Name: זיהוי מיני מיקובקטריום בשיטת שבב מיקרו-מערך DNA (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-06-24T14:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 27 s
Description: למד זיהוי מיני מיקובקטריום בשיטת שבב מיקרו-מערך DNA לדיאגנוסטיקה קלינית מהירה ומדויקת. השיטה מציעה רגישות וספציפיות גבוהות לזיהוי מוקדם של זיהומים ושיפור תוצאות טיפול חולים.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Primm, T. P., Lucero, C. A., Falkinham, J. O. III <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Health+impacts+of+environmental+mycobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Health impacts of environmental mycobacteria.</a> Trends Genet. 38 (8), 821-830 (2004).</li>
<li>Sawyer, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mycobacterium+bovis+and+its+impact+on+human+and+animal+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Mycobacterium bovis and its impact on human and animal tuberculosis.</a> Trends Genet. 39 (8), 587-592 (2023).</li>
<li>Zhao, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+impact+of+DNA+microarray+chip+technology+on+the+diagnosis+and+management+of+non-tuberculous+mycobacterial+infections+in+immunocompromised+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">The impact of DNA microarray chip technology on the diagnosis and management of non-tuberculous mycobacterial infections in immunocompromised patients.</a> Antimicrob Agents Chemother. 65 (12), e01500-e01500 (2021).</li>
<li>Liu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray-based+detection+of+drug-resistant+Mycobacterium+strains%3A+a+single-center+experience%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Infect%22%5BJournal%5D)">DNA microarray-based detection of drug-resistant Mycobacterium strains: a single-center experience.</a> Clin Microbiol Infect. 26 (10), 1400-1407 (2020).</li>
<li>Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+evaluation+of+DNA+microarray+and+next-generation+sequencing+for+Mycobacterium+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparative evaluation of DNA microarray and next-generation sequencing for Mycobacterium identification.</a> Int J Infect Dis. 118, 250-258 (2022).</li>
<li>Chen, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimizing+probe+design+for+DNA+microarray-based+Mycobacterium+identification%3A+a+computational+biology+approach%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Optimizing probe design for DNA microarray-based Mycobacterium identification: a computational biology approach.</a> BMC Microbiol. 19 (2), 120-129 (2019).</li>
<li>Michelet, L., Boschiroli, M. L. Mycobacterium uberis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMichelet%2C+L+%22Microorganisms%22">Microorganisms</a>. 8 (11), 1701(2020).</li>
<li>Imran, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+technology+for+the+detection+and+identification+of+Mycobacterium+species%3A+a+review%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Biotechnol+Res%22%5BJournal%5D)">DNA microarray technology for the detection and identification of Mycobacterium species: a review.</a> J Microbiol Biotechnol Res. 6 (2), 275-285 (2020).</li>
<li>Garcia-Sanchez, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+DNA+microarray+technology+for+Mycobacterium+detection+and+characterization%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Advances in DNA microarray technology for Mycobacterium detection and characterization.</a> J Mol Diagn. 24 (5), 650-662 (2022).</li>
<li>Wang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Machine+learning+analysis+of+SERS+fingerprinting+for+the+rapid+determination+of+Mycobacterium+tuberculosis+infection+and+drug+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Struct+Biotechnol+J%22%5BJournal%5D)">Machine learning analysis of SERS fingerprinting for the rapid determination of Mycobacterium tuberculosis infection and drug resistance.</a> Comput Struct Biotechnol J. 26 (20), 5364-5377 (2022).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integration+of+DNA+microarray+data+with+clinical+outcomes+in+tuberculosis+patients%3A+implications+for+personalized+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Integration of DNA microarray data with clinical outcomes in tuberculosis patients: implications for personalized medicine.</a> Mol Diagn. 16 (3), 150-160 (2024).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+Mycobacterium+tuberculosis+complex+and+common+non-tuberculous+Mycobacteria+by+DNA+microarray+chip%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of Mycobacterium tuberculosis complex and common non-tuberculous Mycobacteria by DNA microarray chip.</a> BMC Microbiol. 21 (1), 242(2021).</li>
<li>Smith, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+insights+into+Mycobacterium+epidemiology+and+control+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">DNA microarray insights into Mycobacterium epidemiology and control strategies.</a> J Clin Microbiol. 60, e02033-e02121 (2022).</li>
<li>Garcia, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tracking+Mycobacterial+spread+via+DNA+microarray%3A+a+community-based+study%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Tracking Mycobacterial spread via DNA microarray: a community-based study.</a> PLoS One. 18 (3), e0282123(2023).</li>
<li>Li, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Economic+evaluation+of+DNA+microarray+chip+technology+in+Mycobacterium+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Diagnostics%22%5BJournal%5D)">Economic evaluation of DNA microarray chip technology in Mycobacterium diagnosis.</a> Diagnostics. 11 (12), 2235(2021).</li>
<li>Wang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cost-benefit+analysis+of+implementing+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+detection+in+clinical+settings%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Econ%22%5BJournal%5D)">Cost-benefit analysis of implementing DNA microarray chip for Mycobacterium detection in clinical settings.</a> J Med Econ. 25 (1), 113-122 (2022).</li>
<li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((False+positives+and+false+negatives+in+DNA+microarray+chip+detection+of+Mycobacteria%3A+a+comprehensive+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Pathog%22%5BJournal%5D)">False positives and false negatives in DNA microarray chip detection of Mycobacteria: a comprehensive analysis.</a> Microb Pathog. 149, 104671(2020).</li>
<li>Chen, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+and+improvement+of+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+identification%3A+coping+with+genetic+variants%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Validation and improvement of DNA microarray chip for Mycobacterium identification: coping with genetic variants.</a> Front Cell Infect Microbiol. 11, 627923(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>הזרקת נתרן כלורי 0.9% (NaCl)</td><td>פוג'ואו הייוואנגפויאו</td><td>H35020289</td><td></td></tr><tr><td>מכשירי הגברה של אפלייד ביוסיסטמס</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק</td><td>Veriti 96-Well Thermal Cycler</td><td></td></tr><tr><td>קפיטלביו LuxScan10K/B</td><td>קפיטל ביו</td><td>לוקסקאן10K/B</td><td></td></tr><tr><td>מכונת כביסה CapitalBio 24&nbsp;</td><td>קפיטל ביו</td><td>מכונת כביסה 24&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>&nbsp; צנטריפוגה&nbsp;</td><td>אפנדורף</td><td>ר5424ר</td><td>מהירות MaX: 15000 דקות-1</td></tr><tr><td>מאגר הכלאה</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>שבב וכיסוי מיקרו-מערך גנים של HybSet</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>ערכת זיהוי מיני Mycobacterium</td><td>קפיטל ביו</td><td>301030</td><td></td></tr><tr><td>בקרות שליליות, בקרות חיוביות</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>מחלץ חומצות גרעין</td><td>טיאנלונג</td><td>ג'ין רוטקס 96</td><td></td></tr><tr><td>מגיב הגברת PCR</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>pH 6.8 מאגר פוספט</td><td>ShangHai yuanye ביוטכנולוגיה</td><td>R20029-10</td><td></td></tr><tr><td>פיפטורים וטיפים</td><td>תרמו סיינטיפיק</td><td>0.1 - 10 &mu; L, 2 - 20 &mu; L, ו- 20 - 200 &mu; L, 100-1000 &mu; L</td><td></td></tr><tr><td>qEx-DNA/RNA ערכת מיצוי או טיהור חומצות גרעין</td><td>טיאנלונג</td><td>qEx-DNA/RNA</td><td></td></tr><tr><td>SDS</td><td>קפיטל ביו</td><td>441060</td><td></td></tr><tr><td>נתרן הידרוקסיד (NaOH)</td><td>שילונגס&nbsp; מדעי</td><td>XK13-011-00027</td><td></td></tr><tr><td>SSC</td><td>קפיטל ביו</td><td>441050</td><td></td></tr><tr><td>אמבט מים תרמוסטטי</td><td>סורוי</td><td>HH-W600</td><td></td></tr></tbody></table>

