Name: כימות של קולוניזציה Sporogenesis פטרייתי, ולאחר הפקה של mycotoxins שימוש bioassays-Kernel (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2012-04-23T13:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 1 s
Description: למד כיצד לכמת ביוסינתזה של מיקוטוקסינים וצמיחת פטריות בזרעים באמצעות ביואסיי גרעינים. שיטה זו מאפשרת ניתוח אינטראקציות בין זרעים לפטריות מזיקות ותורמת להגנת יבולים.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

אנו רוצים להודות ברנדון הסאט וקרלוס אורטיז לקבלת סיוע טכני שלהם. עבודה זו נתמכה על ידי מענקים NSF IOB-0544428, IOS-0951272, ו IOS-0925561 ד&quot;ר מיכאל Kolomiets, ועל ידי משרד החקלאות המכון הלאומי המזון והחקלאות (NIFA), גידול הצמח AFRI וחינוך גרנט # 2010-85117 ל -20,539 בני הזוג. סת מוריי, תומאס Isakeit, ו Kolomiets מייקל.

1. ליבה תירס המבדק <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שבועיים לפני, תרבות של פתוגנים פטרייתיים על אגר תפוחי אדמה דקסטרוז (PDA) ב 28 מעלות ג </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בחר גרעינים עם גודל צורה דומה, רצוי שטוח כך הם שכבו עם רמת התחתון של צלוחיות המבדק, ומכניסים 50 מ&quot;ל צינורות פלקון. גרעינים שנבחרו חייבים הופקו במקביל בסביבה אותו כדי להבטיח גיל הזרע דומה והרכב המטבוליט. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פני השטח לעקר גרעיני על ידי ניעור צינורות בטמפרטורת החדר במשך 5 דקות עם אתנול 70%, 1 דקה עם מים סטריליים, ו -10 דקות עם hypochlorite נתרן 6%. יש לשטוף, שלוש פעמים, במשך 5 דקות בכל פעם, עם מים סטריליים תוך רעד מתמשך. פאט גרעינים יבשים על מגבות autoclaved. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי להקל על דלקת של אספרגילוס flavus, ליצור פצע קטן בצד, העובר עם מחט 18 G עד לעומק של 0.5 ס&quot;מ. עם זאת, מניסיוננו פצע גדול דרוש זיהום verticillioides Fusarium. הerefore, השתמש בסכין גילוח כדי לחתוך בצד העובר בעומק של 0.5 מ&quot;מ. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן את ההשעיה הבידוד על ידי גירוד צלחות בתרבית על 5 מ&quot;ל של תמיסת autoclaved tween-20 0.01% לשחרר נבגים ולהסיר תפטיר על ידי כוח המשיכה סינון דרך לפחות 4 שכבות של אריג autoclaved. חישוב ריכוז נבג עם hemocytometer ולהתאים את 10 6 נבגים למ&quot;ל של א &#39; flavus או פ verticillioides. אם אתה משתמש מינים אחרים של הפתוגן או המארח, חשוב להעריך ריכוזים של הבידוד לזיהום המתאים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יצירת תא לחות במיכל פלסטיק (29.2 ס&quot;מ X 18.7 ס&quot;מ X 8.3 ס&quot;מ) ובו חמישה גיליונות של נייר סופג או 100 מ&quot;ל של מים סטריליים. לשכת הוא לא מים או אוויר חזק מים נוספים יש להוסיף במהלך הניסוי לשמור על מגבות נייר לחות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מקום ארבעה גרעינים לתוך בקבוקון autoclaved 20 מ&quot;ל נצנץ זכוכית להקליט המסה שלהם. לחסן עם ההשעיה 200 μl נבג,כובע, ואת המערבולת באופן שווה גרעיני מעיל עם ההשעיה. שחרר כמוסות באופן חופשי ולאפשר חילופי האוויר במקום לחדר לחות. </li></ol> הערה: זרעים או