Name: גילוי מוצר טבעי עם סינון פיצול LC-MS/MS: בקשה ניתוח Microcystin (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-05-31T14:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 18 s
Description: גלה מוצרים טבעיים חדשים באמצעות סינון פיצול אבחנתי ב-MZmine. שיטת LC-MS/MS זו מאפשרת זיהוי רעלנים ותרכובות מבניות בקומפלקסים ביולוגיים ליישומי בטיחות מזון ומים.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

המחברים מודים הת רושון (מרכז התרבות Phycological הקנדי, אוניברסיטת ווטרלו על מתן התרבות הקיבקקטריה למד וסורסאן אבושרף (אוניברסיטת קרפלטון) לקבלת סיוע טכני.

1. הכנת כרומטוגרפיה בלתי ממוקדת (LC)-ערכות נתונים MS/MS
הערה: DFF ניתן לבצע באמצעות ספקטרומטר מסה ברזולוציה גבוהה ושיטה אנליטית ממוטבת עבור מחלקת היעד של האנליטים. התנאים של מיטוב LC-MS/MS על ספקטרומטר המסה של אורדרראפ מפורטים בטבלת החומרים.
<ol><li>
הורדת MZmine 2 (http://mzmine.github.io/) הערה: נתונים לדוגמה CPCC300. raw ניתן למצוא ב-https://drive.google.com/open?id=1HHbLdvxCMycSasyNXPRqIe5pkaSqQoS0.<ol>
<li>תחת התפריט הנפתח שיטות נתונים גולמיים , בחר באפשרות ייבוא נתונים גולמיים .</li>
		<li>בחר את קבצי הנתונים שיש לנתח. ניתן לייבא קבצים בודדים או מרובים.</li>
	</ol>
</li>
	<li>אופציונלי אם תבנית נתוני הספק אינה נתמכת על-ידי MZmine, השתמש ב-פרוטרוביזארד16 כדי ליצור קבצי נתונים centroided. mzmine.<ol>
<li>בחר במסנן ' מרב האיסוף ' כדי להחיל אלגוריתם מבני מרחב המסופק על-ידי הספק.</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. סינון פיצול אבחון של קובצי הדה המיובאים
<ol><li>באמצעות הסמן, בחר וסמן את קבצי הנתונים בעמודת קבצי הנתונים הגולמיים של מסך MZmine הראשי.</li>
	<li>תחת התפריט הנפתח החזותי , בחר באפשרות סינון פיצול אבחון .</li>
	<li>בתיבת הדו DFF המופיעה (איור 3), הקלט את האפשרויות הבאות:<ol>
<li>זמן שמירה – השתמש בטווח אוטומטי או הגדר את טווח זמני השמירה בדקות שבהן המחלקה הייעודית של האנליטים תהיה בסדר.</li>
		<li>
שימוש בטווח אוטומטי m/z להשתמש או להגדיר את טווח m/z של מחלקת היעד של האנליטים, כולל האפשרות של תרכובות טעונה מרובים בעת הצורך.</li>
		<li>
m/z סובלנות – להזין את הדיוק של MS/ms השגה המוני של MSinstrument; 0.01 מ'/ת' או 3.0 ppm מתאים לפלטפורמת אורדרראפ. אם רק יוני מוצרים אבחוניים ייחקרו, קלט 0.0 לתוך האפשרות האבחונית (Da) של אבחון הפסד נייטרלי . לעומת זאת, אם הפסדים מסוימים בלבד לא ייבדקו, הקלט 0.0 לתוך האפשרות של יוני מוצר האבחון (m/z) .</li>
		<li>
יוני מוצרים אבחוניים (m/z) -קלט את יון המוצרים הספציפי (עם) m/zשל המחלקה. הפרד בין יוני מוצרים מרובים באמצעות פסיק. הערה: הזנת יוני מוצרים מרובים ידמיינו את הספקטרום המכיל את כל יוני המוצרים המפורטים.</li>
		<li>
ערך הרזיה נייטרלי (Da) – קלט הפסד נייטרלי מסוים (es). הפרד בין הפסדים ניטרליים מרובים באמצעות פסיק. הערה: הזנת הפסדים ניטרליים מרובים תדמיין את הספקטרום המכיל את כל ההפסדים הניטרליים המפורטים. הזנת יוני מוצר אבחון והפסדים נייטרליים יהיה להמחיש ספקטרום שיספק את כל הקריטריונים.</li>
		<li>
עוצמת יון אבחונית מינימלית (% בסיס שיא) – כ-% מפסגת הבסיס של ספקטרום MS/ms, להגדיר את העוצמה המינימלית עבור יוני מוצר אבחון ו/או הפסדים ניטרליים להיחשב.</li>
		<li>
