Name: מידות תא יחיד של קרע vacuolar נגרמים על ידי פתוגנים תאיים (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2013-06-12T12:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 39 s
Description: למד שיטה לניטור קרע ממברנות תוך-תאיות הנגרמות על ידי פתוגנים תאיים כמו Shigella flexneri ו-Mycobacterium tuberculosis באמצעות בדיקת CCF4. שיטה זו מאפשרת זיהוי בזמן אמת של פעילות חיידקית בתאי מארח ומסייעת בפיתוח אנטיביוטיקות חדשות.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

עבודה זו מומנה על ידי סוכנות הידיעות Nationale pour la משוכלל ונדיר ועל ידי מועצת המחקר האירופית.

Assay עובד בפורמטים שונים, עם זאת אנו ממליצים קנה מידה במורד נפח הדגימה כדי להציל את חומרים כימיים, במיוחד CCF4-PM. לכן, הפרוטוקול הבא מתואר לתאי הלה קבועים או THP-1 תאים דמויי מקרופאג בפורמט גם 96, ולאחר מכן לתאי הלה פעילים ב35 מנות תחתיות זכוכית מ&quot;מ. Assay יכול להיות מותאם לפתוגנים אחרים. חוץ מזיהום Shigella, אנו מתארים assay עבור THP-1 מ &#39;זנים שונים phagocytosing y cobacterial. חשוב מכך, לאחר טעינת CCF4-בבוקר, כל חומרים כימיים והחוצצים בין מאגרי כביסה דורשים הנוכחות של probenecid ב1 מ&quot;מ. Probenecid הוא מעכב ערוץ אניון שמקדם שימור cytosolic של CCF4 לאורך כל השלבים של הפרוטוקול. דגימות קבועות צריכים להירכש תוך כמה שעות לאחר הניסוי מאז אות CCF4 אינה יציבה לפרקי זמן ארוכים. 1. CCF4 Assay על דגימות קבועות באמצעות Shigella Flexneri (96 צלחות גם) <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנת חיידקים לתרבויות לילה. לחסן את טרום תרבויות חיידקי סוג בר (M90T AfaI) ומוטציה (BS176 AfaI) זני יום 1 לפני הזיהום ב8 מיליליטר tryptic קזאין סויה מרק (TCSB) בתוספת אמפיצילין (50 מיקרוגרם / מ&quot;ל) שבייקר על 37 מעלות צלזיוס למשך הלילה . </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תאי ציפוי לזיהום. תאי זרע הלה ב96 צלחות גם יום 1 לפני הזיהום בצפיפות של 5 x 10 3 תאים לכל גם בDMEM המכיל 10% עוברי עגל בסרום (FCS) ופניצילין, סטרפטומיצין 1% בשנת 5% CO 2 באינקובטור בנפח סופי של 100 μl. במקרה של תאי THP-1 דמוי מקרופאג, ציפוי תא נעשה 2 ימים לפני הזיהום בצפיפות של 5 x 10 4 תאים / היטב, והם מודגרת עם 30 ננומטר אצטט Myristate phorbol (PMA) בRPMI המכיל 10% עוברי עגל בסרום (FCS), 1% פניצילין, streptomycine ו0.05 מ&quot;מ 2-mercaptoethanol. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנה לחיידקים תת. לחסן תרבויות חיידקי לילהבדילול 1/100 בTCSB בתוספת 50 מיקרוגרם / מיליליטר אמפיצילין שבייקר על 37 מעלות צלזיוס למשך 2.5 שעות (OD600 = 0.3-0.4). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> טעינת תאים עם CCF4-AM. מכין את תערובת CCF4-AM הטעינה עבור נפח סופי של 25 μl לכל גם מכיל 1 מ&quot;מ probenecid (Sigma), 1.5 מיקרומטר CCF4-AM (6 מיקרומטר במקרה של THP-1) ו1.25 μl של טעינת הפתרון B (100 מ&quot;ג / מיליליטר Pluronic-F127 פעילי שטח בDMSO/0.1% חומצה אצטית מסופק יחד ערכת CCF4-AM LiveBlazer טעינה על ידי Invitrogen) בחיץ EM (120 מ&quot;מ NaCl, 7 מ&quot;מ KCl, 1.8 מ&quot;מ CaCl 2, 0.8 מ&quot;מ MgCl 2, גלוקוז 5 מ&quot;מ, 25 מ&quot;מ בHEPES pH 7.3). לשטוף את תאי פעם עם PBS ולהוסיף 25 μl של CCF4-AM תמהיל טעינה לכל גם בטמפרטורת חדר בחושך במשך 2.5 שעות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנת חיידקים לזיהום. ספין 1 מ&quot;ל של תת תרבות חיידקים ב9,000 סל&quot;ד דקות 1. שטפי פעם עם 500 PBS μl, ספין ב9,000 סל&quot;ד דקות 1 ו resuspend ב PBS μl 500 בתוספת 10 מיקרוגרם / מיליליטר פולי-L-ליזין (Sigma) ו -40 מיקרוגרם / מיליליטר β-lactaMASE (Sigma). לאחר 10 דקות של דגירה על גלגל מסתובב בטמפרטורת חדר, לשטוף פעם אחת עם 500 PBS μl וחיידקים resuspend במאגר 500 EM / probenecid 1 מ&quot;מ μl. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> זיהום סלולרי וקיבעון. לשטוף את תאי פעם אחת עם 150 מ&quot;מ probenecid μl PBS / 1, להכין תערובת של 10 μl של חיידקי resuspended בנפח סופי של 100 μl של EM חיץ / probenecid 1 מ&quot;מ ולהפיץ אותו לכל אחד. לאחר הדגירה 15 דקות בחושך בטמפרטורת חדר, לעבור את הצלחת עד 37 מעלות צלזיוס במשך שעה 1 (90 דקות במקרה של THP-1), לשטוף עם 150 PBS μl / probenecid 1 מ&quot;מ ולתקן עם paraformaldehyde 4% 50 μl / 1 מ&quot;מ probenecid למשך 10 דקות בחושך. לאחר מכן, לשטוף עם 150 PBS μl / probenecid 1 מ&quot;מ, דגירה למשך 30 דקות עם 30 μl של 10 מיקרומטר גרעיני הצבע Draq5 (Biostatus), לשטוף עם 150 PBS μl / probenecid 1 מ&quot;מ ולהשאיר את הדגימות ב100 PBS μl / probenecid 1 מ&quot;מ. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הגדרות רכישת דגימות קבועות. רכישה מתבצעת גם באמצעות (i) מייקר epifluorescence הפוךלהתמודד עם 20x (0.5 צמצם מספרי (NA), 2.1 מרחק עבודה (WD)) או 40x (0.75 NA, 0.72 WD) אובייקטיבי אוויר N-תכנית או (ii) באמצעות מיקרוסקופ confocal עם מטרת 10x. דימות פלואורסצנטי מתבצעת עם עירור ב 405 ננומטר (Semrock, FF01-387/11-25) והפליטה זוהתה באמצעות 450 ננומטר (Semrock, FF02-447/60-25) ומסננים (535 ננומטר Semrock, FF01-520/35- 25) שימוש בזמני חשיפה של 5 אלפיות שנייה (אור מועבר), 1,000 אלפיות שנייה (535 ננומטר) ו500 אלפיות שניים (450 ננומטר). ההדמיה confocal מתבצעת באמצעות זמן החשיפה הבא: 240 אלפיות שני (450 ננומטר) ו360 אלפיות שניים (535 ננומטר) עבור 405 ננומטר לייזר (870 μW), 640 אלפית השני (Draq5) עבור 640 ננומטר לייזר (2560 μW). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ניתוח שלאחר רכישה. כתוצאה מכך, תמונות נותחו על ידי אלגוריתם מחשב המאפשר ניקוד אוטומטי של אות הקרינה עבור כל אדם תאים. ניתן להשתמש בתוכנה כגון Metamorph 7.1 או Acapella ליצור תסריט למדידת היחס בין אותות פליטת 450nm ו535nm (על פי בקשה). ראוי לציין, השימוש במכשיר כיול פוקוס מצמידים את מיקרוסקופיה האוטומטית במהלך הרכישה מאפשר לרכוש עשרות עמדות שונות במספר רב של בארות באותו הזמן. </li></ol> 2. CCF4 Assay בדוגמאות חיים באמצעות Shigella flexneri (35 עיצוב זכוכית תחתון מ&quot;מ, MatTek) <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנת חיידקים לתרבויות לילה. המשך כפי שתואר קודם לכן. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תאי ציפוי לזיהום. תאי זרע הלה ב35 מנות מ&quot;מ זכוכית תחתונה תרבות (MatTek 10 מ&quot;מ microwell, MatTek תאגיד) 1 יום לפני הזיהום בצפיפות של 2 x 10 5 תאים / צלחת בנפח סופי של 2 מ&quot;ל. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנה לחיידקים תת. המשך כפי שתואר קודם לכן. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> טעינת תאים עם CCF4-AM. מכין את תערובת טעינת CCF-AM כפי שתואר לעיל עבור נפח סופי של 2 מ&quot;ל למנה. לפני טעינתו, לשטוף את התאים פעם עם PBS. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנת חיידקים לזיהום. המשך כפי שתואר קודם לכן. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Acquisitהגדרות יון של דגימות חיות. רכישה מתבצעת במשך 60 דקות בכל 90 שניות עם מיקרוסקופ epifluorescence הפוך באמצעות 20x (NA 0.5, 2.1 WD) או אובייקטיבי אוויר 40x (0.75 NA, 0.72 WD) N-תכנית בתוך 37 מעלות צלזיוס תא חימום. דימות פלואורסצנטי מתבצעת עם עירור ב 405 ננומטר (Semrock, FF01-387/11-25) והפליטה זוהתה באמצעות 450 ננומטר (Semrock, FF02-447/60-25) ומסננים (535 ננומטר Semrock, FF01-520/35- 25) שימוש בזמני חשיפה של 5 אלפיות שנייה (אור מועבר), 200 אלפיות שנייה (535 ננומטר) ו100 אלפיות שניות (450 ננומטר). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> זיהום סלולרי ורכישה חי. לשטוף את תאי פעם אחת עם 2 מ&quot;ל PBS / probenecid 1 מ&quot;מ, להוסיף 2 מ&quot;ל של EM / probenecid 1 מ&quot;מ, הר הצלחת על הבמה של מיקרוסקופ ולהתחיל את הרכישה. לאחר 6 דקות (4 נקודה זמן), לשים את הרכישה בהמתנה, להוסיף 250 μl של resuspension חיידקים על גבי התאים ולהפעיל מחדש את הרכישה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ניתוח שלאחר רכישה. סרטים ניתן דמיינו באמצעות Metamorph או ImageJ. 450/535 ננומטר יחסי עוצמה עבור כל indiviניתן להשיג בתא כפול באמצעות ImageJ. כפי שהוזכר קודם לכן, את השימוש במכשיר כיול פוקוס מצמידים את מיקרוסקופיה האוטומטית במהלך הרכישה מאפשר לרכוש עמדות שונות מרובות, בהתאם לזמן לשגות. </li></ol> 3. CCF4 Assay על דגימות קבועות באמצעות Mycobacteria (96 פורמט טוב) <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנת חיידקים. לגדול זני mycobacterial לשלב אמצע יומן ב7H9 המכיל דקסטרוז אלבומין קטלאז (ADC) על 30 מעלות צלזיוס (לMycobacterium marinum) או 37 מעלות צלזיוס (Mycobacterium לוביס BCG וMycobacterium tuberculosis). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תאי ציפוי לזיהום. מקרופאגים-1 THP פלייט 2 ימים לפני ההדבקה דוגרים אותם עם 30 ננומטר PMA בRPMI המכיל 10% עוברי עגל בסרום (FCS), פניצילין, סטרפטומיצין 1% ו0.05 מ&quot;מ 2-mercaptoethanol ב5% CO 2 באינקובטור בנפח סופי של 100 μl בצפיפות של 5 x 10 4 תאים / היטב. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנת חיידקים לזיהום. הארוותרבויות est, לשטוף וresuspend עם PBS לפני sonication וסינון באמצעות מזרק על מנת להימנע מיצירת גושים. קבע את הריכוז של כל זן על ידי OD600 מדידה ולהדביק תאי THP-1 במשרד פנים של 1:1 על 30 מעלות צלזיוס (לMycobacterium marinum) או 37 מעלות צלזיוס (Mycobacterium לוביס BCG וMycobacterium tuberculosis) במדיום RPMI עם 5% CO 2. לאחר 2 שעות, להסיר בינונית, לשטוף 3 פעמים עם PBS ולהוסיף בינוניות טרי שלמה ל -1 או 2 ימים (במקרה של Mycobacterium marinum) או 3 עד 7 ימים (במקרה של Mycobacterium בוביס BCG וMycobacterium tuberculosis). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> טעינת תאים עם CCF4-AM וקיבעון. לשטוף את תאי פעם עם PBS ולהכין את תערובת טעינת CCF4-AM כפי שתואר לעיל עבור נפח סופי של 25 μl לכל גם באמצעות ריכוז סופי CCF4-AM של 6 מיקרומטר. טוען מתרחש בטמפרטורת חדר בחושך במשך שעה 2 לפני הכביסה עם 150 מ&quot;מ probenecid PBS / 1 μl ולתקןation באמצעות 50 paraformaldehyde μl ב 4% בתוספת with1 מ&quot;מ probenecid למשך 30 דקות בחושך. לאחר מכן, לשטוף עם 150 מ&quot;מ probenecid μl PBS / 1 ולהשאיר את הדגימות ב100 PBS μl / probenecid 1 מ&quot;מ. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הגדרות רכישה וניתוח שלאחר רכישה. המשך כפי שתואר לעיל בפסקה הראשון באמצעות Shigella flexneri. </li></ol> פרוטוקול משלים מבחני Fluorimetric מבוצעים על מנת לבדוק פעילות β-lactamase על פני השטח של חיידקים. זה צריך להיעשות עבור כל זן חיידקים מיועדים לשמש בassay תאר. לצורך כך, הם הכניסו חיידקי שטף במגע עם 100 ננומטר CCF4-AM (Invitrogen), 50 מיקרוגרם / מ&quot;ל ​​תמציות כבד החזיריות esterase (Sigma) ב 1 מ&quot;ל של PBS במשך שעה 1 ב 37 ° C בחושך. המסיס lactamase 1 מ&quot;ג / מ&quot;ל ​​(Invitrogen) יכול לשמש כביקורת חיובית. לאחר מכן, סריקת פליטה מתבצעת בעירור 405nm באמצעות fluorimeter PTI Quantamaster וליטר 1 מ&quot;לz קובט. הפסד של 535 ננומטר סריג ובמראה של פסגה גבוהה ננומטר 450 הם דמיינו על חיידקים בנוסף לבדיקת CCF4.

