10 בנובמבר 2015
המטרה של כתב היד הזה היא לחקור את ההיפוקמפוס ואת תת-השדות של ההיפוקמפוס באמצעות MRI. כתב היד מתאר פרוטוקול לפילוח ההיפוקמפוס וחמישה תת-מבנים של ההיפוקמפוס: קורנו אמוניס (CA) 1, CA2/CA3, CA4/פיתול משונן, שכבות רדיאטום/לקונוסום/מולקולר וסוביקולום.
המטרה הכוללת של פרוטוקול זה היא לספק שיטה אמינה ומדויקת מבחינה אנטומית לפילוח ההיפוקמפוס האנושי עם תת-שדות בתמונות תהודה מגנטית. כאן, תת-השדות של ההיפוקמפוס מחולקים לחמש תוויות, CA אחת, CA שתיים, CA שלוש, CA ארבע, פיתול משונן, S-R-S-L-S-M וה-ICM. שיטה זו יכולה לעזור לענות על שאלות מפתח בתחום הדימות המוחי, כגון כיצד מבנה תת-שדה ההיפוקמפוס משתנה במצבים בריאים וחולי.
היתרון העיקרי של טכניקה זו הוא שהיא מותאמת לתמונות ברזולוציה גבוהה שנאספו בסורק שלושה T, והיא כוללת הגדרות תת-שדה לכל האורך האחורי הקדמי של ההיפוקמפוס. התחל בהזנת סצנת הפקודה הבאה כאן לטרמינל. כדי לפתוח את ממשק התוכנה בתמונה משוקללת T one, הגדל את התצוגה העטרתית והגדל את ההיפוקמפוס, בחר פילוח בחלון הניווט ולאחר מכן בחר רדיוס XY.
הגדר את גודל מברשת XY ל- 0.1. גלול אל הפרוסה הקדמית ביותר של ההיפוקמפוס עבור פרוסה a, פרוסת המוט הקדמית. צייר את הגבול החיצוני ביותר של החומר האפור בהיפוקמפוס במקום שבו הוא פוגש את החומר הלבן של האונה הרקתית שמסביב, והשתמש בחומר הלבן בעוצמה גבוהה של האלפים כדי לסייע בגבול העליון.
השתמש במקש מילוי התווית בתפריט הפילוח של חלון הניווט כדי למלא את התווית בתוך הגבול. עבור פרוסה B, ראש ההיפוקמפוס ניצח. המשך לצייר את גבולות ראש ההיפוקמפוס על ידי שימוש בחומר הלבן של האונה הרקתית והאלפים כמדריך.
הבא עבור פרוסה C, ראש ההיפוקמפוס שניים עם תאריכים. צייר את הגוונים של ההיפוקמפוס באמצעות החומר הלבן של האליוס. לאחר מכן השתמשו במבט הצירי כדי לצייר קו אופקי מהקצה הקדמי של ההיפוקמפוס הצדדי ולהגדיר כל דבר מתחת לקו הזה כחלק מההיפוקמפוס.
עכשיו עבור פרוסה D, ראש ההיפוקמפוס, שלוש, מצייר את הגבול התחתון של ההיפוקמפוס בחומר הלבן של האונה הטמפורלית ואת הגבול הצדדי בקרן התחתונה של החדר הצדדי. צייר את הגבול העליון בחומר הלבן של האליוס fibr ואת הגבול המדיאלי באזור ההיפו אינטנסיבי של בור הסביבה. עבור פרוסה, E, צייר את העליון הרוחבי התחתון ואת הגבולות המדיאליים.
כמו קודם, הגדירו את הגבול המדיאלי על ידי ציור החלק התחתון של הגבול המדיאלי שבו ההיפוקמפוס מתדלדל מעט ומשתרע לתוך החומר האפור של קליפת המוח הבין-לאומית. בפרוסות אלה, כלול את הנטל בסגמנטציות ההיפוקמפוס. לאחר מכן ייעד את גוף ההיפוקמפוס בפרוסה F.As לפני, אל תכלול את נוזל עמוד השדרה המוחי בעוצמה נמוכה של חריץ ההיפוקמפוס השרידי בסגמנטציה.