פטריות אחרות מאלו המתוארות במסגרת שיטות אלו, כמות הבידוד הנדרש עשויים להיות שונים ויש נגזרת באופן ניסיוני. <ol start="8" style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגירה גרעיני תחת photoperiod 12-h-light/12-h-dark על 28 מעלות צלזיוס למשך 7 ימים או עד הרצויה. </li></ol> 2. נבגי ספירת <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר תקופה זיהום, מוסיפים 5 מ&quot;ל של autoclaved 0.01% Tween-20 כדי בקבוקונים המכילים גרעינים נצנץ נגוע מערבולת היטב במשך דקה 1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> משתמש קצה פיפטה רחב משעמם, מיד לדלל על ידי העברת שני נפרדים aliquots 200 μl של השעיה נבג לתוך צינורות 2.0 מ&quot;ל Eppendorf המכילים 1.8 מ&quot;ל של 0.01% tween-20 (או לדלל לפי הצורך בהתאם זיהום). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> למנות כל aliquot 200 μl פעמיים עם hemocytometer 4ולהשוות את הרמות של נבגי בין הטיפולים. </li></ol> 3. אפלטוקסין כימות <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף גרעיני מדגם 1-50 מ&quot;ל בבלנדר כוס עם 20 מ&quot;ל של מתנול 80% ו - 0.05 גרם NaCl, מכסים בתערובת במהירות גבוהה במשך דקות 1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים נייר פילטר מחורץ על כלי אוסף נקי לשפוך תמצית לתוך מסנן. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להעביר 10 מ&quot;ל של תסנין לכלי נקי, מוסיפים 20 מ&quot;ל מזוקקים H 2 O, ומערבבים היטב. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מדגם סינון דרך פילטר זכוכית microfibre 1.5 מיקרומטר לתוך כוס נקייה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> החל 1 מ&quot;ל של מיצוי מסונן לעמודה מבחן Afla, באמצעות אוויר דחוס, לאלץ את תמצית מסוננת דרך העמודה בקצב של 1-2 טיפות / שנייה עד שרוקנו. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף את הטור פעמיים עם 1 מ&quot;ל של H 2 O מזוקקים ולעבור טור ב 1-2 ירידה / 2 עד שהאוויר מגיע דרך. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> טור Elute עם מתנול 1ml של 100% HPLC כיתה ב 1-2 ירידה / שיעור 2 אסף לתוך קובט זכוכית. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להוסיף1 מ&quot;ל של מפתחים מבחן Afla כדי eluate ומערבבים היטב. מקום קובט אל fluorometer מכויל ולקרוא על 60 שניות. </li></ol> הערה: בעת שימוש בפרוטוקול Aflatest FGIS, מדידה מ fluorometer מחושב על בסיס של 50 גרם הראשונים של המדגם שחולצו ל -100 מ&quot;ל. אם לוקחים בחשבון דילול של המדגם עם מים, 1 מ&quot;ל להחיל עמודה מייצגת 0.166 גרם של המדגם. לכן, כאשר שינוי פרוטוקול, אתה צריך לקחת בחשבון את הבדלי גודל המדגם והפתרון החילוץ הראשוני. כך, למשל, 2 גרם של גרעינים מופקים ב 20 מ&quot;ל מתנול 80%. זה 0.1 גרם / מ&quot;ל. כאשר 1 מ&quot;ל של דגימה זו הוא מעורבב עם 2 מ&quot;ל מים, שיעור מדגם בנוזל עכשיו 0.033 גרם / מ&quot;ל. אם מדגם זה נותן קריאה fluorometer של ppb 100, ריכוז בפועל מבוסס על שיעור של מדגם 0.166, כלומר, ppb = (0.166 X 100 גרם ppb) / 0.1 גרם), או 166 ppb. עבור אפלטוקסין quantifi אלטרנטיביתשיטות קטיון, ראה התייחסות 7. 