פרוטוקול זה מדגים ויזואלית את השקיעה של מרכיבי דופן התא ליגנין ופקטין בחתכים רוחביים של גבעולי אלפאס (Medicago sativa L.). המטרה היא לזהות רקמות ספציפיות בגבעול שניתן יהיה להכווין אליהן פיתוח של זני אלפאס חדשים בעלי מאפייני עיכול רצויים של הגבעול.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה מדגים ויזואלית את השקיעה של מרכיבי דופן התא ליגנין ופקטין בחתכים רוחביים של גבעולי אלפאס (Medicago sativa L.). המטרה היא לזהות רקמות ספציפיות בגבעול שניתן יהיה להכווין אליהן פיתוח של זני אלפאס חדשים בעלי מאפייני עיכול רצויים של הגבעול.
הצטברות של רכיבי דופן התא ככל שהצמחים גדלים מגבילה את התזונה מהמספוא עבור רuminants. בפרט, שקיעת ליגנין ברקמות הצמח מעכבת את פירוק הפחמימות של דופן התא, תאית (cellulose) והמיצלולוז (hemicellulose), ובכך מפחיתה את כמות האנרגיה הזמינה מהמספוא. עם זאת, רכיב הפקטין של דופן התא, הניתן לעיכול גבוה, זמין בקלות לפירוק. מידע על שקיעת ליגנין ופקטין בסוגים שונים של תאי גבעול עשוי לספק תובנות מכניסטיות לגבי הגורמים העומדים בבסיס השונות בעיכול הגבעול בין זני אלפאלופה. דגירה In vitro של חתכי גבעול בנוזל קיבה מדמה את התהליכים שמרכיבי הגבעול עוברים בקיבה. בשילוב עם צביעה היסטולוגית ומיקרוסקופיה, שיטה זו מאפשרת ויזואליזציה של שינויים בפירוק הרקמה לאורך זמן ואת מיקומם של הליגנין והפקטין בגבעול. צבע Wiesner מגיב עם יחידות אלדהיד של גואיסיל (G) בליגנין וצובע אותן בוורוד פוקסיה. באופן דומה, ruthenium red מקיים אינטראקציה עם קבוצות הקרבוקסיל של הפקטין, וצובע את הפקטין בגבעול בגוונים הנעים בין ורוד לכתום וחום. פרוטוקול זה מתאר את עיכול חתכי גבעול של אלפאלופה לאחר חשיפה למיקרובים של הקיבה, ולאחריו צביעה לוויזואליזציה של תבניות ליגנין ופקטין בדפנות התאים. ניתן להשתמש בשיטה זו כדי לזהות רקמות גבעול שבהן ליגנין ופקטין נוכחים או חסרים, דבר המקל על השוואות בין זני אלפאלופה.
דופן תא עוטפת כל תא צמחי. תאית (cellulose), המיצלולוז (hemicellulose), ליגנין ופקטין הם מרכיבים של דופן התא והם תורמים לסיב הצמחי, חלק הכרחי בתזונתו של בעל מע反ר (ruminant). בעוד שפקטינים הם פוליסכרידים בני עיכול גבוה (מסיסים)1, ליגנין הוא פולימר שאינו ניתן לעיכול המגביל את פירוק הסיבים2. לכן, ליגנין מפחית את יכולת העיכול של הצמח ובסופו של דבר מקטין את האנרגיה הזמינה לבעל המע反ר מהמספוא. עם זאת, ליגנין תומך בתפקודים פיזיולוגיים חשובים של הצמח, כגון הובלת מים ברחבי הצמח באמצעות חיזוק אלמנטים של טרכאות (tracheid elements)3. עבודות קודמות הראו כי שינויים בסיבי הגבעול המפחיתים ליגנין או מגבילים פקטין עשויים לשפר את יכולת העיכול של הגבעול ואת הערך התזונתי של המספוא4. לפיכך, פרוטוקול זה מתמקד בשני מרכיבי דופן התא הללו. ריכוזים כוללים של ליגנין ופקטין בדופן תאי הגבעול אינם מספקים מידע מספיק כדי להסביר את המנגנונים העומדים בבסיס יכולת העיכול של סיבי הגבעול5. דגירה In vitro עם נוזל קיבלה (rumen fluid) וצביעה היסטולוגית יכולות לספק תובנות ברמה התאית על ידי ויזואליזציה של הבדלים במרכיבי דופן התא בין צמחים בעלי יכולת עיכול שונה של סיבי הגבעול4,6. בפרוטוקול הנוכחי, אלפאלפא (Medicago sativa L.), קטנית מספוא רב-שנתית נפוצה, משמשת כמין מודל להדגמת דפוסי ליגנין ופקטין ברקמות הגבעול, המכילות יותר ליגנין אך פחות פקטין מאשר העלים.
