מיקרוסקופיה תוך-חיונית ברזולוציה גבוהה שינתה את חקר ההתנהגות התאית הדינמית ברקמות שלמות בכך שאפשרה הדמיה ישירה של נדידת תאים, אינטראקציות וסקולריות ומעקב חיסוני ברזולוציה תאית בודדת 1,2,3,4. בעוד שגישות אלו בשימוש נרחב במחקר סרטן 3,5, יישומן לזיהומים ריאתיים מוגבל בשל תנועת הנשימה, שבריריות הרקמות ומגבלות בטיחות ביולוגית. התקדמות אחרונה בפלטפורמות הדמיה של בית החזה, כולל חלונות אופטיים מיוצבים בוואקום ומושתלים לצמיתות, התמודדה עם רבים מהאתגרים הטכניים הללו על ידי מתן הדמיה יציבה וללא תנועה של מיקרו-סביבת הריאות לאורך תקופות ממושכות 6,7,8,9,10. חלונות קבועים להשתלה, במיוחד, הם כלים רבי עוצמה, שכן הם מאפשרים הדמיה חוזרת של זרימת כלי דם, דינמיקת תאי החיסון והתנהגות תא יחיד במשך שעות עד שבועות, והיו חיוניים בהגדרת מנגנוני הגרורות של סרטן, חדירות כלי דם ומעקב חיסוני11,12.
למרות ההתקדמויות הללו, הדמיה תוך-חיונית לא יושמה קודם לכן על זיהום Mycobacterium tuberculosis (Mtb) בריאות יונקת בתוך החיים, ברזולוציה של תא יחיד. התקדימים הקרובים ביותר מגיעים מהדמיה תוך-חיונית של זיהומים מיקובקטריאליים בסביבות אחרות. הדמיה בזמן אמת של זיהום Mycobacterium marinum בעוברי דגי זברה13 חשפה אינטראקציות מוקרופאגים מוקדמות והתחלת גרנולומה, בעוד שהדמיה בשני פוטונים של גרנולומות מונעות על ידי BCG בכבד העכבר14,15 חשפה דינמיקה בין מקרופאגים ותאי T במהלך התפתחות הגרנולומה והפגינה הצגה מוגבלת של אנטיגן ותפקוד אפקטור של תאי T בתוך נגעים גרנולומטוזיים. מחקרים אלו הקימו תובנות יסוד לגבי אינטראקציות בין המארח לפתוגני מיקובקטריאלי, אך לא הגיעו לריאה היונקית שלמה 8,16.
שיטות הדמיה תוך-חיוניות יושמו גם על הריאה בהקשרים זיהומיים וביולוגיים נוספים, כולל הדמיה ריאתית כללית8, מחקרים המגלים כי מקרופאגים אלוואולריים מסיירים יכולים להסתיר חיידקים ממערכת החיסון17 ומאפיינים את התגובה המיאלואידית המיידית לזיהום SARS-CoV-2 בריאות האדם16. הדמיה תוך-חיונית יושמה באופן דומה לריאות נגועות בשפעת, ומאפשרת הדמיה ישירה של התנהגות תאי חיסון דינמית בתוך רקמת הריאה הנגועה18,19.
גישות דימות אופטי לכל הגוף באמצעות גירוי מיקרואנדוסקופיסיב אופטי 20 וטכנולוגיית פלואורסצנציה אנזימטית מדווחת21,22 אפשרו זיהוי רגיש של Mtb בריאות עכברים, אך אינן יכולות לזהות אשכולות בודדים או קטנים של חיידקים, לעקוב אחר דינמיקת הצטברות חיידקים, או להמחיש אינטראקציות ישירות בין מיקובקטריה לתאי מארח בתוך רקמת הריאה שלמה. שיטות הדמיה תוך-חיוניות בהגבלה גבוהה יושמו לריאות נגועות בסביבות BSL-3, כולל פלטפורמות הדמיה רב-פוטונית ממוקדות ב-SARS-CoV-2 ב-SARS-CoV-2 ופלטפורמות רב-פוטון ממוקדות Mtb24. מחקרים אלו מראים את היתכנות התמונה של ריאות נגועות תחת כליאה, אך מערכות כאלה נותרות תובעניות מבחינה טכנית ואינן נגישות באופן נרחב. עבודה עם Mtb אלימות דורשת בידוד BSL-3, מה שמציב אתגרים הנדסיים וביובטיחותיים משמעותיים בהדמיה תוך-חיונית 23,24. כתוצאה מכך, רוב המחקרים על זיהום מוקדם ב-Mtb מסתמכים על בדיקות קצה סטטיות שאינן יכולות ללכוד את הדינמיקה המרחבית והזמנית של התנהגות חיידקים בריאות.