4. Fumonisin B1 (FB1) ניתוח <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כאשר הפטרייה הוא גדל על גרעיני תירס, לחלץ דגימות לילה עם 10 מ&quot;ל של אצטוניטריל / מים (50/50, נ / V) בטמפרטורת החדר, ללא התרגשות. לאחר מכן, לערבב את תמצית (2 מ&quot;ל) עם מים deionized (6 מ&quot;ל), ולהחיל את תמהיל (8 מ&quot;ל) ישירות מיצוי שלב C-18 מוצק. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לפני טעינת המדגם, תנאי החילוץ C-18 מוצקים בשלב בטור על ידי שטיפה עם 2 מ&quot;ל של אצטוניטריל ואחריו 2 מ&quot;ל מים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר טעינת לדוגמה, העמודה נשטף עם 2 מ&quot;ל מים ואחריו 2 מ&quot;ל של אצטוניטריל / מים (15/85 V / V). לדוגמה עבור HPLC ניתוח (המכיל FB1) הוא eluted עם 2 מ&quot;ל של אצטוניטריל / מים (70/30 V / V). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Derivatize FB1 עם O-phthaldehyde (OPA) על ידי העברת 0.1 מ&quot;ל של eluate עמודה בקבוקון המכיל 0.1 מ&quot;ל borate חיץ (0.05 מ &#39;בור acid/0.05 M נתרן borate [50/50, נ / v], pH 8.5) ו - 0.1 OPA מ&quot;ל (0.1 מ&quot;ג / מ&quot;ל ​​ב acetonitrile עם 0.5% - mercaptoethanol). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לעצור את התגובה לאחר 10 דקות על ידי הוספת 0.5 מ&quot;ל של acetonitrile/0.01 M בור חומצה (40/60, נ / V). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ניתוח FB1 על מערכת HPLC LC-20AT Shimadzu מצויד טור Zorbax ODS אנליטית (4.6 150 מ&quot;מ) אורך גל משתנה Shimatzu RF-10Axl גלאי הקרינה (עירור 335 ננומטר / פליטה 440 ננומטר). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שיפוע ליניארית משמש (ממס: acetonitrile/0.1 M פוספט נתרן (40/60), pH 3.3, ב ממס: אצטוניטריל / M 0.1 פוספט נתרן (60/40), pH 3.3) ואת תוכנית שיפוע הוא כדלקמן: 100% ל-B של 100% ב 10 דקות, 100% עבור 5 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ניתוח FB1 סטנדרטים ידי HPLC, מדידות שטח שיא משמשים ליצירת עקומת סטנדרטי. לאחר מכן, לכמת FB1 רמת במדגם על ידי השוואת שטחים שיא עם עקומת FB1 סטנדרטי. </li></ol> 5. Ergosterol ניתוח <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תרבות פטרייה על גרעיני תירס על 7-14 ימים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר תקופת הדגירה, להוסיף 10 מ&quot;ל של כלורופורם: ספידanol (02:01, V / V) בבקבוקון אחד. לאחר ההוספה, לנער היטב דגימות ואז דגירה צלוחיות בחושך בטמפרטורת החדר למשך 24 שעות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר 24 שעות, צנטריפוגות מדגמים, ולאסוף supernatant ולסנן אותה דרך הממברנה 0.45 ניילון אום. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להזריק מדגם ישירות לתוך מערכת HPLC LC-20AT Shimadzu מצויד עמודה 4.6 ODS-C18 U (200 א, 250 ± 4.6 מ&quot;מ) Shimadzu SPD-20A UV / VIS גלאי להגדיר כדי לפקח על 282 ננומטר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש מתנול (100%) בקצב זרימה של 1.5 mL / min כשלב הנייד. לקבוע כימות ergosterol בדגימות על ידי השוואת שטחי שיא של דגימות כדי עקומת סטנדרט שנוצר HPLC כיתה ergosterol. </li></ol> 6. נציג תוצאות בעקבות חיסון ו הדגירה בתא לחות על שניים עד שלושה ימים, גידול פטרייתי צריך להתחיל להופיע על הגרעינים. שבעה ימים שלאחר הטיפול, גידול צמח על צמחים שטופלו צריך להיות בבירור, whilפקדי דואר מדומים צריך להיות נגוע (איור 1 ב, למעלה). תקופות של דגירה עוד הם תורמת לצמיחה צמח שופע יותר (איור 1 ב &#39;, למטה). בתנאים המתוארים לעיל (איור 2G), א &#39; flavus wild-type NRRL 3357 ערכים מרביים המוצגים של קולוניזציה, הצטברות אפלטוקסין, וייצור נבגים בבית 8, 6, ו 8 ימים, בהתאמה (איור 2, AC). עם זאת, כאשר זיהום mycotoxin ו conidiation הושוו ליחידת ergosterol, הרמות הגדולים ביותר נצפו ב 4 ו 6 ימים, בהתאמה (איור 2, DE). איור 2F מסכם אלה פטרייתיים ביומסה תלויי היותר בעלי ערך תצפיות. מעניין לציין, כי בין 4-6 ימים לאחר חיסון, הגרעינים עוברים השפלה חומצות גרעין, כפי שניתן לראות על ידי RNA הכולל דוגמאות על קורס בזמן (איור 2H, למטה). מספר מחקרים, כולל שלנו, יש examinאד פ verticilliodies על זיהום גרעיני תירס 2,8,9,10,11,12 ומשמש בהצלחה 7-13 ימים עם הזמן נקודות לתצפיות. שימוש בשיטות המתוארות להלן, fumonisin רמות נע בין 3,500-8,000 ng / g טווח הקרנל 4,13 ורמות ergosterol של 5,000-10,000 ng / g הקרנל 14,13. איור 3 מציג פסגות נציג עבור fumonisin (למעלה) ו ergosterol (התחתון ) מ-HPLC chromatograms. מדידת ergosterol יכול גם להיות דרך ספקטרום ספיגת 15. <img alt="איור 1" src="/files/ftp_upload/3727/3727fig1.jpg" /> באיור 1. תרשים זרימה כימות של ביומסה sporogenesis פטרייתי, וייצור mycotoxin ותוצאות נציג לצמיחה צמח מ bioassays ליבה. א) תרשים זרימה מתאר את השיטה המתוארת על כימות של פרמטרים ביולוגיים בסיסיים להערכת הפתוגנזה פטרייתי על גרעיני תירס. ב) נציגהתוצאות עבור bioassays ליבה. למעלה, א flavus (NRRL3357) גידול צמח על גרעיני תירס ברקע הגנטי B73. הזרעים היו מחוסן עם 200 μl של 10 נבגים 6 / mL והתמונות נלקחו 7 ימים חיסון הודעה. בתחתית, פ verticillioides מחוסן הגרעינים ברקע B73 13 יום שלאחר זיהום. הגרעינים היו מחוסן עם 200 μl של 10 6 נבגים למ&quot;ל. <img alt="איור 2" src="/files/ftp_upload/3727/3727fig2.jpg" /> 2. איור אספרגילוס הקרנל flavus המבדק זמן כמובן. B73 הגרעינים היו מחוסן עם μl 200 של 10 מ&quot;ל / 6 נבגים אספרגילוס ההשעיה flavus הנבגים ו מודגרת למשך 2-8 ימים (G). כל הערכים נקבעו לעומת ממוצע משקל יבש של 4 גרעיני (n = 3-4, ממוצע ± SE). א) ההתיישבות (על בסיס ergosterol), (ב) אפלטוקסין, ו (ג) conidiation היו לכמת בשיטות שתוארו לעיל. E) ו אפלטוקסין (F) conidiation מוצגיםכפונקציה של ביומסה פטרייתי, כפי שהיא נמדדת באמצעות ה ergosterol. F) ערכים מרביים עבור ergosterol, הצטברות אפלטוקסין, ו conidiation כפונקציה של ביומסה פטרייתי - ערכים מרביים עבור כל כמות ציין נקבע על 100%. (ג) 1 מיקרוגרם לכל נתיב של RNA הכולל כמובן בזמן. <img alt="איור 3" src="/files/ftp_upload/3727/3727fig3.jpg" /> איור 3. הנציג העליון נוזלי ביצועים כרומטוגרפיה (HPLC) chromatograms עבור fumonisin B1 (למעלה) ו ergosterol (למטה) מבודד גרעינים נגועים verticillioides Fusarium (M3125).

