סימולציה מבוססת מבנה ודגימה של תנועות חלבון פקטור שעתוק לאורך דנ"א מצעד בקנה מידה אטומי לדיפוזיה גסה-גרגרית

2.7K צפיות

צוטט 2 פעמים

09:17 דק'

1 במרץ 2022

10.3791/63406-v

1 במרץ 2022

2.7K צפיות

Chao E^*¹ , Liqiang Dai^*¹^,² , Jiaqi Tian³^,⁴ , Lin-Tai Da⁴ , Jin Yu⁵^,⁶^,⁷

¹Beijing Computational Science Research Center, ²Shenzhen JL Computational Science and Applied Research Institute, ³School of Medical Informatics and Engineering, Xuzhou Medical University, ⁴Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education), Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, ⁵Department of Physics and Astronomy, University of California, Irvine, ⁶Department of Chemistry, University of California, Irvine, ⁷NSF-Simons Center for Multiscale Cell Fate Research, University of California, Irvine

^* These authors contributed equally

מטרת פרוטוקול זה היא לחשוף דינמיקה מבנית של דיפוזיה חד-ממדית של חלבון לאורך דנ"א, תוך שימוש בחלבון מקדם שעתוק צמחי WRKY כמערכת מופתית. לשם כך יושמו הן סימולציות של דינמיקה מולקולרית אטומיסטית והן של דינמיקה מולקולרית גסה, יחד עם דגימות חישוביות נרחבות.

גלה סרטונים נוספים

DNA

Coarse Grained

WRKY

Chapters in this video