Name: בדיקת מיקרו-פטרנינג למדידת כיראליות תאים (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2022-03-11T13:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 7 s
Description: למד כיצד לבצע בדיקת מיקרו-פטרנינג למדידת כיראליות תאים רב-תאית. שיטה זו מאפשרת כימות אוטומטי של הטיות שמאל-ימין בסוגי תאים שונים ומתאימה לסקרים בקנה מידה גדול.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

עבודה זו מומנה על ידי המכונים הלאומיים לבריאות (OD /NICHD DP2HD083961 ו- NHBLI R01HL148104). ליאו ק. וואן הוא חוקר פיו במדעים ביו-רפואיים (PEW 00026185), הנתמך על ידי נאמנויות הצדקה של פיו. האוקאנג ג'אנג נתמך על ידי מלגת קדם-דוקטורט של איגוד הלב האמריקאי (20PRE35210243).

1. ייצור חותמות פולידימתילסילוקסן (PDMS)16
<ol><li>ציירו מערך של טבעות בקנה מידה זעיר באמצעות תוכנת CAD, עם קוטר פנימי של 250 מיקרומטר וקוטר חיצוני של 450 מיקרומטר. התבנית המשמשת בפרוטוקול זה היא מערך של 10 x 10 עם מרחק של 850 מיקרומטר בין טבעות.</li>
	<li>הדפס מסכת שקיפות של התבנית ברזולוציה הרצויה באמצעות שירות הדפסת המסכות של חברת המיקרו-פבריקציה (ראה טבלת חומרים). הערה: הממדים שסופקו של הטבעת הוכחו כעובדים עבור סוגי תאים רבים7.</li>
	<li>ביצוע פוטוליתוגרפיה אולטרה סגולה (UV) באמצעות המסכה המכילה את התכונות הרצויות ליצירת תבנית פוטורסיסטית שלילית (כגון SU-8)8.<ol>
<li>כסו פרוסת סיליקון מצופה בפוטורסיסט על ידי מסכת השקיפות המיוצרת בשלבים 1.1-1.2.</li>
		<li>על יישור מגע UV, פולימריזציה של הפוטורסיסט תחת אזורים שקופים של המסכה על ידי אור UV. הערה: לאחר שטיפה ופיתוח נוספים, התבנית הראשית עם התכונות הרצויות מיוצרת8. הפרטים התפעוליים תלויים בציוד הספציפי שבו נעשה שימוש.</li>
	</ol>
</li>
	<li>מכינים פרה-פולימרים אלסטומריים של PDMS על ידי ערבוב עם חומר הריפוי שלו ביחס של 10:1 ואז מטילים את התערובת על התבנית בצלחת פטרי.</li>
	<li>מניחים את המנה בתא ואקום למשך 30 דקות כדי להסיר בועות אוויר ב- PDMS ואופים בתנור בטמפרטורה של 60 מעלות צלזיוס למשך 2 שעות לפחות.</li>
	<li>לאחר ריפוי מלא של PDMS, חתכו את מערכי התבניות לבולים. הערה: ניתן להעדיף חותמות עבות יותר (כ-1 ס"מ) בשל קלות הטיפול בשלבים המאוחרים יותר של הדפסת מיקרו-קונטיקט.</li>
</ol>2. ציפוי שקופיות זכוכית
<ol><li>נקו את מגלשות הזכוכית. משרים את המגלשות באמבט 100% אתנול, מתפזרים במשך 5 דקות ואז שוטפים במים.</li>
	<li>חזור על שלב זה תחילה עם אצטון, לאחר מכן עם איזופרופנול, ולאחר מכן ייבוש בזרם חנקן.</li>
	<li>השתמש בציוד אידוי של קרן אלקטרונים (E-beam) כדי לצפות שכבות טיטניום וזהב על מגלשות זכוכית. הערה: עבור שכבת הטיטניום, העובי הרצוי הוא 15 Å (1 Å = 10-10 מ '). עבור שכבת הזהב, העובי הרצוי הוא 150 Å. ציפוי טיטניום תחילה ולאחר מכן זהב, שכן שכבת הטיטניום משמשת כדבק בין זהב למגלשת הזכוכית.</li>
	<li>מניחים את המגלשות המנוקות בתא האידוי ומכניסים כור היתוך מזהב וטיטניום מתחת לתריסים.</li>
	<li>שאבו את התא כדי ליצור ואקום נמוך מ-10-5 Pa לפני התכת המתכות. מקד את קרן האלקטרונים על המתכת והתאים את ההספק כך שקצב ההפקדה יתאים לשליטה בעובי התצהיר.</li>
	<li>פתח את התריס כדי להתחיל את תצהיר המתכת. סגור את התריס כאשר מגיעים לעובי הרצוי.</li>
	<li>החלף כור היתוך בין אידוי רציף של שתי מתכות.</li>
	<li>המתן עד שכור ההיתוך יתקרר כנדרש על ידי הציוד, פתח את החדר והוציא את מגלשות הזכוכית המצופות בזהב.</li>
	<li>שאבו שוב את החדר לצורך תחזוקת ציוד. הערה: הפרטים התפעוליים עשויים להיות תלויים במאייד קרן E ספציפי. חשוב שיהיה בעל שיעור הפקדה מבוקר היטב ונמוך של טיטניום. שכבת טיטניום עבה מובילה לעתים קרובות לנראות לקויה, במיוחד להדמיה פלואורסצנטית של התאים. לאחר הציפוי, ניתן לאחסן את מגלשות הזכוכית המצופות טיטניום/זהב בתא ואקום יבש בטמפרטורת החדר למשך חודש לפחות.</li>
</ol>3. הדפסה מיקרו-קונקרטית
<ol><li>חתכו את החלקה המצופה טיטניום/זהב לחתיכות קטנות יותר, אם תרצו. צורה מרובעת של 12 מ"מ x 12 מ"מ מומלצת ליישום טיפוסי (איור 1B).</li>
