Name: אגר-Block מיקרוקוסמוס של פירוק רקמות הצמח מבוקרת על ידי פטריות אירובית (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2011-02-03T17:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 34 s
Description: למד את שיטת מיקרוקוסמוס אגר-בלוק לחקר פירוק עץ על ידי פטריות אירוביות בשליטה מלאה על לחות וחומרי מצע חיצוניים. שיטה זו מאפשרת תוצאות ברמת שחזור גבוהה לביולוגיה של פטריות ואקולוגיה מיקרוביאלית.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>ASTM D1413-07. Standard test method for testing wood preservatives by laboratory soil-block cultures. . <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Annual+Book+of+ASTM+Standards%22">Annual Book of ASTM Standards</a>. , 185-192 (2007).</li>
<li>Bravery, A. F. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBravery%2C+AF+%22A+miniaturized+wood+block+for+the+rapid+evaluation+of+wood+preservative+fungicides%22">A miniaturized wood block for the rapid evaluation of wood preservative fungicides</a>. , International Research Group on Wood Protection (IRG/WP 2113). (1978).</li>
<li>Low, G. A., Young, M. E., Martin, P., Palfreyman, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessing+the+relationship+between+the+dry+rot+fungus+Serpula+lacrymans+and+selected+forms+of+masonry%5BTitle%5D)+AND+%22Int.+Biodeterior.+Biodegrad%22%5BJournal%5D)">Assessing the relationship between the dry rot fungus Serpula lacrymans and selected forms of masonry.</a> Int. Biodeterior. Biodegrad. 46, 141-150 (2000).</li>
<li>Nicolas, D. Volume I (One/1) - Degradation and Protection of Wood (Syracuse Wood Science Series #5). <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aNicolas%2C+D+%22Wood+Deterioration+and+Its+Prevention+by+Preservative+Treatments%22">Wood Deterioration and Its Prevention by Preservative Treatments</a>. , Syracuse University Press. (1973).</li>
<li>Schilling, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+calcium-based+materials+and+iron+impurities+on+wood+degradation+by+the+brown+rot+fungus+Serpula+lacrymans%5BTitle%5D)+AND+%22Holzforschung%22%5BJournal%5D)">Effects of calcium-based materials and iron impurities on wood degradation by the brown rot fungus Serpula lacrymans.</a> Holzforschung. 64, 93-99 (2010).</li>
</ol>

אין ניגודי אינטרסים הכריז.

באמצעות אגר לחסום שלנו הגדרת (איור 1) Serpula lacrymans גדל במגע ישיר עם משטחי גבס לתוך גושי עץ (איור 2), מובילה לאובדן יותר מ 60% במשקל של חום נרקב לשלוט בלוקים אורן (איור 3 ). זה בקלות עונה על המטרה תקן ASTM של ריקבון&gt; 50%, ואת הממוצע של מקדם השונות (C V) ב ריקבון בבית היה 0.055 בשבוע 16. נתונים אלה פורסמו שילינג 7. שוב, פטריות אחרות ידרשו הדגירה כבר הבלוק אגר מאשר גוש אדמה. לקבלת התייחסות, יש לנו להפעיל בהצלחה עיצובים דומים בעבר מספר ניסויים עם...