In vitro inkובציה עם נוזל קיבלה (rumen fluid) מדמה את עיכול העשב בקיבתו של בעל מעי רשת, ומאפשרת לבחון את השפעות האנטומיה של העשב על העיכול. על ידי יצירת תנאים במבחנה הדומים לאלו הקיימים בקיבלה, ניתן להוציא בנקודות זמן שונות חתכים רוחביים של הגבעול המודבקים למסליילי זכוכית, כדי להעריך את מידת פירוק הרקמה בעקבות החשיפה לנוזל הקיבלה6. שיטה זו מספקת גישה פשוטה, מהירה וזולה יחסית להדמיית המבנים האנטומיים של גבעולי אלפאלפה7 ולבחינת האופן שבו סוגי תאים המכילים רכיבי דופן תא שונים משתנים ככל שהגבעול מעוכל.
צביעה היסטולוגית של חתכים רוחביים של הגבעול מאפשרת ויזואליזציה של רכיבי הדופן התאית. פלורוגלוצינול וחומצה כלורית (HCl) משולבים ליצירת צביעת Wiesner, המדגישה רקמות גבעול המכילות יחידות ליגנין עשירות בגואיאציל8 על ידי תגובה עם מונומרים של G C6C3 aldehyde (coniferaldehyde)9. ליגנין מורכב ממספר תת-יחידות מונומריות; עם זאת, לאורך מאמר זה, המונח "ליגנין" מתייחס אך ורק למונומר מסוג G-unit, שכן זהו המונומר המגיב לצביעת Wiesner10 ולכן הוא זה המיוצג ויזואלית באמצעות פרוטוקול זה. רקמות מסוימות, כגון צינורות xylem, הן תמיד מולגננות6. אחרת, השקעת ליגנין ברקמות גבעול של אלפאס (lucerne) מתחילה ברגע שהצמיחה המשנית (קמביאלית) נפתחת, וזה חופף להפסקת ההתארכות של מפרקי הגבעול6. Ruthenium red נקשר לחומרים פקטיים, המכילים קבוצות קרבוקסיל שלעתים נמצאות באסטריפיקציה וחולקות כמה שרשראות צד11. קבוצות הקרבוקסיל של פקטינים הנמצאים בלאמלה האמצעית ובדפנות התא הראשוניות מגיבות עם ruthenium red11. פקטין מעורב בהתארכות תאים ולכן הוא נוכח בתאים במהלך צמיחה ראשונית. לאורך כתב היד, המונח "פקטין" מתייחס באופן כללי למערך הפקטינים שעשויים להיות נוכחים. שילוב של צביעה היסטולוגית עם דגירה של רומן in vitro מקל על תצפית במיקומם של רכיבי הדופן התאית בגבעול ומדגיש כיצד סוגי תאים שונים משתנים במהלך עיכול ברומן. בסופו של דבר, ניתן להשתמש בפרוטוקול זה כדי לזהות תאי גבעול המכילים ליגנין ופקטין ולאפיין דפוסים בין זני אלפאס וזמני דגירה שונים.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מחקר זה נערך בהתאם להנחיות המוסדיות לניסויים בבעלי חיים (IACUC 2301-40689B).
