סטרפטוקוקוס פיוגנס (Streptococcus קבוצה A, GAS) הוא פתוגן אנושי משמעותי הגורם לזיהומים ברקמות רכות נמקיות (NSTIs)1, מה שמוביל להרס מהיר של העור והרקמות הבסיסיות 2,3,4. חקר הפתוגנזה של זיהומים אלו דורש מודלים של בעלי חיים שמסכמים פגיעה ברקמה מקומית תוך מתן הערכה עצמאית של שכפול חיידקים ופתולוגיה מתווכת מארח5. מודלים רבים של זיהום מסורתיים, כגון חיסון מערכתי או מערכות תרביות תאים במבחנה, מוגבלים ביכולתם להפריד בין עומס חיידקי לנזק לרקמה, מה שמקשה להעריך את התרומה הספציפית של גורמי אלימות או תגובות מארח.6.
המטרה הכוללת של שיטה זו היא לספק מודל תת-עורי סטנדרטי וניתן לשחזור של זיהום עור נמק של S. pyogenes. ההיגיון בטכניקה זו הוא להקים מערכת in-vivo ניתנת לטיפול שמפרידה בין שכפול פתוגן לפגיעה ברקמה המתווכת על ידי המארח. מודל זה גמיש מאוד לזני עכברים נפוצים במעבדה. בעוד שהזן SKH1 (ללא שיער) משמש לעיתים קרובות להקל על ניטור נגעים 7,8, הפרוטוקול פועל ביעילות על זנים בעלי שיער (למשל C57BL/6J) לאחר הסרת הפילציה. דוחות שפורסמו בדרך כלל משתמשים במין או במין יחיד (לעיתים נקבות) ולעיתים קרובות מוצאים אזור פגיעה/עומס חיידקי דומה בתנאים הניסיוניים הספציפיים; עם זאת, רקע גנטי של מארח ומין מין יכולים להשפיע על חומרת מחלת GAS במצבים מסוימים ויש לקחת זאת בחשבון בעת תכנון ניסויים וניתוח תוצאות9. יתרון מרכזי של מודל זה על פני חלופות הוא היכולת שלו לנטר לאורך זמן נגע מקומי, המאפשר כימות מדויק ועצמאי של אזור הכיב ועומס החיידקים מאותו בעל חיים לאורך זמן. עם חיסון וזן שנבחרו כראוי, זיהומים תת-עוריים לעיתים קרובות ממוקדים ומאפשרים חקר התקדמות ופתרון הנגעים. עם זאת, האם הזיהום נשאר מקומי תלוי בזן, באינוקולום ובמארח: איזודות קליניות מסוימות (או זנים שמקבלים מוטציות של CovRS) ואינוקולה גדולה מספיק יכולים להפיץ ולגרום לבקטרמיה או מחלות קטלניות בעכברים חיסוני10. המחברים צריכים לדווח על הזן, החיסון, המסלול וכל שינוי במארח, ולשנות את האינוקולה בעת התאמת המודל לבידוד חדש. גישה זו ניתנת לשחזור גבוה, נגישה ותואמת לניתוחים מגוונים במורד הזרם, כולל היסטולוגיה ופרופיל חיסוני.
הפרוטוקול יושם על מספר זנים של GAS (כולל מבודדים מסוג M1 כגון HSC511 ו-M1T110,12 אחרים) ועל מבודדי NSTI קליניים. מכיוון שפנוטיפים של אלימות שונים בין סוגי eMM ובין מבודדיםבודדים 13, על החוקרים לייעל אמפירית את החיסון ולעקוב אחר התפשטות מערכתית בעת תרגום הפרוטוקול לזנים חדשים.
פרוטוקול זה מתאים לחוקרים בתחום פתוגנזה מיקרוביאלית, אימונולוגיה ומחקר תרגומי המעוניינים לחקור אלימות חיידקית, תגובות חיסוניות של מארח, או אסטרטגיות טיפוליות חדשות המתמקדות בשימור רקמות במהלך זיהום פולשני. העיצוב הסטנדרטי והכמותי שלו מאפשר הערכה קפדנית של ההתערבויות ומספק פלטפורמה גמישה לחקר האינטראקציה בין שכפול פתוגן לבין פגיעה ברקמה המתווכת על ידי המארח.