זיהוי מיני מיקובקטריום בשיטת שבב מיקרו-מערך dna

Identification of Mycobacterium Species by DNA Microarray Chip Method

תוצאות חיוביות עבור הבדיקות של הסוג Mycobacterium (בקרה פנימית, IC) ו-Mycobacterium tuberculosis, ערכי התוצאה החיובית שלהם נקבעים בשיטת מאפיין ההפעלה של המקלט (ROC). עבור הבדיקות המשמשות לזיהוי 16 NTM האחרים, ערכי התוצאה החיובית שלהם נקבעים בשיטת האחוזון.
בקרת איכות ניסויית תוצאת הזיהוי של תוצר הבקרה החיובי צריכה להיות "קומפלקס Mycobacteriumtuberculosis " (כפי שמוצג באיור 3A); תוצאת הזיהוי של תוצר ...

זיהוי מיני מיקובקטריום בשיטת שבב מיקרו-מערך DNA

This study presents a DNA microarray chip method designed for the accurate identification of Mycobacterium species. By leveraging asymmetric PCR ...

identification-of-mycobacterium-species-by-dna-microarray-chip-method

Research

JoVE Journal

Medicine

רפואה

סרטון זה מדגים שיטה לזיהוי זני ציאנובקטריה בדגימה סביבתית באמצעות שבב מיקרו-מערך נוגדנים. דגימות הנושאות חיידקים שונים מקיימות אינטראקציה עם נוגדנים מודפסים, והצבעה חיסונית עם נוגדנים אנטי-ציאנובקטריאליים המסומנים כפלואורופורים חושפת את נוכחותם של זנים ציאנובקטריאליים ספציפיים באמצעות פלואורסצנטיות בנקודות שונות.

טכניקה לזיהוי זנים ציאנובקטריאליים באמצעות שבב מיקרו-מערך נוגדנים

Microarray הגברה משלב הכלאת הגברה וmicroarray PCR אסימטרי לתוך תא בודד, אשר מייעל באופן משמעותי את זרימת עבודה microarray למשתמש הקצה. פישוט זרימת העבודה microarray הוא צעד ראשון הכרחי ליצירת אבחון מבוסס microarray שניתן להשתמש באופן שיגרתי בסביבות נמוכים יותר משאבים.