Peaklist קובץ פלט – בחר נתיב ושם קובץ כדי להפיק את התוצאות.</li>
		<li>לחץ על אישור לחצן כדי להפעיל את ניתוח dff. העלילה DFF תופיע על השלמת השלבים לעיל בהצלחה הערה: קבצי נתונים משני. csv ייווצרו. {קובץ הפלט של Peaklist}. csv מכיל את המספרים המקודטים של m/z, מספרי הסריקה ושעות השמירה של הסריקות. זה יכול לשמש מודולים MZmine הקיים כולל שיטות נתונים גולמיים &Gt; זיהוי שיא &Gt; ממוקד לזיהוי השיא כדי ליצור כרומטוגרמות ion שחולצו של סמנים שנתקלו בקריטריוני dff המוגדרים. {קובץ הפלט של Peaklist} _ data. csv מכיל את ה- m/zהקודמן, המוצר יון /ת' וזמני השמירה כדי לאפשר יצירה של חלקות Dff מחוץ ל-mzmine.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. שימוש לדוגמה ב-DFF לניתוח microcystin
<ol><li>
הכנה לדוגמא
	<ol>
<li>לחטא 250 mL מבחנות erlenmeyer אייר המכיל 30 מ ל של מדיה סטרילית של MA17 או אחרים מדיה הצמיחה כחוליות (BG-11) מצויד בפקק קצף.</li>
		<li>איחסן מדיה הצמיחה מעוקר עם התרבות הציאנקטריה כ 5 × 105 תאים mL-1 תחת תנאים אספטי. הצג את צפיפות התאים עם הדימום. בדוגמה זו, לגדול M. aeruginosa זן CPCC300 פוטואוטוטרופי ב 27 ° c, מואר עם אור פלורסנט לבן קריר (30 μe M-2 s-1) באמצעות אור 12 h: 12 h כהה המשטר. מערבולת את התאים פעם ביום.</li>
		<li>הפרד את התאים מתוך מדיום התרבות לאחר 26 ימים על ידי סינון ואקום באמצעות 47 מילימטר בקוטר GF/C מיקרופייבר מטלית זכוכית.</li>
		<li>הוסף 3 מ"ל של 80% מתנול (aq) לתאים שנקטפו 14 מ ל שפופרת בדיקה (s).</li>
		<li>מערבולת ולאחר מכן sonicate את שפופרת הבדיקה (עם) המכילים תאי כחוליות עבור 30 s כל אחד. אחסן את שפופרת הבדיקה ב-20 ° c עבור 1 h. החזר את צינורית הבדיקה לטמפרטורת החדר ואפשר למדגם (ים) להפשיר במשך 15 דקות.</li>
		<li>חזור על השלב 3.1.5 שתי פעמים נוספות כדי לשחזר ביעילות את התאים.</li>
		<li>לסנן את התמצית כתוצאה מהחיידקים (ים) באמצעות מסנני 0.22 יקרומטר (s).</li>
		<li>תמצית יבש (ים) עם מאייד בטמפרטורה של 30 ° צ' באמצעות זרם עדין של גז חנקן. אחסן את התמצית יבש ב-20 ° c עד לניתוח LC-MS/MS.</li>
		<li>מרכיבים מחדש את שאריות יבשים עם 500 μL של 90% מתנול (aq) ו מערבולת עבור 30 בקבוקון כתום ענבר לפני ניתוח.</li>
	</ol>
</li>
	<li>באמצעות שיטת רכישה. ברזולוציה גבוהה של ספקטרומטר מסה הערה: תנאי LC-MS אופטימיזציה עבור ניתוח MC משמש כאן מפורטים בטבלה של חומרים.</li>
	<li>הכן את ה-datafile (s) ויבא לתוך MZmine בעקבות שלבים 1.1 ו-1.2.</li>
	<li>בחר את datafiles והפעל את מודולי DFF בעקבות השלבים 2.1-2.2.</li>
	<li>עבור ניתוח MC, השתמש בהגדרות הבאות בתוך מודול DFF (איור 3).<ol>
<li>
זמן השמירה – הקלט את הטווח של 2.00 עד 6.00 דקות.</li>
		<li>
מקודמן m/z – טווח קלט m/z של 430.00 עד 1200.00.</li>
		<li>
m/z סובלנות – החל את הסובלנות m/z של 0.01 m/z או 3.0 ppm.</li>
		<li>
יוני מוצרים אבחוניים (m/z) – קלט m/z של 135.0803, 163.1114 כיוני מוצרים אבחוניים</li>
		<li>
ערך הרזיה נייטרלי (Da) – קלט 0.0 כדי להגדיר כי לא נעשה שימוש בהפסדים ניטרליים לאבחון.</li>
		<li>
עוצמת יון אבחונית מינימלית (% בסיס שיא) – שימוש 15.00 כסף האינטנסיביות המינימלי</li>
		<li>
Peaklist קובץ הפלט – להגדיר את קובץ הפלט כמו putative_MCs. csv.</li>
	</ol>
</li>
	<li>לחץ על אישור לחצן כדי להפעיל את ניתוח dff. מגרש DFF (איור 4) יופיע על השלמת השלבים לעיל בהצלחה</li>
</ol>