<ol><li>van der Goot, F. G., Gruenberg, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intra-endosomal+membrane+traffic%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Intra-endosomal membrane traffic.</a> Trends Cell Biol. 16, 514-521 (2006).</li>
<li>Raposo, G., Marks, M. S., Cutler, D. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lysosome-related+organelles%3A+driving+post-Golgi+compartments+into+specialisation%5BTitle%5D)+AND+%22Curr.+Opin.+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Lysosome-related organelles: driving post-Golgi compartments into specialisation.</a> Curr. Opin. Cell Biol. 19, 394-401 (2007).</li>
<li>van der Wel, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((M.+leprae+translocate+from+the+phagolysosome+to+the+cytosol+in+myeloid+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">M. leprae translocate from the phagolysosome to the cytosol in myeloid cells.</a> Cell. 129, 1287-1298 (2007).</li>
<li>Sansonetti, P. J., Ryter, A., Clerc, P., Maurelli, A. T., Mounier, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplication+of+Shigella+flexneri+within+HeLa+cells%3A+lysis+of+the+phagocytic+vacuole+and+plasmid-mediated+contact+hemolysis%5BTitle%5D)+AND+%22Infect+Immun%22%5BJournal%5D)">Multiplication of Shigella flexneri within HeLa cells: lysis of the phagocytic vacuole and plasmid-mediated contact hemolysis.</a> Infect Immun. 51, 461-469 (1986).</li>
<li>Bobard, A., Mellouk, N., Enninga, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spotting+the+right+location-+imaging+approaches+to+resolve+the+intracellular+localization+of+invasive+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim.+Biophys.+Acta%22%5BJournal%5D)">Spotting the right location- imaging approaches to resolve the intracellular localization of invasive pathogens.</a> Biochim. Biophys. Acta. 1810, 297-307 (2011).</li>
<li>Beauregard, K. E., Lee, K. D., Collier, R. J., Swanson, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((pH-dependent+perforation+of+macrophage+phagosomes+by+listeriolysin+O+from+Listeria+monocytogenes%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Exp.+Med%22%5BJournal%5D)">pH-dependent perforation of macrophage phagosomes by listeriolysin O from Listeria monocytogenes.</a> J. Exp. Med. 186, 1159-1163 (1997).</li>
<li>Shaughnessy, L. M., Hoppe, A. D., Christensen, K. A., Swanson, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Membrane+perforations+inhibit+lysosome+fusion+by+altering+pH+and+calcium+in+Listeria+monocytogenes+vacuoles%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Membrane perforations inhibit lysosome fusion by altering pH and calcium in Listeria monocytogenes vacuoles.</a> Cell Microbiol. 8, 781-792 (2006).</li>
<li>Zlokarnik, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitation+of+transcription+and+clonal+selection+of+single+living+cells+with+beta-lactamase+as+reporter%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Quantitation of transcription and clonal selection of single living cells with beta-lactamase as reporter.</a> Science. 279, 84-88 (1998).</li>
<li>Charpentier, X., Oswald, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+the+secretion+and+translocation+domain+of+the+enteropathogenic+and+enterohemorrhagic+Escherichia+coli+effector+Cif%2C+using+TEM-1+beta-lactamase+as+a+new+fluorescence-based+reporter%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Identification of the secretion and translocation domain of the enteropathogenic and enterohemorrhagic Escherichia coli effector Cif, using TEM-1 beta-lactamase as a new fluorescence-based reporter.</a> J. Bacteriol. 186, 5486-5495 (2004).</li>
<li>Mills, E., Baruch, K., Charpentier, X., Kobi, S., Rosenshine, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Real-time+analysis+of+effector+translocation+by+the+type+III+secretion+system+of+enteropathogenic+Escherichia+coli%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Host+Microbe%22%5BJournal%5D)">Real-time analysis of effector translocation by the type III secretion system of enteropathogenic Escherichia coli.</a> Cell Host Microbe. 3, 104-113 (2008).</li>
<li>Bish, S. E., Song, W., Stein, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+bacterial+internalization+by+host+cells+using+a+beta-lactamase+reporter+strain%3A+Neisseria+gonorrhoeae+invasion+into+cervical+epithelial+cells+requires+bacterial+viability%5BTitle%5D)+AND+%22Microbes+Infect%22%5BJournal%5D)">Quantification of bacterial internalization by host cells using a beta-lactamase reporter strain: Neisseria gonorrhoeae invasion into cervical epithelial cells requires bacterial viability.</a> Microbes Infect. 10, 1182-1191 (2008).</li>
<li>Ray, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tracking+the+dynamic+interplay+between+bacterial+and+host+factors+during+pathogen-induced+vacuole+rupture+in+real+time%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Tracking the dynamic interplay between bacterial and host factors during pathogen-induced vacuole rupture in real time.</a> Cell Microbiol. 12, 545-556 (2010).</li>
<li>Blocker, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+tripartite+type+III+secreton+of+Shigella+flexneri+inserts+IpaB+and+IpaC+into+host+membranes%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">The tripartite type III secreton of Shigella flexneri inserts IpaB and IpaC into host membranes.</a> J. Cell Biol. 147, 683-693 (1999).</li>
<li>Mounier, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+IpaC+carboxyterminal+effector+domain+mediates+Src-dependent+actin+polymerization+during+Shigella+invasion+of+epithelial+cells%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Pathog%22%5BJournal%5D)">The IpaC carboxyterminal effector domain mediates Src-dependent actin polymerization during Shigella invasion of epithelial cells.</a> PLoS Pathog. 5, e1000271(2009).</li>
<li>Nowicki, B., Hart, A., Coyne, K. E., Lublin, D. M., Nowicki, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Short+consensus+repeat-3+domain+of+recombinant+decay-accelerating+factor+is+recognized+by+Escherichia+coli+recombinant+Dr+adhesin+in+a+model+of+a+cell-cell+interaction%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Experimental+Medicine%22%5BJournal%5D)">Short consensus repeat-3 domain of recombinant decay-accelerating factor is recognized by Escherichia coli recombinant Dr adhesin in a model of a cell-cell interaction.</a> The Journal of Experimental Medicine. 178, 2115-2121 (1993).</li>
<li>Nothelfer, K., Dias Rodrigues, C., Bobard, A., Phalipon, A., Enninga, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Monitoring+Shigella+flexneri+vacuolar+escape+by+flow+cytometry%5BTitle%5D)+AND+%22Virulence%22%5BJournal%5D)">Monitoring Shigella flexneri vacuolar escape by flow cytometry.</a> Virulence. 2, 54-57 (2011).</li>
<li>Simeone, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phagosomal+rupture+by+Mycobacterium+tuberculosis+results+in+toxicity+and+host+cell+death%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Pathog%22%5BJournal%5D)">Phagosomal rupture by Mycobacterium tuberculosis results in toxicity and host cell death.</a> PLoS Pathog. 8, e1002507(2012).</li>
</ol>

יש לנו מה למסור.