<table><tbody><tr><td>צלוחיות פטרי</td><td>Nalge Nunc international</td><td>4014</td><td>25 x 150 mm</td></tr><tr><td>אגר, סוג A</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A4550</td><td></td></tr><tr><td>אמוניום ניטראט, NH&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;NO&lt;sub&gt;3&lt;/sub&gt;</td><td>Millinckrodt</td><td>3436-12</td><td></td></tr><tr><td>אשלגן פוספט, KH&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;PO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;</td><td>JT Baker</td><td>3246-01</td><td></td></tr><tr><td>מגנזיום סולפט 7-הידרט, MgSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>230391</td><td></td></tr><tr><td>D-(+)-גלוקוז</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G8270</td><td>דקסטרוז</td></tr><tr><td>חומצה בורית, H&lt;sub&gt;3&lt;/sub&gt;BO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>2549-04</td><td></td></tr><tr><td>אבץ סולפט 7-הידרט, ZnSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>8880-12</td><td></td></tr><tr><td>מנגן(II) כלוריד 4-הידרט, MnCl&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&amp;#8226;4H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>JT Baker</td><td>2540-04</td><td></td></tr><tr><td>נחושת(II) סולפט 5-הידרט, CuSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;5H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>209198</td><td></td></tr><tr><td>אמוניום הפטמוליבדאט 4-הידרט, (NH&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;)&lt;sub&gt;6&lt;/sub&gt;Mo&lt;sub&gt;7&lt;/sub&gt;O&lt;sub&gt;24&lt;/sub&gt;&amp;#8226;4H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>431346</td><td></td></tr><tr><td>סידן כלורידי דיהידרט, CaCl&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&amp;#8226;2H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>4160-12</td><td></td></tr><tr><td>נתרן כלוריד, NaCl</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>7581-12</td><td></td></tr><tr><td>ברזל סולפט 7-הידרט, FeSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>5056-12</td><td></td></tr><tr><td>עזר למpipette (Pipet-aid)</td><td>Drummond Scientific</td><td>4-000-110</td><td>אלחוטי&lt;br/&gt;ניקוי המשטח ב-EtOH</td></tr><tr><td>פיפטת פוליסטירן סטרילית 10 ml</td><td>BD Biosciences</td><td>357551</td><td></td></tr><tr><td>רשת הגנה למרזב (Gutter Guard)</td><td>Thermwell Products Co.</td><td>VX620</td><td>נקרצפה מראש עם סבון&lt;br/&gt;חנות חומרי בניין</td></tr><tr><td>סידן סולפט המיהידרט, CaSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;0.5H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Acros Organics</td><td>385355000</td><td></td></tr><tr><td>מחורר שעם מס' 4</td><td>Boekel Scientific</td><td>1601</td><td></td></tr><tr><td>Parafilm &quot;M&quot;</td><td>Pechiney Plastic Packaging</td><td>PM-996</td><td></td></tr></tbody></table>

אגר-block מיקרוקוסמוס של פירוק רקמות הצמח מבוקרת על ידי פטריות אירובית

Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi

שתי השיטות העיקריות לחקר ביודגרדציה פטרייתי של רקמות הצמח lignocellulosic פותחו עבור בדיקות משמר עץ (אדמה לחסום; אגר בלוק). זה טוב כי קיבל אדמה לחסום מיקרוקוסמוס להניב שיעורי עששת גבוה יותר, פחות בעיות רטיבות, השתנות נמוך יותר בקרב מחקרים, ועל סף גבוה יותר של רעילות חומר משמר. אדמה היא לחסום בדיקות ובכך הטכניקה מנוצל יותר כבר טופל על ידי האגודה האמריקאית לבדיקות וחומרים (ASTM) (שיטה D 1413-1407). העיצוב אדמה לחסום יש חסרונות, לעומת זאת, שימוש במקורות אדמה מקומית משתנה וגם להגביל את השליטה של ​​חומרים מזינים חיצוני (אקסוגני) לרקמות מתפורר. חסרונות אלה התפתחו כמו בעיה ביישום שיטה זו, מטרות אחרות מחקר פופולרי יותר ויותר. אלה מטרות המודרני כוללים lignocellulosics משפיל למחקר Bioenergy, בדיקות bioremediation של שיתוף מטבוליזם רעלים, הערכת המנגנונים חמצוני, ועוד אלמנטים translocated מעקב לאורך רשתות hyphal. קרקע, בלוקים לא להשאיל לשלוט מספיק ביישומים אלה. גישה מעודן אגר לחסום הכרחי. כאן, אנו משתמשים ריקבון חום עץ משפיל פטרייה Serpula lacrymans להשפיל עץ אגר לחסום מיקרוקוסמוס, באמצעות עמוק צלחות פטרי עם אגר סידן נמוכה. אנחנו בודקים את התפקיד של אקסוגניים גבס על ריקבון בסדרה פעמי, כדי להדגים את השירות ואת השתנות צפוי. רחובות אחד לוח לקרוע (חתך אורך) מותנים, שקל, autoclaved, והציג בסביבה נקייה מחיידקים, על גבי רשת פלסטיק. חיסונים פטרייתיים הם על הפנים כל בלוק, עם גבס אקסוגניים נוסף על ממשקים. היבולים הם aseptic עד הקציר הרסני הסופי. מיקרוקוסמוס אלה נועדו לחסום להימנע ממגע עם אגר או קירות פטרי צלחת. עיבוי ממוזער במהלך צלחת שופך במהלך הדגירה. לבסוף, inoculum / גבס / עץ המרווח ממוזער אך מבלי לאפשר קשר. אלה ההיבטים הטכניים של עיצוב פחות אגר לחסום גם הם הגורמים השכיחים ביותר של כישלון המקור המפתח של השתנות בין המחקרים. פרסום וידאו ולכן הוא שימושי במקרה הזה, ואנחנו מראים השתנות נמוך, תוצאות באיכות גבוהה.