<ol><li>Mayer, P. M., Poon, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+mechanisms+of+collisional+activation+of+ions+in+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Mass+Spectrometry+Reviews%22%5BJournal%5D)">The mechanisms of collisional activation of ions in mass spectrometry.</a> Mass Spectrometry Reviews. 28 (4), 608-639 (2009).</li>
<li>Fisch, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biosynthesis+of+natural+products+by+microbial+iterative+hybrid+PKS%E2%80%93NRPS%5BTitle%5D)+AND+%22RSC+Advances%22%5BJournal%5D)">Biosynthesis of natural products by microbial iterative hybrid PKS–NRPS.</a> RSC Advances. 3 (40), 18228-18247 (2013).</li>
<li>Kelman, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+six+new+Alternaria+sulfoconjugated+metabolites+by+high-resolution+neutral+loss+filtering%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Communications+in+Mass+Spectrometry%22%5BJournal%5D)">Identification of six new Alternaria sulfoconjugated metabolites by high-resolution neutral loss filtering.</a> Rapid Communications in Mass Spectrometry. 29 (19), 1805-1810 (2015).</li>
<li>Renaud, J. B., Kelman, M. J., Qi, T. F., Seifert, K. A., Sumarah, M. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Product+ion+filtering+with+rapid+polarity+switching+for+the+detection+of+all+fumonisins+and+AAL-toxins%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Communications+in+Mass+Spectrometry%22%5BJournal%5D)">Product ion filtering with rapid polarity switching for the detection of all fumonisins and AAL-toxins.</a> Rapid Communications in Mass Spectrometry. 29 (22), 2131-2139 (2015).</li>
<li>Renaud, J. B., Kelman, M. J., McMullin, D. R., Yeung, K. K. -C., Sumarah, M. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+C8+liquid+chromatography-tandem+mass+spectrometry+for+the+analysis+of+enniatins+and+bassianolides%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Chromatography+A%22%5BJournal%5D)">Application of C8 liquid chromatography-tandem mass spectrometry for the analysis of enniatins and bassianolides.</a> Journal of Chromatography A. 1508, 65-72 (2017).</li>
<li>Walsh, J. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diagnostic+Fragmentation+Filtering+for+the+Discovery+of+New+Chaetoglobosins+and+Cytochalasins%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Communications+in+Mass+Spectrometry%22%5BJournal%5D)">Diagnostic Fragmentation Filtering for the Discovery of New Chaetoglobosins and Cytochalasins.</a> Rapid Communications in Mass Spectrometry. , (2018).</li>
<li>Wang, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sharing+and+community+curation+of+mass+spectrometry+data+with+Global+Natural+Products+Social+Molecular+Networking%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+biotechnology%22%5BJournal%5D)">Sharing and community curation of mass spectrometry data with Global Natural Products Social Molecular Networking.</a> Nature biotechnology. 34 (8), 828(2016).</li>
<li>Bartók, T., Szécsi, Á, Szekeres, A., Mesterházy, Á, Bartók, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+new+fumonisin+mycotoxins+and+fumonisin-like+compounds+by+reversed-phase+high-performance+liquid+chromatography%2Felectrospray+ionization+ion+trap+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Communications+in+Mass+Spectrometry%3A+An+International+Journal+Devoted+to+the+Rapid+Dissemination+of+Up-to-the-Minute+Research+in+Mass+Spectrometry%22%5BJournal%5D)">Detection of new fumonisin mycotoxins and fumonisin-like compounds by reversed-phase high-performance liquid chromatography/electrospray ionization ion trap mass spectrometry.</a> Rapid Communications in Mass Spectrometry: An International Journal Devoted to the Rapid Dissemination of Up-to-the-Minute Research in Mass Spectrometry. 20 (16), 2447-2462 (2006).</li>
<li>Bartók, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+and+characterization+of+twenty-eight+isomers+of+fumonisin+B1+%28FB1%29+mycotoxin+in+a+solid+rice+culture+infected+with+Fusarium+verticillioides+by+reversed-phase+high-performance+liquid+chromatography%2Felectrospray+ionization+time-of-flight+and+ion+trap+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Communications+in+Mass+Spectrometry%22%5BJournal%5D)">Detection and characterization of twenty-eight isomers of fumonisin B1 (FB1) mycotoxin in a solid rice culture infected with Fusarium verticillioides by reversed-phase high-performance liquid chromatography/electrospray ionization time-of-flight and ion trap mass spectrometry.</a> Rapid Communications in Mass Spectrometry. 24 (1), 35-42 (2010).</li>
<li>Pluskal, T., Castillo, S., Villar-Briones, A., Orešič, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MZmine+2%3A+modular+framework+for+processing%2C+visualizing%2C+and+analyzing+mass+spectrometry-based+molecular+profile+data%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+bioinformatics%22%5BJournal%5D)">MZmine 2: modular framework for processing, visualizing, and analyzing mass spectrometry-based molecular profile data.</a> BMC bioinformatics. 11 (1), 395(2010).</li>
<li>Spoof, L., Catherine, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Appendix+3%3A+tables+of+microcystins+and+nodularins%5BTitle%5D)+AND+%22Handbook+of+cyanobacterial+monitoring+and+cyanotoxin+analysis%22%5BJournal%5D)">Appendix 3: tables of microcystins and nodularins.</a> Handbook of cyanobacterial monitoring and cyanotoxin analysis. , 526-537 (2016).</li>
<li>Pick, F. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Blooming+algae%3A+a+Canadian+perspective+on+the+rise+of+toxic+cyanobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Canadian+Journal+of+Fisheries+and+Aquatic+Sciences%22%5BJournal%5D)">Blooming algae: a Canadian perspective on the rise of toxic cyanobacteria.</a> Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 73 (7), 1149-1158 (2016).</li>
<li>Carmichael, W. W., Boyer, G. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Health+impacts+from+cyanobacteria+harmful+algae+blooms%3A+Implications+for+the+North+American+Great+Lakes%5BTitle%5D)+AND+%22Harmful+algae%22%5BJournal%5D)">Health impacts from cyanobacteria harmful algae blooms: Implications for the North American Great Lakes.</a> Harmful algae. 54, 194-212 (2016).</li>
<li>Mayumi, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structural+characterization+of+microcystins+by+LC%2FMS%2FMS+under+ion+trap+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+antibiotics%22%5BJournal%5D)">Structural characterization of microcystins by LC/MS/MS under ion trap conditions.</a> The Journal of antibiotics. 59 (11), 710(2006).</li>
<li>Frias, H. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+electrospray+tandem+mass+spectrometry+for+identification+of+microcystins+during+a+cyanobacterial+bloom+event%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemical+and+biophysical+research+communications%22%5BJournal%5D)">Use of electrospray tandem mass spectrometry for identification of microcystins during a cyanobacterial bloom event.</a> Biochemical and biophysical research communications. 344 (3), 741-746 (2006).</li>
<li>Kessner, D., Chambers, M., Burke, R., Agus, D., Mallick, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ProteoWizard%3A+open+source+software+for+rapid+proteomics+tools+development%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">ProteoWizard: open source software for rapid proteomics tools development.</a> Bioinformatics. 24 (21), 2534-2536 (2008).</li>
<li>Watanabe, M. F., Oishi, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+environmental+factors+on+toxicity+of+a+cyanobacterium+%28Microcystis+aeruginosa%29+under+culture+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Applied+and+Environmental+microbiology%22%5BJournal%5D)">Effects of environmental factors on toxicity of a cyanobacterium (Microcystis aeruginosa) under culture conditions.</a> Applied and Environmental microbiology. 49 (5), 1342-1344 (1985).</li>
<li>Hollingdale, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Feasibility+study+on+production+of+a+matrix+reference+material+for+cyanobacterial+toxins%5BTitle%5D)+AND+%22Analytical+and+bioanalytical+chemistry%22%5BJournal%5D)">Feasibility study on production of a matrix reference material for cyanobacterial toxins.</a> Analytical and bioanalytical chemistry. 407 (18), 5353-5363 (2015).</li>
<li>Yuan, M., Namikoshi, M., Otsuki, A., Sivonen, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+amino+acid+side-chain+on+fragmentation+of+cyclic+peptide+ions%3A+differences+of+electrospray+ionization%2Fcollision-induced+decomposition+mass+spectra+of+toxic+heptapeptide+microcystins+containing+ADMAdda+instead+of+Adda%5BTitle%5D)+AND+%22European+Mass+Spectrometry%22%5BJournal%5D)">Effect of amino acid side-chain on fragmentation of cyclic peptide ions: differences of electrospray ionization/collision-induced decomposition mass spectra of toxic heptapeptide microcystins containing ADMAdda instead of Adda.</a> European Mass Spectrometry. 4 (4), 287-298 (1998).</li>
<li>Schymanski, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identifying+small+molecules+via+high+resolution+mass+spectrometry%3A+communicating+confidence%5BTitle%5D)+AND+%22Environmental+science+%26+technology%22%5BJournal%5D)">Identifying small molecules via high resolution mass spectrometry: communicating confidence.</a> Environmental science & technology. 48 (4), 2097(2014).</li>
</ol>

