$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
המיטוכונדריה, האברונים הציטופלזמיים הידועים כתחנות הכוח של התא, עוברים שינויים מבניים ותפקודיים דרסטיים במהלך התקדמות הסרטן.
כדי לבודד מיטוכונדריה, קחו רקמה סרטנית נקייה בכלי זכוכית וטחנו אותה לחתיכות קטנות. העבירו את החלקים לצינור המכיל מאגר בידוד מיטוכונדריאלי. הומוגניזציה של הדגימה כדי לשבש את התאים ולשחרר את תוכנם, כולל האברונים.
צנטריפוגה את התערובת במהירות נמוכה. זה מגלגל את הרכיבים הצפופים יותר כמו גרעינים, פסולת רקמות וכל תא שלם, ומשאיר רכיבים פחות צפופים כמו מיטוכונדריה, מיקרוזומים, פרוקסיזומים וליזוזומים בסופרנטנט. אוספים את הסופרנטנט והצנטריפוגה במהירות גבוהה. מיקרוזומים, בהיותם קלים יחסית, נשארים בסופרנטנט, בעוד שהחלק הגולמי המכיל מיטוכונדריה מתגלגל בתחתית.
הסר את ה-supernatant והשהה מחדש את הגלולה במדיום שיפוע צפיפות מתאים. הגדר שיפוע צפיפות לא רציף על ידי שכבות השבר המיטוכונדריאלי הגולמי בתוך מדיות צפיפות שונות, וסידורם בסדר יורד של צפיפות מלמטה למעלה. צנטריפוגה במהירות גבוהה מאוד. אברונים נפרדים בתוך הצינור כדי לאמץ עמדת שיווי משקל על סמך הצפיפות היחסית שלהם. אסוף את השבר המיטוכונדריאלי שנוצר בממשק בין אמצעי הצפיפות, המכיל פרוקסיזומים וליזוזומים.
כדי להתחיל בהליך זה, הכינו 250 מיליליטר של מאגר הבידוד המיטוכונדריאלי כמתואר בפרוטוקול הטקסט. מניחים כ -1.5 גרם רקמות סרטן השחלות בכלי זכוכית נקי. הוסף 2 מיליליטר של חוצץ בידוד מיטוכונדריאלי מקורר מראש כדי לשטוף קלות את הדם מפני השטח של הרקמה. חזור על שטיפה זו שלוש פעמים.
לאחר מכן, השתמש במספריים עיניים נקיים כדי לטחון את הרקמה במלואה לחתיכות בגודל של כמילימטר מעוקב ולהעביר את הרקמות הטחונות לצינור צנטריפוגה של 50 מיליליטר. הוסף 13.5 מיליליטר של מאגר בידוד מיטוכונדריאלי המכיל נגארס בריכוז של 0.2 מיליגרם למיליליטר. השתמש בהומוגנייזר חשמלי כדי להומוגניזציה של הרקמות הטחונות למשך שתי דקות בחום של 4 מעלות צלזיוס.
לאחר מכן, הוסף עוד 3 מיליליטר של מאגר בידוד מיטוכונדריאלי להומוגנטים של הרקמות וערבב אותם היטב על ידי פיפטינג. צנטריפוגה הרקמה המוכנה הומוגנית ב -1,300 x גרם וב -4 מעלות צלזיוס למשך 10 דקות. הסר את הכדור ושמור את הסופרנטנט.
לאחר מכן, צנטריפוגה את הסופרנטנט ב-10,000 x גרם וב-4 מעלות צלזיוס למשך 10 דקות. הסר את הסופרנטנט המכיל מיקרוזום ושמור את הגלולה. הוסף 2 מיליליטר של מאגר בידוד מיטוכונדריאלי והשהה מחדש את הגלולה ביסודיות על ידי פיפטינג קל.
צנטריפוגה מתלה גלולה זו ב-7,000 x גרם וב-4 מעלות צלזיוס למשך 10 דקות. השליכו את הסופרנטנט ושמרו את הגלולה, המכילה את המיטוכונדריה הגולמית. הוסף 12 מיליליטר של מדיום שיפוע בצפיפות של 25% כדי להשעות מחדש את המיטוכונדריה הגולמית המופקת. צור שיפוע צפיפות לא רציף המכיל את המיטוכונדריה הגולמית המרחפת, כמתואר בפרוטוקול הטקסט, וצנטריפוגה אותו ב-52,000 x g וב-4 מעלות צלזיוס למשך 90 דקות.
השתמש במזרק ארוך וקהה כדי לאסוף את המיטוכונדריה המטוהרת בממשק בין המדיומים השיפועים של 25% ל-30% והעביר אותם לצינור נקי. הוסף מאגר בידוד מיטוכונדריאלי למיטוכונדריה שנאספה כדי לדלל אותו לנפח פי שלושה. צנטריפוגה ב-15,000 x גרם וב-4 מעלות צלזיוס למשך 20 דקות. השליכו את הסופרנטנט ושמרו את הגלולה. אוספים את הגלולה הסופית, המכילה את המיטוכונדריה המטוהרת, ומאחסנים אותה במינוס 20 מעלות צלזיוס.