וידאו זה מדגים גישה בסביבה מבוקרת ללמוד השפלה של רקמות הצמח lignocellulosic ידי פטריות אירובית. היכולת לשלוט במקורות מזין לחות היא יתרון המפתח של אגר, לחסום מיקרוקוסמוס, אך הגישה לרוב מניב הצלחה מעורבת. אנו כתובת החסרונות קריטי תשואה לשחזור, השתנות נמוך התוצאות.

אגר-Block מיקרוקוסמוס של פירוק רקמות הצמח מבוקרת על ידי פטריות אירובית

שתי השיטות העיקריות לחקר ביודגרדציה פטרייתית של רקמות צמחים ליגנו-צלולוזיות פותחו לצורך בחינת חומרי שימור לעץ (בדיקת בלוק קרקע; ...

המטרה הכללית של פרוצדורה זו היא להחדיר פטרייה אירובית מפרקת עץ למיקרוקוסמוס בצלחת פטרי, שבו לחות העץ ותשתי העשיר (exogenous substrates) נמצאים תחת בקרה הדוקה. מטרה זו מושגת תחילה על ידי הכנת מיקרוקוסמוסים עם נפחים מדויקים של מצעים ידועים. לאחר מכן, העץ המיועד לפירוק וכל תשתית מוצקה חיצונית מונחים מעל רשת פלסטיק על פני השטח של האגאר, מבלי לאפשר מגע בין התשתיות.לאחר מכן מחדירים למיקרוקוסמוס את הפטריית הבדיקה ומדגירים אותו. עם סיום הדגירה, קוצרים את גושי העץ כדי לקבוע את אובדן המסה ולהכין רקמות לצורך אנליזות. לבסוף, ניתן לקבל תוצאות המראות את מידת הביודגראדציה של העץ ואת תפקידם של מקורות אלמנטים חיצוניים באמצעות מדידות אובדן מסה, תצפיות על מורפולוגיית המיצליום ואנליזות אלמנטריות ממוקדות, כגון ספקטרוסקופיה של פלזמה מצומדת השראיתית (ICP).שלום, שמי ברוק ג'ייקובסון מהמעבדה של ד"ר ג'ונתן שילינג במחלקה להנדסת ביו-מוצרים ומערכות ביולוגיות באוניברסיטת מינסוטה. היום נראה לכם פרוצדורה לשימוש בצלחות פטרי כמיקרו-סביבות לפירוק רקמת צמחים על ידי פטריות אירוביות. אנו משתמשים בפרוצדורה זו במעבדתנו כדי לחקור את מנגנוני פירוק הליגנוצלולוז על ידי פטריות.ליגנוצלולוז הוא רקמה צמחית המורכבת מליגנין, תאית והמיצלולוז. הרקמה אותה אנו לומדים לעיתים קרובות ביותר היא עץ; טעויות בהיבטים הפחות טכניים של תכנון בלוק המקדח הן הגורמים השכיחים ביותר לכישלון ומקורות מרכזיים לשונות בין מחקרים, מה שהופך את פרסום הסרטון של מערך בלוק המקדח שלנו למועיל. אנו יודעים מניסיון שפרוצדורה זו מניבה תוצאות באיכות גבוהה עם שונות נמוכה.אם כן, נתחיל. עבור ניסויים אלו, השתמשו בצלחות פטרי העמוקות בסנטימטר אחד יותר מצלחות פטרי טיפוסיות, כדי להגדיל את המרווח מעל גוש העץ במיקרוקוסמוס.התחילו את הכנת המיקרוקוסמוס על ידי הכנת כמות מספיקה של מדיום עבור 20 מיליליטר לכל צלחת פטרי, ללא סידן וברזל. הוסיפו אגר בריכוז של 15 גרם אגר לבקבוק מדידה של 500 מיליליטר המכיל בערך 400 מיליליטר של מים דה-יוניים תומחים בתוספים. השתמשו בתמיסות מלאי שהוכנו מראש כדי להוסיף מיקרו-נוטריאנטים לתערובת.לאחר הוספת חומרי ההזנה, מלאו את הבקרה הנפחית עד לקו ה-500 milliliter. לאחר מכן, העבירו את המצע לבקרה של 1000 milliliter. בצעו עיקור באוטוקלאב בטמפרטורה של 121 degrees Celsius ובלחץ של 16 PSI למשך 20 דקות.הקפידו שלא לעבור נפח של 500 milliliters לכל בקבוק כדי למנוע את התגבשות ה-agri לפני הגשת פלטות הבדיקה. לאחר האוטוקלאב, המתינו עד שהמצע יתקרר למגע כדי למזער עיבוי. מזעור הלחות הוא קריטי בניסויים אלה, כפי שמוגדר כתכולת לחות או mc.מעל 80% יגרמו לאנוקסיה ברקמות. הגבילו את הריקבון על ידי פטריות אירוביות והגבירו את השונות פעם אחת. קררו. השתמשו בעזר פיפטה נייד ובפיפטות פוליסטירן סטריליות של 10 milliliter כדי לבצע את הפעולה באופן אספטי.