למחברים אין מה לחשוף

DFF היא אסטרטגיה ישר-קדימה ומהירה לזיהוי מחלקות שלמות של תרכובות, רלוונטיות במיוחד עבור גילוי מתחם טבעי מוצר. ההיבט החשוב ביותר של DFF הוא הגדרת קריטריונים ספציפיים MS/MS הפיצול עבור המעמד המיועד של תרכובות. בדוגמה זו, השתמשו ב-DFF כדי לאתר את כל שאריות Adda המכילים מחשבי MCs בתמצית סלולרית של M. aeruginosa . למרות שהרוב המכריע של MCs מכילים שאריות Adda, שאריות אחרים בעמדה זו ידועים, בעיקר deמתיל ו-acetyldemethyl-Adda משתנים19. כל MCs עם שאריות אלה לא יזוהו באמצעות הקריטריונים שהוגדרו. עם...

טנדם המסה (MS/MS) היא בשימוש נרחב ספקטרומטר מסה שיטה הכוללת בידוד יון מקודמת וגורם לפיצול באמצעות יישום של אנרגיה הפעלה כגון התנגשות המושרה (CID)1. האופן שבו שברי יונים מקושרים בצורה אינטימית למבנה המולקולרי שלו. מוצרים טבעיים הם לעתים קרובות biosynthesized סונתז תערובות של תרכובות דומות מבנית ולא כמו כימיקל יחיד ייחודי2. ככאלה, תרכובות קשורות מבנית המהווים חלק מאותה מחלקה biosynthetic לעתים קרובות לשתף מאפיינים מרכזיים MS/MS הפיצול, כולל יוני מוצרים משותפים ו/או הפסדים ניטרליים. היכולת להקרין דגימות מורכבות עבור תרכובות בעלות יוני מוצר ספציפיים לכיתה ו/או הפסדים ניטרליים היא אסטרטגיה רבת עוצמה כדי לזהות מחלקות שלמות של תרכובות, שעשויות להוביל לגילוי של מוצרים טבעיים חדשים3, ד , מיכל 5 , 6. במשך עשרות שנים, שיטות ספקטרומטר המסה כגון סריקת הפסד נייטרלי וסריקת יון מקודמות שבוצעו על מכשירים ברזולוציה נמוכה אפשרה יונים עם הפסד נייטרלי או יוני מוצר זהים להתגלות. עם זאת, היונים או המעברים הספציפיים הנחוצים להגדרה לפני ביצוע הניסויים. כאשר ספקטרומטר מסה ברזולוציה גבוהה הפכו לפופולריים יותר במעבדות מחקר, דוגמאות מורכבות מוקרן כעת בדרך כלל באמצעות שיטות רכישה לא ממוקדות ותלויות נתונים. בניגוד לאובדן נייטרלי מסורתי סריקת יון מקודמן, תרכובות קשורות מבנית ניתן לזהות על ידי ניתוח לאחר הרכישה7. בעבודה זו, אנו מוכיחים אסטרטגיה שפיתחנו לסנן פיצול אבחון (dff)5,6, ישר קדימה וידידותי למשתמש גישה לזהות מחלקות שלמות של תרכובות בתוך מטריצות מורכבות. מודול DFF זה כבר יושם לתוך מקור פתוח, MZmine 2 פלטפורמת והוא זמין על ידי הורדת MZmine 2.38 או מהדורות חדשות יותר. DFF מאפשר למשתמשים למסך ביעילות את מערכות הנתונים של ד. א. ל. (MS/MS ספקטרה המכילים את יון מוצר (ים) ו/או הפסד נייטרלי (es) כי הם אבחון עבור כיתות שלמות של תרכובות. מגבלה של DFF הוא יונים אופייניים מוצר ו/או הפסדים ניטרליים עבור מחלקה של תרכובות חייב להיות מוגדר על ידי האנליסט.
לדוגמה, כל אחד יותר מ 60 שונים של fumonisin פטרת מזוהה8,9 בעלי שרשרת של tricarballylic אשר יוצר m/z 157.0142 (C6H5O5-) מוצר יון על פיצול של [M-H]- יון4. לכן, כל pumonisins במדגם ניתן לזהות באמצעות DFF על ידי הקרנת כל MS/MS ספקטרום בתוך ערכת נתונים של לוד המכילים את הבולטים m/z 157.0142 המוצר יון. באופן דומה, תרכובות sulfated ניתן להבחין על ידי הקרנת מגדיר הנתונים של דה לטרשת נפוצה/ms המכילים אובדן ניטרלי אבחון של 79.9574 Da (SO3)3. גישה זו גם הוחל בהצלחה לגילוי חדש פפטידים מחזורי5 ומוצרים טבעיים המכילים טריפטופן או שאריות פנילאלטין6.
כדי להדגים את האפקטיביות של DFF ואת קלות השימוש שלה בתוך פלטפורמת MZmine10, החלתי גישה זו לניתוח microcystins (mcs); מחלקה של מעל 240 רעלים הקשורים מבחינה מבנית המיוצר על ידי כחוליות מים מתוקים11,12,13.
מרבית הרעלים שדווחו הם MCs, עם MC-LR (לאוצין [L]/arginine [R]) congener לרוב למדו (איור 1). מחשבי MCs הם מונלוציציתיים שאינם הריבוזומפיים, ביוסינתזה על ידי מספר סייאובקטריה כולל מיקרוצילסטיס, אננינה, Nostoc, ו- plankto,12. מחשבי MCs מורכבים מחמישה שאריות משותפים ושני תנוחות משתנה שנכבשו על ידי חומצות אמינו. כמעט כל MCs בעלי מאפיין β-אמינו חומצה 3-אמינו-9-מתיונין-2, 6, 8-triמתיק-10-פנילdeca-4, 6-חומצה dienoic (Adda) שאריות בעמדה 511.  משעולים הפיצול ms/ms של mcs מתוארים היטב14,15; שאריות adda אחראי יון מוצר ms/ms בולטים, m/z 135.0803+ (C9H11O+) כמו גם יוני מוצרים אחרים כולל m/z 163.1114+ (C11H15 O+) (איור 2). לא ממוקד הנתונים של מערכת המידע הנייד של מיקרוצילף שניתן להציג עבור כל microcystins הנמצאים באמצעות יוני אבחון אלה, והעניק כי המיקרוcystins יש שאריות adda.

