במחקר זה, אנו מתארים פרוטוקול שלב אחר שלב ומדגישים את הפרטים העיקריים לקביעת מאפיינים מורפולוגיים של מיטוכונדריה בתאים חיים, כולל הכנת דגימות, רכישת תמונה וניתוח נתונים. שיטה זו משמשת בדרך כלל לבחינת מורפולוגיה מיטוכונדריאלית לחקר מצבים שונים.
מאמר שיטה
במחקר זה, אנו מתארים פרוטוקול שלב אחר שלב ומדגישים את הפרטים העיקריים לקביעת מאפיינים מורפולוגיים של מיטוכונדריה בתאים חיים, כולל הכנת דגימות, רכישת תמונה וניתוח נתונים. שיטה זו משמשת בדרך כלל לבחינת מורפולוגיה מיטוכונדריאלית לחקר מצבים שונים.
האיזון הדינמי של היתוך וביקוע מיטוכונדריאלי תורם ישירות להומאוסטזיס המיטוכונדריאלי, המשפיע על תפקודים תאיים רבים בנוסף להומאוסטזיס אדנוזין טריפוספט (ATP). לכן, הערכת מורפולוגיה מיטוכונדריאלית בתנאי לחץ חיונית למחקר מכניסטי. מחקר זה מתאר פרוטוקול מפורט לניתוח מורפולוגיה מיטוכונדריאלית, הכולל הכנת תמיסת MitoTracker, צביעה של מיטוכונדריה, אופטימיזציה של פרמטרי הדמיה וזיהוי מאפיינים מורפולוגיים. MitoTrackers הם צבעים נפוצים וחסכוניים ספציפיים למיטוכונדריה. עם זאת, שינויים מסוימים במורפולוגיה המיטוכונדריאלית עשויים להתרחש עקב טיפול לא מתאים, שיכול להיות בלתי נתפס ולא לשקף את המצב האמיתי של המיטוכונדריה. לכן, יש להבין כיצד לנתח שינויים במורפולוגיה המיטוכונדריאלית באמצעות MitoTrackers. הפרוטוקול השתמש בתאי SH-SY5Y מגורים עם 1-מתיל-4-פנילפירידיניום יודיד (MPP+) כדי להמחיש את הפרוטוקול של ניתוח מורפולוגי מיטוכונדריאלי. בהשוואה לתאי ביקורת, תאים מגורים MPP+ הראו מיטוכונדריה קטנה ומקוטעת יותר, עם פרמטרים מורפולוגיים המצביעים על ירידה בטביעת הרגל המיטוכונדרית. תוצאות אלו מצביעות על כך שצביעת MitoTracker היא שיטה יעילה ואפשרית לניתוח מורפולוגי מיטוכונדריאלי שניתן ליישם (עם שינויים קלים) לחקר מצבים שונים.
המורפולוגיה המיטוכונדריאלית נשמרת על ידי האיזון הדינמי של היתוך וביקוע מיטוכונדריאלי ומכאן משפיעה על הומאוסטזיס אנרגיה ותפקודים תאיים רבים אחרים, מה שמוביל לפתולוגיות שונות כגון מחלות ניווניות של מערכת העצבים, סרטן ודלקת 1,2,3,4,5 . כדי להתבונן במורפולוגיה המיטוכונדריאלית, פותחו מספר כתמים סלקטיביים למיטוכונדריה, כולל בדיקות ונוגדנים, לשימוש במיקרוסקופ קונפוקלי. כמה בדיקות ספציפיות למיטוכונדריון, כמו טטרמתילרוזאמין ורודמין 123, פועלות על סמך פוטנציאל הממברנה המיטוכונדריאלית (MMP), מה שמגביל את יישומם במחקרים על מצבים המשבשים MMP 6,7. לעומת זאת, צביעת נוגדנים מספקת הערכה מורפולוגית בלתי תלויה ב-MMP לבחינת מורפולוגיה מיטוכונדריאלית בתאים קבועים. למרות שכתם מתאים מאפשר להעריך את המורפולוגיה המיטוכונדריאלית בתאים קבועים, בחינת המורפולוגיה המיטוכונדריאלית בתאים חיים שנפגעו על ידי גורמים מסוימים נותרה מאתגרת. MitoTracker, בדיקה פלואורסצנטית קטיונית חדירה לתאים וספציפית למיטוכונדריון, מציעה פתרון לאתגר זה, ומאפשרת צביעה של תאים חיים וקבועים כאחד. בדיקה זו שימשה באופן נרחב לבחינת מורפולוגיה מיטוכונדריאלית במחקרים על מחלות שונות 8,9,10,11. עם זאת, כמה מחקרים דיווחו על בעיות כמו אות רקע גבוה וכריכה לא ספציפית, גם כאשר נעשה שימוש בבדיקה בהתאם להנחיות שסופקו על ידי היצרן. תצפיות אלו מדגישות את החשיבות של הבנה מעמיקה של הכנת דגימה ורכישת תמונה לניתוח מוצלח של מורפולוגיה מיטוכונדריאלית.
