מדוע בדיקת השערת האפס חשובה עבור כימות שכיחות ליפידים?

בדיקת השערת האפס מאפשרת לצוותים לקבוע האם הבדלים נצפים בשפע הליפידים בין מוחות של Drosophila ביקורת למוחות מוטנטיים הם מובהקים סטטיסטית, מה שתומך בתיקוף יעיל של המטרה ומפחית תוצאות חיוביות שגויות בשלבי הגילוי המוקדמים.

כיצד בידוד משתנה בלתי תלוי משתלב בהכנת דגימות עבור MALDI MSI?

בידוד משתנים כגון גנוטיפ או טיפול במהלך הכנת הדגימות מבטיח כי שינויים בהתפלגות הליפידים שזוהו על ידי MALDI MSI ניתן לייחס לגורמים ניסיוניים ספציפיים, ובכך מוגברים הבהירות המכניסטית והביטחון בתהליך העבודה.

מה מאפשרות מדידות כמותיות של משתנים תלויים בדימוי MALDI?

מדידות כמותיות של עוצמות יוני ליפידים לאורך חתכי רקמה מאפשרות השוואה ישירה של שינויים מטבוליים, ובכך מאפשרות לצוותים להעריך את ההשפעה של התערבויות גנטיות או פראמקולוגיות ברזולוציה מרחבית גבוהה.

מדוע דרישות השחזור קריטיות למחקרי ליפידומיקה רב-תפקודיים?

שכפול בין דגימות ביולוגיות ובין הרצות טכניות מבטיח את היכולת לשחזר את התוצאות ואת המהימנות של ממצאים ליפידומיים, ובכך מקל על שיתוף פעולה בין-תפקודי ואינטגרציה של נתונים בסביבות מו"פ מרובות אתרים.

אילו יכולות ניתוח סטטיסטי נדרשות לפני יישום MALDI MSI?

על הצוותים להיות מצוידים לביצוע נורמליזציה, כיול והשוואה סטטיסטית של ספקטרום מס כדי לאמת את זהות הליפידים והשכיחות שלהם, ולהבטיח שתוצרי ה-MALDI MSI יהיו ברי-שימוש לקבלת החלטות בשלבים הבאים.

הכנת דגימה לניתוח שומנים מהיר במוח דרוזופילה באמצעות הדמיית ספקטרומטריית מסה של ספיחה/יינון בלייזר בסיוע מטריצה

3K צפיות

צוטט 8 פעמים

09:00 דק'

14 ביולי 2022

10.3791/63930-v

14 ביולי 2022

3K צפיות

Yuki X. Chen^*¹^,⁵^,⁶ , Kelly Veerasammy^*¹^,² , Jun Yin^*³ , Tenzin Choetso¹^,⁴ , Tiffany Zhong⁷ , Muniyat A. Choudhury¹^,⁴^,⁵ , Cory Weng¹^,⁴^,⁵ , Ethan Xu⁸ , Mayan A. Hein⁹^,¹⁰ , Rinat Abzalimov² , Ye He¹

¹Advanced Science Research Center, Neuroscience Initiative, the City University of New York, Graduate Center New York, ²Advanced Science Research Center, Structural Biology Initiative, the City University of New York, Graduate Center, ³National Institute of Neurological Disorders and Stroke, National Institutes of Health, ⁴The City College of New York, CUNY, ⁵Macaulay Honors College, CUNY, ⁶Graduate School of Public Health and Health Policy, The City University of New York, ⁷Princeton University, ⁸Ardrey Kell High School, ⁹The Borough of Manhattan Community College, CUNY, ¹⁰Gallatin School of Individualized Study, New York University

^* These authors contributed equally

מטרת פרוטוקול זה היא לספק הדרכה מפורטת על הכנת דגימה נכונה לניתוח שומנים ומטבוליטים ברקמות קטנות, כגון מוח דרוזופילה , באמצעות הדמיית ספקטרומטריית מסות בסיוע מטריצה.