Name: ניטור הורמונים צמחיים במהלך התגובות מתח (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2009-06-15T00:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 1 s
Description: למדו שיטה יעילה לחילוץ וניתוח הורמונים צמחיים מדגימות קטנות באמצעות GC/MS. השיטה משתמשת בחילוץ פאזת אדים לטיהור ומאפשרת כימות בו-זמני של הורמונים חשובים.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ראשית אנחנו צריכים להכין את 2ml בורג מכסה צלוחיות להפקת: הוסף חוצץ מיצוי 400ul (1-propanol: H2O: מרוכזת HCl 2:1:0.002 כרך / כרך / כרך א) ו - 10 μl של התקן פנימי, בהתאמה (10ng/μl ) כדי בקבוקון. הקפאה בחנקן נוזלי ולאחר מכן להוסיף את חרוזי קרמיקה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מוסיפים את חומר צמחי (בין 50 ל 200 מ&quot;ג), בעוד צלוחיות מוצבים עדיין חנקן נוזלי. שים לב כי המשקל של החומר צמח הוסיף צריך להיות מוערך לפני עיבוד נוסף כדי לאפשר מאוחר יותר כימות מדויק, אשר מבוססת על משקל טרי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ודא שכל החנקן הנוזלי מתאדה עוד לפני סגירת בחוזקה את הבקבוקון עם כובע. שים לב, כובע צריך להיות חותמת גומי כדי למנוע נזילות של ממיסים ולכן, תרכובות שחולצו במהלך homogenization. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Homogenize רקמות FastPrep או Precellys homogenizer חרוז מטחנת במהירות של 6000 (עבור Precellys) למשך 30 שניות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר צלוחיות מ homogenizer בנפרד, לפתוח בזהירות את המכסה ומוסיפים 1ml של dichloromethane לטעום כל אחד. צלוחיות סגור שוב בחוזקה homogenize שוב 10-15sec ב 6000 (Precellys). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העברת צלוחיות על השולחן צנטריפוגה ולהפריד את השלב האורגני משלב מימית ב 10.000xg עבור 60sec. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר הפרדת פאזות להעביר את השכבה התחתונה ירוק (שלב אורגנית, מכילה את ההורמונים ואת הסטנדרטים הפנימיים) של בקבוקונים בודדים בקבוקון זכוכית נקי 4ml. הימנע העברת מים (השלב ​​העליון). לחלופין, אתיל אצטט יכול לשמש במקום dichloromethane. במקרה זה השלב ethyacetate תהיה השכבה העליונה (ירוק), והוא כעת קל יותר להסיר והועברו בקבוקון זכוכית טרי 4ml. כמו בעבר, למנוע את העברת מים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פוצץ את הממס עם האוויר דרך סעפת בערך 10-25 דקות (תלוי מדגם); לבדוק עם טיפ זרימת האוויר יחיד אם דגימות יבשים (בזהירות). אל דגימות overdry, עבור זה עלול לגרום להפסדים של תרכובות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר הדגימות מיובש אנחנו יכולים להתחיל את מתילציה של carboxylic חומצה המכילים תרכובות בדגימות שלנו. ראשית, 100 μl של תערובת diethyether / מתנול (09:01 כרך / כרך) מתווספים בקבוקון אחד ואחריו 4μl פתרון trimethylsilyldiazomethane 2M (ב הקסאן, Sigma Aldrich). בקבוקונים סגורים מיד עם מכסה גג פתוח בורג מצויד מחצה טפלון מצופה סיליקון. לנער בעדינות לדגור על RT במשך 25 עד 30 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר שסיים את שלב 9, להפעיל בלוק חימום בטמפרטורה להגדיר את האוסף הרצוי. התנודתיות של תרכובות מפוגל תלוי בגודל שלהם, אלא גם על קבוצות אחרות קוטבי יותר כמו = O,-OH, ו-NH. עבור חומצה סליצילית jasmonic ו חומצה מתיל אסטרים אוסף של טמפרטורות סביב 80 מעלות צלזיוס מספיקים, בעוד למשל תרכובות אחרות כמו חומצות שומן C18, jasmonic חומצה אמינית conjugates חומצה, coronatine, ו-12-אוקסו phytodienoic מתיל אסטר חומצה דורשים טמפרטורה בין 180-200 מעלות צלזיוס ביעילות לנדוף. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר דגירה 30 דקות התגובה מתילציה שחייב להפסק כדי למנוע תגובה לא רצויה משנית. הדבר נעשה על ידי הוספת 4 μl של פתרון חומצה אצטית 2M (ב הקסאן) כדי בקבוקון אחד. לאחר סגירת צלוחיות עם כובעים vortexing קצר, דגימות רשאים דגירה עבור 30 דקות אחר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מסננים המשמשים להפקת את השלב הזה אדי הם עבודת יד בצורת הציג לא זמינים מסחרית. הם מורכבים צינור טפלון החיצונית (כ 7-8cm רב), שבו מצד אחד צינור היטב הולם זכוכית באורך כ 4cm מוכנס. בצד השני של הצינור טפלון דיסק חלד רשת פלדה נדחף בתוך הצינור עד שהוא מגיע שפופרת זכוכית פנימית על כי כ 20-30mg של בעלי כושר ספיגה (או SuperQ 80/100 (הופסק) או HayeSep ® Q80/100) מתווספים. דיסק נוסף רשת נירוסטה מוכנס ולבסוף קצה של כוס הוא דוחף לתוך צינור טפלון, ובכך בזהירות לחיצה על נירוסטה רשת דיסק על סופג. תמונה מפורטת מסנן מוצג באיור 1. <img src="/files/ftp_upload/1127/1127fig1.jpg" alt="איור 1" /> באיור 1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בזמן הדגירה של שלב 11, מסננים לאיסוף, הורמונים מפוגל ולכן צמח תנודתי, צריך לשטוף באמצעות 200ul הראשון של מתנול, ולאחר מכן 2 שוטף עם dichloromethane 200ul כל אחד. מרכך שנותרו מסננים הוא פוצץ אז את האוויר. המסננים כעת ניתן להשתמש בהם ללכידה של הורמונים נדיפים באמצעות מיצוי שלב אדי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר 30 דקות של דגירה septa הגומי של הבקבוקון כמוסות 4ml נחתכים עם אזמל. כדי לאסוף את הורמונים צמחיים על ידי מיצוי שלב אדי לנקות את המסננים מחוברים קווי ואקום בודדים בקצב הזרימה של כ 800ml/min. המסננים מוכנסים מכן לתוך הבקבוקון דרך septa לחתוך. טיפ קטן pipet מוכנס גם לשמש כניסת אוויר. בחלק הראשוני הזה של ההליך צלוחיות עם מסנני מוכנס צריך שיתקייםבתנוחה זקופה, כדי למנוע כל הנוזל בתוך הבקבוקון להגיע במגע עם קצה מסנן, אשר היה לזהם את המסנן ולאחר מכן גם GC / MS. צלוחיות מתקיימים אז ביד עד שכל הנוזל מתאדה דרך המסנן. ואז צלוחיות עם מסנני מצורף ממוקמים ברחוב חימום חום התאדו תרכובות שנאספו 3min. רכיבים העיקרון של המערכת, כמו גם את הגדרת מתוארים באיור 1. לאחר שלב זה השלב הסופי מיצוי אדי צלוחיות עם מסנני מחוברת עדיין מונחות על מדף ואפשרו להתקרר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כאשר המסננים הגיעו לטמפרטורת החדר שוב הם eluted עם 150 מ&quot;ל של dichloromethane לתוך בקבוקון-GC 1.5 מ&quot;ל מצויד להוסיף. אלתר נושף הממס שנותר מסנן את בקבוקוני הם כתרים ונותחו על ידי GC / MS. </li></ol> גז כרומטוגרף מצויד לפצל / מזרק splitless (מצב splitless 250 ° C, נפח הזרקה 1μ) interfaced כדי ספקטרומטר מסה פעל במצב יינון כימי (CI) אמור לשמש לניתוח). תרכובות מופרדות על עמודת HP-1MS (30 x 0.25mm x 025μm) שנערך 40 ° C עבור 1min לאחר ההזרקה, ולאחר מכן טמפרטורה לתכנת ב 15 ° C / min עד 250 ° C (עבור 10min), עם הליום כנושא גז (0.7ml/min זרם בלתי פוסק). לניתוח MS-מבוסס הן, quadropole (למשל Agilent HP5973) ואת מלכודת יונים מבוססות (למשל וריאן שבתאי 2200) ספקטרומטר מסה יכול לשמש. כמו גז CI או isobutane (מגיע בלוני גז) או מתנול (אדים מן המאגר נוזל משמשים) ניתן להשתמש, לעומת זאת, בכל מקרה שברים של התגובה יינון צריך להיבדק לפני יון שנבחר לספור (SIC) תוכניות נוצרים. השתמשנו את התוכנית הבאה של מערכת GC-MS וריאן 3900/Saturn 2200, מתנול כמו מגיב CI: 5.00-11.30min יונים (M 1) + 153-158 (salicylate מתיל 153, מתיל 2 H 5-סליצילט); 11.30-13.30min יונים (M +1) + 207-228 (מתיל jasmonate 207 ו - 225, מתיל dihydrojasmonate 209 ו - 227); 13.30-16.30min יונים (M +1) + 237-300 (מתיל חומצה abscisic 261, מתיל 2 H 6-abscisic חומצה 267 (חומצה abscisic מייצרת בעיקר [MH 2 O 1] + יונים). תרכובות כל צריך להיות מזוהה על ידי השוואה עם סטנדרטים זמינים מסחרית אותנטי. כימות JA, SA, ו ABA נעשה על ידי correlating באזור השיא (חילוץ יונים) עם אזור השיא (יוני חילוץ) של התקן פנימי בהתאמה מבוססת גם על המשקל הטרי של חומר המשמש את המפעל.

