גישה החילוץ של מטה-נתונים עבור דוחות מקרה קליני לאפשר מתקדם הבנה של מושגי ביו

שיטה זו יכולה לעזור לענות על שאלות על מחלות ופתולוגיות על ידי מתן תצוגה מובנית על תסמיני מחלה, הליכים אבחוניים וטיפוליים, ותוצאות המטופלים מדווחי מקרה קליני. היתרון העיקרי של טכניקה זו הוא שניתן ליישם אותה על כל קבוצת מטופלים בספרות הביו-רפואית. הפיכת מחקרים אפידמיולוגיים של תנאים נדירים או מתעוררים לניתן למציאה.

שיטה זו הופכת את זרימות העבודה הבאות של ניתוח טקסט לאינטואיטיביות וקלות יותר ליישום. על-ידי הפיכת מכונת נתוני טקסט לקריאה עם מטה-נתונים עשירים, אנו יכולים ליצור דוחות אירועים קליניים כמשאב נתונים ניתן לניתג, נגיש, ניתן לשימוש הדדי וניתן לשימוש חוזר או הוגן. מרכזית בשיטה זו היא תבנית המטה-נתונים המשמשת לחילוץ כל המידע הקליני הכלול בדוחות המקרים הקליניים שנבחרו.

ביצוע זרימת העבודה כפי שמודגם יאפשר הרכבה של קורפוס דו"ח מקרה קליני. כדי לשפר את יכולת הלמידה, הנגישות, יכולת הפעולה ההדדית והמשיכולת מחדש של התוכן הרפואי מתוך דו"ח מקרה קליני. כלול פרטים הקשריים בכל שדה במקום לספק מונחים רק מתוך אוצר מילים מבוקר.

השמט מילים וביטויים שחוזרים על עצמם בדרך כלל. בתבנית הביאור, ספק מונחים ספציפיים המזוהים בתוך מסמך בדרך כלל בכותרת העליונה שלו כמונחי מפתח המופרדים באמצעות נקודה-פסיק. ספק ערכים דמוגרפיים.

באופן ספציפי כל הצהרות טקסט המתארות את הרקע של המטופל כולל מין ו /או מין, מוצא אתני גיל או לאום. ספק מיקומים גיאוגרפיים המוזכרים בתוך הנרטיב הקליני מלבד כתובות מוסד ספציפיות. ספק ערכי סגנון חיים, כולל הצהרות טקסט המתארות פעילויות או התנהגויות תכופות של מטופלים הרלוונטיים לבריאותם הכללית.

בפועל, זה כרוך לעתים קרובות הרגלי עישון או צריכת אלכוהול אבל עשוי לכלול גם חשיפה לשמש, דיאטה או תדירות של סוגים מסוימים של פעילות גופנית. ספק ערכי היסטוריה רפואית המתייחסים להיסטוריה המשפחתית, כולל הצהרות טקסט המתארות תצפיות קליניות, ואירועים שחווים אחים, הורים ובני משפחה אחרים. כמו גם תנאים גנטיים ותצפיות שליליות.

ספק ערכים המתייחסים להיסטוריה החברתית, כולל הצהרות טקסט המתארות את רקע המטופל שאינם מכוסים בסעיפי הדמוגרפיה או אורח החיים. ההצהרות עשויות לכלול היסטוריה תעסוקתית והרגלים חברתיים. לספק ערכים המתייחסים להיסטוריה הרפואית והכירורגית של המטופלים, כולל הצהרות טקסט המתארות תצפיות רפואיות, טיפולים או אירועים אחרים שהתרחשו לפני תחילת המצגת הקלינית.

ציין אחת או יותר מ-16 קטגוריות מערכת המחלות הבאות בהתבסס על אלה המשמשות בסיווג הסטטיסטי הבינלאומי של מחלות ובעיות בריאות קשורות, תיקון 10 כמצוין בטבלה. לספק פרטים של כל הסימנים והתסמינים כולל כל הצהרות טקסט המתארות כל תצפיות רפואיות של סימנים או תסמינים החל במצגת הראשונית על תחילת, משך, חומרה או פתרון של הסימפטומים כפי שסופק. ספק פרטים על כל מקרה תחלואה, כולל מונחים או ביטויים המתארים מחלות שונות שנכחו בזמן המצגת הקלינית הראשונית.