כעת עבור קטע G, זנב ההיפוקמפוס מתחיל לפלח את הזנב. כאשר השייט של הפורניקס נראה לראשונה. אל תכלול את הבליטה השלפוחית על ידי אקסטרפולציה של צורת הפיתול השלפוחית לזנב ההיפוקמפוס לפרוסות קדמיות יותר.
כאשר כבר לא ניתן להבחין בפיתול השלפוחית, התייחסו לכל החומר האפור הנראה כזנב ההיפוקמפוס. ואז עבור פרוסה H, זנב ההיפוקמפוס שני מקטעים, החומר האפור בעוצמה נמוכה של זנב ההיפוקמפוס האחורי מהחומר הלבן בעוצמה גבוהה שמסביב. לבסוף, או עין פרוסה, החלק האחורי ביותר של פרוסה, האזור הקטן שנותר של החומר האפור בהיפוקמפוס מהחומר הלבן הסובב את האונה הטמפורלית.
התחל בגלילה לחלק הקדמי ביותר של ההיפוקמפוס בתמונה משוקללת T שתיים. שנה את צבע המברשת על ידי בחירת הגדר תווית צבע והזנת מספר בין אחד ל -255 במסוף. עבור פרוסה A, הפרוסה הקדמית ביותר, צייר קו המחלק את החומר האפור ההיפוקמפוס הנראה לאורך הציר הארוך ביותר הנראה לעין לשני חלקים שווים.
השתמש בשני צבעים שונים כדי לתייג את העליון מבין שני החלקים הללו כ-ca אחד ואת החלק התחתון כ-sulu עבור פרוסה B, ראש ההיפוקמפוס. סמן את אזור העוצמה הנמוכה באמצע היווצרות ההיפוקמפוס. כ- SR SLSM, הגדר את ה- csum התחתון כגבול אחד בעיקול בהיפוקמפוס התחתון.
המשיכו לעקוב אחר הציר הארוך ביותר של ההיפוקמפוס כדי לצייר את גבול ה-ca one sulu על הקצה המדיאלי העליון של פרוסה C, ראש ההיפוקמפוס. שניים עם פיתויים. סמן את פס ה-S-R-S-L-S-M הכהה העוקב אחר העקומה של תווית ה-ca, כל חומר אפור בעוצמה גבוהה בתוך ה-S-R-S-L-S-M כ-CA ארבע dg.
לאחר מכן הגדר את הגבול האחד באמצעות העיקול וההיפוקמפוס התחתון. הגדר את הגבול בין CA 1 ל-CA 2, CA 3 כקו זווית של 45 מעלות, המשתרע בכיוון העל-צדדי מהקצה העל-צדדי ביותר של ה-S-R-S-L-S-M. הרחיבו את ה-ca two CA שלוש באופן מדיאלי לאורך הקצה העליון עד לשוקת שבין ה-dations ותייגו את שאר הקצה העליון כ-ca one עבור פרוסה D, ראש ההיפוקמפוס שלוש.
סמן את ה-S-R-S-L-S-M CA ארבע, DG ו-ICM בדיוק כפי שתואר זה עתה. עבור פרוסה C, הרחב את CA שתיים, CA שלוש מדיאלית באמצע הדרך לאורך הקצה העליון, ותייג את החצי השני של הקצה העליון כ-CA אחד. חלקו את ראש ההיפוקמפוס הסופר מדיאלי אנכית לשניים.
סמן את החצי המדיאלי כ-S-R-S-L-S-M. ואז אופקית, חלקו את החצי הרוחבי לשניים. שוב, סמנו את החלק התחתון כ-CA שתיים, CA שלוש, ותייגו את החלק העליון כ-CA ארבע DG עבור פרוסה E, ראש ההיפוקמפוס ארבע עם אנגוס.
הגדר את הגבול האחד כקו אנכי המשתרע בכיוון התחתון מהקצה המדיאלי ביותר של ה-CA ארבע dg. המשך להגדיר את גבולות CA אחד, CA שתיים, CA שלוש s, RSL, SM ו-CA ארבעה DG. כמו קודם, סמן את האחריות של ההיפוקמפוס כראש ההיפוקמפוס עובר לגוף ההיפוקמפוס בתווית האחריות, האזור בעוצמה נמוכה במרכז כ-SRSL sm.