	<li>השתמשו בחותך זכוכית כדי להחליק על פני השטח כדי להשאיר מסלול מעוות, ואז החזיקו את מגלשת הזכוכית משני הצדדים והתכופפו לעבר השקע כדי לפרוץ לרבעים קטנים. הימנע מלגעת במשטח המצופה בזהב. הערה: כדי לקבוע באופן חזותי איזה צד של הזכוכית הוא המשטח המצופה במקרה של התהפכות מקרית, השווה את השתקפות האור משני הצדדים. המשטח המכוסה זהב יראה השתקפות בהירה יותר, ואילו הצד הלא מצופה יהיה בעל השתקפות עמומה יותר (משכבת הטיטניום בצד השני של הזכוכית). דרך חלופית היא להתבונן בשולי המגלשה, וניתן לקבוע את צד הציפוי ממשטח החיתוך האנכי.</li>
	<li>נקו את המגלשות על ידי השריית 100% אתנול בצלחת פטרי עם צד הזהב למעלה על שייקר מסלול למשך 10 דקות לפחות. שאפו החוצה את האתנול, ואז ייבשו כל מגלשה על ידי נשיפה עם זרם חנקן.</li>
	<li>נקו את חותמות ה-PDMS עם מי סבון ולאחר מכן 100% אתנול. מייבשים את הבולים בגז חנקן.</li>
	<li>הכינו תמיסת 2 mM octadecanethiol (C18) על ידי המסת 5.74 מ"ג של אבקת C18 ב-10 מ"ל של 100% אתנול. הערה: אטום ואחסן את תמיסת C18 בטמפרטורת החדר. דפוסים מודפסים עם C18 יוצרים מונו-שכבתי דביק המורכב בעצמו שעבורו הפיברונקטין והתאים יתחברו באופן מועדף.</li>
	<li>השרו את חותמות ה-PDMS בתמיסת C18 כאשר המשטח המעוצב פונה כלפי מטה במשך 10 שניות ויבשו בעדינות בגז חנקן במשך 60 שניות. הערה: בעת הייבוש, הניחו תחילה את הנחל הרחק מהבול (כ-1 מ') עד שרוב הנוזלים יתאדו ואז הזיזו את הנחל באיטיות קרוב יותר כדי לייבש את החותמת במלואה. זאת כדי למנוע תמיסת C18 להתפוצץ במקום להתייבש על הבול.</li>
	<li>הניחו את הבול עם הפנים כלפי מטה על שקופיות הזהב במשך 60 שניות לפני ההסרה.</li>
	<li>כדי להבטיח הטבעה נכונה, הקש בעדינות על הפינצטה על הבולים כדי להעביר כראוי את התבניות. אל תדחפו חזק מדי למטה, ומשקל הפינצטה בדרך כלל מספיק. הערה: בדיקה חזותית של הבול במהלך ההקשה תוודא כי החותמת ושקופית הזכוכית יצרו מגע אחיד.</li>
	<li>הכינו תאי לחות.<ol>
<li>פיפטה 1 מ"ל של 70% אתנול לתוך מכסה צלחת פטרי הפוך והניח חתיכת פרפילם כדי לכסות את פני השטח (מכוסה עם הפנים כלפי מעלה).</li>
		<li>השתמשו בפינצטה כדי להרים, הניחו פרפילם כדי להבטיח שאין בועות אוויר והסירו עודפי אתנול במידת הצורך.</li>
	</ol></li>
	<li>הכן 2 mM HS-(CH2)11-EG 3-OH (EG3) פתרון: דילול 5 μL תמיסת מלאי ב 5 מ"ל של 100% אתנול. הערה: ניתן לאטום ולאחסן את תמיסת EG3 המדולל בטמפרטורה של 4 מעלות צלזיוס, ויש לאחסן מלאי EG3 לא מדולל בטמפרטורה של -20 מעלות צלזיוס. הטיפול ב-EG3 משמש כדי להפוך את אזור הזכוכית ללא C18 ללא דבק לתאים.</li>
	<li>טיפות Micropipette 40 μL של EG3 עבור כל רבע זכוכית מחליקות על הפרפילם בתא הלחות, ומשאירות מספיק מקום בין טיפות כדי להסביר את המרווח של מגלשות הזהב.</li>
	<li>השתמשו בפינצטה כדי למקם שקופיות זהב מודפסות C18 עם הפנים כלפי מטה על הטיפות ולהבטיח שאין בועות מתחת לשקופיות. דחפו בעדינות את המגלשות זו לזו מבלי להרים אותן כדי למזער את האידוי. הערה: מניחים קצה אחד של שקופיות הזכוכית כלפי מטה ליד הטיפה, ולאחר מכן מורידים באיטיות את הקצה השני של החלקת הזכוכית כלפי מטה. אם קיימת בועה, דחפו את מגלשת הזהב מבלי להרים אותה עד שהבועה כבר לא תהיה נוכחת.</li>
	<li>אטמו את צלחת הפטרי בחוזקה עם פרפילם והשאירו אותה בטמפרטורת החדר למשך 3 שעות לפחות. הערה: אם רוצים דגירה נרחבת, אטמו פעמיים את צלחת הפטרי והשאירו אותה עד 24 שעות.</li>
	<li>בארון בטיחות ביולוגית, מניחים שקופיות זהב עם הפנים כלפי מעלה בצלחת פטרי, משרים ושוטפים 3 פעמים ב-70% אתנול כדי להסיר EG3, ואז משאירים באתנול למשך 10 דקות לעיקור.</li>
	<li>שאפו את האתנול והחליפו אותו ב-PBS סטרילי.</li>
	<li>הכינו תא לחות נוסף כמתואר בשלב 3.9, עם PBS במקום אתנול. הערה: בשל ההבדל במתח הפנים, קל יותר להוסיף תחילה 4-5 מ"ל של PBS כדי להניח parafilm ולהסיר בועות, ולאחר מכן לשאוף החוצה את עודף.</li>
	<li>הכינו את תמיסת הפיברונקטין של 50 מיקרוגרם/מ"ל (חלבונים אחרים, אם תרצו) ב-PBS סטרילי ובטיפות מיקרופיפט 50 μL של תמיסת פיברונקטין לכל רבעון להחליק על הפרפילם, ולהשאיר רווח מסוים בין הטיפות. הערה: ציפוי פיברונקטין מקל על היצמדות תאים למשטחים מעוצבים.</li>
	<li>השתמשו בפינצטה של פרוסות כדי להניח שקופיות עם הפנים כלפי מטה על הטיפות ולוודא שאין בועות מתחת לשקופיות. דחפו בעדינות את המגלשות זו לזו מבלי להרים אותן. הערה: פינצטה מזכוכית או פינצטה עם קצוות רחבים ישרים מומלצים לטיפול בשקופיות.</li>