<table><tbody><tr><td>Cyanobacteria</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Microcystis aeruginosaCPCC300</td><td>המרכז הקנדי לתרבות פיזיולוגית</td><td></td> CPCC300 <td>https://uwaterloo.ca/canadian-phycological-culture-centre/</td></tr><tr><td>תוכנה</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Proteowizard (תוכנה)</td><td></td><td></td><td>http://proteowizard.sourceforge.net/</td></tr> <tr><td>Mzmine 2</td><td></td><td>software</td><td>http://mzmine.github.io/</td></tr><tr><td>LC-MS</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Q-Exactive Orbitrap</td><td></td> <td>Thermo-מצויד</td> <td>במקור יינון HESI</td></tr><tr><td>1290 UHPLC</td><td>Agilent</td><td></td><td>מצויד במשאבה בינארית, דגימה אוטומטית, תא עמודים</td></tr><tr><td>עמודה C18</td><td>Agilent</td><td>959757-902</td><td>עמודת Eclipse Plus C18 RRHD (2.1 ופעמים; 100 מ"מ, 1.8 &mu; m)</td></tr> <tr><td><חזק>ממיסים< / חזק></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Optima LC-MS כיתה מתנול</td><td></td><td>פישר A456-4</td><td></td></tr><tr><td>OptimaLC-MS כיתה אצטוניטריל</td><td>פישר</td><td>A955-4</td><td></td></tr><tr><td>OptimaLC-MS כיתה מים</td><td></td><td>Fisher W6-4</td><td></td></tr><tr><td>LC-MS כיתה חומצה פורמית</td><td>פישר</td><td>A11710X1-AMP</td><td></td></tr><tr><td>Vortex-Genie 2</td><td>Scientific Industries</td><td>SI-0236</td><td></td></tr><tr><td>צנטריפוגה Sorvall Micro 21</td><td>Thermo Scientific</td><td>75-772-436</td><td></td></tr><tr><td><חזק>אחר</חזק></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>ענבר בקבוקוני HPLC 2 מ"ל/כמוסות</td><td>Agilent</td><td>5182-0716/5182-0717</td><td></td></tr><tr><td>0.2-&mu; מסנני מזרק PTFE</td><td>מ Pall Corp.</td><td>4521</td><td></td></tr><tr><td>Whatman 47 מ"מ GF / A מסנני מיקרופייבר זכוכית</td><td>סיגמא-אולדריץ'</td><td>WHA1820047</td><td></td></tr><tr><td><חזק>מדיה</חזקה></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>MA מדיה (pH 8.6) (כמות / ליטר)</td><td></td><td></td><td>Watanabe, M. F. & Oishi, S. השפעות של גורמים סביבתיים על רעילות של ציאנובקטריום (Microcystis aeruginosa) בתנאי תרבית. מיקרוביולוגיה יישומית וסביבתית. 49 (5), 1342-1344 (1985).</td></tr><tr><td>Ca(NO3)&middot; 4H2O, 50 מ"ג</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C2786</td><td></td></tr><tr><td>KNO3, 100 מ"ג</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P8291</td><td></td></tr><tr><td>NaNO3, 50 מ"ג</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S5022</td><td></td></tr><tr><td>Na2SO4, 40 mg</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S5640</td><td></td></tr><tr><td>MgCl2&middot; 6H20, 50 מ"ג</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M2393</td><td></td></tr><tr><td>נתרן גליצרופוספט, 100 מ"ג</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G9422</td><td></td></tr><tr><td>H3BO3, 20 מ"ג</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B6768</td><td></td></tr><tr><td>Bicine, 500 מ"ג</td><td>תמיסת מתכת Sigma-Aldrich</td><td>RES1151B-B7</td><td></td></tr><tr><td></td><td>P(IV), 5 מ"ל</td><td></td><td></td></tr><tr><td>הבא את הדברים הבאים ל-1 L עם ddH2O</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>NaEDTA&middot; 2HO</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>E6635</td><td></td></tr><tr><td>FeCl3 &middot; 6H2O</td><td>סיגמא-אולדריץ'</td><td>236489</td><td></td></tr><tr><td>MnCl2&middot; 4H2O</td><td>Baker</td><td>2540</td><td></td></tr><tr><td>ZnCl2</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Z0152</td><td></td></tr><tr><td>CoCl2&middot; 6H2O</td><td>סיגמא-אולדריץ'</td><td>C8661</td><td></td></tr><tr><td>Na2MoO4&middot; 2H2O</td><td>Baker</td><td>3764</td><td></td></tr><tr><td>Cyanobacteria BG-11 50X תמיסת מים מתוקים</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C3061-500mL</td><td></td></tr></tbody></table>