<ol><li>Tsitsigiannis, D. I., Keller, N. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oxylipins+as+developmental+and+host-fungal+communication+signals%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Oxylipins as developmental and host-fungal communication signals.</a> Trends Microbiol. 15, 109-118 (2007).</li>
<li>Gao, X., Shim, W. -B., Göbel, C., Kunze, S., Feussner, I., Meeley, R., Balint-Kurti, P., Kolomiets, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Disruption+of+a+maize+9-lipoxygenase+results+in+increased+resistance+to+fungal+pathogens+and+reduced+levels+of+contamination+with+mycotoxin+fumonisin%5BTitle%5D)+AND+%22Mol.+Plant-Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Disruption of a maize 9-lipoxygenase results in increased resistance to fungal pathogens and reduced levels of contamination with mycotoxin fumonisin.</a> Mol. Plant-Microbe Interact. 20, 922-933 (2007).</li>
<li>Brodhagen, M., Tsitsigiannis, D. I., Hornung, E., Goebel, C., Feussner, I., Keller, N. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reciprocal+oxylipin-mediated+cross-talk+in+the+Aspergillus+-+seed+pathosystem%5BTitle%5D)+AND+%22Mol.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Reciprocal oxylipin-mediated cross-talk in the Aspergillus - seed pathosystem.</a> Mol. Microbiol. 67, 378-391 (2008).</li>
<li>Gao, X., Brodhagen, M., Isakeit, T., Brown, S. H., Göbel, C., Betran, J., Feussner, I., Keller, N. P., Kolomiets, M. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Inactivation+of+the+lipoxygenase+ZmLOX3+increases+susceptibility+of+maize+to+Aspergillus+spp%5BTitle%5D)+AND+%22Mol.+Plant-Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Inactivation of the lipoxygenase ZmLOX3 increases susceptibility of maize to Aspergillus spp.</a> Mol. Plant-Microbe Interact. 22, 222-231 (2009).</li>
<li>Gao, X. Q., Kolomiets, M. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Host-derived+lipids+and+oxylipins+are+crucial+signals+in+modulating+mycotoxin+production+by+fungi%5BTitle%5D)+AND+%22Toxin+Rev%22%5BJournal%5D)">Host-derived lipids and oxylipins are crucial signals in modulating mycotoxin production by fungi.</a> Toxin Rev. 28, 79-88 (2009).</li>
<li>Mukherjee, M., Kim, J. -E., Park, Y. -S., Kolomiets, M. V., Shim, W. -B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulators+of+G+protein+signaling+in+F.+verticillioides+mediate+differential+host-pathogen+responses+on+non-viable+versus+viable+maize+kernels%5BTitle%5D)+AND+%22Mol.+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Regulators of G protein signaling in F. verticillioides mediate differential host-pathogen responses on non-viable versus viable maize kernels.</a> Mol. Plant Pathol. 12, 479-491 (2011).</li>
<li>Zheng, M. Z., Richard, J. L., Binder, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+review+of+rapid+methods+for+the+analysis+of+mycotoxins%5BTitle%5D)+AND+%22Mycopathologia%22%5BJournal%5D)">A review of rapid methods for the analysis of mycotoxins.</a> Mycopathologia. 161, 261-273 (2006).</li>
<li>Bacon, C. W., Bennett, R. M., Hinton, D. M., Voss, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scanning+electron+microscopy+of+Fusarium+moniliforme+within+asymptomatic+maize+kernels+and+kernels+associated+with+equine+leukoencephalomalacia%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Dis%22%5BJournal%5D)">Scanning electron microscopy of Fusarium moniliforme within asymptomatic maize kernels and kernels associated with equine leukoencephalomalacia.</a> Plant Dis. 76, 144-148 (1992).</li>
<li>Munkvold, G. P., Hellmich, R. L., Rice, L. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+fumonisin+concentrations+in+kernels+of+transgenic+Bt+maize+hybrids+and+nontransgenic+hybrids%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparison of fumonisin concentrations in kernels of transgenic Bt maize hybrids and nontransgenic hybrids.</a> Plant Dis. 83, 130-138 (1999).</li>
<li>Sagaram, U. S., Shaw, B. D., Shim, W. -B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fusarium+verticillioides+GAP%21%2C+a+gene+encoding+a+putative+glycolipid-anchored+surface+protein%2C+participates+in+conidiation+and+cell+wall+structure+but+not+virulence%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiol%22%5BJournal%5D)">Fusarium verticillioides GAP!, a gene encoding a putative glycolipid-anchored surface protein, participates in conidiation and cell wall structure but not virulence.</a> Microbiol. 153, 2850-2861 (2007).</li>
<li>Shim, W. -B., Flaherty, J. E., Woloshuk, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+Fumonisin+B1+biosynthesis+in+maize+germ+and+degermed+kernels+by+Fusarium+verticillioides%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Food+Protect%22%5BJournal%5D)">Comparison of Fumonisin B1 biosynthesis in maize germ and degermed kernels by Fusarium verticillioides.</a> J. Food Protect. 66, 2116-2122 (2003).</li>
<li>Shim, W. -B., Woloshuk, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+fumonisin+B1+biosynthesis+and+conidiation+in+Fusarium+verticillioides+by+a+cyclin-like+%28C-type%29+gene%2C+FCC1%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Micrbiol%22%5BJournal%5D)">Regulation of fumonisin B1 biosynthesis and conidiation in Fusarium verticillioides by a cyclin-like (C-type) gene, FCC1.</a> Appl. Environ. Micrbiol. 67, 1607-1612 (2001).</li>
<li>Conversation with: Won-Bo Shim. , (2011).</li>
<li>Shin, J. -H., Shim, W. -B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+PPR1+and+PPR2%2C+genes+encoding+regulatory+subunits+of+protein+phosphatase+2A+in+Fusarium+verticillioides%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathol%22%5BJournal%5D)">Characterization of PPR1 and PPR2, genes encoding regulatory subunits of protein phosphatase 2A in Fusarium verticillioides.</a> Phytopathol. 99, S119(2009).</li>
<li>Breivik, O. N., Owades, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spectrophotometric+Semimicrodetermination+of+Ergosterol+in+Yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Yeast.+Agric.+and+Food+Chem%22%5BJournal%5D)">Spectrophotometric Semimicrodetermination of Ergosterol in Yeast.</a> Yeast. Agric. and Food Chem. 5, 360-363 (1957).</li>
</ol>