	<li>השאירו את צלחת הפטרי בארון הבטיחות הביולוגית למשך 30 דקות.</li>
	<li>לאחר 30 דקות, הניחו את מגלשות הזהב עם הפנים כלפי מעלה ב- PBS לאחר שטיפה במשך 3 פעמים. הערה: ניתן לאחסן שקופיות בדוגמת פיברונקטין ב- PBS ב- 4 °C (75 °F) למשך כחודש.</li>
</ol>4. זריעת תאים על גבי שקופיות מיקרו-פוטרניות
<ol><li>חממו את המדיה של תרביות התאים וטריפסין באמבט מים בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס. הערה: התיאור הבא של תת-תרבות הוא עבור תאי NIH/3T3. תנאי התרבית עשויים להשתנות בהתאם לסוגי התאים.</li>
	<li>(אופציונלי) השרו שקופיות מעוצבות במדיה של תרבית בצלחת של 12 בארות, התחממו עד 37 מעלות צלזיוס באינקובטור לפני טריפסיניזציה של תאים לחיבור טוב יותר של התאים.</li>
	<li>נסה את התאים, נטרל עם מדיה המכילה FBS, צנטריפוגה כלפי מטה ב- 100 x g למשך 3 דקות, ולאחר מכן החייאה על ידי ערבוב טוב עם מדיה טרייה. הערה: ודא שהתאים מנותקים לחלוטין זה מזה.</li>
	<li>ספרו את התאים, דיללו ל-200,000 תאים/מ"ל והוסיפו 0.5 מ"ל של תרחיף התאים לכל באר המכילה שקופית זהב אחת.</li>
	<li>יש לנער בעדינות את צלחת הבאר מספר פעמים לזריעת תאים אחידה ולאחסן אותה באינקובטור למשך 15 דקות כדי לאפשר חיבור לתא.</li>
	<li>לאחר 15 דקות, בדקו את חיבור התא תחת מיקרוסקופ. אפשר זמן נוסף, במידת הצורך. הערה: התאים המחוברים יתפזרו על פני השטח עם פילופודיום גלוי או שיטוח ולא יזוזו מהמשטח כאשר לוחית הבאר תוטפח בעדינות או תזוז.</li>
	<li>שאפו החוצה את המדיה המכילה תאים לא מחוברים מכל באר והוסיפו 1 מ"ל של מדיה תרבית. לטיפול תרופתי, יש להשלים ריאגנטים נוספים לתקשורת התרבות בשלב זה.</li>
	<li>תרבית את התאים באינקובטור במשך 24 שעות ובדוק את המפגש כדי לקבוע אם נוצרה כיראליות. הערה: מפגש של מעל 75% מומלץ עבור רוב סוגי התאים, ומפגש יתר עשוי להשפיע על אפיון הכיראליות.</li>
</ol>5. אוסף תמונות
<ol><li>תקן את התאים במפגש.<ol>
<li>הסירו את מדיית התרבית מצלחת הבאר ושטפו פעם אחת עם PBS.</li>
		<li>מוסיפים תמיסת פרפורמלדהיד של 4%, דוגרים בטמפרטורת החדר למשך 15 דקות, ולאחר מכן שוטפים 3 פעמים עם PBS. הערה: אם הקיבוע משנה באופן משמעותי את המורפולוגיה של התא, מומלץ לבצע הדמיה לפני הקיבוע</li>
	</ol>
</li>
	<li>השתמש במיקרוסקופ ניגודיות פאזה עם פונקציונליות מצלמה, צלם כל טבעת על השקופיות ברזולוציה גבוהה (עדשת אובייקט 10x מספיקה לניתוח).</li>
</ol>6. אפיון כיראליות של תאים (איור 2)
<ol><li>הורד קבצי קוד MATLAB לאפיון כיראליות מהקבצים המשלימים (קובץ משלים 1). הערה: הקוד נבדק כדי לעבוד עם MATLAB_R2015b וגרסאות מתקדמות יותר הן במערכות Windows והן במערכות macOS. ארגז הכלים של הסטטיסטיקה המעגלית נדרש גם להפעלת הקבצים, אותם ניתן למצוא בהפניה17.</li>
	<li>הוסף את תיקיית הקוד ותיקיות המשנה (עם ארגז כלים לסטטיסטיקה מעגלית בפנים) לנתיב MATLAB ופתח את הקובץ "ROI_selection.m". בשורה 4, שנה את הספריה לתיקיית הנתונים הרצויה (עבור משתמשי חלונות, החלף את "/" ל- "\" בשורות 4 ו- 5).</li>
	<li>שנה את גודל התמונה בשורה 14, כאשר שתי הדמויות הראשונות מייצגות את גודל העיגול הפנימי של הטבעת ואילו השתיים האחרות מייצגות את החיצוני. הערה: ודא שהגדלים של כל התמונות בתיקיה שיש לנתח זהות.</li>
	<li>לחץ על לחצן הפעלה כדי להפעיל את קוד MATLAB "ROI_selection.m" כדי לקבוע את אזור העניין (ROI) בתמונות של ניגודיות פאזה.</li>
	<li>גררו ידנית את ריבוע הבחירה כך שיתאים לטבעת, ולאחר מכן לחצו פעמיים על התמונה כדי לאשר את הבחירה.</li>
	<li>חזור על שלב זה עבור כל תמונה בתיקיה (התמונה הבאה תופיע באופן אוטומטי לאחר אישור בחירת ההחזר על ההשקעה של תמונה קודמת); קובץ ".mat" ייווצר כדי לאחסן את פרטי ההחזר על ההשקעה עבור כל תמונה.</li>
	<li>פתח את הקובץ "Analysis_batch.m" ושנה את ספריית התיקיה זהה לשלב 6.2. (עבור משתמשי החלונות, לשימוש בפעם הראשונה, החלף את "/" ל-"\" בשורות 5, 6, 124 ו-130)</li>
	<li>לחץ על כפתור הפעלה כדי לבצע את הקוד "Analysis_batch.m" כדי לקבוע את הכיראליות של תבניות טבעת סלולריות מרובות. ייווצר קובץ "datatoexcel.txt", המכיל נתונים סטטיסטיים מעגליים עבור כל טבעת, כמו גם את המספרים של טבעות בכיוון השעון, שאינן כיראליות ואנטי-כיוון השעון.</li>
</ol>