Assay CCF4-AM/β-lactamase הוא שיטה פשוטה כדי לעקוב אחר שיבוש vacuolar תאי הנגרם על ידי Shigella flexneri וmycobacteria בתאים מסוגים שונים. זה עושה שימוש בכתב סריג שהוא ביקע ידי אנזים פעיל על פני השטח של החיידקים רגיש cytoplasmic lactamase. אובדן של מצע CCF4-AM יכול בקלות להימנע על ידי הוספת probenecid לכל פתרונות לאחר הטעינה של המצע. כפי שהוכח, assay יכול להיות מותאם לסוגי תאים מרובים (תאי אפיתל, תאי phagocytic) ותבניות (96 טובים, 35 מנות תחתיות זכוכית מ&quot;מ, 6/12/24 גם צלחות). לשימוש ב6/12/24 הצלחת היטב, coverslips סטריליים מופצות בתחתית כל היטב לפני זריעת התאים. בסופו של הניסוי, coverslips מועברות בשקופיות בהרכבה בינונית, כמו להאריך את מגיב Antifade זהב (Invitrogen). בדרך זו האות היא יציבה לפרקי זמן ארוכים יותר לאחר assayבהשוואה לפורמט 96 הבארות שבו דגימות נשמרות בPBS לאחר קיבוע. העלות הגבוהה של מצע CCF4-AM צריכה להילקח בחשבון לפני קביעת נפח הדגימה. זו הסיבה שאנחנו ממליצים על קנה מידה במורד אותם. ניסויים יקרים יותר ב6/12/24 פורמט היטב, אך את האותות הם יציבים במשך ימים. אדרבה, ניסויים הם זולים יותר בפורמט גם 96, אבל דגימות צריכים להיות מנותחות ביום של הניסוי. ראוי לציין כי גם ניתן לבצע ניסויים בחיות גם 96 או 384 פורמט היטב. זה מאפשר ביצוע ניסוי חי באמצעות עשרות תנאים באותו הזמן (חיידקים שעברו מוטציה, מוי, transfection פלסמיד או siRNA, כימיקלים וכו &#39;) עם מספרים של עמדות בכל טוב. אמנם מתאים לShigella flexneri, אנו מדגישים כי בזמן אמת &quot;אמיתי&quot; או ניסויי זמן לשגות הם לא ריאלי עבור מחקרי mycobacteria מאז מחזור הזיהום עולה על ריכוזים מדידים של CCF4 שיכול להישמר בcytosol. עבורמהסיבה זו, מצע CCF4-AM מוחל על תאים רק לאחר הפלישה מושגת. במקרה תוכנת MetaMorph משמשת לרכישה והניתוח, אנו ממליצים להשתמש ב&quot; רכישת המסך &quot;מודול המאפשר רכישת צלחת גם כל 96/384 עם מספר מסוים של תמונות בכל טוב. יתר על כן, &quot;נתוני מסך הסקירה&quot; מודול מאפשר (אני) לדמיין את תמונת הפסיפס של כל התפור היטב לכל ערוץ באותו הזמן על &quot;המפרסם&quot; גדול וכן (ii) לולאת אלגוריתם מיוחד למדידת העוצמות וב535 את 450 ערוצי ננומטר. למרות, שהצלחנו למדוד קרע vacuolar על ידי חיידקים בודדים באמצעות מיקרוסקופיה זמן לשגות, ברצוננו להזהיר כי הפעילות האנזימטית על פני השטח של חיידקים בודדים משתנה טיוח זה קשה בדיוק לתאם מספר החיידקים והיעילות של vacuolar תאיים קרע. בהתחשב בחוסן של assay, זה מתאים לשעותתפוקת igh מתקרבת ב96 או 384 פורמטים כן. יש לנו גם להתאים בהצלחה בפרוטוקול זה לניתוח FACS ללמוד את הזיהום של תאים בתרחיף 16. Assay יכול לשמש גם לחקירה של חיידקים או לנושאים אחרים המציגים lactamase על פני השטח שלהם, מה שמוביל למגוון רחב של יישומים. לדוגמה, ניתן להשתמש בגישה זו כדי ללמוד קרע vacuolar הנגרם על ידי פתוגנים אחרים כגון β-lactamase להביע Legionella pneumophila, חיידקי ליסטריה או סלמונלה typhimurium 12. מאז יש לו חיידקי ליסטריה מחזור זיהום קצר להשוות Shigella flexneri, ניסויי זמן לשגות הם אפשרי. בניגוד לכך, כי Legionella pneumophila ומחזורים ארוכי זיהום סלמונלה typhimurium תצוגה, אנו ממליצים לבצע ניסויי נקודת סיום. מגוון רחב של יישומים אפשריים הופך את assay CCF4-AM/β-lactamaseשיטת fluorometric מעניינת למעקב קרע vacuolar הנגרם על ידי פתוגנים תאיים בדגימות קבועות או בזמן אמת.

חיידקים פתוגנים רב הם הפנימו בתאי קרום של תאים סגורים אוקריוטים במהלך קורס זיהום שלהם. כניסה לתא מתרחש גם דרך phagocytosis ידי תאי מארח מיוחדים, כמו במקרה של שחפת Mycobacterium שהם מעובדים על ידי מקרופאגים, או גורמי המחלה באופן פעיל לגרום לספיגה שלהם לתוך בדרך כלל תאים שאינם phagocytic. במקרה של ספיגה הנגרמת, למשל לShigella flexneri, הפתוגן מזריק חלבונים למפעיל המארח שcytosol לחטוף בין פונקציות תאים אחרות מכונות מיון endomembrane מוסדרות היטב וכתוצאה מכך לוקליזציה חיידקים בתוך תא 1,2 endosomal. כתוצאה מכך, Shigella משבש את הקרום מצרף מוביל לקרע vacuolar והגישה cytosolic של הפתוגן מפריע לסחר קרום מארח ומשלוח הימנעות ליזוזום. לאחרונה, קרע phagolysosomal נמצא גם כstr זיהוםategy בשימוש על ידי Mycobacterium tuberculosis, הפתוגן שחשב במשך זמן רב שיש באופן בלעדי מקומי בתוך תא קרום הנכנס 3,17. כדי לחקור את הדינמיקה של סחר קרום subcellular של פתוגנים פולשים, שיפורים גדולים הושגו מאז מיקרוסקופ האלקטרונים ההילוכים (TEM) מבוסס מחקרים של שנתי ה -1980 המאוחרות 4,5. לדוגמה, בשיטות המבוססות על מיקרוסקופ פלואורסצנטי באמצעות צבעים, נוגדנים נגד מרכיבי משטח חיידקים, או סמנים לשיתוף לוקליזציה עם תאי subcellular השתלטו על 6,7. עם זאת, הם עדיין לא יניבו רזולוציה spatiotemporal מדויקת וחוסן למדוד קרע vacuolar על ידי חיידקים פתוגנים כמותית. המשוכה הזאת כבר התייחסה עם assay המבוסס על כתב צפלוספורין נגזר CCF4-AM סריג ששמש לראשונה ללמוד ביטוי גנים 8. ואז, זה היה בשימוש בהקשר של infהביולוגיה ection לחקור הפרשת מפעיל ולעקוב אחרי הספיגה של Neisseria לתוך תאי מארח 9,10,11. פיתחנו assay ניצול של הכתב הזה ללימוד קרע vacuolar הנגרם על ידי Shigella 12 flexneri וMycobacterium tuberculosis 17. העיקרון של שיטתנו מתואר באיור 1 באמצעות Shigella flexneri. ראשית, תאי מארח נטענים עם מצע סריג CCF4-AM כי הוא לכוד בתוך הציטופלסמה לאחר ביקוע את moieties אסתר AM. לאחר מכן, תאים נגועים בShigella flexneri. הווה β-lactamase על פני השטח של החיידקים הוא מסוגל לבקע את מצע CCF4 הקדם קרע vacuolar מתרחש. זה מוביל לאובדן של סריג אות מיתוג שיא הפליטה מ535 ננומטר ל -450 ננומטר על עירור של החללית ב 405 ננומטר. מדידת ratiometric של 450/535 ננומטר העוצמות מדגישה יושרת vacuolar: יחסים נמוכים משקפים קרום-enחיידקים סגורים או תאיים ואילו יחס גבוה משקפים קשר בין החיידקים וcytosol המארח. כמו כן, אנו מדווחים על התאמה של שיטה זו ללימוד קרע phagosomal הנגרם על ידי Mycobacterium tuberculosis במקרופאגים-THP 1. העקרונות הניסיוניים יישארו זהים למרות שההסדר מתהפך, וטוען CCF4-AM מתבצע רק לאחר זיהום חיידקים. לכן, על ידי מדידות הקרינה ratiometric כמותיים ברמת התא הבודד, קרע vacuolar של Shigella flexneri ניתן לעקוב בזמן אמת ובדגימות קבועות מסוגי תאים שונים 12,13,14. יתר על כן, בשיטה זו ניתן להתאים למספר פתוגנים פולשניות אחרים, כפי שמוצג במחקר זה באמצעות Mycobacterium בוביס ושחפת Mycobacterium. לבסוף, המזעור של הפרוטוקול שלנו ל96 גם (או 384 גם) פורמטים מאפשר הקרנה של מספר רב של תנאים בתפוקה גבוהה.

