ניתוח ביבליומטרי זה השתמש ב-CiteSpace, VOSviewer ו-Scimago Graphica כדי להעריך מגמות פרסום, רשתות שיתופי פעולה ומוקדי מחקר מתפתחים במחקר תכנות מטבולי של T-לימפוציטים בין השנים 2016 ל-2025.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר מחקר
ניתוח ביבליומטרי של תכנות מחדש מטבולי בלימפוציטים T חושף מגמות מחקר ומוקדי חום מתפתחים, 2016-2025
* These authors contributed equally
במאמר זה
סיכום
תקציר
לימפוציטים T הם רגולטורים מרכזיים של תגובות חיסוניות, ומחקרים עדכניים הראו שתהליכים מטבוליים משפיעים על הפעלה, התמיינות ותפקוד האפקטורים של T-לימפוציטים בסרטן ובמחלות אוטואימוניות. מחקר זה ביצע ניתוח ביבליומטרי של פרסומים מה-1 בינואר 2016 ועד ה-31 בדצמבר 2025, שנלקח מאוסף הליבה של Web of Science. CiteSpace שימש לניתוח הופעות משותפת, ציטוט משותף ואשכול של הפניות ומילות מפתח. VOSviewer שימש לניתוח כתבי עת, מחברים, מקורות, מדינות ומוסדות, בעוד ש-Scimago Graphica הציגה רשתות שיתוף פעולה לאומיות ו-Excel שימשה להערכת מגמות פרסום שנתיות. בסך הכול נכללו 1,882 פרסומים. תפוקת הפרסום השנתית עלתה בהתמדה, עם צמיחה ניכרת שנצפתה בשנים 2021 ו-2025. סין תרמה את כמות הפרסומים הגבוהה ביותר, בעוד שארצות הברית הראתה השפעה גדולה יותר על ציטוטים. Frontiers in Immunology היה כתב העת הפורה ביותר, בעוד Nature הראה את ההשפעה הגבוהה ביותר על הציטוטים. קיבוץ מילות מפתח וניתוחי ציטוטים זיהו מוקדי מחקר מתפתחים המתמקדים בתכנות מטבולי של לימפוציטים T, במטבוליזם של גלוקוז וחומצות אמינו, ובעניין מתהווה באינטראקציות מטבוליות בין מערכת החיסון. בסך הכול, ניתוח ביבליומטרי זה מראה התרחבות מתמשכת במחקר באימונומטבוליזם של לימפוציטים T, ומדגיש כיוונים נושאיים מתפתחים, כולל ויסות מטבולי בין-תאי ומטבוליזם של שומן.
מבוא
לימפוציטים נאיביים של T מסתמכים בעיקר על פוספורילציה חמצונית מיטוכונדריאלית (OXPHOS) כדי לשמור על מצב מטבולי שקט ואנרגטי נמוך1. עם גירוי אנטיגן, לעומת זאת, לימפוציטים T מופעלים עוברים שינוי מטבולי לעבר גליקוליזה אירובית כדי לתמוך בהתרבות מהירה ובפונקציונל אפקטור2. לימפוציטים של אפקטור T, במיוחד תת-קבוצות ציטוטוקסיות, תלויים בגליקוליזה כדי לעמוד בדרישות הביואנרגטיות והביוסינתטיות המוגברות הקשורות לייצור ציטוקינים ולהרחבת תאים3. למרות שגליקוליזה מייצרת פחות אדנוזין טריפוספט (ATP) לכל מולקולת גלוקוז מאשר OXPHOS, קצב חילוף החומרים המהיר שלה תומך בדרישות התפקודיות של תאי מערכת החיסון המופעלים4. פעילות גליקוליטית מופרזת עלולה גם היא לתרום להשפעות מזיקות בתוך המיקרו-סביבה החיסנית. הצטברות לקטט עלולה לפגוע בסינתזת סרין שמקורה בגלוקוז ולשנות את איזון החמצון התוך-תאי, ובכך לדכא את התרבותותפקוד הלימפוציטים של T. בנוסף, רמות לקטט גבוהות משבשות את מסלולי הנדידה התלויים בגליקוליזה ומפחיתות את התנועתיות של לימפוציטים 6,7 של CD4⁺ ו-CD8⁺ T.