<ol><li>Wan, L. Q., Chin, A. S., Worley, K. E., Ray, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+chirality%3A+emergence+of+asymmetry+from+cell+culture%5BTitle%5D)+AND+%22Philosophical+Transactions+of+the+Royal+Society+B%3A+Biological+Sciences%22%5BJournal%5D)">Cell chirality: emergence of asymmetry from cell culture.</a> Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 371, 20150413(2016).</li>
<li>Rahman, T., Zhang, H., Fan, J., Wan, L. Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+chirality+in+cardiovascular+development+and+disease%5BTitle%5D)+AND+%22APL+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Cell chirality in cardiovascular development and disease.</a> APL Bioengineering. 4 (3), (2020).</li>
<li>Inaki, M., Liu, J., Matsuno, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+chirality%3A+Its+origin+and+roles+in+left-right+asymmetric+development%5BTitle%5D)+AND+%22Philosophical+Transactions+of+the+Royal+Society+B%3A+Biological+Sciences%22%5BJournal%5D)">Cell chirality: Its origin and roles in left-right asymmetric development.</a> Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 371 (1710), 20150413(2016).</li>
<li>Utsunomiya, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cells+with+broken+left-right+symmetry%3A+Roles+of+intrinsic+cell+chirality+in+left-right+asymmetric+epithelial+morphogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Symmetry%22%5BJournal%5D)">Cells with broken left-right symmetry: Roles of intrinsic cell chirality in left-right asymmetric epithelial morphogenesis.</a> Symmetry. 11 (4), 505(2019).</li>
<li>Tamada, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chiral+neuronal+motility%3A+The+missing+link+between+molecular+chirality+and+brain+asymmetry%5BTitle%5D)+AND+%22Symmetry%22%5BJournal%5D)">Chiral neuronal motility: The missing link between molecular chirality and brain asymmetry.</a> Symmetry. 11 (1), 102(2019).</li>
<li>Tee, Y. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cellular+chirality+arising+from+the+self-organization+of+the+actin+cytoskeleton%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Cellular chirality arising from the self-organization of the actin cytoskeleton.</a> Nature Cell Biology. 17 (4), 445-457 (2015).</li>
<li>Wan, L. Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Micropatterned+mammalian+cells+exhibit+phenotype-specific+left-right+asymmetry%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Micropatterned mammalian cells exhibit phenotype-specific left-right asymmetry.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108 (30), 12295-12300 (2011).</li>
<li>Fan, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+chirality+regulates+intercellular+junctions+and+endothelial+permeability%5BTitle%5D)+AND+%22Science+Advances%22%5BJournal%5D)">Cell chirality regulates intercellular junctions and endothelial permeability.</a> Science Advances. 4 (10), 2111(2018).</li>
<li>Singh, A. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Carbon+nanotube-induced+loss+of+multicellular+chirality+on+micropatterned+substrate+is+mediated+by+oxidative+stress%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nano%22%5BJournal%5D)">Carbon nanotube-induced loss of multicellular chirality on micropatterned substrate is mediated by oxidative stress.</a> ACS Nano. 8 (3), 2196-2205 (2014).</li>
<li>Zhang, H., Fan, J., Zhao, Z., Wang, C., Wan, L. Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+Alzheimer%27s+disease-related+proteins+on+the+chirality+of+brain+endothelial+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Cellular+and+Molecular+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Effects of Alzheimer's disease-related proteins on the chirality of brain endothelial cells.</a> Cellular and Molecular Bioengineering. 14, 231-240 (2021).</li>
<li>Chen, T. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Left-right+symmetry+breaking+in+tissue+morphogenesis+via+cytoskeletal+mechanics%5BTitle%5D)+AND+%22Circulation+Research%22%5BJournal%5D)">Left-right symmetry breaking in tissue morphogenesis via cytoskeletal mechanics.</a> Circulation Research. 110 (4), 551-559 (2012).</li>
<li>Ray, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intrinsic+cellular+chirality+regulates+left-right+symmetry+breaking+during+cardiac+looping%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Intrinsic cellular chirality regulates left-right symmetry breaking during cardiac looping.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115 (50), 11568-11577 (2018).</li>
<li>Fan, J., Zhang, H., Rahman, T., Stanton, D. N., Wan, L. Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+organelle-based+analysis+of+cell+chirality%5BTitle%5D)+AND+%22Communicative+and+Integrative+Biology%22%5BJournal%5D)">Cell organelle-based analysis of cell chirality.</a> Communicative and Integrative Biology. 12 (1), 78-81 (2019).</li>
<li>Chen, C. S., Mrksich, M., Huang, S., Whitesides, G. M., Ingber, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Geometric+control+of+cell+life+and+death%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Geometric control of cell life and death.</a> Science. 276 (5317), 1425-1428 (1997).</li>
<li>Liu, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanowire+magnetoscope+reveals+a+cellular+torque+with+left-right+bias%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nano%22%5BJournal%5D)">Nanowire magnetoscope reveals a cellular torque with left-right bias.</a> ACS Nano. 10 (8), 7409-7417 (2016).</li>
<li>Wan, L. Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Geometric+control+of+human+stem+cell+morphology+and+differentiation%5BTitle%5D)+AND+%22Integrative+Biology%22%5BJournal%5D)">Geometric control of human stem cell morphology and differentiation.</a> Integrative Biology. 2 (7-8), 346-353 (2010).</li>
<li>Circular Statistics Toolbox. MathWorks. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/10676-circular-statistics-toolbox-directional-statistics">https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/10676-circular-statistics-toolbox-directional-statistics</a> (2021).</li>
<li>Chin, A. S., Worley, K. E., Ray, P., Kaur, G., Fan, J., Wan, L. Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Epithelial+cell+chirality+revealed+by+three-dimensional+spontaneous+rotation%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Epithelial cell chirality revealed by three-dimensional spontaneous rotation.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115 (48), 12188-12193 (2018).</li>
<li>Worley, K. E., Chin, A. S., Wan, L. Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lineage-specific+chiral+biases+of+human+embryonic+stem+cells+during+differentiation%5BTitle%5D)+AND+%22Stem+Cells+International%22%5BJournal%5D)">Lineage-specific chiral biases of human embryonic stem cells during differentiation.</a> Stem Cells International. 2018, 1848605(2018).</li>
</ol>