הוכחת סמים רבים עמידים<em&gt; חפת Mycobacterium</em&gt; Microarray ההגברה

Microdissection כבר מועסק באופן נרחב לבדיקה של DNA, RNA וחלבונים בתוך רקמה. לייזר מיקרוסקופית הלכידה (LCM) הוא השיטה הנפוצה ביותר, אך טכניקה חדשה כרסום, mesodissection, זמינה לאחרונה. אנו מדגימים מיצוי RNA מפרפין פורמלין mesodissected הקבוע שקופיות רקמות גלומות של גרנולומות חפת Mycobacterium.

גישה החדשנית Microdissection לשחזור<em&gt; חפת Mycobacterium</em&gt; תמלילים ספציפיים מפרפין קבוע פורמלין משובץ ריאות גרנולומות

מאמר וידאו זה מתאר שיטת microarray מבוסס במבחנה כדי לקבוע את מטרות הגן ואתרי קישור לשני רגולטורים תגובת מערכת רכיב.

שיטת צ&#39;יפ (DAP-שבב) מטוהרת-DNA-זיקה לקביעת מטרות גן לחיידקית שתי מערכות רגולטוריות רכיב

זמן ספיגה/יינון לייזר בסיוע מטריקס של ספקטרומטריית מסה של טיסה (MALDI-TOF MS) וטכניקות מולקולריות (ריצוף גנים 16S rRNA) מאפשרות זיהוי של פתוגנים חיידקיים נדירים באבחון שגרתי. מטרת פרוטוקול זה טמונה בשילוב של שתי הטכניקות מה שמוביל לנתונים מדויקים ואמינים יותר.

זיהוי של חיידקים פתוגנים נדירים לפי 16S rRNA ג&#39;ין סידור MALDI-TOF MS

נוכחותם של רעלנים ציאנובקטריאליים במאגרי מים מתוקים למאכל אדם היא דאגה גדולה עבור רשויות ניהול המים. כדי להעריך את הסיכון לזיהום מים, מאמר זה מתאר פרוטוקול לגילוי בשטח של זנים ציאנובקטריאליים בדגימות נוזליות ומוצקות באמצעות שבב מיקרו-מערך נוגדנים.

פרוטוקול הניסוי לזיהוי כחוליות בדגימות נוזלים ומוצקים עם צ'יפ Microarray נוגדן

EUCAST פיתחה פרוטוקול בדיקת רגישות מיקרוביאלית ישירה (AST) עבור תרביות דם אוטומטיות. עם זאת, ניתן לייתר את תלותו בזיהוי מיקרוביאלי מבוסס ספקטרומטריית מסות על ידי שימוש בפרוטוקול הכנת חיסון ישיר במערכת זיהוי מיקרוביאלית אוטומטית. גישה זו יכולה לספק דוחות AST תוך 24 שעות מאיסוף הדגימות.

זיהוי מיקרוביאלי ישיר באמצעות מערכת זיהוי מיקרוביאלית אוטומטית כדי להקל על שיטת EUCAST RAST ללא ספקטרומטריית מסות

טכניקת iChip עושה שימוש במכשיר בידוד זול ופשוט באתרו המגביר את שיעורי גילוי המיקרואורגניזמים החדשים מהאדמה. ניתן להשתמש במיקרואורגניזמים חדשים למחקר נוסף הנוגע למיקרוביום הקרקע או לגילוי מוצרים טבעיים, בין היתר.

בידוד מיקרואורגניזמים בקרקע באמצעות טכנולוגיית iChip

פרוטוקול זה מתאר את שיטת ה-CTAB לחילוץ DNA איכותי ממיקובקטריה, תוך התמודדות עם האתגרים שמציבים דפנות התאים הקשות והעשירות בחומצה המיקולית. התהליך כולל עיכול אנזימטי, פירוק תאים באמצעות CTAB, וטיהור DNA באמצעות הפקה אורגנית והשקעת אתנול. שיטה זו מייצרת DNA המתאים למחקרים מולקולריים ואמינה למחקר מיקובקטריאלי.

הפקת חומצה דאוקסיריבונוקלית בגנום מלא ממיני מיקובקטריום באמצעות טכניקת Cetyltrimethylammonium Bromide

כאן אנו מציעים שיטות פשוטות כדי לבחון ולהעריך את הנוכחות של מינים חמצן תגובתי בתאים.

הפקה וזיהוי של מינים חמצן תגובתי (ROS) סרטן

למד זיהוי מיני מיקובקטריום בשיטת שבב מיקרו-מערך DNA לדיאגנוסטיקה קלינית מהירה ומדויקת. השיטה מציעה רגישות וספציפיות גבוהות לזיהוי מוקדם של זיהומים ושיפור תוצאות טיפול חולים.

זיהוי מיני מיקובקטריום בשיטת שבב מיקרו-מערך DNA

גלה סרטונים נוספים