חילוף החומרים התאים מסתגל דינמית לגירויים סביבתיים ופיזיולוגיים בתהליך הידוע כתכנות מחדש מטבולי 8,9. עדויות הולכות וגדלות מצביעות על כך שלתכנות מחדש מטבולי יש תפקיד מרכזי בוויסות הפעלה, התמיינות ופלסטיות תפקודית של לימפוציטים T. שינויים מטבוליים אלו רלוונטיים במיוחד בסרטן ובמחלות אוטואימוניות, שבהן שינויים במיקרו-סביבה החיסונית משפיעים על תפקוד ולוויסות החיסון של לימפוציטים T12,13. למרות שמספר מחקרים ביבליומטריים העריכו את האימונומטבוליזם בהקשרים רחבים יותר, כולל סרטן אימונומטבוליזם ומטבוליזם חיסוני הקשור למחלות, ניתוחים אלו מתמקדים בעיקר באינטראקציות כלליות בין מערכת החיסון למטבוליזם ולא בתכנות מחדש מטבולי ספציפי ל-T-לימפוציטים14,15. הערכה ביבליומטרית מקיפה המוקדשת במיוחד לאימונומטבוליזם של T-לימפוציטים נותרה מוגבלת, במיוחד בכל הנוגע למגמות מחקר, רשתות שיתוף פעולה ומוקדי נושא מתפתחים בתחום זה.
כדי להתמודד עם פער זה, מחקר זה ביצע ניתוח ביבליומטרי של פרסומים שמופיעים באוסף הליבה של Web of Science (WOScc) מה-1 בינואר 2016 ועד ה-31 בדצמבר 2025. CiteSpace, VOSviewer ו-Scimago Graphica שימשו לניתוח כמותי של תפוקת פרסום, דפוסי שיתוף פעולה, יחסי ציטוט משותף והתפתחות נושאית במחקר תכנות מחדש מטבולי של T-לימפוציטים. בניגוד לסקירות נרטיביות מסורתיות, ניתוח ביבליומטרי מספק סקירה מובנית ומונחית נתונים של הנוף המדעי באמצעות ציטוטים, אשכולות וניתוחי מילות מפתח. מטרת המחקר הייתה לאפיין באופן שיטתי מגמות מחקר עולמיות ומוקדי חום מתפתחים באימונומטבוליזם של לימפוציטים T, ולספק סקירה מאורגנת של נוף הידע הנוכחי בתחום המתפתח במהירות.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול
מחקר זה ניתח באופן בלעדי נתונים ביבליוגרפיים שנאספו ממאגרי מידע נגישים לציבור ולא כלל משתתפים אנושיים, בעלי חיים או נתונים אישיים מזוהים; לכן, לא נדרשו אישור אתי מוסדי והסכמה מדעת.
איסוף נתונים ואסטרטגיית חיפוש
הנתונים נאספו מ-WoSCC (https://www.webofscience.com/wos/woscc/) ב-27 בינואר 2026. מהדורות המאגר שנבחרו היו מדד הציטוטים המדעי המורחב (SCI-EXPANDED) ומדד הציטוטים של מדעי החברה בתוך WoSCC. החיפוש בוצע באמצעות ממשק החיפוש המתקדם. אסטרטגיית החיפוש יושמה בשדה "נושא (TS)", ושאילתת החיפוש המלאה והרשומות שהתקבלו מוצגות בטבלה 1. תקופת החיפוש הוגבלה לפרסומים שמאונדקסים בין 1 בינואר 2016 ל-31 בדצמבר 2025 באמצעות מסנן "Timespan" של WoSCC. רק מאמרי מחקר מקוריים ומאמרי סקירה נכללו במסנן "סוגי מסמכים". השפה הייתה מוגבלת לאנגלית, ולא הוטלו הגבלות בנוגע למדינה, מוסד או תחום מחקר. כל הרשומות יוצאו בפורמט טקסט פשוט עם "רשומה מלאה ומקורות מצוטטים" שנבחרו במהלך הייצוא. כאשר מספר הרשומות שנאספו עלה על 500, הרשומות הורדו במספר אצוות ואז אוחדו למערך נתונים אחד לפני הניתוח. לאחר השחזור, כל הרשומות יובאו ל-CiteSpace לעיבוד מוקדם וניתוח ביבליומטרי. רשומות כפולות זוהו והוסרו באמצעות פונקציית הסרת השכפול המובנית ב-CiteSpace בהתבסס על מטא-נתונים ביבליוגרפיים, כולל כותרת, מחברים, שנת פרסום וכתב עת מקור. כאשר זוהו אי-עקביות פוטנציאליות או רשומות ביבליוגרפיות לא שלמות, בוצע גם אימות ידני כדי להבטיח דיוק ועקביות נתונים לפני הניתוח.
