-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

HE

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

he_IL

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Chemistry
גילוי מוצר טבעי עם סינון פיצול LC-MS/MS: בקשה ניתוח Microcystin
גילוי מוצר טבעי עם סינון פיצול LC-MS/MS: בקשה ניתוח Microcystin
JoVE Journal
Chemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Chemistry
Natural Product Discovery with LC-MS/MS Diagnostic Fragmentation Filtering: Application for Microcystin Analysis

גילוי מוצר טבעי עם סינון פיצול LC-MS/MS: בקשה ניתוח Microcystin

Full Text
9,524 Views
07:18 min
May 31, 2019

DOI: 10.3791/59712-v

David R. McMullin1, Shawn Hoogstra2, Kimberlynn P. McDonald1, Mark W. Sumarah1,2, Justin B. Renaud2

1Department of Chemistry,Carleton University Ottawa, 2London Research and Development Center,Agriculture and Agri-Food Canada

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

Diagnostic fragmentation filtering is a method for detecting structurally-related natural products within complex mixtures. Implemented in MZmine, this approach enables the exploration of mass spectrometry datasets for new compounds that may otherwise be overlooked.

Key Study Components

Area of Science

  • Natural products
  • Mass spectrometry
  • Analytical chemistry

Background

  • Natural products are often synthesized as classes of compounds.
  • Complex mixtures can obscure the detection of individual products.
  • Diagnostic fragmentation filtering enhances the identification of related compounds.
  • This method can be applied to various contexts, including food safety and bioproduct discovery.

Purpose of Study

  • To identify new natural products from complex mixtures.
  • To detect toxins that may contaminate food and water.
  • To inform exposure assessments related to toxins.

Methods Used

  • Implementation of diagnostic fragmentation filtering in MZmine software.
  • Analysis of mass spectrometry data sets.
  • Search for product ions and neutral losses.
  • Exploration of microbial and plant extracts.

Main Results

  • Identification of new bioproducts and toxins.
  • Enhanced detection of structurally-related compounds.
  • Improved exposure assessments for food and water contaminants.
  • Discovery of new compounds from various natural sources.

Conclusions

  • Diagnostic fragmentation filtering is a valuable tool for natural product discovery.
  • This method can significantly improve the analysis of complex mixtures.
  • It has implications for both environmental safety and bioproduct development.

Frequently Asked Questions

What is diagnostic fragmentation filtering?
It is a method for detecting structurally-related natural products in complex mixtures using mass spectrometry.
How does MZmine facilitate this process?
MZmine implements diagnostic fragmentation filtering to analyze mass spectrometry datasets effectively.
What types of compounds can be identified?
The method can identify new bioproducts and toxins from various natural sources.
Why is this method important for food safety?
It helps detect toxins that may contaminate food and water, informing exposure assessments.
Can this method be applied to other areas of research?
Yes, it can be used in various contexts, including environmental science and pharmacology.

סינון פיצול אבחון, מיושם לתוך MZmine, היא גישה אלגנטית, לאחר הרכישה למסך LC-MS/MS datasets עבור מחלקות שלמות של מוצרים טבעיים ידועים ולא ידועים. כלי זה מחפש את MS/MS ספקטרום עבור יוני מוצרים ו/או הפסדים ניטרליים כי האנליסט הגדיר כאבחון עבור המחלקה כולה של תרכובות.

מוצרים טבעיים הם לעתים קרובות biosynthesized כמו סוג של תרכובות, ולא כמוצר אחד. סינון פיצול אבחון הוא גישה פשוטה לזיהוי כל התרכובות הקשורות מבנית בתוך תערובת מורכבת. סינון פיצול אבחון, המיושם בתוכנת MZmine, מאפשר לאנליסט לחקור ערכות נתונים ספקטרומטריות מסה עבור מוצרים טבעיים חדשים שאחרת היו מפספסים.