<p class="jove_content"&gt; אין לי מה לחשוף.</p

<p class="jove_content"&gt; השיטות שתוארו כאן נבדקו בהרחבה הוכיחה להיות חזקים בדור של תוצאות לכימות להתיישבות sporogenesis פטרייתי, וייצור של mycotoxins. יתר על כן, שיטות אלה צריכות לחול על זרעים של מיני צמחים אחרים, כי הם רגישים לזיהום עם פטריות mycotoxigenic (כגון בוטנים, חיטה, כותנה, פיסטוקים וכו &#39;). למפעל לפתוגן ניתוחים המוסמכות אינטראקציה, זוהי חובתו של הזרעים לשמר אותם. האתר פצע קטן בצד העובר של הקרנל מאפשר זיהום תוך שמירה על יכולת הקיום של זרע.</p&gt;<p class="jove_content"&gt; מבחני ליבה הפועלות ביעילות הוכחו תוצאות מקבילות מהשדה. ב...

<table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td> שם מגיב </td><td> חברה </td><td> קטלוג # </td></tr><tr><td> דקסטרוז אגר תפוחי אדמה </td><td> פישר Scientifc </td><td> S71659A </td></tr><tr><td> Tween-20 </td><td> פישר Scientifc </td><td> BP337-100 </td></tr><tr><td> הדגירה מיכל פלסטיק </td><td> Sterilite </td><td> 1713LAB06 </td></tr><tr><td> ממחה </td><td> Vicam </td><td> 20200 </td></tr><tr><td> 24 ס&quot;מ מחורץ מסנן ניירות </td><td> Vicam </td><td> 31240 </td></tr><tr><td> 1.5 מיקרומטר זכוכית microfibre </td><td> Vicam </td><td> 31955 </td></tr><tr><td> Afla טור מבחן </td><td> Vicam </td><td> G1024 </td></tr><tr><td> Afrla מפתחים מבחן </td><td> Vicam </td><td> 32010 </td></tr><tr><td> מתנול </td><td> Vicam </td><td> 35016 </td></tr><tr><td> אצטוניטריל </td><td> פישר Scientifc </td><td> AC14952-0025 </td></tr><tr><td> אתנול </td><td> פישר Scientifc </td><td> AC39769-0025 </td></tr><tr><td> C-18 בשלב מוצק החילוץ עמודה (הכנה ספטמבר טור SPE C18) </td><td> פישר Scientifc </td><td> 60108-304 </td></tr><tr><td> O-phthalaldehyde (OPA) </td><td> סיגמא כימית Co </td><td> 79760-5G </td></tr><tr><td> בור חומצה </td><td> פישר Scientifc </td><td> BP168-500 </td></tr><tr><td> נתרן borate </td><td> פישר Scientifc </td><td> RDCS0330500 </td></tr><tr><td> Mercaptoethanol </td><td> פישר Scientifc </td><td> 45-000-231 </td></tr><tr><td> Shimadzu HPLC LC-20AT (משאבה) </td><td> Shimadzu מכשירים מדעיים, Inc </td><td> LC-20AT </td></tr><tr><td> Zorbax ODS עמודה (4.6x150mm) </td><td> Agilent Technologies </td><td> 443905-902 </td></tr><tr><td> Shimatzu RF-10Axl גלאי הקרינה </td><td> Shimadzu מכשירים מדעיים, Inc </td><td> RF-10AXL </td></tr><tr><td> סודיום פוספט </td><td> פישר Scientifc </td><td> AC38987-0010 </td></tr><tr><td> FB1 תקני </td><td> סיגמא כימית ושות&#39; </td><td> F1147-במינון של 1 </td></tr><tr><td> כלורופורם </td><td> VWR </td><td> MK444410 </td></tr><tr><td> מזרק 13 מ&quot;מ מסנן עם קרום 0.45 ניילון אום (HPLC) </td><td> חיים מל המדע </td><td> 4426 </td></tr><tr><td> Ergosterol </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 45480-F-50 גרם </td></tr><tr><td> נצנץ בקבוקונים </td><td> VWR </td><td> 66021-602 </td></tr><tr><td> סודיום כלוריד </td><td> Vicam </td><td> G1124 </td></tr></tbody></table>

כימות של קולוניזציה sporogenesis פטרייתי, ולאחר הפקה של mycotoxins שימוש bioassays-kernel

Quantification of Fungal Colonization, Sporogenesis, and Production of Mycotoxins Using Kernel Bioassays

ריקבון של דגנים על ידי הזרע, מדביק פטריות מהווה אחד האתגרים הכלכליים הגדולים ביותר ברחבי העולם ייצור דגני בוקר, שלא לדבר על סיכון רציני לבריאות האדם ובעלי חיים. בין ייצור דגנים, תירס הוא לטעון את היבול הנגוע ביותר, עקב פתוגן המושרה הפסדים שלמות תבואה זרע זיהום mycotoxin. שני mycotoxins הנפוצים ביותר ובעייתי עבור מגדלי תירס ומוצרי מזון מעבדים מזון הם אפלטוקסין ו fumonisin, המיוצר על ידי Aspergillus flavus ו verticillioides Fusarium, בהתאמה. מחקרים שנעשו לאחרונה במפעל לפתוגן אינטראקציות מולקולריות הראו הבטחה בהבנת מנגנונים ספציפיים הקשורים תגובות צמחים לזיהום פטרייתי וזיהום mycotoxin 1,2,3,4,5,6. כי מעבדות רבות משתמשות מבחני ליבה ללמוד הצמח לפתוגן אינטראקציות, יש צורך בשיטה אחידה לכימות פרמטרים ביולוגיים שונים, כךתוצאות של מעבדות שונות ניתן לחצות, לפרש. עבור אמצעי חזקים לשעתקו עבור ניתוחים כמותיים על זרעים, פיתחנו ב-Lab מבחני ליבה ושיטות הבאים לכמת הצמיחה ביומסה פטרייתי, וזיהום mycotoxin. ארבעה גרעיני תירס מעוקרים הם מחוסן ב צלוחיות זכוכית עם מתלה פטרייתי (10 6) מודגרת למשך פרק זמן מוגדר מראש. צלוחיות מדגם יבחרו מכן על ידי ניתוח ביומסה hemocytometer, ergosterol מבוסס על ספירה של נבגים על ידי כרומטוגרפיה נוזלית בעל ביצועים גבוהים (HPLC), כימות אפלטוקסין באמצעות שיטה fluorometer AflaTest, וכימות fumonisin ידי HPLC.