| סט | תוצאות | שאילת חיפוש |
| #1 | 252,461 | TS=("תא T*" או "תא T*" או "לימפוציט T*" או "לימפוציט T*" או "לימפה T*" או "תא T*" או "תא T CD4+*" או "תא T ציטוטוקס*" או "תא T רגולטורי*" או "Treg*" או "תא עזר T*" או "תא Th*" או "תא T נאיבי*" או "תא T נאיבי*" או "תא T זיכרון*" או "תא T אפקטיבי*") |
| #2 | 13,799 | TS=("תכנות מחדש מטבולי*" או "עיצוב מחדש מטבולי*" או "חיווט מחדש מטבולי") |
| #3 | 1,882 | #1 ו-#2 |
טבלה 1: אסטרטגיית החיפוש של Web of Science Core Collection המשמשת לשליפת נתונים ביבליומטריים. הטבלה מסכמת את אסטרטגיית החיפוש המפורטת, שילובי מילות מפתח, אופרטורים בוליאניים וספירות שליפה סופיות ששימשו לאיסוף ספרות מה-WoSCC. החיפושים בוצעו באמצעות שדה "נושא (TS)" בממשק החיפוש המתקדם. קלפים פראיים (*) שימשו לשחזור סיומות מילים מרובות ומונחים קשורים. מאגר הנתונים הסופי כלל פרסומים שאנדקסו בין 1 בינואר 2016 ל-31 בדצמבר 2025 לאחר יישום מסנני שפה וסוגי מסמך.
גישות אנליטיות
גישה ביבליומטרית רב-כלי יושמה באופן שיטתי לניתוח נתונים. הניתוח בוצע בסביבת מערכת הפעלה Windows 10. CiteSpace (v.5.7.R2) שימש לניתוח הפניות ומילות מפתח על ידי עיבוד נתוני פורמט TXT שיוצאו מ-WoSCC. פרמטרי CiteSpace הוגדרו כך: (1) חיתוך הזמן נקבע מ-2016 עד 2025 עם שנה אחת לכל פרוסה; (2) קריטריוני הבחירה הוגדרו באמצעות מדד g (k = 25); (3) שיטות גיזום כללו את Pathfinder, Cutting Sliced Networks, ו-Cutting the Merged Network כדי לפשט את מבני הרשת תוך שמירה על קשרים מרכזיים; ו-(4) בוצע ניתוח אשכולות באמצעות אלגוריתם יחס לוגריתם-סבירות16. ניתוח זה יצר רשתות ציטוט משותף, מפות אשכולות, ויזואליזציות של ציר זמן ומפות לזיהוי פיצוצים הן עבור הפניות והן עבור מילות מפתח. במפות הוויזואליזציה, גודל הצומת ייצג תדירות, עובי הקישור סימן את חוזק ההופעה המשותפת, וטבעות סגולות ייצגו מרכזיות ביניים גבוהה. צמתים בבורסט שיקפו עלייה פתאומית בתדירות הציטוט או במילות מפתח לאורך זמן.
בהמשך, הקבצים שיוצאו נשמרו מחדש בקידוד UTF-8 באמצעות Windows Notepad ויובאו ל-VOSviewer (גרסה 1.6.20) למיפוי ביבליומטרי, כולל שותפות לכתיבה, ציטוט משותף וניתוחי הופעה משותפת בין מחברים, כתבי עת, מוסדות ומדינות17. שיטת הספירה המלאה יושמה והנרמול בוצע באמצעות שיטת חוזק האסוציאציה. נקבעו ספי הופעה מינימליים בהתאם לגודל מאגר הנתונים (המחברים ≥ 5 פרסומים; מילות מפתח ≥ 5 הופעות; מוסדות ≥ 3 פרסומים). ויזואליזציה ברשת התבססה על משקל הפריט ועוצמת הקישור הכוללת. לניתוח שיתוף פעולה ברמת המדינה, קבצי GML שיוצאו מ-VOSviewer יובאו ל-Scimago Graphica (גרסה 1.0.53), שם הצמתים ייצגו מדינות. ויזואליזציה ואשכול ברשת נוצרו באמצעות אלגוריתם הפריסה המונחה כוח, המוגדר כברירת מחדל, כדי לייצג יחסים מרחביים ודפוסי שיתוף פעולה בין מדינות. WPS Excel שימש לניתוח סטטיסטי תיאורי של מגמות הפרסום השנתיות ולסיכום נתונים בסיסיים. התוצאות הוצגו באמצעות תרשימי עמודות, תרשימי עמודות וגרפים קוויים.