<table><tbody><tr><td>ערכת טעינה של LiveBlazer FRET-B/G (CCF4-AM) </td><td>Invitrogen</td><td>K1089</td><td>הגנה מפני אור, מלאי ב - 80 מעלות; בכמות העיקרית</td></tr><tr><td>Draq5</td><td>Biostatus</td><td>DR50050</td><td></td></tr><tr><td>פולי-L-ליזין</td><td>סיגמא</td><td>P9155</td><td></td></tr><tr><td>&mu; צלחת שקופה, שחורה, 96 באר </td><td>Greiner Bio-One</td><td>655090</td><td></td></tr><tr><td>35 מ"מ תחתית זכוכית</td><td>MatTek corp.</td><td>P35G-1.5-10-C</td><td></td></tr><tr><td>Probenecid</td><td>Sigma</td><td>P8761</td><td></td></tr><tr><td>&#946;-lactamase</td><td>Sigma</td><td>P0389</td><td></td></tr></tbody></table>

מידות תא יחיד של קרע vacuolar נגרמים על ידי פתוגנים תאיים

Single Cell Measurements of Vacuolar Rupture Caused by Intracellular Pathogens

Shigella flexneri הם חיידקים פתוגניים כי לפלוש לתוך תאי מארח נכנסים vacuole endocytic. לאחר מכן, הקרע של קרום תא מוקף זה מאפשר לחיידקים לנוע בתוך cytosol, להתרבות ועוד לפלוש לתאים שכנים. Mycobacterium tuberculosis הוא phagocytosed על ידי תאי מערכת חיסון, ולאחרונה הוכח קרום phagosomal קרע במקרופאגים. פיתחנו assay חזק למעקב אחר שיבוש קרום phagosomal לאחר כניסת תא המארחת של Shigella flexneri או Mycobacterium tuberculosis. הגישה עושה שימוש CCF4, סריג כתב רגיש לβ-lactamase שequilibrates בcytosol של תאי מארח. עם הפלישה של תאי מארח על ידי חיידקים פתוגנים, החללית נשארת שלמה כל עוד החיידקים מתגוררים בתאי קרום סגורים. לאחר שיבוש פעילות vacuole, β-lactamase על פני השטח של הפתוגן דבק תאיים CCF4 באופן מיידי להובילing להפסד של סריג אות ומיתוג ספקטרום הפליטה שלה. assay ratiometric חזק זה מניב מידע מדויק על העיתוי של קרע vacuolar הנגרם על ידי החיידקים הפולשים, וזה יכול להיות בשילוב למיקרוסקופיה האוטומטית ועיבוד תמונה על ידי אלגוריתמים מיוחדים לזיהוי של את אותות הפליטה של ​​סריג תורם acceptor. יתר על כן, היא מאפשרת לחקור את הדינמיקה של שיבוש vacuolar שהושרו על ידי חיידקים תאיים בזמן אמת בתאים בודדים. לבסוף, הוא מתאים באופן מושלם לניתוח תפוקה גבוהה עם רזולוציה מרחב ובזמן העולה על שיטות קודמות. כאן, אנו מספקים את הפרטים הניסיוניים של פרוטוקולים למופת עבור assay קרע vacuolar CCF4 על תאי הלה ומקרופגים THP-1 לניסויי זמן לשגות או ניסויי נקודות קצה באמצעות Shigella flexneri כמו גם זנים רבים mycobacterial כגון Mycobacterium marinum, Mycobacterium בוביס, ושחפת Mycobacterium.

