טכניקות היסטולוגיות מספקות הבנה בסיסית של דגימות ביולוגיות באמצעות חתך רקמות/איברים. עם זאת, תיחום אינטראקציות אנטומיות מורכבות של תאים/תאים ורקמות/רקמות בשלושה דימנמנטים (תלת מימד) היה - עד לאחרונה - קשה להשגה. צורך בלתי מסופק זה היה בולט במיוחד בהקשר של מערכת הלב וכלי הדם במצבים בריאים וחולים. הדמיית רקמות שלמות הייתה מאתגרת בעבר עקב ספיגת אור ופיזור אור, מה שהופך אותן לאטומות במהותן. ניקוי רקמות הופך את הדגימה הביולוגית השלמה לשקופה על ידי מזעור מגבלות אלה. ההתפתחויות האחרונות בטכניקות ניקוי רקמות מאפשרות הדמיה תלת מימדית ברזולוציה גבוהה של רקמות שקופות לא חתוכות כדי לספק תובנה ניכרת לגבי המיקרו-ארכיטקטורה התאית והמבנית של איברים שלמים ברזולוציה מיקרומטרית, ובכך לאפשר הגדרה של רשתות קישוריות אנטומיות.
טרשת עורקים מערבת שלוש שכבות של דופן העורק, כולל שכבת האינטימה הפנימית, שכבת המדיה האמצעית ושכבת רקמת החיבור החיצונית, המכונה אדוונטיטיה. פלאק טרשת עורקים בשכבה הפנימית של העורקים היה יעד קונבנציונלי למחקר במשך עשרות שנים 1,2. עם זאת, שכבת האדוונטיטיה מכילה כלי דם, כלי לימפה וסיבי עצב של מערכת העצבים ההיקפית. יתר על כן, האדוונטיציה קשורה לרקמת השומן הפרי-וסקולרית ולמרכיבי הרקמה העצבית, כולל עצבים היקפיים וגרעינים פריוסקולריים 3,4. ידוע כי עצבים היקפיים משתמשים באדוונטיציה כצינורות כדי להגיע לרקמות מטרה רחוקות, ולמעשה, לתאים5. המחקרים האחרונים שלנו קידמו את ההתקדמות בהבנת האינטראקציות הרב-שכבתיות של המערכות הביולוגיות העיקריות, הכוללות את מערכת החיסון, מערכת העצבים ומערכת הלב וכלי הדם. קראנו לאינטראקציות הללו ממשקים נוירו-אימוניים-קרדיווסקולריים 6,7. במהלך אטרוגנזה, רכיבי דופן העורקים עוברים ארגון מחדש ועיצוב מחדש חזקים. לדוגמה, בסמוך להתקדמות רובד טרשת עורקים באינטימה, נוצרים אגרגטים של תאים חיסוניים, וניאוגנזה של אקסון עצבי מתרחשת באדוונטיציה אבי העורקים של העכברים 6,8,9. ככל שטרשת העורקים מתקדמת, אגרגטים של תאי חיסון מתפתחים לאיברי לימפה שלישוניים בעורקים (ATLOs) מובנים היטב עם אזורי תאי T, תאי B ותאי פלזמה מובחנים10. עם זאת, כדי לתאר את השינויים הללו בתלת מימד, הדמיה ברזולוציה גבוהה של הרקמה השלמה הייתה מאתגרת בגלל חדירות לא מספקת של הממברנה ופיזור אור מובנה11. גישות ניקוי רקמות התגברו על המגבלות העיקריות של גישות היסטולוגיה קונבנציונליות 11,12,13,14,15 עם חדירה משופרת של נוגדנים כדי להגיע עמוק לרקמות או איברים שלמים על ידי התאמה אחידה של מקדם השבירה (RI), מה שמוביל לתמונות ברזולוציה בקנה מידה מיקרומטרי עם עומק הדמיה גבוה יותר בווקסלים. ניתן להתאים RIs של דגימות לגליצרול (RI 1.46) או לשמן טבילה (RI 1.52), ובכך להפחית מאוד את פיזור האור והסטיות הכדוריות, מה שמאפשר רזולוציה גבוהה. ההתקדמות האחרונה בטכניקות ניקוי של כל האיברים או רקמות הגוף כולו, כגון 2,2-תיודיתנול (TDE) מבוסס מים והדמיה תלת מימדית של איברים מנוקים ממסים (iDISCO), בהתאמה, יחד עם טכניקות הדמיה נפחית (כולל הדמיית מיקרוסקופיה קונפוקלית, מולטיפוטונית ומיקרוסקופיה קלה) אפשרו שחזורים של המיקרואנטומיה של ארכיטקטורת כלי הדם על ידי בניית אטלס הקישוריות שלהם11,16. הדמיה של הקשרים התאיים והמבניים הללו בתלת מימד יכולה לספק תובנות חדשות כדי לענות על שאלות ביולוגיות שעד כה לא נענו.