גילוי מוצר טבעי עם סינון פיצול lc-ms/ms: בקשה ניתוח microcystin

Natural Product Discovery with LC-MS/MS Diagnostic Fragmentation Filtering: Application for Microcystin Analysis

מוצרים טבעיים הם לעתים קרובות biosynthesized סונתז תערובות של תרכובות דומות מבנית, ולא מתחם אחד. בשל תכונות מבניות נפוצות שלהם, תרכובות רבות בתוך אותה מחלקה עוברים פיצול MS/MS דומה ויש להם כמה יונים מוצר זהה ו/או הפסדים ניטרליים. המטרה של סינון פיצול אבחון (DFF) היא לזהות ביעילות את כל התרכובות של מחלקה נתונה בתמצית מורכבת על-ידי הקרנת מערכות נתונים מסוג LC-MS/MS לצורך הגדרת מערך MS/ms, המכילות יוני מוצרים ספציפיים למחלקה ו/או הפסדים ניטרליים. שיטה זו מבוססת על מודול DFF מיושם בתוך פלטפורמת MZmine מקור פתוח הדורש תמציות לדוגמה להיות מנותח על ידי רכישה תלוי נתונים על ספקטרומטר מסה ברזולוציה גבוהה, כגון אוריוראפ פי ארבעה או מאסה פי ארבעה של הטיסה. אנלייזרים. המגבלה העיקרית של גישה זו היא שהאנליסט חייב להגדיר תחילה אילו יוני מוצר ו/או הפסדים ניטרליים הם ספציפיים למעמד היעד של מוצרים טבעיים. DFF מאפשר את הגילוי הבא של כל המוצרים הטבעיים הקשורים במדגם מורכב, כולל תרכובות חדשות. בעבודה זו, אנו מדגימים את האפקטיביות של dff על ידי הקרנת תמציות של מיקרוקילף aeruginosa, בולט פריחת אצות בולטים מזיקים גרימת חיידקים, לייצור של microcystins.

העלילה DFF שנוצרה לאחר ניתוח של M. aeruginosa CPCC300 מוצג באיור 4. ציר ה-xשל מחלקה זו הוא m/z של היונים המקודרים המביעות את קריטריוני ה-dff המוגדרים כאשר ציר ה- yמציג את ה- m/z של כל יוני המוצרים בתוך ספקטרום ה-mcs ms/ms. עבור ניתוח זה, הקריטריונים של זיהוי ה-MC כללו יונים מקודמן בתוך טווח m/z של 440-1200, זמני שמירה בין 2.00 – 6.00 min. והכי חשוב, ספקטרום MS/MS זה מכיל הן m/z 135.0803 ו 163.1114...

סינון פיצול אבחון, מיושם לתוך MZmine, היא גישה אלגנטית, לאחר הרכישה למסך LC-MS/MS datasets עבור מחלקות שלמות של מוצרים טבעיים ידועים ולא ידועים. כלי זה מחפש את MS/MS ספקטרום עבור יוני מוצרים ו/או הפסדים ניטרליים כי האנליסט הגדיר כאבחון עבור המחלקה כולה של תרכובות.

גילוי מוצר טבעי עם סינון פיצול LC-MS/MS: בקשה ניתוח Microcystin

Natural products are often biosynthesized as mixtures of structurally similar compounds, rather than a single compound. Due to their common structural ...