גישת CCF4-AM/β-lactamase היא שיטה חזקה ורגישה למעקב קרע vacuolar של פתוגנים תאיים כגון Shigella flexneri (איור 1). זני Shigella המשמשים במחקר זה מכונים M90T AfaI וBS176 AfaI. M90T AfaI הוא זן flexneri Shigella המבטא את AfaE adhesin, שהוא מסוגל להיקשר ביעילות CD55 על פני השטח של תאי האפיתל 15. זנים המבטאים לכן AfaE להציג יכולות גבוהות בהרבה בהשוואה פלישה לזן פראי סוג M90T בתאי האפיתל. BS176 AfaI הוא AfaE להביע מוטציה זן flexneri Shigella נטול ארסיות Shigella פלסמיד. זן זה אינו יכול לפלוש לתאי הלה. עם זאת זן זה הוא מסוגל להיכנס לתאים-1 THP מאז ספיגה בקו תא זה לסמוך רק על phagocytosis הקלסית ואינה דורשת מערכת מסוג 3 הפרשה פונקציונלית. שני הזנים להביע β-lactamase, ופעילות β-lactamase תצוגה על פני השטח שלהם בשל הנוכחות של קידוד AfaE פלסמיד. על זיהום תא הלה עם זן AfaI BS176 לא פולשנית עבור שעה 1, CCF4 סריג החללית נותרה בשלמותה, כפי שמוצג באיור 2 א על ידי האות הירוקה (535 ננומטר). להיפך, הזיהום בזן AfaI M90T הארסי עבור שעה 1 מוביל למתג של אות לכיוון כחול (450 ננומטר) המדגיש את המחשוף של החללית בcytosol. על מנת לכמת את זה, פיתחנו תסריט לתוכנת Metamorph וAcapella המאפשרת זיהוי אוטומטי של תאים ומדידה של עוצמות וב535 450 ערוצי ננומטר לקביעת אות ratiometric. כפי שמוצגים באיור 2, הגרעינים וcytosol של תאים מפולחים באמצעות ערוץ Draq5. לאחר מכן, האלגוריתם מסוגל לזהות את 450 ננומטר ואוכלוסיות התאים החיוביים 535 ננומטר לחישוב היחס בין שתי העוצמות לכל אחד מתאי אדם שהואמיוצג כההיסטוגרמה באיור 2 ג. יחסים נמוכים מתקבלים לזן מוטנטי לעומת יחס גבוה לזן האלים. בעוד ניסוי זיהום נציג זה נרכש באמצעות מיקרוסקופ confocal, מיקרוסקופיה epifluorescence מתאימים גם למשימה זו איורים 3 ו -4 דוגמאות הצג שימוש 2 סוגי תאים אנושיים שונים:. תאי אפיתל הלה וTHP-1 תאים דמויי מקרופאג. עם ההידבקות בזן האלים M90T AfaI Shigella עבור שעה 1 ו 90 דקות להלה ותאי THP-1, מתג של אות מירוקה (535 ננומטר) לכחול (450 ננומטר) הוא ציין בהשוואה לתאים נגועים BS176 AfaI (3A דמויות ו4 א). התסריט שפיתחנו על תוכנת MetaMorph מזהה ישירות האוכלוסייה החיובית CCF4 של תאים ולחשב את היחס בין העוצמות וב450 535 ערוצי ננומטר עבור כל אדם תאים. לאחר מכן תאים מסווגים כפונקציה של היחס שלהם באמצעות develo מאקרוPED ב-Excel, ובכך מניב היסטוגרמות מראות את חלוקת התא. כפי שהיה במקרה של התסריט האחר שפותח עבור Acapella, BS176 תאים נגועים AfaI מאופיינים ביחסים נמוכים, ואילו תאים נגועים M90T AfaI להציג יחס גבוה באמצעות אלגוריתם MetaMorph על תאי הלה ומקרופגים THP-1 (איורים 3 ב ו 4 ב) . לבסוף, התאמה של שיטה זו לחקר mycobacteria מוצגת באיור 5. Mycobacterium בוביס BCG מתגורר בphagosome לקורס כולו של הניסוי, כפי שבאו לידי ביטוי על ידי אות ננומטר 535 החזקה זוהתה לאורך כל מהלך הזמן של הניסוי. לעומת זאת, Mycobacterium tuberculosis מעורר קרע קרום phagosomal במקרופאגים-1 THP לאחר יותר מ -3 ימים של זיהום כמודגש על ידי אות 450 ננומטר ב -7 ימים של זיהום (איור 5 א ו5B). באמצעות אותו האלגוריתם ללימוד כקרע vacuolar ידי Shigella </em&gt;, מצאנו כי תאים נגועים שחפת Mycobacterium להציג יחסי ננומטר 450/535 גבוהים יותר מאשר Mycobacterium בוביס BCG לאחר 7 ימים של זיהום (איורים 5 ג ו5D). <img alt="איור 1" fo:content-width="4in" fo:src="/files/ftp_upload/50116/50116fig1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50116/50116fig1.jpg" /> איור 1. תכנית המייצגת את העיקרון של assay CCF4-AM/β-lactamase למעקב קרע Shigella flexneri vacuolar. CCF4-AM מפזרת בחופשיות דרך קרום הפלזמה לתוך הציטופלסמה שבי moieties אסתר הם ביקע את ידי esterases cytosolic ייצור CCF4 אניוני. תגובה זו מונעת CCF4 מלהיכנס כל קרום תא משובץ. בשלב זה, CCF4 מעורר סריג ב 535 ננומטר על עירור ב 405 ננומטר. החללית נשארת שלמה עד חיידקים המבטאים β-lactamase rupturדואר vacuole endocytic. בשלב זה, סריג האות הולך לאיבוד בגלל CCF4 הוא ביקע ידי β-lactamase מפעילה מתג בפליטה מ535 ננומטר ל -450 ננומטר על עירור ב 405 ננומטר. <img alt="איור 2" fo:content-width="2.25in" fo:src="/files/ftp_upload/50116/50116fig2highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50116/50116fig2.jpg" /> איור 2. מעקב קרע vacuolar flexneri Shigella באמצעות מיקרוסקופיה confocal. () לאחר 30 שעות 2 דקות של טעינת CCF4-AM, תא הלה נגוע β-lactamase זן מבטא Shigella flexneri BS176 AfaI המוטציה או זן האלים M90T AfaI עבור שעה 1 וקבועה באמצעות paraformaldehyde 4% למשך 10 דקות. ואז, גרעיני מגואלות Draq5 ותאים הם צילמו באמצעות מיקרוסקופ confocal עם מטרת 10x. תמונות נציג נבחרו עם הערוצים הממוזגים הבאים: CCF4 החללית השלמה מופיעה ב535 ננומטר (Green), CCF4 הבדיקה ביקע מופיעה ב450 ננומטר (כחול). (ב &#39;) דוגמאות לתמונות המדגישות את מערכת זיהוי האוטומטי של האלגוריתם שלנו על תוכנת Acapella. פילוח של התאים (גרעינים + cytosol) מתקבל באמצעות ערוץ Draq5. CCF4 תאים חיוביים מתקבלים באמצעות 450 ו535 ערוצי ננומטר אספו יחד. (ג) היסטוגרמה המראה את התוצאה של הניתוח האוטומטי שלנו על Acapella באמצעות Shigella flexneri BS176 AfaI מוטציה זן או זן אלים M90T AfaI. היחס הממוצע מייצג את היחס בין עוצמת וב450 535 ערוצי ננומטר. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/50116/50116fig2large.jpg" target="_blank">לחץ כאן לצפייה בדמות גדולה.</a> <img alt="איור 3" fo:content-width="4.5in" fo:src="/files/ftp_upload/50116/50116fig3highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50116/50116fig3.jpg" /> איור 3. מעקב Shigella fleקרע xneri vacuolar בתאי הלה באמצעות מיקרוסקופ epifluorescence. () לאחר 30 שעות 2 דקות של טעינת CCF4-AM, תאים הלה נגועים בβ-lactamase זן מבטא Shigella flexneri BS176 AfaI המוטציה או זן האלים M90T AfaI במשך שעה ו1 קבוע באמצעות paraformaldehyde 4% למשך 10 דקות. לאחר מכן, תאים הם צילמו באמצעות מיקרוסקופ epifluorescence עם מטרת 20x. תמונות מייצגות נבחרו בערוצים הבאים:. בדיקה שלמות CCF4 535 ננומטר (ירוק) וCCF4 ננומטר 450 הבדיקה בקע (כחול) (ב) היסטוגרמה המייצגת את התוצאה של הניתוח האוטומטי שלנו על תוכנת MetaMorph. התאים הבודדים מופצים בפונקציה של היחס בין העוצמות וב450 535 ננומטר הערוצים שלהם. <img alt="איור 4" fo:content-width="4.5in" fo:src="/files/ftp_upload/50116/50116fig4highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50116/50116fig4.jpg" /> &gt; איור 4. מעקב קרע Shigella flexneri vacuolar בתאי THP-1 באמצעות מיקרוסקופ epifluorescence. () לאחר 30 שעות 2 דקות של CCF4-AM טוען, THP-1 תאים נגועים β-lactamase זן מבטא Shigella flexneri BS176 AfaI המוטציה או AfaI M90T זן אלים דקות 1 שעות 30 וקבועות באמצעות paraformaldehyde 4% למשך 10 דקות. לאחר מכן, תאים הם צילמו באמצעות מיקרוסקופ epifluorescence עם מטרת 20x. תמונות מייצגות נבחרו בערוצים הבאים:. בדיקה שלמות CCF4 535 ננומטר (ירוק) וCCF4 ננומטר 450 הבדיקה בקע (כחול) (ב) היסטוגרמה המייצגת את התוצאה של הניתוח האוטומטי שלנו באמצעות תוכנת MetaMorph. התאים הבודדים מופצים בפונקציה של היחס בין העוצמות וב450 535 ננומטר הערוצים שלהם. ghres.jpg &quot;src =&quot; / files/ftp_upload/50116/50116fig5.jpg &quot;/&gt; איור 5. מעקב Mycobacterium בוביס BCG וקרע phagosomal Mycobacterium tuberculosis במקרופאגים THP-1 באמצעות מיקרוסקופ epifluorescence. (A, B) THP-1 תאים נגועים β-lactamase להביע Mycobacterium בוביס BCG או Mycobacterium tuberculosis במשך שעה 2 ותרבית במשך 3 עד 7 ימים . לאחר כביסה, תאים נטענים עם CCF-4-AM עבור שעה 2 וקבוע באמצעות paraformaldehyde 4% למשך 30 דקות לפני ההדמיה באמצעות מיקרוסקופ epifluorescence עם מטרת 40X. תמונות מייצגות נבחרו בערוצים הבאים: שלם CCF4 הבדיקה, 535 ננומטר (ירוק); CCF4 ביקע, ננומטר הבדיקה 450 (כחול) (C, D) Histograms מציג את התוצאה של הניתוח האוטומטי שלנו באמצעות תוכנת MetaMorph.. תאים בודדים מופצים כפונקציה של היחס בין עוצמת וב450 535 ערוצי ננומטר.

אנו מתארים שיטה למעקב אחר קרע endomembrane שהושרו על ידי החיידקים תוך תאיים<em&gt; Shigella flexneri<em&gt;</em</em&gt; ו<em<em&gt;<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt;</em</em&gt; על פלישת תא מארחת. assay שלנו עושה שימוש בCCF4, מארח cytoplasmic סריג בדיקה בתאים חיים או קבועים. הכתב הזה הוא מושפל על ידי הווה פעילות אנזים על פני החיידקים.

Shigella flexneri are pathogenic bacteria that invade host cells entering into an endocytic vacuole. Subsequently, the rupture of this membrane-enclosed ...

