מחקר זה מתאר גישה יעילה ולא כירורגית להשתלה אורתוטופית של השתלות סרטן שד שמקורן בחולה בעכברים. רקמת גידול השד פורקה באמצעות אנזימים ספציפיים לאדם ותסיסה מכנית, הושעה מחדש ביחס של 1:1 v/v של Matrigel: RPMI 1640, והוזרקה אורתוטופית לתוך כריות השומן המפשעתי של עכברי NSG (איור 1 ואיור 2). כדי להבטיח את נאמנות המודלים של PDX, ההתאמה של דגימת הגידול המקורית של המטופל עם הגידולים העוברים אומתה בטכניקות היסטופתולוגיות וגנומיות מבוססות. ביטוי הקולטן נבדק באמצעות צביעה אימונוהיסטוכימית (IHC) של קולטנים סטנדרטיים לסרטן השד, כולל קולטן אסטרוגן (ER), קולטן פרוגסטרון (PR) וקולטן גורם גדילה אפידרמלי אנושי 2 (HER2) (איור 3). המורפולוגיה התאית הוערכה באמצעות צביעת המטוקסילין ואאוזין (H&E) של פרוסות גידול חתוכות ופרשנות פתולוגית מומחית של החלקים המוכתמים. שימור הנוף הגנטי ושימור תאים אנושיים אומתו באמצעות ריצוף RNA בתפזורת ואימות חוזר טנדם קצר (STR) (איור 4 וטבלה 1). בנוסף, בדיקות פתוגנים לא זיהו זיהום של המטופל או דגימות גידול מעבר, וזהו שלב אימות חיוני בהתחשב בשימוש בעכברים חסרי חיסון.

איור 1: סקירה כללית של הפרוטוקול. ייצוג של דיסוציאציה של גידול וזרימת עבודה בהזרקה. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
עכברי NSG הוכנו להזרקה באמצעות קרם הסרת שיער שנמרח בתנועות לסירוגין עם כיוון השעון ונגד כיוון השעון כדי להסיר ביסודיות פרווה מאזור כרית השומן המפשעתי (איור 2A). עודפי קרם להסרת שיער ניגבו מעור בטן חשוף באמצעות גזה סטרילית, והאזור חוטא באמצעות פד אלכוהול (איור 2B). מחט סטרילית עמוסה בתאי גידול מנותקים הוצבה בזווית של כ-45 מעלות של 0.5-1 מ"מ זנב לרפידות השומן של פטמת החלב המפשעתית הרביעית (איור 2C). תאי הגידול הוזרקו בצורה מבוקרת לתוך כריות השומן של פטמת החלב המפשעתית הרביעית (איור 2D). גידול הגידול זוהה בתחילה על ידי מישוש דיגיטלי של רפידות השומן. לאחר מכן, התקדמות נפח הגידול הייתה במעקב כמותי באמצעות הדמיית תהודה מגנטית (MRI) (איור 2E). גם משקל הגוף (איור 2F) וגם נפחי הגידול (איור 2G) נמדדו מדי שבוע כדי לעקוב אחר תנודות במשקל והתקדמות נפחי הגידול. הגידולים נבדקו ויזואלית כדי לעקוב אחר פצעים כגון כיב שיחייב הפסקה מוקדמת. השתלה דו-צדדית מוצלחת של ה-PDX ברפידות השומן המפשעתיות מוצגת באיור 2H, וכריות השומן לאחר כריתת הגידולים מוצגות באיור 2I.

איור 2: הכנת עכברים, הזרקת PDX ומעקב אחר התקדמות הגידול. (A) רפידות שומן החלב הוסרו ביסודיות. (ב) הצגת אתר ההזרקה עם נראות ברורה של אזורי הזרקת המטרה. (C) מיקום המזרק על כרית השומן, בדרך כלל 0.5-1 מ"מ זנב לכרית השומן כתלות באורך המחט. החץ הלבן מציין את אזור המטרה של המחט בעת ההחדרה. (D) תיאור של הזרקת תאים מנותקים לתוך כרית השומן של פטמת החלב המפשעתית הרביעית השמאלית. יש להחזיק את המחט בזווית של כ-45 מעלות כפי שמוצג להזרקה. (E) תמונת MRI מייצגת של גידולים שהושתלו דו-צדדית באתר ההזרקה. הגידולים מודגשים בירוק. (F) התקדמות מייצגת של משקל הגוף בגרמים לאחר הזרקת תאי גידול (n = 5). הקו הכחול הכהה מייצג רגרסיה ליניארית פשוטה, שאינה אפס באופן משמעותי (p < 0.0001); עכברים העלו בממוצע 22 מ"ג.יום-1. הצללה בכחול כהה היא רווח בר-סמך של 95%, הצללה בצבע תכלת היא מרווח חיזוי של 95%, וקווים כתומים הם מדידות משקל גוף אורכיות. (G) התקדמות מייצגת של נפחי גידול בודדים במ"מ3 לאחר הזרקת תאי גידול (n = 10). הקו הכחול הכהה מייצג רגרסיה אקספוננציאלית; זמן הכפלת נפח הגידול היה 19.08 ימים. הצללה בכחול כהה היא רווח בר-סמך של 95%, הצללה בצבע תכלת היא מרווח חיזוי של 95%, וקווים כתומים הם נפחי גידול אורכיים. (H) השתלה דו-צדדית מוצלחת של תאי PDX לתוך רפידות השומן המפשעתיות. שימו לב שניתן לראות כלי דם המספקים כל גידול. החצים הלבנים מזהים את הגידולים. (I) אזור כרית השומן המפשעתי לאחר כריתת הגידולים. (ח,י) היחידות על הסרגל הן בס"מ. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
ה-PDX המייצג (PEN_056) מקורו בנקבה קווקזית בת 31 עם קרצינומה פולשנית של שד שלב 3A. הגידול הראשוני, שנאסף מהשד הימני, היה בעל סטטוס קולטן של ER ו-PR שלילי, HER2 חיובי (ER-PR-HER2+). צביעת IHC עבור קולטני ER, PR ו-HER2 הראתה התאמה בין המטופל לגידולי PDX (איור 3). עם זאת, ה-PDX מראה ביטוי גדול יותר של HER2, שעשוי לנבוע מגידול סלקטיבי של תאי HER2+. הערכה פתולוגית של חתכים מוכתמים ב-H&E אישרה קרצינומה מובחנת בצורה גרועה עם מורפולוגיה וציטולוגיה עקביות הן בדגימות המטופל והן בדגימות PDX (איור 3).

