מאמר זה מתאר את השימוש במיקרוסקופיה קונפוקלית וב-ImageJ כדי להעריך דינמיקת ביקוע/היתוך מיטוכונדריאלית באמצעות פלואורסצנטיות מיתוג צילום Dendra2.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
מאמר זה מתאר את השימוש במיקרוסקופיה קונפוקלית וב-ImageJ כדי להעריך דינמיקת ביקוע/היתוך מיטוכונדריאלית באמצעות פלואורסצנטיות מיתוג צילום Dendra2.
מיטוכונדריה מוכרים בעיקר בזכות תפקידם בסינתזת ATP ומשמשים כמווסתים מרכזיים של חילוף החומרים התאי. דינמיקה מיטוכונדריאלית מבינה את התנועה התוך-תאית והבין-תאית של המיטוכונדריה, כמו גם את תהליכי הביקוע/היתוך. אירועים אלה חיוניים לשמירה על תפקוד המיטוכונדריה על ידי שמירה על הומאוסטזיס תאי, מורפולוגיה, ביו-אנרגטיקה, בקרת איכות ותגובות לחץ. מצד שני, חוסר ויסות של הדינמיקה המיטוכונדריאלית משפיע על המורפולוגיה והתפקוד של התא. מדידה מדויקת של אירועי ביקוע/היתוך מיטוכונדריה יכולה להעיד על בריאות התאים. המתודולוגיות הנוכחיות למדידת דינמיקת המיטוכונדריה משתמשות בהדמיה מתקדמת כמו מיקרוסקופיה ברזולוציה גבוהה, טכניקות פלואורסצנטיות (התאוששות פלואורסצנטית לאחר פוטו-הלבנה (FRAP)) לקישוריות, וכלים אופטוגנטיים לבקרה מרחבית-זמנית. ניתוח כמותי משתמש בכלים חישוביים למדידת פרמטרים כמו אורך, מספר והסתעפות, המצביעים על איזון ביקוע/היתוך. עם זאת, שיטות אלו דורשות מיומנויות ומכשירים מתוחכמים. במאמר זה, אנו מתארים את השימוש במיקרוסקופיה קונפוקלית בשילוב עם כלים חופשיים לשימוש ב-ImageJ (פיג'י) כדי לחקור אירועי ביקוע/היתוך באמצעות תכונת מיתוג התמונות של חלבון dendra2, המתויג לציטוכרום המיטוכונדריאלי c.
מיטוכונדריה היא אברון דינמי הממלא תפקיד חיוני בייצור אנרגיה, מוות תאים והעברת אותות1. מורפולוגיה מיטוכונדריאלית מתייחסת לגודל ולצורה של תאים מיטוכונדריאלים, המגיבים מאוד לתנאים תוך-תאיים וחוץ-תאיים והם חיוניים לשמירה על בריאות התאים2. המורפולוגיה של המיטוכונדריה יכולה לספק תובנות מפתח לגבי תפקודם, עם זאת, שינויים בצורת המיטוכונדריה יכולים להשפיע על חילוף החומרים התאי ועל הבריאות הכללית3. שיבושים במורפולוגיה המיטוכונדריאלית קשורים למספר מחלות, כולל הפרעות ניווניות, סרטן ומחלות מטבוליות4. מורפולוגיה מיטוכונדריאלית מווסתת באופן דינמי על ידי אירועי היתוך וביקוע/היתוך, החיוניים לשמירה על הומאוסטזיס תאי ולתגובה לדרישות מטבוליות שונות 5,6.