למחברים אין מה לחשוף.

בדיקת התבניות בצורת טבעת המתוארת כאן מספקת כלי קל לשימוש לאפיון כמותי של כיראליות רב-תאית, המסוגלת להפיק תוצאות אמינות ביותר וניתנות לחזרה. ייצור מהיר של מיקרו-סביבה מוגדרת זהה וניתוח בלתי מוטה מאפשר עיבוד אוטומטי בתפוקה גבוהה של דגימות בגודל גדול. פרוטוקול זה דן בייצור המיקרו-פטרנים הטבעתיים, בתבניות התאים ובניתוח אוטומטי של יישור התאים המוטה ותנועת הכיוון. שיטה זו תואמת לטכניקות הדמיה חיות לחקר תנועתיות התאים והמורפוגנזה הכיראלית, וניתן לשלב אותה באופן פוטנציאלי בתוכנות אחרות לזיהוי רעילות9 או ל...

אסימטריה שמאל-ימין (LR) של התא, הידועה גם בשם ידיים תאיות או כיראליות, מתארת את קוטביות התא בציר LR ומוכרת כתכונה ביופיזית בסיסית, שמורה, 1,2,3,4,5. כיראליות התא נצפתה הן in vivo והן in vitro במספר קשקשים. ממצאים קודמים חשפו מערבולת כיראלית של שלד אקטין ציטוסקלטון בתאים בודדים שנזרעו באיים עגולים6, נדידה ויישור מוטים של תאים בתוך גבולות מוגבלים 7,8,9,10,11, ולולאה א-סימטרית של צינור חום עוף 12.
ברמה הרב-תאית, כיראליות התאים יכולה להיקבע מתוך נדידה או יישור כיווניים, סיבוב תאי, דינמיקה של השלד הציטוסקטלי ומיקום אברוני התא 7,8,9,10,11,12,13. הקמנו בדיקה מבוססת מיקרו-פטרינגשל 14 כדי לאפיין ביעילות את ההטיה הכיראלית של תאים דביקים 7,8,9,10. כאשר המיקרו-פטרנים בצורת טבעת מגבילים באופן גיאומטרי את צבירי התאים, התאים מפגינים יחד נדידה כיוונית ויישור מוטה. תוכנית MATLAB פותחה כדי לזהות ולמדוד באופן אוטומטי את יישור התאים בתמונות של ניגודיות פאזה של הטבעת. כיוון יישור התאים המקומיים מכמת בזווית מוטה, בהתאם לסטייתו מהכיוון ההיקפי. לאחר ניתוח סטטיסטי, תבנית הטבעת של התאים מוגדרת כהטיות נגד כיוון השעון (CCW) או כהטיות בכיוון השעון (CW).
בדיקה זו שימשה לאפיון הכיראליות של פנוטיפים של תאים מרובים (טבלה 1), והאסימטריה LR של תאים נמצאה כ-7,11,15 ספציפיים לפנוטיפ. יתר על כן, הפרעה לדינמיקה ולמורפולוגיה של אקטין יכולה לגרום להיפוך של הטיה כיראלית 7,8, ועקה חמצונית יכולה לשנות גם את כיראליותהתאים 9. בגלל הפשטות של ההליך והחוסן של הגישה 7,8,9,10, בדיקת כיראליות דו-ממדית זו מספקת כלי יעיל ואמין לקביעה ולימוד כיראליות רב-תאית במבחנה.
מטרת פרוטוקול זה היא להדגים את השימוש בשיטה זו כדי לאפיין את כיראליות התא. פרוטוקול זה מתאר כיצד לייצר מערכים תאיים עם דוגמאות באמצעות טכניקת הדפסה מיקרו-קונטקונטקטית ולבצע ניתוח כיראליות באופן אוטומטי באמצעות תוכנית MATLAB.

<table><tbody><tr><td>200 הוכחה אתנול</td><td>Koptec</td><td>DSP-MD-43</td><td></td></tr><tr><td>BZX מערכת מיקרוסקופ</td><td>Keyence</td><td>BZX-600</td><td></td></tr><tr><td>מדיום הנשר השונה של Dulbecco (DMEM), מאייד</td><td></td> קרן אלקטרונים <td>Gibco</td> 11965092 <td></td>גלוקוז גבוה</tr><tr><td></td><td>Temscal</td><td>BJD-1800</td><td>ציפוי סרט זהב-טיטנום</td></tr><tr><td>סרום בקר עוברי</td><td>VWR</td><td>89510-186</td><td></td></tr><tr><td>פיברונקטין מפלזמת בקר</td><td>סיגמא</td><td>F1141-5MG</td><td></td></tr><tr><td>שקופיות מיקרוסקופ זכוכית</td><td>VWR</td><td>10024-048</td><td></td></tr><tr><td>פינצטה מזכוכית</td><td>Exelta</td><td>390BSAPI</td><td></td></tr><tr><td>כדורי אידוי זהב</td><td>חומרים מתקדמים בינלאומיים</td><td>AU18</td><td></td></tr><tr><td>HS-(CH2)11-EG3-OH (EG3)</td><td>Prochimia</td><td>TH 001-m11.n3-0.2</td><td></td></tr><tr><td>MATLAB</td><td>Mathworks</td><td>MATLAB_R2020b</td><td></td></tr><tr><td>תאי NIH/3T3 ATCC</td><td></td><td>CRL-1658</td><td></td></tr><tr><td>OAI יישור מגע</td><td>OAI</td><td>200</td><td>פוטוליתוגרפיה UV</td></tr><tr><td>אוקטדקנתיול (C18)</td><td>Sigma</td><td>O1858-25ML</td><td></td></tr><tr><td>שייקר אורביטלי</td><td>VWR</td><td>89032-088</td><td></td></tr><tr><td>מי מלח חוצץ פוספט (PBS)</td><td>מוצר מחקר בינלאומי</td><td>P32080-100T</td><td></td></tr><tr><td>פולידימתילסילוקסן סילגארד 184</td><td>דאו קורנינג</td><td>DC4019862</td><td></td></tr><tr><td>רקיק אוניברסיטת</td><td>רקיק סיליקון</td><td>מזהה #809</td><td></td></tr><tr><td>נתרן פירובט</td><td>תרמו פישר מדעי</td><td>11360-070</td><td></td></tr><tr><td>SU-8 3050 פוטו-רזיסט</td><td>MicroChem</td><td>Y311075 0500L1GL</td><td></td></tr><tr><td>כדורי אידוי טיטניום</td><td>בינלאומי מתקדם חומרים</td><td>מסכת שקיפות TI14</td><td></td></tr><tr><td>(עם תכונה)</td><td>Outputicity.com</td><td>שירות</td><td>הדפסת מסכות</td></tr><tr><td>Trypsin-EDTA (0.25%)</td><td>Thermo fisher scientific</td><td>25200-072</td><td></td></tr></tbody></table>

