אלגוריתם רומן ייס שינוי נקודות לניתוח הגנום רחב, של סוגי נתוני ChIPseq מגוונים

10.8K צפיות

צוטט 6 פעמים

12:39 דק׳

10 בדצמבר 2012

10.3791/4273-v

10 בדצמבר 2012

10.8K צפיות

Haipeng Xing¹ , Willey Liao¹^,² , Yifan Mo¹^,² , Michael Q. Zhang²^,³

¹Department of Applied Mathematics & Statistics, Stony Brook University, ²Computational Biology and Bioinformatics, Cold Spring Harbor Laboratory, ³Department of Molecular and Cell Biology, University of Texas at Dallas

נקודת השינוי בייס שלנו (BCP) אלגוריתם בונה על התקדמות מדינה-of-the-art בדוגמנות שינוי נקודות באמצעות מודלי מרקוב נסתרים וחייל אותם על הכרומטין immunoprecipitation ניתוח נתוני רצף (ChIPseq). BCP מבצע היטב בסוגי נתונים רחבים וpunctate, אבל מצטיין בזיהוי איים חזקים, לשעתק של העשרת היסטון מפוזרת באופן מדויק.