דינמיקה מיטוכונדריאלית עוזרת לאברון להגיב לגורמי לחץ שונים ולדרישות מטבוליותשונות 7. זה כרוך בביקוע/היתוך מתמשך, ותנועה של מיטוכונדריה בתוך תאים או בין תאים. המיטוכונדריה מסתגלת לדרישות האנרגיה התאית באמצעות שינויים במורפולוגיה באמצעות אירועי ביקוע/היתוך8. תהליכים אלה קובעים את צורת המיטוכונדריה ומשפיעים על תפקודי המיטוכונדריה כגון תפוקת אנרגיה, ייצור מיני חמצן תגובתיים (ROS) ובקרת איכות מיטוכונדריאלית 7,9,10. יתר על כן, ביקוע/היתוך מיטוכונדריאלי הם מנגנוני איזון נגדיים השומרים על רשת מיטוכונדריאלית פונקציונלית11. היתוך מאפשר חילופי תוכן מיטוכונדריה, מקדם השלמה וחציצה מפני נזק מקומי, בעוד ביקוע מאפשר הפרדה והסרה של מיטוכונדריה פגומה באמצעות מיטוכונדריה 7,12. יתר על כן, ביקוע מסייע להפריד רכיבים פגומים של המיטוכונדריה, אשר מוסרים לאחר מכן על ידי מיטופגיה, תהליך אוטופגיה סלקטיבי13. היתוך, לעומת זאת, מאפשר השלמה של תכולת המיטוכונדריה, ומדלל את כל הרכיבים הפגומים14. שחקני המפתח בביקוע/היתוך מיטוכונדריאלי הם מיטופוסינים (MFN1/2), החיוניים לאיחוי ממברנה מיטוכונדריאלית חיצונית15,16, (OPA1): GTPase דמוי דינמין זה אחראי לאיחוי ממברנה מיטוכונדריאלית פנימית16. חלבוני ביקוע כוללים חלבון הקשור לדינמין 1 (Drp1), חלבון פרו-ביקוע13,17. חלבון ביקוע מיטוכונדריאלי 1 (Fis1), גורם ביקוע מיטוכונדריאלי (Mff) ומווסת ביקוע מיטוכונדריאלי 1 כמו (MTFR1L). מספר טכניקות, כמו EM ברזולוציה גבוהה, שימשו לחקר אולטרה-מבנה מיטוכונדריאלי18. פלואורסצנציה של מולקולה אחת במקום הכלאה (smFISH) בשילוב עם מיקרוסקופיה ברזולוציה גבוהה של STED ו-MINFLUX (ננוסקופיה) שימשו להמחשת mRNA מיטוכונדריאלי בודד וחלבונים קשורים18. טכניקות מיקרוסקופ לוקליזציה של מולקולה בודדת (SMLM) עוקבות אחר שינויים במרווח הממברנה19. מיקרוסקופיה סופר-רזולוציה של מיקרוסקופיה שחזור אופטי סטוכסטי (STORM) מאפשרת לחקור קומפלקסים של הממברנה הפנימית המיטוכונדריאלית20. עם זאת, השימוש בציוד מתקדם זה אינו נגיש בקלות. מיקרוסקופיה קונפוקלית נגישה ודורשת פחות מומחיות. יתר על כן, הפיתוח של חלבונים פלואורסצנטיים ממוקדי מיטוכונדריה קידם משמעותית את חקר הדינמיקה המיטוכונדריאלית בתאים חיים21, מכיוון שאנו משתמשים בחלבון פלואורסצנטי ירוק הניתן לפוטו-אקטיבציה (GFP) כדי לדמיין ולכמת את ההיתוך המיטוכונדריאלי22.
כדי לחקור ביקוע ואיחוי מיטוכונדריה, התאים נלחצים או נחשפים לתרופות כמו ציספלטין, שנקשר ל-DNA וגורם לנזק ל-DNA, שמגיע לשיאו באפופטוזיס בתיווך מיטוכונדריה23. במחקר זה, השתמשנו במיטוכונדריה מתויגת Dendra2 הניתנת להחלפה בעכברי מיטוכונדריה הניתנים להפעלה באור כדי לחקור את אירועי הביקוע וההיתוך בתאי צינוריות בכליה שטופלו בציספלטין, מכיוון שהם עשירים במיטוכונדריה ובעלי יכולת התחדשות גבוהה. עם זאת, ניתן להשתמש בפרוטוקול זה בכל סוג תא שיש לו מיטוכונדריה Dendra2 מתויגת הניתנת להחלפה בתמונה (איור 1A-C).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כל העבודה בבעלי חיים בוצעה בהתאם לפרוטוקולים שאושרו על ידי הוועדה המוסדית לטיפול ושימוש בבעלי חיים של אוניברסיטת טמפל, אוניברסיטת טמפל (פרוטוקול בעלי חיים-5183). עכברי הפאם, שיש להם מיטוכונדריה המבטאת חלבון Dendra2, נרכשו.
1. הכנת מדיום תרבית תאים
2. אינדוקציה של מתח באמצעות ציספלטין
3. הדמיה
4. ניתוח תמונות
הערה: מכיוון שהמיטוכונדריה מתויגים עם חלבון Dendra2, לאחר שעוברים פוטו-הלבנה, שינוי קונפורמציה בלתי הפיך בחלבון Dendra2 מוביל לעלייה בקרינה האדומה שזוהתה באמצעות לייזר 561 ננומטר. כאשר המיטוכונדריה האדומה מתמזגת עם המיטוכונדריה הירוקה הלא מולבנת, השילוב נותן צבע צהוב. תוך ניצול תופעה זו, ניתן למדוד את אירועי הביקוע/היתוך הדינמיים.