בוצע ניתוח משלים עם חתך זמן באמצעות אותה אסטרטגיית חיפוש שתוארה לעיל, כאשר החיפוש הוגבל לפרסומים שמאונדקסים בין 1 בינואר 2025 ל-31 בדצמבר 2025. בתוך אותה מסגרת שאילתות וסביבה אנליטית של WoSCC, פורסמו פרסומים עדכניים ותוצרים הקשורים לכנס לצורך הקשר ותיאור. הליך זה בוצע כולו בממשק האנליטי המובנה של ה-WoSCC. לא נוצר מאגר נתונים עצמאי, והמידע שהוחזר לא שולב במאגר הביבליומטרי הראשי ולא שימש לניתוח כמותי. עיצוב המחקר הכולל ותהליך הניתוח הביבליומטרי מסוכמים בתרשים זרימה (איור 1).
איור 1. תהליך העבודה של ניתוח ביבליומטרי של מחקר תכנות מחדש מטבולי של T-לימפוציטים. סקירה סכמטית של עיצוב המחקר וזרימת העבודה האנליטית בניתוח הביבליומטרי הזה. פרסומים נאספו מאוסף הליבה של Web of Science (WoSCC) באמצעות אסטרטגיות חיפוש מוגדרות מראש וקריטריוני הכללה. רשומות שנשלפו יוצאו בפורמט טקסט פשוט ועברו עיבוד מוקדם, כולל הסרת כפילויות וסטנדרטיזציה של נתונים ביבליוגרפיים. ניתוחים ביבליומטריים בוצעו באמצעות CiteSpace לניתוחי ציטוט משותף, הופעה משותפת של מילות מפתח, אשכולות וניתוחי זיהוי פרצים, וכן VOSviewer לניתוחי רשת שיתופי פעולה בין מחברים, מוסדות, מדינות וכתבי עת. Scimago Graphica שימשה להמחשת רשתות שיתוף פעולה בינלאומיות, ו-WPS Excel שימשה לניתוח מגמות פרסום שנתיות וסטטיסטיקות תיאוריות. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
תוצאות
תוצרת פרסומים ומגמות זמניות
כדי לאפיין את ההתפתחות הזמנית של פעילות המחקר בתחום זה, בוצע ניתוח ביבליומטרי באמצעות פרסומים שמאונדקסים ב-WoSCC. בסך הכל נאספו לראשונה 1,991 רשומות בעשור האחרון. לאחר הסרת רשומות כפולות ולא באנגלית, נכללו ונותחו בסופו של דבר 1,882 פרסומים, כולל 1,046 מאמרי מחקר מקוריים ו-836 מאמרי סקירה. מגמות הפרסום והציטוטים השנתיות בין 2016 ל-2025 מוצגות באיור 2, ומדגימות עלייה עקבית בפעילות המחקר לאורך זמן. בשנת 2020, מספר...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
דיון
הניתוח הביבליומטרי שלנו של תכנות מחדש מטבולי בתאי T חשף עלייה מתמשכת בתפוקת המחקר לאורך זמן. בשנת 2020 נרשמה עלייה ניכרת במספר הפרסומים והציטוטים, עם 40 פרסומים נוספים ו-1,989 ציטוטים נוספים לעומת 2019. העלייה הזו התרחשה במקביל למספר פרסומים מצוטטים מאוד, כולל Glutamine blockade induces Varigent Metabolic Program להתמודדות עם התחמקות חיסונית מגידול (פורסם ב-22 בנובמבר 2019), שדורג בין המקורות המצוטטים ביותר והמרכזיות הגבוהה ביותר במאגר הנתונים. מחקר זה צו...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
גילויים
ניגודי עניינים:
המחברים מצהירים שאין ניגודי עניינים הקשורים לעבודה זו.
תרומות מחברים:
איסוף נתונים ואיסוף ספרות בוצעו על ידי יי ליו. עיבוד נתונים מוקדם וניתוחים ביבליומטריים בוצעו על ידי יינפינג יאנג. הדמיה והכנת דמויות בוצעו על ידי שיניואה יאנג וג'ינצ'ואן לי. הטיוטה הראשונה של כתב היד נכתבה על ידי יי ליו וויהונג לי. כל המחברים תרמו לעריכת כתב היד ואישרו את הגרסה הסופית שהוגשה.
תודות
המחברים מודים בהכרת תודה על התמיכה הכספית מקרנות המחקר הבסיסיות לאוניברסיטאות המרכזיות (2022-JYB-JBZR-037).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
חומרים
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| CiteSpace | אוניברסיטת דרקסל | v.5.7.R2 | SCR_025121 |
| Microsoft Excel | מיקרוסופט תאגיד | v.2604 Build 16.0.19929.20136 | SCR_016137 (Microsoft Excel) |
| WPS Excel | Kingsoft Office | v.12.1.0.26375 | |
| Scimago Graphica | Scimago Lab | v.1.0.53 | לא זמין |
| VOSviewer | אוניברסיטת ליידן | v.1.6.20 | SCR_023516 |
| Web of Science Core Collection | Clarivate Analytics | נגיש ב-27 בינואר, 2026; גרסה לא חלה | לא זמין |
| מערכת הפעלה Windows | מיקרוסופט תאגיד | Windows 10 | לא זמין |
מקורות
- Pearce EL, et al. Fueling immunity: insights into metabolism and lymphocyte function. Science. 2013;342(6155):1242454.