<ol><li>Schmelz, E. A., Engelberth, J., Tumlinson, J. H., Alborn, H. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+use+of+vapor+phase+extraction+in+metabolic+profiling+of+phytohormones+and+other+metabolites%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Journal%22%5BJournal%5D)">The use of vapor phase extraction in metabolic profiling of phytohormones and other metabolites.</a> Plant Journal. 39, 790-808 (2004).</li>
<li>Engelberth, J., Alborn, H. T., Schmelz, E. A., Tumlinson, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Airborne+signals+prime+plants+against+insect+herbivore+attack%5BTitle%5D)+AND+%22PNAS%22%5BJournal%5D)">Airborne signals prime plants against insect herbivore attack.</a> PNAS. 101, 1781-1785 (2004).</li>
<li>Schmelz, E. A., Engelberth, J., Alborn, H. T., O&acute, D. onnel, Sammons, P., Toshima, M., H, J. H. T. umlinson <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simultaneous+analysis+of+phytohormones%2C+phytotoxins%2C+and+volatile+organic+compounds+in+plants%5BTitle%5D)+AND+%22PNAS%22%5BJournal%5D)">Simultaneous analysis of phytohormones, phytotoxins, and volatile organic compounds in plants.</a> PNAS. 100, 10552-10557 (2003).</li>
<li>Engelberth, J., Schmelz, E. A., Alborn, H., Cardoza, Y. J., Huang, J., Tumlinson, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simultaneous+Quantification+of+Jasmonic+acid+and+Salicylic+acid+by+Vapor+Phase+Extraction+and+Gas+Chromatography+-+Chemical+Ionization-Mass+Spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Analytical+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Simultaneous Quantification of Jasmonic acid and Salicylic acid by Vapor Phase Extraction and Gas Chromatography - Chemical Ionization-Mass Spectrometry.</a> Analytical Biochemistry. 312, 242-250 (2003).</li>
</ol>