5. לנתח אירועי היתוך
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
תאי אפיתל צינוריים ראשוניים בודדו מכליות העכבר על ידי עיכול אנזימטי ותרבית ב-DMF-12 בתוספת 5% FBS, 1% פניצילין-סטרפטומיצין ב-37 מעלות צלזיוס מתחת ל-5% CO2. עם הגעתם למפגש של 80%, התאים עברו טריפסין (0.25% טריפסין-EDTA) ונזרעו בצפיפות של 5 × 104 תאים לבאר לתוך צלחות תרבית תחתית זכוכית, מצופות מראש בקולגן.
מדיום התרבית הכיל ציספלטין בריכוז סופי של מיקרומטר ב-DMF-12 בתוספת 0.004% DMSO (v/v; תואם לנפח הממס של ציספלטין). התאים נחשפו לטיפולים ב...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
ביקוע/היתוך מיטוכונדריאלי הם תהליכים דינמיים חיוניים השומרים על הומאוסטזיס מיטוכונדריאלי וכדאיות תאית26. הערכה נכונה של תהליכים אלה דורשת טכניקות הדמיה מתקדמות כדי לדמיין ולכמת את המורפולוגיה, הדינמיקה והתפקוד המיטוכונדריאלי27,28. טכניקות שונות שימשו למדידת ביקוע/היתוך מיטוכונדריאלי. חלק מהכלים המתוחכמים כוללים ננוסקופיה של דלדול פליטה מגורה (STED), המאפשרת הדמיה של דינמיקת קריסטה מיטוכונדריאלית בתאים חיים...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים שאין להם מה לחשוף.
עבודה זו נתמכה על ידי מענקי מחקר ממענק המכון הלאומי לבריאות מספר 5R01DK135470-03, מענק ISAC-NIH 5U24DK128851-03 ומלגת פוסט-דוקטורט של איגוד הלב האמריקאי.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| Cell Culture | |||
| DMEM/F12 | בסיס בינוני | (גיבקו/חתול. מס' 11320033 ) | תרבית תאים צינורית פרוקסימלית |
| סרום בקר עוברי (FBS) | 5-10% תוספים | (ביוווסט/קט. No.S181B) | עשרה של מדיה תרבותית |
| פניצילין-סטרפטומיצין | 100X | (גיבקו/חתול. מס' 15140122) | הגנה מפני אנטיביוטיקה |
| קולגן IV | ציפוי | (סיגמא-C5533-5M) | ציפוי לוחות Ibidi |
| Trypsin-EDTA | 0.25% פתרון | (גיבקו/חתול. מס' 25200056) | ניתוק תאים |
| סליין מפוזר-פוספט (PBS) | (גיבקו/חתול. מס' 10010023 ) | שטיפת תאים | |
| <חזק>טיפולים | |||
| Cisplatin | 2 ומיקרו; M בעבודה התמחות ו-nbsp; | (סלק כימיקלים/חתול. מס' S1166) | השראה למתח |
| דימתיל סולפוקסיד (DMSO) | בקרת רכב | (פישר סיינטיפיק/קט. No.D1391) | Cisplatin solvent control |
| imaging | |||
| פנול אדום-חופשי מדיום | הדמיה חיה | (גיבקו/חתול. מס' 21041025) | הפחתת פלואורסצנציה ברקע |
| ביולוגיה מולקולרית | |||
| טריזול ורג; | חילוץ RNA | (גיבקו/חתול. מס' 15596018) | בידוד RNA מלא |
| SYBR Green Master Mix | qPCR כימיה | (תרמו סיינטיפיק/Cat. No.K0221) | ביטוי גנים בדינמיקת מיטוכונדריה (DNM1L, FIS1, MFN1, MFN2, OPA1) |
| Fluorescent Tools | |||
| Dendra2 | תג מטריצה מיטוכונדריאלית | מעבדת ג'קסון (PhAMexcised) | כתב שניתן להחליף תמונות (המרה ל-405 ננומטר, הדמיית 488/561 ננומטר) |
| <חזק>מיקרוסקופים | |||
| מיקרוסקופ קונפוקלי | לייקה DMi8 | הדמיה של תאים חיים ו-FRAP | לייזרים 405nm/488nm/561nm |
| תמונה J | https://imagej.net/software/fiji/downloads | ||
| תוסף ל-RGB Profiler | https://imagej.net/ij/plugins/rgb-profiler.html. | ניתוח אירועי היתוך (חפיפה בין אות אדום/ירוק) |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.