ניסוי זה מנטר קרע של VA המגורה על ידי פתוגנים תוך-תאיים בתאים בודדים. ראשית, טען את התאים בצבע CCF 4:00 AM, אשר נשבר על ידי אסטרזים תאיים. לאחר מכן, הכן והעלה את חיידשיי ה-FL neuro על התאים הטעונים ב-CCF four, והדגר את התאים בטמפרטורה של 37 °C כדי לאפשר פלישה של החיידקים לתאי המאחסן.לאחר מכן, קבעו את יחס העוצמות שנפלטו בערוצי ה-450 ננומטר וה-535 ננומטר. התוצאות מראות נוכחות של פתוגנים בציטוזול בשל יכולת ההסתגלות של הליזה לסריקה בתפוקה גבוהה. טכניקה זו מקלה על זיהוי אנטיביוטיקה חדשה על ידי טיפול בבעיה מרכזית של לוקליזציה תת-תאית של חיידקים במהלך אינטראקציות של פתוגנים עם המארח.יחד עם עמיתי Tran Vanu, התעניינו בפיתוח גישות לבחינת פתוגנים תוך-תאיים ברזולוציה זמנית גבוהה. הדבר הוביל לביסוס של בדיקת ה-CCF four betalactamase regular ular rupture. היום, גישה זו תוצג באופן ניסיוני על ידי שתי סטודנטיות לתואר מתקדם במעבדה, Nora MellU ו-Charlotte Keller. ניתן להוסיף את זני החיידקים מסוג הטיפוס הפראי והמוטנטי לשמונה מיליליטר של TCSB המכיל 50 µg/mL של ampicillin, והנח את התרביות בשייקר בטמפרטורה של 37 °C. כעת, זרע 5×10³ תאי HeLa לכל באר.ב-100 µL של DMEM המכיל 10% fetal calf serum ו-1% penicillin streptomycin, יש להדגיר את התאים באינקובטור עם 5% carbon dioxide. למחרת, יש לבצע תת-תרבית של החיידקים בדילול של 1:100 ב-TCSB המועשר ב-50 µg/mL של ampicillin, ולגדלם בשייקר בטמפרטורה של 37 °C למשך שעתיים וחצי. להטענת תאי HeLa, יש להכין צבע CCF 4:00 AM בבופר EM ולשטוף את התאים פעם אחת ב-PBS. לאחר מכן, יש להוסיף 25 µL של תערובת הטענה של CCF 4:00 AM לכל באר ולהדגיר בטמפרטורת החדר בחשכה למשך שעתיים ו-30 דקות. כדי להכין את החיידקים להדבקה, יש להשקיע 1 mL של תרבית על ידי סרטיפוגציה, ולאחר שטיפה אחת עם 500 µL של PBS, יש להשעות את החיידקים ב-500 µL של PBS המועשר ב-10 µg/mL של polyol lysine וב-40 µg/mL של beta-lactamase.דגרו במשך 10 דקות על גלגל סיבוב בטמפרטורת החדר, לאחר מכן שטפו פעם אחת עם 500 µL של PBS והשביו כל משקע בקטריאלי ב-500 µL של 1 mM Probenecid בבופר EM; שטפו את התאים פעם אחת עם 150 µL של 1 mM prob בבופר EM. לאחר מכן, דללו 10 µL של בקטריות ב-100 µL של תמיסת 1 mM probed וחלקו אותה לכל באר של תאי hela. לאחר דגירה של 15 דקות בחושך בטמפרטורת החדר, העבירו את הפלטה ל-37 °C למשך שעה אחת.שטפו פעם אחת עם 150 µL של תמיסת probit בריכוז 1 mM. לאחר מכן, קבעו את הדגימות עם 50 µL של 4% paraform aldehyde בתוך תמיסת Pro בריכוז 1 mM למשך 10 דקות בחושך. לאחר שטיפה אחת עם תמיסת Probenecid, הוסיפו 30 µL של צבע גרעין drac five בריכוז 10 µM לצורך סגמנטציה אופטימלית של התאים. דגרו את התאים למשך 30 דקות, שטפו פעם אחת והוסיפו 100 µL של תמיסה בריכוז 1 mM כדי לרכוש תמונות באמצעות מיקרוסקופ fluorescence epi הפוך.השתמש באורך גל עירור של 405 ננומטר. גלה פליטה באמצעות מסננים של 450 ננומטר ו-535 ננומטר תוך שימוש בזמני חשיפה של חמישה מילי-שניות עבור אור שעבר. 1000 מילי-שניות עבור 535 ננומטר ו-500 מילי-שניות עבור 450 ננומטר.השימוש במכשיר כיול פוקוס המחובר למיקרוסקופיה אוטומטית מאפשר רכישה סימולטנית של עשרות מיקומים שונים במספר בארות. במידה ומשתמשים במיקרוסקופ קונפוקאלי, יש להשתמש בזמני חשיפה של 240 milliseconds ב-450 nanometers, 360 milliseconds ב-535 nanometers עבור לייזר של 405 nanometer ו-640 milliseconds עבור לייזר של 640 nanometer. נתח את הנתונים באמצעות אלגוריתם מחשבי המאפשר דירוג אוטומטי של האות הפלואורסצנטי עבור כל תא בנפרד.לדוגמה, השתמשו בתוכנה כגון metamorph ו-acapella כדי ליצור סקריפט למדידת היחס בין אותות הפליטה של 450 nanometer ו-535 nanometer. עבור בדיקה זו, התחילו תרבית HELOC עם 2×10⁵ תאים בנפח סופי של 2 milliliters. הכינו את החיידקים להדבקה והטעינו את תאי ה-hela ב-CCF 4:00 AM; הגדירו מיקרוסקופ confocal עם עדשת N plan air בתוך תא חימום של 37 °C.הגדירו את הלייזר ב-405 nanometer ואת הפליטה באמצעות מסננים של 450 nanometer ו-535 nanometer. כמו כן, הזינו זמני חשיפה של חמישה milliseconds עבור אור תמסורת, 200 milliseconds עבור 535 nanometer ו-100 milliseconds עבור 450 nanometer.הגדירו את איסוף הנתונים למרווחים של 90 שניות לאורך 60 דקות. כעת שטפו את התאים פעם אחת עם 2 mL של תמיסת Probenecid בריכוז 1 mM. הוסיפו 2 mL של prob בריכוז 1 mM ב-em buffer.לאחר מכן, מקם את הצלחת על במת המיקרוסקופ והתחל ברכישת הנתונים לאחר שש דקות. השהה את רכישת הנתונים. הוסף 250 µL של תרחיף חיידקים מעל התאים והפעל מחדש את רכישת הנתונים לצורך ניתוח לאחר הרכישה.בצעו ויזואליזציה של הסרטים באמצעות Velocity metamorph או image J. השגין יחסי עוצמה של 450 עד 535 nanometer עבור כל תא בודד. גישת ה-CCF 4:00 AM beta-lactamase היא שיטה חסונה ורגישה למעקב אחר קריעה של המעטפת של פתוגנים תוך-תאיים כגון gel flexneri בעת זיהום של תאי HELOC. עם חשיפה לא-פולשנית ל-BS 176 AFA למשך שעה אחת, גשושית ה-CCF four fret נשארת שלמה ופולטת אות ירוק.לעומת זאת, זן M 90 TFA I virulent מעביר את האות לכיוון כחול, באופן העולה עם פיצול הגשש בציטוסול לצורך קביעת האות הרציומטרי. פיתחנו סקריפט עבור תוכנות metamorph ו-acapella כדי לאוטומט את זיהוי התאים ואת המדידות בערוצים של 535 ו-450 ננומטר. הגרעינים והציטוסול של התאים מופרדים באמצעות ערוץ DR five.לאחר מכן, האלגוריתם מסוגל לזהות ולכמת את אוכלוסיות התאים החיוביים ב-450 nanometer וב-535 nanometer. יחסי הממוצעים המחושבים נמוכים עבור הזן המוטנטי וגבוהים עבור הזן virulent. ניתן לבצע ניסויים בסוגים שונים של תאי אדם, כגון תאי אפיתל של Gila ותאי THP one דמויי מקרופאג.שני סוגי התאים מגיבים לזן virulent M 90 T AFA one cha על ידי החלפת האות הנפלטת מירוק לכחול תחת זיהום. עם הזן הבלתי-פולשני, האות הירוקה נשמרת; כימות באמצעות סקריפט שפותח בתוכנת metamorph ומאקרו שפותח ב-Excel מציג היסטוגרמות של rupture של וולקולות כפונקציה של התפלגות התאים. ניתן להתאים את השיטה בהצלחה כדי להבין את מידת הזיהומיות של חיידקים שונים.לדוגמה, מערך נתונים זה מראה ש-mycobacterium Bovis. BCG שוהה בפגוזום לאורך כל מהלך הניסוי, כפי שמעיד האות הירוק העקבי. בניגוד לכך, mycobacterium tuberculosis גורם לקרע בממברנה של הוואגולית בתאי THP one macrophages לאחר שבעה ימים של זיהום, כפי שמודגש על ידי הופעת אות של 450 nanometer לאחר שבעה ימי זיהום תוך שימוש באותו אלגוריתם.בבואנו לחקור את קריעת הוולאר על ידי Ella, מצאנו שתאים שנדבקו ב-mycobacterium tuberculosis מציגים יחסים גבוהים יותר של 450 ל-535 ננומטר מאשר mycobacterium bovis BCG לאחר שבעה ימי זיהום. לאחר צפייה בסרטון זה, תגמירו להבין היטב כיצד לחקור קריעת וולאר על ידי פתוגנים באמצעות בדיקת CCL four betalactamase. לאחר שליטה בשיטה, ניתן לבצע פרוטוקול זה בארבע שעות, אך זכרו, עליכם להוסיף proce לכל באפר לאורך כל הפרוטוקול. היתרון המרכזי של טכניקה זו על פני שיטות קיימות, כגון מיקרוסקופיה אלקטרונית או פרקציונציה של ממברנות, הוא שניתן לבצעה בזמן אמת ללא טיפולים ביוכימיים כלשהם.ניתן לבצע ניתוחים נוספים, כגון סימון actin או בדיקת הגנה באמצעות gentamicin, על מנת להעריך את הספיגה ואת השגשוג של החיידקים בתאי המאכסן.