העבירו את האגר לערימה גבוהה של צלחות בתוך קבינה לבטיחות ביולוגית. לאחר מכן, גזרו בנדיבות רשתות פלסטיק שיתאימו לתחתית הצלחות. לאחר הגזירה ושטיפה יסודית של הרשתות במים וסבון, הכינו את רשתות הפלסטיק לייבוש ולאוטוקלאב לצורך הדגמה זו.אותריח צהוב דרומי (Southern yellow pine או SYP) משמש במחקר זה כיוון שהוא מהווה מקור חשוב לעץ למסחר. בבנייה למגורים בארה"ב, השתמש בעץ שאינו מטופל וחתוך בלוקים נטולי קשרים בגודל 19 על 19 מילימטר מחיתוך א अनुדריך אחד לאורך הסיב. חתוך אורך זה לבלוקים של 19 מילימטר מעקוב.חלקו את הבלוקים בגודל 19 מילימטר מעקב בחצייה לאורך הסיבים באמצעות פסול ופטיש במקום מסור. פעולה זו תיצור קצה בלוק מחוספס שיהיה פונה כלפי מטה אל הרשת הפלסטית במיקרוקוסם של בלוק החקלאות, וקצה עליון חלק לסימון. סמנו את הקצה החלק של הבלוקים בעזרת עיפרון, חתכו מספיק בלוקים עבור הטיפולים, וכן עבור הביקורות ללא ההדבקה שישמשו הן כניטורים לזיהום והן כדגימות נתוני בסיס שיעברו התנייה במקביל עבור חומר מיובש בתנור; הניחו את הדגימות בתבניות גבינה מאלומיניום והכניסו לתנור קונבקציה בטמפרטורה של 100 degrees Celsius למשך 48 שעות.העבירו את הדגימות מהתנור למ desiccator לקירור. שקלו את הדגימות מראש כדי לקבוע את המשקל הראשוני לאחר ייבוש בתנור. לבסוף, הכינו את הדגימות, כולל רשתות פלסטיק ועץ, לאוטוקלאב על ידי עטוףה הדוקה בנייר כסף כדי למזער את ההרטבה.אין צורך לעטוף כל דגימה בנפרד, אך יש לוודא שהחשיפה לקיטור היא נמוכה ועקבית. בצעו אוטוקלב לדגימות המסומנות ב-121 degrees Celsius וב-16 PSI למשך שעה אחת. בתוך קבבית בטיחות ביולוגית סטרילית, הכינו AEs ריקים, פלטת מקור עבור תשתית צמחים רשתית של אינוקולום (inoculum), חומרים אקסוגניים, טוש Sharpie, רצועות פאראפורם, פינצטה וכלי העברה.השלב הבא של ההחדרה הוא הוספת הפריטים לצלחוני פטרי סטריליים כדי להקטין את הסיכון לזיהום. עטרו את כלי ההעברה והפינצטות בלהבה או ב-95% ethanol בעת השימוש בהם. ראשית, הוסיפו את רשת הפלסטיק לצלחון הפטרי.לאחר מכן, הוסיפו כאן את מצע העץ. שני בלוקי עץ מתווספים לאורך הרשת כדי שניתן יהיה להจับ נתונים מלקטים מוקדמים ומאוחרים. בלוקים אלו מתווספים זה לצד זה, כאשר הסיבים פונים לעבר מקור התוסיף הפטרייתי.בשלב הבא, הוסיפו את החומרים החיצוניים. כאן, נבחן את תפקידו של הגבס בתהליך הריקבון שנגרם על ידי פטרייה סיפית. לכן, על הפטרייה להיתקל בדיסקיות הגבס הללו לפני הגעתה לעץ.דיסקית גבס אחת מתווספת בין כל בלוק לנקודת接 inoculation בחלק העליון של הרשת. יש להקפיד על מניעת מגע בין הדיסקיות בתוך העץ, תוך שמירה על קרבה ביניהן. עבור התמצית הפטרייתית, השתמשו במקדח שעם מספר 4 בעלת קוטר של 7 מילימטר כדי להכין פלאגים מתרביותיות בנות שבועיים שגדלו ב-20 milliliters של agar.פעולה זו מסייעת לשלוט בנפח התוסיף. עבור ביקורות ללא תוסיף, מומלץ להוסיף פקק מתוך צלחת סטרילית. אין לאפשר מגע בין התוסיף לבין התשתיות החיצוניות או העץ, אך יש להניחם קרוב זה לזה.השתמשו בתקע הinoculum אחד לכל בלוק. אטמו את הצלחות באמצעות param שנגזר בסכין גילוח; החזיקו את הפלטות במצב אופקי ועטפו את ה-param בתנועה חלקה ורציפה. לבסוף, סמנו את מכסיי הצלחות באמצעות מרקר עמיד לאלכוהול, כאשר מספרי הבלוקים מסומנים ישירות מעל לתשתיות המתאימות.שרטטו גם עיגולים מעל דיסקיות הגבס. העבירו את הפלטות בזהירות לאנקובטור ביולוגי כדי למנוע ניעור של התכנים ולצמצם קונדנסציה עקב תנודות בטמפרטורה. התנאים המשמשים כאן הם 20 °C ובחושך; בצעו איסופים של סדרות זמן באופן אספטי, למעט באיסוף האחרון.