JoVE Encyclopedia of Experiments
מחקר סרטן
0 צפיות • 4:21 דק' • April 30th, 2023
- אקסוזומים הם שלפוחיות קטנות הקשורות לקרום הנושאות ביומולקולות כמו שומנים, חלבונים, DNA, mRNA ומיקרו-רנ"א. אקסוזומים משתחררים על ידי סוגי תאים שונים לחללים חוץ-תאיים וניתן לבודד אותם מנוזלים ביולוגיים כמו פלזמה.
כדי להתחיל, צנטריפוגה את דגימת הפלזמה כדי להסיר תאים ופסולת. מעבירים את העל-נאטנט של הפלזמה לתוך צינור טרי. לטפל פלזמה עם הריכוז הרצוי של אנזים ribonuclease. יש לדגור על הדגימה על גוש חימום בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס למשך זמן מתאים.
האנזים מפרק כל RNA חופשי בדגימה, בעוד שהרנ"א האקזוסומלי נשאר מוגן. לדלל את הדגימה באמצעות PBS. לאחר מכן, להוסיף את הריכוז הרצוי של תמיסת אנזים Proteinase K ולדגור ב 37 מעלות צלזיוס לזמן מתאים. פרוטאינאז K מפרק את רוב חלבוני הפלזמה. הוא גם משבית את אנזים הריבונוקלאז שנוסף בעבר, ובכך מבטל את הסיכון לפירוק RNA אקסוזומלי במהלך עיבוד במורד הזרם.
הוסף נפח מתאים של מאגר משקעים אקסוזום כדי להקל על הפרדה אקסוזום מהפלזמה. צנטריפוגה את הדגימה כדי לקבל גלולה המכילה אקסוזומים שלמים. האקסוזומים המבודדים מוצאים יישומים בשלבים במורד הזרם כמו RNA ומיצוי חלבונים.
בפרוטוקול הבא נבצע בידוד אקסוזום מדגימת פלזמה של חולי סרטן ריאה מסוג תאים לא קטנים.
- כדי להתחיל, הפשירו דגימת פלזמה של 1 מיליליטר על קרח. לאחר ההפשרה, הפוך את הצינור מספר פעמים כדי לפרק את כל cryoprecipitates שאולי נוצרו. לאחר מכן, צנטריפוגו את הפלזמה במהירות של 2,000 Gs למשך 20 דקות בטמפרטורת החדר, על מנת להסיר תאים ופסולת. אספו את הסופרנאטנט וצנטריפוגו את הפלזמה שוב, עכשיו ב-10,000 ג'י למשך 20 דקות. שוב, לאסוף את supernatant פלזמה עכשיו להוסיף 10 מיקרוליטר של RNAse. לדגור את הפלזמה ב 37 מעלות צלזיוס במשך 10 דקות בתנור בלוק תרמי.
- הוספנו שלב טיפול RNAse לפרוטוקול הערכה הסטנדרטי על מנת לפרק את המיקרו-רנ"א החופשי. מאוחר יותר, שלב הטיפול בפרוטאינאז K, שנכלל בפרוטוקול הערכה, נוצל על מנת לפרק את ה-RNAse ולהגן על שלמות המיקרו-רנ"א האקזומלי.
- לאחר מכן, להעביר את הפלזמה לצינור חדש בחצי נפח של 1x PBS ולסובב אותו. לאחר מכן, להוסיף 0.05 נפחים של תמיסת פרוטאינאז K, מערבלים את הדגימה שוב ולדגור אותה ב 37 מעלות צלזיוס במשך 10 דקות. כעת, הוסף 0.2 נפחים של מאגר משקעים אקסוזום וערבב את המדגם לפי היפוך. לאחר מכן, לדגור את הדגימה בארבע מעלות צלזיוס במשך 30 דקות.
לאחר הדגירה הקרה, צנטריפוגו את הדגימה ב-10,000 גרם למשך חמש דקות בטמפרטורת החדר. קח 20 עד 50 מיקרוליטר aliquot של supernatant ולאחסן אותו למטרות שליטה. לאחר מכן שאפו והשליכו את הסופר-נטנט שנותר.
השהה מחדש את גלולת האקזוזום במאגר הנבחר, בנפח בהתאם לניתוח במורד הזרם. לניתוח RNA, הוסף חיץ ליזיס ספציפי למיצוי RNA.
מאמר זה דן בבידוד אקסוזומים מדגימות פלזמה, ובמיוחד מחולים עם סרטן ריאותה שאינו תאי קטנים. אקסוזומים הם שלפוחיות קטנות הנושאות ביו-מולקולות שונות וממלאות תפקיד משמעותי בתקשורת בין-תאית.
בידוד אמין של אקסוזומים מפלסמה מאפשר גישה לא פולשנית לסמנים ביולוגיים מולקולריים, ובכך תומך בגילוי מוקדם ובניטור לאורך זמן במחקרי אונקולוגיה. תהליך עבודה זה מגביר את הביטחון החזוי בגילוי סמנים ביולוגיים ובמחקרים תרגומיים על ידי שמירה על שלמות ה-RNA והחלבונים האקסוזומליים. השיטה מציבה את הביופסיה הנוזלית מבוססת האקסוזומים ככלי הניתן להרחבה עבור תיקוף סמנים ביולוגיים ברחבי פורטפוליו ומעקב אחר התקדמות המחלה.
פרוטוקול זה לבידוד אקסוזומים משלב בין ביולוגיה של גילוי למחקר תרגומי, ותומך בתהליכי עבודה החל מזיהוי מוקדם של סמנים ביולוגיים ועד לאישוש פרה-קליני.
סרטונים קשורים
0 צפיות
סרטונים קשורים
0 צפיות
סרטונים קשורים
0 צפיות
סרטונים קשורים
0 צפיות
סרטונים קשורים
0 צפיות
סרטונים קשורים
0 צפיות
סרטונים קשורים
0 צפיות
סרטונים קשורים
0 צפיות
סרטונים קשורים
0 צפיות
סרטונים קשורים
0 צפיות
עודכן לאחרונה: 29 אוגוסט 2026