בדיקת מיקרו-פטרנינג למדידת כיראליות תאים

A Micropatterning Assay for Measuring Cell Chirality

כיראליות היא תכונה תאית פנימית, המתארת את האסימטריה במונחים של קיטוב לאורך ציר שמאל-ימין של התא. מכיוון שתכונה ייחודית זו מושכת תשומת לב גוברת בשל תפקידיה החשובים הן בהתפתחות והן במחלות, שיטת כימות סטנדרטית לאפיון כיראליות תאים תקדם את המחקר ואת היישומים הפוטנציאליים. בפרוטוקול זה אנו מתארים בדיקה של אפיון כיראליות רב-תאית המשתמשת במערכים מיקרו-פטרתיים של תאים. מיקרו-פטרנים סלולריים מיוצרים על שקופיות זכוכית מצופים טיטניום/זהב באמצעות הדפסה מיקרו-קונקרטית. לאחר זריעה על האיים המוגדרים באופן גיאומטרי (למשל, בצורת טבעת), המצופים בחלבון, התאים נודדים בכיוון ויוצרים יישור מוטה לכיוון הכיוון השעון או לכיוון נגד כיוון השעון, אותו ניתן לנתח ולכמת באופן אוטומטי על ידי תוכנית MATLAB שנכתבה בהתאמה אישית. כאן אנו מתארים בפירוט את הייצור של מצעים micropatterned, זריעת תאים, איסוף תמונות וניתוח נתונים ומציגים תוצאות מייצגות שהושגו באמצעות תאי NIH/3T3. פרוטוקול זה אומת בעבר במספר מחקרים שפורסמו והוא כלי יעיל ואמין לחקר כיראליות תאים במבחנה.

רבע שעה לאחר זריעת תאי NIH/3T3, הידבקות התאים בתבנית הטבעת אושרה חזותית על ידי הדמיית ניגודיות פאזה. לאחר תרבית מאוחרת יותר של 24 שעות, התאים על התבניות התכנסו והתארכו עם יישורים א-סימטריים בעליל, מוטים לכיוון הכיוון השעון (איור 2). נדידה כיוונית של תאים מחוברים נרשמת על ידי הדמיה בהילוך מהיר, ניתן לכמת את תנועתיות התאים ואת המורפוגנזה באמצעות ניתוחים נוספים של הסרטון. כדי לבצע ניתוח כיראליות, תמונות של ניגודיות פאזה ברזולוציה גבוהה נלקחות לאחר הקיבוע (איור 2A-C...

אנו מציגים פרוטוקול לקביעת כיראליות רב-תאית במבחנה, תוך שימוש בטכניקת המיקרו-פטרינג. בדיקה זו מאפשרת כימות אוטומטי של הטיות שמאל-ימין של סוגים שונים של תאים וניתן להשתמש בה למטרות סינון.

Chirality is an intrinsic cellular property, which depicts the asymmetry in terms of polarization along the left-right axis of the cell. As this unique ...