בנקודת הקציר של השבוע החמישי, הוצא את כל מנת הטיפול. רסס כל צד תחתון ועליון ב-70% ethanol והשתמש בפינצטה שעברה עיקור בלהבה כדי להוציא חומר בתוך קבינת הבטיחות הביולוגית. צלם תמונות לפני השמדת צלחות הגידול (agri plates), תוך התמקדות בכל morph F או במלון.לאחר מכן הוצא את הבלוקים המיועדים לטיפול. גלל הלאה עודפי pha, אך היזהר לא לאבד חומר רקוב בתהליך. ייבש את הבלוקים בתבניות אלומיניום וקבע את אובדן המסה באמצעות המשקלים הרטובים והיבשים של הביקורות כדי לנטר ספיגה מוגברת.נתוני איבוד מסה מסייעים להערכת התקדמות הריקבון ומהווים נתונים חשובים. אם יש לחשב ריכוזים של יסודות על בסיס משקל בגרמים, יש לנרמל את נתוני האחוזים. לצורכי סטטיסטיקה, סמנו ועקבו אחר כל הבלוקים בעלי גוון חום כהה, שרוויים בבירור במים.לבסוף השמידו את התרביות בשקיות המתאימות לאוטוקלאב, תוך שמירה על רשת התמיכה מפלסטיק וכל רכיב אחר שניתן למחזר לשימוש בניסויים עתידיים. בשימוש במערך המיקרוקוסמוס של בלוקי חקלאות (agri block), בלוקי עץ אורן מונחים על רשת פלסטיק כדי להגביה את הבלוקים מעל מגע החקלאות. פטריות Crains מעגליות גדלו במגע ישיר עם משטחי הגבס ובתוך בלוקי העץ.מיצליום זה מייצג קשר חשוב בין עץ לבין מקורות חיצוניים של רכיבי תזונה. שליטה במקורות החומרים החיצוניים הללו באגר או בחומרים מוצקים היא יתרון מרכזי של תכנון בלוקי חקלאיים לעומת תכנון בלוקים של קרקע. כאן מוצגת אובדן המשקל הממוצע באחוזים כמדד להיקף ריקבון העץ על ידי ser crain's לאחר חמישה ו-15 שבועות של אינקובציה עם אורן במיקרוקוסמים של בלוקים חקלאיים.לא בוצעו טיפולים. התווסף סידן כלוריד בריכוז Five millimolar לאגר עם גבס בטוהר של יותר מ-99% או גבס מועשר ב-1% iron; עבור כל קציר, עמודות תחת אותה אות אינן שונות באופן מובהק. כאשר פסי השגיאה מייצגים את סטיית התקן, נצפתה הפסד משקל של יותר מ-60% בבלוקים של אורן עם ריקבון חום בקבוצת הביקורת, נתון העומד ביעד התקן של ה-American Society for Testing and Materials לריקבון של יותר מ-50%.מקדם השונות הממוצע של הריקבון היה 0.055 בשבוע 16. בנוסף לשונות נמוכה, נצפה אפקט טיפולי. ריקבון פטרייתי נבלם באמצעות תוספות סידן, בין אם הוספו לאגר כסידן כלורי או כגבס טהור.באופן מעניין, שיעורי הריקבון התאוששו עם הוספת ברזל לגבס. הדבר מרמז כי ברזל, ולא סידן, הוא הגורם הקריטי בתצפיות על חמשת החזרות בשבוע ה-15 של הריקבון. בבדיקת פטריית ריקבון חום דומה, למינאות מעגליות, צבע המיצליום חושף את המהות.הבדלים בהיפים חיצוניים בין הטיפולים; הבלוקים הוסרו ויובשו. הדבר חשף את המחסור במיצין בטיפול נטול סידן. ההצהבה בטיפולי סידן טהור והמראה החלוד בטיפול עם תוספת ברזל.הביקורת מייצגת בלוקים שלא הוכנסו פטריות לצורך השוואה. באופן מעניין, ההשפעות המרכזיות הולכות לאיבודים בשימוש במצע עשיר בברזל. יחד, הדבר מרמז כי פטרייה זו מנצלת ברזל, ולא סידן.בחומרים אלו, הצגנו כיצד להשתמש במערך בלוקי קידוח (auger block) כדי לבחון בהצלחה את הbiodegradation של רקמות צמחים על ידי פטריות חוטיות אירוביות. בעת ביצוע הליך זה, חשוב לזכור למנוע מגע בין התשתיות, ובמיוחד בין רקמת הצמח לקידוח, למזער את תכולת הלחות מהקידוח ומהפלטות, ולוודא שוב שתוכנן של כל פלטה לא זז לפני האינקובציה. כאשר לוקחים משתנים אלו בחשבון, ניתן לשלוט בסביבת הריקבון בצורה טובה הרבה יותר מאשר בשימוש במערך בלוקי קרקע.ניתן להפיק נתונים עם עוצמה סטטיסטית הדרושה למענה על שאלות המחקר שלכם. זהו זה. תודה לצפייה ובהצלחה בניסויים.