השיטה המוצגת כאן הוכח לעבוד באופן מהימן עבור מגוון רחב של תרכובות צמחים איתות ובלבד גודל ואת האופי הכימי של המתחם אינו למנוע ממנו חילוץ, מפוגל, ו מתאדה. כמו כן, הליך מתילציה כפי שהוא מתואר במסמך זה לא הדרך היחידה של derivatization. Silyllation ו acetylation הן שיטות חלופיות ופרוטוקולים ניתן למצוא בקלות באינטרנט. אם ספקטרומטר מסה אינו מסוגל יון בודד ניטור מגוון המונית נרשם במהלך הריצה יש להגביל להוציא יונים לא רצו...

ניטור הורמונים צמחיים במהלך התגובות מתח

Monitoring Plant Hormones During Stress Responses

הורמוני הצמח תרכובות איתות הקשורים לשחק תפקיד חשוב בוויסות של תגובות צמחים לגירויים סביבתיים ומדגיש שונים. בין מדגיש חמורים ביותר הם herbivory חרקים, זיהום הפתוגן, ומתח הבצורת. עבור כל אחד מהם מדגיש קבוצה מסוימת של הורמונים ו / או צירופם של אלה ידועים לכוונן את התגובות, ובכך להבטיח הישרדות של הצמח. ההורמונים העיקריים המעורבים בוויסות של תגובות אלה חומצה jasmonic (JA), חומצה סליצילית (SA), וחומצה abscisic (ABA). כדי להבין טוב יותר את התפקיד של הורמונים הפרט, כמו גם אינטראקציה הפוטנציאל שלהם במהלך התגובות הללו יש צורך לעקוב אחר השינויים השפע שלהם הזמני כמו גם בצורה מרחבית. עבור כימות קל, רגיש, לשעתקו אלה ותרכובות אחרות איתות פיתחנו שיטה המבוססת על מיצוי שלב אדי כרומטוגרפיה / ספקטרומטריית מסה גז (GC / MS) ניתוח (1, 2, 3, 4). לאחר חילוץ התרכובות הללו מרקמות הצמח על ידי מימית חומצית 1-propanol מעורבב עם dichloromethane חומצה המכילים תרכובות carboxylic הם מפוגל, מתאיידים תחת חום, שנאספו על סופג פולימריות. לאחר elution לתוך בקבוקון מדגם analytes מופרדים על ידי גז כרומטוגרפיה ו זוהה על ידי ספקטרומטריית יינון כימי המוני. השימוש בסטנדרטים הפנימי המתאים ואז מאפשרת כימות פשוט על ידי הנוגעים בתחומים השיא של תקן אנליטי ופנימיים.

השיטה הפשוטה היא ובלבד מאפשר מיצוי ניתוח מהיר של הורמונים צמחיים מרובים דגימות רקמה קטנות. הליך משתמשת מיצוי שלב אדי כצעד טיהור חגיגית. דוגמאות מנותחות על ידי GC / MS עם יינון כימי שמייצר בעיקר (M 1) יונים +.

הורמונים של צמחים ותרכובות איתות קשורות ממלאים תפקיד חשוב בבקרה של תגובות צמחים לגירויים ולעקות סביבתיות שונות. ...