מוצרים טבעיים הם לעתים קרובות biosynthesized כמו סוג של תרכובות, ולא כמוצר אחד. סינון פיצול אבחון הוא גישה פשוטה לזיהוי כל התרכובות הקשורות מבנית בתוך תערובת מורכבת. סינון פיצול אבחון, המיושם בתוכנת MZmine, מאפשר לאנליסט לחקור ערכות נתונים ספקטרומטריות מסה עבור מוצרים טבעיים חדשים שאחרת היו מפספסים.זה כולל תוצרים ביולוגיים חדשים, וגם רעלנים חדשים. סינון פיצול אבחון, המוחל על מחלקות רעלנים המזהמות מזון ומים, יכול ליידע הערכות חשיפה. כאשר מוחל על תמציות מיקרוביאלית וצמחים, זה יכול לגרום לגילוי של תרכובות חדשות.שימוש בסינון פיצול אבחון דורש הבנה של תכונות ספקטרומטריית מסת טנדם מרכזיות המגדירות מחלקה כימית. משמעות הדבר היא כי תרכובות דומות מבנית ייצרו יונים אופייניים. שמי שון הוגסטרה.אני טכנאי מחקר ומפתח תוכנה במרכז שלנו, ואני אדגים את ההליך. כדי להכין מדגם לניתוח מיקרוציסטין, לחסן 30 מיליליטר של ציאנובקטריה סטרילית צמיחה בינונית עד כ 5 פעמים-10-the-החמישי תאים למיליליטר, בתנאים אספטיים, ב 250 מיליליטר ארלנזייר flasks, ניטור צפיפות התא עם המוציטמטר. לאחר 26 ימים של תרבות פוטואטוטרופית, מואר עם אור פלואורסצנטי לבן קריר באמצעות משטר 12 שעות בהיר כהה ב 27 מעלות צלזיוס, עם מערבולת פעם ביום, להשתמש 47 מיליליטר קוטר GF / C מיקרופייבר זכוכית ניירות מסנן להפריד את התאים מן מדיום התרבות על ידי סינון ואקום.הוסף שלושה מיליליטר של 80% מתנול לתאים שנקטפו במבחנות 14 מיליליטר, ומערבולת ולאחר מכן sonicate כל צינור במשך 30 שניות. לאחר sonication, lyse את הדגימות עם שלוש שעה אחת רצופה, מינוס 20 מעלות צלזיוס להקפיא, ו 15 דקות טמפרטורת החדר להפשיר מחזורים, ולסנן כל תמצית תא ציאנובקטריה וכתוצאה מכך באמצעות מסנני מזרק פוליטרא-פוליאלורואתילן בודדים 0.22 מיקרומטר. בעזרת זרם עדין של גז חנקן, ייבשו את התמציות עם אידוי ב-30 מעלות צלזיוס, ואחסנו את התמציות יבשות במינוס 20 מעלות צלזיוס.לניתוח ספקטרומטריית מסת טנדם כרומטוגרפיה נוזלית, יש לבנות מחדש את השאריות המיובשת שיש לנתח עם 500 מיקרוליטרים של 90% מתנול, ומערבולת הדגימות למשך 30 שניות. מעבירים לבקבוקון כרומטוגרפיה נוזלי בלחץ גבוה ענבר. לאחר מכן לנתח את תמצית ציאנובקטריה באמצעות שיטת רכישה תלוית נתונים על ספקטרומטר מסה ברזולוציה גבוהה על פי פרוטוקולים סטנדרטיים.רוב המיקרוציסטינים מכילים שאריות ATA המייצרות שני יונים של מוצרי אבחון בספקטרומטריית מסה דו-מושבית, M עד Z 135.0803 ו- 163.1114. להכנת ערכת נתונים של ספקטרומטריית מסה טנדם נוזלית לא ממוקדת, פתחו את MZmine 2 ובחרו ייבוא נתונים גולמיים"תחת שיטות נתונים גולמיות". לאחר מכן בחר את קבצי הנתונים מניתוח המיקרוציסטין ובחר את מסנן איסוף השיא כדי להחיל אלגוריתם centroiding שסופק על-ידי הספק.לסינון פיצול אבחון, או DFF, של קבצי הרכישה המיובאים התלויים בנתונים, השתמש בסמן כדי לסמן את קבצי הנתונים ופתח את התפריט הנפתח 'פריט חזותי' כדי לבחור באפשרות DFF. בתיבת הדו-שיח DFF שמופיעה, הזן את טווח זמני השמירה ודקות שבהם המחלקה הממוקדת של אנליטים תימשך, ולמצוא את טווח יחס המסה-לטעינה של המחלקה הממוקדת של אנליטים, כולל האפשרות עבור תרכובות טעונות מרובות בעת הצורך. הזן את דיוק מסת מסת הדו-מושבית בר השגה של מכשיר ספקטרומטריית המסה, והזן את יונות המוצר הספציפיות לקבוצה של יחס המסה לטעינה.הזן את ההפסדים הניטרליים הספציפיים לקבוצה והגדר את העוצמה המינימלית עבור יווני מוצרי אבחון ו/או הפסדים ניטרליים שייחשבו כאחוז מהשיא הבסיסי של ספקטרומטריית ספקטרומטריית מסת הדו-מושבית. לאחר מכן בחרו נתיב ושם קובץ כדי ליצור פלט של התוצאות ולחצו על הלחצן 'אשר'' כדי להפעיל את ה- DFF. התוויית DFF תופיע עם השלמת ההתקנה בהצלחה.האנליסט חייב לפרש ספקטרום מסה טנדם של תרכובות ידועות בתוך מחלקה מורכבת כדי לזהות את היונים המוצר ו / או הפסדים ניטרליים כי הם אבחון עבור כל המחלקה של תרכובות. עלילה זו DFF נוצרה בעקבות הניתוח של M.aeruginosa CPCC 300. ציר ה- x מייצג יחס מסה-לטעינה זה של היונים המבשרים שהתאימו לקריטריוני ה- DFF המוגדרים, בעוד ציר ה- y מציג את יחס המסה לטעינה של כל היונים של המוצר בתוך ספקטרום ספקטרומטריית מסת הדו-שאדם של המיקרו-cystins.לניתוח זה, הקריטריונים לגילוי מיקרוצסטין כללו היונים המבשרים ביחס המסה לטעינה של 400 עד 1, 200, ושעות שמירה בין שתיים לשש דקות. והכי חשוב, ספקטרום ספקטרומטריית מסת טנדם אלה הכיל את שני יחסי המסה לטעינה מעל לסף עוצמת השיא המוגדר של 15%. מתוך 4, 116 ספקטרום ספקטרומטריית מסה טנדם שנרכש במהלך הניתוח, 26 הסתפקו בקריטריוני DFF וזוהו בתמצית M.aeruginosa CPCC 300.המיקרוציסטינים העיקריים שזוהו יכולים להיות מוקצים בביטחון כמיקרוציסטין לאוצין ארגינין וחומצה אספרטית דמתילציה מיקרוציסטין לאוצין ארגינין. כמו תרכובות חדשות מתגלים באמצעות סינון פיצול אבחון, האורגניזמים ניתן לגדל בקנה מידה גדול לבידוד ואפיון של תרכובות על ידי NMR. כאשר מוחל על microcystins, סינון פיצול אבחון מאפשר לנו לקבוע אם שיטות סינון ממוקדות מסורתיות מזהות את הרעלים העיקריים הקיימים בתוך מדגם.

natural-product-discovery-with-lc-msms-diagnostic-fragmentation

Research

JoVE Journal

Chemistry

כימיה

בהתחשב רוק הדגימה עבור יישומים קליניים בעתיד, כמו סוכריה על מקל (LLUF) בדיקה ultrafiltration היה מפוברק להשתלב בחלל הפה האנושי. ניתוח ישיר של רוק לא מעוכל על ידי NanoLC-LTQ ספקטרומטריית מסה הפגינו את היכולת של בדיקות LLUF להסיר חלבונים גדולים וחלבונים שפע גבוהות, ולהפוך נמוך שפע לזיהוי פפטידים יותר.