agar-block-microcosms-for-controlled-plant-tissue-decomposition

Research

JoVE Journal

Biology

ביולוגיה

סרטי פלסטיק שכותרתו "מתכלה" זמינים מסחרי לשימוש חקלאי כmulches. עבוד האדמה מייצגת שיטת סילוק אטרקטיבית, אבל השפלה בתנאי שדה הוא הבין היטב. מטרתו של מחקר זה הייתה לפתח שיטות לבידוד פטריות וחיידקים אדמת מולדת שליישב סרטים מאלצים פלסטיק לאחר קבורת שדה.

בידוד של מיקרואורגניזמים באדמה אינדיאני עם פוטנציאל לפירוק סרטים מאלצים פלסטיק מתכלים המשמש בחקלאות

מאמר זה מתאר מפורטת פרוטוקולים עבור ייצור המערכת האקולוגית של התקנים (EcoFABs) המאפשרים את הלימודים של הצמחים והאינטראקציות צמח-חיידק בתנאי מעבדה מבוקרת מאוד.

המערכת האקולוגית פרוטוקולים פבריקציה נוספת (EcoFAB) להקמת מערכות אקולוגיות מעבדה שנועדה ללמוד אינטראקציות צמח-חיידק

כמו אורגניזמים אנאירובית מחייב אינם מסוגלים לצמוח על החשיפה לחמצן, השימוש של טכניקות culturing אנאירובית הוא הכרחי. כאן, אנו להדגים שיטה פשוטה ויעילה לטפח תרבות מעורבת נגזר צמח ביוגז מפני התקשורת הכנה גז וכימות חומצות שומן נדיף.