כדי להקל על ניתוח המורפולוגיה המיטוכונדריאלית, פותחו תוכניות ואלגוריתמים שונים לעיבוד תמונה 12,13,14,15,16. במחקר זה, השתמשנו בכלי המאקרו ניתוח רשת מיטוכונדריאלית (MiNA) ב-ImageJ כדי לנתח מורפולוגיה מיטוכונדריאלית13. כלי זה מזהה ומאפיין ביעילות מאפיינים מורפולוגיים של רשתות מיטוכונדריאליות על ידי חישוב תשעה פרמטרים תיאוריים, כולל מספר הפרטים (מבנים ללא ענפים), מספר הרשתות (מספר העצמים עם פיקסל צומת אחד לפחות), אורך ממוצע (אורך ממוצע של כל המוטות והענפים), אורך חציוני (אורך חציוני של כל המוטות והענפים), סטיית תקן אורך (סטיית תקן של אורכים בודדים), גודל רשת ממוצע (המספר הממוצע של סניפים לרשת), גודל רשת חציוני (הערך האמצעי של מספר הסניפים לרשת), סטיית תקן של גודל הרשת (סטיית תקן של מספר הסניפים לרשת) וטביעת הרגל המיטוכונדריאלית (שטח האות הכולל לאחר הפרדת רקע). בפרוטוקול זה, טביעת הרגל המיטוכונדריאלית נבחרה כפרמטר מייצג.
מטרת מחקר זה היא לספק פרוטוקול שלב אחר שלב לניתוח מורפולוגי מיטוכונדריאלי, תוך התמקדות בפרטים מרכזיים. השתמשנו בתאי SH-SY5Y המושרים על ידי MPP+ כדי להדגים פרוטוקול זה. MPP+ מעכב קומפלקס I של שרשרת הנשימה המיטוכונדריאלית בתאי עצב דופמינרגיים, וכתוצאה מכך נזק למורפולוגיה ולתפקוד המיטוכונדריאלי 8,17. פרוטוקול הניתוח המורפולוגי המתואר במחקר זה מאפשר רכישת תמונות ברזולוציה גבוהה והערכת פרמטרים רלוונטיים להגדרת מאפיינים מורפולוגיים של רשתות מיטוכונדריאליות.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. הכנה
גירוי 2. MPP+
3. מכתים של MitoTracker
4. פרמטרי הדמיה למיקרוסקופ קונפוקלי
5. אופטימיזציה של פרמטרי ההדמיה
זהירות: הימנע מחשיפת העיניים לקרינה ישירה ומפוזרת מלייזר גלוי ו/או בלתי נראה.
6. ניתוח נתונים
הערה: הנתונים נותחו באמצעות ImageJ המותקן מראש עם תוסף MiNA13. כדי להשיג מדידות רלוונטיות מדויקות, התמונות צריכות ללכוד מיטוכונדריה שנפתרה באופן עצמאי עם צביעה נקייה ובהירה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול זה מתאר נוהל מפורט, שלב אחר שלב לניתוח מורפולוגי מיטוכונדריאלי באמצעות שלושה מודולי אופטימיזציה תלויים זה בזה: סטנדרטיזציה של פרוטוקולי הכנת דגימות, אופטימיזציה שיטתית של פרמטרים אופטיים להדמיית מיקרוסקופיה קונפוקלית והנחיות עיבוד תמונה חישובית. פרוטוקול הכנת דגימה אופטימלי הוא קריטי להשגת נתוני הדמיה מיטוכונדריאלית אמינים. הערכה שיטתית של ריכוזי MitoTracker Red CMXRos הדגימה מאפייני פלואורסצנטיות תלויי ריכוז. הטיפול ב-25 ננומטר הביא לאותות פלואורסצנטיים חלשים משמעותית בהשוואה לריכוזים גבוהים יותר (
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחקר הנוכחי מבסס מתודולוגיה שיטתית לניתוח מורפולוגיה מיטוכונדריאלית בתאים חיים בתנאי עקה. שלבים פרוצדורליים מכריעים בהדמיה מיטוכונדריאלית כוללים: ריכוז מתאים של בדיקות MitoTracker, שטיפה יסודית של כלים קונפוקליים לפני רכישת תמונה, מזעור הפרעות למצב התאי וקביעת פרמטרי הדמיה מתאימים.
שימוש בריכוזים גבוהים יותר של MitoTracker יכול לגרום לציטוטוקסיות, להפוך את המיטוכונדריה לרגישה לכוח לייזר ועלול לגרום לצבע להכתים מבנים תאיים אחרים (
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין ניגודי אינטרסים לחשוף.
עבודה זו נתמכה על ידי הקרן הלאומית למדעי הטבע של סין (81974501).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 1-מתיל-4-פנילפירידיניום יודיד (MPP+) | מקלין | M875357 | משמש להשראת עקה חמצונית |
| צלחת קונפוקלית | קן | 801001 | משמש לתרבית התאים |
| מיקרוסקופ קונפוקלי | ניקון | ג2 | משמש ללכידת תמונות |
| תערובת איגל בינונית/תזונתית F-12 של Dulbecco | תרמו-פישר סיינטיפיק | 11320033 | משמש לאספקת הזנה לתאים |
| דימתיל סולפוקסיד (DMSO) | ביוטיים | ST038 | משמש להמסת בדיקת ה-mitotracker |
| סרום בקר עוברי (FBS) | תרמו-פישר סיינטיפיק | A3161001C | משמש לאספקת הזנה לתאים |
| תמונהJ | מכוני הבריאות הלאומיים | תמונהJ | משמש לניתוח מורפולוגיה מיטוכונדריאלית |
| MitoTracker אדום CMXRos | תרמו-פישר סיינטיפיק | M7512 | משמש להמחשת מיטוכונדריה |
| מי מלח פוספט (PBS) | תרמו-פישר סיינטיפיק | C10010500BT | משמש לשטיפת התאים על כלים קונפוקליים |
| תא SH-SY5Y | ATCC | CRL-2266 | משמש להדגמת זרימת העבודה של ניתוח מורפולוגיה מיטוכונדריאלית |
| TI-SH-U Stage Adapter | ניקון | MEC59110 | משמש לאבטחת דגימות |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה