרים כדי להראות כי מוות מתכנת באופן חד משמעי הוא בהישג יד. באופן דומה, מחקר מכניסטי נוסף יחקור את המטרות הקריטיות של מקרי מוות מתוכנתים שונים.
בנוסף, במהלך הכנת הניסוי מצאנו כי קיימים כיום הליכי ניסוי מפורטים רבים עבור SEM של תאים דבקים, עם תיאור מועט של תאים מרחפים. כאן, אנו מספקים תיאור מפורט יותר של שיטת הכנת הדגימה עבור תאים מרחפים. שלב 5.5 הוא צעד הכרחי כדי לסייע בהשתקת תאים מרחפים לשקופיות תאים. הפעולות הבאות חייבות להתבצע בעדינות כדי למנוע ניתוק תאים. בנוסף לתמיסת אלום כרום, פולי-L-ליזין יכול גם לשתק תאים.