הליך זה מתחיל בהומוגנציה של חומר צמחי באמצעות חרו지를 קרמיקה ולאחר מכן במיצוי בדיכלורומתאן כדי להשיג את הפאזה האורגנית. לאחר סבוב בצנטריפוגה, הדגימות מיובשות באוויר ומוכנות למיצוי בפאזת האדים. לאחר שטיפה (elution) ממסנני מיצוי פאזת האדים, ניתן להמשיך לאנליזה של הורמוני צמחים באמצעות ספקטרומטריית מסות וכרומטוגרפיה של גזים.שלום, אני מארי אנגלברג ממעבדת ג'ו אנגלברג במחלקה לביולוגיה באוניברסיטת טקסס כאן בסן אנטוניו, ואני ג'ו אנגלברג. היום נראה לכם פרוצדורה פשוטה לכימות סימולטני של הורמונים חשובים בצמחים. אנו משתמשים בשיטה זו באופן שגרתי כדי לעקוב אחר שינויים בהורמונים אלו בצמחים תחת השפעת נגיסות חרקים.אנו יכולים גם לנטר שינויים בהרכב החומצות השומניות. לכן, בואו נתחיל. לצורך המיצוי, עליכם להכין תחילה מבחנות עם פקק הברגה בנפח של שני מיליליטרים.כדי לבצע זאת, הוסיפו למבחנה 400 microliters של תמיסת מיצוי ו-10 microliters של התקן הפנימי המתאים בריכוז של 10 nanograms per microliter. לאחר מכן, הקפיאו את המבחנות בחנקן נוזלי. לאחר ההקפאה, הוסיפו למבחנות את חרוזי הקרמיקה.בעוד שהמבחנות עדיין ממוקמות בחנקן נוזלי, הוסיפו בין 50 ל-200 מיליגרם של חומר צמחי. יש לזכור כי יש להעריך את משקל החומר הצמחי שהוסף לפני המשך העיבוד כדי לאפשר כימות מדויק מאוחר יותר, המבוסס על המשקל הרענן. ודאו שכל החנקן הנוזלי התאדה לפני סגירת המבחנה היטב עם פקק.וודאו שלמכסה יש אטם גומי למניעת דליפה של ממסים ותרכובות מופקות במהלך ההומוגניזציה. בצעו הומוגניזציה לרקמה במטחנת חרוזי FastPrep או PSU. עבור מכשיר PSU, הפעילו את ההומוגניזטור במהירות של 6,000 למשך 30 שניות.לאחר ההומוגניזציה, הוצא את המבחנות מההומוגנייזר באופן פרטני ופתח בזהירות את המכסה כדי להוסיף מיליליטר אחד של di chloral methane לכל דגימה, סגור שוב את המבחנות היטב ובצע הומוגניזציה למשך 10 עד 15 שניות במהירות של 6,000. לאחר ההומוגניזציה, העבר את המבחנות לצנטריפוגה שולחנית והפרד את הפאזה האורגנית מהפאזה המימית במהירות של 10,000 ×g למשך 60 שניות. לאחר הפרדת הפאזות, העבר את השכבה הירוקה התחתונה מהמבחנות הפרטניות למבחנה זכוכית נקייה בנפח של ארבעה מיליליטר.זהו השלב האורגני המכיל את ההורמונים ואת התקנים הפנימיים. כדי למנוע העברה של מים או של השלב העליון, השתמשו באוויר דרך סבב (manifold) כדי לה 날אט את הממס למשך כ-10 עד 25 דקות. משך הזמן יהיה תלוי בדגימה.בדקו בעזרת קצה של זרימת אוויר (airflow tip) בודד כדי לראות בזהירות אם הדגימות יבשות. הקפידו לא לייבש את הדגימות יותר מדי, שכן הדבר עלול לגרום לאובדן של תרכובות. לאחר שהדגימות יובשו, ניתן להתחיל במתילציה של התרכובות המכילות חומצה קרבוקסילית בדגימות שלנו.ראשית, הוסיפו לכל מבחנה 100 microliters של תערובת D ethyl ether ומתנול ביחס נפחי של תשעה לאחד. לאחר מכן, הוסיפו ארבעה microliters של תמיסה ריכוזה שניים molar של trimethyl Cyl Diaz methane בתוך hexane. סגרו מיד את המבחנות עם פקק הברגה פתוח המצויד במחיצת סיליקון מצופה Teflon, נערה את המבחנות בעדינות והדגירה בטמפרטורת החדר למשך 25 עד 30 דקות.הפעילו בלוק חימום וכוון אותו לטמפרטורת האיסוף הרצויה. נדיפותם של התרכובות הממותילתן תשתנה בהתאם לגודלן ולמספר הקבוצות הפולריות שבהן. הטמפרטורות יכולות לנוע בין 80 ל-200 מעלות. לאחר דגירה של 30 דקות, הפסיקו את תגובת המתילציה על ידי הוספה של ארבעה µL של תמיסת חומצה אצטית ריכוז 2 M ב-hexane לכל מבחנה.פעולה זו מבוצעת כדי למנוע תגובה משנית לא רצויה. המסננים המשמשים למיצוי פאזת האדים הם בעבודת יד. הם עשויים מצינורות טפלון.