-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

HE

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

he_IL

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
בדיקת תגובת שרשרת של פולימראז דיגיטלי טיפתי לזיהוי וקטורים נגיפיים הקשורים לאדנו במחקרי שפיכה ביו...
בדיקת תגובת שרשרת של פולימראז דיגיטלי טיפתי לזיהוי וקטורים נגיפיים הקשורים לאדנו במחקרי שפיכה ביו...
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
A Validatable Droplet Digital Polymerase Chain Reaction Assay for the Detection of Adeno-Associated Viral Vectors in Bioshedding Studies of Tears

בדיקת תגובת שרשרת של פולימראז דיגיטלי טיפתי לזיהוי וקטורים נגיפיים הקשורים לאדנו במחקרי שפיכה ביולוגית של דמעות

Full Text
2,913 Views
07:43 min
July 14, 2023

DOI: 10.3791/65495-v

Bryanna Longacre1, Amanda Souaysene1, Carrie A. Vyhlidal1, Matthew R. Pennington1

1Cell and Gene Therapy,KCAS Bioanalytical and Biomarker Services

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a protocol for the detection and quantification of adeno-associated viral vectors (AAV) in human tears using droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR). It addresses significant regulatory gaps in laboratory practices for molecular studies and aims to provide a reliable framework for clinical applications.

Key Study Components

Research Area

  • Gene therapy vectors
  • Viral vector detection
  • Clinical trial assays

Background

  • Current regulatory gaps in biosafety evaluation
  • Challenges of detecting rare viral events in complex samples
  • Importance of accurate quantification in clinical samples

Methods Used

  • Droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR)
  • Adeno-associated viral vectors (AAV)
  • Sample validation processes without specific DNA extraction

Main Results

  • Achieved intra-assay precision of 3.7% at high spike level and 12.2% at low level
  • Established accuracy metrics for different QC levels
  • Demonstrated robustness for potential application in various viral shedding studies

Conclusions

  • This study showcases a validated ddPCR protocol suitable for regulatory studies of viral vectors in clinical settings.
  • It contributes significantly to the field of gene therapy and molecular diagnostics.

Frequently Asked Questions

What is ddPCR?
Droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) is a highly sensitive method for quantifying DNA without the need for a standard curve.
Why is accurate detection of AAV important?
Accurate detection is crucial for assessing the performance and safety of gene therapy interventions.
What challenges do complex matrices present in viral vector studies?
PCR interference and the presence of inhibitors can significantly affect the accuracy of quantification in complex samples like tears.
Can this protocol be applied to other viral vectors?
Yes, the framework developed here is adaptable for various viral vector shedding studies beyond AAV in human tears.
What are good laboratory practices?
Good laboratory practices are a set of principles intended to ensure the quality and integrity of laboratory studies and results.
How does this method improve assay validation?
By streamlining the validation process and eliminating specific DNA extraction steps, this method enhances reproducibility and efficiency.

כאן, אנו מציגים פרוטוקול לפיתוח ותיקוף של שיטות מעבדה טובות בזיהוי תואם של וקטורים נגיפיים הקשורים באדנו בדמעות אנושיות על ידי תגובת שרשרת פולימראז דיגיטלית טיפתית לתמיכה בפיתוח קליני של וקטורים של ריפוי גנטי.

הפרוטוקול שלנו מכמת וקטורים נגיפיים הקשורים באדנו במטריצות מורכבות. זיהוי וכימות מדויקים חיוניים להערכת הביצועים שלהם בניסויים קליניים. פרוטוקול זה מבקש באופן ספציפי למלא את הפערים הרגולטוריים הנוכחיים בתכנון מחקרים מולקולריים תואמי שיטות מעבדה טובות.

כחלק מפיתוח וקטורים ויראליים, רשויות רגולטוריות דורשות הערכה של נשירה ביולוגית וקטורית. ddPCR היא טכנולוגיה מבטיחה להערכה זו מכיוון שהיא מאפשרת כימות מדויק ללא שימוש בעקומה סטנדרטית ורגישות משופרת בהשוואה ל- qPCR. כימות מדויק במטריצות המורכבות בהן נתקלים במסגרות קליניות, כגון דמעות, יכול להיות מאתגר לאימות עקב הפרעות ואינהיביציה של PCR.

כמויות דגימה קליניות מוגבלות יכולות גם להגביל את היכולת לזהות אירועים נדירים אם הבדיקה אינה רגישה מספיק. הגישה שלנו מפתחת מסגרת מבוססת ddPCR הניתנת לחזרה ולהתאמה כדי לאמת בדיקות לשימוש במחקרים מוסדרים. שיטה זו מונעת שלב ספציפי של מיצוי DNA, מאפשרת אימות יעיל יותר ומספקת קריטריונים ברורים שמולם ניתן להעריך את ביצועי הבדיקה כדי להבטיח עמידות וחזרתיות.

לפרוטוקול זה יש פוטנציאל להיות מיושם בכל מחקר של שפיכת וקטורים ויראליים, לא רק בזיהוי AAV בדמעות, כפי שמוצג כאן. היא יוצרת מסגרת חזקה וחוזרת על עצמה שעליה ניתן לפתח מספר תוכניות מותאמות למטרה ומוסדרות.

Explore More Videos

ביולוגיה גיליון 197 PCR דיגיטלי טיפתי (ddPCR) AAV דמעות וקטור ויראלי שיטות מעבדה טובות אימות

Related Videos

שיטת PCR טיפה דיגיטלית לכימות יעילות טרנסדוקציה AAV ב- מורין רשתית

09:50

שיטת PCR טיפה דיגיטלית לכימות יעילות טרנסדוקציה AAV ב- מורין רשתית

Related Videos

5.2K Views

כימות גנומים נגיפיים הקשורים באדנו בדגימות וקטוריות מטוהרות על ידי תגובת שרשרת של פולימראז טיפתי דיגיטלי

04:43

כימות גנומים נגיפיים הקשורים באדנו בדגימות וקטוריות מטוהרות על ידי תגובת שרשרת של פולימראז טיפתי דיגיטלי

Related Videos

2.5K Views

Mutagenesis וניתוח פונקציונלי של תעלות יונים הביעו Heterologously בתאי יונקים

15:28

Mutagenesis וניתוח פונקציונלי של תעלות יונים הביעו Heterologously בתאי יונקים

Related Videos

18K Views

תגובת שרשרת פולימרז: פרוטוקול בסיסי פלוס אסטרטגיות לפתרון בעיות ואופטימיזציה

09:00

תגובת שרשרת פולימרז: פרוטוקול בסיסי פלוס אסטרטגיות לפתרון בעיות ואופטימיזציה

Related Videos

410.4K Views

זיהוי של רנ"א נגיפי על ידי הקרינה באתרו הכלאה (דגים)

10:16

זיהוי של רנ"א נגיפי על ידי הקרינה באתרו הכלאה (דגים)

Related Videos

39.5K Views

העסקת דיגיטלי אגל PCR לזיהוי מוטציות V600E BRAF בשורות תאי ההפניה תקן קבוע פורמלין מוטבע-פרפין

10:16

העסקת דיגיטלי אגל PCR לזיהוי מוטציות V600E BRAF בשורות תאי ההפניה תקן קבוע פורמלין מוטבע-פרפין

Related Videos

13.7K Views

וזמינותו חשופה כמותיים נקודה עבור טיטור AAV והשימוש בה להערכה תפקודית של וירוס Adeno-הקשורים ההרכבה-הפעלת חלבונים

14:49

וזמינותו חשופה כמותיים נקודה עבור טיטור AAV והשימוש בה להערכה תפקודית של וירוס Adeno-הקשורים ההרכבה-הפעלת חלבונים

Related Videos

14.4K Views

זרימת עבודה של פרוטאומיה כמותית באמצעות זיהוי מבוסס ניטור תגובה מרובה של חלבונים מרקמת המוח האנושית

11:49

זרימת עבודה של פרוטאומיה כמותית באמצעות זיהוי מבוסס ניטור תגובה מרובה של חלבונים מרקמת המוח האנושית

Related Videos

5.1K Views

פרוטוקולי PCR דיגיטליים טיפתיים דו-שלביים של תמלול לאחור לזיהוי וכימות SARS-CoV-2

07:54

פרוטוקולי PCR דיגיטליים טיפתיים דו-שלביים של תמלול לאחור לזיהוי וכימות SARS-CoV-2

Related Videos

5.4K Views

סניקה של הסביבה העירונית - צינור לדגימה וזיהוי של SARS-CoV-2 ממאגרים סביבתיים

07:13

סניקה של הסביבה העירונית - צינור לדגימה וזיהוי של SARS-CoV-2 ממאגרים סביבתיים

Related Videos

4.7K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code