רוק הדגימה האדם Peptidome ילידים באמצעות בדיקה Lollipop-Like Ultrafiltration: פשט ולשפר גילוי פפטיד של ספקטרומטריית מסה קלינית

פרופיל מטבוליט לא ממוקד על ידי כרומטוגרפיה נוזלית בעלת ביצועים גבוהים במיוחד בשילוב עם ספקטרומטריית מסה (UPLC-MS) היא טכניקה רבת עוצמה לחקירת חילוף החומרים.  מאמר זה מתאר זרימת עבודה טיפוסית המשמשת לפרופיל מטבוליט לא ממוקד של סרום, כולל ארגון והכנת דגימות, רכישת נתונים, ניתוח נתונים, בקרת איכות וזיהוי מטבוליטים.

בקנה מידה גדול Profiling metabolomic ללא ממוקד של סרום על ידי כרומטוגרפיה נוזלית ביצועים-Mass ספקטרומטריית Ultra (UPLC-MS)

פרוטוקול זה מיועד למיצוי וריכוז של חלבון ו-DNA מביומסה מיקרוביאלית שנאספה ממי ים, ולאחר מכן יצירת פפטידים טריפטיים המתאימים לניתוח פרוטאומי מבוסס ספקטרומטריית מסה טנדם.

Metaproteomics זרימת עבודה Aquatic מיקרוביאלית: מתאים לtryptic פפטידים מתאימים לניתוח מבוסס ספקטרומטריית מסת טנדם

מוצג פרוטוקול מהיר לעיכול פרוטאוליטי עם מיקרו-ריאקטור טריפטי שנבנה בזרימה פנימית יחד עם ספקטרומטר מסה של יינון אלקטרו-ספריי (ESI). מתוארים ייצור המיקרו-כור, מערך הניסוי ותהליך רכישת הנתונים.

עיבוד אנזימתי תענית חלבונים עבור איתור MS עם microreactor זרימה דרך

כאן, אנו מציגים את פרוטוקול כימות יישוב רציף וניתוח שאינן ממוקדות של תרכובות fluorinated במים באמצעות ספקטרומטר מסה. מתודולוגיה זו מספק רמות כמותית של תרכובות שטיח ידוע ומזהה כימיקלים לא ידוע בדגימות קשורים עם הערכות כמותיות למחצה של שפע שלהם.

זיהוי לכל-כימית Polyfluorinated מינים בזרימת עבודה משולבת יישוב, שאינו ממוקד-סינון ברזולוציה גבוהה ספקטרומטר מסה

פרוטוקול זה מכסה ניתוח מפורט של הרכב פפטידוגליקן באמצעות ספקטרומטריית מסה של כרומטוגרפיה נוזלית בשילוב עם מיצוי תכונות מתקדם ותוכנת ניתוח ביואינפורמטיקה.

ניתוח כמותי למחצה של פפטידוגליקן על ידי כרומטוגרפיה נוזלית, ספקטרומטריית מסה וביואינפורמטיקה

כאן מתוארת בעיה רב-תחומית לגילוי מוקדם של פריחות ציאנובקטריאליות וציאנוטוקסינים נלווים. זה מאפשר זיהוי של ציאנובקטריה וציאנוקסינים הקשורים בדגימות מים ומטריצות אורגניות, כגון דגימות דו-כיווניות, תוך 24 שעות.

גילוי מוקדם של פריחות ציאנובקטריאליות וציאנוקסינים נלווים באמצעות אסטרטגיית זיהוי מהירה

הפרוטוקולים מתארים שיטות כרומטוגרפיה נוזלית בעלות ביצועים גבוהים בשילוב עם אינדקס שבירה או זיהוי ספקטרומטרי מסה לחקר תגובות מטבוליות במערכות מורכבות המבוססות על ליסאט ללא תאים.

כרומטוגרפיה נוזלית בשילוב לאינדקס שבירה או זיהוי ספקטרומטרי מסה ליצירת פרופיל מטבוליט במערכות ללא תאים מבוססות ליסאט

אנו מציגים שיטה לביאור וסיווג מבוססי ספקטרומטריית מסה מהירה (MS)/ספקטרומטריית מסה (MS) של אלקלואידים טרופאניים, שימושית הן לשכפול ראשוני של דגימות המכילות טרופאן והן לגילוי אלקלואידים חדשים לבידוד.

יישומים של ספקטרומטריית מסה טנדם כרומטוגרפיה נוזלית במחקר מוצרים טבעיים: אלקלואידים טרופאן כמקרה בוחן

פותח דגם אוטומטי משולב וקולקטור שבר (LC-mate) לאוטומציה של הפרדות HPLC חוזרות. תואם לגלאי HPLC שמפיקים אותות אנלוגיים, LC-mate משפר את ביצועי מערכות המופעלות ידנית ומאיץ תהליכי מחקר התלויים בכרומטוגרפיה נוזלית בעלת ביצועים גבוהים.

הפרדה אוטומטית של HPLC באמצעות LC-mate: דוגם אוטומטי משולב ואוסף חלקיקים לטיהור בקנה מידה מיקרו

כאן אנו מציגים פרוטוקול סטנדרטי המשלב עצי ספקטרומטריית מסה רב-שלביים עם תהליך פיצול המבוסס על נוזל אוראלי Huoxiang Zhengqi.

גישה טכנית לניתוח מבני של תרכובת לא ידועה בנוזל פה של Huoxiang Zhengqi בהתבסס על ספקטרומטריית מסה של מלכודת יונים ליניארית

גלה מוצרים טבעיים חדשים באמצעות סינון פיצול אבחנתי ב-MZmine. שיטת LC-MS/MS זו מאפשרת זיהוי רעלנים ותרכובות מבניות בקומפלקסים ביולוגיים ליישומי בטיחות מזון ומים.

גילוי מוצר טבעי עם סינון פיצול LC-MS/MS: בקשה ניתוח Microcystin

גלה סרטונים נוספים