זה כולל תוצרים ביולוגיים חדשים, וגם רעלנים חדשים. סינון פיצול אבחון, המוחל על מחלקות רעלנים המזהמות מזון ומים, יכול ליידע הערכות חשיפה. כאשר מוחל על תמציות מיקרוביאלית וצמחים, זה יכול לגרום לגילוי של תרכובות חדשות.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

כימיה גיליון 147 MZmine LC-MS/MS ניתוח ממוקד למחצה רכישה תלוית נתונים גילוי מוצר טבעי אורדרראפ מיקרוקינים

Related Videos

רוק הדגימה האדם Peptidome ילידים באמצעות בדיקה Lollipop-Like Ultrafiltration: פשט ולשפר גילוי פפטיד של ספקטרומטריית מסה קלינית

08:37

רוק הדגימה האדם Peptidome ילידים באמצעות בדיקה Lollipop-Like Ultrafiltration: פשט ולשפר גילוי פפטיד של ספקטרומטריית מסה קלינית

Related Videos

12K Views

בקנה מידה גדול Profiling metabolomic ללא ממוקד של סרום על ידי כרומטוגרפיה נוזלית ביצועים-Mass ספקטרומטריית Ultra (UPLC-MS)

07:34

בקנה מידה גדול Profiling metabolomic ללא ממוקד של סרום על ידי כרומטוגרפיה נוזלית ביצועים-Mass ספקטרומטריית Ultra (UPLC-MS)

Related Videos

13.5K Views

Metaproteomics זרימת עבודה Aquatic מיקרוביאלית: מתאים לtryptic פפטידים מתאימים לניתוח מבוסס ספקטרומטריית מסת טנדם

08:09

Metaproteomics זרימת עבודה Aquatic מיקרוביאלית: מתאים לtryptic פפטידים מתאימים לניתוח מבוסס ספקטרומטריית מסת טנדם

Related Videos

9.3K Views

עיבוד אנזימתי תענית חלבונים עבור איתור MS עם microreactor זרימה דרך

09:49

עיבוד אנזימתי תענית חלבונים עבור איתור MS עם microreactor זרימה דרך

Related Videos

8.6K Views

זיהוי לכל-כימית Polyfluorinated מינים בזרימת עבודה משולבת יישוב, שאינו ממוקד-סינון ברזולוציה גבוהה ספקטרומטר מסה

09:04

זיהוי לכל-כימית Polyfluorinated מינים בזרימת עבודה משולבת יישוב, שאינו ממוקד-סינון ברזולוציה גבוהה ספקטרומטר מסה

Related Videos

13.3K Views

המסה ספקטרומטר מודרמטריה מונחה הגנום ככלי לחשוף מוצרים טבעיים הרומן

11:13

המסה ספקטרומטר מודרמטריה מונחה הגנום ככלי לחשוף מוצרים טבעיים הרומן

Related Videos

11.7K Views

ניתוח כמותי למחצה של פפטידוגליקן על ידי כרומטוגרפיה נוזלית, ספקטרומטריית מסה וביואינפורמטיקה

09:09

ניתוח כמותי למחצה של פפטידוגליקן על ידי כרומטוגרפיה נוזלית, ספקטרומטריית מסה וביואינפורמטיקה

Related Videos

5.2K Views

גילוי מוקדם של פריחות ציאנובקטריאליות וציאנוקסינים נלווים באמצעות אסטרטגיית זיהוי מהירה

07:13

גילוי מוקדם של פריחות ציאנובקטריאליות וציאנוקסינים נלווים באמצעות אסטרטגיית זיהוי מהירה

Related Videos

4.6K Views

כרומטוגרפיה נוזלית בשילוב לאינדקס שבירה או זיהוי ספקטרומטרי מסה ליצירת פרופיל מטבוליט במערכות ללא תאים מבוססות ליסאט

14:42

כרומטוגרפיה נוזלית בשילוב לאינדקס שבירה או זיהוי ספקטרומטרי מסה ליצירת פרופיל מטבוליט במערכות ללא תאים מבוססות ליסאט

Related Videos

5.8K Views

יישומים של ספקטרומטריית מסה טנדם כרומטוגרפיה נוזלית במחקר מוצרים טבעיים: אלקלואידים טרופאן כמקרה בוחן

09:36

יישומים של ספקטרומטריית מסה טנדם כרומטוגרפיה נוזלית במחקר מוצרים טבעיים: אלקלואידים טרופאן כמקרה בוחן

Related Videos

1.6K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code