פיתוח זני Mtb משולשים-אוקסוטרופיים המוגדרים גנטית ומאושרים על ידי BSL-2 מספק הזדמנות ייחודית להתגבר על מגבלות אלו. זן mc27902, נגזרת אוקסטורופית Mtb של פנטותנט-לאוצין-ארגינין מ-H37Rv, מוחלש לחלוטין, אינו משתכפל בעכברים עם מערכת חיסון מוחלשת, שומר על צביעה קלאסית מהירה לחומצה, מציג רגישות לפאג' רגילה, וניתן לטפל בו בבטחה מחוץ למתקני BSL-325. תכונות אלו הופכות את mc27902 לתחליף אידיאלי ליצירת גישות דימות תוך-חיוניות ולבדיקת אינטראקציות מוקדמות בין מארח לפתוגן תחת בידוד ביו-בטיחותי מופחתת.
כאן, אנו מיישמים את חלון הדמיה ברזולוציה גבוהה של הריאה (WHRIL) עם mc28471, נגזרת מבטאת טומטומטר פלואורסצנטי של זן ה-Mtb המשולש mc27902, כדי להמחיש זיהום מוקדם של Mtb בריאה שלמה של עכברים. ניסויים בוצעו בעכברי Rag2-/- 26 עם מערכת חיסון מוחלשת עם עכברי MacBlue27, שבהם פרומוטר Csf1r מניע ביטוי של חלבון פלואורסצנטי ציאן משופר (ECFP) במונוציטים, מיקרוגליה, ותת-קבוצות של תאי דנדריט ומאקרופאגים. הגן הטרנסג'ני MacBlue מאפשר הדמיה ברורה של אוכלוסיות הפגוציטים המונוגרואליים במהלך זיהום מוקדם ב-Mtb. בחרנו להשתמש בעכברים חסרי Rag2 כדי למקד את המערכת באינטראקציות המולדות המולדות בין המארח לפתוגן ולהימנע מהמורכבות הנוספת של תגובות חיסוניות אדפטיביות במהלך חלון ההדמיה הקצר שנבדק כאן. חשוב לציין, שטכניקה זו אינה מוגבלת לעכברים חסרי Rag2 וניתן לבצע אותה גם בבעלי חיים חיסוניים לא מקצועיים.
על ידי שילוב חלון ריאה קבוע עם זן Mtb מוחלש פלואורסצנטי תואם BSL-2, פלטפורמה זו מאפשרת הדמיה תוך-חיונית סדרתית של אינטראקציות בין חיידקים לתאי מארח באותה מיקרוסביבה ריאתית ברזולוציה של תא יחיד במשך מספר ימים. למרות שהודגם כאן לזיהום מוקדם, הפלטפורמה עצמה אינה מוגבלת בהכרח לנקודות זמן מוקדמות ויכולה, עקרונית, להיות מיושמת בשלבים מאוחרים יותר בהתאם למודל הניסויי ולעיצוב המחקר. מכיוון שהיישום המוצלח של פלטפורמת הדמיה זו תלוי בשימוש בתכשיר החיידים הפלואורסצנטי הספציפי המתואר כאן, כללנו את השלבים החיוניים הנדרשים לייצור והכנת המגיב כחלק מהפרוטוקול המלא. פלטפורמה זו מספקת הדמיה ישירה בזמן אמת של התנהגות Mtb ב-vivo ומבססת בסיס למחקרים מכניים עתידיים של פיזיולוגיה חיידקית, זיהוי מארח ופינוי מתווך חיסוני.