1. סימון מבחנות הדגימה
2. חיתוך גבעול בחתך רוחב והצמדתו לשקופיות
3. הכנה לדגירה in vitro של חתכי רוחב של הגבעול
4. אינקובציה In vitro של חתכים רוחביים של הגבעול
5. צביעת חתך רוחבי עבור ליגנין
6. צביעת חתך רוחב לפקטין
7. דימוי בשדה בהיר
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
השימוש במבחנות צנטריפוגה לסימולציה של תנאי הקיר (rumen) אפשר עיכול in vitro מהיר וזול יחסית של חתכים רוחביים מגבעול Medicago sativa. באמצעות מיקרוטום, הוכנו חתכים רוחביים של גבעולי M. sativa בעובי 100 μm (איור 1A). החתכים הרוחביים של הגבעול הודבקו לשקופיות זכוכית באמצעות סרט הדבקה דו-צדדי (איור 1B) והוטבלו בתמיסת אינוקולציה של נוזל קיר למשך תקופות דגירה שנעו בין 4 h ל-96 h (איור 1C). עבור הדגירה in vit...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
חומר גלם של אלפאלפה ששימש במחקר הנוכחי כלל שיבוטים מחמישה קווי אלפאלפה. שני קווים ניסיוניים נבחרו לאחר שני מחזורי ברירה מנוגדת לעיכול סיבים בנייטרל דטרגנט in vitro (IVNDFD) מצמחי אם בעלי ערכי 16 h IVNDFD נמוכים ו-96 h IVNDFD נמוכים, או ערכי 16 h IVNDFD גבוהים ו-96 h IVNDFD גבוהים12. שלושה קווים מסחריים עם רקע גנטי לא ידוע נכללו אף הם במחקר, וצמחי אם נבחרו על בסיס ניתוח ספקטרוסקופיה באינפרא-אדום קרוב כדי לזהות פרטים עם (א) כמות הליגנין הגבוהה ביותר, (ב) כמות הליגנין הנמוכה ביותר, ו-(ג...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים כי המחקר נערך ללא כל מערכות יחסים מסחריות או פיננסיות שעלולות להיחשב כניגוד עניינים פוטנציאלי. אזכור של שמות מסחריים או מוצרים מסחריים בפרסום זה נועד אך ורק למטרת מתן מידע ספציפי ואינו מרמז על המלצה או תמיכה מצד משרד החקלאות של ארה"ב (U.S. Department of Agriculture). ה-USDA הוא ספק ומעסיק המעניק שוויון הזדמנויות. כל הניסויים בוצעו בהתאם לחוקים הנוכחיים של ארצות הברית, המדינה שבה הם נערכו.
המחברים מודים ל-R. Ted Jeo על תובנותיו בנוגע לעבודות קודמות רלוונטיות. תודה למרכז הדימוג של אוניברסיטת מינסוטה - טווין סיטיז על מתן גישה לתוכנות רכישת וניתוח תמונות מיקרוסקופ לצורך הכנת התמונות לפרסום. עבודה זו נתמכה על ידי משרד החקלאות של ארצות הברית – שירות המחקר החקלאי [062-21500-001-000D] והסכם שיתוף פעולה ללא סיוע (מס' 58-5062-2-016).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| נייר אלומינום | Boardwalk | 7106BW | 18 אינץ' × 1,000 רגל; משמש להגנה של תמיסות צביעה רגישות לאור מפני אור |
| קלציום כלוריד דיהידראט, מינימום 99% | Sigma Life Science | C7902-500G | מספר CAS 10035-04-8; ריאגנט עבור McDougall’בופר s |
| תוכנת מצלמה | Nikon | NIS-Elements AR 5.42.04 | תוכנת דימות ב-64 סיביות המשמשת לרכישת תמונות ולניתוחן |
| גז פחמן דו-חמצני | Matheson | UN1013 | בדרגת שימוש כללית; משמש לשמירה על תנאים אנוקסיים במהלך ההכנה והאינקובציה |
| מקלחת מים עם סירקולטור | דיוק | — | אמבט מים מחזיר עם בקרת טמפרטורה המשמש לשמירה על דגימות ב- 39 °C |
| תקן לגבעולי תירס | אוניברסיטת מינסוטה | לא ניתן לספק תרגום כיוון שלא הוזן טקסט מקור. נא להזין את הטקסט באנגלית שברצונך לתרגם. | נקצר בסתיו 2023 בסנט פול, מינסוטה, ארה"ב; נטחן לגודל של 1 מ"מ ושימש כתשתית מיקרוביאלית |