מצד אחד, מוכנסת צינורית זכוכית המותאמת היטב באורך של כארבעה סנטימטרים. ניתן לראות את שתי הדיסקיות של רשת פלדת אל-חלד, המחזיקות כ-20 עד 30 מיליגרם של חומר סופח. שטפו את המסננים שישמשו לאיסוף ההורמונים הצמחיים הממתילתיים והנשאלים באמצעות 200 µL של מתנול.בשלב הבא, שטפו את המסננים פעמיים עם 200 µL של dichloromethane. ייבשו כל מסנן באוויר כדי להסיר את השאריות של הממס. כעת ניתן להשתמש במסננים ללכידת הורמונים נתיפים באמצעות חילוץ משלב האדים.לאחר 30 דקות של דגירה של הדגימות, נחתכים ספטא הגומי של מכסי המבחנות בנפח ארבעה מיליליטר באמצעות סכין מנתח. כעת החומר המופק מוכן לאיסוף של ההורמונים הצמחיים באמצעות מיצוי פאזה של אדי. המסננים הנקיים מחוברים לקווי ואקום נפרדים בקצב זרימה של כ-800 milliliters per minute.לאחר מכן, מכניסים את המסננים לתוך הבקבוקון דרך המחיצות הגזורות. מכניסים גם קצה של פיפטה קטנה שישמש ככניסת אוויר. במהלך חלק זה של הפרוצדורה, יש להחזיק את הבקבוקונים עם המסננים המוחדרים במצב אנכי, כדי למנוע מכל נוזל בתוך הבקבוקון לבוא במגע עם קצה המסנן, דבר שיגרום לזיהום של המסנן.ולבסוף, החזיקו את המבחנות עבור ה-GCMS ביד עד שכל הנוזל יתאדה דרך המסנן. לאחר מכן, הניחו את המבחנות עם המסננים המחוברים על גבי בלוק חימום, ואספו את התרכובות שהתאדו בחימום למשך שלוש דקות. לאחר שלב זה של מיצוי פאזה גזית סופי, הניחו את המבחנות כשהמסננים עדיין מחוברים אליהן על מעמד והמתינו שיתקררו.הכינו מבחנות GC בנפח 1.5 מיליליטר המצוידות ב inserts כאשר המסננים הגיעו לטמפרטורת החדר. שוב, העבירו לולאה עם 150 מיקרוליטר של dichloromethane אל תוך המבחנות. לאחר נישוף שארית הממס מהמסנן, סגרו את המבחנות במכסה וכעת ניתן לנתח אותן באמצעות כרומטוגרפיית גז עם ספקטרומטריית מסות (GC-MS).לצורך הניתוח, השתמשו בכרומטוגרף גזי המצויד במזרק עם מחלק (split injector) המחובר לספקטרומטר מסות הפועל במצב יינון כימי; לאחר ההזרקה, התרכובים מופרדים בעמודת HP-5MS ששומרה בטמפרטורה של 40 °C למשך דקה אחת. הטמפרטורה מתוכננת לעלייה של 15 °C לדקה עד ל-250 °C למשך 10 דקות, כאשר ההליום משמש כגז נשא בזרימה קבועה של 0.7 mL/min. עבור הניתוח מבוסס ה-MS, ניתן להשתמש בספקטרומטר מסות המבוסס על קוואדרופול או על מלכודת יונים כגז CI.ניתן להשתמש באיזובוטאן או במתנול. עם זאת, בכל מקרה, יש לבדוק את השברים של תגובת היינון לפני יצירת תוכניות ספירת היונים הנבחרות. אנו משתמשים במערכת גז כרומטוגרף variant GC 3, 900 המחוברת לספקטרומטר מסות Saturn MS 2200, ובמתנול כריאגנט ל-CI.אנא עיינו בפרוטוקול הכתוב שלנו לתיאור התוכנית. ודאו שכל התרכובות מזוהות על ידי השוואה לסטנדרטים מסחריים אותנטיים הזמינים בשוק. כימות של JA SA ו-A BA מבוצע על ידי מתאם בין שטח הפסגה של היונים שהופרדו לבין שטח הפסגה של היונים שהופרדו של הסטנדרט הפנימי המתאים, והוא מבוסס גם על המשקל הרטוב של החומר הצמחי שנעשה בו שימוש.לאחר חילוץ הנתונים מקובצי ה-GCM S וביצוע מספר חישובים, מצאנו כי האתין הוביל להצטברויות משמעותיות של חומצה סליצילית, חומצה מוניקה וכן חומצה אביקה בהשוואה לבקרה שלא טופלה. הנתונים עבור כל הורמון בודד נלקחו מהרצה אחת, והם מדגימים את יכולתה של שיטה זו לניתוח הורמונלי מרובה (multiplex). הצגנו בפניכם הליך פשוט אך יעיל לחילוץ ולכימות של הורמוני צמחים חשובים ותרכובים מאותתים אחרים.התהליך קל לביצוע וניתן להכין בקלות את רוב הכלים שראיתם מחומרים סטנדרטיים של מעבדה. זה הכל. תודה שצפיתם ובהצלחה בניסויים שלכם.