ההרס של פלחה ידי זרעים מדביק פטריות גרם מאמצי מחקר רבים כדי להבין טוב יותר הצמח לפתוגן אינטראקציות. ללמוד זרעים פטרייתיים אינטראקציות במעבדה להגדרה, פיתחנו שיטה חזקים כימות של רבייה ביומסה פטרייתי, וזיהום mycotoxin באמצעות bioassays ליבה.

כימות של קולוניזציה Sporogenesis פטרייתי, ולאחר הפקה של mycotoxins שימוש bioassays-Kernel

ריקבון של דגנים על ידי פטריות המדביקות זרעים מהווה את אחד האתגרים הכלכליים הגדולים ביותר לייצור דגנים ברחבי העולם, שלא לדבר על סיכונים חמורים...

המטרה הכללית של פרוצדורה זו היא לכמת במדויק את הביוסינתזה של מיקוטוקסינים, את השחיתות ואת הצמיחה, וזאת כדי לחקור אינטראקציות מולקולריות בין פטריות לזרעים. מטרה זו מושגת תחילה על ידי הקמת ביו-סבדיקה לגרעינים. לאחר מכן סופרים את ה-kedia, ולאחר מכן מכמתים את המיקוטוקסינים.לבסוף, נמדדת הביומסה הפטרייתית. בסופו של דבר, ניתן להשיג תוצאות המראות את השפעותיה של פיזיולוגיית הזרעים על התפתחות הרבייה והמטבוליזם המשני של פטריות מייצרות מיקוטוקסינים, וזאת באמצעות כימות הביומסה והמטבוליטים המשניים תוך שימוש בטכניקות של ספירת נבגים בשילוב עם כרומטוגרפיה נוזלית בעתד גבוה (HPLC). היתרון המרכזי בהפצת טכניקה זו הוא סטנדרטיזציה של השיטות בין מספר מעבדות, כך שניתן יהיה לבצע פרשנות משוות לתוצאות ממעבדות שונות.שיטה זו יכולה לסייע במתן תשובות לשאלות מפתח בתחום האינטראקציות המולקולריות בין מיקרובים לזרעים, כגון האופן שבו פטריות פתוגניות מרתקות את חילוף החומרים של ליפידים בצמחים כאסטרטגיה של virulent. בדרך כלל, אנשים שאינם מכירים את השיטה עשויים להיתקל בקשיים מכיוון שזנים שונים של פטריות מראים דפוסי גדילה והתפתחות שונים. לכן, חיוני להבטיח אופטימיזציה של התנאים עבור האינטראקציה הפטרייתית-זרעית המועדפת עליכם שבועיים לפני ביצוע המהלך.תרבית לבדיקה ביולוגית של גרעינים. הפטריות הפתוגניות על מצע אגר פוטטו-דקסטרוז

quantification-fungal-colonization-sporogenesis-production-mycotoxins

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

אימונולוגיה וזיהומים

כדי לחקור את תהליכי ההתפתחות של ascospores ב Gibberella zeae, נוהל איסוף בתנאים סטריליים מצולם על מנת להפיק את הרמה הגבוהה ביותר של מידע עבור תיאור פרוטוקול. זה אמור להקל על שחזור של הניסוי, היבט חיוני כאשר ביטוי מלא הגנום בדיקות פרופיל מיושמים.

Gibberella zeae Ascospore ייצור אוסף לניסויים microarray.

מיצוי חלבון עבור ניתוחים proteomic במינים פטרייתי דורש רמה גבוהה של סטנדרטיזציה כדי להתבצע על פי מידע המינימום על ניסוי (MIAPE) הנחיות proteomic. אנו מציגים וידאו פרוטוקול הכולל הליך מזעור הטיה במהלך הניסוי אינדוקציה רעלן והוצאה חלבון...

רעלן אינדוקציה ואת מיצוי חלבון מן Fusarium Spp. תרבויות ללימודי proteomic

צלבים מיניים ובידוד של הצאצאים רקומביננטי הם כלי מחקר חשובים פטריות...

