$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
בחלק מההפרעות הנוירודגנרטיביות, החלבון הקשור למחלה מורכב מפוליגלוטמין מורחב, polyQ, דרכי - מחרוזת של שאריות גלוטמין עוקבות - והוא תואם באופן חריג. הקונפורמציה הלקויה מערערת את ההומאוסטזיס של החלבון, גורמת להצטברות חלבון ולהיווצרות אגרגטים רעילים, מה שמוביל לתפקוד לקוי של העצבים ולמוות.
כדי לסנן את יכולת ההגנה של תרכובת בדיקה בהקלה על פרוטאוטוקסיות הקשורה לצבירת polyQ, השג השעיה של זחלי Caenorhabditis elegans טרנסגניים המבטאים חלבוני polyQ מתויגים פלואורסצנטיים בתאי שריר דופן הגוף.
קח צלחת מרובת בארות המכילה מדיה בתוספת מזון חיידקי. הוסף את תרכובת הבדיקה בסט בארות אחד. העבירו את הזחלים לצלחת מרובת הבארות. אטום את הצלחת כדי למנוע התייבשות מדיה וזיהום מיקרוביאלי. דגירה, מה שמאפשר לזחלים לגדול לבוגרים.
במהלך ההתפתחות, ככל שהנמטודה מזדקנת, חלבוני polyQ מצטברים בהדרגה בתוך תאי השריר ויוצרים אגרגטים.
אם תרכובת הבדיקה קיימת במדיה, היא נכנסת לתאי השריר, ובהתאם ליכולת ההגנה שלה, עלולה להפעיל אפקט צבירה אנטי-polyQ, לדכא ולעכב צבירת polyQ.
קצרו את הנמטודות והצנטריפוגות הבוגרות. השעו מחדש את הנמטודות הכדוריות. מעבירים לצלחת מרובת בארות. לשתק את הנמטודות באמצעות נתרן אזיד.
בעזרת מכשיר פלואורסצנטי ברזולוציה גבוהה, ספרו את הפונקטה הפלואורסצנטית, המייצגת אגרגטים של polyQ, לכל נמטודה.
מספר ממוצע נמוך יותר של אגרגטים של polyQ בטיפול מאשר בארות בקרה מצביע על יכולת הגנה גבוהה יותר של תרכובת הבדיקה בהקלה על פרוטאוטוקסיות הקשורה לצבירת polyQ.
התחל בהעברת 300 עד 500 זחלי L1 מסונכרנים של נמטודות AM141 לכל באר של צלחת של 48 בארות עם 500 מיקרוליטר של מדיום S המכיל זן OP50 של E. coli, וחמישה מיליגרם למיליליטר של אסטרגלן. אטמו את הצלחת עם פרפילם, ודגרו אותה בטמפרטורה של 20 מעלות צלזיוס ו -120 סיבובים לדקה למרווחי זמן רצויים.
העבירו את הנמטודות בצינור מיקרו-צנטריפוגה סטרילי של 1.5 מיליליטר, ושטפו עם מאגר M9 שלוש פעמים על ידי צנטריפוגה, כדי להסיר את תאי ה-OP50 הנותרים. לאחר מכן, השעו מחדש את נמטודות AM141 במאגר M9.
כעת, העבירו 10 עד 15 נמטודות לכל באר בצלחת של 384 בארות, קבעו 10 בארות משוכפלות לכל טיפול, והוסיפו 10 מיקרוליטרים של 200 מילי-מולרי נתרן אזיד לכל באר, כדי לשתק את הנמטודות על ידי מתן אפשרות להן להתיישב לקרקעית.
הנח את הלוח במערכת הדמיה בעלת תוכן גבוה כדי לקבל תמונות פלואורסצנטיות. פתח את התוכנה לרכישת תמונות והגדר את הפרמטרים המוזכרים בכתב היד של הטקסט. נתח את נתוני התמונה על ידי פתיחת "Review נתוני לוחית" חלון ובחירת "לוחית בדיקה" לניתוח תמונה.
לחץ פעמיים על מאגר בדיקה כדי להציג את התמונה שלו. לאחר מכן, בחר ב"ספירת גרעינים" כשיטת הניתוח, ולחץ על כפתור "הגדר הגדרות". הגדר את תמונת המקור מערוץ FITC ובחר באפשרות "אלגוריתם סטנדרטי".
הגדר את פרמטרי ניתוח התמונה כמתואר בכתב היד של הטקסט, ובדוק אותם כדי לייעל את שיטת הניתוח. שמור את ההגדרות והפעל את הניתוח על כל הבארות. ייצא את "סך הגרעינים "כמספר הכולל של אגרגטים Q40::YFP בכל באר.
ספרו את מספר הנמטודות בכל באר, וחשבו את המספר הממוצע של אגרגטים Q40::YFP לכל נמטודה בכל קבוצה. לאחר מכן, חשב את מדד העיכוב.