Interactome-Seq: A Protocol for Domainome Library Construction, Validation and Selection by Phage Display and Next Generation Sequencing

Maria Felicia Soluri; Simone Puccio; Giada Caredda; Giorgio Grillo; Vito Flavio Licciulli; Arianna Consiglio; Paolo Edomi; Claudio Santoro; Daniele Sblattero; Clelia Peano

doi:10.3791/56981

Interactome-Seq: פרוטוקול עבור ספריית Domainome ובניה, אימות בחירה Phage התצוגה ורצף הדור הבא

JoVE Journal
Biology

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biology

Interactome-Seq: A Protocol for Domainome Library Construction, Validation and Selection by Phage Display and Next Generation Sequencing

Interactome-Seq: פרוטוקול עבור ספריית Domainome ובניה, אימות בחירה Phage התצוגה ורצף הדור הבא

Full Text

9,504 Views

12:04 min

October 3, 2018

DOI: 10.3791/56981-v

Maria Felicia Soluri¹, Simone Puccio², Giada Caredda², Giorgio Grillo³, Vito Flavio Licciulli³, Arianna Consiglio³, Paolo Edomi⁴, Claudio Santoro¹, Daniele Sblattero⁴, Clelia Peano^5,6

¹Department of Health Sciences,Università del Piemonte Orientale & IRCAD, Novara, Italy, ²Institute of Biomedical Technologies,National Research Council, Segrate, Milan, Italy, ³Institute of Biomedical Technologies,National Research Council, Bari, Italy, ⁴Department of Life Sciences,University of Trieste, Italy, ⁵Institute of Genetic and Biomedical Research,National Research Council, Rozzano, Milan, Italy, ⁶Humanitas Clinical and Research Center, Rozzano, Milan, Italy

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

הפרוטוקולים תיאר מאפשרים אפיון ובניה, מבחר (נגד המטרה של הבחירה) ספרייה "domainome" גרם מכל מקור ה-DNA. זו מושגת על ידי צינור מחקר המשלב טכנולוגיות שונות: phage התצוגה, כתב מתקפלים, רצף הדור הבא עם כלי אינטרנט לניתוח נתונים.

שיטה זו יכולה לעזור לענות על שאלות מפתח במחקר מבוסס חלבון כגון ביאור של חלבונים חדשים או תחומי חלבון, אפיון תכונות מבניות ותפקודיות של חלבונים ידועים, הגדרת רשתות אינטראקציה עם חלבונים או חתימות נוגדנים אנטיגן בתנאים שונים. היתרון העיקרי של טכניקה זו הוא שהיא בלתי משוחדת לחלוטין, תפוקה גבוהה ומודולרית לכל סוג של מחקר החל וגן יחיד ועד גנום שלם. בניית ספריית דומיין שימושית מאוד למחקרים פונקציונליים.

ניתן להעביר אותו להקשר תצוגת פאג' ו לשמש לבחירה נגד מטרות שונות כגון חלבונים מחייבים או נוגדנים מטוהרים. הצימוד עם NGS מאפשר ניתוח רגיש ורב עוצמה ביותר. יחד עם זאת, כלי האינטרנט שפותחו במיוחד מעניקים אפיון מדויק של כל הדומיין והאינטראקציה.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos