טיהור הגנום כולו של DNA המעגל extrachromosomal מתאי איקריוטיים

28.7K צפיות

צוטט 59 פעמים

14:26 דק׳

4 באפריל 2016

10.3791/54239-v

4 באפריל 2016

28.7K צפיות

Henrik D. Møller¹ , Rasmus K. Bojsen² , Chris Tachibana³ , Lance Parsons⁴ , David Botstein⁵ , Birgitte Regenberg¹

¹Department of Biology, University of Copenhagen, ²National Veterinary Institute, Technical University of Denmark, ³Group Health Research Institute, ⁴Lewis-Sigler Institute for Integrative Genomics, Princeton University, ⁵Calico Life Sciences LLC

מאמר זה מציג שיטה רגישה הנקראת Circle-Seq לטיהור DNA מעגלי חוץ-כרומוזומלי (eccDNA). השיטה כוללת טיהור עמודות, הסרת ה-DNA הכרומוזומלי הליניארי שנותר, הגברת מעגל מתגלגל ורצף תפוקה גבוהה. Circle-Seq ישים לסינון בקנה מידה גנומי של eccDNA איקריוטי ולחקר חוסר יציבות הגנום ושונות במספר העתק.