N 6-מתילאדנוזין (m⁶A) הוא השינוי הפנימי הנפוץ ביותר ב-RNA שליח אאוקריוטי (mRNA) ומשחק תפקיד חיוני בוויסות לאחר שעתוק, כולל יציבות, חיבור, פירוק, תרגום וייצוא 1,2,3. דיסרגולציה של שינוי m⁶a הייתה מעורבת בתהליכים פיזיולוגיים ופתולוגיים מגוונים, כולל התחלה, התקדמות וגרורה של גידול. באוסטאוסרקומה, רמות m⁶a גבוהות נצפו הן בקווי תאים והן ברקמות, מה שמרמז על תפקיד למתילציה חריגה של RNA בביולוגיה של מחלה 6,7. לכן, הערכה שיטתית של שפע m⁶a העולמי, יחד עם השינויים בתמלילים ובמסלולים הרגולטוריים הקשורים לאוסטאוסרקומה, חיונית להבהרת המנגנונים הביולוגיים וההשלכות הקליניות של מתילציה של RNA באוסטאוסרקומה.
קיימות מספר שיטות אנליטיות ללימוד שינויים ב-m⁶A 8,9. כרומטוגרפיה נוזלית-ספקטרומטריית מסה/ספקטרומטריית מסה (LC-MS/MS)10 ובדיקות11 מבוססות ELISA, שניות משמשות למדידת רמות m⁶A גלובליות. הראשון מציע רגישות גבוהה אך דורש ציוד מיוחד ומומחיות, בעוד שהשני מספק רמות m6Aיחסית ותורם לעלות גבוהה יותר מבדיקת dot blot. MeRIP-qPCR מאפשר הערכה ממוקדת של תמלולים מסוימים, אך הוא מושפע מאוד מיעילות אימונופרציפיטציה12. MeRIP-seq13, m⁶A-seq 14, ו-m⁶A-SAC-seq15 הם גישות מבוססות ריצוף, שיכולות למפות בדיוק אתרי m⁶A מתילציה; עם זאת, הם יקרים ודורשים ניתוח ביו-אינפורמטי נרחב.
מבחן m⁶A dot blot מציע שיטה פשוטה, מהירה וחסכונית לקביעת רמות שינוי גלובליות של m⁶A ב-RNA. כאימונואסיה חצי-כמותית, היתרון העיקרי שלה הוא יצירת תמונה כוללת של שפע m⁶A ללא צורך בציוד מיוחד או ניתוח ביואינפורמטי מורכב. דבר זה הופך את בדיקת ה-m⁶a dot blot לכלי חשוב לסינון שגרתי, אימות תפקודי ראשוני ומחקר קליני, וכן להשלים מעשי לגישות מתקדמות בריצוף וספקטרומטריית מסה. הפרוטוקול הנוכחי מציע תהליך עבודה מפורט שלב-אחר-שלב, המבטיח זיהוי שניתן לשחזור ויישום רחב.