דימות ריאתי רב-מודאלי: שימוש במידע משלים מ-CT ו-MRI 129Xe היפרפולרי להערכת מבנה הריאות
April 12th, 2024
CT ו- 129Xe MRI מספקים מידע משלים על מבנה הריאות שניתן לנצל לניתוח אזורי באמצעות רישום תמונה. כאן, אנו מספקים פרוטוקול הבונה מהספרות הקיימת עבור רישום תמונה 129Xe MR ל- CT באמצעות פלטפורמות קוד פתוח.
כדי להתחיל, פתח תמונות ולאחריהן מסיכות בתוכנת התצוגה הרצויה של התמונה כדי לוודא שכיוון התמונה והמסיכה תואמים לכל קובצי CT, Proton ו- Xenon. לאחר מכן, שמרו את רכיבי DICOM של התמונה ומסיכות תווית בודדות כקובצי NIfTI באותה תיקייה שבה נמצא קובץ reg. py.
לרישום CT Xenon MRI, פתח את קובץ reg. py בהגדרת סביבת המחשוב הרצויה של Python. אם אתה משתמש בסביבה וירטואלית, הגדר את מספר יחידות העיבוד המרכזיות, מספר הליכי המשנה וה- RAM כרצוי או כזמין בסביבת המחשוב.
לאחר מכן, הגדר את השינוי הרצוי אינטרפולציה, ואחריו את התמונה קבועה ונעה. הפעל reg. py בסביבת המחשוב Python.
לאחר השלמת ההרשמה, המשך להערכה. שמירה על תמונת ct. nii כתמונת הבסיס, פתח אוורור warp.nii.
gz כתמונה נוספת וכיסו אותה על תמונת ה- CT עם מפת הצבעים הרצויה. סקור את החפיפה של תמונת קסנון MR עם תמונת CT בכל מישורי התמונה כדי להעריך את היישור החזותי של ציוני דרך כגון גבולות הקרינה והריאות. תוצאות ההרשמה הראו יישור טוב של כל גבולות הריאות עבור המשתתף הבריא.
בשלושת המשתתפים עם מחלת ריאות חסימתית כרונית, היה יישור טוב של גבולות הריאות שהיו זמינים, החל מהפרעות אוורור מפוזרות, הפרעות אוורור באונה העליונה עם גבולות ריאה אפיים נעדרים והפרעות אוורור אונה תחתונה עם גבולות ריאה סרעפתיים נעדרים.
סקירה כללית
מאמר זה מציג פרוטוקול לרישום 129 Xe MRI עם תמונות CT כדי לשפר את ניתוח מבנה-תפקוד הריאות. השיטה משתמשת בפלטפורמות קוד פתוח לרישום תמונות, המאפשרת ניתוח אזורי.
מרכיבי מחקר עיקריים
תחום המדע
- מדעי המוח
- הדמיה רפואית
- רדיולוגיה
רקע
- CT ו-129 Xe MRI מספקים מידע משלים על מבנה ותפקוד הריאות.
- רישום תמונות חיוני לניתוח אזורי מדויק.
- הספרות הקיימת על טכניקות 129 Xe MR מספקת את הבסיס לפרוטוקול זה.
- פלטפורמות קוד פתוח משפרות את הנגישות לחוקרים.
מטרת המחקר
- לפתח פרוטוקול חזק לרישום תמונות CT ו-129 Xe MRI.
- לשפר את ניתוח תפקוד הריאות באמצעות טכניקות הדמיה משופרות.
- לספק שיטה שניתן לשחזרה לחוקרים בתחום.
שיטות ששימשו
- פתיחת תמונות ומסכות בתוכנת הדמיה של תמונות.
- אימות כיוון של קבצי CT, פרוטון וקסנון.
- שמירת תמונות ומסכות כקבצי NIfTI.
- שימוש בסביבת חישוב Python לצורך רישום.
תוצאות עיקריות
- הפרוטוקול מאפשר רישום יעיל של תמונות CT ו-129 Xe MRI.
- מאפשר ניתוח אזורי מפורט של מבנה ותפקוד הריאות.
- מדגים את התועלת של כלים בקוד פתוח בהדמיה רפואית.
- מספק בסיס למחקר עתידי בהדמיית ריאות.
מסקנות
- הפרוטוקול המפותח משפר את הדיוק של ניתוח הדמיית הריאות.
- שילוב של CT ו-129 Xe MRI מספק תובנות מקיפות על תפקוד הריאות.
- פלטפורמות קוד פתוח מעודדות שיתוף פעולה וחדשנות במחקר.