| זכוכית כיסוי | Thermo Scientific | 3419 | 24 מ"מ × 30 מ"מ, עובי מס' 1.5, 1 אונקיה |
| מצלמת מיקרוסקופ Digital Sight 10 צבעונית עם חיישן תמונה CMOS בפורמט רחב FX | Nikon | MQA20000 | מצלמת צבע דיגיטלית המשמשת לרכישת תמונות מיקרוסקופיות בשדה בהיר (brightfield) |
| מיקרוסקופ דיסקשן (מיקרוסקופ להבדילה) | Nikon | SMZ18 | מיקרוסקופ סטריאו המשמש להכוון ומיקום של חתכי רוחב של גבעולים |
| סרט דביק דו-צדדי | סרט הדבקה דו-צדדי מויניל למשרד של SelloTape | 4270 | 2 ממ"׳ × 53 מ'; משמש לקיבוע חתכי רוחב של גבעול לשיםות זכוכית |
| מאזנ דיגיטלי | וְ | GH-202 | מאזניים אנליטיים עם רזולוציה של ארבע ספרות אחרי הנקודה |
| בקבוק ארלנמייר (125 מ"ל) | Kimax | 25600 | בקראי 125 מ"ל; תואם לפקק מס' 5 |
| בקבוק ארלנמייר (25 מ"ל) | Pyrex | 4980 | בקבוקון בנפח 25 מ"ל; תואם פקק מס' 0 |
| אתנול (200 proof) | Fisher Scientific | 04-355-720 | אתנול מוחלט המשמש להכנת תמיסות צביעה ולשטיפות טרום-צביעה |
| בידוד קצף פוליסטירן קשיח מוקצף (XPS) | Owens Corning | 1407788 | 1 אינץ' × 2 רגל × לוח קצף בעובי 2 רגל, R-5, 15 PSI; משמש לתמיכה במפרקי הגבעול במהלך חיתוך נתחים |
| פינצטה | Fisher Scientific | 10-316A | פינצטות מעבדה המשמשות לטיפול במקטעי גבעול, זכוכיות מיקרוסקופ וחתכים מורכבים |
| זכוכית למשטחי דגימה | FisherBrand | 125503 | 25 מ"מ × 75 מ"מ × 1 מ"מ; משמש להרכבת חתכים רוחביים של הגבעול |
| בקבוע עגול (6 ליטר) | Pyrex | CLS43205L-4EA | בקבוק זכוכית בנפח 6 ליטר המשמש להכנה או לטיפול בנפחים גדולים של תמיסות |
| גליצרין, נוזל בדרגת מעבדה | Fisher Science Education | 525342C | מספר CAS 56-81-5; גליצרול המשמש בתמיסות קיבוע ואחסון |
| בד גזה כפול, דרגה 50 | חנות JINIOHEE | B0FL27KXRN | 100% כותנה, מולבנת בלבן; משמשת לסינון חומר מהקימע (rumen) ונוזל קימע |
| משיח מדורג (10 מ"ל) | Pyrex | 700024 | משורה של 10 מ"ל המשמשת למדידת נפחי נוזלים |
| חומצה הידרוכלורית | Fisher | A1445-500 | מספר CAS 7647-01-0; משמש עם פלורוגלוצינול להכנת צבע ויסנר (Wiesner stain) |
| טוש פרמננטי תעשייתי חזק במיוחד | Sharpie | 13601 | כתף דקה; משמשת לסימון מבחנות דגירה בסימונים עמידים למים |
| L-cysteine hydrochloride hydrate | Sigma-Aldrich | C121800-10G | מספר CAS 345909-32-2; חומר מחזר המשמש להכנת תמיסת האינקובציה |
| נייר סופג דל-סיבים | Kimberly-Clark | 34155 | 4.5 אינץ' × 8.5 אינץ'; משמש לספיגת שאריות נוזלים מהשקופיות ללא השארת סיבים |
| להב מיקרוטום בעל פרופיל נמוך | Leica 819 | 63065-LP | להב חלופי בעל פרופיל נמוך המשמש להכנת חתכים רוחביים אחידים של גבעול |
| מגנזיום סולפט הפטהידראט | Fisher Chemical | M80-500 | מספר CAS 10034-99-8; ריאגנט עבור McDougall’בופר s |
| מגנט לערבוב | Fisher Scientific | 03-411-783 | 76 מ"מ × 12 מ"מ; משמש לערבוב בופר ותמיסוֹת הדבקה |
| תוויות לכתובות למשלוח בדואר | Avery | 5167 | 1/2 אינץ' × 1 3/4 אינץ'; משמש לזיהוי דגימות ושלשויות |
| מברשת צבע | לואו-קורנל | — | סדרה 7000, מספר 3 עגולה; מברשת עדינה המשמשת להעברה ולמניפולציה של חתכי רוחב של גבעול |