הכנה בינונית לטיפוח מיקרואורגניזמים בתנאים אנאירובית/אנקסימית בלבד

כאן אנו מציגים פרוטוקול לבדיקת המגוון הביולוגי בקרקע כדי לחפש זנים פטרייתיים המעורבים בפירוק של חומרים סרבנים. ראשית, זנים פטרייתיים המסוגלים לגדול על חומצות הומיות או ליגנוצלולוז מבודדים. פעילותם נבדקת לאחר מכן הן במבחנים אנזימטיים והן במזהמים כגון פחמימנים ופלסטיק.

בידוד וסינון מהמגוון הביולוגי בקרקע עבור פטריות המעורבות בהתדרדרות של חומרים סרבנים

בשל האטימות של האדמה, לא ניתן לדמיין בקלות אינטראקציות בין המיקרובים המרכיבים אותה עם רזולוציה תאית. כאן מוצגים שני כלים מיקרופלואידיים, המציעים הזדמנויות חדשות לחקר אינטראקציות פטרייתיות-מיקרוביאליות. המכשירים הם רב-תכליתיים ופשוטים לשימוש, ומאפשרים שליטה מרחבית-טמפורלית גבוהה והדמיה ברזולוציה גבוהה ברמה התאית.

כלים מיקרופלואידיים לחקר אינטראקציות פטרייתיות-מיקרוביאליות ברמה התאית

במאמר זה אנו מתארים טכניקה פשוטה וזולה לחיסון והתבוננות בפטריות מיקוריזה ארבוסקולריות במערכות אוטוטרופיות סופר-סופגות מבוססות פולימרים.

חיסון והתבוננות בתרביות מיקוריזה ארבוסקולריות על מערכות אוטוטרופיות מבוססות פולימרים סופר-סופגים

אנו מציעים פרוטוקול מיקרוסקופ אלקטרונים סורק אופטימלי להדמיית דגימות הטרוגניות ועדינות ביותר המכילות ביומסה צמחית ופטרייתית, יחד עם מיקרוביוטה וביופילם. פרוטוקול זה מאפשר לתאר את הממדים המרחביים של ארגון המיקרוביוטה.

מיקרוביוטה של גני נמלים אטיין: הדמיה של נוף מיקרוביאלי על ידי סריקת מיקרוסקופ אלקטרונים

פרוטוקול זה מפרט את הרכבת מערכי מיני-ביו-ריאקטור שישמשו לתרבית זרימה רציפה של קהילות צואה מורכבות בתנאים אנאירוביים. אנו דנים גם בשיטות ההרכבה, החיסון והדגימה של הכורים להמשך ניתוח.

מכלול ביו-ריאקטור לתרבית מתמשכת של קהילות צואה מורכבות

כאן, אנו מציגים מתודולוגיה אופטימלית לייצור חומרים מרוכבים מבוססי תפטיר (MBC) מפטרוכימיקלים וחומרים מזהמים ליישומי בידוד תרמי. כדי להפוך לניטרלי פחמן ובר קיימא, חומרים מבוססי ביו וניתנים לקומפוסטציה כמו תפטיר ביו-מרוכב יכולים להיות הפתרון. כדי לקבוע אם הם עומדים בתקני הבנייה, נערכו מספר ניסויים.

ייצור ובדיקה של התנהגות לחות ותכונות תרמיות של קש לפתית וביו-קומפוזיטים של תפטיר Ganoderma resinaceum

אנו מציגים בלוק גרדיאנט טמפרטורה ומפרטים את בנייתו ושימושו. הבלוק מספק 22 טמפרטורות נפרדות, המפוזרות ליניארית בין טווח מוגדר על ידי המשתמש בין 0 ל-90 מעלות צלזיוס.  הנתונים שנאספו מהמערכת הזו מאפשרים לבדוק ולפתח תיאוריות חדשות על תגובת הטמפרטורה של קצב פירוק חומר אורגני בקרקע.

תגובת טמפרטורה של קצבי פירוק חומר אורגני בקרקע: בנייה ויישומים של בלוק גרדיאנט טמפרטורה

למד את שיטת מיקרוקוסמוס אגר-בלוק לחקר פירוק עץ על ידי פטריות אירוביות בשליטה מלאה על לחות וחומרי מצע חיצוניים. שיטה זו מאפשרת תוצאות ברמת שחזור גבוהה לביולוגיה של פטריות ואקולוגיה מיקרוביאלית.

אגר-Block מיקרוקוסמוס של פירוק רקמות הצמח מבוקרת על ידי פטריות אירובית

גלה סרטונים נוספים