- Wang R, et al. The transcription factor Myc controls metabolic reprogramming upon T-lymphocyte activation. Immunity. 2011;35(6):871-82.
- Shyer JA, et al. Metabolic signaling in T cells. Cell Res. 2020;30(8):649-59.
- Gubser PM, et al. Rapid effector function of memory CD8+ T cells requires an immediate-early glycolytic switch. Nat Immunol. 2013;14(10):1064-72.
- Yuan Q, et al. Enhancing intracellular NADPH bioavailability through improving pentose phosphate pathway flux and its application in biocatalysis asymmetric reduction reaction. J Biosci Bioeng. 2022;134(6):528-33.
- Quinn WJ III, et al. Lactate limits T-cell proliferation via the NAD(H) redox state. Cell Rep. 2020;33(11):108500.
- Pucino V, et al. Lactate buildup at the site of chronic inflammation promotes disease by inducing CD4+ T-cell metabolic rewiring. Cell Metab. 2019;30(6):1055-74.e8.
- O'Neill LAJ, et al. A guide to immunometabolism for immunologists. Nat Rev Immunol. 2016;16(9):553-65.
- Almeida L, et al. Metabolic pathways in T-cell activation and lineage differentiation. Semin Immunol. 2016;28(5):514-24.
- Haas R, et al. Lactate regulates metabolic and pro-inflammatory circuits in control of T-cell migration and effector functions. PLoS Biol. 2015;13(7):e1002202.
- Chang CH, Pearce EL. Emerging concepts of T-cell metabolism as a target of immunotherapy. Nat Immunol. 2016;17(4):364-68.
- Ho PC, et al. Reenergizing T-cell anti-tumor immunity by harnessing immunometabolic checkpoints and machineries. Curr Opin Immunol. 2017;46:38-44.
- Von Meyenn L, et al. Targeting T-cell metabolism in inflammatory skin disease. Front Immunol. 2019;10:2285.
- Zhu H, et al. Trends and hotspots in research related to tumor immune escape: bibliometric analysis and future perspectives. Front Immunol. 2025;16:1604216.
- Zhang B, et al. Mapping research trends in immune-cell metabolic reprogramming in breast cancer: a parallel dual-database bibliometric study. Discov Oncol. 2026;17:724.
- Chen G, et al. Rheumatoid arthritis and fibromyalgia syndrome: a bibliometric and bioinformatics perspective on comorbidity research. J Multidiscip Healthc. 2025;18:6811-27.
- Wang Y, et al. Research trends and hotspots in JAK inhibitors for ulcerative colitis: a bibliometric analysis from 2015 to 2024. J Multidiscip Healthc. 2025;18:6755-71.
- Leone RD, et al. Glutamine blockade induces divergent metabolic programs to overcome tumor immune evasion. Science. 2019;366(6468):1013-21.
- Watson MJ, et al. Metabolic support of tumour-infiltrating regulatory T cells by lactic acid. Nature. 2021;591(7851):645-51.
- Xia L, et al. The cancer metabolic reprogramming and immune response. Mol Cancer. 2021;20(1):28.
- Miao S, et al. tRNA m1A modification regulates cholesterol biosynthesis to promote antitumor immunity of CD8+ T cells. J Exp Med. 2025;222(3):e20240559.
- Angelin A, et al. Foxp3 reprograms T-cell metabolism to function in low-glucose, high-lactate environments. Cell Metab. 2017;25(6):1282-93.e7.
- Huang SC, et al. Metabolic reprogramming mediated by the mTORC2-IRF4 signaling axis is essential for macrophage alternative activation. Immunity. 2016;45(4):817-30.
- Nakaya M, et al. Inflammatory T-cell responses rely on amino acid transporter ASCT2 facilitation of glutamine uptake and mTORC1 kinase activation. Immunity. 2014;40(5):692-705.
- Ma EH, et al. Serine is an essential metabolite for effector T-cell expansion. Cell Metab. 2017;25(2):345-57.
- Pearce EL, et al. Fueling immunity: insights into metabolism and lymphocyte function. Science. 2013;342(6155):1242454.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.