single-cell-measurements-vacuolar-rupture-caused-intracellular

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

אימונולוגיה וזיהומים

מאמר זה מתאר שיטה בידוד וטיהור של...

טיהור vacuoles הפתוגן מ<em&gt; הלגיונלה</em&gt; נגועים phagocytes

אנו מתארים את שיטת האבטיפוס לייצור coverslips מיקרוסקופ פלואורסצנטי המצופה ג'לטין להמחשת הפחתת מטריצת invadopodia בתיווך. טכניקות חישוב באמצעות תוכנה זמינה מוצגות לכימות הרמות כתוצאה של proteolysis מטריצה ​​של תאים בודדים בתוך אוכלוסייה מעורבת וקבוצות תאיות המקיפות את השדות מיקרוסקופים שלמים.

מדידת כמותית של Proteolysis מטריקס invadopodia בתיווך בקשרים יחידים ורבים תאיים

Source: Dubois, V., et al. Identification of Virulence Markers of Mycobacterium abscessus for Intracellular Replication in Phagocytes. J. Vis. Exp. (2018)This video demonstrates the procedure of co-culturing amoebae with mutant bacterial strains to evaluate their intracellular survival and identify virulence markers through differences in colony counts.

Detecting Bacterial Virulence Using Amoeba as a Host System

סרטון זה מדגים בדיקה לכימות ציטוסולי וסלמונלה טיפימוריום בתוך מקרופאגים שמקורם במח עצם באמצעות חדירה דיפרנציאלית. המקרופאגים נגועים בסלמונלה המבטאת חלבון פלואורסצנטי, המופנמת בתוך מבנה כלי דם מיוחד הנקרא ואקואול המכיל סלמונלה או SCV. תת-קבוצה של חיידקים בורחת מה-SCV ונכנסת לציטוזול. קרום הפלזמה העשיר בכולסטרול של המקרופאגים חדור באמצעות דיגיטונין, ומשאיר את ה- SCV שלם. לאחר תיוג החיידקים הציטוסוליים עם נוגדן מתויג פלואורסצנטית, אחוז החיידקים vacuolar ו cytosolic מכומת באמצעות מיון תאים מופעל...

בדיקה לכימות סלמונלה ציטוסולית וסלקולארית במקרופאגים ראשוניים נגועים

pH vacuolar וcytosolic ניתן למדוד בשמרי חיים...

מדידה של pH vacuolar וCytosolic<em&gt; In Vivo</em&gt; בהשעיות תא שמרים

הדמיה חיה של תאים שנחשפו לצבע lipophilic FM1-43 מאפשרת קביעה מדויקת של קינטיקה שבו רעלים יוצרים נקבוביות יוסרו מקרום הפלזמה. זה assay רגיש שיכול לשמש כדי להעריך את הדרישות לCa 2 +, sphingomyelinase וגורמים אחרים על תיקון קרום פלזמה.

לחיות ההדמיה Assay להערכת התפקידים של Ca<sup&gt; 2 +</sup&gt; וSphingomyelinase בתיקון פצעי רעלן נקבובית יוצרי

התהליך של ריפוי תאים נפצעו כרוך בסחר של חלבונים מסוימים ותאי subcellular לאתר של פציעת קרום תא. פרוטוקול זה מתאר מבחני כדי לפקח על תהליכים אלה.

תא ההדמיה ממברנה פגיעה ותהליכי subcellular המעורבים בתיקון

אנו מתארים את הכימות של סלמונלה טיפימוריום ציטוזולי ווואקולרי במקרופאגים שמקורם במח עצם באמצעות חדירות דיפרנציאלית של דיגיטונין.

כימות של Cytosolic לעומת vacuolar<em&gt; סלמונלה</em&gt; ביסודי המקרופאגים על ידי דיפרנציאל permeabilization

AlPcS2a-mediated chromophore-assisted laser inactivation (CALI) הוא כלי רב עוצמה לחקר נזק מרחבי-זמני של שלפוחיות תוך-תאיות (IVs) בתאים חיים.

גישה פוטודינמית לחקר תפקוד קרע שלפוחית תוך תאית

סלמונלה פולשת ומשתכפלת בתוך תאי אפיתל מעיים הן בוואקולות ספציפיות לסלמונלה והן בחינם בציטוזול (היפר-שכפול). פרוטוקול מבוסס מיקרוסקופיה פלואורסצנטית בתפוקה גבוהה מתואר כאן כדי לכמת את הפנוטיפים התוך-תאיים של סלמונלה על ידי שני ניתוחי תמונה משלימים באמצעות ImageJ, המגיעים לרזולוציה של תא בודד וניקוד.

ניתוח אוטומטי של פנוטיפים תוך תאיים של סלמונלה באמצעות ImageJ

פרוטוקול זה מתאר שיטת הדמיה של תאים חיים לניטור חדירות הממברנה הליזוזומלית במהלך נקרופטוזיס, תוך שימוש בבדיקות פלואורסצנטיות המזהות שינויים בשלמות הממברנה הליזוזומלית והחמצתה.

הדמיית תאים חיים של חדירת הממברנה הליזוזומלית במהלך נקרופטוזיס

למד שיטה לניטור קרע ממברנות תוך-תאיות הנגרמות על ידי פתוגנים תאיים כמו Shigella flexneri ו-Mycobacterium tuberculosis באמצעות בדיקת CCF4. שיטה זו מאפשרת זיהוי בזמן אמת של פעילות חיידקית בתאי מארח ומסייעת בפיתוח אנטיביוטיקות חדשות.

מידות תא יחיד של קרע vacuolar נגרמים על ידי פתוגנים תאיים

גלה סרטונים נוספים