monitoring-plant-hormones-during-stress-responses

Research

JoVE Journal

Biology

ביולוגיה

איתות 2 + Ca מסדירה תהליכים ביולוגיים מגוונים בצמחים. כאן אנו מציגים גישות לניטור לחץ אביוטי המושרה Ca מרחב ובזמן 2 + אותות בתאי ארבידופסיס ורקמות באמצעות Ca 2 + אינדיקטורים מקודד גנטי Aequorin או Case12.

מדידת מרחב ובזמן Ca 2 + אותות בצמחים ארבידופסיס

יש צורך בהערכה לא פולשנית של לחץ. מאמר זה מתאר פרוטוקול פשוט באמצעות הדמיה תרמית כדי לזהות תגובה משמעותית בטמפרטורת עין-אזור בציצים הכחולים פראיים ללחץ אקוטי קל.

הדמיה תרמית לחקר מתח הלא פולשני בציפור ללא ריסון

כאן אנו מתארים שיטה חדשה ללמוד יבוא החלבון לתוך כלורופלסטים מבודדים תחת לחץ. השיטה היא מהירה וישירה, וניתן להחיל ללמוד את ההשלכות של תנאי לחץ שונים לייבוא ​​חלבון הכלורופלסט, ואת מנגנוני ויסות המקביל.

ניתוח של ייבוא ​​חלבון לתוך כלורופלסטים מבודדים מצמחים לחוצים

מערכת פשוטה רב-תכליתי, בעלות נמוכה במבחנה הידרופוני בהצלחה אופטימלי, הפעלת ניסויים בקנה מידה גדול בתנאים סטריליים. מערכת זו מקלה על היישום של חומרים כימיים פתרון וספיגה יעילה שלהם על ידי השורשים ללימודי מולקולרית, ביוכימיה ו פיזיולוגיים.

עלות נמוכה גמיש מערכת הידרופונית להערכת תגובות צמח מולקולות קטנות בתנאים סטריליים

מטרת הנייר היא לזהות שינויים ברמות הסטרס לאחר הביקור בשלוש הגדרות שונות ולתאר את השיטות המשמשות לזיהוי רמות הסטרס המבוססות על מדדים של קורטיזול בהרוק, α-עמילאז, ודוח עצמי פסיכולוגי כלי.

מדידת רמות המתח הביופיזיקלי והפסיכולוגית בעקבות ביקורי שלושה מיקומים בעלי רמות שונות של טבע

כאן, אנו מאפיינים את התגובות הסלולר מדגיש התגובה התאית ב-נמטודות C. אלגיה על ידי מדידת ההפעלה של כתבים פלורסנט ההמרה ולומר רגישות ללחץ פיזיולוגי.

מדידות התגובות הפיזיולוגיות של הלחץ בג. אלגיה

תכננו פרוטוקול פנוטיפ מבוסס תמונה כדי לקבוע את התגובות המורפולוגיות והפיזיולוגיות לטיפולי חום, בצורת וכריתת מים בודדים ומשולבים. גישה זו אפשרה זיהוי של תגובות מוקדמות, מאוחרות והתאוששות ברמת צמח שלם, במיוחד חלקים מעל פני הקרקע, והדגישה את הצורך בשימוש בחיישני הדמיה מרובים.

פנוטיפ מבוסס תמונה בתפוקה גבוהה לקביעת תגובות מורפולוגיות ופיזיולוגיות ללחצים בודדים ומשולבים בתפוח אדמה

הפרוטוקול המוצג כאן כולל פרופיל פוליזומלי כדי לבודד טרנסלטום, mRNA הקשור לריבוזומים, לרנ"א לא פוליזומלי ופוליזומלי מארבידופסיס באמצעות צנטריפוגה הדרגתית של צפיפות סוכרוז. שיטה זו מדגימה את יעילות התרגום של Arabidopsis בלחץ חום.

בדיקת יעילות תרגום באמצעות פרופילי פוליזום תחת לחץ חום

פרוטוקול זה מתאר גישה בעלת תפוקה גבוהה להערכת דליפת יוני צמחים, פעילות פרוקסידאז וייצור קלוז באותה דגימה.

הערכת תגובות עלים למטבוליטים משניים מיקרוביאליים באמצעות פורמט בעל תפוקה גבוהה

הבסיס המולקולרי של מרחבי ספציפי התגובות phytochrome נחקרת באמצעות הצמחים הטרנסגניים כי התערוכה רקמות איברים ספציפיים ליקויים phytochrome. הבידוד של תאים ספציפיים מציג המושרה דלדול chromophore phytochrome על ידי תא הקרינה המופעל מיון ואחריו מנתח microarray הוא מנוצל כדי לזהות גנים המעורבים מרחבית ספציפית התגובות phytochrome.

חקירת רקמות ו איברים ספציפיים התגובות Phytochrome באמצעות FACS בסיוע נייד מסוג פרופיל ביטוי ספציפי ארבידופסיס thaliana</em

למדו שיטה יעילה לחילוץ וניתוח הורמונים צמחיים מדגימות קטנות באמצעות GC/MS. השיטה משתמשת בחילוץ פאזת אדים לטיהור ומאפשרת כימות בו-זמני של הורמונים חשובים.

ניטור הורמונים צמחיים במהלך התגובות מתח

גלה סרטונים נוספים