בהמשך לפרוסה E, צייר קו בקצה העליון של קטע S-R-S-L-S-M לאורך הציר הסופר-מדיאלי התחתון של תווית UCAS. כל החומר האפור מעל הקו הזה כ-CA שתיים, CA שלוש, מסמן כל חומר אפור ללא תווית מתחת לקו זה כ-CA ארבע D.Next, או פרוסה F, גוף ההיפוקמפוס. המשך להחיל את הגבולות עבור ה-sulu S-R-S-L-S-M כארבע, DG ca שתיים, CA שלוש כפי שהוזכר עבור פרוסה E בפרוסה G, זנב ההיפוקמפוס אחד.
גבול ה-ICM ca אחד הופך לקו זווית של 45 מעלות, המשתרע בכיוון האינפרא מדיאלי מהקצה המדיאלי של ה-CA ארבע DG עבור פרוסה H. זנב ההיפוקמפוס השני מסמן את השכבה הפנימית בעוצמה נמוכה כ-S-R-S-L-S-M ואת השכבה החיצונית בעוצמה גבוהה כ-CA אחת. ברגע שלא ניתן עוד להבחין בין הבליטה השלפוחית לבין היווצרות ההיפוקמפוס, סמנו כל חומר אפור שנותר באמצע כ-CA 4 dg. לבסוף, עבור עין פרוסה, הפרוסה האחורית ביותר משאירה את כל המבנה כ-CA אחד.
ברגע שה-S-R-S-L-S-M הכהה כבר לא נראה בתצורת ההיפוקמפוס, פרוטוקול זה משתמש בהדמיית תהודה מגנטית כדי לפלח את ההיפוקמפוס האנושי. כאן, ההיפוקמפוס כולו מחולק לתשע פרוסות עטרה באמצעות תמונות משוקללות ב-T אחד. חמש, תת-שדות היפוקמפוס מפולחים לאחר מכן באמצעות T שתי תמונות משוקללות כאן, ניתן לראות את CA אחד, CA שתיים, CA שלוש, CA ארבע, פיתול דנאט, S-R-S-L-S-M ו-ICM בתוך פרוסת ראש ההיפוקמפוס הזו.
לאחר שליטה, ניתן להשלים טכניקה זו עבור כל נושא תוך 40 שעות אם היא מבוצעת כראוי. חשוב לזכור לעקוב אחר דפוסי העוצמה בתמונות ככל האפשר ולהיות עקביים עם הגבולות בין הנושאים בעקבות הליך זה. ניתן לבצע טכניקות פילוח אוטומטיות אחרות כדי לענות על שאלות לגבי נפח וצורת ההיפוקמפוס באוכלוסיות פגיעות כמו אלה שעוברים הזדקנות בריאה או סובלים ממחלת אלצהיימר.
לאחר צפייה בסרטון זה, אתה אמור להיות מסוגל לשכפל את הפרוטוקול הזה באופן אמין ולקבל תובנה לגבי האנטומיה המפורטת של תת-שדה ההיפוקמפוס של הנבדקים שלך.
צפו בתמליל המלא וקבלו גישה לאלפי סרטונים מדעיים
כתב יד זה מציג פרוטוקול לסגמנטציה של ההיפוקמפוס האנושי ותתי-שדותיו באמצעות MRI. הוא מתמקד באספקת שיטה מדויקת מבחינה אנטומית המותאמת לתמונות ברזולוציה גבוהה.
סגמנטציה ידנית ברזולוציה גבוהה של תתי-שדות ההיפוקמפוס באמצעות MRI ב-3T מאפשרת תחימה אנטומית מדויקת, החיונית לגילוי מוקדם ולמחקר ופיתוח בתחום מדעי העצב התרגומיים. פרוטוקול זה תומך בניתוח כמותי חסון של מורפולוגיית ההיפוקמפוס, ומסייע בהפחתת סיכונים מנגנוניים ובתיקוף מטרות במחקר של מחלות נוירופסיכיאטריות וניורודגנרטיביות. סגמנטציה אמינה של תתי-השדות משפרת את הביטחון החזיוי עבור פיתוח ביומרקרים והחלטות על תיעוד וסינון של תיקי מחקר.
פרוטוקול סגמנטציה זה משתלב ברצף שבין השלב הגילוי לשלב הפרה-קליני, ומספק נתונים אנטומיים בסיסיים לבדיקת השערות, זיהוי מועמדים תרופתיים ופיתוח ביומרקרים תרגומיים.