איור 3: קולטן IHC וצביעה של H&E. (עמודה שמאלית) צביעת IHC של קולטני ER, PR ו-HER2 וצביעה של H&E בגידול המטופל. כתמי ER ו-PR אינם מראים כתמים חיוביים ברורים, כצפוי. כתמי HER2 מראים חיוביות ל-HER2 (חום). (עמודה ימנית) צביעת IHC של קולטני ER, PR ו-HER2 וצביעת H&E בדגימת PDX המועברת. צביעת קולטנים דומה מאוד לזו שנראית בדגימת המטופל, אם כי HER2 מראה ביטוי גדול יותר לאחר המעבר. סרגל קנה מידה: 50 מיקרומטר; הגדלה: פי 20. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
גנוטיפ חוזר טנדם קצר (STR) אישר דמיון של >80% על פני 13 הלוקוסים האוטוזומליים שהוגדרו על ידי הנחיות הקונצנזוס של American Type Cell Culture Collection (ATCC) ASN-0002-2022 בתוספת 3 אתרים נוספים (טבלה 1). ריצוף RNA בתפזורת (RNA-seq) של דגימת הגידול של המטופל ו-PDX אישר רמות שוות ערך של יישור לגנום הייחוס האנושי העדכני ביותר (T2T CHM13v2.0), עם 82.3% ו-79.1% מהקריאות מיושרות, בהתאמה. יתר על כן, הגידול של החולה ו-PDX הראו מתאם חיובי חזק עם ערך פירסון r של 0.9559 (איור 4A). ניתוח העשרת מערך גנים המשווה PDX לעומת גידול מטופל גילה כי 10 המסלולים המועשרים באופן משמעותי מתהליכים ביולוגיים של אונטולוגיה גנטית היו בעיקר מערכי גנים אימונולוגיים, מה שמצביע על כך שרוב שונות השעתוק בין PDX לגידול החולה נובעת מהיעדר תאים חיסוניים בדגימת PDX (איור 4B).
| D5S818 | D13S317 | D7S820 | VWA | ת'01 | AM | TPOX | CSF1PO | D3S1358 | D21S11 | D18S51 | Penta_E | Penta_D | D8S1179 | FGA |
| גידול בחולה | 12 13 | 8 8 | 8 9 | 17 17 | 9 9.3 | X X | 8 10 | | 15 16 | 29 31.2 | 16 19 | 12 13 | 14 14 | 10 14 | 21 25 |
| גידול PDX | 13 14 | 8 8 | 8 9 | 17 17 | 9 9.3 | X X | 10 10 | | 15 15 | 29 29 | 16 19 | 12 13 | 14 14 | 10 14 | 21 25 |
טבלה 1: אימות חזרה כפולה קצרה (STR).

איור 4: מתאם ריצוף RNA והעשרת מערך גנים. (A) תרשים פיזור שמדמה את הספירה המנורמלת של log2 למיליון (CPM) עבור כל הגנים מהגידול של המטופל (ציר x) ו-PDX (ציר y). נמצא מתאם חיובי חזק, עם ערך פירסון r של 0.9559. (B) תרשימי רכס עבור 10 מערכי הגנים הביולוגיים של אונטולוגיה של גנים מועשרים כאשר משווים PDX לעומת PDX. גידול המטופל. עקומות מתארות את התפלגות ניקוד ההעשרה עבור כל קבוצת גנים; צבע מייצג את ערך ה-Q של FDR עבור כל קבוצת גנים. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.