בדיקת כיראליות תאי באסט מיקרו-פטרנינג היא כלי רב עוצמה לחקר מורפוגנזה כיראלית רב-תאית בהתפתחות מחלות. זה חשוב גם למחקר בתאים. מערכת macropattern זו קלה לייצור ולשימוש, מסוגלת להפיק תוצאות אמינות ביותר וניתנות לחזרה, והיא גם תואמת לעיבוד אוטומטי בתפוקה גבוהה לגודל מדגם גדול.התחילו בחיתוך המגלשה המצופה בזהב טיטניום לחתיכות מרובעות קטנות בגודל של כ-12 על 12 מילימטרים. באמצעות חותך זכוכית, החליקו על פני השטח כדי להשאיר מסילה מעוותת, ואז החזיקו את מגלשת הזכוכית משני הצדדים והתכופפו לעבר השקע כדי לפרוץ לרבעים קטנים. כדי לנקות את המגלשה, משרים אותה עם הצד המוזהב כלפי מעלה ב-100% אתנול הכלול בצלחת פטרי על שייקר מסלולי למשך 10 דקות לפחות.לאחר שאיפת האתנול, ייבשו את המגלשה על ידי נשיפה עם זרם חנקן. נקו את חותמות הפולידימתילסילוקסן או PDMS במי סבון לפני ייבוש החותמת בגז חנקן. ממיסים 5.74 מיליגרם של אוקטאדקנתיול או C18 ב-10 מיליליטרים של 100% אתנול כדי ליצור תמיסת C18 של שני מילימולר, ולאחר מכן מנקים את חותמות ה-PDMS עם 100% אתנול.השרו את חותמת ה-PDMS כאשר משטח התבנית פונה כלפי מטה בתמיסת C18 למשך 10 שניות ולאחר מכן ייבשו אותה בעדינות בגז חנקן למשך 60 שניות. לאחר הייבוש, הניחו את הבול הפונה כלפי מטה אל מגלשת הזהב למשך 60 שניות לפני ההסרה. כדי להבטיח הטבעה נכונה, הקישו בעדינות על הפינצטה על החותמת כדי להעביר את התבניות כראוי.לאחר מכן, הכינו את תאי הלחות על ידי צנרת מיליליטר אחד של 70% אתנול למכסה צלחת פטרי הפוך. ובעזרת הפינצטה, הניחו חתיכת פרפילם כדי לכסות את פני השטח ולהבטיח שלא יישארו בועות. הסר את האתנול העודף במידת הצורך.הוסיפו 40 טיפות מיקרוליטר של תמיסת EG3 עבור כל רבע החלקת זכוכית על הפרפילם בתא הלחות, והשאירו מספיק מקום בין הטיפות כדי לקחת בחשבון את המרווח של שקופיות הזהב. השתמש בפינצטה כדי למקם את שקופית הזהב המודפסת C18 הפונה כלפי מטה אל הטיפה, ולהבטיח שלא יישארו בועות מתחת לשקופית. דחפו בעדינות את המגלשות זו לזו מבלי להרים אותן כדי למזער את האידוי.לאחר אטימת צלחת הפטרי בחוזקה עם פרפילם, השאירו אותה בטמפרטורת החדר למשך שלוש שעות לפחות. בארון בטיחות ביולוגית, משרים ושוטפים את מגלשת הזהב הפונה כלפי מעלה שלוש פעמים ב-70% אתנול כדי להסיר EG3, ואז משאירים את האתנול למשך 10 דקות לעיקור. לאחר שאיפת האתנול, הוסיפו PBS סטרילי.הכינו תא לחות נוסף עם PBS במקום אתנול כפי שהודגם. לאחר מכן, הוסיפו 50 טיפות מיקרוליטר של תמיסת פיברונקטין עבור כל רבע החלקה על הפרפילם, והשאירו רווח מסוים בין הטיפות. לאחר מכן הניחו את המגלשה הפונה כלפי מטה אל הטיפה כפי שהוכח קודם לכן והשאירו את צלחת הפטרי בארון הבטיחות הביולוגית למשך 30 דקות.לאחר שטיפת המגלשה המצופה זהב, הניחו את המגלשה הפונה כלפי מעלה ב-PBS. לפני זריעת התאים, חממו את המדיה והטריפסין באמבט מים התמזג בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס. לחיבור טוב יותר של התאים, משרים את שקופית התבנית בצלחת בת 12 בארות המכילה מדיית תרבית ומחממים אותה ב-37 מעלות צלזיוס באינקובטור.לאחר שהתאים עוברים טריפסיניזציה, מנטרלים את התאים עם FBS המכיל מדיה, מפילים את התאים ב-100 פעמים G למשך שלוש דקות ואז מנצלים מחדש את גלולת התא במדיה טרייה. לספור את התאים ולדלל את תרחיף התא כדי להשיג את הריכוז של 200, 000 תאים למיליליטר. הוסיפו 0.5 מיליליטרים של תרחיף התא לכל באר המכילה מגלשת זהב אחת.יש לנער בעדינות את הצלחת מספר פעמים לצורך זריעת תאים אחידה לפני דגירה למשך 15 דקות לחיבור התא. לאחר 15 דקות, בדוק את חיבור התא תחת מיקרוסקופ, ובמידת הצורך, דגירה למשך זמן נוסף. לאחר חיבור התאים, שאפו החוצה את המדיה המכילה תאים לא מחוברים מכל באר והוסיפו מיליליטר אחד של מדיית תרבית טרייה.תרבית את התאים באינקובטור במשך 24 שעות ובדוק את המפגש כדי לקבוע אם נוצרה כיראליות. כאשר המפגש הנדרש מושג, תקן את התאים על ידי הסרת מדיית התרבית. לאחר שטיפה עם PBS פעם אחת, הוסיפו תמיסת פרפורמלדהיד של 4% למגלשה ודגמו את טמפרטורת החדר למשך 15 דקות לפני השטיפה שוב עם PBS שלוש פעמים.כדי להשיג את התמונות, השתמש במיקרוסקופ ניגודיות פאזה עם פונקציונליות המצלמה וצלם כל טבעת בשקופית ברזולוציה גבוהה. לאפיון כיראליות, הורד את קבצי הקוד של MATLAB, הוסף את תיקיית הקוד ואת תיקיות המשנה לנתיב MATLAB ופתח את ROI_selection. קובץ m.בשורה הרביעית, שנה את הספריה לתיקיית הנתונים הרצויה. שנה את גודל התמונה בשורה 14 כאשר שתי הדמויות הראשונות מייצגות את גודל העיגול הפנימי של הטבעת בעוד שהשתיים האחרות מייצגות את החיצוני. כדי לקבוע את אזור העניין או ההחזר על ההשקעה בתמונות ניגודיות הפאזה, הפעל את קוד MATLAB ROI_selection.m על ידי לחיצה על לחצן הפעלה. גררו ידנית את ריבוע הבחירה כך שיתאים לטבעת, ולאחר מכן לחצו פעמיים על התמונה כדי לאשר את הבחירה. לאחר בחירת ROI מכל התמונות בתיקייה, ייווצר קובץ Mat כדי לאחסן את פרטי ההחזר על ההשקעה עבור כל תמונה.לאחר מכן פתח את analysis_batch. m קובץ ושנה את ספריית התיקיה כפי שהודגם קודם לכן. לחץ על כפתור ההפעלה כדי לבצע את analysis_batch הקוד.m כדי לקבוע את הכיראליות של תבניות טבעת תאיות מרובות. A datatoexcel. קובץ txt ייווצר המכיל נתונים סטטיסטיים מעגליים עבור כל טבעת, כמו גם את המספרים של טבעות לא כיראליות ואנטי כיוון השעון נגד כיוון השעון.הממצאים הנוכחיים מדגימים את התועלת של בדיקת כיראליות תבנית הטבעת שפותחה באופן ניסיוני, כמו גם את הרגישות של מבחן זה לשינויים בשלד הציטוסקלטון. במחקר הנוכחי, נמצא כי על ידי שיבוש הפילמור של אקטין עם 50 טיפול latrunculin A ננומולרי, תאי המיובלסט C2C12 של העכבר הפגינו שינוי של הטיה כיראלית נגד כיוון השעון או CCW לתוספת של כיוון השעון או CW.In, תאי האנדותל של כלי הדם הטבוריים האנושיים או hUVECs שטופלו ב-12-o-tetradecanoyl-phorbol-13-acetate או TPA כדי להפעיל את החלבון קינאז C הציגו העברה תלוית מינון של כיראליות התא מ-CW ל-CCW. לאחר זריעת תאים לדפוסים, ניתן להשלים כימיקלים או תרופות למדיום כדי לחקור את התגובה, וניתן לשלב את מערכת transwell כדי לחקור תרבית משותפת של תאים.בדיקה זו מספקת כלי יעיל לחקר כיראליות רב-תאית תחת מסגרות ניסוי שונות ומציעה תובנות חשובות לגבי תפקידה של כיראליות התא בתופעות ותהליכים ביולוגיים שונים.

a-micropatterning-assay-for-measuring-cell-chirality

Research

JoVE Journal

Bioengineering

הנדסה ביולוגית

אנו להדגים שיטה פשוטה עבור הצבת תאים במקומות הרצויים על המצע. שיטה זו דפוסי תאים על ידי הטלת שבב סיליקון שמכיל microwells מלא תאים על גבי המצע. שיטה זו מספקת דרך חדשה כדי לווסת איתות diffusible ו juxtacrine בין תאים.