התפתחות מינית והפרשות Ascospore ב Fusarium graminearum</em

כאן נתאר פרוטוקול כדי לקבוע נטל פטרייתי ריאתי בעכברים עם aspergillosis פולשנית באמצעות כימות של כסף methanamine שונה של Gomori מכתים בסעיפים היסטולוגית. השימוש בשיטה זו הביאה תוצאות דומות עם פחות בעלי חיים לעומת הערכה של הנטל פטרייתי מאת PCR כמותי של ריאות פטרייתית דנ א.

כימות היסטולוגית כדי לקבוע נטל פטרייתי ריאות ב Aspergillosis ניסיוני

כאן אנו מציגים פרוטוקול לנתח אספרגילוס flavus צמיחה וייצור aflatoxin ב תירס גרעינים ביטוי של חלבונים נגד פטריות.  באמצעות זן GFP-לבטא flavus א לנו פיקוח זיהום או התפשטות הפטרייה ב גרעינים בוגרת בזמן אמת. וזמינותו היא מהירה, אמינה, לשחזור.

עיכוב של צמיחה אספרגילוס flavus Aflatoxin ייצור הטרנסגניים תירס לבטא מעכב α-עמילאז מן Lablab purpureus ל'

אנו מתארים שיטה מבוססת אגר שונה שנועדה לכמת את ההשפעות האנטי פטרייתיות של מוצרים שמקורם בצמחים. ניתן להעריך הן תרומות תנודתיות והן תרומות לא תנודתיות לפעילות האנטי-פטרייתית באמצעות פרוטוקול זה. בנוסף, ניתן למדוד את היעילות נגד פטריות בשלבים התפתחותיים מרכזיים במערך ניסיוני יחיד.

מדידת פעילות אנטי פטרייתית נדיפה ולא נדיפה של מוצרי ביו-בקרה

אנו מציגים פרוטוקול הדמיה חיה ללא תוויות באמצעות טכניקות מיקרוסקופיה אור מועברות כדי ללכוד תמונות, לנתח ולכומת קינטיקה צמיחה של הפטרייה חוטית A. nidulans הן בתרבויות שקועות ומדיה מוצקה. פרוטוקול זה יכול לשמש בשילוב עם מיקרוסקופיה פלואורסצנטית.

ניתוח כמותי של אספרגילוס nidulans קצב הצמיחה באמצעות מיקרוסקופיה חיה ותוכנה בקוד פתוח

כאן אנו מציגים פרוטוקול המבוסס על מערכת פיתיון תולעי הארוחות (Tenebrio molitor) ששימשה לבידוד ובחירה של פטריות אנטומופתוגניות (EPF) מדגימות קרקע. נוסחת מספר קונידיה יעילה (ECN) משמשת לבחירת EPF עמיד בפני מתח גבוה המבוסס על מאפיינים פיזיולוגיים לבקרת מזיקים מיקרוביאלית בתחום.

בידוד ובחירה של פטריות אנטומופתוגניות מדגימות קרקע והערכה של אלימות פטרייתית נגד מזיקי חרקים

פרוטוקול זה נועד לספק נהלים מפורטים לאיסוף, תיקון ותחזוקה של דגימות צמחים מיקוהטרוטרופיים, תוך יישום טכניקות מיקרוסקופיה שונות כגון מיקרוסקופיית אלקטרונים סורקת והולכה, מיקרוסקופיית אור, קונפוקלית ופלואורסצנטית כדי לחקור התיישבות פטרייתית ברקמות צמחים ובזרעים שנבטו בפטריות מיקוריזאליות.

טכניקות מיקרוסקופיה לפענוח התיישבות פטרייתית ברקמות צמחים מיקוהטרוטרופיים ונביטה סימביוטית של זרעים

כתב יד זה מפרט פרוטוקול חיסון אופטימלי המשתמש בנדן עלי תירס מנותק למחקרים ציטולוגיים, פיזיולוגיים ומולקולריים הניתנים לשחזור של אינטראקציות תירס עם פתוגנים צמחיים פטרייתיים. מעטה העלים מאפשר תצפית בזמן אמת על אינטראקציות תאיות בין הצמח החי לפטרייה ברקמות לא מקובעות.

נדן תירס מנותק להדמיית תאים חיים של זיהום על ידי פתוגנים פטרייתיים של תירס פוליארי

למד כיצד לכמת ביוסינתזה של מיקוטוקסינים וצמיחת פטריות בזרעים באמצעות ביואסיי גרעינים. שיטה זו מאפשרת ניתוח אינטראקציות בין זרעים לפטריות מזיקות ותורמת להגנת יבולים.

כימות של קולוניזציה Sporogenesis פטרייתי, ולאחר הפקה של mycotoxins שימוש bioassays-Kernel

גלה סרטונים נוספים