שימוש במחשוף תחת מטרות ותיוג (CUT&Tag) בדיקה במחקר מיובלסטים עכבר

המחקר של הקבוצה שלנו מתמקד באופן שבו מבנה הגנום, והשעתוק, בתאי גזע של שרירי שלד בוגרים מווסתים ומתוחזקים, במיוחד במהלך שינויים סולפטים, כמו מחויבות תאי גזע, התמיינות וטינזיס. תאי גזע של שרירי שלד בוגרים, המהווים רק 1% מתאי מונו-גרעין ברקמת השריר, מהווים אתגר למחקרי תכונות כרומטין המשתמשים ב-High-C, ChIPs ו-ATAC seq, בשל מיעוטם בתרחיפים של תאים בודדים המתקבלים מעיכול שרירים. Chromatin immuno-precipitation, ChIP, היה כלי מפתח ליצירת פרופיל תכונות גנום.

טכניקת cut&tag פשוטה ויעילה יותר, שפותחה על ידי ד"ר סטיבן הניקוף, עולה לעתים קרובות על ChIP, במיוחד בחקר אפיגנטיקה באוכלוסיות תאים נדירות. קלות השימוש בו מרחיבה את הנגישות לחוקרים, כולל מומחים שאינם אפיגנטיים.