| צלוחיות פטרי עם מכסים | כלי מעבדה של Becton Dickinson | 81731119 | 60 מ"מ × 15 מ"מ; משמש לאחסון זמני של חתכי רוחב של גבעול במים אולטרה-טהורים |
| פלורוגלוצינול, 1,3,5-טריהידרוקסיבנזן | Sigma-Aldrich | P3502-25G | מספר CAS 108-73-6; ריאגנט המשמש להכנת צבע ויסנר (Wiesner stain) |
| פיפטה (100 μL) | Gilson | P 1000; 767547M | פיפט עם נפח מתכוונן המשמש לחלוקת תמיסות צביעה |
| משפך פלסטיק רב-שימושי | Nalgene | 10-437-23E | 150 מ"מ; משמש להעברת ריאגנטים ולסינון |
| ביקר פוליפרופילן (4 ליטר) | Nalgene | 1201-4000 | ביקר בנפח 4 ליטר העמיד לכימיקלים, המשמש להכנה ולערבוב של תמיסות הַחְדָּרָה (inoculation) |
| אשלגן כלוריד | Fisher Chemical | P217-500 | מספר CAS 7447-40-7; ריאגנט עבור McDougall’בופר s |
| סכיני גילוח | פרסונה | 66-0089 | בעובי 0.009 אינץ'; משמש לקיצור ידני של חומרי גבעול |
| רותניום אדום, רותניום אוקסיכלוריד מאמוני | סיגמא | R-2751 | מספר CAS 11103-72-3; צבע היסטולוגי המשמש להדגשת חומרים פקטיים |
| מספריים | Fiskars | 1063071 | מספריים רב-תכליתיים המשמשים לחיתוך סרט הדבקה, קצף וחומרים מתכלים אחרים |
| מבחנות צנטריפוגה קוניות עם פקק הברגה (50 מ"ל) | Corning | 430828 | פוליפרופילן, לא פירוגני; משמש להחזקת דגימות, אינקובציה, שטיפה ואחסון |
| מיקרוטום סלדג' (Sledge microtome) | Leica | 2000R | מיקרוטום להחלקה/מזחלה המשמש להכנת 100 μm-חתכים רוחביים עבים של הגבעול |
| נתרן ביקרבונט, בדרגת ACS | Fisher Chemical | S233-3 | מספר CAS 144-55-8; ריאגנט עבור McDougall’בופר s |
| נתרן כלוריד | Fisher Chemical | — | מספר CAS 7647-14-5; ריאגנט עבור McDougall’בופר s |
| נתרן הידרוקסיד | Fisher Chemical | S318-500 | מספר CAS 1310-73-2; משמש להכנת תמיסת החמצון |
| נתרן פוספט דו-בסיסי אנידרי (Na2HPO4) | Sigma Aldrich | S-9763 | CAS 7558-79-4 |
| סודיום סולפיד ללא מים (anhydrate), בדרגת ACS, מינימום 98.0% | Oakwood Chemicals | 245960 | מספר CAS 1313-84-4; חומר מחזר המשמש להכנת תמיסת האינקובציה |
| כף מעבדה מסוג Spoonula | Fisher Scientific | 14-375-10 | שפכטל מעבדה המשמש להעברת ריאגנטים באבקה |
| פלטת ערבוב | ThermolyneK של Sybron | 7200 | פלטת ערבוב מגנטית המשמשת לערבוב של תמיסות בופר ותמיסות הדבקה |
| מזרק (60 מ"ל) עם מחט רחבה | Monoject | 935401028 | מזרק של 60 מ"ל עם מחט רחבת קוטר המשמש להזרקת תמיסת ההוצאה (inoculation solution) |
| מתקני מבחנות | Thermo Scientific | 14-809-44 | מעמדים המשמשים לארגון ותמיכה במבחנות דגירה של 50 מ"ל |
| מדחום | FisherBrand | 13201663 | מדחום מעבדה המשמש לאימות טמפרטורת התמיסה ואמבט המים |
| מיקרוסקופ אנכי | Nikon | Eclipse Ni | מיקרוסקופ שדה בהיר (Brightfield) זקוף המשמש להדמיה וויזואליזציה של חתכי רוחב צבועים של גבעול |
| משאבת עזר | Little Giant Pump Co. | 502203 | דגם 2E-38N; 115 VAC, 60 Hz, 1.7 A; משמש להזרמת מים ולשמירה על טמפרטורת אמבט אחידה |
| נייר שקילה | VWR Scientific Products | 12578-165 | נייר שקילה חד-פעמי המשמש לשקילה ולהעברה של ריאגנטים מוצקים ומצע גבעולי תירס |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מאמר זה פורסם
הסרטון יגיע בקרוב