דפוסים של תאים עובריים באמצעות שבב להעיף ביו

Micropatterns דבק כי לנרמל ארכיטקטורה הסלולרי יכול לשמש כדי להגביר את הרגישות של זיהוי של השפעות התרופה, לשפר reproducibility ולפשט רכישת התמונה ניתוח אוטומטי. טכנולוגיה זו ייהנו סמים / siRNA מבחני המיון, שבוצעה על התרבות תומך קונבנציונלי התא וכתוצאה מכך סובל השתנות התא אל התא מוגזמת.

ויזואליזציה שיפור ניתוח כמותי של השפעות התרופה באמצעות תאים micropatterned

בסרטון זה, אנו מתארים בדיקת כיראליות של תאים כדי לקבוע את הטיית היישור של תאים בגבול גיאומטרי מוגבל כגון מיקרו-תבנית טבעתית. כיראליות היא תכונה אינהרנטית של רוב סוגי התאים והיא נקבעת על ידי גורמים גנטיים וסביבתיים. הכרת הכיראליות של אוכלוסיית תאים נורמלית יכולה לעזור לסנן תאים שטופלו בתרופות.

בדיקת כיראליות תא בצורת טבעת בצורת טבעת: טכניקת מבחנה לקביעת כיראליות רב-תאית בהתבסס על יישור תאים על מיקרו-תבניות בצורת טבעת

פרוטוקול זה מתאר שיטת microfabrication התואם לדפוסי תא על SiO 2. עיצוב parylene-C מוגדר מראש מודפס photolithographically על SiO 2 הוופלים. תאים לאחר דגירה עם סרום (או פתרון הפעלה אחר) לדבוק במיוחד ל( ולגדול בהתאם להתאמה של) parylene-C שבבסיס, בעוד שנהדף על ידי SiO 2 אזורים.

תא דפוסים על photolithographically מוגדר Parylene-C: SiO<sub&gt; 2</sub&gt; מצעים

נייר זה מציג שיטות לגידול מיוציטים לבביים עם צורות שונות, המייצגות פתולוגיות שונות, ומיון מיוציטים לביים דבקים אלה בהתבסס על המורפולוגיה שלהם ברמת תא אחד. הפלטפורמה המוצעת מספקת גישה חדשנית לתפוקה גבוהה והקרנת סמים עבור סוגים שונים של אי ספיקת לב.

גישה לחקר תעתיק תלוי צורה ברמת תא יחיד

כאן אנו מציגים פרוטוקול לתאים זעירים ברזולוציה של תא בודד באמצעות הידבקות מתוכנתת DNA. פרוטוקול זה משתמש בפלטפורמת פוטוליטוגרפיה על הספסל כדי ליצור דפוסים של אוליגונוקלאוטידים DNA על שקופית זכוכית ולאחר מכן תוויות קרום התא עם אוליגונוקלאוטידים משלימים זמינים מסחרית. הכלאה של אוליגוס גורמת הידבקות תאים מתוכנתים.

דפוס פשוט, זול ומודולרי של תאים המשתמשים ב- DNA

הפרוטוקול המוצג כאן מאפשר ייצור אוטומטי של מיקרופטרנים המתקננים את צורת התא כדי לחקור מבנים ציטוסקלטליים בתוך תאי יונקים. טכניקה ידידותית למשתמש זו ניתנת להגדרה עם מערכות הדמיה זמינות מסחרית ואינה דורשת ציוד מיוחד שאינו נגיש למעבדות סטנדרטיות לביולוגיה של התא.

שליטה בגיאומטריית התא באמצעות מיקרופטרנינג בסיוע לייזר אינפרא אדום

אנו מציגים טכנולוגיה המשתמשת בהרכבה בסיוע נימי בפלטפורמה מיקרופלואידית כדי לעצב עצמים בגודל מיקרו המושעים בנוזל, כגון חיידקים וקוליואידים, למערכים שנקבעו על מצע פולידימתילסילוקסן.

דפוס של מיקרואורגניזמים ומיקרו-חלקיקים באמצעות הרכבה בסיוע נימים רציפים

אנו מתארים שיפורים בשיטה סטנדרטית למדידת כוחות המתיחה התאית, המבוססת על הדפסה מיקרו-קונטרקטית עם שלב דפוס תת-קרקעי יחיד של מערכי נקודות של חלבוני מטריצה חוץ-תאית על הידרוג'לים רכים. שיטה זו מאפשרת ייצור פשוט ועקבי יותר של דפוסי איים, החיוניים לשליטה בצורת צביר התאים.

יצירת תבניות למיקרוסקופיית מתיחה מיקרופטרן

באופן מסורתי, תרבית תאים מבוצעת על מצעים מישוריים המחקים בצורה גרועה את הסביבה הטבעית של תאים in vivo. כאן אנו מתארים שיטה לייצור מצעי תרביות תאים עם גיאומטריות מעוגלות רלוונטיות מבחינה פיזיולוגית וחלבונים חוץ-תאיים מיקרו-פטרייתיים, המאפשרת חקירה שיטתית של חישה תאית של רמזים חוץ-תאיים אלה.

יצירת מיקרו-סביבה תאית רב-תכליתית על-ידי UV-Photopatterning של מצעי תרביות תאים תלת-ממדיים

אנו מציגים פלטפורמת בדיקת קשיחות דינמית והפיכה המיוצרת באמצעות אלסטומר סיליקון רך במיוחד (פולידימתילסילוקסן, PDMS) עם חלקיקי ברזל משובצים. בדיקה חדשנית זו מתאימה לחקר שינויים פיזיים תלויי זמן בפנוטיפים של תאים, כולל הנחיית מגע. כאן, אנו מודדים יישור קרדיומיוציטים של חולדות יילודים עם התקשות מטריצה באמצעות מגנטיות.

אלסטומרים מגנטו-ריאולוגיים מיקרו-דפוסיים להנעת שינויים ביישור קרדיומיוציטים

למד כיצד לבצע בדיקת מיקרו-פטרנינג למדידת כיראליות תאים רב-תאית. שיטה זו מאפשרת כימות אוטומטי של הטיות שמאל-ימין בסוגי תאים שונים ומתאימה לסקרים בקנה מידה גדול.

בדיקת מיקרו-פטרנינג למדידת כיראליות תאים

גלה סרטונים נוספים