לספק פרטים על כל טכניקות האבחון והנהלים כולל שמות ההליכים הרפואיים שהושלמו למטרות אבחון. כגון בדיקות, בדיקות ודמיון. כמו גם התנאים שבהם בוצעו הבדיקות והמיקומים האנטומיים הרלוונטיים.

אבל לא כולל תוצאות בדיקה. ספק פרטים על האבחנה. כולל כל הצהרות טקסט המתארות את אבחנות המחלה.

גם אם האבחנה הסופית מעורפלת. ספק את כל ערכי המעבדה ותוצאות הבדיקה. כולל שמות בדיקות האבחון, ערכיהן והתנאים שבהם בוצעו הבדיקות.

השימוש בערכים מספריים ואיכותיים מקובל. ספק פרטים על הפתולוגיה. כולל כל הצהרות טקסט המתארות את כל התוצאות של מחקרי הפתולוגיה וההיסטולוגיה.

כגון פתולוגיה ברוטו, אימונולוגיה או מחקרים מיקרוסקופיים. חלק מהמונחים עשויים לחפוף לאלה המשמשים בסעיף טכניקות אבחון והליכים. לספק את כל הטיפולים הפרמקולוגיים.

כולל כל הצהרות טקסט המתארות את הטיפולים התרופתיים המשמשים במהלך הטיפול ומתי וכיצד הטיפולים הופסקו. שימוש במונחים כלליים כגון אנטיביוטיקה או שמות תרופות ספציפיים. ספק את כל ההליכים ההתערבותיים.

כולל כל הצהרות טקסט המתארות הליכים טיפוליים המשמשים במהלך הטיפול ומתי וכיצד ההליכים הופסקו, כמו גם כל הליכים פולשניים. ההשתלה של מכשירים רפואיים או הליכים הושלמה כדי להקל על טיפולים אחרים. ספק את תוצאת המטופל.

כולל הצהרות טקסט המתארות את בריאות המטופל נכון לסוף המצגת הקלינית המתוארת בדו"ח. כולל כל בדיקות מעקב. לאחר מכן, ספק ספירות של כל תמונות האבחון, הדמויות, הסרטונים או ההנפשות והטבלאות.

כלי ביתרוח כל ספירות המדיה החזותית הכלולות בדוח בתבנית שצוינה. כדי להבחין בין הדמויות והתמונות, ספור את התמונות כמוצרים כלשהם של אבחון קליני. כולל תצלומים, מיקרו גרפים, תמונות קצב אלקטרוקרדיוגרמה או מוצרים אחרים של הדמיה אבחנתית.

בעוד שהמספרים צריכים להיחשב לכל התמונות האחרות. בדרך כלל כולל התוויות נתונים ואיורים. בטבלה זו מוצגות דוגמאות לשתי קבוצות של ביאורי מטה-נתונים של דוח אירועים קליניים שהושלמו.

הדוגמה הראשונה כוללת נתונים מדומים כדי להמחיש את התבנית האידיאלית של כל ערך. בעוד שהדוגמה השנייה מכילה ערכים שחולצו מדוח מקרה קליני שפורסם בפועל על מצב נדיר; אקרודרמטיטיס אנטופתיקה. שיטה זו מקלה הן על גישות אנושיות והן על גישות אוטומטיות לביאור מסמכים קליניים של טקסט חופשי.

על-ידי יצירת תבנית סטנדרטית מובנית של מטה-נתונים המבטיחה שהמידע הכלול בה יהיה נגיש ושימושי. המטה-נתונים הנוצרים על-ידי שיטה זו תומכים בניתוח טקסט במורד הזרם, כגון זיהוי ישויות בשם. מתן אפשרות לחוקרים לחלץ מידע על סימנים ותסמינים, טכניקות אבחון ונהלים וערכי מעבדה על פני קבוצת מטופלים המיוצגת בספרות הביו-רפואית.